2GHBA

Thermotoga maritima maltotriose binding protein, ligand free form
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
373
structure length
373
Chain Sequence
QPKLTIWCSEKQVDILQKLGEEFKAKYGVEVEVQYVNFQDIKSKFLTAAPEGQGADIIVGAHDWVGELAVNGLIEPIPNFSDLKNFYETALNAFSYGGKLYGIPYAMEAIALIYNKDYVPEPPKTMDELIEIAKQIDEEFGGEVRGFITSAAEFYYIAPFIFGYGGYVFKQTEKGLDVNDIGLANEGAIKGVKLLKRLVDEGILDPSDNYQIMDSMFREGQAAMIINGPWAIKAYKDAGIDYGVAPIPDLEPGVPARPFVGVQGFMVNAKSPNKLLAIEFLTSFIAKKETMYRIYLGDPRLPSRKDVLELVKDNPDVVGFTLSAANGIPMPNVPQMAAVWAAMNDALNLVVNGKATVEEALKNAVERIKAQIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title T. maritima maltotriose binding protein open form
rcsb
molecule keywords maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein
molecule tags Sugar binding protein
source organism Thermotoga maritima
total genus 119
structure length 373
sequence length 373
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ghbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ghbA01
2REGA 1DSNA 1NNKA 2F6GA 3JV9A 2HZKA 1R6ZA 4R9GA 3PPNA 4YICA 1LFGA 2NUVA 2Z8FA 2M8CA 4QF9A 1I69A 1MQDA 2G93A 1FQAA 2O7IA 4H1XA 1R1NA 1OLAA 4NF6B 2G29A 3DP6A 2IA4A 1XVXA 3IK6B 5I2NB 5J1DA 4GOTA 1LFHA 1R9LA 3U92A 5AA4B 4YB6A 1IXGA 1PDAA 2THIA 4MH5A 5K2XA 1MQHA 5KCJA 3U8QA 3OSRA 4EF1A 3FD3A 2ZMBA 1NNPA 4PETA 5H8FB 3VDFA 1WVJA 1A7LA 4OFLA 2OLBA 2ZNUA 3B6WA 1XOCA 2F7CA 4RPOA 2VHAA 3V89B 4GIZA 3FV1A 1MY1A 4JWXA 5L8DA 1ZU0A 3IO6A 1GV8A 2OZZA 3IOTA 3KSJA 2UYEA 4R74A 1URGA 4I8CA 4HW8A 2QPQA 1MPBA 1USYH 1P1QA 3HO7A 4R73A 2H9BA 3ZSFA 3TQLA 4YU0A 1IITA 1RYOA 4DXBA 1GGGA 4OXVA 3C35A 3GBBA 5KZTA 4GL0A 4L17A 1PBPA 1ZTYA 4GQOA 4DXCA 4EQ9A 2I58A 4YMBA 3U72A 2RINA 3KN3A 4JB7A 1R9QA 4OETA 4XKRA 1JW4A 1P99A 4U23A 3IB0A 1B46A 3H4ZA 3PUWE 2Q9TA 1SW2A 2D5WA 2ANJA 1ZIUA 3MVZA 2V25A 3FJGA 3PMVA 4ZEIA 3S9LC 4F18A 3TDJA 1UIVA 1JEUA 3KOTA 4NMYA 4KFQA 2ABHA 2O6AA 3RN8A 4P11A 3DELB 4U4XA 2ZNTA 3CFZA 1S50A 2DOJA 1D3KA 4IY6A 3EF7A 3K6VA 2P2AA 4O3AA 3MAMA 1ZBMA 4ZZAA 3LR1A 5ICQA 4G77A 3TEPA 1BTJA 2GRVA 1FTJA 