2I3VA

Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: structure of g725c mutant
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGCNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Measurement of Conformational Changes accompanying Desensitization in an Ionotropic Glutamate Receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 76
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3vA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3vA02
5I2NA 4M4GA 3O6GA 1Y4TA 1B51A 4YB6A 1MM7A 4RA1A 3PPOA 3T9UA 1B4ZA 4KYEA 4JWYA 3MP6A 1MDP1 4YZZA 3PPNA 4G68B 4C0RA 1FTJA 2F5XA 3TQLA 3D4CA 2OWSA 4QHQA 3QYTA 5ITPA 4OEVA 1IXGA 4NWCA 5CBSA 1PB9A 1GGGA 4KHZE 1L5TA 5L8DA 4KD5A 2QRYA 4JWXA 1I6QA 4NF6A 1ZU0A 4P11A 3H4ZA 3VDFA 1FW0A 1FTOA 1D4NA 2I6EA 4H1XA 2GFEA 1DPPA 2PT1A 4YAHX 2ZYOA 3TZAA 3OXNA 3Q28A 1MXWA 1LFIA 5DEXA 3SEYA 2AL5A 4LATA 2YJPA 3CFZA 4OWDA 5IKBA 3QUJA 1A55A 2Y84A 4JXIA 1IITA 1B3HA 1MY4A 4PQJA 1Y20A 4G68A 4YMBA 3U1OA 1RKMA 2RINA 2B3BA 4FE8A 2OWTA 4NF8B 3QUFA 4UA8A 2O51A 4BLAA 3UK4A 3A3CA 3GXAA 1SQYA 3RLFE 4U4SA 1P1WA 3MZBA 4NTLA 3U93A 1B3LA 1I6AA 4QSDA 3L6GA 3S9NC 1NMUA 4RNSA 5I57B 1FQFA 3A3UA 4YKJA 4HW8A 3FVKA 5FTHA 2Y7WA 3PU5A 3CFXA 5CRYA 1S7YA 1J1NA 1ZBMA 2DVCA 1MS7A 3BFTA 1QULA 3T22A 1FTLA 1R9LA 3CFLA 4R74A 3BBRA 2DE4A 4F1VA 4OMBA 3VLUA 3PD9A 3MP8A 3LR1A 3TCGA 5ICTA 2O1LA 4NF8A 3K1NA 3QSLA 3K0VA 3Q26A 4MFIA 5I84A 5CC2A 5I2KB 1B7HA 3TYHA 3DP8A 2QS4A 4Q5TA 4XKQA 2XXUA 3FD3A 5I57A 3KGCA 5L9OA 4AQ4A 1Y1MA 3OMBA 2V25A 3VVDA 1VFDA 4ZEFA 1NNPA 2QJEA 1TT1A 2P2AA 2V93A 1B52A 4YB5A 5H8SA 3ILTB 1URDA 1I69A 2W7YA 2H25A 1LGBC 4F1UA 2E1SA 4ECFA 3K6WA 3PD8A 3FV1A 1A54A 4ZEKA 3T66A 2XXWA 1MXUA 4ZECA 3UIFA 4ZS9A 2H5YA 4EQ7A 