2O1LA

Structure of a complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with disaccharide at 1.97 a resolution
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of a complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with disaccharide at 1.97 A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Hydrolase
total genus 111
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-11-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o1lA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o1lA02
5CBRA 3ZKLA 2VD3A 5CMBA 3T22A 2QMWA 4RNSA 4TQUQ 3UK4A 5I2NB 3MPKA 3CIJA 4QSDA 4XXUA 3PPQA 4R72A 2THIA 4DXCA 2Q2CA 1USYE 3U72A 1L5TA 1LFIA 4QFPA 1ELJA 5FHOA 3LBSA 1CB6A 3OO6A 5H8QA 2DXRA 3CFXA 2QJEA 4BDNA 2E0SA 3QYTA 3PMXA 4BLAA 1IIWA 4FATA 3SDFA 4YKKA 3T9XB 4FEBA 4P0GA 3O6GA 4MBPA 3R7XA 4IO3A 1I69A 3OO8A 3H7MA 1IXIA 3N26A 1MXUA 4QHQA 1TT1A 3CG3A 5H8NB 4THIA 1FQFA 3FZVA 4WEDA 1MH3A 2I58A 5FTIA 3IORA 4LVQA 1R1NA 2RC9A 1LAHE 3CR9A 2O51A 1FTJA 4MF3A 3C9HA 1NMUA 1LB9A 3PUZE 2A5SA 4GD5A 3RLFE 2DE2A 4F1UA 3PU5A 4H6DA 2XD3A 3OSRA 5AA4A 3PV0E 4BDMA 4F19A 3H06B 1JW4A 3GXAA 4U23A 1B58A 1NFTA 2ANJA 3ILTB 2ZMBA 4F3GA 4R2FA 4RA1A 3PD8A 5I59A 1SBPA 2QMXA 4ND9A 1B46A 1FTMA 4NF4B 4MH5A 4ZEFA 1B3HA 2V93A 2XXHA 1JQFA 5ICQA 1NNFA 1PB9A 5A5XA 1DOTA 4IO6A 3HN0A 4O3CA 4LQ5A 5AA2D 2OK2A 5ITPA 1B5IA 3MZ9A 1BIYA 3OSQA 3A09A 4TOZA 3G3KA 3QSLA 1DTGA 4U4SA 2F6GA 5AE4A 3LSWA 3UP9A 3MP6A 4LP2B 4FORA 3TYHA 1OMPA 4F3BA 3TMGA 3SEVA 2NWJA 3Q29A 4R9GA 4FEDA 3K6VA 4FECA 1QKBA 4IO2A 1P1UA 1SW5A 4OQOA 2D3IA 1JNFA 1YTVA 1GGGA 1SYHA 4K3FA 4KYDA 5J1DA 5HM4B 1SYIA 2DWIA 1IXCA 4HTGA 3RT6B 2XXXA 1MPCA 5KCJA 1POY1 2XXTA 5DEXB 4R75A 1MPDA 3EHUA 2Z23A 1VR5A 1DTZA 4ONYA 3ODBA 5L9OA 1AMFA 1MQIA 5I2KB 2DSFA 1GVCA 3I3VA 4NF5B 4ISUA 5I56B 4G8NA 1I6BA 1FQEA 3WAFA 2P1SA 2VGQA 1B1HA 4MFIA 2ZXTA 1NKXA 3KZGA 1URDA 2OZZA 1MXWA 2IA4A 5I2NA 3QAXA 3L6GA 1VE4A 1EU8A 2XXYA 3C36A 3EN3A 2ONRA 3QUFA 1YAEA 3K0VA 1OLCA 2V3UA 3U1OA 1Q35A 3JYRA 1URSA 1O63A 1TXFA 1QVSA 3FXQA 4GLIA 2QSXA 4PFWA 5EHSA 4H65A 2CMOA 4PETA 3TPAA 4YKPA 5CI5A 1JW1A 3L6HA 4GF8A 1D9VA 1GR2A 3JV9A 3B6WA 2ZNSA 2UVGA 4PQJA 3ECRA 2RKMA 2Y84A 4F31B 5JK4A 2G93A 3FJMA 1XOCA 5LOMA 3C33A 4H0WA 2O7UA 3G3FA 3IAZA 1M5EA 5DT6A 3FV1A 3KBRA 2Y7WA 4OFJA 3TCFA 3OO7A 4F18A 1B32A 5JTYA 3K6XA 4H8IA 1PBQA 3R6UA 3HPIA 3H6WA 4LA9A 2V3QA 4OMBA 1QUKA 2F97A 4JBZA 5AA4B 3VFJA 1MY1A 4OEUA 5DVJA 5ELVA 1UIUA 4YZZA 1Y1ZA 1D3KA 3UN6A 1Y4CA 2PT2A 1NL5A 1GTKA 3H3GA 4Q0CA 1H76A 1EZPA 4QFLA 1HSJA 4NTLA 3G3JA 2Q2AA 5BUUA 4OZ9A 1OLAA 4KYSA 2UXAA 1IXGA 4JWOA 3KGCA 3QK6A 5F1QA 1P1QA 3UA8A 3VVEA 2DVZA 2QS3A 2XX7A 1B3GA 3C35A 