2HAVA

Apo-human serum transferrin (glycosylated)
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
676
structure length
676
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The Crystal Structure of Iron-free Human Serum Transferrin Provides Insight into Inter-lobe Communication and Receptor Binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
molecule tags Metal transport
total genus 192
structure length 676
sequence length 676
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2havA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2havA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2havA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2havA03
2XXHA 4RJZA 3SESA 3T9UA 3ILTB 3K6WA 3UK4A 5AE4A 3IOWA 3T22A 2UYFA 2PT1A 1ATGA 1N84A 4LQ2A 2IA4A 5CMMA 5ELVA 3ZKKA 3GLBA 4JWXA 1NKXA 2P0SA 4RY1A 4G4PA 4R9FA 4UACA 3ILUB 2Z23A 4XKRA 1BP5A 1MRPA 3PPPA 4ND9A 3ECRA 1LFGA 1ZIUA 3QAXA 3OSRA 2D21A 4YAHX 4HTGA 4AB6A 1MQDA 1B51A 1MXUA 1UTHA 2E1SA 4FEBA 4ESXA 4F3GA 5H8HB 2Y84A 3E4RA 3K6XA 4QFLA 3TTMA 2CZLA 2QMWA 1MPDA 4FORA 3PPQA 3FXQA 2I3VA 3ODBA 4KCDA 5CBSA 4QSCA 2DS9A 3MWBA 1IITA 1XHYA 4IY5A 2A5TA 4IO3A 5TP9B 4R74A 3EHUA 4OFJA 3SEUA 1BLFA 2V3UA 5H8FB 4MLVA 1FQEA 2I4CA 4F39A 1AL3A 3CSGA 5AA4B 1FTKA 4QHQA 2Z22A 2QJEA 3G3KA 1FW0A 4QF9A 3IAZA 3L6HA 3CRBA 4Q0CA 1QVSA 3GXAA 4F3BA 1B5HA 3LC8A 4LZ8A 2O6AA 3UGWA 1LB9A 3EPEA 3SERA 1DSNA 3TODA 4RPOA 4Z0IA 1ZJLA 3T93B 3K1PA 4UA8A 1FQFA 3VXBA 3B6TA 3VE1B 3TTKA 2H25A 3S9LC 4GL8A 5BUUA 1B52A 2XXWA 5HPQA 1ELJA 1MQIA 2RKMA 4WXJA 3G7WA 1I69A 2OJTA 3IORA 4G8HA 2QSXA 1P99A 3PPOA 2Z8EA 4F18A 4LZ5A 1SI0A 3HN0A 3VV5A 3IJXB 2OLBA 4QSEA 1Z7ME 3FVNA 4KHZE 2B3FA 4JSOA 5F7VA 4F2QA 2H9BA 1MDP1 2Z8FA 4OQOA 2R6GE 4LVQA 4ONYA 2UVJA 2F7CA 3C32A 4Q30B 1FTJA 2X7PA 4H5GA 5K2XA 3V8XB 4ZE9A 2UYEA 1QJMA 1B3LA 4ZEKA 3I5OA 5I58B 2WKYA 5H8NA 4G68A 3OXNA 2NXOA 3PMXA 4XTCQ 4JXIA 2Q8JA 1FTOA 1Y4TA 4P0IA 2ZNSA 1NMUA 3V5AA 3S9NC 1ZBMA 4DLDA 2REJA 1B6HA 1SW5A 