4FEBA 1MXZA 2WKYA 1QULA 4HTGA 3EN3A 4ND9A 1I6AA 4LATA 3TCFA 3KBRA 4XTCQ 1A8EA 4U1OA 4GXAA 4Q0CA 4BDNA 1SI1A 3I5OA 1NNTA 3MC2A 4RNSA 2A5TA 2ONKE 2CMOA 2B65A 1LAXA 3OEKA 3DP8A 4ZE9A 3MZ9A 4QSDA 5H8SA 5A5XA 1LAHE 4DDDA 1PB8A 3K6UA 3FXRA 4BDQA 1BKAA 3TTLA 4G8MA 4WKMA 1XVYA 1OQGA 4GD5A 1P1NA 3IB1A 1II5A 3T9HB 1PB7A 4IO4A 2YPNA 1JVXA 3ZKKA 1OIBA 2B3FA 3E3KA 2I4BA 4WEPA 2NWJA 2Q89A 2OWTA 3O2AA 1ELJA 4I9DA 1US5A 4MFIA 3OENA 1LSTA 3SETA 1OQHA 3C33A 3Q29A 2HAUA 2KLFA 4LA9A 1D9YA 3OO7A 4WXJA 4YKPA 3DP4A 3TELA 3HHFA 4POXA 5I58A 2D21A 5ITPA 1EZ9A 5FHMA 5L9OA 1SBPA 3IX1A 3MP1A 1TT1A 1DMBA 1MXUA 3K01A 4KQPA 3CG1A 2O51A 3K00A 4KYSA 1B2HA 2NOOA 1D9VA 3EHSA 3LBSA 2QMWA 4M1VA 5I59B 1M5DA 5DYHA 1MXYA 1N7XA 4ZDMA 4N6PA 5FTIA 3SEVA 1BP5A 3HHGA 5CM6A 2DXRA 2F78A 1FQFA 4F3GA 4ONYA 4LONB 3ODBA 4QHQA 1RKMA 4NF6A 4X9TA 3KJ7A 2YJPA 1H44A 1B3HA 5I2NA 2ZYOA 4MF3A 5JK4A 4G4PA 4GLIA 4LVQA 3Q26A 2VOZA 3FXQA 5AA4A 1FTKA 4LUBA 4TQUQ 3H6UA 5CBSA 1B05A 1IUDA 5TU0A 2DWIA 1M5FA 3K4UA 1A55A 1YCJA 4F1UA 2DS9A 5H8FA 4KCDA 1B6HA 1MY2A 2F97A 1QUKA 2I3WA 4U21A 4QSCA 1USYE 4C1UA 2DSFA 4KCCA 5H8HB 1A99A 4RJZA 5H8NB 2XXYA 3CFXA 3UIFA 2DVCA 2DXYA 2XX9A 1XS5A 3S9EA 4NEDA 2ESNA 1N84A 4KYDA 3E9XA 3CI8A 1N3XA 5I2KB 2VGQA 3H6TA 2Q2CA 1L5TA 2PX1A 1MY4A 3FVNA 3QAXA 1M5CA 4ZEFA 3OXNA 4H6DA 5AE4A 4IB2A 3KJTA 1TXFA 2ZYMA 4KPTA 4ELPA 4GRKA 1B7ZA 4G68C 3V8XB 2H98A 3IB2A 3RTFB 4DXUA 3O6HA 2ZXTA 1MQJA 4R75A 2O68A 4MLQA 1TFDA 2PT1A 4I62A 1B3GA 4BDOA 1FQDA 2DYXA 4F2OA 1HSJA 5HPQA 1OVTA 3UGWA 3IOUA 2DE3A 1Y9UA 4YAHX 4QFLA 5CMCA 1A40A 4AQ4A 3TMGA 2O1MA 5IKBA 2DWJA 1OVBA 3C32A 4F29A 2ONRA 2QS1A 4R6HA 1NL5A 2R71A 2XXQA 4G8HA 3H6VA 1SW1A 4Q5TA 1LBCA 4IO3A 5H8QB 3TTNA 1YTVA 3KSXA 1B9JA 1LB9A 1H76A 2ALUA 4C0RA 3RGYA 3KEIA 3K1MA 1SW4A 3PGFA 4YB7A 3UORA 2RKMA 4RXLA 3I3VA 1B5JA 2D3IA 2UVHA 1AH5A 2O69A 5DEXB 3QK6A 3RY3A 1JW1A 1UTBB 5EHSA 4OTEA 4F19A 3E13X 4F39A 4KD5A 2RC9A 3D4GA 1JETA 1PC3A 1CE2A 5L9MA 5DT6A 4RYAA 3V83A 1EZOA 2I0CA 1ZMGA 1AMFA 2GHBA 3VLVA 4OEUA 5I56B 3S2VA 3WAFA 3FJMA 1N76A 2CZLA 4OESA 