2H5YA

Crystallographic structure of the molybdate-binding protein of xanthomonas citri at 1.7 ang resolution bound to molybdate
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
232
structure length
232
Chain Sequence
TAPVTVFAAASLKESMDEAATAYEKATGTPVRVSYAASSALARQIEQGAPADVFLSADLEWMDYLQQHGLVLPAQRHNLLGNTLVLVAPASSKLRVDPRAPGAIAKALGENGRLAVGQTASVPAGKYAAAALRKLGQWDSVSNRLAESESVRAALMLVSRGEAPLGIVYGSDARADAKVRVVATFPDDSHDAIVYPVAALKNSNNPATAAFVSWLGSKPAKAIFARRGFSLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystallization, data collection and phasing of the molybdate-binding protein of the phytopathogen Xanthomonas axonopodis pv. citri
pubmed doi rcsb
molecule keywords Molybdate-binding periplasmic protein
molecule tags Metal transport
source organism Xanthomonas axonopodis pv. citri
total genus 75
structure length 232
sequence length 232
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2h5yA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2h5yA02
4YU0A 4EF2A 4GD5A 3SEXA 4L17A 1YTVA 3QUFA 5FHMA 1MXYA 2UVGA 5HBCA 3C34A 1B1HA 3VXCA 5BWJA 1IXHA 1GV8A 3QIMA 1PC3A 2QS2A 1Y3NA 3FJMA 5H8NB 4P0GA 4M4GA 1QKAA 4NF6A 2I3VA 2YLNA 1N3WA 1A54A 3E13X 4IGRA 1QUIA 4YKPA 1GR2A 2G29A 2NWJA 3EPEA 4NF8A 4NF4B 3K1PA 3ZSFA 3Q26A 4DXBA 4QFOA 3MC2A 4OMBA 4AQ4A 2QL3A 3B7DA 3JZJA 5KCJA 2I0BA 2OZZA 2X7QA 4JBZA 3UP9A 3QK6A 3K01A 1TT1A 4R9FA 4DXUA 3VDFA 1SW2A 2XXQA 5H8FB 3T66A 3FXRA 1MQDA 3M3LA 1SW4A 3G7WA 3TMGA 3PUYE 3MW0A 3BBRA 1XC1A 1L5TA 5DVFA 2I49A 5I56B 4OVJA 3RN8A 3TEPA 3E4RA 2CZLA 3HN0A 3O6GA 3D4GA 4H8IA 4ELRA 3MPKA 1A8FA 4F3GA 2RINA 2A5TA 1B3LA 4XIGQ 1P1WA 3FZVA 3VFJA 3JV9A 4ESXA 3DP8A 3UK4A 2H5YA 1DOTA 5TPAA 4HS7A 1LAFE 1UIUA 4OFOA 3B6QA 5A5XB 3BKIB 1Q35A 1NH8A 4MBPA 3G3KA 3OO8A 5AA3A 4Q5TA 3FXQA 3E9XA 1AL3A 4BDRA 5CBRA 4EF1A 2O1LA 1A7LA 