2F7BA

Catm effector binding domain
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
214
structure length
214
Chain Sequence
QTLRIGYVSSLLYGLLPEIIYLFRQQNPEIHIELIECGTKDQINALKQGKIDLGFGRLKITDPAIRRIVLHKEQLKLAIHKHHHPNQFAATGVHLSQIIDEPMLLYPVSQKPNFATFIQSLFTELGLVPSKLTEIREIQLALGLVAAGEGVCIVPASAMDIGVKNLLYIPILDDDAYSPISLAVRNMDHSNYIPKILACVQEVFATHHIRPLIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Distinct Effector-binding Sites Enable Synergistic Transcriptional Activation by BenM, a LysR-type Regulator.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HTH-type transcriptional regulator catM
molecule tags Gene regulation
source organism Acinetobacter baylyi
total genus 66
structure length 214
sequence length 214
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f7bA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f7bA02
3K6UA 3G3HA 3TTMA 4BDQA 4GIZA 3CIJA 4LONB 3S9EA 4U2RA 1IXGA 2F6PA 2DE3A 5H8QB 3RGYA 3PMWA 1OVBA 4OVJA 1A8EA 4QSEA 4PFTA 3EHUA 5A5XB 4JSDA 5FTHA 3DM0A 3H4ZA 1B3HA 5ISUA 3Q29A 2DQVA 5F1QA 1DOTA 2XXTA 1Q1KA 1AH5A 1MY4A 2VGQA 5I58A 1LFHA 3PD8A 3C31A 1ANFA 2DWAA 3T9UA 2D3IA 1N7WA 5CMBA 3HO7A 3TCFA 2OBGA 4NF4B 3M8UA 1YPNA 1XVXA 2I6EA 1GR2A 4ZEBA 4R75A 3QK6A 3MWBA 2HXWA 5H8FB 1TXFA 3MBPA 4JSOA 1ZTYA 2OJTA 4IO3A 3DP8A 1I69A 3MP8A 4U22A 3QAXA 4JWOA 4F2QA 1POTA 2QRYA 4G68A 1B4HA 2RCAA 1US5A 1MY0A 2I3VA 4NF8B 4Z0IA 3G3FA 2RCBA 2NXOA 2Y7RA 3ZSFA 2I49A 5I84A 3C9HA 1O64A 3PPNA 2WKYA 5F7VA 4ZZEA 3LC8A 4TQUQ 4MFIA 4DDDA 5KCJB 1B51A 3DLNA 2QPQA 3EN3A 4ZDMA 3VVDA 2O7UA 2RC8A 3PD9A 4GQOA 3M3FA 5DTBA 4OERA 3TCHA 2XD2A 2O69A 1LFIA 4THIA 4OESA 5J1DA 2DWIA 3OSQA 1SYHA 1SW4A 4IGTA 5AE4A 3E13X 2F78A 3U72A 4WEDA 4XIGQ 5H8HA 4K3FA 4YAHX 5KDTB 1S7YA 4OFLA 4KCCA 5CMMA 2RF1A 4XKPA 5BUUA 4ZEIA 3OSRA 1P1NA 