1Z7NE 3MBPA 3TPAA 1B7UA 1D4NA 3CIJA 3K6XA 3PU5A 3U93A 1LCFA 1POY1 3H3GA 4RY1A 4PFYA 1OLCA 4I1DA 1IZ1A 3MP6A 4ECFA 3KG2A 3KGCA 2PVUA 1WODA 2Y7RA 3M3LA 5JEIA 5B7DA 2O7UA 3R7XA 1MQGA 4GF8A 3N26A 1B32A 1IXCA 4YZZA 2QJEA 1Y1MA 3O66A 4OQOA 3PPQA 1Q1KA 3OO6A 1P1OA 4NWCA 4H5FA 3V5AA 1AOVA 4HS7A 1SDXA 1FTOA 3G3KA 5I59A 3ILUB 4IO2A 2QSXA 4LQ2A 1Y3NA 4R2BA 5DVFA 3PPPA 4DE8A 3FZVA 4NF8B 3KN8A 4F22A 3CRBA 1MH4A 4H8JA 3KOSA 4OFJA 1PB9A 2B3BA 3PMWA 3T96B 4ZZEA 4OEVA 3U1OA 2I0BA 5KDTB 3B6TA 3RUMA 3KN7A 1VE4A 4UACA 3VVFA 3EQ1A 2QS3A 4ISUA 5ELVA 2Y7KA 4OFOA 4JXIA 4ESWA 1EH3A 2XXIA 2H5YA 1MXXA 3PMXA 3VFJA 3IL1B 3MVYA 5CMBA 1POTA 3TTMA 3P7IA 4YB5A 2AL4A 1ANFA 4EQ7A 4H67A 1Y20A 3SEUA 2UXAA 5H8HA 5H8NA 3K1NA 1NFTA 4LP2B 4OVJA 5CBRA 3SDFA 3C34A 1QKAA 4H8IA 3IOVA 5AA2B 2PBWA 4GVOA 2RC7A 3C36A 5I2KA 2REJA 2XXVA 4XKQA 4XKNA 2I3VA 3R6UA 3Q27A 1PBQA 5AA1A 1J1NA 3OO9A 4X1BA 3GXAA 1GTKA 4G2ZA 4PFTA 3K1PA 1XT8A 3N6UA 4XKPA 3EPEA 2XXXA 2H99A 5TP9B 3PD9A 1UTHB 1XC1A 3W9WA 3PV0E 4X1DA 4H65A 5IAIA 4NF5B 1VSOA 1B40A 2NVUB 1SW5A 3C4MA 3K0VA 2W7YA 1O7TA 3MQ9A 3N5LA 3MP8A 1EU8A 2Z8DA 4QFKA 1YPNA 4OENA 3S9NC 4M4GA 4LZ5A 5I57B 3RTWB 3T9VA 3M3FA 4E0XA 5JTYB 3I6VA 1MS7A 4YMAA 4F3PA 2F7BA 3MZ1A 5AA3A 2FYIA 1MPCA 2AIXA 4IO7A 3EHTA 5M2VA 4G68B 5CRYA 1AIVA 4G8NA 3IORA 1B4HA 3K2DA 1B1XA 4ELQA 1HSLA 3N6TA 3O28A 3D4CA 3O97A 3L6GA 4U22A 1N3WA 5DTBA 3G3GA 3QUJA 4ELRA 2XX7A 5H8QA 3QYTA 1IQ7A 4FATA 5ICTA 4F31B 5TPAB 2Q8JA 3JYRA 4PP0A 2XXWA 1GR2A 1N7WA 4KYEA 1VFDA 4ZEKA 1NKXA 1MG1A 1B0LA 3FVKA 4LZ8A 3ONMA 2OBGA 2VD2A 2QRYA 2V3TA 4N13A 4Z0IA 2HEUA 4DLDA 2Q2AA 3S9MC 5DEXA 1SVXB 2XD2A 4F3BA 1UTBA 1SQYA 1MQIA 1N0TA 3H7MA 1GVCA 1NMUA 4NTLA 4FIMA 4YKKA 4PQJA 1NNFA 5HBCA 3EHUA 5I56A 3HN0A 2A5SA 4ZS9A 2Z8EA 4TLMB 1FQCA 1YAEA 1VR5A 3G7WA 3FASA 3TTRA 3LSWA 2Q88A 1LAFE 4ZEBA 3T93B 5CI5A 3S4UA 2AYSA 4XXUA 3FUZA 3LSLA 3C31A 3FATA 4OHNA 1Q35A 2E1SA 3UK4A 1MDP1 2LAOA 4OYVA 3IAZA 3MPLA 2RCAA 4JWOA 4FJPA 1EZPA 3E4RA 3VXBA 2FA7A 3RT8A 1LFIA 1A8FA 3SEWA 1SYHA 1Y3PA 1BIYA 2E0SA 4PE5B 3SKPA 4OWDA 3H06B 