2O1LA

Structure of a complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with disaccharide at 1.97 a resolution
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of a complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with disaccharide at 1.97 A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Hydrolase
total genus 111
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-11-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o1lA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o1lA02
1B4HA 3MP8A 2NXOA 3C31A 4KYEA 5TP9B 1MXUA 2QL3A 3T96B 1CE2A 4KYDA 2DXRA 1O64A 2DOJA 2V3QA 4LVQA 4H67A 4NTLA 4ZE8A 3MC2A 5A5XB 3TTRA 3DP6A 3N5LA 5CBSA 1MH3A 3WAEA 1GVCA 3MBPA 4ND9A 1FQCA 3PUWE 1FQBA 1ZMGA 4PP0A 2XXHA 2QSXA 1POTA 4F3BA 2Q89A 4P0IA 3PV0E 2OBGA 1QUJA 3T9VA 1O7TA 4EQ9A 3ECRA 1SYIA 1N7XA 2XX9A 4ZEDA 4TQUQ 3RUMA 2R71A 3O6HA 5KCJB 4AB5A 4R2FA 4QSCA 4N07A 1QJMA 4ESXA 5FTIA 2O84X 2OCUA 4FECA 2QS4A 1H43A 1NNPA 2YJPA 4FAJA 4OTEA 4OWDA 1B0LA 3G3IA 1WDNA 2F7CA 4YMAA 4F29A 2RKMA 5K2XA 1P1QA 3TCFA 1LBCA 3W15C 4N13A 1LSTA 4AB6A 4U4XA 3KSXA 4HTGA 3MP6A 1P1NA 2PT1A 4G68A 1HSLA 2V3UA 1IZ1A 4IY5A 1YPNA 1LAFE 3UIFA 5CMKA 1BTJA 3H6TA 1BLFA 1QUKA 4Q0CA 1OQGA 1MXVA 3H06B 4U4SA 1QW0A 4LQ2A 5EHMA 2B65A 3USDA 3IOUA 1RYOA 2V3TA 1JEUA 3TZAA 1POY1 4MFIA 4RNSA 4N6PA 4OFOA 1L5TA 1Y4TA 4FATA 2QS2A 5TP9A 2G29A 1LCFA 1SYHA 4F19A 3EHSA 5L9SA 2ABHA 1P1UA 3IL1B 2RC8A 3IO4A 4C1UA 2ZNTA 4LP2B 4YB7A 1M5DA 4AQ4A 5A5XA 1UQWA 3PMVA 4R9FA 5DVFA 2REGA 3C9HA 3S9LC 4GL8A 3H6UA 4F3PA 3Q27A 4EQBA 3FASA 1DPEA 4LATA 3SETA 1MY1A 1VSOA 2H99A 2F7AA 2I49A 5KCJA 3JYRA 2UVGA 4U1OA 1N3WA 3B6WA 3R7XA 2A5TB 5AA3A 5M2VA 4HCWA 1Y1ZA 3TODA 3IOWA 3CG1A 3VVFA 3UGWA 2V84A 3SEVA 