2FNCA

Thermotoga maritima maltotriose binding protein bound with maltotriose.
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
KLTIWCSEKQVDILQKLGEEFKAKYGIPVEVQYVDFGSIKSKFLTAAPQGQGADIIVGAHDWVGELAVNGLIEPIPNFSDLKNFYDTALKAFSYGGKLYGVPYAMEAVALIYNKDYVDSVPKTMDELIEKAKQIDEEYGGEVRGFIYDVANFYFSAPFILGYGGYVFKETPQGLDVTDIGLANEGAVKGAKLIKRMIDEGVLTPGDNYGTMDSMFKEGLAAMIINGLWAIKSYKDAGINYGVAPIPELEPGVPAKPFVGVQGFMINAKSPNKVIAMEFLTNFIARKETMYKIYLADPRLPARKDVLELVKDNPDVVAFTQSASMGTPMPNVPEMAPVWSAMGDALSIIINGQASVEDALKEAVEKIKAQIEKGSHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of redundant maltotriose binding proteins from the thermophile Thermotoga maritima
rcsb
molecule keywords maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein
molecule tags Sugar binding protein
source organism Thermotoga maritima
total genus 124
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2fncA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2fncA01
4H65A 3DELB 4OFJA 4GXAA 3USDA 4H6DA 3OO9A 1LAGE 1RYXA 5ELVA 2F78A 3K00A 3KJ7A 3C31A 4JSDA 3C9HA 5AA1A 5CMMA 2F7AA 4Z0IA 2X7PA 1EZ9A 2OWSA 3CFLA 1QJMA 1IITA 1Y4TA 4GRKA 2PYYA 2V3QA 1XS5A 3HHFA 3U1OA 1B40A 5BUUA 3RTWB 1BIYA 4IO3A 2AYSA 1UIUA 3CFZA 3ILTB 4JWOA 4QSDA 1BP5A 4YB5A 3OENA 4ZEKA 4DXBA 5ICQA 3G3KA 1A7LA 4F2OA 4F22A 2V93A 2FYIA 1QULA 2F7BA 3FVOA 1HSLA 1B2HA 5HPQA 2Z8FA 1D4NA 1Y3PA 1P1QA 1WVJA 1UTHA 5TP9A 2QS4A 5AA2B 2Z23A 5AA3A 3B6WA 4F1UA 3U93A 5I57A 1IZ1A 4U22A 2Y7WA 1AMFA 2CZLA 3S9MC 2A5SA 3E3KA 1A54A 2RC9A 3THIA 1JW4A 3CI8A 1MXXA 5F7VA 1OIBA 2QPQA 2FNCA 4DZ1A 1XC1A 1UTHB 2GH9A 2ZYMA 4OYVA 2V3TA 3D4GA 3FVNA 3T9VA 5TP9B 4R6YA 1MM7A 3TCHA 4LA9A 4HCYA 3ZS6A 1NH8A 3FASA 1WDNA 1FQCA 5I57B 4ELRA 2LAOA 4QSCA 4BDOA 4F29A 3OD7A 2XXYA 4I9DA 4FECA 3VVEA 3GBBA 1SI0A 1Y4CA 1I6BA 2OJTA 4F1VA 2B3FA 3VFJA 5DVFA 4IGRA 4GVOA 4ZEDA 1LSTA 5JK4A 4R72A 2H99A 4PETA 1NNFA 4H8IA 4P0GA 4EF2A 5I84A 3OEKA 2HQ0A 2F6PA 4XXUA 4GOTA 2RINA 4X1DA 3FATA 3ZSFA 3B6QA 3W9VA 2PT1A 3K2DA 1YAEA 3OO7A 4NF5A 1IIWA 1QUIA 3F11A 2DP8A 5DVIA 