2HXWA 2PMSA 4HCWA 5DT6A 3MUQA 1LAXA 1US4A 3OOAA 2XX8A 1M5CA 5I2KA 1MQGA 5IAIA 1QUKA 1N84A 3K6UA 3MVZA 4QFNA 3FJ7A 2I0CA 3OSRA 2RCAA 3C31A 4OFOA 1LAFE 4IO4A 1Y4CA 4LZ7A 2DYXA 4TQUQ 4F22A 2X26A 3FJMA 3KSJA 1MY3A 5I58B 3HPIA 2NXOA 3I3VA 3U94A 1UIVA 3KG2A 3UP9A 1F9BA 4LP2B 1MQJA 2UYFA 1Z7ME 4G8MA 4JWOA 2XXQA 4QFKA 3TAJA 3S2VA 2DP8A 3BKIB 1YPNA 4XIGQ 3F11A 4ELOA 1PB8A 3AXFA 2ZYMA 3UN6A 3EHTA 5H8FA 4RJZA 4G68C 2V3TA 1POY1 2FNCA 1B6HA 2R9JA 1QVSA 3TKDA 5KCJB 3S9EA 1JEUA 1RYXA 3ZKLA 3CVGA 4X48A 3V89B 4Z7EA 1P1NA 2OBGA 5AE4A 3EN3A 1ZTYA 1MM6A 1GV8A 1B5JA 2ONKE 3FIRA 4DLDA 4EXLA 4R9FA 1Q1KA 1MH4A 1O7TA 4C1UA 3TUSA 1MRPA 4KFQA 1B0HA 3N5LA 5I58A 4ZE8A 3EHUA 1ATGA 4O3AA 4FECA 2QMXA 3PUXE 1SDXA 1B1XA 3QAXA 1M5DA 4GXAA 4OEUA 3GBAA 3SERA 2V3UA 2PYYA 1AH5A 4RK9A 2XXYA 4DCXA 4I8CA 1D3KA 3K4UA 4PFUA 1JETA 2NUVA 4G4PA 3TEPA 2O69A 1NH8A 3RTFB 5KCJA 3R6UA 2HAVA 1T0KA 1MY2A 3FZVA 3CSGA 1POTA 3P7IA 4G8HA 5L9SA 1M5EA 1YCJA 1PBPA 1YTVA 4DE8A 4HCYA 1LCFA 2LAOA 2GHAA 3W9VA 1QKBA 1IIWA 4DDDA 1H44A 3KN7A 1B0LA 2GH9A 3M3KA 3TPAA 4IY6A 3C36A 2THIA 1M5FA 3PGFA 1LCTA 4I9DA 2AYSA 3TELA 3K02A 2RF1A 4THIA 4GD5A 4NF5B 1Y3NA 1HSJA 2A5TB 1NKXA 3TTRA 4X1BA 2IA4A 4KYSA 3UORA 2F36A 3MZ9A 3HHFA 4EUOA 2PX1A 3VXCA 3C33A 1MPDA 1B46A 3I5OA 3VFJA 3WAFA 3VXBA 1DTZA 1S9TA 1N04A 4WEDA 4M1VA 1AMFA 3KSXA 5EYFA 4FORA 4F39A 5HM4B 2ZNUA 3T9XB 2F7BA 2XXVA 4DXCA 2PVUA 4OHNA 2I3VA 1FQBA 3JYRA 3RUMA 2UVJA 3OENA 3MVXA 2BJJX 4RK2A 4LQ2A 3HN0A 3IOUA 4G77A 1MPCA 4H6DA 4NF5A 1B05A 5KZTA 5LOMA 1PBQA 2A5TA 2XXHA 1IEJA 2Q2CA 3FXUA 3CSBA 2DQVA 3CG1A 4OERA 3S4UA 2VD2A 1H45A 4YKIA 4BDRA 5AA3A 4PP0A 4PFTA 2G29A 3ZS6A 1Q35A 4OYVA 4QRZA 1IXCA 3FXRA 3LSLA 3V5AA 2F97A 3OEKA 4RPNA 3H6VA 4YICA 5H8HB 