1T0KA 4IGRA 4GL8A 1QVSA 2PYYA 4ESXA 1JQFA 1MDQA 4U2RA 4QFOA 3VVDA 3QIMA 2RF1A 1DOTA 3VVEA 2XXTA 3MZBA 4OMBA 4DIGA 4IO6A 1B51A 4EXKA 1H45A 2UYFA 2OJTA 1B0HA 2XXPA 2P1SA 4QFNA 1FTLA 2QS2A 3CSGA 3OELA 1NH7A 1LAGE 2OWSA 4AB5A 5AA2D 4NF8A 2I6EA 1RYXA 1FQBA 1LBBA 3ECRA 4EDPA 3PD8A 3PUZE 2I4CA 2Z22A 1O63A 3SEYA 5KDTA 1JEVA 3G3HA 1FQEA 3IJOB 1P1UA 3VV5A 4U1ZA 4F1VA 1LLSA 3RQTA 3OMBA 3USDA 4PFUA 3R26A 3MVWA 1ZKBA 4NF4B 1F9BA 3MW0A 3A3UA 3MVXA 1IXIA 4AB6A 3ZKLA 2F7AA 3W15C 4R6KA 2AL5A 2VD3A 5CC2A 3CFLA 1B3FA 4JSOA 2XXRA 4FECA 3TTKA 2Y84A 3TAJA 3THIA 3JZJA 1LGBC 2RCBA 1AL3A 3IOWA 5AA2A 2OCUA 1JNFA 1B4ZA 3SESA 2X7QA 2QL3A 2YLNA 3OOAA 3SERA 5ISUA 3TFLA 2H4IA 3N94A 4OZ9A 3BKIB 4TLLB 4BDMA 1URSA 5B70A 2DE4A 5TP9A 1DTGA 3GLBA 3G3IA 1UTHA 3C9HA 4H5GA 2DE2A 1P1WA 1B5IA 4NF5A 2HQ0A 1KWHA 3TYHA 3TUSA 4RPNA 4R9FA 4BDRA 2GHAA 3FIRA 3CG3A 1I6BA 4GWOA 5LOMA 2HZLA 3HSTA 3Q28A 3O6IA 3UN6A 4EXLA 2UVIA 2F6PA 3ILTB 3OEMA 2XX8A 3BBRA 3K02A 5I57A 2I49A 3CVGA 5F1QA 3IO4A 5JTYA 4K3FA 2F5XA 3A09A 1B52A 2O84X 3HCQA 4WEDA 5HM4B 2F8DA 4P0IA 1JW5A 4R6YA 3PUYE 1B3EA 3OD7A 3VE1B 4E0WA 4G68A 1CB6A 2GH9A 3TKDA 1Y1ZA 2NXOA 3B6QA 1Y4TA 4JBZA 4U4SA 2Z23A 1WDNA 3UA8A 4NWDA 4QFPA 3KZGA 4JSDA 4FE8A 1HSEA 1FCKA 1H43A 5FHOA 3MPKA 2HCAA 5FTHA 3MWBA 3O9PA 3DLNA 1QW0A 3FVGA 5TPAA 1ZLQA 3IJXB 1OMPA 5KCJB 3WAEA 3LC8A 2V3UA 2FNCA 1S9TA 2XXUA 3OO8A 2IEEA 2QS4A 4IO5A 3MUQA 2V93A 2XD3A 1M5BA 1B3LA 3CSBA 1QUIA 3ZS6A 2HFBA 3RPWA 3BFUA 1SYIA 3Q25A 4N07A 1MRPA 4H0WA 5I84A 4POWA 3H6WA 3T9UA 5DVIA 3G3JA 2VP1A 2PT2A 2ZYKA 4QSEA 3O29A 3M3KA 3DM0A 4F3SA 5ITOA 1MY0A 4JDFA 4BLAA 3K6WA 3QXMA 3PPRA 3MJNA 5BWJA 4LQ5A 2PMSA 1N04A 5K2YA 3TODA 2RC8A 1MM7A 5BUUA 1B58A 1Y4CA 4FAJA 3CR9A 4O3BA 1IXHA 4DCXA 1O64A 3OSQA 5CMMA 3IR1A 3LSXA 1FW0A 2XHDA 3RLFE 3RNNA 4Z7EA 1QUJA 3F11A 3FXUA 1Z7ME 2ONSA 4JWYA 1MPDA 5L9SA 1MH3A 1BLFA 2F35A 3VXCA 3VLUA 1H3DA 2QMXA 2ZNSA 1IEJA 3B7DA 3T22A 3GZGA 1LB8A 1JVYA 4YKJA 2R6GE 1DPEA 1MY3A 4QRZA 2DWAA 3FGSA 1MM6A 2DP8A 4THIA 3O6GA 3PPOA 1US4A 3M8UA 3VLWA 1IIWA 2F36A 4F2QA 3TCHA 4EF2A 