2O1LA

Structure of a complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with disaccharide at 1.97 a resolution
Total Genus 111

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
5010015020025030030025020015010050
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
publication title Structure of a complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with disaccharide at 1.97 A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 111
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-11-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o1lA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o1lA02
3MW0A 1GR2A 1Y1ZA 2VGQA 4NTLA 3KSXA 4NF8A 3UN6A 2H5YA 5TPAA 4GIZA 2ANJA 1YTVA 2P2AA 1SDXA 3O29A 4EDPA 1BTJA 3FJ7A 3TTMA 3JV9A 4OEUA 4EUOA 3UIFA 4YMBA 2ONSA 3SESA 4EF1A 4IGRA 1D9VA 3QUFA 3VLVA 1B40A 5HPQA 2OJTA 4ZEIA 2OZZA 4JWXA 2GHBA 2M8CA 3PUWE 5FHNA 3MPKA 2IEEA 3CFZA 1ZIUA 5AE4A 1MY3A 4RXLA 4ESWA 3ILUB 1XS5A 4DLDA 5FHMA 4TLMB 2Y7WA 5H8NB 3RLFE 3I3VA 3N5LA 1ZBMA 2I0CA 3G3KA 1D3KA 3M3LA 4G68C 1A55A 1R1NA 5DYHA 3IJXB 2ONRA 3VXBA 1LAGE 3V83A 2ABHA 5I59B 1I6AA 3D4GA 1LLSA 1D4NA 4JBZA 2PX1A 5IKBA 4M1VA 2Q89A 5F1QA 5EYFA 1A40A 1MQGA 3MAMA 1VE4A 2R9JA 1AMFA 3O66A 4ZE9A 3FJGA 2UVJA 2ESNA 3KN3A 1B52A 2DWAA 3VVFA 2R6GE 1LAXA 1QW0A 1MPDA 3K01A 2AL4A 3LUYA 3BFUA 3HCQA 3A3CA 3LSFB 1OQGA 1MXXA 2XD3A 3U94A 3IAZA 4BDOA 3K6UA 2ZXTA 3KOSA 4ZZEA 2AIXA 4OTEA 3VE1B 3G3IA 4PFTA 5I57B 1ZJLA 3T9XB 3V8XB 5K2XA 4JSDA 2A5SA 4R6KA 1POTA 5FHOA 2RC7A 2XX8A 3ZKKA 1N0TA 5JEIA 3CIJA 5A5XB 2ZYOA 1S50A 4QSEA 3PPRA 4ND9A 4F39A 1MS7A 3VVDA 1FTKA 4EF2A 1Y3PA 2W7YA 2HCAA 3EHSA 3UGWA 2O1LA 5KCJA 3OENA 1PB8A 3UK4A 3Q27A 4ZEBA 2Q8JA 3FXUA 3SKPA 3OO9A 1HSLA 3OMBA 3GLBA 3DP4A 3T9UA 1NNPA 1PBQA 4PFWA 1NNTA 1MY1A 4G77A 1VFDA 3VXCA 1SD3A 3M3KA 2UVGA 1B1XA 4KCDA 2X7QA 3MVYA 1LBCA 4Q0CA 3HHGA 3OEKA 4K3FA 2F7AA 2O1MA 1O63A 3B6WA 3GXAA 3MPLA 5I59A 1IITA 1Q1KA 2F7BA 1OMPA 1NKXA 3FVOA 4XTCQ 3U93A 