2I0BA

Crystal structure of the glur6 ligand binding core elkq mutant dimer at 1.96 angstroms resolution
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREEVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITLAILKLQEQGKLHMMKEKWWRGNGC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Conformational restriction blocks glutamate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 86
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i0bA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i0bA02
4JBZA 5KDTA 2R6GE 4DE8A 3H4ZA 3EHUA 4KYEA 2GHAA 1XHYA 2Z22A 1S9TA 3N26A 4F31B 3M3FA 3FJMA 3C9HA 3C4MA 2VP1A 3LUYA 4OYVA 2VD2A 4FE8A 3GBAA 3TTRA 3VLVA 3RNNA 3Q29A 4G4PA 1P1WA 5FHOA 5DVJA 2GH9A 5I58A 4RYAA 3QUJA 3KN7A 4FJPA 4LP2B 3LR1A 2DQVA 3OEMA 1MY3A 1YAEA 4G8HA 4EF1A 3MZBA 4M1VA 3LC8A 1ZBMA 1AIVA 3FATA 4IGTA 1D9VA 5I2KB 2Y7IA 3FV2A 4O3CA 3C34A 4GXAA 4ZE9A 1SW5A 2HZKA 3SEYA 3LSXA 1FQDA 5A5XA 3FV1A 4OFLA 3FXQA 4GVOA 5AE4A 5AA2D 4HTGA 2XXHA 2OBGA 1PC3A 4ZEFA 2RF1A 1R9QA 1WODA 2VD3A 5ITPA 4KD5A 2QPQA 4OFOA 2FNCA 5KZTA 3MZ1A 3D4GA 2H4IA 5I2NA 2V3UA 3GZGA 4GWOA 1GV8A 1USYH 3PPRA 3CFXA 5B7DA 2DWHA 4XKQA 2QS2A 1FTMA 5H8NB 3GLBA 2REJA 3TODA 1URDA 5ICTA 3O6IA 4QFOA 4PFUA 2NWJA 3R26A 1N7XA 3Q28A 1NH7A 3PD8A 1FQFA 4GQOA 4BDOA 3TTKA 3H7MA 4DZ1A 4ZEIA 4H0WA 3PMWA 4U23A 2OWTA 5FHMA 5I59A 2DWIA 4QSDA 1M5CA 4I62A 1XVYA 4PFTA 3O6GA 2RC7A 4F1UA 1IZ1A 5L9OA 3FD3A 2UVIA 2IEEA 4GL0A 4GLIA 1B32A 4RK9A 2Y7KA 3K00A 5TP9A 1LLSA 4P0GA 5AA3A 2O1LA 3VXBA 2RCAA 2I4CA 4ELRA 3MC2A 3MP1A 4THIA 2I3VA 1N04A 4DCYA 3AXFA 3K6VA 5H8FA 1F9BA 4X9TA 1ELJA 2DOJA 3OXNA 3VFJA 2F7BA 2HZLA 5CC2A 3K01A 3MZ9A 4PQJA 5JK4A 4F1YA 3W9WA 3K02A 4U1OA 3HPIA 4X1DA 3TAJA 3SESA 2DWJA 1MPBA 