2Y7WA 3FVOA 2AYSA 3I6VA 4XXUA 2X26A 3TTRA 1II5A 4OESA 4U1OA 2Z22A 3D4CA 1YCJA 4NE4A 1NKXA 3DM0A 4F3SA 5KDTB 4IB2A 1MY1A 1ZIUA 2VP1A 3MWBA 3KFMA 5ISUA 3QUJA 3FJGA 4LZ7A 1EU8A 4XKRA 3W9VA 2FYIA 5H8QA 3RPWA 5CBSA 3DP4A 1VFDA 2XXUA 3HPIA 3IJXB 2XXYA 4KFQA 3MVZA 5ELVA 1R1NA 4K3FA 1SQYA 3U1OA 4YB7A 3KN7A 4H5GA 3RY3A 2GRVA 4KYDA 4DCYA 3O29A 4I8CA 4YICA 3K6VA 1URDA 2XX8A 1I69A 1Y1MA 2UVHA 4OYVA 3SERA 4ELPA 4KD5A 4ZS9A 4OEUA 4OENA 4H65A 4OZ9A 2V3QA 2ALUA 1SI0A 4RXLA 3R26A 3H6VA 4ELQA 2R71A 1PDAA 3G3GA 2DXRA 2YPNA 3WAFA 3PPNA 4TLLB 3A09A 3W15C 5DTBA 1N04A 5H8NA 4FATA 4JWXA 1FTMA 3C31A 2B3BA 4U2RA 1HSJA 2PT2A 1POTA 2XXHA 1LAGE 3OENA 1JW5A 1MQJA 5HPQA 4JSOA 2DWIA 5L9MA 3FVGA 3QAXA 3S9NC 3RT8A 1BLFA 1OLAA 4PETA 4U1ZA 2I3WA 3PMWA 3TKDA 1EZ9A 1LFGA 4N13A 4DCXA 3CSGA 4GXAA 4R6YA 3MZBA 3CFLA 1IXIA 3MVWA 2DWAA 3PV0E 5TU0A 4PFTA 3L6HA 4IGTA 2Q88A 2VHAA 3HHFA 2XX7A 5ICQA 4IO2A 3OO7A 2Q2CA 2HAVA 1B4ZA 3T22A 2V3UA 5I56A 4OETA 4F19A 3RLFE 2DOJA 4XKNA 1I6BA 4Q8RA 1A8EA 4ONYA 4NEDA 3IB1A 3MBPA 3UN6A 3H7MA 1QULA 4G4PA 4KR5A 4LQ5A 5F1QA 2F5XA 1QW0A 3OEKA 3C36A 5JEIA 4IO7A 3ZS6A 2O51A 1JVXA 2DP8A 5A5XA 3F11A 1R9LA 1EZPA 3TTKA 1SD3A 5JTYB 4GOTA 4YMAA 3GLBA 1IXGA 4P0IA 3SETA 1NFTA 5L9OA 1B7HA 2H25A 4G68B 4BDQA 3MAMA 3C32A 2AIXA 3VE1B 1Z7NE 5I59B 2DYXA 3FJ7A 2DS9A 1JVYA 5AA4B 3LSWA 4EDPA 2A5TB 4F2QA 1GGGA 3KJ7A 4BDMA 4EXLA 5KDTA 2DQVA 3FUZA 1WODA 1LB8A 2XXRA 2UVJA 3PMXA 3U92A 1MXWA 1J1NA 5AE4A 3LUYA 4U4XA 1FTOA 1OMPA 2B65A 3OMBA 4PQJA 1O7TA 5FTHA 3CFXA 5DEXB 1D3KA 1QUJA 2WKYA 4G68C 3T9UA 3K02A 5DYHA 1Z7ME 3LSFB 2H9BA 4EQBA 1MXVA 2V3TA 1FQCA 4TOZA 2ABHA 4NTLA 1NNPA 3SKPA 2O69A 1MY3A 1B6HA 3S2VA 3CVGA 1AH5A 1LB9A 3ODBA 4NWCA 3I3VA 2I4CA 3Q28A 3G3IA 3EHUA 4YB6A 5LOMA 1N0TA 1DTGA 1HSLA 1B5HA 4GIZA 1A55A 2B3FA 3I5OA 4AB6A 4ZEIA 2VD3A 3TQLA 3KN8A 3E3KA 2PT1A 