2I4CA

Crystal structure of bicarbonate transport protein cmpa from synechocystis sp. pcc 6803 in complex with bicarbonate and calcium
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
401
structure length
401
Chain Sequence
PEMMPETANIKLGYIPIVEAAPLIIAQEKGFFAKYGMTGVEVSKQANWASARDNVTIGSQGGGIDGGQWQMPMPHLITEGIITNGNKVPMYVLAQLITQGNGIAVAPMHEGKGVNLDITKAADYIKGFNKTNGRKFKAAHTFPNVNQDFWIRYWFAAGGVDPDTDIDLLAVPPAETVQGMRNGTMDAFSTGDPWPYRIVTENIGYMAGLTAQIWPYHPEEYLAIRADWVDKNPKATKALLKGIMEAQQWIDDPKNRPEVVQIVSGRNYFNVPTTILESPFKGQYTMGDGQPAIDDFQKGPLYWKDGIGNVSYPYKSHDLWFLTESIRWGFHKNAIPDLDTAQKIIDKVNREDLWREAATEAGFTADIPSSTSRGVETFFDGITFDPANPSAYLQSLAIKKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Structure of a Cyanobacterial Bicarbonate Transport Protein, CmpA.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Synechocystis sp.
molecule keywords Bicarbonate transporter
total genus 144
structure length 401
sequence length 401
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13379 NMT1_2 NMT1-like family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i4cA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i4cA01
3IOVA 4F31B 4YICA 4U22A 3VVFA 5K2YA 3LUYA 5FTIA 1LAGE 3KSJA 1GTKA 4KR5A 5H8QA 2R6GE 3DP4A 5DYHA 2HFBA 3HO7A 1DMBA 5CBRA 1MPCA 2Q8JA 5H8HA 1VE4A 1XVYA 1M5CA 2VP1A 4OQOA 3V8XB 3FATA 3LC8A 4KYEA 1CE2A 3OEMA 1R9LA 4EUOA 1B52A 2PMSA 3FXUA 3A3CA 2OBGA 1QJMA 1TWYA 4DZ1A 3IOWA 1EZPA 4QFKA 3CI8A 4M4GA 1B3EA 2OCUA 2UYFA 2UVJA 1P1QA 2P1SA 4U1OA 4MBPA 3O28A 1FQCA 3GLBA 3AXFA 2A5SA 1VSOA 4U23A 1Z7ME 5TP9A 4TLLB 1MM6A 4ZZEA 1SVXB 3VLWA 4O3AA 2Y7KA 3BFTA 5DVJA 2REJA 1MXZA 3S9MC 3SEVA 1QULA 4DXBA 2CMOA 4OESA 4JSOA 3O2AA 1NNKA 5KDTA 4O3BA 4POWA 3PUZE 5I57A 1NNPA 4C0RA 5B70A 2FA7A 3RUMA 4FEDA 3EHSA 5JTYA 1MXUA 4YZZA 1MY0A 5FHOA 3LR1A 1M5BA 5CMKA 2ZYMA 2DWHA 3B6TA 3IB1A 2OLBA 1FQAA 1Q35A 1FTKA 1N84A 1ZBMA 3T96B 1YTVA 2RCAA 1ZMGA 3K6XA 3UK4A 1LCTA 3UIFA 3M3LA 4ZEFA 4P11A 3HN0A 2Y7IA 1O64A 2A5TB 4XIGQ 2QL3A 5TPAA 4F29A 3B6WA 1FW0A 1B1XA 4KI0E 1EZOA 3IO4A 4JSDA 1BTJA 2XX7A 4OWDA 3T9HB 