2I3WA

Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: structure of s729c mutant
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDCKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Measurement of Conformational Changes accompanying Desensitization in an Ionotropic Glutamate Receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 79
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3wA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3wA02
3ZKLA 2AL5A 2UXAA 1EU8A 3TFLA 3DP6A 1SW4A 2QRYA 3MVWA 4F31B 4ISUA 3C31A 3SDFA 2NUVA 3TCGA 3RQTA 5ICQA 4UA8A 1J1NA 2DE3A 4KR5A 1MXUA 1B0LA 1R6ZA 3VLUA 3UP9A 1F9BA 4YAHX 3U72A 3Q29A 3TMGA 1MY3A 1NL5A 5AA4B 4POWA 2VOZA 1LCFA 5KCJA 3DELB 1LB8A 1WVJA 1IUDA 3EF7A 1ATGA 3JZJA 3CSGA 5K2XA 2O68A 5DVFA 3V83A 1FQCA 4IO5A 4DXCA 2B65A 3PD9A 4U4XA 2XXYA 1PB8A 1P1UA 4QFPA 4GQOA 1LSTA 4HTGA 2ZYNA 3PGFA 4YKPA 4TQUQ 5TP9B 4GIZA 1B46A 3U1OA 2XXUA 3CG3A 3FJMA 2Q88A 4TLLB 4EUOA 3I3VA 5TU0A 2G29A 1SYHA 4LQ2A 2P1SA 1USYE 1A99A 1MXYA 2PYYA 4JWYA 1PBQA 5KZTA 2OWSA 3SKPA 2RF1A 3KEIA 2NWJA 3ILUB 4DXBA 4F18A 3FXQA 2XXIA 1BP5A 1B32A 4I1DA 1NKXA 1OIBA 3IL1B 1L5TA 3TELA 4LZ5A 4U4SA 3CFXA 1MY4A 3LUYA 2O84X 3RUMA 2AYSA 1H43A 1UIUA 3MW0A 1SI1A 2ALUA 4JSOA 1UTBB 4M4GA 3PMXA 4WEDA 3TCHA 2F7BA 4U2RA 5I56B 4DCXA 5EHSA 3G3KA 2ZMBA 1MY2A 1N0TA 2H99A 3TQWA 1URDA 4QRZA 3EHSA 1M5DA 3E9XA 1SW1A 3FVOA 4F39A 1B4HA 3O6HA 5I59B 2F7AA 2XHDA 3KSXA 4NF6A 5H8NA 3QUFA 1URSA 4JBZA 4YZZA 2H5YA 2NOOA 3MBPA 3GZGA 4R2FA 2Q8JA 3R6UA 2W7YA 2ZXTA 4NWDA 1R1NA 1R9QA 2ZNUA 1PDAA 5H8FA 1TFDA 4OTEA 2AIXA 3S9EA 3U93A 1S50A 1D9YA 4EQ7A 1QW0A 1Z7ME 4RNSA 3TQLA 3RTFB 1B2HA 1NH8A 1R9LA 1RYXA 3MZ1A 1H3DA 1MPBA 5TPAB 3CIJA 4BLAA 4PP0A 1NNFA 