2HCAA 4QF9A 1MQIA 4YB7A 1SYIA 3S2VA 1SI0A 1OVBA 2QJEA 1B4ZA 3CG1A 1II5A 3UIFA 1P1QA 4LZ7A 4YMBA 2PT2A 3EQ1A 2ONSA 1YCJA 3FGSA 2AL4A 5I56A 1A55A 2XHDA 1B7UA 4F3SA 2I58A 3LSFB 4WXJA 2RC9A 1D4NA 1SBPA 4OERA 2A5TB 4GD5A 3SEWA 4HCWA 4R2FA 2Z8FA 1M5DA 3RTFB 1UTHA 3FVOA 1NFTA 1Y3PA 3B6QA 4XKRA 2CZLA 3IB0A 1SI1A 3C33A 1B7HA 3IO6A 2M8CA 2QL3A 3VLUA 1JETA 4F2QA 2R71A 3QK6A 3G3JA 3T9XB 2O1MA 1FTJA 2ZNSA 4BDMA 4F19A 1QKAA 3OELA 4LONB 4MFIA 3T9UA 2PBWA 1PB9A 3UN6A 3F11A 3IAZA 2XX9A 4Z7EA 3PD9A 3K0VA 4FEBA 1MRPA 1MXXA 4ECFA 2QMXA 3K1PA 1B3HA 4BLAA 1PBQA 4ZZEA 4IO2A 4NMYA 4JXIA 2I6EA 1OQGA 1Z7NE 3TDJA 2X26A 2H9BA 4KPTA 3TQLA 4ELQA 2PMSA 4ZEDA 4I9DA 1SD3A 2GFEA 3QXMA 1A8FA 3DP4A 3T66A 1S7YA 1IIWA 3ZKLA 4YKKA 3E9XA 2Q8JA 4H1XA 3MJNA 2OLBA 3ECRA 1R6ZA 3DELB 3U8QA 1Q35A 1JNFA 4ZEBA 1HSJA 4ZECA 3OO6A 4GL8A 1N3WA 1A99A 4X1BA 2ZXTA 4IO3A 1B58A 1B3LA 4GFRA 3KJTA 2UYEA 2P1SA 5I84A 1MDQA 5ISUA 3PMVA 3EPEA 5HM4B 1A40A 3CFZA 4WEPA 4ELOA 3G3HA 3CVGA 4KR5A 4RJZA 1MXWA 4FIMA 2XXIA 3VLWA 3IK6B 1B51A 4YAHX 2Y7RA 3K2DA 2X7QA 1OLCA 5TPAA 3MVWA 4YKIA 2H98A 3C35A 4Z0IA 4MLVA 1UTHB 3B6TA 3O6HA 3ODBA 3ZKKA 3MAMA 3IL1B 4L17A 3KGCA 1EZ9A 2NOOA 2AIXA 2E1SA 5H8QB 4RXLA 4Q30B 2KLFA 3RT8A 2X7PA 2ZYKA 2NVUB 1NNFA 3GXAA 3O97A 1O63A 2P0SA 5J1DA 3CG3A 3S9MC 4LVQA 4RPNA 1DPPA 2THIA 2VOZA 3IOWA 3SETA 4OETA 1LAFE 4MLQA 3CI8A 1QJMA 1H3DA 4XIGQ 1VSOA 1R1NA 4LUBA 3T9HB 2IA4A 2F7AA 1FQCA 1PB7A 1IXGA 1AMFA 1H43A 2QSXA 4OESA 4G8MA 4ONYA 4LZ5A 5K2XA 2XXWA 4H65A 1WDNA 5CI5A 3FASA 3FJGA 3O2AA 3QAXA 4JB7A 3R6UA 2UVHA 1M5FA 1P99A 5AA2A 1BLFA 1MQDA 2QMWA 4I1DA 1DSNA 5KCJA 4C1UA 1MXZA 3M8UA 4KYDA 4EUOA 4LATA 2OK2A 3FZVA 1MH4A 2D21A 2F35A 3D4CA 4NF4A 3W15C 4M4GA 1O64A 4AQ4A 1ATGA 1Y9UA 4DXCA 3K6UA 