1LCTA 2REJA 4C0RA 1OVTA 4LZ8A 2Z8EA 2FA7A 5I58B 2QS2A 3PUVE 1MDP1 1PC3A 2UVGA 2Y7IA 2UXAA 4EUOA 4IO6A 2UYEA 3FXUA 2F7CA 3SEWA 3H6VA 2FYIA 1FQFA 1SW5A 1MY1A 1BTJA 4G8NA 3USDA 3SEUA 3IB2A 1PB7A 3HV1A 4ELQA 1XHYA 4GXSB 4LUBA 5KZTA 3LR1A 2Z8FA 4DIGA 1HSLA 3KN8A 3JYRA 2O1LA 2ZYKA 2CMOA 1EU8A 2ZNSA 3SERA 4NTLA 1JEUA 3CI8A 1MQJA 3OD7A 4LQ5A 4RY1A 5FHOA 4G4PA 1F9BA 3K6XA 3OO8A 3OO9A 4JB7A 2FNCA 3TMGA 2XXYA 3Q28A 1RYXA 4I9DA 1XT8A 1A99A 3CSGA 3GBBA 3LSXA 3CG3A 2O51A 3I5OA 4PE5B 5DT6A 2HAVA 3T93B 1B3GA 1LLSA 5L9MA 5AA2A 4YMAA 3ECRA 4H0WA 3DP6A 4OEVA 5H8HB 3SESA 1UTBA 4ND9A 4RPOA 5TP9A 3KGCA 4KPTA 3VDFA 5DYHA 1N04A 4DLDA 4F19A 2O68A 3EHTA 2ZYMA 4MLVA 2VP1A 2R6GE 3OO6A 2ZXTA 1MM7A 2P1SA 4U4XA 2IEEA 5DEXB 3RLFE 3T9HB 2LAOA 1LAFE 4QFKA 2DOJA 3C4MA 4N07A 3M3LA 4KI0E 3U93A 3HHGA 3FVKA 1IQ7A 1NFTA 2AIXA 1SD3A 3MP1A 5I2KA 2HEUA 3B6TA 3I3VA 2F6GA 2OZZA 2OWSA 2Z22A 1IUDA 2OLBA 3PPQA 3OOAA 2O6AA 2QMWA 1PDAA 1A8FA 2ANJA 5CM6A 1EZ9A 1FTOA 3VLVA 2P2AA 1BIYA 1QUJA 2VD3A 1MY3A 1QUKA 3GZGA 5H8NB 3OO7A 5I59A 2VHAA 4R6YA 1KWHA 1Y4CA 4GRKA 4I8CA 4H8IA 1SI1A 3ZS6A 3VE1B 3RN8A 4KR5A 4UACA 1LB8A 3KN3A 4OXVA 2REGA 3IJOB 4Z7EA 5JK4A 5I56A 1QUIA 3SDFA 4H1XA 1PBPA 1R9LA 4DXBA 4ELPA 4P11A 3C32A 3C35A 4H5GA 1XS5A 2HAUA 1R1NA 3U94A 1VE4A 5H8QA 2YPNA 3E9XA 1MG1A 1LAGE 1OLAA 3C36A 2UVJA 4YKJA 2PVUA 4G2ZA 1P1OA 1UTBB 1MXYA 4F3BA 4RNSA 3FIRA 3CVGA 3C34A 3QXMA 4OEUA 5A5XA 4FATA 4ZZAA 1LBBA 4ZEDA 2OWTA 2V93A 2XXVA 4TOZA 4H65A 2UVHA 4ESXA 3K1NA 4C1UA 2I4BA 1NH7A 4NE4A 3HPIA 3IOTA 3W9VA 4POWA 3TQWA 1LAHE 4NF4A 4OYVA 4LZ7A 4R73A 2OK2A 5I2KB 4KYSA 5H8FA 1ZMGA 2Z8DA 4YICA 1ZBMA 2XXXA 4EQ7A 4HTGA 4QF9A 3OELA 3K4UA 1BP5A 2XXUA 2B3BA 4U1OA 3FASA 2HZKA 3CFLA 5AA1A 4YZZA 4EQ9A 1N0TA 3RTWB 1URDA 1ZJLA 3QYTA 4IO5A 1J1NA 3HSTA 2F34A 2DXRA 4BDRA 3EHSA 2ONSA 