2HAUA

Apo-human serum transferrin (non-glycosylated)
Total Genus 170
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
170
sequence length
676
structure length
676
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYDKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSDVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The Crystal Structure of Iron-free Human Serum Transferrin Provides Insight into Inter-lobe Communication and Receptor Binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
total genus 170
structure length 676
sequence length 676
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hauA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hauA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hauA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hauA03
2PT1A 4G68A 1B3EA 1GV8A 4ELQA 5TPAB 3TELA 1NFTA 3TYHA 3T9XB 3S9EA 1US4A 3KSXA 1QUIA 1XS5A 5CRYA 1IXGA 4L17A 2REJA 1QKBA 2ESNA 5EHMA 1QW0A 2Q89A 1LFHA 3LBSA 3H6UA 1R9LA 3OD7A 2A5TB 3G3IA 1H45A 3LSXA 1P1UA 2QRYA 3RQTA 1BLFA 2PX1A 1IIWA 1AMFA 3DM0A 3I5OA 1URSA 1ANFA 2VD3A 3CRBA 1UQWA 4XKQA 1XVYA 3SEXA 4GD5A 2RCAA 2ZXTA 2QS2A 3HPIA 4U2RA 3K6VA 3UK4A 3V83A 1P99A 2Z8DA 2ALUA 3VV5A 2YPNA 3TKDA 3H7MA 5ICTA 3ZS6A 1B7HA 2O1LA 5KCJB 1Y3PA 2XHDA 2XXIA 3O6IA 4KI0E 4R9FA 3VVEA 4HCYA 3ECRA 1ZMGA 3IB0A 3RNNA 1N3WA 1CB6A 4G2ZA 4ISUA 5AA3A 5I84A 2OWSA 4F1YA 1IZ1A 2RKMA 3WAEA 1B6HA 2DE2A 4XKRA 1LAGE 4O3AA 2QPQA 1KWHA 3H3GA 2I48A 2P0SA 4F29A 3BKIB 1OVBA 3D4GA 1JW5A 4R6YA 3H6VA 3SEVA 3GBAA 3C9HA 1I6QA 3OO8A 4U22A 4F2QA 4Q0CA 3PGFA 4DIGA 3PUWE 2DXRA 2HEUA 4ZE8A 3TTLA 3LSWA 2W7YA 3I6VA 2AL4A 1ELJA 3RPWA 4PP0A 5KDTA 3UN6A 2BJJX 4NEDA 4DXBA 2G93A 4R2FA 1B2HA 4LQ5A 4YMBA 1MQGA 4THIA 3CVGA 2F5XA 3DELB 5JTYA 4DLDA 4OWDA 4NMYA 1FQCA 