2Z8EA 3PPQA 5ISUA 3HCQA 1MM7A 5I58A 3SEUA 3TMGA 4EF1A 3I6VA 3KGCA 3VV5A 4XXUA 4JSOA 4ZEIA 4ZEKA 4P11A 1N76A 4WXJA 4WEPA 1LAHE 3IB2A 3G3JA 1Y4CA 5L8DA 3C34A 3PD8A 1PB8A 1Y20A 3W9WA 1UIUA 2HQ0A 1D3KA 3K00A 1N84A 2H5YA 4G77A 5I57A 2IEEA 2XD3A 3KEIA 2PVUA 3ZKLA 1A40A 2HCAA 3QSLA 2YPNA 4YAHX 4NF8B 1A54A 2DQVA 3U94A 2X7PA 3O66A 4DLDA 2UVJA 4GXSB 1OVTA 3K1MA 2F5XA 3L6GA 3FV1A 1DOTA 2ESNA 4R6YA 2XXWA 4ELRA 2X26A 4RPOA 4LZ5A 4OMBA 3U1OA 3IB0A 4BDLA 5H8SA 1AMFA 1EU8A 1MQJA 1ZU0A 4HS7A 3EF7A 4F1YA 4IO7A 2ZYNA 2NVUB 3VLVA 5BUUA 3SEXA 3H6WA 2ONSA 2XXIA 2F34A 3CR9A 4R75A 4GWOA 3H6VA 3K6WA 1QUIA 5ITPA 3SEWA 4NF6B 1NH8A 2Y7IA 3THIA 4LQ5A 1S7YA 4LUBA 3G3GA 2A5TA 2DE4A 2I6EA 4RPNA 2O69A 3EHUA 3O6GA 1OLCA 1URDA 3E4RA 3T9HB 4R73A 1JVXA 1LFGA 1UTBB 1SW5A 3KG2A 3T93B 1IUDA 4DXCA 3TTKA 1EZ9A 1M5CA 3LSXA 1ZKBA 3IJXB 1ZJLA 4TOZA 4U22A 2P2AA 3MP1A 2ANJA 2PBWA 4JSDA 4I62A 1NL5A 3I5OA 1AIVA 1AL3A 2XX8A 4F22A 2B3FA 3OEKA 4RY1A 2H25A 2W7YA 4IO6A 1MDQA 3ODBA 4H5FA 3SDFA 3U93A 2UYFA 4KHZE 4ISUA 4ELPA 2RC7A 4YICA 3LBSA 3O28A 4Q30B 3KSJA 4NE4A 4LZ7A 3P7IA 1SI0A 1LB9A 3KBRA 4IGTA 4ECFA 1XVYA 3FATA 3VFJA 3OELA 1LCTA 3PUZE 3K1NA 4DE8A 1PB9A 2XXUA 2QJEA 3HV1A 4MLQA 3LR1A 3UP9A 1MXZA 1RKMA 2XXRA 1IXIA 1M5FA 3IOVA 4PFTA 1LGBC 4G68B 1B58A 1MQDA 3TKDA 1LAGE 3W9VA 3OO6A 3K6XA 3IK6B 1B0HA 2D5WA 1R6ZA 1XOCA 4EXKA 3S9EA 2I0CA 3UN6A 1TT1A 2PT2A 3RN8A 1Z7NE 1R9LA 1USYE 4H1XA 4G2ZA 3OEMA 3RY3A 4F1VA 3N26A 2Y84A 3TYHA 3KOTA 3KFMA 1IXCA 1TFDA 4O3AA 3Q29A 4YB5A 3PU5A 1MY4A 2I58A 2DWHA 3K2DA 5LOMA 2ONKE 2R9JA 4QRZA 2ZYOA 1Y3NA 2P1SA 1YCJA 1N04A 2DXYA 1UTBA 5K2YA 2H9BA 1S50A 3JZJA 3BBRA 4DXUA 1Y3QA 3U8QA 2VD2A 3HSTA 5AE4A 2XXXA 1IITA 3G3FA 4GVOA 1NMUA 1FQDA 4L17A 3IORA 3MVYA 2O7IA 3FXQA 