3B7DA 3Q26A 4QF9A 3T9HB 2GH9A 1LFHA 5JTYB 1B7HA 4N6PA 4YICA 5AA4B 3IX1A 4LVQA 3OO6A 3PGFA 3LSWA 2HZKA 4QFNA 2YPNA 2D5WA 3M8UA 4X1BA 5F7VA 2DE4A 4POWA 5L9MA 4DE8A 1BLFA 4YKKA 5CM6A 4O3BA 4OYVA 5LOMA 1LCTA 3G7WA 3VLWA 4RYAA 4YB6A 2VHAA 3CR9A 1TFDA 5CBRA 2DVZA 1JQFA 4H5FA 1M5FA 5ICQA 5H8QB 4F3PA 3IORA 3OEMA 1XHYA 4DXCA 2XXUA 1FQDA 3GBBA 3N26A 1B5HA 4UA8A 4NWCA 2DOJA 3IOTA 4X48A 1IXGA 2F5XA 1PC3A 2I48A 4H5GA 3SERA 2Y7IA 5TU0A 1B32A 1POY1 2Y7PA 4IO7A 5H8HA 2UYFA 4GOTA 1PB9A 3TMGA 5I2KA 5TPAB 5IAIA 1SW1A 2H25A 2YLNA 1N7XA 4GL8A 4U2RA 2DYXA 1B5IA 4RJZA 3FXQA 1FW0A 4JXIA 3MJNA 4HCYA 5L9SA 4RY1A 1DOTA 3MQ9A 3FV2A 4PFUA 1B7UA 2XX9A 2G29A 5CC2A 2VD2A 3IB1A 1MG1A 1MXVA 3K6XA 3RGYA 2I6EA 3FVGA 3TFLA 1R6ZA 2D21A 4LP2B 2NUVA 3TYHA 3G3HA 3MVXA 3W9VA 5I56A 4DXUA 1A8FA 3JZJA 3FV1A 1B9JA 1TFAA 2QRYA 4HCWA 3IB0A 1Y4CA 5KDTA 2QPQA 3MWBA 4IO2A 3Q25A 2OLBA 1B3GA 4O3AA 1RKMA 4TLLB 4F31B 3OSQA 2HZLA 4YKIA 2REJA 4PFYA 4G4PA 3KFMA 3ONMA 2Y84A 5I2NA 4KHZE 4LATA 3C36A 1URGA 3MP6A 3BBRA 3MVZA 4FATA 1Y20A 3DP6A 1FQAA 1WDNA 5KZTA 2XXIA 3TCGA 3C32A 5CMCA 5AA2D 3VDFA 2VOZA 5BWJA 3TTRA 5I58A 5HM4B 5CMBA 4FEBA 3FUZA 1AOVA 4R74A 1B2HA 3OELA 2ONKE 1MQIA 1MXYA 1WVJA 3PUYE 1H76A 1UTHA 5AA3A 4YU0A 2UVHA 2Z22A 3QAXA 5B7DA 4LQ2A 3H6TA 1N3WA 2O7IA 1VSOA 2RKMA 3FIRA 5H8FA 4LQ5A 3QSLA 4NWDA 4OESA 1MY0A 4C0RA 3KZGA 1N76A 3DLNA 1XC1A 3K1MA 4BDMA 3PUXE 1ZMGA 1MPCA 1SW4A 5I84A 4E0WA 2H98A 2DE2A 1H3DA 4F1UA 3CFLA 1SYHA 4DDDA 3OD7A 3DM0A 3QXMA 3C9HA 5CRYA 1B1HA 4OENA 1AH5A 1Y1MA 1B0LA 2I3VA 4I1DA 2XXWA 3EHUA 1JW1A 2ZNTA 3K6VA 4HS7A 2HAUA 5TP9B 3T22A 5KCJB 1MM6A 2DWIA 2UXAA 1QKBA 4F19A 4UACA 2RCAA 3LR1A 4GLIA 4I9DA 2X7PA 4X1DA 1SW2A 4NF5A 4GL0A 1P1OA 1PDAA 1ELJA 4DXBA 1P1NA 2XXTA 3R26A 2DE3A 1YCJA 4C1TA 3SEVA 3S9EA 3CI8A 4P0IA 2NOOA 2QS3A 3EPEA 4XKNA 1N84A 5DT6A 1USYE 4EXKA 1P1WA 5EHSA 3JYRA 1IZ1A 3IO6A 4EQBA 1PEBA 3MP8A 5CMMA 4KYSA 1SQYA 4WEDA 2F7CA 2F6PA 1B3EA 4ISUA 1D9YA 1LB9A 1CB6A 1JEUA 1UTBB 4F3SA 4KFQA 3B6QA 