3TDJA 3O29A 3MBPA 2ZXTA 4YKJA 3O6GA 1I69A 1MQDA 3MP1A 5DT6A 2XXWA 2H9BA 4R9GA 5FHNA 5I59B 2FYIA 5I56B 4ELOA 3H7MA 4MF3A 5H8NA 4WXJA 4YKIA 4QSCA 2ONSA 3TCHA 1JW4A 3KGCA 4NTLA 3ECRA 1TXFA 4POXA 1O7TA 4IY5A 2DXRA 3K1MA 3K01A 3TEPA 1JETA 4F3GA 4OEVA 4LZ8A 2F7CA 3TUSA 1Y20A 1MY1A 3ONMA 4XXUA 3FVOA 1VFEA 3T22A 1WDNA 3UP9A 1POY1 3B7DA 3MUQA 3ZSFA 5H8FB 2Q2CA 4RJZA 4KPTA 5L9MA 1EZ9A 4ELQA 4DXCA 1JEVA 4NF5A 4F1YA 1URDA 3OOAA 1JNFA 1LSTA 3KZGA 4AB6A 2O69A 4N13A 2VD3A 3PV0E 1S9TA 1PB9A 3MVWA 2XXVA 4K3FA 4RA1A 4AB5A 1B3GA 3FVGA 4OFJA 1DOTA 2Q88A 2I48A 4OFOA 3VE1B 5TU0A 1EU8A 2I6EA 1Y3QA 1H76A 3MVXA 4BDOA 4DDDA 4BDMA 1B7HA 1PDAA 3KSXA 3O66A 4NF5B 4THIA 4RK9A 4NMYA 1TFDA 3LSWA 4C1UA 2QMXA 3CFZA 5I58A 3PMVA 2OK2A 1H3DA 2ONKE 3PPRA 3C33A 3HPIA 1JW1A 4AQ4A 5AA4B 1B5IA 2ZNTA 4R75A 4U1ZA 3OEKA 3MC2A 2OZZA 4IO5A 1II5A 4R2BA 3K00A 1MRPA 1SQYA 2VGQA 3ILUB 3K1NA 1NH7A 2OWSA 4GFRA 4G2ZA 3L6GA 3RNNA 1FQFA 1SYHA 4N6PA 3CFLA 3DM0A 1DPPA 2FNCA 1IZ1A 4KCCA 1OVBA 4BDQA 3D4CA 1A99A 2ZNSA 1ZJLA 2Y7WA 3OO7A 1QUKA 3IJXB 3G3GA 3BBRA 3MP8A 3W9WA 3OD7A 2B65A 4ECFA 3CRBA 3LSFB 1Z7NE 2XX8A 1SD3A 2AL5A 3MPKA 2F6PA 3N6UA 3CG3A 1A8EA 4F2QA 3LSXA 1D9YA 4P0IA 3O6HA 2QMWA 4TOZA 2DWAA 5HPQA 1URSA 3A09A 1MQGA 3G3HA 1D9VA 4XKNA 3U92A 3TFLA 5DEXA 2UVHA 3VFJA 1UTHB 2ESNA 2I49A 3E13X 3FJ7A 5JEIA 1B5JA 1M5FA 4PFTA 1QW0A 2DQVA 4XKRA 5KZTA 2F7AA 3SDFA 1VFDA 2DOJA 4DE8A 1MPDA 3QIMA 3CVGA 3P7IA 1B51A 4NWDA 1LLSA 4IY6A 3TKDA 4ND9A 3OMBA 4LATA 1FCKA 3FVNA 5FHMA 1SW5A 4GVOA 1UTBB 3KOSA 3QK6A 4NWCA 2O7IA 4OEUA 3GBBA 3IORA 1B1HA 1XT8A 2XHDA 5CRYA 1B0LA 3S9LC 4C1TA 2DSFA 4HTGA 5CM6A 1A7LA 2Y7RA 3BKIB 1B32A 3OENA 5I84A 5ICTA 2F8DA 3TTNA 3SEUA 4QSDA 2F78A 2D3IA 4OETA 4F2OA 1D3KA 2O1MA 4GWOA 3U1OA 2UVIA 3G3KA 3SESA 1MXWA 3TTMA 3OO6A 1FQDA 3S4UA 4XKPA 5CI5A 1DTZA 4E0WA 1D4NA 3R26A 4F18A 1AIVA 3FGSA 1MDP1 5AA2A 3THIA 4G4PA 3GBAA 1LAXA 2H5YA 3RGYA 5I2KB 3HHGA 3K6VA 2H4IA 4PFUA 3PUYE 3PMXA 3MJNA 1BIYA 1I6QA 4LA9A 3FJMA 3RT6B 3E4RA 4E0XA 2D21A 4U4SA 2XXIA 4LZ5A 5H8QB 3VVEA 1GGGA 1UIVA 2XXTA 3E3KA 3IOUA 1GVCA 3TAJA 4LQ2A 4ELRA 