3I6VA 4F2QA 2FNCA 2OK2A 4QHQA 1NMUA 1M5FA 3PMWA 1MQIA 2UYFA 2O1MA 2R9JA 1B05A 2ZYKA 3MPKA 1MXWA 4ZEBA 1B3GA 3D4GA 3GLBA 5AA4A 2V3TA 5CI5A 2PT1A 1ZBMA 2DYXA 3ILTB 2Z22A 1JW4A 2X26A 4H67A 4MBPA 3OO9A 3IX1A 1Y3QA 1YCJA 1B40A 5TP9A 1FCKA 4R9FA 3UIFA 3M8UA 3PU5A 4C0RA 1LFHA 1O64A 5IAIA 5HPQA 1EZ9A 2F34A 4I9DA 4L17A 4HCWA 4FORA 3UA8A 3R7XA 2LAOA 1OMPA 1LLSA 2A5TB 3C35A 1B58A 5CMMA 3WAEA 1H44A 4QFLA 3QYTA 4RYAA 2Z8EA 1I6BA 3P7IA 3LSLA 3IB0A 2F97A 3H6UA 1N7WA 3UORA 4N13A 3TCFA 3H4ZA 4LZ7A 3RT6B 3PMVA 1MH3A 2DP8A 2FYIA 3E13X 1UTBA 1A55A 1P1NA 4UACA 5H8QB 3K2DA 1PEBA 5I56A 3C4MA 4KYDA 1VR5A 2F36A 2HAVA 4NF4B 4XKPA 3BFUA 4GFRA 1A8FA 3THIA 5L9OA 1POY1 2Y7IA 4NEDA 3OMBA 5I59A 1IXHA 4RY1A 2E1SA 3K4UA 3L6GA 4NF8B 1B7UA 4LZ8A 5FTHA 2XD2A 4H1XA 2Y7PA 4GL0A 2ZNSA 2HZKA 1MM6A 5AA3A 1FTJA 3VXBA 4DIGA 2QL3A 4THIA 5H8HB 3OD7A 2VD3A 3I5OA 3KFMA 2H4IA 5JEIA 3OXNA 1SW5A 1QUIA 2VGQA 1MH4A 2RCBA 1FTMA 2XD3A 3TPAA 3HHGA 4R2BA 3TYHA 5BUUA 1USYH 1TT1A 2OJTA 1A7LA 2F78A 1FTKA 3V89B 1N3XA 5TPAA 4IO3A 4F3SA 5LOMA 2IA4A 1VE4A 4OMBA 3G3FA 4P0IA 1Y4CA 3FVKA 3LC8A 3CFZA 1URGA 3K1PA 2F5XA 1N04A 2RINA 5J1DA 3PPOA 3BFTA 2HAUA 3FJ7A 3D4CA 1Z7NE 4EF1A 4H65A 4YKIA 3QSLA 1KWHA 3KG2A 4R6HA 2ZYMA 4FEDA 4YMAA 3G7WA 2ONRA 5I2NB 2R71A 3RPWA 2Y7KA 3TKDA 1AOVA 3RTWB 2XX9A 4GF8A 4QF9A 3K1MA 4KHZE 4FEBA 1LBBA 4MH5A 3CRBA 2QS1A 1JEVA 3IOTA 4IGTA 5I84A 1Y3NA 4EQ9A 3B6WA 2XX8A 3PPQA 1TXFA 3MVZA 2I6EA 3DLNA 4IB2A 1B6HA 4ZDMA 5AA2B 3S9LC 2UVIA 3H6WA 1ZMGA 3HV1A 2A5TA 5I57B 3IO6A 3IB1A 2QPQA 4JWXA 3FGSA 2RC9A 3IOWA 1MXZA 4MFIA 4R75A 2B3FA 4KFQA 2YPNA 4NWCA 5AE4A 3E4RA 2ONKE 4YB5A 2KLFA 4EF2A 1A40A 2R6GE 3VVFA 2VP1A 1DOTA 3B6QA 1JEUA 1QVSA 4KQPA 2DWHA 3H6TA 1YAEA 5DEXB 1JVXA 1UTHB 