2OZZA 1QUKA 2OWSA 3CRBA 3PPPA 4RA1A 1URSA 4NEDA 2NUVA 3EHSA 1NMUA 1LBBA 3SDFA 3MP8A 4KCDA 5TU0A 5DEXB 4IGRA 5F7VA 4F1VA 1MQGA 4IO5A 1LGBC 1BTJA 5TPAB 1VR5A 3SEXA 1LFIA 1VFEA 3OMBA 5H8HA 3HCQA 2ANJA 2ONKE 4U4XA 4O3AA 3JV9A 3OD7A 3W9VA 3ZS6A 3OSQA 4Q5TA 2I0BA 4HCYA 5H8SA 2ONRA 3V8XB 3L6HA 4YICA 2XX8A 2I0CA 4QSEA 5I57B 2FYIA 3CIJA 5IKBA 3EF7A 3G3KA 2ZYOA 3PPNA 2UVGA 3PGFA 4IO4A 2DE4A 2F36A 3FJ7A 2DYXA 3SERA 1SYHA 4N13A 3FIRA 2Z23A 2OJTA 2Q2AA 4LQ2A 3IOTA 4QFNA 3MQ9A 3PPOA 3O9PA 5KDTB 4KFQA 1B0LA 3IJOB 1I6QA 4QFKA 5CRYA 1UIUA 4IO6A 3U94A 3TEPA 2HFBA 2LAOA 1PDAA 1B6HA 3BKIB 3UP9A 3JYRA 1XT8A 3O29A 4R9FA 3OENA 2QS1A 3UK4A 5AA2B 1N84A 5DYHA 5I58B 3IORA 4YB6A 3BFUA 4OEUA 3LBSA 1TWYA 4TQUQ 1GR2A 4U2RA 3LSWA 3G3IA 3M3LA 1H45A 1BP5A 2YJPA 4R6YA 3Q27A 3FVNA 2F7CA 4G8NA 1B5IA 1GVCA 1IXHA 1UIVA 5CBSA 1ZKBA 1J1NA 3H03A 3PMXA 1H76A 1GTKA 3PUXE 4GF8A 1DMBA 3IB2A 2F78A 1AL3A 2O7IA 3OEKA 1O7TA 1URGA 3CFLA 3RPWA 3S9LC 5A5XB 1NNKA 3TFLA 1POY1 2I49A 2PVUA 1Z7ME 4OWDA 5ELVA 1B3FA 4JDFA 4ZE8A 4H6DA 1LB8A 3S4UA 4MH5A 4OZ9A 4NF5A 4U22A 4KHZE 4R74A 4TLLB 5AA4A 4JWXA 4ZDMA 3N94A 3A3UA 5I2NB 3PUZE 4K3FA 1B46A 2CMOA 4NF8A 2QRYA 3EHTA 1MG1A 2A5SA 4G2ZA 4H5GA 2O51A 3MW0A 3OO7A 3PUWE 1LAHE 4U21A 2QS3A 1B9JA 1IUDA 3GBBA 3HO7A 2V84A 3B6WA 4MBPA 4EDPA 3K1NA 2F5XA 4DDDA 2F6PA 4IY6A 3TUSA 3QUFA 1FTOA 2O84X 4F39A 1MH3A 5CMCA 1LAGE 2XD2A 2AL5A 2DE2A 3MVXA 3ILTB 1IITA 1P1NA 5JTYA 5I59B 4WKMA 1XOCA 2UXAA 3U1OA 4TLMB 4DIGA 1QUIA 3O66A 4UA8A 1QUJA 2DVZA 4JWYA 1NNTA 5TP9B 1JW1A 1US4A 4RNSA 3P7IA 3THIA 2ABHA 2B3FA 3Q25A 2QS4A 3Q26A 3MP6A 3HN0A 1UQWA 2GHBA 4QFPA 1TFDA 1BIYA 5BWJA 3SEVA 4EXKA 3K4UA 5H8FB 1CE2A 2Y7PA 2DXYA 4EXLA 1UTBA 2GRVA 4QHQA 1VFDA 5FTHA 4BDRA 4C0RA 1DOTA 