1R6ZA 2VHAA 4KYSA 4AQ4A 4N13A 3OELA 4TLLB 2AL4A 4LZ5A 1URGA 3B6TA 1DMBA 4OMBA 3FXRA 1URSA 1VE4A 3BKIB 4PFTA 1AH5A 2P1SA 4NF4A 3MVXA 4P0IA 3ZKKA 4GLIA 4NF5B 3TCGA 1B0HA 1KWHA 2Y7KA 3O28A 1SQYA 2ZYNA 3FJGA 4YB7A 3Q28A 1QUJA 3O6HA 4GL0A 2Y7PA 2XXIA 3JZJA 3IJOB 4IGTA 3DP6A 2V84A 1D9VA 1RKMA 1MDQA 4DDDA 4NF4B 2FA7A 1IEJA 1M5BA 4FEDA 1B1HA 1GVCA 1FCKA 1JVYA 4F3PA 4ECFA 2XHDA 3QAXA 1Y1MA 4F19A 3VDFA 4G68A 3C35A 2CMOA 3TTLA 1MQDA 1HSJA 4JSOA 4F39A 2ZNSA 1EH3A 5DEXB 1Q35A 1H3DA 2XXUA 2ZXTA 3QSLA 1N0TA 3K6WA 5CI5A 1LAFE 2G93A 2XXTA 2RCBA 1DOTA 3G3IA 2YPNA 5ITOA 3MJNA 4LQ5A 4G68B 1VFDA 3M3KA 3MP6A 3HHGA 1UIVA 5KCJB 1LFIA 1JQFA 4Q0CA 3G3FA 3H7MA 3KJTA 2Z8EA 4G4PA 1F9BA 5HM4B 3PGFA 1N3XA 1OVTA 3M3LA 4NTLA 4IB2A 4FE8A 1A99A 3ECRA 1PB7A 3P7IA 3L6HA 3V89B 1P1UA 1A8EA 3Q29A 3VLVA 4G2ZA 5L9SA 3TUSA 1US4A 1LBBA 4OERA 3H06B 4MLVA 1JETA 2NVUB 4P11A 4GQOA 3TQWA 1UTBB 4ZEFA 2QS2A 1H44A 1MXVA 3N26A 4OWDA 1B0LA 2Y7IA 4UA8A 1B52A 4ELQA 3KSJA 2XXVA 4H8JA 4OVJA 4GIZA 3HSTA 3O66A 1IUDA 2PBWA 1SI1A 5FTIA 1QKBA 3HO7A 1MS7A 3PPOA 2VD3A 4XKRA 1B58A 2UYEA 2IEEA 4AB5A 3ODBA 3PPQA 1D9YA 4PQJA 4R6KA 4QFKA 3FJ7A 2DXYA 3SDFA 1B6HA 4RK9A 3C4MA 4KI0E 3TPAA 4JBZA 3O97A 1BKAA 1XOCA 2DS9A 2UXAA 1LGBC 3PMVA 1CB6A 4LZ7A 1FTJA 4BDMA 5B70A 5EHSA 3QIMA 1FTOA 1DTZA 1PEBA 3SEYA 3SEVA 2HAUA 3UP9A 4C1TA 2GFEA 3KFMA 4Q5TA 4QFNA 4IO4A 4H0WA 2H4IA 2GHAA 3L6GA 4TLMB 4YB6A 3U92A 2Y84A 2Z22A 3FIRA 2Q2AA 1B4ZA 4EF1A 3G3GA 3OEMA 3HPIA 3Q26A 4G77A 4I1DA 3DLNA 1AOVA 3SESA 1OLCA 3PMXA 4PFYA 1ZBMA 1Y1ZA 5L8DA 3FVGA 2I3VA 3C32A 4ZECA 1MQHA 5EHMA 3T66A 3DM0A 3CR9A 3W15C 1M5CA 3A3UA 4RXLA 5DT6A 1B3GA 2DWAA 3DP8A 2QMWA 4ND9A 4ZE9A 4G8MA 3GBAA 3EHSA 3MW0A 2OZZA 3E13X 4YAHX 3TTNA 3TQLA 2I4CA 3R26A 1IXIA 3V83A 4DIGA 5CM6A 1DSNA 2XXWA 3IK6B 3KN8A 3T9HB 2REJA 4RNSA 1XHYA 3IX1A 3MVYA 2XXRA 1LAHE 1EZPA 4EXKA 3KSXA 1ZLQA 1OMPA 4KCDA 1YPNA 3FVKA 3UORA 5ISUA 4PFWA 3MZ9A 2W7YA 1I69A 3PUZE 3OOAA 1MXWA 3TTRA 3M3FA 1O63A 1QW0A 1FTKA 4G8HA 3K6VA 1LCFA 4ZDMA 3PD9A 3TEPA 4LP2B 1D3KA 4GL8A 3TKDA 1P99A 3KBRA 