4QSCA 1IEJA 3TDJA 2RC8A 4X1DA 1QKBA 1B51A 1DTGA 4AB5A 5H8QA 2HCAA 2O69A 4ZS9A 3IAZA 3Q25A 1MPCA 2QS3A 1FQDA 4NF4A 3K6UA 4U1ZA 3W15C 3FZVA 2QJEA 2VHAA 4ESXA 5CMBA 2I58A 4ECFA 3DP8A 3TTLA 3ZKKA 1XHYA 2H98A 1M5BA 3ODBA 4DLDA 1IXGA 4NF8A 4R74A 1OLCA 2OZZA 3FD3A 1FQBA 4ZE8A 3G3JA 4XKRA 2I0BA 4GL8A 5L9MA 3O6IA 1B4ZA 4QSEA 3IJXB 5H8HA 4RK9A 2G93A 4GRKA 2QMXA 4GWOA 3G3HA 4Q5TA 2Z8DA 1CE2A 2HZLA 2M8CA 4G68B 5KDTB 1Y4TA 1ZU0A 3S9NC 3QXMA 2V25A 3Q27A 1B5HA 4R9GA 3OENA 1MDP1 2DE4A 4IO4A 3PUXE 1RYOA 3VXCA 1EH3A 4ZZEA 4F29A 3SETA 1B5JA 4BDRA 4IY5A 2I4BA 2OCUA 4BDMA 2P2AA 3U94A 3FVGA 3RNNA 1DSNA 4OFOA 2Y7WA 3EPEA 1GGGA 4F1VA 2XX7A 3RT8A 3PUWE 4H6DA 2THIA 3SEUA 3IR1A 1TWYA 4YB6A 4ZEFA 3RY3A 3KOTA 4QSDA 4H8JA 3FXRA 1O7TA 1GVCA 2QMWA 2I49A 4GOTA 5I2NA 5FHNA 2V3QA 1ZLQA 4RK2A 2F35A 1VSOA 4O3BA 4DXUA 4FE8A 1VFDA 1MQHA 1XS5A 3KJTA 4LP2B 3TZAA 1ZTYA 1Q1KA 1A54A 2V3UA 2YLNA 1JQFA 4X1BA 5I2KB 3Q28A 4KYSA 1TFAA 2Y84A 2OWTA 4EDPA 3KGCA 2F7CA 1B3HA 4ONYA 5AA2A 1XT8A 5F7VA 2OBGA 5I57A 4Q0CA 4RPNA 3W9VA 4JB7A 3U92A 2CMOA 5B70A 3MC2A 4HS7A 5DYHA 3FJGA 3IK6B 4JXIA 1B3EA 3ECRA 5M2VA 2A5SA 3K6WA 1MS7A 1OVTA 3FV1A 3M3FA 4C1TA 3A3UA 4PFWA 1ZIUA 1ZJLA 3N26A 3QK6A 5DEXA 1UTHA 4G8NA 2F6PA 3VLWA 3MQ9A 4OEVA 4U21A 3ZS6A 4HCYA 2AL4A 1B3LA 2Y7RA 5DVIA 3QUJA 3HHFA 3H6VA 3KSJA 3RLFE 1CB6A 2QSXA 3EHTA 2UVGA 2PX1A 3ZSFA 5CBSA 4WEPA 2CZLA 4OEUA 3MWBA 3TTKA 2UVJA 1MDQA 2GRVA 1S7YA 2FA7A 3KN8A 3IJOB 5F1QA 4H5FA 2H9BA 4XTCQ 3S2VA 3O9PA 1YTVA 5JTYB 2F8DA 1B52A 4XXUA 4KCDA 4DZ1A 3OEMA 3K1NA 4YICA 1WODA 2PBWA 4OETA 2O1LA 3MZ9A 4H8IA 2DWJA 4JSDA 5ISUA 4Q30B 4E0XA 4G68A 5KDTA 3PPPA 3UGWA 5DTBA 1MY0A 4K3FA 3L6HA 1LFGA 4F3BA 3H06B 3PUZE 3MJNA 2B3BA 1B3FA 3A09A 4C1UA 3KN7A 5EYFA 