2ZNTA 3MZ1A 2HFBA 2QS3A 1H44A 3SEWA 3K4UA 1P1OA 3GBAA 4KYSA 3N6UA 1LGBC 4DXCA 3ONMA 5H8HB 1IQ7A 4F31B 3UGWA 4HW8A 1I6QA 2RF1A 1FTLA 1USYE 2CMOA 1URSA 3OEMA 4DIGA 4G8HA 5TP9B 2XXPA 1D4NA 4JSDA 1B5IA 4I9DA 3Q29A 4QFLA 3OD7A 1GVCA 4LZ5A 2QMXA 1B51A 1NL5A 4JDFA 4ZECA 3VV5A 3HSTA 2DSFA 2QS4A 1N3XA 2ONKE 2O84X 4KYEA 1AOVA 4ZZAA 3U93A 3MUQA 3SEVA 3KSXA 3S4UA 3EF7A 3PMVA 4NWDA 2DWHA 1BIYA 2GFEA 3PUWE 1PB7A 4U23A 5EHSA 1MY4A 1ZKBA 4RJZA 3U8QA 3IORA 4YAHX 2M8CA 2E1SA 3IOWA 4PFWA 4YKIA 1IUDA 1B2HA 4DE8A 5DVIA 4Z7EA 1MY2A 4IY5A 4F29A 2I58A 5JTYA 3KJTA 2HEUA 3HHGA 1IIWA 1DTZA 4G68A 5K2YA 4XTCQ 2A5SA 4FEDA 5I59A 2QSXA 4RPNA 1M5BA 2I0CA 2QRYA 2IEEA 3JYRA 3R6UA 3PGFA 5AA4A 1TXFA 4H1XA 3G3JA 3TQWA 3ZKKA 4OHNA 5L9SA 4FEBA 1M5EA 1B52A 4FAJA 3OSQA 3BFTA 1MXZA 1MPDA 1LAXA 4G77A 4ZEKA 1FTJA 2H4IA 3KOTA 4KPTA 1IITA 3CIJA 3OO6A 5FHNA 3CG3A 2HXWA 4BLAA 4PP0A 4GLIA 5DEXA 3THIA 1JETA 4MF3A 1H76A 4QHQA 1OVTA 1ELJA 2ANJA 4DZ1A 1SVXB 2H98A 5FHOA 4EQ7A 1R9QA 3H3GA 3ECRA 3C4MA 4ZEBA 3FVKA 1MQHA 3Q27A 3U72A 1TFDA 2XXWA 3EHTA 4ZDMA 3IK6B 4H5FA 1B32A 1Y3PA 2ONSA 4ZE9A 2REGA 4OFJA 2Z23A 1SYIA 5CC2A 3TPAA 3PD8A 1B0HA 1WVJA 3MVXA 2ZYKA 1MXUA 3PU5A 2FA7A 2QMWA 2ONRA 5H8HA 3TTNA 3KN3A 3IR1A 3TODA 1Y4TA 5I2KB 1YPNA 3MPLA 4ELOA 1Q1KA 4QFKA 1N84A 1MG1A 1MPCA 4U21A 5TP9A 3S9MC 1B3GA 2OWTA 3UORA 4GRKA 4IO6A 4POWA 4HCWA 2XXIA 4XKQA 4R74A 1MY0A 1B3EA 3H6UA 3LC8A 2F34A 4Z0IA 1P1NA 3N94A 3CFZA 4MFIA 3IO4A 2DVCA 3DELB 4RYAA 4R6KA 3T9VA 4F1VA 2F6GA 3IOVA 1OQHA 2HQ0A 1MM6A 3FXUA 4F3BA 1GTKA 1FCKA 4GF8A 3O97A 1A40A 1D9YA 3CI8A 1SDXA 4WEDA 2ZMBA 4X1DA 3N6TA 2G93A 3H03A 2RC9A 2Q9TA 4KCDA 4YKJA 3K1NA 2PX1A 1B40A 4LA9A 5CMBA 4NF5B 5HM4B 4H8JA 3EN3A 5ICTA 1EZOA 2ZYMA 1PB8A 1NNTA 5I84A 3TFLA 5B70A 5CM6A 2HAUA 5CMCA 3RUMA 4PFUA 1IZ1A 1OIBA 3QSLA 2RKMA 1MXXA 2O1MA 2PVUA 2PYYA 4WEPA 