3TMGA 2DE3A 1IXGA 1FQFA 5CMBA 1B4HA 3AXFA 1LLSA 4F2QA 3KZGA 5I59A 2REGA 3VV5A 3LSXA 1USYH 3IB1A 4IO6A 3RLFE 3RT6B 4IO7A 3LUYA 1MPBA 3RN8A 2F5XA 5CMKA 3EQ1A 4U1OA 1ZTYA 3H3GA 4BLAA 4OETA 4OZ9A 3FXUA 5H8SA 1LB9A 1SVXB 2HEUA 4XIGQ 5I59B 4WXJA 1A55A 1MXZA 4ELPA 1OLAA 3O9PA 3N5LA 3IB0A 4F3GA 2DQVA 2G29A 5IAIA 1IXCA 3ILUB 3MVWA 4KPTA 4JB7A 2I4BA 5F1QA 2E0SA 4NF6A 2DOJA 3FJMA 3MBPA 2WKYA 1BLFA 4HW8A 5FTHA 2VGQA 4DCXA 3JV9A 4K3FA 1O7TA 2QL3A 4X48A 4DE8A 3QUJA 1NL5A 2Q2CA 4EXLA 3E4RA 4XTCQ 2F8DA 3EF7A 1MG1A 5A5XA 3E9XA 1NFTA 3K01A 3LC8A 1QVSA 4UACA 4BDLA 3PMWA 5CMCA 1JW1A 1MQIA 4QRZA 4NMYA 3TAJA 1FTMA 1QKAA 2YLNA 1MY4A 1Y9UA 4TQUQ 4F31B 1ZMGA 2XXPA 2O6AA 5I2NA 4R6HA 4GF8A 3RY3A 3KOSA 3IJXB 3QK6A 2OWTA 1YTVA 1J1NA 2F6GA 1VSOA 3S4UA 5A5XB 2IA4A 1PB8A 3IORA 5FHMA 4XKNA 3KN7A 1B5JA 1B9JA 4EDPA 1MQJA 4EQ9A 2HZKA 4AB6A 3U72A 1Y3QA 2PMSA 3OO6A 3EPEA 4G68C 5ICTA 4RYAA 5I2NB 3S2VA 5EYFA 4WEPA 2UVJA 1XVXA 3GZGA 4KYDA 2BJJX 4KD5A 2F34A 5CRYA 2XD3A 3IAZA 2HCAA 1DPEA 3S9LC 4QFOA 4YMAA 1MM6A 3I5OA 4RJZA 1Y3NA 5DVJA 4N07A 4BDQA 3PUXE 4Q8RA 2I3WA 4X9TA 4ELOA 5L9MA 3UIFA 5CBRA 4ISUA 3H4ZA 5ITPA 4C1UA 3TODA 3TZAA 2QS3A 1B3FA 2D3IA 1II5A 4PP0A 1SD3A 1AIVA 4DXCA 2OBGA 5H8FA 2F97A 1FQAA 4R9FA 4RY1A 2P0SA 2F36A 4EQBA 4U2RA 2Q9TA 2AL5A 2D21A 1RYOA 4YKKA 2PVUA 1N7XA 1WODA 4F18A 3RT8A 1B1XA 2RKMA 2VD2A 4ESWA 4QHQA 1M5EA 4IY6A 3LSWA 4IO2A 5H8FB 5I2KA 1OVBA 3QXMA 1B05A 3W9WA 3SEXA 2OCUA 5TU0A 5H8QA 3MAMA 1N7WA 1LCTA 3G3HA 1GTKA 2DWJA 3VLUA 4M1VA 2ZMBA 3GXAA 1UQWA 4H5GA 4YKPA 2ESNA 3SEWA 4RA1A 4OFOA 1ZJLA 4FORA 2GRVA 5KDTA 4R73A 4E0WA 1AL3A 1ZIUA 3D4CA 5I2KB 1VFEA 3S9NC 3HV1A 3FD3A 4QFPA 4H67A 5H8QB 2I6EA 3MQ9A 3R6UA 3OXNA 2HXWA 3MZ1A 4OENA 4LUBA 4BDNA 3U94A 2H98A 4POWA 2RC7A 1NKXA 2DYXA 1SBPA 2O7UA 4R9GA 2VP1A 3EHUA 4LATA 4IO5A 1MXYA 2QSXA 4LONB 4IY5A 3H6UA 5HBCA 2DE2A 1N04A 3TYHA 1ANFA 3PPNA 4QF9A 1ATGA 3H6TA 1B3LA 4O3AA 1FW0A 2B3BA 1LFHA 1N76A 4U1ZA 4RPOA 3FV1A 2HAVA 1LBCA 4DCYA 4JXIA 4M4GA 1Y20A 3K1PA 3H03A 3GLBA 2QRYA 3C34A 2UVGA 3A3CA 4HS7A 3CRBA 1MY2A 