2F7BA

Catm effector binding domain
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
214
structure length
214
Chain Sequence
QTLRIGYVSSLLYGLLPEIIYLFRQQNPEIHIELIECGTKDQINALKQGKIDLGFGRLKITDPAIRRIVLHKEQLKLAIHKHHHPNQFAATGVHLSQIIDEPMLLYPVSQKPNFATFIQSLFTELGLVPSKLTEIREIQLALGLVAAGEGVCIVPASAMDIGVKNLLYIPILDDDAYSPISLAVRNMDHSNYIPKILACVQEVFATHHIRPLIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Gene regulation
source organism Acinetobacter baylyi
publication title Distinct Effector-binding Sites Enable Synergistic Transcriptional Activation by BenM, a LysR-type Regulator.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HTH-type transcriptional regulator catM
total genus 66
structure length 214
sequence length 214
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f7bA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f7bA02
2OJTA 1MQHA 3UN6A 1O7TA 3G7WA 3OENA 3FD3A 4ECFA 2XXRA 5AE4A 3FVGA 3KOSA 1B3FA 3DELB 4YAHX 5ICTA 1AIVA 3FJMA 5L8DA 1QUIA 3TDJA 3ONMA 3KG2A 4R9GA 1UTHA 4ZS9A 4NF6B 1TFDA 1SDXA 2A5TA 1LCTA 3JZJA 3OSRA 4FECA 1FQDA 3A3CA 3FV1A 1SYHA 4GL0A 3CG3A 3LSXA 4NTLA 4H5FA 3H6WA 3KJ7A 3MVXA 2RC8A 3MUQA 4G8NA 5AA2B 1Y1MA 3MQ9A 4JWOA 2VP1A 1LFGA 1B1HA 4LZ7A 3H7MA 5FTIA 1NKXA 1T0KA 4KCCA 3IL1B 3QXMA 4OWDA 3TZAA 4XXUA 1N7XA 4DXBA 3P7IA 3CVGA 3FZVA 3T66A 1FCKA 1FQBA 5H8HB 3ODBA 4JWYA 2FNCA 4LATA 5ITPA 1MXUA 3N6TA 4NF5B 4PFYA 5H8QA 4NEDA 3O6IA 4DCXA 1LGBC 4FEBA 1ZBMA 3ECRA 3S9LC 4JSOA 4OENA 5JTYB 4QFLA 1MH3A 2UVJA 3W15C 1DMBA 3RNNA 1URDA 4OTEA 3FXRA 1P1UA 4LVQA 2A5SA 2I0CA 4QFKA 1UIVA 2LAOA 1SBPA 1PC3A 3KSJA 1QKAA 1VR5A 1Y3QA 2HAUA 5I2KB 1A99A 1B4HA 3SEXA 4YMBA 3V5AA 3PPQA 4X1BA 5AA4A 4NWDA 3FATA 4PFUA 2P1SA 5FTHA 4IO6A 4U2RA 3PV0E 2W7YA 1P1QA 3S9MC 3KEIA 3VXBA 3V89B 1N84A 1IZ1A 4F39A 3LSLA 3K00A 