3HO7A 3PD8A 2ZYMA 2RINA 4KPTA 2I0BA 5HBCA 3TTKA 4R6YA 1Y3QA 4IGTA 3R7XA 1QVSA 3RT6B 4BDLA 1OVTA 4OFLA 1GGGA 2BJJX 1GTKA 5AA2A 1P99A 5FTIA 3T9VA 5ICTA 4ZE8A 4FEDA 2UVIA 3K00A 2DQVA 3H6UA 2ZNSA 3HN0A 3RTWB 4IO4A 1LBBA 1ANFA 3RNNA 2HFBA 2O7UA 3IOUA 2YJPA 4OFJA 1LCFA 1FTMA 2QMXA 2AL5A 1Y3NA 3PPNA 4ELRA 1SI1A 1QUIA 3TDJA 1IQ7A 2F34A 4GVOA 4THIA 2XXPA 2V3UA 3IJOB 1N7WA 3TTLA 4LA9A 3TZAA 3FD3A 1SW5A 4LZ5A 4R2BA 5H8HB 4DIGA 3RN8A 2VP1A 1FCKA 5I2KB 1IXCA 3BFTA 3RUMA 1FQFA 3M3FA 5TP9A 1TWYA 2ZYKA 3TCFA 3MP1A 1DTGA 2O69A 3LBSA 4DCYA 1EH3A 3RY3A 2V93A 1OVBA 2XHDA 4U1OA 4F1YA 1T0KA 5ITOA 1B05A 4G8NA 1JETA 4MLQA 4OMBA 4OVJA 1SBPA 4KYDA 3PUZE 1S7YA 2REGA 3WAEA 4U4SA 1O7TA 3VV5A 4GF8A 1B4ZA 1H43A 1HSJA 5DTBA 2Z8FA 3W9WA 4YB7A 2RF1A 1HSEA 4EQ9A 3E3KA 1EU8A 3H4ZA 4R9GA 4OERA 1BP5A 5I56B 3UP9A 3K4UA 1AL3A 4WKMA 4F2QA 2ZYNA 4N07A 5KDTB 2AYSA 4G8HA 1UTBA 1RYXA 1GV8A 1NL5A 3O28A 3K1NA 3O6IA 3VLUA 3ZS6A 2OCUA 3MC2A 4PP0A 1Z7NE 2LAOA 5I2NB 1B7ZA 3QIMA 4R72A 4ZEFA 3ZSFA 2KLFA 4BDNA 1FQCA 4G2ZA 3N94A 2Q88A 1MQHA 1XVXA 4LZ7A 1MQDA 1EZOA 2HQ0A 5DEXA 3N6UA 4R9FA 4WXJA 3CSGA 3K02A 1A99A 4LONB 3TTNA 5I58B 2O84X 1L5TA 2QSXA 4U21A 4C1UA 4QFOA 2GRVA 3O9PA 1Q35A 4ZS9A 1FQBA 4IB2A 4L17A 5ITPA 2NWJA 2QS2A 2XX7A 1MXWA 1UTHB 3SDFA 3AXFA 3THIA 4NEDA 1NMUA 3H3GA 3OO7A 3PPOA 3K2DA 5DVIA 4F29A 5H8FB 1QUKA 1S9TA 2R71A 4NF4A 3ZKLA 3B6TA 4GQOA 2F6GA 3ILTB 4P11A 4F22A 2Z8DA 3USDA 1B46A 4GFRA 4OWDA 2DS9A 2XXVA 4RPNA 2GFEA 1MXUA 3C31A 3FVKA 2V3TA 3PPPA 4ELQA 1MY4A 2UYEA 1B51A 2V84A 1OIBA 3P7IA 3RPWA 1TXFA 2Q2CA 1MM7A 2FNCA 3RQTA 3TPAA 1DTZA 1PBPA 3LSXA 4KR5A 3DP8A 3PMWA 3KOTA 3TEPA 1URDA 4NF5B 2XXXA 4GD5A 4H0WA 1JW5A 4PETA 4KCCA 4F18A 3SEYA 1KWHA 2VD3A 4Q5TA 4E0XA 5CMKA 3I5OA 1MH3A 1MDP1 4XKPA 2O68A 3O97A 3OXNA 3HPIA 4RNSA 2V25A 3CG3A 3EN3A 3T66A 3W15C 2OWSA 3S9NC 1BIYA 2FYIA 4YAHX 2F36A 2B65A 1IIWA 1ATGA 4OFOA 2I58A 3RTFB 3S9MC 5L9OA 2A5TA 4Q30B 2H9BA 3G3JA 3UA8A 4YMAA 3KN8A 2E1SA 2OK2A 5AA2B 3N6TA 1UIUA 