3MC2A 3L6HA 3RNNA 1NL5A 1SI0A 1TFAA 1MH3A 4IO3A 4RXLA 1B40A 2ONSA 4ESXA 4OENA 5K2XA 4LZ5A 1BTJA 3QXMA 3C9HA 2QL3A 1VE4A 3R26A 4QF9A 4R6HA 1LAGE 1TFDA 3MZ1A 5L9MA 3SEUA 4I62A 5TPAB 4LUBA 4KCDA 3FGSA 2Q88A 1UTHB 2OCUA 4H8JA 1MQDA 3K1MA 3PUZE 1P99A 2RCBA 2Z8FA 4EDPA 2O84X 1ZLQA 2D5WA 2DWJA 3IAZA 4EF2A 4NWDA 2XD2A 3LSXA 5ELVA 3LC8A 1IUDA 1LFGA 1FTMA 4OQOA 2I4BA 4OFLA 5AA2B 2PBWA 4AB6A 1IXIA 4XTCQ 2VGQA 1GTKA 3IX1A 4TLLB 3SEWA 5AA4B 3PMVA 3MPLA 3TFLA 1VR5A 1BLFA 4O3BA 1KWHA 5BWJA 5DVJA 5H8HA 1VSOA 1B9JA 3QIMA 1EZPA 1WDNA 1SW1A 3VVFA 1B3FA 3FVGA 4WEPA 1Y1ZA 2DSFA 1GVCA 4BDOA 5TPAA 1LAHE 3DM0A 3O6HA 1LB9A 1UQWA 5KDTB 3OD7A 1TXFA 2ZMBA 1UTHA 2AL4A 2ZXTA 3C34A 1A40A 2I48A 5FHOA 3T9VA 1B4HA 2ZNTA 1N7WA 3VLWA 3CRBA 5AA2A 1R6ZA 3ILUB 4HTGA 5CBRA 3IOTA 5AA4A 3MAMA 2WKYA 4F31B 3CG3A 1XC1A 2F34A 1B3EA 3KJ7A 3A09A 3ZSFA 4DXBA 2QS1A 1SYIA 3G3JA 1B2HA 4NF4B 5FTIA 1JQFA 3OO9A 2HFBA 4BDQA 1NH7A 5B7DA 4ND9A 4WKMA 1R1NA 2OZZA 2XX7A 5DVIA 4Q8RA 1DMBA 1LB8A 4GXSB 3SKPA 3U92A 4XXUA 4UACA 1H43A 4H0WA 1Y9UA 1FQCA 2OLBA 4Z0IA 3RGYA 3E3KA 2HAUA 3KFMA 5HBCA 4LA9A 5CI5A 2RKMA 2OK2A 3SEXA 3B6WA 2XXTA 3CR9A 1URSA 2GHBA 4QSCA 4P0IA 5KDTA 4ELRA 1D9YA 3IOVA 2ESNA 1CE2A 2UVHA 4EXKA 4AB5A 1H76A 1XHYA 3C35A 1PB7A 2XHDA 5CMCA 5HPQA 3H06B 4FIMA 3K00A 1B7UA 3VV5A 4F2QA 3MW0A 2F7AA 4MLQA 4P0GA 2REGA 3ONMA 1XVYA 3N26A 1US5A 4ZEDA 5H8NB 5DVFA 3VVEA 1M5BA 4NF4A 2OJTA 5DTBA 4NE4A 2G93A 4ZEIA 5ITOA 4ZZAA 4ISUA 2X7PA 3Q27A 3USDA 1QUJA 2HCAA 4U21A 1OIBA 1ZIUA 3RT8A 4F18A 2VHAA 2XXPA 3EF7A 1A8FA 2ONRA 4GOTA 4GL8A 3B6TA 2O68A 4XKPA 3S9LC 4DCYA 3Q29A 3MP1A 5AA2D 3JV9A 4QFOA 5FHNA 3TMGA 4F3PA 4DXUA 3MPKA 1II5A 4R2BA 3M3LA 4K3FA 1SW4A 2D3IA 1LSTA 5ICQA 1MY0A 1URGA 3V8XB 4YKKA 