2O1MA 1M5FA 4QSEA 2Q2CA 1MY4A 2NVUB 4TLLB 1IEJA 5HBCA 3RN8A 1H3DA 4YICA 3TTRA 1MDQA 2YLNA 1B5HA 5BWJA 3SETA 3DM0A 4H6DA 3QUFA 1XOCA 1HSLA 2ZYNA 3JYRA 1US5A 4KQPA 1SQYA 1MQGA 1PB7A 1UQWA 5TU0A 4H65A 1MY1A 2CMOA 3R6UA 2OZZA 1B0LA 3HHGA 3OELA 3G3HA 1QW0A 1H76A 4POWA 2XD3A 3Q27A 5HM4B 4GXAA 4YKJA 4DDDA 4NMYA 4IO5A 3EHTA 1N3XA 2X7QA 4LQ5A 4UACA 1IXHA 3O28A 1HSEA 3V83A 3K6UA 3CG1A 4GQOA 1D9YA 3K2DA 3A09A 2FA7A 2O69A 4DXCA 2ONRA 2NWJA 3M3LA 4DXUA 2Q89A 4XKNA 4MBPA 3PUZE 4BLAA 2GHAA 1UTBB 5CMCA 5TP9A 5I57A 3MW0A 4LQ2A 1B3HA 4JWXA 2XXWA 3VVFA 3PD8A 4H0WA 5B7DA 3TFLA 1B4ZA 1JEVA 5K2XA 1MXVA 3U92A 3EF7A 2I0BA 3TCGA 3EHUA 2H99A 4R6YA 4GL8A 2V3TA 2XD2A 3TTMA 1VFDA 3RPWA 2H4IA 5CMMA 1MQDA 3WAEA 3FXQA 4LUBA 1IQ7A 2NXOA 1O64A 1AOVA 3W9WA 5AA2A 4RXLA 1ZJLA 1MDP1 4RY1A 5KDTB 3KJTA 4TQUQ 3SERA 1RYOA 3H6VA 1ZLQA 3OO6A 4ESXA 2G29A 1USYE 4F22A 2DE2A 4GVOA 5AA4B 3VV5A 1Y3PA 4C1TA 1NMUA 3PD9A 5DYHA 3OEMA 2ZXTA 3U1OA 3N5LA 1B1XA 1USYH 1R6ZA 3IAZA 2F7BA 3M3KA 4IGRA 5H8SA 1MRPA 2DXRA 2F6PA 4H67A 1ZMGA 3ZSFA 3MVZA 1GGGA 3BFTA 1POTA 2DS9A 1M5EA 5DVIA 4FORA 4JB7A 4G68C 3PUYE 3FV2A 5EYFA 4H8IA 4PQJA 1IITA 3HPIA 4JDFA 3TEPA 3T93B 2VGQA 1PB8A 3PUXE 2UYFA 4EQ7A 1NNFA 1WDNA 2QJEA 4QSCA 2DWAA 3DP6A 3RY3A 2Z23A 1ELJA 3FJGA 4IY6A 2Y7PA 3U8QA 1MY3A 5I2KA 3MVWA 5KCJB 3U94A 1P1WA 5FHMA 4F1UA 2DE4A 1MY0A 3HSTA 2I48A 4NWCA 3UGWA 1IUDA 3KGCA 1US4A 3C36A 4U21A 2V93A 1FTLA 3IOTA 3TMGA 3MP6A 2OLBA 5H8FB 4OQOA 4PP0A 1LSTA 3T9HB 1PBPA 3RTWB 3CSGA 4RNSA 2AL4A 5I59A 1AH5A 1ATGA 4U22A 1Y9UA 2BJJX 1MPDA 3CSBA 3HCQA 1MQJA 3RQTA 4RK2A 1CB6A 3K01A 5TP9B 5I57B 3MP1A 1LFIA 3CFZA 4AQ4A 4ZEDA 4YU0A 2DWJA 3KN3A 3SEYA 4ND9A 1H45A 4P11A 1FQEA 2HEUA 4OEVA 4BDNA 2F6GA 1DTGA 1GV8A 4PETA 1PBQA 3S9EA 4R72A 1B7UA 1URSA 1Y4CA 3E4RA 4IY5A 2O84X 5IAIA 4F2OA 2OCUA 3IK6B 