3RUMA 4RNSA 1I6AA 3TDJA 3O66A 2V84A 2I48A 3QUJA 1B2HA 2UVHA 1OQHA 2G93A 3IL1B 1D4NA 1PEBA 4QFOA 5DVJA 3VXCA 4KD5A 4Z7EA 4OVJA 4ELOA 4ZS9A 3N6TA 2DXRA 2I58A 2ZMBA 3QIMA 2HQ0A 2ZYNA 3IR1A 3G3HA 4RK2A 4U23A 3O6IA 4F19A 1Z7NE 1LBCA 3TUSA 4H8JA 3KN7A 1GVCA 1SYHA 2Y7PA 1VR5A 1UIUA 2XXPA 2VD2A 4AQ4A 4IO7A 4H1XA 3H7MA 1OVBA 4H65A 3Q28A 1S7YA 2ABHA 3EQ1A 2GH9A 3DP6A 1JNFA 4WKMA 3KZGA 4TQUQ 4NF8A 5FHNA 2XX7A 3MZBA 3PPRA 3KOSA 4AB5A 4YKIA 3CSBA 1A99A 4I62A 5DEXB 2YPNA 1LCTA 2I49A 4R2FA 5L9OA 1MM7A 3PPNA 4YKJA 3MPLA 4OEVA 4GRKA 1RYOA 3FGSA 3TTRA 3HV1A 1B46A 4ELRA 1R1NA 2ONSA 4U22A 5EHMA 3TELA 3SDFA 3HHFA 1B5IA 3KN8A 5AA1A 4LATA 4XIGQ 5AA2B 3OOAA 3S2VA 4ELQA 3PGFA 4JWYA 1AOVA 1A54A 5I2NB 2F97A 4QFKA 5CMKA 5DVFA 2IEEA 4YB7A 1MY1A 3N6UA 1LFHA 4DIGA 3G3JA 2ZYKA 3PUXE 1TT1A 1B7HA 4GIZA 4GQOA 2E0SA 3EHTA 5J1DA 1MXZA 2REGA 1DPEA 1SD3A 4F1UA 4QFNA 3TCFA 2NUVA 4JWOA 1S50A 3H6WA 2FNCA 1FQCA 1II5A 1P1UA 4PETA 4OFOA 4X48A 2PT2A 4GD5A 5H8FA 1AH5A 2VHAA 3MJNA 3BFUA 2OWSA 1NH8A 2HCAA 5DVIA 3B6QA 1GGGA 5AA4A 1MDQA 4OETA 5DTBA 2I6EA 3CIJA 4POXA 1ZTYA 4F1VA 2F35A 1UTBA 3RGYA 4POWA 1SW1A 3OO6A 1Y1MA 5I59A 5I56B 1OLAA 1S9TA 2BJJX 2O1MA 3FJMA 2H98A 3LSWA 1MM6A 4OZ9A 1L5TA 1A40A 4KYDA 1YAEA 2KLFA 1URDA 4NF8B 1AIVA 1H43A 2LAOA 3CG3A 1SBPA 1LAXA 4H6DA 1US5A 4NF5B 3MUQA 3QYTA 4YU0A 1KWHA 1PBQA 1FQAA 3RT6B 3K02A 1M5CA 3K0VA 1MH3A 1LGBC 2DE4A 5L9SA 5ITOA 3C34A 1N76A 1M5BA 1TFAA 4ECFA 2F34A 4EUOA 2QS1A 1I6BA 1RYXA 4HCWA 4F29A 3LR1A 3V89B 1PC3A 4ZZAA 1N3WA 3CI8A 1POTA 1DPPA 5I58A 2XX8A 2ALUA 2OWTA 4LUBA 3DELB 2O7IA 1DMBA 3BFTA 3GZGA 4YICA 4YMBA 1B40A 1XVYA 1US4A 1P1QA 1SI1A 3IB2A 2OBGA 4GXAA 1JETA 1EZ9A 3O28A 1FQDA 2B3BA 5A5XA 4OTEA 3K4UA 4EXLA 5F1QA 5B70A 1JEVA 4U2RA 2XXQA 1URGA 2D5WA 4GF8A 3FV2A 5KDTB 3HHGA 3KFMA 2VP1A 3FASA 2M8CA 3OO8A 3MZ9A 4M1VA 1Y3PA 3SEXA 2UVGA 3T9HB 1UTBB 4LONB 2XXYA 1PB7A 2AL5A 4LZ7A 3H6VA 5LOMA 2DQVA 3H3GA 2DSFA 5I2KB 5I59B 4X1BA 2Y7WA 4DXCA 2XD3A 2RF1A 5L9MA 2DXYA 3MZ1A 3PUWE 1M5DA 