2ZYNA 1FQAA 3UA8A 1PEBA 1DPEA 1EU8A 2Z22A 4KR5A 2KLFA 1PDAA 2QS2A 1XS5A 3IK6B 4X1DA 4YMAA 1B5IA 4N13A 2XXXA 5H8NA 2NOOA 1JEVA 1AIVA 1JW4A 1MXZA 3KN3A 3RTWB 4MF3A 1N3XA 3TCFA 2Z8EA 3THIA 1N0TA 2H98A 4U1ZA 3GZGA 4H5FA 4H67A 3DP6A 1WODA 4QSEA 3CI8A 4H8IA 2I4CA 3MWBA 2F8DA 2Y7IA 3KOTA 1HSEA 3H6WA 1NFTA 1SW5A 2XD3A 3SEVA 4L17A 3OO7A 4TLMB 2DVZA 5EHSA 1QKAA 3KEIA 2DS9A 3TODA 4FATA 4GQOA 1I6BA 3OELA 4DIGA 4JSOA 1O63A 4ESWA 4F19A 2DOJA 1DOTA 5K2YA 3G7WA 1HSLA 3T9HB 1B32A 4F3SA 1OLAA 2R71A 3I6VA 3IR1A 2QMWA 5TP9B 4KI0E 4N6PA 3FXQA 5BUUA 2HQ0A 2ZNSA 3B6QA 2HZLA 1MY1A 2Q2AA 2O1MA 5DEXB 1TWYA 4KCCA 2GRVA 1BP5A 3FUZA 3PMWA 1B58A 1H3DA 3VLVA 2HZKA 4E0XA 1NNFA 4IO6A 2O7IA 3U8QA 1B7ZA 5AA1A 3OSQA 1EZOA 4OFJA 1BIYA 1XT8A 1WVJA 3U72A 4EF1A 4OZ9A 2RC7A 2VP1A 1SBPA 2QSXA 4FJPA 3MVYA 4H5GA 4U22A 4PFYA 3FVNA 2XX9A 3GBBA 3C4MA 2CMOA 3TDJA 2XXRA 3MQ9A 4H65A 1MQIA 3CIJA 4R2FA 3K2DA 5TP9A 1OLCA 2I58A 2I49A 3DP4A 1SVXB 3IB1A 2A5SA 4F3BA 1B1HA 4ZZEA 3FV2A 2AIXA 2Y7KA 1MXVA 3T93B 2DE2A 4DZ1A 3O29A 2Z23A 1P1UA 4ELPA 5J1DA 2H99A 3D4GA 5CMKA 2Q89A 2DXYA 3FASA 2XXIA 3G3IA 3V83A 3E9XA 2PT2A 3TTMA 4LONB 3O9PA 1VFEA 2FYIA 4R73A 4KQPA 1D9VA 1XOCA 2F6GA 4BDLA 4U4XA 3K1PA 4WXJA 2UVGA 5B70A 3MBPA 3HV1A 1YAEA 3KBRA 5CM6A 4ZEBA 3K01A 2Z8DA 2Y7PA 4GIZA 3H03A 4IO2A 4NMYA 4ONYA 3O6IA 4LZ8A 3PMXA 4IO5A 4FEBA 1NNTA 3KJTA 3S9MC 4GWOA 1LBBA 2NVUB 5DYHA 1SI1A 4IB2A 4JSDA 4KPTA 2QPQA 4RYAA 3RY3A 3G3GA 3LUYA 3MVWA 4GFRA 4FEDA 1JVXA 3O66A 3BFUA 4OESA 1LFHA 2I0BA 1JW1A 4OETA 3N94A 2REJA 1GR2A 4NEDA 5JK4A 3GLBA 1ANFA 3FATA 3IJOB 1MQHA 4MH5A 1A99A 3M3FA 5A5XB 2HEUA 3PPPA 3PUVE 3HSTA 4U2RA 3TQWA 1N3WA 1P1OA 4I1DA 1DSNA 2F7CA 2O6AA 4JB7A 2VD3A 1MXXA 3SDFA 3W9WA 1JW5A 2P1SA 2DXRA 3IB0A 