2HAUA

Apo-human serum transferrin (non-glycosylated)
Total Genus 170
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
170
sequence length
676
structure length
676
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYDKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSDVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The Crystal Structure of Iron-free Human Serum Transferrin Provides Insight into Inter-lobe Communication and Receptor Binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
total genus 170
structure length 676
sequence length 676
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hauA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hauA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hauA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hauA03
1N84A 1MPDA 3O28A 4N07A 3VVDA 2ZYNA 4OQOA 5AA2B 1S7YA 4I1DA 1R1NA 3LR1A 1ZJLA 3RNNA 3IAZA 3VE1B 3SEWA 2QMXA 3S9LC 1NNPA 2Y7KA 1N3XA 5ICTA 5CC2A 5CI5A 3G3KA 4PFYA 4H5GA 1WVJA 5I2NA 4ZZAA 3OO7A 4IO5A 3BBRA 4F3SA 2I48A 1FQEA 3HHFA 1SW2A 4BDNA 2VP1A 3PUXE 3DP6A 1B7HA 3K1MA 5KCJB 3HHGA 1B4HA 3PD8A 2QSXA 1Y20A 1F9BA 4LZ5A 3U92A 2AYSA 1B40A 3SDFA 2HAUA 4EDPA 3P7IA 1B52A 4JWYA 2RINA 1H76A 2FYIA 3OO6A 5K2YA 4AB6A 4P11A 1H44A 2Y7IA 1J1NA 4BDLA 3G3HA 5AA4B 3SETA 3CFXA 2F5XA 4DLDA 3VLWA 3B6QA 5M2VA 1QUKA 3MPKA 1OIBA 3IOVA 3L6GA 5J1DA 3U93A 2CZLA 2QRYA 1HSLA 3T66A 4KHZE 3EN3A 2CMOA 2HCAA 1MXUA 3MVZA 4YAHX 4NF6B 2V3TA 3RY3A 3GLBA 3KFMA 4ZE9A 5I59B 1S9TA 3JYRA 3ILTB 3TTKA 2ZNTA 4GXSB 1UIVA 4ECFA 4X48A 2Q2CA 3FXRA 2XX8A 5JK4A 3PPQA 3GXAA 4HCYA 4H1XA 1QVSA 3IB2A 1DTZA 2Z8DA 1NMUA 5FTHA 2B3BA 1B58A 1URSA 4QSEA 1AMFA 4U4SA 2IA4A 2G93A 1XVYA 4FJPA 4ISUA 3TZAA 3TUSA 5B70A 3VXCA 4F2QA 1PDAA 1O64A 2XX7A 2O7UA 4PE5B 1MH4A 3PMXA 1IXGA 5AE4A 3Q28A 4JWXA 4ONYA 4RA1A 4ESWA 4ZS9A 1NKXA 1N3WA 4QFLA 3MJNA 3VV5A 3WAEA 1XVXA 5CM6A 3HPIA 3U1OA 4DCYA 3QAXA 1POY1 3O6IA 2XXQA 5KZTA 4LVQA 3CSGA 1XS5A 2Z8EA 1CE2A 4NEDA 1QUIA 3FGSA 3RT6B 2V3QA 3PGFA 