1MY1A 4YB5A 3OENA 5B7DA 3QUFA 1N7XA 4TQUQ 5TPAA 4WEDA 3FIRA 3CR9A 1MM6A 3EF7A 1TFDA 2I0CA 4E0XA 1B3HA 1A8EA 4RY1A 3IJOB 2NUVA 2A5TA 2B3BA 4TLLB 3U72A 4GVOA 3FUZA 2XD3A 4KHZE 3MVYA 4OZ9A 3A09A 1YTVA 3FXUA 3AXFA 5AA1A 1SD3A 1B52A 2I3VA 4IO5A 1MXWA 5AA2B 5ITPA 5I56B 4U1ZA 1UIVA 1A54A 1DSNA 3B6QA 4ESXA 3K1NA 4TOZA 3IK6B 1DPEA 4U4XA 1GGGA 1MQDA 3K6UA 1HSLA 5H8QB 5KCJA 4H6DA 4ELPA 3CFLA 3M3LA 5K2YA 3T66A 4PE5B 2XXVA 1R9QA 1ZBMA 5CBSA 3Q27A 4JDFA 3IORA 2F34A 1LB8A 4QHQA 2NVUB 2UVJA 1B3GA 1DTGA 1D4NA 1JW4A 3FV2A 3HSTA 3FGSA 1ATGA 4BDMA 3FD3A 3K4UA 3FVOA 1JEUA 1BKAA 1OLAA 1YCJA 4LZ5A 3Q29A 2DWJA 1M5CA 1I6BA 3BFUA 3HCQA 3A3CA 1GVCA 1SDXA 5H8HB 4ZEFA 1FQEA 3MUQA 3MBPA 3TODA 4GQOA 3IR1A 5AA2D 1VFEA 2V3QA 1MRPA 4KYSA 3MC2A 1B4ZA 1MXVA 3T96B 4ELRA 2OZZA 1Y4TA 3FZVA 3DP4A 1EZPA 3VXCA 4FIMA 3ZKLA 4ZE9A 4GXSB 3QSLA 3KGCA 4G8NA 2I4BA 3DP6A 4M4GA 3U8QA 3R26A 1D9YA 1MPDA 3MZBA 1Z7NE 2NOOA 1H43A 2VP1A 3M3KA 2D5WA 1H44A 1SW2A 2NXOA 1BP5A 2GFEA 2LAOA 2QL3A 4YICA 4N07A 1LFGA 3MAMA 3RTWB 4NF4B 3KN7A 1MG1A 3FVGA 4JWXA 4ELOA 2GHAA 4OFOA 3TTRA 4FEBA 4XIGQ 1GR2A 4G68C 1F9BA 1A7LA 4F1VA 3RTFB 4GIZA 1N04A 2XXUA 3ILUB 1XVXA 2RINA 3O66A 2QS4A 5AA2A 5H8NB 3V89B 4R6KA 5TU0A 1DPPA 2XX7A 3FJ7A 4I1DA 5JK4A 1NKXA 4OHNA 3H06B 1NH7A 4PFYA 1MH4A 2ONRA 1NNTA 1P1WA 5H8QA 3C4MA 3RT6B 3MPLA 3MW0A 4ZECA 1OQHA 1FTMA 1XC1A 4X1DA 3QIMA 2ZNSA 4IB2A 1MY3A 3IO6A 2IA4A 3W15C 3PPOA 2FNCA 4ECFA 1I69A 2HAVA 1VR5A 3TQLA 3JV9A 2R71A 3GXAA 1TT1A 5F7VA 4KQPA 4IO4A 4U23A 4LONB 4QRZA 1OVTA 4EF2A 1MQHA 4IGRA 2WKYA 3PPPA 1S9TA 4KYDA 3CSGA 2O84X 3K0VA 5F1QA 4Q8RA 1B32A 3N6TA 3KZGA 3IO4A 2DYXA 4F1UA 4JBZA 2PMSA 2NWJA 3KEIA 1Y3NA 1B0HA 3FXRA 1USYH 2XXPA 3H03A 1MXYA 4BDQA 3H6TA 2F97A 5AE4A 3QUJA 1NNFA 1P1QA 3TTNA 1Z7ME 4R75A 2F7BA 1MQJA 4GF8A 3MP8A 3EQ1A 1QJMA 