3TEPA 3ONMA 3FVKA 3PUVE 4QHQA 2QS1A 1YTVA 3T66A 1US5A 4LA9A 2XXPA 2I3VA 4TLLB 1GGGA 4DIGA 3PD9A 3FVOA 3A3UA 4KI0E 5B70A 4I9DA 5TU0A 4C0RA 2XD2A 2ZXTA 3GBAA 1B7UA 4IB2A 4DDDA 5I58B 4EXLA 3BFUA 1HSEA 5F1QA 3OSQA 3T9XB 3OOAA 4HCYA 1MM6A 4G8NA 1JW1A 4ZEFA 4F3SA 2QRYA 3PPNA 5L9OA 1JVYA 1IXGA 1BP5A 5I59B 2FA7A 2F97A 3QAXA 4QFLA 4FEBA 2O7UA 4M1VA 4M4GA 1URGA 2HAUA 3B6QA 2H98A 5I57B 4UA8A 4NWDA 1MXYA 3FVGA 3VVDA 2OWSA 1ATGA 2VOZA 1AOVA 1VR5A 5I2NB 5IAIA 4GOTA 3KN3A 3RT6B 4MF3A 2I0BA 1EZPA 1MQIA 3B6TA 4DXBA 4ZE9A 2QMWA 4Q5TA 3UA8A 3MZBA 2DP8A 4OHNA 3GXAA 2DYXA 5J1DA 5DEXB 3ZS6A 4K3FA 4MH5A 1B1HA 2GRVA 4IO5A 4ZZAA 2RC9A 2VP1A 3IB1A 3O97A 1MXWA 3GLBA 3ILUB 3N6UA 2Q88A 4PE5B 1B7HA 3VVEA 2O1LA 3R6UA 1LFIA 1UIVA 1SQYA 3PMXA 2DE3A 1MXXA 2P0SA 4JWXA 1F9BA 3K6VA 3KJTA 2F7BA 4RYAA 3TTNA 2HEUA 5CMMA 1B32A 2AL4A 1LLSA 1B5IA 4NF5B 5AA4B 3C33A 2Z8FA 4EQ7A 4BDMA 3D4CA 3FVNA 4C1TA 1WVJA 2I48A 1NNKA 3V5AA 4NEDA 3RTWB 4X1DA 4ZEBA 3H03A 3G7WA 4F2OA 3CI8A 5ELVA 3MPLA 1SW2A 3PUYE 5IKBA 3TQLA 1A7LA 4HW8A 1LBBA 4YU0A 5I59A 1DTZA 4F31B 2IA4A 4OFJA 1OVBA 2OK2A 3SERA 4FE8A 1S9TA 2Y7WA 4P0GA 1FTOA 3FUZA 1TWYA 3B7DA 4GRKA 1FTJA 2HXWA 3KZGA 1P1WA 3HN0A 3QXMA 3C32A 4RA1A 4R9GA 3OSRA 5I2NA 1ELJA 1MY0A 1B52A 4OVJA 3CG3A 4OXVA 3K02A 1XVXA 4MLVA 2Q8JA 1VE4A 3K4UA 4QFKA 1JEVA 2Q2CA 3MVXA 4OENA 3H3GA 3KN8A 3LSLA 1B3EA 1GV8A 3Q26A 5EHSA 4OERA 3MZ9A 4RXLA 3TPAA 5DEXA 3S4UA 1A99A 1OLAA 5JK4A 4KD5A 2FYIA 1I6AA 3MQ9A 4ONYA 3CRBA 3CFXA 3M3FA 1P1OA 2V93A 2DWIA 5HPQA 1MPBA 4YKIA 2XXQA 3FJ7A 3DP4A 2I3WA 1ANFA 4PETA 4U2RA 3L6HA 4GFRA 2NWJA 1MG1A 2H4IA 3VE1B 3IO6A 4PQJA 1NFTA 4GF8A 2ZMBA 4KCDA 2VGQA 2KLFA 4NF5A 5AA4A 4QF9A 3FJMA 4IGRA 1LFHA 3VXCA 3LC8A 3DLNA 3RPWA 5ICQA 3F11A 4IO2A 3KOSA 