4N13A 1II5A 4I8CA 1JVXA 3MZ9A 3Q29A 4G77A 4OERA 1M5BA 3IB1A 3PMWA 2O1LA 4G2ZA 2GRVA 3IJXB 5M2VA 4WXJA 4OESA 1H43A 4U4SA 4EXKA 4GRKA 1UTBA 2ZNTA 1LAGE 4X9TA 4G8HA 4EQBA 1QKBA 1SW2A 2RC9A 3T9XB 2ZNUA 4MLVA 4EXLA 2E1SA 1A8EA 1AL3A 1EH3A 1P99A 1MG1A 3K0VA 4FE8A 4OFJA 1A7LA 4H8JA 3TCHA 3MC2A 3LR1A 1L5TA 4QRZA 3OEKA 4RJZA 5ICQA 4WKMA 4YKPA 1WVJA 4KHZE 3T9UA 3MZBA 3H3GA 3PU5A 1N0TA 1SW5A 1DOTA 2THIA 3THIA 1QUKA 3SEWA 3HHFA 2VHAA 4DZ1A 2QMXA 1R9QA 5DT6A 4KI0E 1F9BA 4E0XA 3HO7A 4XKQA 5KDTA 4G4PA 2I6EA 3OO8A 1OLAA 3PGFA 1OMPA 1LAXA 3G3FA 3PPOA 1B9JA 1IXIA 2DSFA 4LA9A 1B7HA 2Q8JA 2IEEA 2ESNA 3RLFE 3VLWA 3OO7A 1N04A 3TTNA 2OK2A 3MWBA 1VFEA 4F3BA 3G3GA 2NOOA 4NF8B 2F35A 4OYVA 3OD7A 4F3PA 4IO3A 1I6BA 4QHQA 4I9DA 5I59B 4RYAA 3LSFB 3RTFB 1JETA 3MJNA 3K6WA 3LUYA 3CI8A 1SW4A 3VFJA 3G3JA 1LFHA 4PFWA 1GVCA 3ZKLA 1SW1A 4R6HA 1B58A 1Y4TA 2CZLA 1QJMA 3T96B 1JW5A 1D9VA 3IB0A 1B51A 4F3SA 4BDMA 5KCJA 1B05A 2QS4A 1RYXA 1ZTYA 1DSNA 4HW8A 1TT1A 3PPRA 1DPPA 3KN7A 4KCDA 2Q9TA 3TUSA 3O9PA 3QIMA 5JEIA 1MXYA 2XXYA 2I3WA 1MY2A 4OXVA 1XHYA 2ONSA 3S2VA 4NE4A 3FJ7A 4Q8RA 1M5CA 4OVJA 3AXFA 5H8FA 1IXGA 4GOTA 1JVYA 2HFBA 2F7CA 2UVHA 2PX1A 4YKKA 3LSWA 4YZZA 2M8CA 1B3GA 4YB6A 3ILTB 3EQ1A 1NL5A 4X48A 1SVXB 3G3IA 4RPOA 4TLMB 3N6UA 2D21A 1ANFA 3B7DA 2DXYA 3SEVA 4IGTA 4Z7EA 3L6HA 5L9OA 5I56B 5CI5A 4I62A 3H4ZA 2DP8A 2ZMBA 1B52A 4N07A 1D3KA 1B32A 1XS5A 1FQFA 3MPKA 4YKIA 3IR1A 3EN3A 3TTKA 4Z0IA 1TXFA 1IIWA 1OQHA 2QL3A 1UIUA 3SESA 4POXA 1OLCA 4KFQA 3MZ1A 3OXNA 2NUVA 3FVNA 5H8NB 1ZIUA 3R26A 1CE2A 4EF1A 3H03A 1S9TA 5JK4A 2YPNA 2D5WA 2Z8DA 2PVUA 2ONKE 2QSXA 4FIMA 4ZEIA 3CR9A 1TWYA 1AMFA 1MS7A 4U4XA 4ONYA 3TCFA 2RCBA 4OFLA 3VLVA 2XXXA 1LBCA 2ANJA 5I2NB 1B3LA 4YB5A 4QFOA 3H6UA 3TPAA 3O29A 1BKAA 3T9VA 4ZEBA 3TAJA 3UA8A 4X1DA 4F3GA 1QUJA 1Q35A 4ZECA 