3EPEA 4TOZA 4U1OA 2Q8JA 4OTEA 4G2ZA 1AOVA 2V3QA 1USYH 4GRKA 2VOZA 2RC9A 5F1QA 1IZ1A 3Q25A 4LQ5A 5H8QB 3TTNA 1AL3A 2UYEA 3H6UA 3QK6A 4XKRA 4N07A 3HO7A 4R6KA 1R9QA 5FHMA 2YPNA 2H9BA 3RPWA 5I59B 3HHGA 1MPBA 3IORA 1QUIA 5H8FB 3DLNA 1SD3A 3E4RA 1ZMGA 4F3GA 1EZ9A 3OO6A 4OVJA 3W15C 4KYDA 4R6YA 2FA7A 3KZGA 1SYHA 1FCKA 3N6UA 3LSWA 2R6GE 2E0SA 3UGWA 3E13X 3H3GA 3PUWE 3O28A 5A5XA 3PPQA 1N76A 5F7VA 2V84A 1O64A 1BKAA 1S50A 3IO4A 1LBCA 4R75A 3EHSA 1IQ7A 3PUYE 4JBZA 2QS3A 4C1TA 4POWA 1ZKBA 2ALUA 2ZYKA 4G8NA 1UTBB 1DTGA 2Y7RA 5H8QA 4IGRA 4YB7A 3OEMA 1P1QA 1ZJLA 4RPOA 1JVYA 4RY1A 4MLVA 2YLNA 1MDQA 2M8CA 3O97A 4BDNA 4MBPA 2DWIA 3KN8A 4EQ9A 3HCQA 5I59A 3T96B 4PFWA 3JZJA 5EHMA 3WAEA 2Q9TA 4QFLA 4GF8A 4YKPA 4F29A 1QW0A 3RN8A 1PC3A 4LVQA 4U23A 1ELJA 4F2OA 2F78A 4O3CA 4IGTA 1RYOA 1OVTA 1Y3QA 4ZDMA 3LBSA 3TTLA 1A8EA 1UIUA 5TU0A 4YU0A 1FQEA 2UVIA 3N6TA 3MJNA 2DE3A 2H4IA 3K6VA 2ABHA 1JNFA 3SESA 3H7MA 2D21A 2DWAA 4IY5A 2I3WA 2B65A 2X7QA 1OQGA 4X9TA 2IEEA 3OO8A 2ANJA 4PETA 4GVOA 5CMMA 4FAJA 1OVBA 1UTBA 1N7XA 2F6PA 4BDMA 3B7DA 3G3KA 1CB6A 1MG1A 2F35A 4HS7A 4OXVA 5M2VA 2DWHA 3PPRA 5JTYB 5I56B 1FTKA 3G3FA 2O7UA 4JDFA 2NWJA 3ECRA 2UXAA 3IO6A 1USYE 5I2NB 1IXHA 1A7LA 4Q30B 3KOSA 4QFPA 1XVXA 4GLIA 5ISUA 3PV0E 4POXA 3IOWA 4EQBA 1QJMA 3SETA 1B3GA 3TTKA 4ZE9A 5CMBA 4XKNA 3G3HA 3IL1B 4Q0CA 3RQTA 3DELB 1B5HA 1MXYA 3RT6B 3EQ1A 4E0WA 3O2AA 4R9GA 3IB2A 3ODBA 2B3FA 2RC8A 1SW2A 1OMPA 1Y3PA 4GL0A 4NF6B 3IJXB 3VE1B 3FVOA 1LLSA 2CZLA 4PE5B 3C32A 3H6TA 1Z7NE 3R7XA 1OQHA 4ELQA 3FJGA 4R72A 5JEIA 4IO7A 5JTYA 3M8UA 5I56A 4F1YA 1FQDA 3LSFB 3ZKKA 2P0SA 3TCHA 1EH3A 3K6XA 1NNKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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