3S2VA 1PB8A 3C36A 1N84A 2HCAA 1SW1A 3G3KA 1DOTA 4MLVA 1Y4CA 2ZYKA 3R6UA 3LUYA 5DT6A 4H5FA 4RPOA 4H0WA 4OYVA 4DZ1A 3DP8A 4YMAA 4H65A 4Q5TA 1B05A 1B5IA 1O63A 1MQIA 1B7UA 1EU8A 1MY0A 3KJ7A 4EQ9A 2X26A 4NWCA 4G77A 4U1OA 4YZZA 4C0RA 1WVJA 4GLIA 2Y84A 2UVGA 1O64A 3E3KA 5FTIA 3FVKA 1IXIA 4KFQA 4NF4A 1JW1A 5H8FB 3B7DA 1OLCA 1H3DA 3KOTA 5DTBA 4G4PA 1SI1A 3VXBA 2YLNA 5AA4B 4X48A 2DQVA 3FXQA 2ABHA 3LSLA 4F3PA 2Y7KA 4H5GA 4WKMA 2RC7A 4LA9A 1IITA 3IOVA 5DVFA 5H8NA 1VSOA 4YKKA 5L9SA 2XD2A 2V3UA 2ZMBA 4M1VA 3C32A 4NWDA 3CIJA 4PQJA 5I59B 3IOTA 3OEKA 1URDA 2GRVA 4YAHX 4MLQA 1L5TA 2Q2AA 2AIXA 5I57B 3TTKA 4OESA 3K01A 4N6PA 2GH9A 3ZSFA 3Q25A 2D3IA 1A55A 1B46A 2V93A 2RC9A 5CMBA 5EHSA 2DE4A 4NF8B 5H8SA 3PUZE 4QSCA 3MP6A 5CM6A 4GRKA 3T22A 4X1BA 4C1TA 3PUYE 1NNKA 1B9JA 3BBRA 3MJNA 3TCHA 4R72A 2V3TA 1B51A 4EQ7A 1PDAA 2QMWA 3MZ9A 2Y7RA 3PV0E 3RY3A 3CSBA 3K02A 2H4IA 2Q88A 4DXUA 1P1NA 3K1PA 4P0IA 3TCGA 1Y20A 1MDQA 3GLBA 1YAEA 4R6HA 3EN3A 4N13A 1XOCA 3JYRA 5IKBA 4KCDA 3C31A 3TTMA 3OMBA 4HW8A 3QAXA 4IY5A 4DCXA 3E9XA 3MZ1A 3SEWA 1MPCA 3KOSA 1JEVA 3FJGA 2PT2A 1AIVA 1LBCA 1M5DA 2F78A 4PFWA 1UTHB 4Q30B 1MY4A 3IOUA 5H8FA 5I2NB 4LZ8A 4C1UA 1RYXA 3GBBA 5KZTA 5AA4A 1Y3QA 1ZLQA 2DXYA 1FTLA 3MVXA 3SEUA 3OEMA 2XX9A 1URGA 4OMBA 4OFLA 4XTCQ 2XXWA 4RYAA 1SYHA 3O97A 4IGTA 3U1OA 3KBRA 3MPKA 4RXLA 4P11A 4I62A 1D9VA 2OWTA 2HAUA 4F3GA 3K1MA 4GOTA 1FTKA 1ZIUA 1B5HA 3EHUA 2DVZA 5I59A 4OVJA 2F6PA 2VD2A 3Q28A 2XX8A 5JEIA 2Q9TA 3RLFE 5FHOA 5I57A 1PBPA 1S50A 3TQWA 3FASA 4WEPA 3F11A 1SW4A 3SKPA 4UA8A 3QK6A 3TEPA 1CE2A 4IO3A 2VGQA 4BDNA 3W9WA 1QVSA 2D21A 1OMPA 4I8CA 4BDOA 3V5AA 2UVIA 2AL5A 3VLUA 3KG2A 1N7WA 4GXAA 1NMUA 1MY2A 3G3HA 1JVYA 5EYFA 1LAFE 3O29A 3EPEA 5FHNA 4F19A 1O7TA 1FQBA 3T9UA 5CMCA 2HQ0A 2UVHA 2Z8EA 4EXLA 4POXA 5CMKA 4Z0IA 4FATA 