1Z7ME 4H5GA 5TPAB 3SKPA 4KR5A 3ZSFA 4GXAA 3TTMA 3TAJA 4G8HA 3TQWA 3M8UA 4U1ZA 3GBBA 2RINA 1MH4A 4OYVA 5JEIA 3DP8A 3KN7A 5BWJA 1QKBA 1FTLA 3A09A 4H8JA 1JQFA 1MS7A 3HO7A 2DVCA 1JNFA 1B05A 1ZBMA 1H76A 4QSEA 3UK4A 1NH7A 3SESA 2F35A 4OZ9A 4YMBA 2XX7A 1XT8A 1B3HA 1Y3PA 4KPTA 2E1SA 4ELQA 2QS3A 5CMBA 1USYH 2VHAA 2GHBA 1NNFA 4RJZA 1FQEA 3LSWA 4GQOA 4BDNA 4XKQA 2O51A 4FEDA 5ITOA 4DCYA 3PPOA 3OMBA 5FHNA 1SDXA 4XKPA 4GL0A 1US4A 1LB8A 2Y7RA 1MPDA 1JETA 3O29A 1B5HA 1DMBA 3CVGA 1DTGA 3O9PA 2ZNUA 3IX1A 2AYSA 3K6UA 4E0WA 4XIGQ 2D3IA 3BKIB 4YKKA 1PEBA 1NKXA 1Y1MA 1FTKA 4X1BA 1IEJA 3N94A 4I8CA 2GH9A 4THIA 2UVHA 1A8EA 3JV9A 2DS9A 4F39A 1FW0A 2HZKA 2E0SA 2Z8DA 4QFNA 2HAVA 1HSJA 3K1PA 5TPAA 3FD3A 5CI5A 3MW0A 2F78A 4H6DA 4JXIA 1IIWA 3EN3A 3KJ7A 5ICTA 3CSBA 2UYEA 2X7QA 5CC2A 4LZ8A 2QPQA 3O6IA 2CMOA 1J1NA 3RGYA 3T9UA 4R6HA 1Q1KA 1I69A 1MQGA 1QULA 4OEUA 4F1UA 4O3BA 1B40A 3RLFE 4F2QA 4EF2A 1CB6A 2BJJX 3QIMA 3TTLA 1MDP1 3HHFA 3S9MC 5EYFA 4Q8RA 4YB6A 4KQPA 3TDJA 2ZYKA 1MY3A 2Y7PA 3OO8A 1N7WA 4NMYA 3MJNA 1A8FA 4OETA 4IO4A 4MBPA 2Q2AA 3EPEA 3EHTA 5CRYA 1B3GA 2Z23A 3GZGA 4G68C 1AH5A 3I3VA 4BDRA 3CSGA 1ZIUA 4WEDA 2DVZA 3ILTB 5CM6A 3H4ZA 4F18A 2XHDA 3HHGA 4ZECA 1EH3A 3OO9A 3OXNA 4KCCA 5I84A 2DWAA 3AXFA 5KDTA 2NOOA 3ZKKA 1YAEA 5H8HB 3M3LA 1FTMA 3OENA 4TLMB 4ZS9A 3PMWA 3FV2A 1MRPA 1N0TA 2F8DA 2ZNSA 4I1DA 4LONB 2F36A 5AA2B 3E13X 3IJOB 2DSFA 4OEVA 3LSFB 3QK6A 2FNCA 2M8CA 3PUXE 1B51A 3MVZA 4F3GA 2XXYA 4JDFA 5DTBA 2G93A 5KZTA 4H8IA 1WODA 2RCAA 3T22A 4R74A 5DT6A 1EZOA 4OQOA 3RQTA 3RT8A 5FHOA 1UTHB 4RK9A 3LUYA 3K01A 2GHAA 5I2KB 3QYTA 5B7DA 2ONRA 1PBQA 1H3DA 2F6PA 2DE2A 3IAZA 4ZDMA 1BKAA 1M5EA 5CBRA 4ELOA 1B6HA 1Q35A 5L9MA 1SBPA 3IOTA 4FJPA 4EDPA 3M3KA 1XS5A 1XHYA 1M5BA 4G8MA 