5AA2D 3VE1B 3UN6A 4RJZA 4PFTA 4GVOA 2UVHA 3VDFA 2XXWA 3RN8A 3M3KA 1O63A 4X9TA 3EN3A 1OLAA 3GBAA 3SESA 2REJA 4FATA 1EZPA 3C33A 4G8HA 2P0SA 4F19A 2HFBA 1B7ZA 3PV0E 4OENA 4R72A 1MQJA 5CRYA 1M5EA 5I2KA 2ANJA 4ELOA 1NNPA 4LUBA 2PMSA 3QAXA 1BTJA 4RPOA 2Q9TA 2HEUA 2XXPA 1MXVA 3PUYE 5JK4A 4Z7EA 4ELRA 2HQ0A 4JDFA 2UYEA 2PVUA 3S4UA 1FQAA 3LSWA 2O7UA 4U1OA 3K00A 4F1YA 1N3WA 1B5IA 2VD2A 1LB9A 2NXOA 4E0WA 1RKMA 3FUZA 2DQVA 2Q2AA 3LBSA 2RKMA 2H25A 4GLIA 4GXAA 4ZEDA 2ESNA 2YJPA 1UQWA 5L8DA 3VVDA 1LCTA 4X48A 4ZEKA 2I4CA 3CR9A 1I6AA 1QUJA 3KZGA 1IQ7A 2DVZA 3MP1A 3CI8A 4F2OA 4MF3A 1UIVA 3B7DA 3Q26A 1MPDA 4POXA 2X7QA 1LAXA 2DWIA 1N84A 3PUVE 2IEEA 1H45A 4DE8A 3KOSA 3OO6A 4KCCA 1YPNA 3HN0A 3V8XB 4G68C 5JTYA 3K6XA 1FTOA 4I62A 1SBPA 2V84A 1SVXB 3G3IA 1POTA 2REGA 4ND9A 3T96B 1LBCA 2GFEA 4ELQA 2E0SA 4F3GA 3C32A 3DP4A 1NNKA 1QJMA 4NE4A 4H5GA 3C36A 4NF5B 1FTLA 3N6UA 1MQGA 3MUQA 5FTIA 3MAMA 4PE5B 4KI0E 2DS9A 3CG1A 2XXTA 2DOJA 1PB7A 3OSQA 1JETA 2DXYA 3F11A 3W9WA 1PBPA 4F3PA 3FVNA 3KBRA 4OYVA 4EQBA 2ZYOA 4LATA 3VV5A 1ELJA 3JYRA 3K01A 4R6KA 3JV9A 1AIVA 4LONB 1NFTA 2QS4A 5AA1A 1P99A 2DVCA 1EZOA 4TLMB 1SW2A 4ESWA 1FW0A 3O29A 2V93A 4LQ5A 1XC1A 4IGRA 4OERA 1GR2A 1LAGE 5IKBA 3KJ7A 1US4A 4TOZA 1AL3A 3LR1A 4ZE9A 5H8SA 3DM0A 3H03A 1QKAA 3N94A 1JW5A 4ZEIA 3LSFB 4BDLA 4QFKA 1P1WA 3BKIB 4OZ9A 2BJJX 4KD5A 1LAFE 1IXCA 2Q2CA 3MVXA 2OLBA 4G4PA 2ZNTA 2Z23A 5CBRA 4QFOA 4ELPA 1NH7A 4BDNA 4YU0A 4F22A 4O3CA 4WKMA 1LGBC 4BDOA 3HSTA 3SEVA 3WAFA 3PPNA 2DXRA 2WKYA 1MM7A 1LAHE 3TEPA 4YKKA 1SD3A 4MLQA 3T9UA 3BBRA 1DTZA 3OO8A 3UK4A 4GXSB 3E3KA 3U8QA 5DVJA 1A8EA 3CVGA 4OHNA 1IIWA 3VLVA 2Q89A 2F6GA 3SEWA 2GHAA 3TODA 3AXFA 1SDXA 1NNTA 1OVBA 5ITOA 4YKJA 2NVUB 2O6AA 1HSEA 2DE2A 4GD5A 3FASA 