4WKMA 5K2XA 1XHYA 1QUKA 3O66A 4O3BA 4Q0CA 2D21A 2RC8A 2F97A 4YZZA 3H4ZA 3P7IA 4F18A 5DT6A 1QKBA 5IAIA 2OWSA 1LBCA 4YB5A 4TLMB 3VVDA 4GFRA 3IB0A 2ZNSA 4AB5A 3V8XB 1Y3QA 1MRPA 2F35A 3OELA 1R6ZA 4THIA 2ZXTA 3K6UA 3KEIA 2W7YA 4C1TA 4P11A 4MLVA 2P0SA 2NUVA 1UQWA 3OO9A 3RGYA 3USDA 3TCFA 1MH3A 5CMKA 2F7BA 2E0SA 3VLVA 1DSNA 3SESA 1B46A 3U94A 3SEYA 1RKMA 4EUOA 4MLQA 2XXVA 3M3FA 4C1UA 2OK2A 2OCUA 3MP1A 1SBPA 1USYH 1URGA 1ZTYA 4LP2B 2GHAA 1MM7A 2XXXA 3OOAA 2Q8JA 3V83A 5CI5A 1JNFA 3CR9A 1B58A 3PUVE 4ECFA 4HTGA 4RPOA 3B6WA 4F2OA 5I2KA 2F7CA 4UACA 4OQOA 3C9HA 3KBRA 4OWDA 4O3AA 4XKPA 3TCHA 4R6HA 1XVXA 2Q2AA 4PE5B 3PUXE 1D9VA 4F3PA 2REJA 2ZYOA 1P1UA 2PBWA 1NNFA 5ITOA 1LFIA 1M5CA 1UTHB 4NMYA 1B7ZA 1FW0A 3UIFA 4F1YA 1OLCA 3HO7A 1SW5A 2R6GE 1VE4A 1QJMA 3ILUB 1N7WA 1M5DA 3RT6B 1Y9UA 3FV2A 2RCBA 3V89B 2DVZA 2VD2A 3R7XA 4M1VA 4G2ZA 1YAEA 1BP5A 4OEVA 3TTLA 1MDP1 2HZKA 3QYTA 4QSCA 1F9BA 1B05A 3VVFA 2DXYA 4ESWA 2DE2A 2ZNUA 3RNNA 3O28A 1QVSA 3S9LC 3PD9A 3VVEA 5FTIA 3IL1B 4G8MA 4ZE8A 4NF5A 2DE4A 3K2DA 3CSBA 4R2BA 4PFYA 2O6AA 1SYHA 3MQ9A 2NVUB 5CRYA 3IAZA 4H67A 3W9WA 2V93A 3L6GA 3IO6A 1US4A 4I62A 2Y7RA 1UIVA 1NMUA 5AA2D 5ITPA 2F7AA 3SEUA 1IXCA 1O64A 2ZYNA 4KHZE 1FQEA 4KQPA 4X1BA 2XD3A 2IA4A 2OJTA 3RTWB 3FVNA 2XX9A 2H99A 3GZGA 5BUUA 2I4BA 4F22A 5L8DA 3M8UA 2DWJA 4LZ8A 1CB6A 4E0WA 3O2AA 2UYFA 5M2VA 1UTBA 1LFHA 1NNKA 3IB2A 5IKBA 1FQBA 4JWOA 4MH5A 3WAEA 5I57B 3KG2A 4QRZA 1SW1A 1B0LA 4FJPA 4FE8A 1NH7A 5AA2B 4GL0A 1T0KA 2P1SA 4H0WA 2KLFA 3V5AA 3RQTA 3GBBA 2V84A 1MPBA 2UVIA 3T9XB 1TWYA 1ZJLA 3TDJA 1S50A 4JWYA 1XOCA 4Q30B 2Q89A 3HV1A 1XT8A 1Y1ZA 4IY6A 1B3HA 4R73A 2DE3A 3C33A 1DPPA 3H6TA 3CG1A 4LVQA 3PPPA 1LCFA 4X48A 1LCTA 2D3IA 1O63A 1B1XA 4LUBA 1MS7A 3QXMA 1JEVA 2AL4A 3M3KA 3IX1A 3FATA 3N26A 2Z8FA 3G3HA 2YJPA 3KZGA 1OQGA 2LAOA 3TTMA 4QF9A 3TYHA 4IO4A 3IOTA 