2AIXA 3T9XB 3PUVE 1MH4A 3IL1B 3BFTA 1PBPA 5AA4A 2QJEA 3T22A 4U4XA 1B5IA 3K4UA 2A5TA 4ZS9A 4RPNA 1POY1 3LSFB 5IKBA 2XX9A 3SEUA 1QUKA 1S50A 1GV8A 3KOTA 4YZZA 2ZYOA 1I6QA 1FQBA 3TCFA 1DPPA 1M5FA 5JTYA 4KFQA 3FGSA 4NE4A 1US5A 3H6VA 1LFGA 4EUOA 3VXBA 4Z7EA 3ZKLA 5AA4B 1IXHA 2A5TB 1GR2A 5CBSA 1JVXA 5KZTA 3PPPA 3KEIA 2XXQA 2X26A 3CSBA 4ZE8A 4YMBA 1PDAA 3IOWA 2XX7A 4U23A 4N6PA 1XT8A 5CC2A 3HCQA 4FJPA 3CG1A 4PE5B 1CE2A 5JTYB 4I8CA 3MC2A 3T96B 1S9TA 5AA2A 1FTLA 4F3SA 4GD5A 2O84X 2ZYKA 3UN6A 4JWYA 1T0KA 2UYFA 4F3BA 2H9BA 1L5TA 3A09A 4DLDA 4KCCA 1PBQA 3BFUA 4NEDA 4R75A 4FIMA 4WEDA 3RNNA 5B7DA 1SDXA 3UA8A 3PPRA 2HFBA 4LVQA 1A40A 3CIJA 3KGCA 1NNKA 3S9EA 3OMBA 5TPAA 4H1XA 2O51A 3UGWA 3V8XB 4Q30B 5H8NA 4WKMA 3QUFA 3RQTA 3U8QA 3R7XA 2QS1A 4OTEA 3LR1A 1N3WA 3HN0A 2DXRA 3PUYE 1JNFA 5DYHA 2UVHA 3VVFA 3I6VA 3MUQA 3CSGA 2QMXA 5AE4A 2DSFA 5TPAB 1I6AA 3G3JA 3VXCA 2H5YA 2XX8A 3SETA 3TTMA 5H8NB 1B5HA 3LBSA 5FHOA 4F1YA 2Q88A 3Q27A 1MY3A 3CVGA 3C36A 3FV2A 1SW2A 3VVDA 1B46A 3KG2A 2Q89A 1EZOA 3TFLA 2O1LA 4ONYA 2F7CA 2O1MA 4OQOA 4G8NA 2H25A 1OQHA 1B7ZA 1JEVA 1FQEA 3WAFA 3O2AA 1EU8A 2Z8DA 3TDJA 2R71A 2XXHA 1TT1A 3MP1A 4MFIA 4OHNA 3OO8A 3CG3A 4YICA 4NF6B 4OESA 5L9OA 4QSEA 1M5DA 1SYHA 3RGYA 4U4SA 3OSQA 4NWDA 4HCWA 3MZBA 1FQDA 3PUWE 1NNTA 3H6WA 1VR5A 1BTJA 3IO6A 3EHTA 2RF1A 1NNPA 3IR1A 3WAEA 1TFDA 1PC3A 3JYRA 4R2FA 1GGGA 1POTA 4ZEIA 1DTGA 2NXOA 4ESXA 5K2YA 2O68A 2M8CA 1R1NA 2OLBA 4C0RA 1B3EA 1MH3A 2P2AA 5FHNA 4GWOA 4O3CA 3K0VA 1TWYA 1B3HA 5DEXA 2O69A 4U21A 3K02A 3IOUA 2NWJA 1NMUA 4I62A 2ONRA 2ZNTA 2HZLA 3MPKA 2RCAA 3I3VA 4ZZAA 4GXSB 2R9JA 2DE4A 3RPWA 3PD8A 3N94A 1B32A 4XKQA 2RC8A 3MP8A 3UK4A 5I58A 5KCJA 1MDP1 1R9QA 3MPLA 4POXA 2ONSA 4YKIA 3O6GA 5H8HA 2DVZA 5JEIA 1SW4A 2ALUA 4L17A 1SW5A 1JW5A 2R6GE 4JWXA 2XD2A 2PX1A 5I58B 3G7WA 2GHBA 5K2XA 1A8FA 4R74A 4DXUA 4FAJA 2O7IA 3BBRA 4KQPA 2I0CA 3LSLA 3O29A 4QFLA 5H8HB 1H45A 1UTBA 3T93B 3K6UA 3K6XA 4O3BA 4E0XA 1R9LA 2X7QA 4LQ2A 4JDFA 1JEUA 1TFAA 3ONMA 4HTGA 3C33A 4MH5A 2Y7RA 4MLQA 3N6UA 4YKJA 1XVYA 1OQGA 3KN3A 4OFLA 