3OO7A 3FIRA 4OFJA 3EQ1A 1XVYA 1OQGA 1VFEA 1DMBA 3K6VA 3VFJA 4PFYA 5CC2A 4PFUA 1DPPA 1XOCA 4XKQA 4O3AA 1S9TA 2DSFA 4BDQA 4OXVA 4N07A 1SQYA 4XIGQ 3GXAA 4G77A 1Y1ZA 4OQOA 1PB9A 2ABHA 4PETA 1QULA 4QFNA 5A5XB 3FXUA 4G8MA 4M1VA 3TTRA 2I0CA 4OESA 4G2ZA 4NF5A 1HSJA 4RA1A 1P1OA 4FECA 1N7XA 3T22A 4EXLA 3T66A 1Y9UA 1B0HA 4LVQA 5I58B 1DPEA 1JVYA 5EHMA 5ICTA 4F1UA 4LA9A 1I6QA 1Y20A 4NTLA 3MVYA 4AB6A 4XKNA 5ELVA 3O28A 3HCQA 3O2AA 1HSLA 4H0WA 1MQDA 3SEYA 2ONSA 2Z8FA 1FQFA 1B1HA 2PT2A 3KN3A 1ZKBA 1SYIA 4YMBA 3T9VA 1XVXA 1OQHA 3O6GA 1I69A 4OFLA 3TAJA 1LFIA 2D5WA 1D4NA 3OEKA 4JWOA 3M3LA 3PD8A 5KCJB 3IB2A 1B9JA 2I3WA 4Z0IA 4Q8RA 1QUKA 4ZZAA 1JNFA 4N6PA 1T0KA 3HPIA 3LSXA 3SERA 5HM4B 3S9MC 1US5A 3K02A 1IITA 3USDA 1D9VA 4I8CA 3T93B 4MLVA 1M5CA 1Y1MA 4OWDA 4IO7A 4KYEA 1D3KA 3EHUA 3MZBA 1ANFA 1BKAA 3TUSA 1AMFA 5CMCA 4NMYA 5CMKA 2D21A 1B1XA 3IORA 4IY6A 3O66A 4ZECA 4R73A 5K2YA 4DCYA 1JW1A 5L9SA 1MXXA 5B7DA 4IO2A 4OVJA 1BLFA 3QIMA 4YB7A 4HW8A 1WDNA 2I48A 1B7HA 2XXVA 1N76A 3T9HB 3TTNA 2DWAA 3CFLA 3V5AA 1IXIA 1P1QA 5HBCA 4RXLA 1GV8A 3MP6A 2HXWA 1AH5A 3CSBA 1MG1A 5FHMA 2XXRA 1FQEA 1SI0A 4FIMA 4FAJA 4R6YA 3IOVA 3RGYA 4P0GA 3PPRA 5ITPA 2QS2A 4WXJA 3H3GA 4AQ4A 3K0VA 3T9XB 1MY1A 3SEXA 1Y3PA 3FATA 3C34A 3MPLA 1IZ1A 3OOAA 3HO7A 4NF6B 5DT6A 5H8NB 4EXKA 3MP8A 1II5A 1GTKA 3B6TA 5A5XA 1H76A 1BIYA 4PQJA 3TTMA 3GBBA 2D3IA 4KPTA 5FHOA 1MRPA 4FJPA 2O7IA 3H7MA 3IOUA 3O97A 2GHBA 1PC3A 5BWJA 2RC7A 5H8FB 3IO4A 2GH9A 4U22A 1Q35A 2RCAA 2I3VA 5I58A 3FV2A 5CM6A 4U23A 3A3CA 3ONMA 2O51A 3C9HA 3R26A 3OSRA 3N5LA 3OELA 4DDDA 4IO6A 3G3GA 2XXXA 2XXQA 4P11A 3N6TA 3VVEA 2X7PA 2XXHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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