4BLAA 1MXVA 4IO5A 1D9YA 3MVWA 3TCGA 4RPNA 4P0GA 3I3VA 3SEWA 2F6GA 4G8NA 4NWCA 2I0CA 2Z8DA 4QFPA 4RYAA 2H4IA 4HCYA 3MVYA 4EXKA 5KZTA 4BDLA 3KJ7A 4R6KA 1O64A 1IZ1A 4OXVA 4DXUA 3CFLA 2DVZA 2O68A 2G29A 2H99A 2HZKA 1TFDA 3CVGA 3KSJA 5FHOA 3PD8A 4JDFA 1FQBA 1O7TA 2PMSA 3SEYA 4ZE8A 4OERA 5DEXA 3C9HA 4F1YA 3KJTA 4U21A 3CG1A 4NMYA 2GHAA 4ZDMA 4LQ5A 5ISUA 3KBRA 4DCYA 2DOJA 2HEUA 3PV0E 4U4SA 1IXCA 3B7DA 3T9VA 3LSLA 5JEIA 2GHBA 5AA2A 1M5FA 4OESA 1PB8A 5DYHA 4QSDA 2P1SA 5I2NA 4KI0E 4YMAA 1ZMGA 2F7BA 3VDFA 3K6VA 3MBPA 3PUYE 4GLIA 3Q27A 2P2AA 1MY2A 2OCUA 2W7YA 1MXXA 3R26A 4R9GA 1B0LA 3MP6A 4GL0A 4BDOA 5A5XB 3G3IA 1WODA 4NWDA 5IKBA 2ONRA 4DXBA 1N04A 3GBAA 2ANJA 1MS7A 3E9XA 5CRYA 3Q26A 2RCAA 1XVXA 3R6UA 4KYEA 5I57B 4IY6A 1FTMA 1MQGA 4ZZEA 1MXWA 1VFEA 3IX1A 2GFEA 2ZNUA 2VGQA 1B5JA 2PYYA 4NEDA 4F2OA 1TXFA 3TYHA 3C33A 2XX9A 1IXGA 4XXUA 4JBZA 5EYFA 2V3TA 3IO6A 3N26A 4EF2A 1N0TA 4IB2A 1Y9UA 3FVKA 4I1DA 4EQBA 3N94A 1B0HA 3U72A 3IOTA 4KPTA 4G2ZA 3A09A 5CI5A 1OVTA 5I56A 3T9XB 1HSEA 4THIA 4OENA 5JTYB 2XXRA 1USYH 3SETA 3ONMA 1Y20A 2XD2A 5KCJA 1MPCA 3KGCA 3M8UA 1QKBA 1RKMA 1SW4A 1MY0A 4KCCA 3LUYA 2UVIA 4XKNA 1LAFE 1VE4A 3H6UA 4R6HA 1NNFA 3MW0A 3TAJA 4NF5A 1JQFA 1GV8A 4H5FA 1XT8A 3BKIB 3S9MC 4R75A 2X26A 4XKPA 5B7DA 4NE4A 4ISUA 4DDDA 4N6PA 1MQHA 1QUIA 2OZZA 3M3KA 5ICTA 3PUZE 4O3CA 4BDMA 1VFDA 2QMXA 4R72A 3RTWB 5FHMA 3RTFB 4R2BA 3IOUA 1BIYA 3Q25A 3MPKA 3TFLA 3CFXA 3JYRA 3OSQA 3DP4A 2Q2AA 4R6YA 3MP1A 2DE3A 1SW2A 4WEPA 5H8QA 2QRYA 4YB6A 1H44A 3C31A 4NF6A 3FD3A 3VVEA 3S9EA 3D4CA 3SEVA 1VSOA 2DWHA 3K1NA 4LP2B 3N5LA 1B3HA 2V3QA 1OQGA 4FE8A 4MF3A 3RLFE 3IOVA 1P1WA 2Q89A 3LSXA 1I6QA 2DWIA 3FUZA 4FATA 4E0XA 1ZKBA 5FTIA 4RXLA 4EF1A 3K2DA 3U93A 3O29A 2Q2CA 5KDTA 2VOZA 5L8DA 4QRZA 1JW4A 1YPNA 3USDA 4YB5A 4FECA 1NFTA 4G8MA 4PFYA 1SDXA 4U4XA 1XC1A 2RCBA 4H0WA 3EN3A 5I2KA 1WDNA 1ZLQA 1JVYA 4BDNA 4F22A 3E3KA 4MFIA 4JSDA 2HAVA 3MP8A 1H45A 2YJPA 1EH3A 5FTHA 5KCJB 2RC8A 1B4HA 2V93A 1CB6A 1QULA 2QS2A 2XXTA 1GR2A 2O84X 4PFUA 