5CMMA 4MFIA 5H8HB 4ONYA 4KHZE 3O9PA 3UN6A 1XHYA 4OHNA 4ZS9A 3UORA 3CG1A 2Z8DA 3IAZA 4OZ9A 2F5XA 3VLVA 3ZKKA 1SW4A 4GQOA 2XX9A 1IIWA 2DWJA 2IA4A 1N7XA 3E9XA 1NNTA 2O1LA 4X9TA 4FEBA 3GZGA 4R6YA 4H8JA 3TCGA 3PUVE 4YB6A 2QS1A 1ANFA 2I0CA 4F3PA 4GF8A 3JZJA 2G93A 4QF9A 5TP9B 1KWHA 4R72A 3K6WA 3G3FA 4LZ7A 3TPAA 4NF8A 1UIUA 5L8DA 2HZKA 3DELB 3PPQA 4NE4A 4WKMA 4U2RA 4GLIA 2F7BA 4IB2A 2I4CA 2QPQA 4HW8A 1LAFE 4R6HA 3RTFB 4FATA 1B7UA 5KDTB 3ILTB 3RPWA 4EXLA 2LAOA 3PD9A 1GR2A 2E0SA 5I57B 1IXGA 1B9JA 4YMAA 3I5OA 1YAEA 3VXCA 3USDA 1N76A 4ZEIA 5JTYB 1Y1ZA 4JWYA 2E1SA 1P1UA 1JVXA 3FXRA 4QFNA 2X7PA 2PT1A 1B4ZA 4KFQA 5BWJA 3C34A 3CSBA 1B40A 4RK2A 2DYXA 1ATGA 4ZEBA 1T0KA 4U4XA 1B58A 1MDQA 5TPAB 3RT8A 5ITOA 3QXMA 3TTKA 3A3UA 3Q27A 4ZDMA 3SKPA 4GD5A 3MQ9A 4ZEDA 2DS9A 4YB5A 2V3UA 4EF2A 2XXPA 1JW5A 3Q29A 4X48A 3L6HA 4X1DA 4EQ9A 4RYAA 1A40A 5H8NB 1QKAA 1ZU0A 3S2VA 3FVKA 3LSLA 1PB7A 2DE2A 1MH4A 2B3FA 5CMCA 4QSEA 4MLQA 1B2HA 1BLFA 2QS3A 3W9VA 1IEJA 2UVGA 3KOTA 4HCWA 3R7XA 4MLVA 4JWOA 3TYHA 3G3JA 1HSJA 4NF6A 3TQWA 1B0HA 4QHQA 4UACA 5M2VA 1US5A 4NF4A 3T9XB 3CR9A 4ESWA 2ZMBA 2ALUA 1UQWA 3HSTA 3C35A 1VR5A 1IXCA 3KN8A 2GHBA 3CIJA 4JWXA 3T66A 4LP2B 5JK4A 1MXYA 1ZIUA 5ITPA 3EQ1A 1S7YA 3SEWA 4OYVA 3K6UA 3M8UA 1RYXA 2DP8A 2HAUA 1JVYA 1OVTA 2B3BA 1MM7A 1AMFA 4WEPA 4RY1A 1US4A 4GRKA 1B3FA 2O68A 1P1WA 1SI0A 3IO6A 2ABHA 5ELVA 1P1OA 3TODA 5L9OA 4G8HA 3W15C 1PEBA 5KCJA 3Q25A 3QUJA 1R9QA 5IKBA 3MZBA 1F9BA 2AL4A 2THIA 5I58B 1Y3PA 3FIRA 4EQBA 4F1VA 4RPOA 4EF1A 4ESXA 2IEEA 4P0GA 5AA2D 1SBPA 5A5XA 1I6AA 3ODBA 4EQ7A 3K4UA 2Q9TA 3PPOA 4HCYA 2QJEA 5CC2A 4KCDA 2QS2A 3IOTA 1Y1MA 2CZLA 5IAIA 3KBRA 3H06B 2V93A 4H5FA 3H4ZA 3FD3A 1B6HA 3IX1A 1NMUA 2V3TA 2XD2A 1QKBA 1SDXA 3MP6A 1URGA 3C4MA 4F3BA 1MXVA 3TMGA 4LVQA 3KN3A 2DXYA 1B3LA 1USYH 1OLAA 5BUUA 1YCJA 2HQ0A 3VLUA 3HV1A 3TCFA 4I1DA 5L9SA 4Q8RA 3C31A 4PE5B 2F97A 3IL1B 4M1VA 2Z8EA 2I3VA 4FECA 4L17A 4DIGA 3DLNA 4O3CA 1S50A 3KFMA 3T93B 3K02A 3IR1A 1MPBA 5DEXB 5DVIA 3ZS6A 1OLCA 2HCAA 4OVJA 4JB7A 4YB7A 4Z7EA 1XC1A 4G68A 1DPEA 3ZKLA 2I3WA 3FZVA 3JV9A 4OERA 1QVSA 1FTLA 