2KLFA

Pere nmr structure of maltodextrin-binding protein
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Use of Relaxation Enhancements in a Paramagnetic Environment for the Structure Determination of Proteins Using NMR Spectroscopy
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
molecule tags Transport protein
source organism Escherichia coli
total genus 69
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-07-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2klfA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2klfA01
4ZE8A 4YMBA 3ECRA 3RQTA 3UGWA 1US5A 4WEPA 2F6PA 3T93B 2ZMBA 5FTIA 4R75A 4KI0E 5I84A 4BLAA 1Y9UA 2ZYMA 2FNCA 3C34A 2ZYNA 3HV1A 2REGA 4ELPA 1MY1A 3PD9A 1TFAA 4LQ2A 2GHAA 3PPPA 4KQPA 2ZNTA 1FTJA 2V93A 3FVNA 4DZ1A 3K6WA 4DCYA 4X48A 1Y20A 4Z0IA 3WAFA 4KYSA 2CMOA 2O1MA 2F7CA 4ZEFA 4N6PA 2DWIA 3FUZA 5JTYA 3C32A 3CSGA 1LAHE 3EPEA 3K6UA 2XXVA 4F29A 4KYDA 3TEPA 2Q89A 5A5XB 3IO4A 4GWOA 3QSLA 1B1XA 1MY2A 3W9VA 4BDRA 2V3TA 5I56B 4G8HA 4ELOA 4YKJA 5KDTB 2O7UA 3E13X 4LATA 4H0WA 5I59B 2GRVA 1GVCA 2XHDA 3M3LA 2Z8FA 3CFZA 2PYYA 4N07A 1URSA 1QKBA 4QFLA 4PP0A 3LSXA 3ZSFA 1FTOA 3QYTA 4H8IA 1PC3A 3ZKLA 3G3IA 4FORA 4F31B 3KSJA 4GRKA 3DLNA 4DXCA 3TYHA 1NKXA 3JYRA 2RCBA 1FW0A 1FQEA 3USDA 5AA4B 2DYXA 3T9VA 4Q8RA 4G77A 3ONMA 3OENA 4JDFA 4MFIA 1NH8A 4NF5A 4DXUA 4EQBA 5ISUA 4AB6A 4WKMA 1PDAA 4E0XA 4PQJA 2Y7IA 1ZJLA 3RGYA 4FIMA 1Q35A 1LAGE 4GIZA 1Y3NA 2VD2A 1MH3A 3OO6A 1JVXA 3OSRA 2V3QA 4OXVA 2I49A 3I3VA 2H98A 3H6UA 1MY0A 1B58A 2XX9A 4DLDA 4F3PA 1MG1A 2NWJA 3H06B 3RPWA 1ZMGA 2ONSA 2A5SA 4JWOA 4FATA 5I2NB 4HCYA 4H6DA 3IOWA 1M5CA 5FHNA 2OZZA 3U8QA 1Z7ME 4U1OA 2I4BA 3R6UA 2NOOA 4DXBA 1P1NA 4RK9A 1ZLQA 5EYFA 4NF4B 3PGFA 4ZE9A 3TCFA 4KHZE 1B5IA 2RKMA 4IB2A 1RYXA 3U94A 4GVOA 3S9MC 1PBPA 1MY4A 2XXXA 4YKIA 4XKNA 3FXQA 1XVYA 5I2KA 1MS7A 1J1NA 3O28A 2DE2A 3IORA 3PV0E 1IUDA 1A8FA 1B0HA 1FQBA 2P1SA 1B5JA 4LA9A 2HFBA 4ND9A 2UVJA 4JSDA 3C35A 3KFMA 1IXCA 