4PETA 1NH8A 4O3BA 5CMMA 4LQ5A 3RT6B 3WAFA 1FQAA 3MBPA 2H25A 3KBRA 3H06B 4XXUA 4NWDA 1R9LA 5FTIA 3N6TA 4NF6A 5EHMA 1FCKA 1MY0A 3MPLA 3TYHA 3TMGA 1B2HA 4RY1A 4F22A 1IEJA 5L9MA 3VE1B 3H6TA 5I56B 2DS9A 4XKNA 3TPAA 3SEUA 4WEDA 3TCHA 3HHGA 4F29A 3VDFA 2P2AA 5BUUA 5AA1A 2I48A 3WAEA 2O69A 1MY1A 4DLDA 1YTVA 5I2KA 4PP0A 4UACA 3I3VA 3TCGA 4F3BA 1MS7A 4YU0A 3TKDA 3TTMA 1SW1A 2PX1A 3KJ7A 2G93A 1MXUA 3KOTA 1N76A 1SDXA 2O68A 4G68C 3T9VA 3M3KA 5K2YA 1JW5A 3QSLA 5DT6A 2REGA 5JTYB 1VE4A 5FHNA 3EN3A 4EQBA 1LFHA 5DTBA 2H99A 1EZOA 1SQYA 4XKPA 2DXRA 4FAJA 3KFMA 2RC8A 1B3EA 3KG2A 4JSDA 1B5HA 1B7ZA 2V3QA 4DXUA 1I6BA 3MWBA 1QULA 4HS7A 1ZIUA 1B40A 4YZZA 3V5AA 1Y3QA 5M2VA 1LFGA 1DTZA 4YMAA 3BFTA 2XXYA 4OQOA 1SW4A 1Y1MA 3H6VA 2V3TA 1Y3NA 2XX7A 2ZNUA 4F18A 1UTBB 1RYXA 4KCCA 3C36A 3KZGA 1JW4A 3L6GA 4R6HA 4Q0CA 3C32A 3TCFA 3TTLA 3FVKA 4N07A 3RY3A 1JVXA 1KWHA 4FATA 1B1XA 4NF6B 3IR1A 3LSLA 1MXYA 4C1TA 4GOTA 5EYFA 2YPNA 4GIZA 4QFLA 3KEIA 1PB8A 1GGGA 1MM7A 3H6UA 1QW0A 3K1MA 4POXA 4DCXA 3TQWA 4RK2A 2RINA 4DXBA 3DM0A 2DE3A 1JEVA 3U72A 1A7LA 1EZPA 1N3XA 2ALUA 3QYTA 1ZMGA 3USDA 3RLFE 1A54A 3CSBA 1PEBA 4F3GA 2Z8EA 1Q1KA 1NL5A 1AH5A 3MUQA 5HBCA 4R72A 2ZYMA 2H5YA 5ICQA 2DSFA 4ZEKA 1YPNA 4OMBA 3OO8A 1JVYA 2VGQA 5ITOA 4H5FA 1IXCA 4R73A 5IAIA 3KOSA 2V93A 1ZJLA 2AYSA 1TFAA 3VVDA 2A5TA 2HAVA 1B1HA 1I69A 4OHNA 3MVZA 1DPEA 3PV0E 4ELPA 2F6GA 4GRKA 1D3KA 1US5A 2DP8A 2E0SA 3A09A 3JZJA 1MM6A 1N0TA 4G68A 3U92A 2HQ0A 1MXVA 1CB6A 1S50A 5KCJB 4E0XA 2XD3A 2Y7WA 3TTNA 2ZNTA 3E3KA 3VVEA 3T93B 4RPOA 4NF4B 2YLNA 2XXRA 3UGWA 2Q2CA 4BDLA 1B3GA 4OVJA 4U1ZA 2PYYA 4PFWA 1B0HA 4ZZAA 3B7DA 4R75A 2ZMBA 3TZAA 4OEVA 3RTWB 2O7UA 1P1UA 2PT1A 3HSTA 2B65A 3ONMA 2RCBA 4FECA 4AB5A 4G77A 3BBRA 4KQPA 2NXOA 4TOZA 