2A5SA 1FQFA 3V8XB 2WKYA 2ZYMA 4JBZA 4KFQA 3VLWA 3DELB 1QVSA 3TCGA 2F6GA 3MPKA 4JWOA 1SI1A 4POWA 1JW5A 5H8FB 4R6KA 4NF4B 4U21A 2OJTA 3TCHA 3V89B 1QKAA 2ALUA 3V83A 3QUJA 5H8QB 5DVJA 3S9NC 4BLAA 4PFYA 2CZLA 3TUSA 3O2AA 4IY6A 1PB7A 4PFWA 1PDAA 4IO3A 1B7ZA 1MQHA 5H8NB 1I6BA 4H0WA 2R6GE 2I4BA 3OD7A 2UVIA 4OFLA 1MY2A 2OWTA 3D4GA 1FQAA 2THIA 1PC3A 1SW1A 3OO7A 2DWJA 1LAXA 2YLNA 2HFBA 3C35A 3FIRA 4QSDA 1B2HA 5HBCA 3E9XA 5H8HA 3Q28A 3S2VA 1B3FA 4EUOA 1XC1A 2HZLA 3MAMA 1R1NA 4YKPA 2O68A 1D9VA 3FZVA 3FXRA 3WAFA 4U23A 2RF1A 5I56B 4DCXA 5AA2A 1SW4A 4GIZA 4ZZEA 1NNTA 2LAOA 3R26A 5FHMA 1GTKA 3DM0A 3CFZA 5AA1A 2UXAA 2O1MA 1B4ZA 3RNNA 3IR1A 4NWCA 1B1XA 4UACA 4X48A 2GFEA 3H7MA 5JTYB 2Z22A 1H44A 5AA2D 2OZZA 1H45A 1UTHA 4PFUA 4G4PA 3VXBA 3QUFA 5I2KA 4FIMA 3CFLA 4GD5A 3E3KA 3A3CA 3VLUA 5DYHA 1A55A 4XTCQ 3N6TA 1D4NA 1B3LA 2AL5A 4JB7A 1VFEA 4E0XA 3HPIA 1II5A 4QFOA 4XKRA 4BDQA 3K0VA 4Z7EA 5CMCA 1IQ7A 4X9TA 4XKNA 4JWYA 4YKJA 1SD3A 1VFDA 5H8FA 2PX1A 4FORA 3UORA 1D9YA 3U92A 4OESA 4NF4A 1B5JA 3FXUA 1RYXA 1N3XA 1GR2A 2PMSA 1URSA 1MPCA 5H8QA 4DZ1A 1KWHA 1OIBA 2I4CA 5FTHA 3G3HA 3MVWA 3RTFB 3SEYA 2VD3A 5H8NA 2Y7KA 2O6AA 4H65A 1B9JA 1JW4A 3EQ1A 1B46A 2D21A 1PBPA 1OMPA 2RCBA 4WKMA 4R2BA 4BDOA 1BIYA 3CIJA 1DSNA 3PGFA 4NF8A 1IXHA 1FCKA 1SVXB 4QFPA 5DVIA 2OLBA 1TXFA 3C4MA 3Q25A 3FGSA 3MZ1A 3PPPA 5HM4B 2PYYA 4ESWA 1T0KA 2Q9TA 2XXTA 3MUQA 5I56A 3TELA 3VDFA 3MWBA 3PPRA 3BFTA 4R72A 1O63A 2AIXA 5F7VA 1P99A 4Z0IA 1OQHA 1ZTYA 1Y9UA 4KYSA 1TFAA 2QMXA 3G3KA 4RK2A 2V25A 3TFLA 1ZLQA 4O3CA 1I6QA 3C36A 5JTYA 1R9QA 2B3BA 4YZZA 4GLIA 5KDTB 2REJA 1DPPA 3U72A 3FJGA 4NF6A 2XXVA 4POXA 2NUVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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