4U1OA 4BDQA 3JZJA 1MY4A 3KG2A 2RC7A 4P11A 4N13A 1UIVA 3U1OA 1QUJA 2Y7RA 1FTLA 2DWJA 4MLQA 1NNTA 1URSA 1YCJA 4PQJA 3O6GA 4X9TA 3P7IA 3C36A 1OLCA 4O3AA 2ZXTA 2Q88A 2DYXA 3G3FA 3O9PA 3OO7A 1H76A 2D3IA 3A3UA 2UXAA 3VLVA 1EZOA 3MQ9A 4PFTA 4OEUA 1SQYA 5H8QB 4F3PA 2X7QA 1YTVA 3K01A 3DP8A 4NF6B 3V83A 2O1LA 1N7XA 1N3XA 4I9DA 4F3SA 3OEMA 4KYSA 4ZECA 3W9VA 2O51A 4NF4A 4O3BA 3UA8A 1IXIA 2HZLA 5ITPA 4M4GA 2PX1A 3UIFA 4ZEBA 5JK4A 2R71A 3IB0A 2YLNA 3S4UA 3TKDA 3W9WA 1IUDA 1Q1KA 1NL5A 3M3FA 3F11A 4C1UA 2H5YA 5I57A 1MXYA 3DLNA 3I6VA 3KEIA 4FAJA 3FIRA 4H67A 2CMOA 3H06B 3LSFB 5K2YA 4MBPA 1JVXA 3Q29A 4H8IA 1LB8A 1LBBA 1NNKA 1IXHA 1Y3NA 1PDAA 5TPAB 3O2AA 5TU0A 4PE5B 1PB9A 2AL4A 1B7ZA 1T0KA 3SKPA 3VVFA 3PMVA 1A8FA 1UQWA 3AXFA 3HSTA 2NOOA 2Y7KA 3RN8A 1J1NA 3GBBA 1QW0A 1LCFA 1TWYA 1ANFA 3FVGA 3MVZA 2ONKE 4TOZA 1P1OA 5M2VA 4OMBA 3CR9A 3VLWA 5JTYA 3WAEA 2XHDA 2ZYMA 3IK6B 3KN3A 2VD3A 2F5XA 3FJGA 4N07A 3MC2A 4G68C 1M5EA 3DM0A 5CBRA 4TLMB 4OHNA 1LFIA 1Y1ZA 4OWDA 2R9JA 3FJ7A 2FYIA 1NH7A 4GFRA 3IO4A 3M3LA 4ZEDA 1BTJA 1R9QA 2Y7IA 1B9JA 1F9BA 3O6HA 3TQWA 2QPQA 3KSXA 3C35A 3TPAA 2O69A 3JV9A 4BDRA 1A55A 4IO6A 4PFWA 3OELA 4ZEIA 3BBRA 2QS3A 1XOCA 2PBWA 3IB1A 3PMWA 3PUVE 3VFJA 4C1TA 4NF4B 4TLLB 3MVXA 1UTHB 1CE2A 1P1NA 1LLSA 4JB7A 3LBSA 3KOTA 1QUKA 5H8SA 1MG1A 1HSJA 1SYIA 1IQ7A 4DZ1A 4FIMA 3UP9A 1MPBA 5EHSA 4ZEFA 3PU5A 2F8DA 2ESNA 1O63A 4C0RA 3FXRA 3TEPA 4U1ZA 3UORA 3FV1A 2I0BA 2A5TB 4HW8A 1IEJA 3D4GA 2DVCA 2AIXA 4GOTA 2PVUA 3H6TA 4IO2A 4L17A 3IJOB 3OMBA 4GVOA 4KFQA 5I84A 1B4ZA 4KR5A 1B3GA 4IO4A 1B1HA 1FCKA 2HFBA 2GRVA 2DE2A 4NTLA 3QK6A 3QXMA 4DCXA 3RPWA 4G77A 5HM4B 4EQ9A 2THIA 3TCHA 4IGRA 2HXWA 4WEDA 4I8CA 3TQLA 3K6UA 1B3FA 4K3FA 4Q8RA 1IIWA 5DT6A 1R9LA 2RINA 3MAMA 5CC2A 3TTNA 3PD9A 1JW5A 3E13X 2O7UA 5AA3A 2ZNTA 3B6WA 1XS5A 5BWJA 1Y3QA 1D3KA 1LAGE 1ZU0A 2XXUA 2XXIA 1DTZA 1DOTA 4IGTA 5IAIA 4PP0A 1LAHE 4XKQA 2I3WA 3OENA 3QSLA 2QL3A 3U8QA 1B7UA 1OMPA 4EDPA 3RNNA 3RQTA 3ZSFA 3HCQA 1R6ZA 3HPIA 2I4BA 3U92A 4MH5A 