1LCFA 4BDNA 1TT1A 3IB1A 2Q89A 5CM6A 3N5LA 3PU5A 5DVIA 3PUYE 4POWA 1LCTA 5H8HB 5L8DA 1SW2A 2ESNA 2DVCA 1NKXA 3PPQA 2UYFA 4E0WA 4ZS9A 4Q8RA 3OOAA 4OENA 1IQ7A 2Q88A 4I8CA 1B52A 1PBPA 3V89B 4EQ7A 1A8EA 2XXPA 2I3WA 5B70A 1RYOA 4XTCQ 4PFYA 3I5OA 5JEIA 5L9SA 3N6UA 2HXWA 2ZYNA 1BKAA 4NE4A 3T22A 4N6PA 3V83A 1MQJA 1POTA 1XS5A 1MY4A 2D3IA 3KSJA 4NWCA 2F8DA 3C31A 3H6WA 3IO4A 3VVFA 2XXXA 2XXUA 2VHAA 1M5EA 3T96B 3DP8A 3IOVA 3E13X 3KN8A 1Y20A 3MPKA 1LBCA 1ZTYA 1D9YA 4KI0E 3ILUB 2HEUA 3I6VA 3IX1A 2WKYA 4R2BA 1I6AA 4H8IA 3ZSFA 3RUMA 3RGYA 3MVYA 1MDP1 3KN3A 4G68B 4FORA 2OCUA 3DLNA 1B05A 5DVFA 2RKMA 3FXRA 4H8JA 1OIBA 5H8QA 4LA9A 4MF3A 4AB6A 2FA7A 1USYE 1ZLQA 2Q9TA 4QRZA 1DTGA 5CMBA 1H44A 4ESWA 1ANFA 2V25A 4OFJA 1QKBA 3O28A 3S9NC 3G3FA 5HPQA 1B5JA 1FQEA 1Y1ZA 4U4SA 1HSLA 2XXTA 1LAXA 1MPCA 2HAUA 4IB2A 1OMPA 2Y84A 4ESXA 1M5BA 3G7WA 2Z8DA 1OLAA 4ISUA 3CR9A 4NTLA 3K6XA 1MPDA 4F3PA 3RN8A 3K6WA 4JSOA 3H3GA 4IY5A 4NF5B 3IOUA 1WVJA 2G29A 5AA4B 2XXQA 1NNPA 1B4HA 2DWAA 3FVGA 2R9JA 3VXCA 4ND9A 1MQHA 1RKMA 4NF8B 3CSGA 2F34A 4H67A 4P0IA 3PUVE 1QVSA 2F97A 4YB5A 1FTKA 3HHFA 4QSCA 4LZ8A 1HSEA 2O6AA 4P11A 5LOMA 1L5TA 3OSRA 4R6KA 1LSTA 4HW8A 1SVXB 3A3CA 4JWOA 2B3BA 3QIMA 3SKPA 3UA8A 5DEXA 1FQBA 1AOVA 1MY2A 1OVTA 4OTEA 1P1OA 4F2OA 1IXIA 5CBRA 1T0KA 1JQFA 1XC1A 2I4BA 3S9EA 1XVXA 3FXUA 1EH3A 3E4RA 4KYSA 3U93A 4R9GA 1FTLA 3UORA 2D5WA 1FW0A 5F1QA 1LB9A 5CMKA 2BJJX 2UVJA 4OXVA 3VV5A 1Y4CA 3TELA 1TXFA 4YKJA 4GXSB 3RQTA 1ZU0A 3DP6A 4EF2A 3OO9A 3R7XA 5H8NA 3HV1A 5I57A 1OQHA 3KSXA 4BDQA 4IO7A 2XXVA 3G3GA 4YKPA 2W7YA 1JEUA 1Y4TA 4X48A 5EHSA 4PE5B 3IJXB 1EU8A 4EQ9A 3FUZA 4FEDA 1N7WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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