4GF8A 2ZYMA 2F36A 5CMKA 5FHOA 2AYSA 4GXSB 5EHMA 4R2FA 1JEUA 5AA2D 4EDPA 2QS2A 4FJPA 3BBRA 5CBRA 1MPBA 2Y7KA 3PUWE 1B3EA 4P0GA 4XKRA 4L17A 5CBSA 4FEDA 2Y7WA 5AA1A 2Z8FA 4OHNA 2F7AA 3MAMA 4GWOA 2XXIA 1A55A 3O66A 2D3IA 1IXCA 1H44A 3RUMA 3TELA 1OQGA 4O3AA 3KOTA 4R2BA 3K1MA 4JSDA 2H5YA 3Q26A 3K4UA 3DP8A 1FTOA 4C1UA 3VVEA 2PMSA 2I4CA 1EZOA 3PPNA 3E9XA 1LLSA 1MXWA 1WODA 4ELPA 3EPEA 3MPLA 3D4GA 4Q30B 3TQWA 2HAVA 2GHBA 2REGA 4IO2A 4EQ9A 4NF8A 1EU8A 4ESWA 1GR2A 5K2YA 3O2AA 5DEXB 3E3KA 4TOZA 1B6HA 3DLNA 4MLQA 4F29A 1PEBA 2DOJA 4M1VA 4BDOA 3M8UA 3QYTA 4PFTA 3O97A 2R71A 3I5OA 2GFEA 4OFOA 1GTKA 4P0IA 2UVIA 4WEDA 3FVKA 5L9SA 3SKPA 3QAXA 3IB2A 1FQAA 5IKBA 4G68B 3K1PA 3VVDA 1DPEA 1A40A 2XHDA 2PT2A 3IOUA 1MXZA 1R9LA 2F8DA 2VOZA 1I6AA 3C33A 2V84A 4ZE9A 1XVYA 4LZ8A 1XT8A 3OSQA 1VSOA 1I6QA 4HTGA 3QK6A 4BDRA 1EZPA 4THIA 4KYDA 4F1YA 2ZNSA 1B40A 4RK9A 1B0HA 3C34A 2RF1A 4KPTA 4UA8A 1NNPA 3N26A 2F5XA 3UK4A 2DYXA 1MPCA 2XXPA 3D4CA 1J1NA 3QUJA 1S50A 1NH8A 3PPPA 2KLFA 4KYSA 2ALUA 1LB9A 2HZKA 4H5GA 3SDFA 3UIFA 2QMWA 3KSXA 3JV9A 1YTVA 3Q25A 5I56A 1QULA 2OWSA 2I58A 4HCYA 2V25A 3C35A 3U72A 4GIZA 1KWHA 3QSLA 3ILUB 2DVCA 4IO7A 4MF3A 2REJA 4ELOA 1ZKBA 1BIYA 4C0RA 3KZGA 4F2QA 1DTZA 4F19A 2O6AA 2B3FA 2P0SA 5H8NA 4QFPA 1LCFA 5F1QA 3GZGA 2ABHA 3TODA 4MH5A 2XXTA 4G8MA 4U1OA 3UORA 2Y7IA 2R9JA 1SI1A 5J1DA 3VXCA 4R6KA 1FTMA 4GLIA 3IOVA 3T22A 4YMAA 4K3FA 4OEUA 3B6TA 2O7IA 4NF4B 1QVSA 3MP8A 2UXAA 2WKYA 4F18A 1B46A 1YCJA 5I2NA 3IO4A 1NFTA 3A3UA 1B5JA 3TTLA 4U23A 1JNFA 5ISUA 5CRYA 2AIXA 1N76A 4XIGQ 4Q0CA 4QSDA 2DWHA 2DE3A 2RKMA 2XXVA 3TKDA 5AA3A 4ZZAA 4RPNA 2I4BA 1B2HA 3K6VA 1BP5A 2O7UA 3KFMA 4M4GA 1N3WA 2Q2AA 3K6XA 3PUVE 1FQCA 3IOWA 4U1ZA 1S7YA 2HQ0A 2I3VA 2ZYKA 3H6TA 5ELVA 3K02A 1MM6A 2DQVA 1LBBA 2R6GE 2B3BA 3GLBA 4ISUA 2PT1A 3OO9A 2F78A 3O6GA 