4OFLA 4LZ8A 2Q88A 1LFIA 2DP8A 4G68A 3UN6A 4R74A 3TKDA 5HPQA 3IL1B 1M5FA 3PPNA 3JZJA 5H8QA 2OLBA 3FATA 1MH4A 2PMSA 1FQDA 4GFRA 5H8NB 3GBBA 2Z23A 1RYOA 1LB8A 3IOVA 1YTVA 5CBSA 3CR9A 4ZDMA 2QJEA 4QSEA 3MWBA 1MXUA 3CI8A 4EQ7A 4U2RA 4KPTA 1BTJA 4JXIA 4P0GA 3MPKA 4G8MA 3LBSA 3I6VA 3FVGA 3GXAA 5AA3A 5ITOA 2F78A 1HSLA 3THIA 4NEDA 4U21A 2RC8A 3KEIA 3W15C 5I57B 3KN8A 3TELA 2RCAA 2Q8JA 1PB7A 1UIUA 1ELJA 3U92A 1MXZA 2X7PA 3M3FA 1A54A 1PBQA 3MQ9A 4OTEA 3RUMA 5A5XA 4OEVA 3G3GA 4LQ5A 3MP1A 3Q28A 3IAZA 4O3AA 4NF6A 3UK4A 3D4GA 3IB0A 3EHTA 4RY1A 3SEUA 1MXYA 1SQYA 3AXFA 2DWJA 3K1MA 5AA2B 1USYE 3MUQA 2AYSA 3SDFA 2CZLA 3H6TA 3CVGA 1XVXA 3VV5A 3TFLA 1N0TA 4R6KA 4DE8A 3ILTB 2I3VA 4JWYA 3F11A 1R6ZA 3KZGA 4LZ5A 2I6EA 3RT6B 2VOZA 4PFTA 2PX1A 2H5YA 3LR1A 3K6XA 2PT1A 4H5FA 1H44A 3C9HA 4P0IA 4PE5B 3CFXA 1XC1A 4X1DA 1AOVA 2VP1A 4FAJA 1MM7A 1XHYA 1MY3A 2LAOA 3MVXA 5AA4A 5ICQA 1D4NA 1TFDA 1Y1ZA 4G8NA 1LBCA 1SW4A 2QS3A 1S7YA 5H8SA 1M5DA 1TWYA 1GV8A 2Z8EA 3G3JA 5DVJA 1IXGA 1B3GA 3T66A 1HSEA 2G29A 3TMGA 3OSQA 4U1ZA 1AMFA 5CI5A 1OVBA 3TQWA 3CG1A 1MXXA 5FHOA 5HBCA 4NF8B 2DQVA 1SDXA 1N76A 4G2ZA 5M2VA 5I2NA 1LCFA 1N7WA 3SESA 5TPAB 2H9BA 2RINA 1IITA 3SEYA 4THIA 4OFOA 2I4CA 3CFLA 2I48A 4GL0A 3PPRA 3RTFB 3WAEA 3PPOA 4NF4A 1S50A 1QKAA 3MVYA 3KGCA 2PVUA 2P0SA 5HM4B 1XT8A 4YICA 2Q2AA 1SW5A 1B7HA 4QHQA 3Q25A 1IXHA 1I69A 1SVXB 1B52A 3K6VA 4IO7A 4AB5A 4LUBA 2O1LA 3FD3A 5EHMA 3LSLA 3H6WA 1H45A 1Q1KA 4HS7A 4OERA 4ELRA 4XKRA 1DMBA 1SI1A 3TTMA 4HW8A 3IK6B 4LVQA 2XXIA 3FGSA 1B3EA 2DXYA 3R7XA 3UA8A 1QUJA 5B7DA 2F7BA 3T9XB 4P11A 4F3GA 4F3BA 4F19A 4ESWA 3PUWE 4JSOA 3KG2A 5TU0A 3VVEA 2A5TA 3DM0A 5K2XA 3SETA 2DSFA 2Y7RA 3CSBA 3EQ1A 4XKQA 1O63A 5IKBA 3KBRA 1H43A 2W7YA 2THIA 3QK6A 4ZEKA 1OMPA 1D9VA 1IIWA 4BDNA 1P1WA 4HTGA 4KCCA 4U4XA 5TP9A 1H76A 4F1YA 1LAXA 3KJTA 2GHBA 3ZKKA 5H8FA 3GBAA 1I6QA 3O29A 5DTBA 4I8CA 5H8NA 3T9UA 4ZZEA 3JV9A 4M1VA 2I58A 1PB9A 2BJJX 3O6IA 1B9JA 3IO6A 4QFPA 5DEXB 3IR1A 1URGA 2P2AA 