3MWBA 1Y9UA 3HHGA 4IO2A 2I58A 3E4RA 4MF3A 1B1HA 1PB9A 1LAXA 2H98A 4OERA 1N0TA 2XXHA 4LUBA 5CMMA 3K6XA 2V84A 1VE4A 3N5LA 1LFIA 1ZKBA 2QJEA 1MXUA 5I56A 3CFXA 1US5A 4R9GA 1POTA 1FTJA 3G3GA 3FVNA 1ZTYA 1P1OA 1SYIA 4DXCA 1N3XA 3HHFA 2CZLA 1B5JA 1R1NA 1II5A 2HXWA 3ILTB 2O51A 2XXTA 3SERA 4XKNA 1UTHA 3EHSA 3TAJA 3VVFA 1S7YA 5I2NA 1TWYA 1FQDA 1H76A 1LSTA 4NTLA 4XKPA 4OENA 5HM4B 1B4HA 1NH8A 2F7AA 2F8DA 4RK2A 1M5BA 3L6GA 3PUXE 3G3FA 3C35A 3P7IA 3FV1A 1N76A 2X7QA 3S9LC 4LP2B 4QFNA 3VFJA 3S9MC 4R74A 2F6GA 1EH3A 2PBWA 1B58A 1LGBC 1LAHE 5H8HA 2QS1A 3FJMA 4BDRA 3UP9A 1MXXA 4IO7A 3L6HA 2I4CA 4H8JA 3OO6A 4ZZAA 2I3WA 5B70A 1A8FA 2OCUA 4PFUA 3UA8A 2F7CA 3KFMA 1A40A 4PETA 2I49A 2UYFA 5HPQA 3G7WA 1UIUA 4H1XA 4ZS9A 2XXRA 4ESWA 2Q8JA 3V8XB 3I3VA 3HV1A 1Y1ZA 3RUMA 1B3LA 3T9HB 4OEUA 3UGWA 4ND9A 3K00A 2B3FA 4FJPA 4LVQA 4QFKA 4E0WA 2E1SA 4DE8A 3W9VA 2OBGA 1IEJA 2R9JA 3PPQA 4POWA 4WXJA 1ZU0A 3KN8A 2M8CA 4YKIA 4OXVA 3SESA 4OFJA 1T0KA 5DEXB 3R7XA 2XXQA 1JNFA 2PYYA 3JZJA 3LSFB 2ONSA 1MXZA 3IJXB 1BTJA 2ONKE 2ZYNA 3B6WA 3S9NC 3O9PA 3Q26A 3GZGA 4YKJA 1FTOA 4ZEKA 4Z7EA 2OJTA 2O7IA 2X7PA 4R73A 2Z22A 2E0SA 3CG1A 3D4CA 4K3FA 3CI8A 2I0BA 4X9TA 4F18A 4MBPA 3CG3A 4GWOA 1QUKA 2ZNTA 1Q1KA 2QSXA 2KLFA 2H99A 2RCBA 1M5FA 3MP1A 4FORA 1VFDA 4BLAA 1J1NA 1PB7A 4BDLA 1NL5A 2R6GE 4NF6B 1DMBA 4ZZEA 2O7UA 1EZ9A 5BUUA 1IXCA 3IX1A 1JVXA 3DLNA 3M3FA 3PD8A 4U4SA 4EDPA 4DDDA 2Y7IA 4F3SA 4JWYA 4JB7A 1SBPA 3O28A 3THIA 3TDJA 2DSFA 1WDNA 4NF5B 4UACA 2A5SA 3TCFA 2XXXA 4DCYA 4RK9A 4P0GA 2UXAA 2F36A 4AQ4A 4HS7A 3OELA 3U94A 3PPNA 2F35A 4GFRA 3TFLA 4RNSA 3O6GA 2H25A 4FECA 1IQ7A 1MDP1 4RPNA 1LBBA 2DWIA 2RC8A 4IO6A 4O3BA 2ZNUA 3TMGA 3OSRA 1PBQA 1TFAA 5L8DA 3PUVE 3TZAA 2FA7A 4NE4A 4U21A 2B65A 3WAFA 3UIFA 4KR5A 1Y1MA 1LCTA 2O68A 2XXYA 3RT8A 1MPBA 1QUJA 4QFPA 1WODA 