3U1OA 4G68C 1RKMA 3U92A 3BFUA 5KCJA 3IOUA 4QFPA 4IB2A 4Q30B 1IITA 1S9TA 3PMVA 1QULA 2F97A 4POXA 1DPEA 5IAIA 2Y7PA 4YKKA 3TFLA 4O3BA 4RPNA 5JTYA 4ZE8A 3ILTB 2DXYA 1MXXA 3OENA 4ELOA 4U23A 3O6IA 3OEKA 2AL4A 4FAJA 2H98A 5ITPA 2VD2A 1UIVA 2ESNA 1MS7A 4GLIA 3PUZE 1D4NA 3F11A 1Y4TA 4YKIA 1TFDA 5KDTA 2V3TA 1MXWA 3PU5A 4OQOA 3TCGA 4ECFA 3VXBA 3D4CA 3S2VA 1IXHA 3KBRA 4R2FA 1ZLQA 4PETA 4R6KA 4Q8RA 3KSXA 4P0IA 5K2YA 3BFTA 1B9JA 1B3LA 3P7IA 3IB1A 3LSLA 1YTVA 2Q2AA 4LQ2A 4PFUA 3JV9A 2G93A 4WKMA 3KEIA 4GVOA 3TDJA 1MPBA 2XX7A 3TYHA 3A3CA 1SI0A 4RK2A 3G3IA 2V25A 3KN7A 2Q8JA 3KSJA 4M1VA 1MXVA 2GHBA 4KD5A 1MH4A 3TTRA 2QJEA 2ZMBA 4P0GA 5H8SA 2I4CA 1OQHA 4F31B 1RYOA 4ESWA 4F22A 4HCYA 1JW5A 4R74A 2GFEA 2QS3A 5TU0A 5JTYB 2H4IA 4FIMA 4KHZE 2IA4A 3RNNA 2F7BA 3UGWA 1SQYA 1XOCA 4LP2B 4YB7A 2DE2A 1Y1MA 4OHNA 2ZYNA 5CMKA 1USYE 1POY1 4F3SA 3IL1B 1FQAA 1B32A 4WEPA 1FQEA 3K00A 3VVFA 3VXCA 4R2BA 1MH3A 3B6WA 4RK9A 2QS1A 2PT2A 1LAXA 2XXQA 1JEVA 4AB6A 2ONRA 3PUYE 5DEXA 2F8DA 2ONKE 3S9LC 1A7LA 1QVSA 2OCUA 4YMBA 1NNTA 4DE8A 2Q9TA 2R9JA 4BDMA 2D5WA 1HSJA 4XXUA 3UK4A 1D9YA 4MF3A 3H6UA 4YB6A 4JXIA 1ELJA 5EHSA 3FXQA 3N5LA 2HFBA 3UP9A 1LBCA 2RC9A 1PBQA 3EF7A 3O29A 3ODBA 1FW0A 2A5TB 3MVXA 4MLQA 4HW8A 2F5XA 3RUMA 1TWYA 1PB8A 2QL3A 5H8NA 1MPCA 2GH9A 3BKIB 3IO6A 5I57A 1FTLA 1MPDA 3UA8A 3PGFA 1N84A 4XTCQ 5L9OA 1Y3QA 4PFWA 5CC2A 1AOVA 1B3FA 1CB6A 4FJPA 3T9VA 4GL0A 4NF5A 4TLLB 3JZJA 1N3XA 1WVJA 1MQHA 4LA9A 3HN0A 1B5JA 1H44A 3V89B 3T66A 4KQPA 4XKRA 1WODA 1ZU0A 3K2DA 4E0XA 1Z7NE 1B5IA 1MQGA 2XXIA 2I0BA 4XKQA 4ELRA 1LB9A 3L6HA 3O6GA 4IO7A 2AL5A 1M5FA 3O97A 3WAFA 4M4GA 4BLAA 4PFYA 3N6TA 3FZVA 1B58A 3MW0A 3TELA 3I6VA 3A09A 4GOTA 1L5TA 3MQ9A 1Y9UA 1LGBC 4HCWA 1R9QA 4BDLA 1P1QA 3RY3A 3N94A 2PT1A 5B7DA 4KYDA 2ZYOA 1SW1A 2I48A 3KZGA 4YKPA 1MRPA 3OEMA 3FJGA 