3USDA 3IORA 4YB7A 4OETA 5A5XB 1YPNA 2XXHA 3HV1A 1PB9A 2HCAA 4R73A 5L9MA 4KR5A 2QS3A 2XX8A 1NNKA 3G3KA 3Q28A 1JW1A 4LZ5A 1Z7NE 1LAHE 4DLDA 5LOMA 1NNTA 3E13X 3I3VA 2P2AA 3S9NC 1A8FA 1BLFA 2Y7RA 1EZ9A 1PDAA 2DWIA 3I6VA 3H06B 1Y20A 5DVJA 3PMVA 5I58A 4GFRA 4LONB 1MM7A 4FAJA 1MXXA 3B6WA 2XXQA 3BKIB 3PMXA 1M5DA 3CIJA 4IB2A 1UTHB 2XX7A 4HCWA 1YAEA 2Z22A 2A5TB 5DVFA 1Q1KA 5DEXA 1BTJA 2V3UA 5CM6A 3RT6B 5EHSA 5TPAA 4EF2A 4XKPA 4KYEA 2RCAA 4N6PA 3OOAA 2H98A 4AB5A 2H9BA 3VLUA 1OVTA 2V3QA 3F11A 4R74A 3SEUA 3FIRA 4G68A 3TYHA 5B70A 3GBBA 4PE5B 2E0SA 2RINA 1FTJA 2F34A 4JBZA 2O51A 3FGSA 4BDQA 3LBSA 2I49A 5F7VA 2AL5A 4I1DA 4H1XA 1A54A 1OVBA 3C4MA 4OMBA 5FHNA 3GXAA 1SYIA 4F31B 3TQLA 3DP4A 1SD3A 3LC8A 2FYIA 4ZE8A 5H8QB 1Y3NA 3VDFA 3ZS6A 2GH9A 4ZZEA 3FASA 4NF6A 1TFAA 3MVYA 3K1NA 2DVZA 1VE4A 2H25A 2Z8EA 2QPQA 4WEPA 3FXUA 1O63A 1SI0A 2HZLA 3IO6A 4OZ9A 1XVXA 4R9FA 1FW0A 3CRBA 3WAFA 4IO4A 2Q88A 3L6GA 2O68A 3V8XB 3FUZA 1N7WA 3S4UA 2ZYOA 4DIGA 3C31A 1NH7A 3IJOB 1MQIA 4ELRA 4HS7A 3M3FA 4KD5A 2PYYA 1XC1A 4AB6A 2G93A 4RA1A 2QS1A 5H8HA 2IA4A 4NF5A 4DE8A 3RGYA 2UYEA 3KBRA 5CMBA 3C9HA 3BFUA 2Y84A 3ZKKA 1B5IA 4MFIA 5HPQA 5JTYA 5I84A 2VD2A 4JXIA 5ITOA 4F1VA 2HXWA 2PBWA 2XXUA 4QFNA 1P1NA 5CC2A 4NF4A 2XX9A 1P1OA 3RT8A 3KN8A 3N94A 1JW4A 1HSJA 1I69A 3U93A 5BUUA 1B7ZA 1POY1 3VE1B 1LB8A 2YJPA 3FVOA 2QRYA 4ZEFA 5I58B 3CFXA 3EHSA 1JQFA 4R75A 4O3BA 4EUOA 1LAFE 3O6HA 4Q5TA 1R1NA 4QF9A 2RC7A 3CFLA 1OIBA 3IX1A 5KZTA 1Z7ME 3C32A 4O3CA 4ZEKA 3GBAA 2OWTA 5TPAB 1MH4A 2VD3A 1ZU0A 2X26A 1Y1ZA 2X7PA 3B6QA 3UP9A 4ELQA 4DCYA 3MBPA 3OMBA 4FATA 5A5XA 4LP2B 5DTBA 4ZDMA 2OBGA 1URGA 4XTCQ 3HN0A 1D4NA 2F97A 2B65A 3W9VA 4E0WA 3R7XA 1RKMA 1FTKA 2UVGA 4GD5A 4BDLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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