4GXAA 2DWHA 3W9WA 2RC9A 3S2VA 4ZEDA 2E1SA 4H65A 3S4UA 4PFWA 3IB2A 3MZ1A 1VFEA 4F22A 1DPPA 2H4IA 1DOTA 3HHGA 4Q0CA 1JEUA 2F34A 1VSOA 2F7AA 1GGGA 4RPOA 1EU8A 2B3FA 3FXRA 4F39A 3O6HA 3RN8A 1LCTA 1B5HA 4BDMA 4POXA 3KOSA 1FTKA 1B3FA 3FJ7A 4EXKA 1P99A 5FHMA 1MPBA 5AE4A 4GLIA 3Q29A 3MPLA 3PUVE 3PUYE 3T96B 3O9PA 3QXMA 5BUUA 2YLNA 2OWSA 3TTLA 4YAHX 5ELVA 1DPEA 2HZKA 3QUJA 2XXTA 4KFQA 3O6GA 3PUXE 2F8DA 1NL5A 1XS5A 1MQIA 4QF9A 1QUIA 3PUZE 1JW1A 1Y1MA 3N26A 3N6TA 1A55A 3DP8A 2OBGA 4R2BA 5K2YA 3B6TA 4WEDA 2UVIA 1QW0A 3G7WA 3O2AA 5H8HA 3MVZA 1R9LA 3TZAA 2ONKE 3IX1A 3HPIA 3VVFA 1Y4CA 1ZU0A 4G68C 2B3BA 5L9SA 1M5EA 5DVFA 4I62A 4QSDA 1NMUA 3LSWA 2FYIA 4IO6A 4DCXA 2HXWA 1N7XA 1AL3A 2ESNA 2ZNSA 3H7MA 3CIJA 5CC2A 2HAUA 5CRYA 1ZKBA 4KR5A 4OETA 3SKPA 2XXHA 1O64A 5JTYB 4KD5A 4OVJA 1A40A 4YB5A 1QUKA 3K1NA 4C1UA 3BFUA 2V3UA 3PU5A 4RA1A 4ZZAA 2YPNA 3KN3A 5TPAA 2IA4A 3FXUA 4NTLA 3VXBA 1WDNA 2XXWA 4GXSB 5LOMA 4ZEIA 3B7DA 3BKIB 4PFUA 3MBPA 4Z7EA 3EF7A 3Q26A 1LGBC 1B4ZA 1N3XA 4BDOA 3FASA 2H99A 1P1QA 2O7IA 4IGRA 3OOAA 1F9BA 2G93A 3UORA 5L8DA 1Z7NE 2O68A 2D3IA 3N94A 1LAFE 1MQDA 3P7IA 4NWCA 4RNSA 4U4SA 2NUVA 3S9LC 2H25A 4DIGA 2OCUA 4F1VA 3OO7A 1TXFA 4H1XA 4AQ4A 1BKAA 3H4ZA 2XXUA 4C1TA 3ZS6A 3B6WA 2XXYA 4L17A 1B05A 2ALUA 4FEBA 1Y4TA 1RKMA 1ANFA 1OIBA 2DE3A 3FIRA 1LFHA 3E3KA 5I56A 1FQAA 2M8CA 1JQFA 3EHSA 3ODBA 5KDTA 5CMMA 1SW1A 3RLFE 5I59A 3M8UA 3S9NC 5CMKA 1UIVA 1HSJA 5ITPA 1IZ1A 3CG3A 4TOZA 3H3GA 2QMXA 5DEXA 4JWXA 3O66A 3SEWA 2Q9TA 5AA2D 3A3UA 1LBBA 1JETA 1FQFA 4Q30B 1VR5A 3SEXA 5CM6A 1MXVA 4H5GA 4IY6A 4GD5A 3T9HB 1B0LA 4KCDA 1M5BA 2QMWA 2B65A 4YMAA 1NNKA 4UA8A 1GR2A 4OZ9A 2I0BA 2F35A 1JEVA 5CMCA 2HQ0A 4EDPA 5DYHA 3A09A 1A8EA 4MBPA 5I2KB 3VLVA 2XX8A 1FCKA 3I5OA 3IJOB 4Q5TA 4EF2A 2KLFA 1JW4A 3FZVA 4QFKA 3U1OA 4GL8A 3M3KA 1OQGA 3RT8A 3VFJA 1YAEA 1XOCA 4MLVA 3TDJA 4MF3A 3PMVA 1S9TA 5KCJB 2ZNUA 1YPNA 3Q27A 5IAIA 3IB1A 3OD7A 3VE1B 3B6QA 1O7TA 2Y84A 4G68B 3KSXA 1IQ7A 4MLQA 4KYEA 2IEEA 