5CBRA 4JSOA 4EUOA 4OQOA 1QULA 1EZOA 1PEBA 2DWHA 3K6WA 4G8HA 4RJZA 2P2AA 3UORA 4JXIA 2HZKA 2O69A 2G29A 5I58B 2Q2CA 3IB1A 1SI0A 1BIYA 3OXNA 5DVJA 3LC8A 5L9MA 5DEXA 5CI5A 1AH5A 3KSJA 3IL1B 5DYHA 1ZJLA 1DTZA 5A5XB 3OOAA 1RYOA 3T9VA 4F31B 4OTEA 1GTKA 3IOWA 1MH3A 5TP9B 4GL8A 5J1DA 5LOMA 1OIBA 4KCCA 3N94A 4QSEA 5M2VA 2HZLA 4MH5A 2Z23A 3A3UA 1XT8A 4QFLA 5ISUA 1M5EA 4YB7A 2O6AA 5I2KB 5FHMA 2RF1A 1POY1 4ONYA 1B40A 5K2XA 2Y7WA 1Q35A 4XXUA 4KD5A 4F2OA 5BWJA 1QKAA 2I6EA 4HCWA 4NF6A 3IB2A 1UTBB 3N26A 4F39A 3SDFA 2Z8FA 2DOJA 4NF8A 3O2AA 3OSQA 1MM7A 3IAZA 4TLMB 2HFBA 2OLBA 3O6HA 3OO7A 1FCKA 1PC3A 2VHAA 3ODBA 4G68B 4NF5A 5HBCA 4I9DA 1HSJA 5ELVA 4HTGA 1FQAA 1NNPA 3KJTA 4PFTA 2FYIA 3U92A 3H4ZA 1XHYA 4KPTA 2IEEA 1B0LA 1LB9A 4QF9A 3PMWA 4AB6A 2DWAA 3C34A 4LQ2A 1D3KA 2YJPA 1YPNA 1A99A 4ZEBA 1I6AA 1LCFA 5IAIA 4MFIA 5FTHA 3MQ9A 1AOVA 1B3FA 2H9BA 1RKMA 4JWOA 4F22A 1HSEA 4LATA 3QYTA 3TUSA 4ZEDA 4LZ7A 1IXHA 3S4UA 4QFOA 3FATA 1B1XA 2PVUA 3HN0A 4FAJA 2ZYOA 2V25A 2ANJA 2DE3A 1IUDA 1MS7A 1FW0A 3U93A 3E13X 3H6WA 2DVCA 2VOZA 4EF1A 3TPAA 3MVWA 5I58A 5ICQA 1SW5A 3PU5A 2OK2A 2P1SA 3VE1B 3OO9A 3B6TA 3C33A 3MVZA 3RGYA 5L9OA 5ITOA 3VLVA 4EXKA 3QXMA 1JQFA 2Y7PA 3SEYA 3PMXA 3M8UA 5A5XA 3KN3A 2AYSA 4R2BA 4O3CA 3G3JA 3VLWA 3ONMA 1LLSA 1SVXB 3CFZA 1B7ZA 4ZEIA 1FQFA 2H5YA 5TP9A 2QS3A 2REGA 4F3BA 3K2DA 2GHBA 4OEVA 3BFTA 3VDFA 1JETA 4IY6A 4EQBA 4YKPA 3PPRA 1AL3A 3LR1A 5I2KA 3ZKKA 2THIA 5CC2A 4OETA 5DVIA 2QMXA 1TXFA 3T93B 2UYEA 2O1MA 1OQGA 3RN8A 3PMVA 4KYEA 1USYE 4RA1A 3HO7A 4JSDA 1SQYA 2CMOA 4H67A 3SETA 5KDTB 4YU0A 1UTBA 2ZYMA 3PD9A 3USDA 4AB5A 4FEDA 3EHTA 4H8IA 4QSDA 4YB6A 3VVDA 2DP8A 4FE8A 4G8MA 5JTYB 3N6UA 1R6ZA 2DS9A 4ZDMA 4GL0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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