1M5EA 4JBZA 4TQUQ 2Z8FA 4LONB 2KLFA 5DVFA 3TELA 3H6VA 3EPEA 3B6QA 5AE4A 3DP6A 4GIZA 2DVZA 1IUDA 1P99A 1MY4A 4QFLA 1N3WA 3JYRA 4G8NA 3PD8A 3QUFA 4Z0IA 2F36A 1LGBC 2DVCA 4QFOA 2ZNUA 5B7DA 4EDPA 2DWIA 1NKXA 2W7YA 1MY2A 3QAXA 4GXSB 1N7WA 4H1XA 1Y4TA 5AA3A 4OXVA 3RTWB 2XD3A 2P0SA 1I6BA 3RN8A 1NL5A 4G68C 1JEUA 2GFEA 5F7VA 2VOZA 2Y84A 3VV5A 1LAHE 2RKMA 4GL0A 1FQEA 4R6KA 2WKYA 4IO2A 1H45A 1SW1A 4Q0CA 3OSQA 3MWBA 4H5GA 1R1NA 2NVUB 1LFHA 4QFPA 4RXLA 1B3HA 1ELJA 3O6IA 4YKPA 5AA2B 4PQJA 1BKAA 4U21A 3FUZA 4ISUA 1OQHA 2RCBA 2F35A 4GXAA 4IO3A 1P1NA 2R9JA 3FXQA 4ZEKA 2NUVA 3WAEA 4F1UA 4F19A 3TQLA 4H8IA 1NFTA 4YMBA 1SW2A 1EH3A 3V89B 4Q30B 2H25A 1A8FA 3PU5A 1XOCA 3RY3A 2ZYNA 4RNSA 1LFGA 1MXXA 1YPNA 1Y4CA 4X1BA 2A5TA 3DP8A 4LUBA 1IXIA 1FTOA 3VVDA 4OENA 2O6AA 3U93A 5CBSA 1WODA 4PFYA 2UYEA 4R73A 1N0TA 1B46A 3U8QA 3CSGA 1MQIA 1A55A 1Q1KA 3K1PA 2V25A 1O63A 5I2NA 4IO7A 1LFIA 3OXNA 1ZKBA 3IB0A 4WEDA 1LBCA 2V3QA 4FORA 1B5HA 3SERA 3EF7A 5I59A 5HBCA 3M3FA 5I56A 1Y3NA 3UA8A 3MVYA 2PVUA 4TLMB 3S9NC 3C9HA 1LCFA 3EN3A 2XXUA 1SYIA 4JXIA 1XS5A 4GOTA 1IITA 1H43A 1MS7A 4R2FA 3MZ1A 3C36A 2O51A 3LBSA 2F34A 4KYSA 1PB8A 4G8MA 3OELA 4NF8B 1R6ZA 3V5AA 3MAMA 5I2NB 5J1DA 3IK6B 4PP0A 1LBBA 3BFUA 4YKKA 2VD2A 1H44A 3VXBA 1TT1A 2PT2A 2XXXA 4BDNA 4BDRA 4F22A 2ZYOA 3EHTA 5K2XA 1Y9UA 5H8FA 4KQPA 1N04A 4IO4A 4OFLA 3D4GA 2YPNA 3UGWA 2UXAA 2PYYA 3SETA 1BP5A 3V83A 4ZZAA 1HSEA 3TTLA 2HXWA 3EHUA 3M3KA 1ZTYA 4FE8A 2ZYKA 4YAHX 2GRVA 2H98A 2Y7PA 4I9DA 5F1QA 4DCYA 4FIMA 3IJOB 4HS7A 3WAFA 3MW0A 2QS4A 3K0VA 1MH3A 2Z22A 4H67A 3OO8A 3N6TA 3PPNA 2PX1A 5EHMA 4BDLA 2HEUA 3KJ7A 2Q2AA 5FTHA 2R71A 4IO6A 2QRYA 4RPNA 5LOMA 2M8CA 3U94A 2REGA 2P2AA 3O97A 3PUXE 2G29A 4IGTA 4XTCQ 4DLDA 3HHFA 1FQBA 3I3VA 1GV8A 3GXAA 1DSNA 2XXRA 2YJPA 4H6DA 3N26A 5AA4A 3QSLA 1USYE 1A54A 4ZE9A 4G77A 4H0WA 3G3IA 3I6VA 3TTRA 1RKMA 1TFAA 3R6UA 3OO9A 3G7WA 2VHAA 3H6WA 2AYSA 3PMWA 4BLAA 4NEDA 2OWTA 1IQ7A 4NF6B 2RF1A 4LQ5A 4PFWA 4NF4B 3MPLA 1B7ZA 3U72A 5EYFA 2RINA 2X26A 2ANJA 2I58A 3RQTA 3H03A 2RC8A 2H99A 4MH5A 3FJGA 1PBQA 4XKQA 3CFXA 1MQHA 2Z23A 4QRZA 3FV1A 