2R6GE 1R9QA 1ATGA 5H8QB 3TCHA 1IXIA 3MVWA 2F5XA 2UYFA 2HEUA 1WODA 4NWDA 2REJA 2XXRA 4ESXA 1FTMA 2O84X 1UTBB 4OHNA 3U93A 2NVUB 1MM6A 4TLMB 3HHFA 2QS2A 3LSFB 3GLBA 4IY5A 1PEBA 1B46A 1URDA 4QSCA 5F1QA 5DVIA 2AL5A 1UTHB 2DVZA 3E4RA 4PETA 4YU0A 4QFNA 2O6AA 1MRPA 3DELB 2F6GA 1EZOA 1EH3A 3FV1A 4G4PA 3C31A 1YCJA 1NNFA 3R26A 3BFTA 1I6BA 3OXNA 3G3FA 4U23A 2HCAA 5I58B 1EZPA 3TPAA 2NXOA 1VE4A 1B2HA 2QS1A 2V25A 1MDP1 4F2OA 1B3HA 3UP9A 1PB8A 1N84A 4F3SA 4RJZA 4NF6B 4ONYA 1SBPA 3L6GA 3MAMA 2XD3A 4M4GA 4OWDA 3OO8A 4R73A 2XXPA 4BDQA 1LSTA 3C4MA 4ZS9A 1ZIUA 1B6HA 5CBRA 4NMYA 3K1PA 3RNNA 1B4HA 3DP4A 1ZTYA 2HAVA 1MPCA 2RF1A 4POWA 4FE8A 4ZECA 1US4A 1MQJA 1P1OA 3PMWA 3TTNA 2WKYA 4IO2A 3V89B 3K01A 3K02A 3LUYA 2DXRA 5I57A 4C0RA 3SEVA 4RPNA 3EHUA 4IO5A 1B51A 1BIYA 4R6HA 2AIXA 4IGTA 4H8JA 2VGQA 5J1DA 4FECA 4OFJA 1QULA 4JB7A 3VLWA 2Y7WA 5B70A 3PPQA 1A99A 1DTZA 3VLUA 4PFYA 3H6VA 5AA2A 3K0VA 1OVTA 1II5A 2OJTA 1CB6A 1POY1 4OESA 3TCGA 4EXLA 3MC2A 4TLLB 2PT2A 3HO7A 3IOUA 4GOTA 3MZ9A 1EZ9A 1R1NA 4RK2A 4X1BA 1D3KA 2E0SA 3N5LA 3K00A 4U22A 3UIFA 1OQHA 4O3CA 1SYIA 2UVHA 2VD3A 4RYAA 4OEUA 1MQHA 3U72A 4X9TA 3FJMA 2Z22A 2QRYA 2F97A 4R6YA 1T0KA 4GQOA 2PBWA 2D5WA 1BP5A 3HCQA 3MJNA 4XTCQ 2QL3A 2AL4A 2O51A 4XXUA 4XKPA 4OYVA 2X7QA 3MP6A 3OMBA 5FTHA 1MDQA 3O97A 4ECFA 4FJPA 3QIMA 4NF8A 3V83A 1SYHA 2DS9A 3TAJA 3TUSA 1D9YA 1USYH 5KCJA 3OELA 2XXQA 3SERA 5L9MA 1B1HA 4YB7A 5JEIA 4H67A 4TQUQ 3MW0A 2A5TB 2DVCA 1GTKA 2X26A 4EUOA 3OO9A 3GZGA 2GH9A 3EN3A 3PD8A 5DT6A 3RY3A 1JVYA 4GF8A 1FTLA 5AA1A 4YKKA 5TP9B 3MZBA 2RC7A 4IO3A 3FV2A 5H8FB 1QJMA 2XX7A 3TQLA 2I0CA 1B3LA 3TTKA 1LLSA 3IOTA 4XIGQ 4LONB 1UTBA 3VVDA 1QVSA 1B32A 4I9DA 2QS4A 3N6UA 5ICTA 4FEDA 3K2DA 2V84A 4UACA 4R9GA 4BDLA 4ZEBA 1L5TA 3DP6A 1NNTA 1LB9A 5CMBA 1BLFA 3VXCA 1NH7A 1CE2A 1UTHA 3PMXA 3QUFA 2UXAA 1B7ZA 2ABHA 2D21A 4LP2B 4F18A 2OK2A 1JW5A 3V5AA 3KN7A 1LFGA 4NF5B 2UVGA 1SW2A 2O69A 3LC8A 5L9OA 3T22A 4QRZA 4EF1A 2OWTA 3TTRA 4LZ7A 2ANJA 4YKPA 