2O7IA 1D9VA 3IR1A 3K0VA 3MZBA 1Y3PA 1TFAA 2HCAA 2A5SA 3BBRA 4F18A 1IZ1A 5B70A 2YLNA 5I57B 3G7WA 4DCYA 3CR9A 3QUFA 3Q27A 4QSCA 1B4ZA 1B1XA 4O3CA 1UTHA 4GD5A 3MVZA 1H43A 3KFMA 4OETA 5AA2D 4DXUA 1Y20A 4IY6A 5M2VA 4L17A 1SYIA 3DELB 3IB0A 3FJ7A 3RT8A 4QFOA 4NF5B 3Q26A 1EZOA 2GHAA 2M8CA 4FEBA 4X9TA 1OLCA 1B05A 4H8JA 3CRBA 4QRZA 4MBPA 4LZ5A 3O28A 1A40A 3SKPA 3IJXB 1AL3A 2Q88A 2P0SA 3MZ1A 2QMXA 5HM4B 2I58A 4OENA 3QSLA 2ZNUA 4G8MA 4DXCA 3FJMA 3MC2A 3C33A 2NVUB 1XVYA 1H45A 3SEXA 3ONMA 3IOWA 2CZLA 3V5AA 5FTIA 5ELVA 4OFJA 3KJ7A 3RT6B 2AYSA 1B7HA 5L9SA 1MQDA 3N6UA 1B1HA 2I3WA 1B3EA 3UIFA 1GVCA 3PUXE 1N3WA 1LCFA 3GXAA 4OMBA 1FTJA 2XXRA 2O84X 4IGRA 5IKBA 1JW4A 5HPQA 1IEJA 1FTMA 3G3KA 4EXLA 4NEDA 2DSFA 2G29A 2H25A 4ZE9A 2DYXA 4FEDA 3QIMA 4EXKA 3FUZA 3SETA 1GGGA 4JBZA 1BKAA 3TAJA 4ISUA 1VFDA 3IOVA 2UVIA 2QSXA 3LSFB 3FVNA 4NWCA 3FVOA 1UTHB 3VLUA 3RTFB 4LATA 3FVGA 4FE8A 3G3JA 5TPAA 5I2NB 4R72A 3EPEA 1HSEA 3FV1A 3UN6A 1IIWA 3VV5A 3MPLA 3TODA 4ZECA 4FORA 3GBAA 5HBCA 5AA4B 2Y7WA 4GF8A 3PV0E 1SVXB 2NUVA 2DE4A 4EF2A 3HCQA 3U8QA 1O7TA 1B7ZA 1B7UA 5ICTA 3W9WA 1BLFA 4KCDA 1QKAA 1MXZA 2ZNTA 5BWJA 1II5A 4U21A 4QSDA 3L6GA 3KOTA 2E1SA 3CSBA 2B3FA 1EH3A 3FXRA 4ZS9A 3TTLA 4PQJA 2H9BA 5EYFA 3TKDA 5L8DA 1Y1ZA 3WAEA 1B0HA 1B52A 3CG1A 1LSTA 4EDPA 3CFXA 1H76A 1OMPA 4RXLA 5LOMA 1EZPA 1B0LA 4YB5A 4N6PA 1M5CA 2A5TA 3HHFA 1QW0A 3MZ9A 4R9FA 3K02A 1DTZA 1FQDA 2V3UA 3SEYA 4UA8A 5FHNA 4ZEFA 2Q2CA 2PBWA 1UIUA 5K2XA 1I6QA 1VSOA 4F39A 1QJMA 4X1DA 5TPAB 1IXCA 1YAEA 3O2AA 1NNPA 2XXWA 5JEIA 3R26A 4F1UA 4H6DA 1NH8A 4F1VA 3TZAA 1PEBA 3H3GA 2Y84A 3FATA 2R71A 2D21A 4RJZA 4R6HA 4IY5A 3OXNA 2W7YA 1VFEA 3H6TA 3TTKA 4GWOA 2V84A 2BJJX 1NNKA 4F29A 1P1UA 1SDXA 4LVQA 2PX1A 5CBSA 1IXIA 2E0SA 4JDFA 4H5FA 1OQGA 2DP8A 4PP0A 2V3QA 3T96B 1M5BA 3TUSA 3KJTA 2X7QA 2RINA 