2XD2A 5I2NB 3TUSA 4I1DA 3FASA 3PUZE 1UTHA 4EQ9A 4FECA 5I58A 1B5JA 3MZ9A 4YMBA 5H8SA 1WDNA 2RC7A 2QJEA 4KI0E 2O7IA 2X7PA 4QSEA 3FGSA 3ILTB 2NXOA 1VFEA 3IJOB 4RNSA 4JB7A 2D5WA 4QSDA 3Q25A 3T93B 4ZEFA 3TCGA 3LSLA 2QPQA 3ZKLA 4YKKA 4BDOA 3CRBA 2Y7PA 4BDNA 1FQFA 4RA1A 4N07A 2F78A 3KOSA 1PB9A 3N5LA 1H45A 1HSEA 2P2AA 2PMSA 3DLNA 4BDLA 1US5A 1B9JA 3PPQA 4GL8A 2O7UA 5AA1A 1FQAA 2F36A 4G8NA 1JW4A 4OXVA 3LBSA 2V25A 4JXIA 3B6TA 2Z8EA 4IO5A 4TQUQ 2HZLA 4QFPA 1PBQA 3G3FA 4C0RA 1JW1A 3MVYA 2UYEA 4LONB 4NF4A 1PEBA 5J1DA 5I57A 3C35A 1BTJA 5B7DA 1LLSA 1P1QA 4GWOA 3VLWA 3KSJA 4IO3A 5AA2A 3EHSA 5H8FA 2Y7KA 1EH3A 5CMMA 3PPRA 1B3FA 3RTFB 1XVYA 3O6IA 4LQ2A 3IOUA 1MH4A 3MP6A 4U4SA 2R9JA 2OBGA 3MP8A 4EXKA 1AIVA 4R2FA 4NF6B 2GHBA 1VR5A 1BKAA 4FORA 4OERA 1H3DA 3TELA 4R9GA 3UA8A 2HCAA 2Z8DA 2FNCA 3PPOA 2F8DA 1UTBB 4NF8B 2UXAA 4GVOA 1P99A 1RYXA 5KCJB 4H6DA 4FIMA 5DVJA 1B7UA 4HCYA 3LSXA 1N76A 3VXBA 1JQFA 3A3UA 3OSRA 5EHMA 4N6PA 2F6PA 3FIRA 5I2NA 4X9TA 3K6WA 2BJJX 1LAHE 4LATA 2OLBA 4RY1A 1ZLQA 4OFLA 2I48A 3K00A 4KCCA 1B4HA 2NOOA 3K0VA 2ESNA 1RYOA 4ND9A 3T96B 2O68A 3EQ1A 1Y20A 1ANFA 4ISUA 1ATGA 2RCAA 1ZU0A 4ZZEA 1LBBA 1S9TA 3LR1A 4E0XA 2XXTA 5TPAB 1DPEA 3FD3A 1SI1A 3HCQA 4R72A 1KWHA 2THIA 2QS1A 4GXSB 3A3CA 1PBPA 2VGQA 3H06B 4F39A 1FTKA 2AL5A 1MDQA 3MJNA 3SDFA 1TFAA 4RK9A 5JK4A 2I6EA 1OVBA 3FV1A 1CE2A 1I6AA 1MQGA 4R75A 5KZTA 5I58B 1LSTA 1A99A 2Y7IA 1H43A 4POXA 3KGCA 3O6HA 2VOZA 1FQDA 5EYFA 3K6XA 1ZMGA 1Y4CA 3VLUA 3BFUA 4UA8A 3H6WA 1S7YA 4GQOA 3O9PA 3S9EA 4OTEA 5F7VA 1DMBA 1IEJA 2Y84A 1XS5A 4F1UA 3TAJA 5H8QB 4U22A 3DP6A 4DLDA 1JEUA 2XHDA 4ZEDA 1VSOA 1MQIA 4RK2A 3T9HB 4DDDA 4WXJA 3TZAA 4QFNA 1AMFA 2GH9A 3OXNA 4O3CA 3K1MA 1M5FA 3AXFA 1N7XA 1ZBMA 1POY1 3GXAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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