4R73A 4OYVA 3ZS6A 3FXUA 4E0WA 4OFLA 3FATA 3O97A 1Y4CA 5ICQA 3RY3A 4YKKA 5CM6A 1B05A 5H8NB 4G68B 3K1MA 3R7XA 3TTLA 2F6PA 4F31B 2FA7A 4KQPA 4YKPA 4LA9A 3K00A 2Q9TA 3T66A 3WAFA 3C4MA 2B65A 2OK2A 1A8EA 1MQJA 4FJPA 3H03A 1EZPA 2HAUA 1B1XA 5H8HA 3L6GA 2QS4A 3TMGA 4Q5TA 2DP8A 3FVOA 2NWJA 1GTKA 3EF7A 4GXSB 1USYE 1BKAA 4ESWA 4HS7A 3VLUA 1WVJA 1PBPA 2XXXA 1LSTA 5TP9A 3THIA 2DWAA 2ZYOA 3EHSA 5CMCA 1SVXB 3CFZA 1B32A 3QUFA 2XXVA 3T96B 2AYSA 1HSLA 3W15C 1DTGA 5TPAA 1QKAA 2F78A 5AA2D 3U94A 3TZAA 3ZKLA 1D9VA 3HO7A 5CMBA 3OEKA 1AMFA 1H3DA 4YZZA 3OO9A 4GWOA 1OIBA 1JW1A 4ELPA 3FZVA 4FEDA 1A7LA 1N7WA 1NNPA 4X1DA 4RK9A 2A5SA 1Q35A 3A3CA 1POY1 4EQ7A 2F36A 1JEUA 5HBCA 3OD7A 2NVUB 4DE8A 3VVDA 1EU8A 1MH4A 3G3GA 3RT8A 1MY3A 2F7AA 1B3EA 2RC9A 2V25A 3UN6A 1B58A 4RA1A 3H4ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1Q9DA 4QBAA 2XXHA 4RJZA 3SESA 1FPLA 3T9UA 3ILTB 3K6WA 3UK4A 5AE4A 3IOWA 3T22A 2UYFA 2PT1A 1ATGA 1N84A 4LQ2A 2IA4A 5CMMA 5ELVA 3ZKKA 3GLBA 4JWXA 1NKXA 2P0SA 1NUYA 4RY1A 4G4PA 4R9FA 1RDZA 4UACA 3ILUB 4MHFA 3MYUA 3B50A 2Z23A 4XKRA 1BP5A 1MRPA 3PPPA 4ND9A 3ECRA 1LFGA 1ZIUA 3QAXA 3OSRA 2D21A 4AS4A 4YAHX 4HTGA 4AB6A 1MQDA 1B51A 1MXUA 1UTHA 2E1SA 4FEBA 4ESXA 4F3GA 5H8HB 1KA0A 2Y84A 3E4RA 3K6XA 4QFLA 1EYKA 3TTMA 2CZLA 2QMWA 1MPDA 4FORA 3PPQA 3FXQA 2I3VA 3ODBA 4KCDA 5CBSA 4QSCA 4HXVA 2DS9A 3MWBA 1IITA 1XHYA 4IY5A 2A5TA 4IO3A 5TP9B 4R74A 3EHUA 4OFJA 3SEUA 1BLFA 2V3UA 5H8FB 4MLVA 1FQEA 4O8MA 2I4CA 4F39A 3D1RA 4MJOA 1AL3A 2WYPA 3CSGA 3FBPA 3RYDA 5AA4B 1FTKA 4QHQA 2Z22A 2QJEA 3G3KA 1FW0A 4QF9A 3IAZA 3L6HA 3CRBA 4Q0CA 1QVSA 3GXAA 4F3BA 1B5HA 3LC8A 4LZ8A 3RPLA 2O6AA 4GBVA 3UGWA 1LB9A 3EPEA 3SERA 1DSNA 3TODA 4RPOA 1DK4A 4Z0IA 1ZJLA 3T93B 3K1PA 4UA8A 4NN3A 1FQFA 3VXBA 4IR8A 3B6TA 2QVRA 3VE1B 3TTKA 2H25A 3S9LC 2PFYA 4GL8A 5BUUA 1B52A 2XXWA 5HPQA 1ELJA 1MQIA 2RKMA 4WXJA 3G7WA 4GBWA 1I69A 2XWOA 2OJTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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