2XX8A 2XXPA 2I0CA 4I62A 3K6VA 3DP4A 1S50A 4F3GA 1MQIA 1NL5A 3RPWA 3THIA 5DVJA 2UYFA 1MXUA 2NWJA 3EQ1A 3A3UA 1JQFA 1NNFA 1MY2A 2PMSA 4F2OA 4U1ZA 1SBPA 1B40A 1MM6A 3T22A 3ZKLA 1FTKA 4R9GA 3E4RA 4G68B 2B65A 4KFQA 4NF6A 3LBSA 1M5DA 3ILUB 1D3KA 2F7AA 3TPAA 3PPRA 1OIBA 2RC7A 3VFJA 3PUWE 2GRVA 3S4UA 3S9MC 3OMBA 1LFGA 3TTNA 4XKNA 4Q0CA 3VLWA 2HZLA 4DCXA 1QKBA 3IAZA 3K01A 1H3DA 5ICQA 1FQCA 1I6BA 3H6WA 5DVFA 1B46A 1XC1A 1ATGA 1N7XA 4GFRA 2NOOA 4MH5A 3IO4A 5CRYA 3W15C 2YJPA 2XX9A 5AA3A 4TLMB 3K1MA 4O3AA 4OTEA 1DPPA 4DZ1A 4ZEKA 3H7MA 4KYEA 3LUYA 1B6HA 4C1TA 3PPPA 1YCJA 3PPOA 3IK6B 4QFLA 1T0KA 2DVCA 4GL8A 3IX1A 3K1PA 1PB9A 2XHDA 4RA1A 1NKXA 2XXHA 2KLFA 3FGSA 4AB5A 4QFNA 1AIVA 3VVEA 4QHQA 2H99A 4IO4A 1A54A 1URGA 1P1WA 2DWHA 2THIA 3MP6A 1SW2A 4NF6B 3V8XB 2RKMA 1N76A 3AXFA 1JETA 1A55A 4WXJA 1AMFA 1CE2A 1P99A 4N13A 3RQTA 1TT1A 3O6HA 1DMBA 4HS7A 2Q89A 3B6QA 5CI5A 5I2NA 5ITOA 2F36A 4H67A 3MAMA 3FV2A 4G77A 1B2HA 3UORA 1WDNA 4ONYA 4U4SA 3G3GA 2X7PA 5DVIA 1I6AA 2DS9A 4BDNA 3KG2A 4OZ9A 3SEVA 2X26A 3K6WA 1UQWA 3CFZA 3Q25A 3O66A 2Y7KA 4IO2A 1Z7ME 3MVWA 5AA4A 1O63A 5CMCA 1GTKA 3IORA 4NMYA 3QUJA 3V83A 1JVYA 3E3KA 5AA2B 3D4GA 4I1DA 1FQBA 4NWDA 4GXAA 3LSWA 5FHMA 1GV8A 5CBRA 4X1BA 2Z23A 5TP9B 3TEPA 3R6UA 1US4A 1DTGA 2PYYA 1JW1A 4JWXA 1DSNA 4OWDA 1URSA 4YU0A 2DWJA 1USYH 2XD3A 4OFOA 3FD3A 1JVXA 3ZKKA 1Q35A 1ZIUA 1R6ZA 3B7DA 3MUQA 3PMXA 2H5YA 1Y3NA 4BDOA 1NMUA 4JWYA 4E0WA 2HQ0A 2DVZA 2VOZA 3MPKA 4Q5TA 4X48A 3S9NC 2O1MA 3T9XB 3H06B 3H03A 3GLBA 3N26A 1ZKBA 2F35A 4NF8A 1M5EA 4AQ4A 5I59B 3MJNA 1B5HA 3TQLA 4EQBA 3KOSA 1JNFA 1VR5A 1MDQA 3R7XA 4RYAA 5EHMA 1FCKA 4F1YA 4G8HA 3O9PA 4EF1A 4F3PA 2ALUA 3MVYA 4FECA 5I56B 2QS4A 2ABHA 3M3KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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