4YB5A 1LAGE 2DXYA 3QSLA 2DE2A 1FTMA 4F3BA 5FTIA 2A5TB 1Z7NE 1OLCA 3FJGA 3VFJA 3USDA 4OWDA 2H5YA 2FNCA 2B65A 2F97A 1B3HA 1I6BA 1JW4A 2RC9A 5A5XB 2ONSA 3QK6A 4ZEBA 4F19A 5ICQA 4LZ7A 4F18A 1MM6A 1Y3NA 4O3AA 4GOTA 2XHDA 4PP0A 3S9NC 1SYHA 4EQBA 1N76A 2I0CA 4OVJA 3RN8A 1RYOA 1XT8A 4KFQA 2PT1A 4RXLA 1B3EA 2V93A 4WXJA 3CSBA 4MBPA 4RY1A 4WEPA 1NH8A 5AA3A 1LAHE 3ILUB 2QJEA 2HAVA 4QF9A 1B1XA 4R6KA 3G7WA 4G4PA 1VFEA 4Q30B 4M1VA 5H8FA 3S4UA 2GH9A 4I8CA 1N04A 1YPNA 3ZSFA 2DWIA 1TFAA 3FXUA 3TCFA 4H0WA 1B5JA 4G8HA 4H8JA 1MY3A 1R9LA 1FTJA 3SKPA 3EHUA 4TQUQ 4M4GA 4R9FA 2GRVA 1P99A 4YKKA 4Z7EA 2UYEA 3OENA 2BJJX 1A8EA 2UVIA 2ZXTA 1MXWA 1D9VA 2P1SA 1MXZA 1B0HA 2WKYA 1MQJA 3O6GA 1MPCA 1EZ9A 2Z23A 4UACA 2DE4A 3H3GA 1IITA 2NXOA 3SEXA 1OMPA 1B5IA 1H3DA 4TLMB 1URDA 2F34A 1MS7A 1MQIA 2DQVA 2F7CA 2F78A 1US4A 2W7YA 3D4CA 4Q0CA 1IZ1A 5HPQA 3BKIB 3G3FA 3LSFB 1QJMA 4LA9A 3FVNA 1FQFA 4E0WA 2H9BA 4KYEA 1SBPA 2Z8FA 5CMKA 1I6QA 3IB0A 3M3LA 1SI0A 4F22A 1Y4CA 3KZGA 1SYIA 4IO4A 3DELB 1SDXA 1MDQA 1BTJA 2KLFA 4UA8A 1MY2A 2DSFA 3PMVA 4NF8A 3O29A 3UK4A 5DTBA 1JW1A 3KGCA 3PD9A 2ANJA 2O6AA 1R6ZA 1TFDA 3O9PA 1HSEA 2X7QA 1ATGA 3PUWE 2NUVA 2Q88A 3OEKA 3HCQA 3LUYA 3THIA 1UQWA 1EH3A 3QXMA 1JVXA 1MQGA 3IJOB 3LSLA 5F7VA 3H7MA 3T9HB 1VE4A 1MQDA 3N6TA 1SD3A 4F1YA 2Q9TA 3LSWA 2O51A 3KEIA 3RQTA 1B1HA 4PFWA 4I9DA 3O6HA 4OERA 1B32A 4U2RA 5I2KB 1ELJA 4DZ1A 2R6GE 4NMYA 3RTWB 5H8QB 2F6PA 4ELPA 1B7ZA 5L9OA 1A55A 1OVBA 5JEIA 3KJ7A 3IJXB 1XC1A 4TOZA 2B3FA 4NF5B 1NNTA 4NWDA 3IOUA 4OFJA 5DVIA 5CMCA 4OZ9A 3V83A 2XXUA 3VLUA 4XIGQ 4NF4A 3K00A 2NWJA 4QFPA 2VHAA 4YZZA 3TEPA 1B3GA 4U4XA 2A5SA 3OSRA 3VLVA 3K02A 1FQDA 3K1PA 3OSQA 3HO7A 4MFIA 4F2OA 4FATA 3UN6A 2F7BA 3JZJA 1MH3A 1LB9A 1II5A 5HBCA 3RPWA 5KDTA 2YJPA 1YTVA 1LBCA 3KSXA 2HZKA 1NNKA 4GLIA 4QHQA 5TPAB 5B7DA 5I58B 2Q8JA 3MBPA 4HCWA 4PETA 3QUFA 2OLBA 4G77A 3DP8A 4ZEKA 3FVGA 3EPEA 3N26A 1NL5A 3K6UA 5I56A 3TFLA 4G68B 3OO9A 1PBQA 1JEVA 2YLNA 4ELRA 1AH5A 2XXIA 3TTRA 4NE4A 3UGWA 3TTMA 1QULA 4RK2A 1GTKA 2OZZA 4IO7A 1LFHA 