1URDA 2V25A 1MXUA 4KYEA 3IB2A 1ZU0A 1TXFA 2V3UA 1N84A 2KLFA 1PB9A 2NOOA 3IO4A 2YJPA 2I49A 1SYIA 4GFRA 4THIA 5BWJA 2UVIA 5KDTB 3MWBA 3O6IA 4KR5A 2ANJA 3OSRA 1NH7A 2ONKE 4X1BA 1HSEA 4NF8A 2I48A 2ABHA 3B7DA 2OK2A 1Z7ME 4KHZE 1YCJA 1Z7NE 3FUZA 4ZZEA 1MPCA 1IQ7A 2D5WA 4FATA 3CFXA 2PT2A 3IOTA 1Q1KA 1O64A 5M2VA 3M8UA 3Q25A 1P1WA 3EN3A 4NF8B 5I56A 3FXQA 1MY1A 3V5AA 3PV0E 3K1MA 2I58A 2I0BA 1USYE 4TOZA 3DP4A 1MRPA 2THIA 1MY0A 3N6TA 1S7YA 3SERA 3K1NA 4ZEBA 1MQGA 1MPDA 4OXVA 5DTBA 4OEVA 2ZNUA 4PFUA 4H5FA 4BDRA 4R2BA 1P1NA 1B7HA 5LOMA 4MBPA 2Q8JA 4EQ7A 3RUMA 3FZVA 3T9UA 5AA2D 3TELA 5I56B 4LZ8A 2DWIA 2B65A 2E1SA 1B51A 1B7UA 1LAXA 4RK2A 1SW1A 3SKPA 3MVZA 4YU0A 3VE1B 1ZKBA 1H76A 4NWCA 3IOVA 1H43A 2XXXA 1ELJA 4MF3A 3PU5A 1LB8A 2F35A 2VOZA 3RTFB 5J1DA 4OEUA 3QYTA 2DVCA 2DWHA 3VLWA 1P1OA 3TTKA 4FEBA 4XKPA 2NUVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H65A 3DELB 4OFJA 4GXAA 3USDA 4H6DA 3OO9A 1LAGE 1RYXA 5ELVA 2F78A 3K00A 3KJ7A 3C31A 4JSDA 3C9HA 5AA1A 5CMMA 4GWYA 2F7AA 4Z0IA 2X7PA 1EZ9A 2OWSA 3CFLA 4UABA 1KA0A 1QJMA 1IITA 4GBWA 1Y4TA 4GRKA 2PFZA 2PYYA 1XS5A 2V3QA 3HHFA 3U1OA 1B40A 5BUUA 3RTWB 1BIYA 4IO3A 2AYSA 1UIUA 3CFZA 3ILTB 4N6DA 4JWOA 2XXKA 4QSDA 1BP5A 1FBGA 4YB5A 3OENA 1FBFA 4ZEKA 4GX4A 4DXBA 5ICQA 3G3KA 1A7LA 4F2OA 4I3EA 4F22A 2V93A 2FYIA 5IZZA 1QULA 2F7BA 4XFEA 3FVOA 1HSLA 1B2HA 5HPQA 2Z8FA 1D4NA 1Y3PA 1P1QA 1WVJA 1UTHA 4X8RA 5TP9A 2QS4A 1FTAA 5AA2B 2Z23A 2Y5KA 5AA3A 3B6WA 3KC0A 4F1UA 3U93A 5I57A 1K9ZA 1IZ1A 4U22A 2Y7WA 1AMFA 2ZZWA 2CZLA 3S9MC 2A5SA 3E3KA 1A54A 4PDDA 2RC9A 3THIA 1JW4A 3CI8A 4N91A 1MXXA 5F7VA 1OIBA 2QPQA 2FNCA 4DZ1A 1XC1A 1UTHB 2GH9A 2ZYMA 3MSTA 4OYVA 2V3TA 3D4GA 3FVNA 3T9VA 5TP9B 4R6YA 1MM7A 3TCHA 4LA9A 4HCYA 3ZS6A 1NH8A 3FASA 1FPDA 4OVPA 1WDNA 1FQCA 5I57B 4GX3A 4ELRA 2LAOA 4QSCA 4BDOA 4F29A 3OD7A 2XXYA 4I9DA 4FECA 3VVEA 3GBBA 1SI0A 1Y4CA 1I6BA 2OJTA 4F1VA 2B3FA 3VFJA 4MEVA 5DVFA 4IGRA 4GVOA 3IFCA 4ZEDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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