3T93B 2QL3A 2B3FA 4JB7A 2PT2A 3K6WA 3VVEA 1M5BA 3G3GA 4R73A 3CRBA 4ESXA 2PMSA 3I6VA 1R9LA 4F1VA 2XXYA 3E4RA 4BLAA 4QFLA 1R9QA 3FVNA 3UORA 3TODA 3Q28A 1M5CA 4IY6A 4QFPA 1B58A 1I69A 2E0SA 4YB5A 4NE4A 3LSLA 2P1SA 4BDRA 1UQWA 3PV0E 4R6HA 1P1QA 1I6BA 3TCHA 1NNFA 1XOCA 4ELOA 3U72A 3HV1A 4FORA 1RYOA 3HHFA 1H44A 4F3GA 3FJMA 3PMXA 2F97A 3C33A 5EHMA 4ZDMA 3SEWA 3O6GA 3O2AA 1TT1A 5L8DA 1FTOA 2FA7A 3IK6B 2QJEA 4MBPA 1FTLA 3F11A 4F2OA 4QRZA 2O51A 3FASA 3L6GA 4QFKA 3TAJA 3WAFA 4QHQA 4RK9A 3C35A 2F35A 4YKJA 1BKAA 2OBGA 1MRPA 4NF6B 2DVCA 5CBSA 1LB8A 3TELA 1CE2A 3A3UA 4ZEDA 3K0VA 3KGCA 4QSDA 2QS1A 1EZ9A 2DXRA 1N3XA 3ECRA 4BDQA 3TKDA 4FIMA 3G3FA 3R6UA 4G68B 1JW4A 1H45A 2GHAA 4ECFA 3KN7A 3SEUA 3TQWA 4IO3A 2I4BA 4KYEA 4POXA 2PBWA 4HW8A 4JDFA 3FATA 2I4CA 1AIVA 4AB5A 1ZKBA 2RC8A 4P0GA 4OEVA 2PVUA 3E9XA 1QULA 1A7LA 1B4HA 4TQUQ 1LAHE 4PE5B 2DWJA 4H67A 1Z7ME 1LFIA 5DEXB 5BUUA 3MZ9A 3PUVE 3QK6A 3IB2A 2V3QA 2RC9A 5H8SA 1MXZA 5ISUA 4TOZA 2HXWA 1LSTA 4RK2A 4MFIA 4JWYA 4GWOA 1MPBA 4EXLA 1P1UA 4KI0E 1NH8A 4YKPA 3MUQA 3SEXA 4XKRA 1B3HA 2ZMBA 2WKYA 2QMWA 1O64A 1JNFA 3V89B 3EF7A 3SETA 3CFXA 4NF4B 3BKIB 3H6WA 3C4MA 4Z7EA 4RA1A 3EQ1A 1Y4TA 2ALUA 4XXUA 1FQEA 4WEPA 1NNKA 2XXQA 5DVFA 1DMBA 2HAVA 1DPPA 2P0SA 3Q29A 2F78A 5H8NA 3KEIA 1II5A 4GXSB 4NF6A 1YAEA 3CSBA 1QKAA 1J1NA 1OLAA 1SVXB 3MZBA 3O6HA 5J1DA 2DSFA 2H99A 3MZ1A 3MBPA 4G68A 2O6AA 4U22A 1US5A 1VFEA 2DWHA 1IEJA 4U4XA 1JEVA 1URSA 3IL1B 3A09A 3EHTA 2B3BA 3KSJA 2Y7RA 4ZEKA 3ODBA 3U92A 1IUDA 2NXOA 1OQHA 3KJTA 5B70A 2QS4A 3IR1A 4KD5A 4U1ZA 2F8DA 1B3LA 3QUJA 2XD2A 4I62A 5DVJA 4FAJA 1LGBC 1N04A 3HSTA 3CVGA 4H65A 1EZPA 2DP8A 1F9BA 5AA1A 4ELPA 2Y7KA 2ZNUA 4DZ1A 2A5TB 1SYIA 4OHNA 3D4CA 5ELVA 2RCBA 1XVYA 3T96B 1JVYA 2OWTA 4AQ4A 2PYYA 1XT8A 4RPOA 3IO4A 2THIA 1IXHA 3GZGA 3LC8A 2CMOA 1VR5A 4O3CA 5I57A 3OOAA 3OO8A 2Q9TA 4MH5A 2IA4A 1M5EA 4XKQA 2X26A 4AB6A 4IO6A 4MF3A 4KQPA 3H7MA 1USYH 5A5XA 4H8IA 1GVCA 3PPQA 4NF8B 1NH7A 4HTGA 1DPEA 4Q8RA 3S4UA 2XXRA 5CI5A 4ONYA 