4IO2A 1TXFA 1DOTA 1B05A 3M8UA 3PPRA 3TQLA 2G29A 1B3LA 5I57B 1LLSA 4F29A 4RNSA 3R26A 1LCTA 4H5FA 3FATA 3PV0E 3JV9A 4DCXA 1M5FA 1N0TA 2XD2A 2DXRA 2ZYKA 4R2FA 2GHBA 4MLQA 1B2HA 1P1UA 1UTBA 1P1QA 1Q35A 4KR5A 5DEXB 1JVYA 1UTHB 2GHAA 3N5LA 3H06B 4U1ZA 1MM7A 4YMBA 2UXAA 4HTGA 4JBZA 1B4ZA 1MXYA 3FASA 3TMGA 1EU8A 4IY6A 2O68A 3KN8A 1MQHA 2HXWA 3IB1A 5BWJA 3W9VA 1FQCA 4FEBA 4EXLA 4KCDA 3MWBA 4IO6A 4EF2A 1FW0A 1FQAA 3OEMA 5JTYA 2QS2A 4H65A 4QFKA 1Y1ZA 4H6DA 4F31B 3V89B 1M5DA 4QRZA 3L6HA 5LOMA 2ESNA 5HM4B 4F3PA 4YKPA 3T9XB 2QS3A 4AB5A 2IEEA 4OETA 3C4MA 3FV1A 3KOSA 3U94A 1PB9A 4Q8RA 1DPEA 1MDP1 1MPBA 1VFDA 1AL3A 2THIA 5AA2A 3K2DA 4E0XA 2ABHA 5CMBA 3HV1A 3FJMA 2XXXA 5IAIA 4BLAA 2F8DA 2PMSA 1SQYA 5H8HB 3CRBA 2I49A 2PBWA 4MH5A 4K3FA 4LP2B 2I58A 5FHNA 3FZVA 4FEDA 1POTA 2REGA 1GV8A 2H98A 4R72A 3B7DA 3TTLA 1IIWA 5TP9B 4RPOA 1N7XA 3FJ7A 1O7TA 3VDFA 3VXBA 3PU5A 4C1TA 3N94A 4WKMA 2Q2AA 3HN0A 1QUJA 4KYSA 1OLAA 1LAFE 4EQ7A 1IEJA 2XXPA 2F7AA 5KCJA 3OOAA 2QS4A 3QUJA 3H6TA 1DMBA 4ND9A 1BLFA 3TAJA 4AQ4A 4EQ9A 4U23A 1SI1A 4GWOA 3IO6A 4H67A 2F35A 3K6WA 3U8QA 3Q27A 5AA4A 1LSTA 4POXA 1JETA 2HQ0A 2I0BA 1MXVA 4F1UA 4OESA 1IUDA 3C33A 4LONB 4YB6A 4BDQA 4R75A 2RC7A 2ONKE 3DP4A 3GZGA 3SERA 4NF6A 4DXUA 2Y84A 3FIRA 3E13X 3ODBA 1SVXB 2PVUA 5I59A 4R73A 1MY1A 5I2NB 4MF3A 4QFOA 2I3WA 4ZEDA 3MZ1A 3LBSA 5KDTB 1Q1KA 3M3FA 4GIZA 2AL4A 2ONRA 4ZDMA 1JQFA 1IQ7A 3MQ9A 4G8NA 3TKDA 4GVOA 2Y7RA 4OHNA 4EF1A 4GL8A 4L17A 3RT8A 1NNFA 2OK2A 3K6VA 1SW1A 4FORA 3EF7A 3KG2A 4G68C 5BUUA 3IO4A 2OWSA 3WAFA 2ZNUA 3UP9A 3MVYA 3A3UA 3FXQA 4JWOA 1PB8A 3CIJA 4ELOA 4X1BA 4KCCA 3F11A 1Y3QA 3T9VA 4BDOA 2VD3A 3GBBA 3Q26A 5EHMA 3CVGA 4GFRA 5L9SA 3IOTA 2M8CA 1LGBC 2ALUA 1H43A 2D3IA 4LUBA 2P2AA 3T9UA 4HS7A 2O1MA 3TDJA 3O97A 4GXAA 1WODA 2X26A 3MPLA 3UORA 4R6YA 2I4BA 4JB7A 5CBRA 4DDDA 1IXHA 2HFBA 1OQHA 1DSNA 2A5TA 4R2BA 1Y4TA 2NOOA 2ZMBA 4TLLB 5I84A 1QW0A 1MXXA 1USYH 4NTLA 3RLFE 3MP1A 2H25A 3KSJA 5A5XA 3H6WA 2I3VA 4N13A 4OTEA 2D5WA 3E3KA 2REJA 3MZ9A 1PB7A 3C31A 1JNFA 1B9JA 