3AXFA 3FVOA 5F7VA 4R2FA 4DZ1A 2P0SA 1ATGA 3SEXA 2HXWA 4X48A 1DPPA 2O1LA 3TQWA 4FORA 4MLVA 1XHYA 4C1TA 2X7PA 3PUVE 4F1YA 4MBPA 1URDA 1TWYA 3U94A 4GXSB 4DCYA 4KR5A 4NF4A 3A3CA 3GBAA 2X26A 4P0GA 2UVGA 3RT6B 4HCYA 4HCWA 3G3FA 3QSLA 4O3CA 2A5TB 4KHZE 3PUXE 1QKBA 4YKIA 1I6QA 3UP9A 2BJJX 3FJ7A 5A5XB 3T66A 2V84A 2OK2A 1PEBA 3T9XB 4PFWA 1FTMA 2HAVA 1SI0A 2R9JA 3BFTA 1QJMA 1VFEA 1B7HA 3KFMA 5CMKA 3QUFA 2GFEA 3TCGA 4ZECA 1B5HA 3HV1A 1ZJLA 2ZYNA 2Y7IA 4FEDA 1B1HA 4Q30B 4NE4A 4ZE8A 4ZEDA 2V3QA 4UA8A 1DTZA 1Y3QA 5FHNA 5EYFA 3W9VA 2DVZA 2H25A 4RK9A 1A54A 2XXHA 5EHMA 1NH8A 4R72A 2DQVA 4TOZA 4XIGQ 4EUOA 5DVJA 4BDLA 4LZ7A 4Q8RA 1S7YA 4EQBA 1M5EA 5I58B 3L6HA 3FV2A 2Y7PA 4GFRA 1SD3A 4ELOA 4RA1A 1LCTA 4KI0E 3TZAA 1UIUA 4RK2A 2I48A 2F34A 1MXVA 1TFAA 2DWHA 3HPIA 3LSFB 4IGTA 2UVJA 2Y7WA 1MXWA 3LUYA 3H03A 4OERA 4IY5A 1UQWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2REGA 1DSNA 1NNKA 2F6GA 3JV9A 2HZKA 1R6ZA 2JJKA 4R9GA 3PPNA 4YICA 1LFGA 2NUVA 2Z8FA 2M8CA 4QF9A 1I69A 1MQDA 2G93A 1FQAA 2O7IA 4H1XA 4PAFA 1R1NA 1OLAA 4MCOA 4NF6B 2G29A 3DP6A 1NUYA 2IA4A 1XVXA 3IK6B 5I2NB 4O7IA 5J1DA 4GOTA 1LFHA 1R9LA 3U92A 5AA4B 4YB6A 1IXGA 1PDAA 2CZKA 2THIA 4MH5A 5K2XA 1MQHA 5KCJA 3U8QA 3OSRA 4EF1A 3FD3A 2ZMBA 1NNPA 4PETA 4XF5A 5H8FB 4X04A 3VDFA 1WVJA 1A7LA 4OFLA 2OLBA 2ZNUA 3B6WA 4PF6A 1XOCA 4IR8A 2F7CA 4RPOA 5ET6A 5EQAA 2VHAA 4PBHA 3V89B 4GBWA 4I3EA 4GIZA 3FV1A 1MY1A 4JWXA 5L8DA 1ZU0A 3IO6A 1GV8A 2OZZA 4NF0A 3IOTA 3KSJA 2UYEA 4R74A 1URGA 4I8CA 4HW8A 1CNQA 2QPQA 1MPBA 1USYH 1P1QA 4P56A 3HO7A 4R73A 2H9BA 3EKIA 3ZSFA 3TQLA 4YU0A 1IITA 1YZ0A 1RYOA 4DXBA 4NG7A 2Q74A 1GGGA 4OXVA 4N81A 3C35A 3GBBA 4X8RA 5KZTA 1FBPA 4GL0A 4L17A 1SPIA 1PBPA 1ZTYA 1NV4A 4GQOA 4DXCA 4PDHA 1NUXA 4EQ9A 2I58A 4YMBA 3U72A 2RINA 3KN3A 4JB7A 1R9QA 4OETA 4XKRA 1JW4A 1P99A 2WX9A 4U23A 4HE0A 3IB0A 1YYZA 1B46A 3H4ZA 3PUWE 1LBXA 2Q9TA 1SW2A 2D5WA 2ANJA 1ZIUA 3MVZA 3CHGA 2QVRA 2V25A 3FJGA 3PMVA 4ZEIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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