1AIVA 2Q2CA 5I58A 4O3BA 4OENA 1NNPA 4HCWA 2DWAA 1SI0A 2ZYKA 4F1UA 2Z8DA 4DDDA 1OLCA 2YJPA 2R71A 4K3FA 5BWJA 1WVJA 3C36A 3A3CA 1IEJA 1SD3A 1P1UA 3RTWB 3QAXA 2GFEA 4OQOA 2QSXA 3MP8A 3FJGA 3VDFA 1B7UA 2ZYOA 4E0WA 1OLAA 1Y3QA 2VHAA 2DOJA 4OMBA 2R9JA 4N13A 1MPDA 1UQWA 2FA7A 4IO4A 3OEMA 1ZBMA 1Y3PA 5EHSA 4EQ9A 3FVKA 5JK4A 1TT1A 5H8HB 2ZXTA 2Y7KA 3KJ7A 1AH5A 1DSNA 4WXJA 2Y7PA 4ISUA 2HZLA 3HSTA 4YZZA 1H3DA 4F2QA 3OEKA 4R2FA 3E9XA 3CRBA 3V8XB 1FQCA 2ONRA 3IJXB 2DE4A 1DTGA 1MXWA 3BBRA 5F7VA 4JBZA 4RXLA 2UYEA 3G3HA 3FVOA 1A7LA 5KZTA 3KOTA 1NFTA 3G3KA 1N3WA 3S9EA 4R9FA 2QPQA 4R72A 4NE4A 3K4UA 1N04A 1VFDA 1KWHA 3L6HA 4I1DA 1B40A 3D4CA 3ILUB 1JNFA 2XD2A 1I6AA 3TODA 3C33A 1MQGA 4QFOA 3HN0A 2I3WA 3H03A 4MH5A 4ELQA 1POTA 2F36A 4YB6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ZE8A 4YMBA 1K9YA 3ECRA 3RQTA 4PAKA 3UGWA 1US5A 4WEPA 2F6PA 3T93B 2ZMBA 5FTIA 4R75A 4KI0E 5I84A 4BLAA 1Y9UA 2ZYMA 2FNCA 1FPGA 3C34A 2ZYNA 1IMBA 3HV1A 4N91A 5F24A 2REGA 4ELPA 1MY1A 3PD9A 1TFAA 4MNIA 1DBZA 4LQ2A 2GHAA 3PPPA 4KQPA 2ZNTA 5IM2A 1FTJA 2V93A 3FVNA 1NI9A 4DZ1A 3K6WA 1G0HA 4DCYA 2F3DA 4X48A 1Y20A 1FJ9A 4Z0IA 3WAFA 4KYSA 2CMOA 2O1MA 1FPDA 2F7CA 2B4LA 4ZEFA 4N6PA 5EQAA 3KC0A 2DWIA 4H46A 3FUZA 5JTYA 3C32A 2FVZA 3CSGA 1LAHE 4H45A 4I40A 3EPEA 3K6UA 2XXVA 4F29A 4KYDA 3TEPA 2Q89A 5A5XB 3RPLA 3IO4A 4GWOA 3QSLA 1B1XA 1MY2A 3W9VA 4BDRA 4I3YA 2V3TA 4GX6A 5I56B 4G8HA 4ELOA 4YKJA 5KDTB 1NV4A 2O7UA 3E13X 4LATA 4H0WA 5I59B 2GRVA 1GVCA 3ROJA 1FBHA 2XHDA 3M3LA 2Z8FA 3CFZA 3T1BA 2WBBA 2PYYA 2JJKA 4N07A 1URSA 1QKBA 4QFLA 4PP0A 3LSXA 3ZSFA 1FTOA 3QYTA 4H8IA 1PC3A 3ZKLA 3G3IA 1FPIA 4P47A 4FORA 4F31B 2CZIA 3KSJA 2WYKA 4GRKA 4MEVA 3DLNA 4GWWA 4DXCA 3TYHA 1NKXA 3JYRA 2RCBA 1FW0A 1FQEA 1NUYA 3USDA 5AA4B 2DYXA 3T9VA 4Q8RA 4UABA 4G77A 3ONMA 3OENA 4JDFA 4MFIA 1NH8A 4NF5A 4DXUA 4EQBA 5ISUA 4AB6A 4WKMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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