2E1SA 3OO8A 3RGYA 3UIFA 3TCGA 5ISUA 1JEUA 1PEBA 1A7LA 4YKIA 3CFLA 4OFOA 1R9QA 2F36A 4KQPA 3GBAA 3DLNA 3K0VA 1B46A 4MLVA 1IXCA 4XXUA 2RCBA 3K01A 1MY4A 1TT1A 2HZLA 4KPTA 4DE8A 5ITOA 5L9MA 2RC8A 1BKAA 4X9TA 4RYAA 4YB7A 1B51A 2QPQA 3K6XA 3MC2A 4O3BA 3TYHA 1ZTYA 2HEUA 4ELQA 1OQGA 1EZPA 4OEUA 3I6VA 1M5BA 1I69A 4XKNA 4HW8A 3TODA 3N6UA 2DWHA 4C1UA 2DVZA 3ECRA 5ELVA 1A54A 2F6GA 1B7UA 3Q25A 3S9EA 3SEYA 1VR5A 2AIXA 1ZLQA 3BFTA 1NFTA 3PUYE 2RF1A 1URGA 2DP8A 4G2ZA 3SEUA 4ZZEA 4RJZA 4G8MA 3G3GA 4IB2A 3CG3A 2ZYMA 3T93B 5H8NA 3A3CA 3TCHA 1B5HA 4JXIA 3FV2A 4EUOA 2H4IA 2DYXA 3H4ZA 1PC3A 4LQ2A 2NVUB 1US5A 2XX9A 5H8FB 4GQOA 1T0KA 4PFUA 2V84A 2DWJA 1MRPA 4QSDA 4OENA 3IK6B 1ANFA 2R9JA 4U22A 2ZYOA 2I4CA 3IX1A 4XKRA 2P0SA 4OYVA 1B3FA 2VOZA 3ZS6A 4R9GA 4IGTA 3SEVA 2OBGA 4ZEFA 3EHTA 2R71A 1Y3PA 3OD7A 1NH7A 3KJTA 1P1WA 2ZNSA 2O84X 3MVXA 4GRKA 4Q5TA 1H45A 1D4NA 4ZECA 2DWAA 2O69A 1ZU0A 1L5TA 3I5OA 4QSCA 3CG1A 2UVHA 1ZBMA 1LBBA 3R6UA 1GGGA 4XKQA 3TQWA 5AA2D 4RPNA 4H8IA 4LQ5A 3O2AA 1B0LA 3IORA 5I2KA 2D21A 2DVCA 5TU0A 5H8QA 4IGRA 1IXIA 1PBPA 3PUZE 1MG1A 1N7WA 5ITPA 4I62A 5EYFA 3MZBA 4NF5A 2FA7A 1HSJA 3W9WA 4QFNA 5EHSA 4GD5A 3ONMA 2I6EA 1LFIA 3EQ1A 2DS9A 1D3KA 1DPPA 4DIGA 1P1NA 3EHSA 2PT2A 2X7PA 4NF8B 4U1OA 3V8XB 3ZKLA 4FIMA 1BIYA 4EXKA 2UYFA 1D9YA 4P0GA 1I6AA 3RUMA 3C34A 2DOJA 3V5AA 3G3IA 4WEDA 2O1LA 3PMWA 4C0RA 2RCAA 3VVFA 4OFLA 3MAMA 1LFGA 3W15C 3O66A 3TPAA 3G3JA 3KN3A 2DE3A 2Q89A 2Y7PA 4X1DA 5TPAA 5K2XA 1WDNA 5I58A 4PQJA 4N6PA 5FHOA 1XOCA 3MUQA 1GVCA 3MP8A 1RKMA 4F39A 1CB6A 4F3GA 4P0IA 3K1NA 5DYHA 2V25A 4YMAA 3PPOA 4O3CA 1M5EA 3I3VA 3B6WA 2Z22A 1LCFA 2PX1A 4YU0A 4G68A 2O7IA 4FAJA 1Y9UA 2E0SA 3H03A 4Z0IA 2LAOA 3IOWA 2QMWA 1Z7ME 4NF4B 5CMMA 1A8FA 3U72A 3C9HA 1TWYA 3CFZA 4JSOA 3C32A 3OELA 3MVWA 3CR9A 2XXTA 1ZMGA 3FVKA 5DVJA 5I57A 1YAEA 2QL3A 4IO3A 1FTKA 4GL0A 5CBSA 1RYXA 3DM0A 3E4RA 3RTFB 1SW4A 3QIMA 4LZ8A 4RK9A 4OMBA 3IR1A 3H6VA 5DVFA 3LC8A 2AL5A 3PPPA 1A99A 4DXCA 3Q29A 1GR2A 1OVTA 1P1OA 4JDFA 5DEXA 1UTHA 3FD3A 1Y1MA 3PUVE 4PFTA 