1OQGA 3SEYA 1RYOA 1NNFA 1LB8A 3N94A 3RLFE 1NH8A 2O7UA 4F39A 1CB6A 2GH9A 2RC9A 4EXKA 3KN7A 3S9EA 1M5DA 4ELPA 3MZ9A 4UA8A 3N5LA 3H6TA 4DXUA 2DE4A 1MQJA 5HM4B 1QUJA 1DTGA 3Q28A 1UTHA 1AOVA 3SEXA 3HCQA 1JQFA 1MY3A 3K2DA 4DCXA 2QSXA 2AIXA 5KCJB 3OSRA 3PGFA 3TZAA 3MVZA 5DTBA 1XVXA 2DE3A 3F11A 2X7QA 2XXHA 1FTJA 3KG2A 4KD5A 2O84X 4N07A 1QUIA 4FJPA 5A5XB 4KYDA 3KEIA 2I0BA 1UTBA 4OMBA 3KJTA 4Q5TA 4GL8A 2ONRA 1FTMA 2YLNA 4F3SA 2F6GA 2XXYA 1LB9A 3IB2A 5H8SA 5AA1A 5ISUA 1AH5A 1N3XA 2GHAA 4R9FA 1PBPA 1HSLA 4I62A 1L5TA 2HZLA 4OTEA 1MG1A 3H3GA 3PPPA 1OIBA 1IXHA 2PBWA 4YU0A 1SI1A 1J1NA 2XXQA 3QYTA 2NOOA 2BJJX 3T9VA 1AL3A 3T9UA 3FV2A 2OJTA 3C32A 2I4BA 1PC3A 3FASA 4ZE8A 5CMBA 4ZECA 4FAJA 1OMPA 2Q89A 4PETA 4R74A 5EHSA 1B4HA 4I8CA 2NXOA 2NWJA 1POTA 1B05A 1WVJA 3PUWE 1ZLQA 5I2KA 4H65A 4IGRA 3Q26A 2RC7A 2V84A 2HAVA 4G68B 3H6UA 5ICQA 4JDFA 2D5WA 3VDFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IOVA 4F31B 3BIHA 4YICA 4U22A 3VVFA 5K2YA 3LUYA 5FTIA 1LAGE 3KSJA 2P3NA 1GTKA 4KR5A 5H8QA 2R6GE 3DP4A 5DYHA 2HFBA 4JVCA 3HO7A 1DMBA 5CBRA 1JP4A 1MPCA 2Q8JA 3IFCA 5H8HA 1VE4A 1XVYA 1M5CA 2VP1A 4OQOA 3V8XB 3FATA 3LC8A 4KYEA 1CE2A 3OEMA 1R9LA 4EUOA 1B52A 2PMSA 3FXUA 3A3CA 2OBGA 1QJMA 1TWYA 4DZ1A 3IOWA 1EZPA 4QFKA 3CI8A 4M4GA 1B3EA 2OCUA 2UYFA 4N8YA 2UVJA 1P1QA 4PAIA 2P1SA 4U1OA 1FPKA 4MBPA 4P1LA 3O28A 1FQCA 3GLBA 3AXFA 2A5SA 1VSOA 4U23A 1Z7ME 5TP9A 4TLLB 1MM6A 5I3SA 4ZZEA 1SVXB 3VLWA 4O3AA 4NX1A 2Y7KA 3BFTA 5DVJA 2REJA 1MXZA 3S9MC 3SEVA 1KA1A 1QULA 1SPIA 2PFYA 4DXBA 2CMOA 4OESA 4JSOA 3O2AA 1NNKA 5KDTA 4O3BA 4POWA 3PUZE 4MMPA 5I57A 1NNPA 4C0RA 5B70A 1FBDA 2FA7A 3RUMA 4FEDA 3EHSA 5JTYA 1MXUA 4YZZA 1MY0A 5FHOA 3LR1A 1M5BA 5CMKA 2ZYMA 2DWHA 3B6TA 3IB1A 2OLBA 1FQAA 1FPFA 1Q35A 1FTKA 1N84A 1ZBMA 4PF6A 3T96B 1YTVA 2RCAA 1ZMGA 3K6XA 3UK4A 1FRPA 1LCTA 3UIFA 3M3LA 4ZEFA 4P11A 3HN0A 2Y7IA 1O64A 2A5TB 4XIGQ 2QL3A 5TPAA 4F29A 3B6WA 1FW0A 1B1XA 4KI0E 1EZOA 3IO4A 4JSDA 4PC9A 1BTJA 2XX7A 4OWDA 3T9HB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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