5FTHA 1B6HA 2G93A 2D3IA 1IXIA 4IY5A 1PB7A 4I8CA 1ZTYA 1WODA 4XIGQ 4FJPA 4JWOA 4EQ7A 4OZ9A 4H6DA 4LZ8A 4NMYA 4MLVA 3E13X 4GXAA 2Z23A 4H1XA 1MY2A 3IOVA 1NFTA 1US4A 3DELB 4G8MA 3PD9A 4OQOA 1M5DA 3TQLA 1MQJA 1Y9UA 3FZVA 1QUJA 3S9LC 4ZECA 4H8JA 1A54A 4F3BA 4Z0IA 3K1PA 4N13A 1LFGA 5JK4A 3FXRA 5K2YA 1QJMA 4U23A 4LUBA 5JTYA 3PU5A 3V5AA 1FTJA 1YPNA 5AA4A 4QSCA 1JVXA 1B5JA 3OSRA 1LAFE 3RT8A 4DCXA 4ZZAA 2XXHA 4OETA 2I49A 3U1OA 1UIVA 3IOWA 4IO5A 2Q2AA 3L6HA 4R2FA 4YZZA 3KBRA 2DXYA 4GRKA 3TUSA 4M4GA 2HEUA 2PT1A 3H06B 1A8EA 4PQJA 3PMVA 3H6VA 2Z8EA 4X9TA 1B0HA 3KG2A 3KJ7A 4JSOA 3CG1A 1DSNA 5H8QA 2NVUB 5M2VA 1ZLQA 3GBAA 2H4IA 3H03A 1SI0A 3VFJA 2I3WA 1B3FA 3C34A 4FECA 3S2VA 4R75A 3FGSA 3QYTA 1MH4A 1OLCA 3MVWA 4OXVA 1MDQA 1I6QA 1ZU0A 4FE8A 2CZLA 3U8QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MW0A 1GR2A 3D1RA 1Y1ZA 2VGQA 4NTLA 3KSXA 4NF8A 3MYUA 3UN6A 2H5YA 5TPAA 4GIZA 2ANJA 1YTVA 2P2AA 1SDXA 5ET8A 3O29A 5EQ8A 4EDPA 2P3VA 1BTJA 3EKIA 3FJ7A 3TTMA 3JV9A 4OEUA 4EUOA 3UIFA 4YMBA 2ONSA 3SESA 3T1BA 4EF1A 4PBHA 4IGRA 3T0JA 1D9VA 3QUFA 3VLVA 1B40A 5HPQA 2OJTA 4ZEIA 2OZZA 2P3NA 4JWXA 2GHBA 2M8CA 3PUWE 5FHNA 3MPKA 2IEEA 3CFZA 1ZIUA 5AE4A 1MY3A 4RXLA 4ESWA 3ILUB 1XS5A 4DLDA 5FHMA 4TLMB 2Y7WA 4PAKA 5H8NB 3RLFE 3I3VA 3N5LA 1ZBMA 2I0CA 3G3KA 1D3KA 4PFBA 3M3LA 4G68C 1A55A 1R1NA 5DYHA 1YYZA 3IJXB 2ONRA 3VXBA 1LAGE 3V83A 2ABHA 3LUZA 5I59B 1I6AA 1NUWA 3D4GA 1LLSA 1D4NA 4JBZA 5IZZA 2PX1A 5I7IA 5IKBA 4M1VA 3KC1A 2Q89A 4OVPA 5F1QA 2HXRA 5EYFA 1A40A 1D9QA 1MQGA 3MAMA 5EQ7A 1VE4A 2R9JA 1AMFA 3O66A 4ZE9A 3FJGA 2UVJA 2ESNA 3KN3A 1B52A 2DWAA 3VVFA 2R6GE 1LAXA 1QW0A 1MPDA 2Q8MA 3K01A 2AL4A 3LUYA 3BFUA 3HCQA 3A3CA 3LSFB 1OQGA 1MXXA 2XD3A 3U94A 3IAZA 4BDOA 3K6UA 2ZXTA 3KOSA 4ZZEA 2AIXA 4OTEA 3VE1B 3G3IA 4PFTA 4GWYA 5I57B 4GX4A 1ZJLA 4N6KA 4XEQA 3T9XB 3V8XB 5K2XA 4JSDA 4PTKA 4GWXA 2A5SA 4R6KA 1POTA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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