3CI8A 3OXNA 3FVOA 3PPNA 3IL1B 3LSXA 4ZEIA 3T96B 4XKPA 3C36A 1ZKBA 1LB8A 2PYYA 4R74A 1B6HA 1USYE 3TELA 1YCJA 1JW5A 2Y7WA 4KD5A 5IKBA 3D4GA 1UIUA 2RKMA 5I56B 2V3UA 3FUZA 5FHMA 3T22A 4XTCQ 1FQBA 4YKJA 3SESA 4DXBA 3OMBA 5H8NB 1XHYA 3C35A 1FTLA 1DTGA 4THIA 2H99A 1O63A 3BFUA 3TTNA 5CRYA 2XXWA 3S2VA 3VVEA 3B6TA 1FTOA 5DT6A 4BDMA 3K4UA 3HSTA 3R7XA 2XXRA 1SW5A 1MY0A 4JSDA 4ZE8A 2VGQA 3KN7A 3ZKKA 2GFEA 1ZIUA 4KYDA 1M5CA 3KBRA 4F1VA 4LATA 1QKBA 5F1QA 2XXYA 3QYTA 2YPNA 3H6UA 2XXHA 1UTBB 5H8SA 3A09A 2UVJA 5H8HA 2XXVA 4ESXA 1S50A 5L8DA 4YICA 5AA1A 4GF8A 2OWTA 1LAXA 4POWA 3S9MC 1AIVA 2OJTA 4FECA 2QS1A 4R6HA 4KI0E 3UA8A 2UVGA 5TP9A 1EZOA 1BP5A 4BDRA 3MP6A 3KOTA 2VD2A 3E9XA 3MW0A 1QKAA 1AOVA 2XD3A 2OCUA 4OXVA 1A40A 1VSOA 3AXFA 5JTYB 4OEVA 3M3KA 1KWHA 4NWCA 4FE8A 4U21A 4IY5A 1FCKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1N84A 1MPDA 3O28A 3LV0A 4N07A 3VVDA 2ZYNA 5IZ3B 4OQOA 5AA2B 1S7YA 4I1DA 1R1NA 3LR1A 2CEXA 1ZJLA 3RNNA 3IAZA 3VE1B 4I3EA 3SEWA 2QMXA 1NV6A 3S9LC 1NNPA 2Y7KA 4GWYA 1N3XA 5ICTA 5CC2A 5CI5A 3G3KA 4PFYA 4H5GA 1WVJA 5I2NA 4ZZAA 1FBDA 3OO7A 4IO5A 5I5PA 1D9QA 3BBRA 4F3SA 2I48A 2PFYA 1YXIA 4PE3A 5A5LA 1FQEA 3HHFA 1SW2A 4GBWA 4BDNA 2VP1A 3PUXE 3DP6A 1B7HA 3K1MA 5KCJB 3HHGA 2FBPA 1B4HA 3PD8A 2QSXA 1FPFA 4HXVA 1Y20A 1F9BA 4LZ5A 5ET6A 3U92A 2AYSA 1B40A 3SDFA 2HAUA 1FPLA 4EDPA 4JVCA 3P7IA 1B52A 4JWYA 2RINA 1H76A 2FYIA 4X8RA 3OO6A 2MKZA 5K2YA 4AB6A 4P11A 1H44A 2Y7IA 1J1NA 4BDLA 3G3HA 4X04A 5AA4B 3SETA 3CFXA 2F5XA 4DLDA 3VLWA 3B6QA 5M2VA 1QUKA 3MPKA 4DI4B 1BK4A 4GBVA 1OIBA 3IOVA 3L6GA 5J1DA 3U93A 2CZLA 2QRYA 1HSLA 3T66A 3HFUA 4KHZE 3EN3A 2CMOA 2HCAA 1MXUA 3MVZA 4YAHX 4NF6B 2V3TA 3RY3A 3GLBA 3KFMA 4ZE9A 5I59B 1FCKA 3FBPA 1S9TA 3JYRA 3ILTB 3TTKA 2ZNTA 4GXSB 1UIVA 4ECFA 4N91A 4X48A 2Q2CA 3FXRA 2XX8A 5JK4A 3PPQA 4MAGA 1EYIA 3GXAA 4HCYA 4H1XA 1QVSA 3IB2A 3ROJA 2KQZA 1DTZA 2Z8DA 3NOHA 1NMUA 5FTHA 2B3BA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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