4RYAA 4GOTA 4FJPA 2XD2A 1MQDA 3CI8A 3FVNA 3MP8A 5TPAA 3RNNA 1AIVA 1MM7A 4U2RA 3SEUA 1MXYA 3I5OA 4YU0A 4QSCA 3K6UA 2NUVA 2Z8DA 4DCYA 4NF8A 1A8FA 5M2VA 2H4IA 2HAVA 3B7DA 4RJZA 5DVIA 3MWBA 3FATA 3QIMA 1OIBA 4H8JA 2P2AA 1RYOA 2RCAA 2F36A 3G3IA 4JSDA 5KCJB 3IJOB 3VVDA 1TWYA 2F8DA 3U93A 4EF2A 1OQGA 4GWOA 5H8HA 3O97A 2E1SA 3LC8A 4GFRA 2VOZA 2F5XA 4P0IA 5I56A 2R71A 1PC3A 4OHNA 3IB0A 1XHYA 3T93B 5EYFA 3F11A 2PVUA 3T66A 3EF7A 1NNPA 3TKDA 1POTA 2ABHA 3TTLA 1R6ZA 3K2DA 4AB5A 1VFDA 1OVTA 3O29A 3LR1A 2ONSA 2Y7KA 1PEBA 3U94A 1PBPA 4X9TA 1II5A 4OESA 1B05A 3U92A 1DSNA 1PB7A 3PUYE 4YB6A 3ONMA 1MRPA 2ZNUA 3PPPA 4POWA 3IOWA 3Q25A 3W15C 1IXHA 3LSLA 1FTLA 4DXUA 3EHSA 1I6QA 3T9VA 2F7CA 1CE2A 1LCFA 2I6EA 1FQCA 3MVWA 4XKRA 1B3LA 3TTNA 3V89B 3MVXA 1M5CA 1H44A 4IGRA 3O66A 2DOJA 2ZYNA 2HFBA 1O7TA 2VD2A 3G3HA 1SW2A 3PPRA 4QRZA 2X7PA 5CMMA 1MDP1 3MJNA 3JZJA 5JTYB 2Q9TA 3H6TA 4WXJA 1LSTA 4WKMA 1MY0A 3IX1A 3BFUA 2VP1A 1B7UA 1ZMGA 3RQTA 1FQBA 3W9WA 4RY1A 4XKPA 4BDOA 1IQ7A 1PDAA 3TUSA 4R6HA 4H1XA 2HEUA 3PUVE 1SD3A 4YB5A 5KZTA 1B4HA 2QS4A 4F3PA 1SW4A 2DXYA 3AXFA 2O68A 2DQVA 4KHZE 3IR1A 3KOSA 3TQWA 1QW0A 4AB6A 2RINA 1XC1A 3FXRA 2A5TA 1UTBB 4ZEBA 2F78A 1IUDA 3PD9A 3OENA 3CRBA 4N07A 2G29A 3H6VA 4U21A 2XXRA 1FQAA 2I0BA 1SVXB 4KQPA 4F1YA 2H98A 4I1DA 2DYXA 2XXWA 3N94A 1USYH 4E0WA 4F2QA 2XXQA 3O6HA 1M5DA 2V3TA 3RUMA 1ZIUA 4ZEKA 4LQ2A 5AA3A 1D9YA 1B7ZA 1MQGA 5HPQA 1GV8A 5TPAB 4X1BA 3O28A 5F7VA 2X7QA 1VFEA 4R6KA 4ZZAA 4QSEA 4NF8B 5TU0A 1H45A 2AIXA 1B3EA 4JDFA 1MY3A 1JVYA 4Q5TA 3FUZA 3TTKA 3RGYA 4ELQA 4ELOA 3MP1A 4JSOA 1S9TA 3FJ7A 1ZBMA 2I3VA 5I57A 2LAOA 1OVBA 3M3FA 2XXVA 3E9XA 2UVHA 2F35A 3H6UA 2ZYMA 2O1MA 5FHNA 1N7XA 4ESXA 4H5GA 4U1ZA 4F3SA 5H8HB 4ZZEA 3ZS6A 3LSXA 4RK9A 1N3XA 4NMYA 1IZ1A 4R6YA 2I48A 4ECFA 4OEVA 1MY4A 3RN8A 2I4BA 3CFLA 2Y7PA 3IO6A 3E13X 2D21A 4ESWA 1XVXA 2D5WA 1ANFA 3KEIA 3TQLA 3OEKA 3SETA 4BDQA 2DVCA 4NWCA 3HSTA 3K4UA 4KCCA 2OLBA 3KFMA 1VSOA 3VE1B 1LB8A 2H9BA 2BJJX 1TFDA 4X1DA 4JB7A 3UORA 3VV5A 4HS7A 3DM0A 2DWAA 2HZKA 4G68C 3GZGA 3LSFB 4NF6A 1RYXA 5CRYA 1H3DA 3THIA 3M3LA 3KSJA 4O3BA 4GVOA 4RK2A 2O84X 4KI0E 3S9LC 4IY5A 1QULA 1UQWA 1LFGA 3K1NA 1M5BA 3P7IA 3V83A 1FTOA 4EDPA 2REGA 3TZAA 5DVFA 4N6PA 4EXLA 1PB8A 1B9JA 3V5AA 1MPBA 2KLFA 1US5A 3CVGA 3E4RA 2F7AA 1SDXA 4POXA 4EXKA 3FGSA 3H4ZA 4Z0IA 2FYIA 3MAMA 1F9BA 1MXVA 3MBPA 2DWJA 1N0TA 3M8UA 3TTMA 3UIFA 1R9LA 3DP4A 3IOVA 4MLQA 2AYSA 1HSLA 3IOTA 1B1XA 5L9SA 2B65A 5L8DA 3QXMA 5K2YA 4DZ1A 2OWTA 1IEJA 5KDTA 2X26A 3KSXA 3VXCA 2WKYA 3ZSFA 3OEMA 4C1TA 1FCKA 3CSBA 1LGBC 2XXPA 3TTRA 3PMWA 4G68B 1MXXA 4N13A 3PUXE 2GHBA 2A5TB 4PFYA 1UTBA 4DE8A 3TCHA 4NEDA 1B0HA 3KJTA 1YPNA 4ZDMA 4LZ7A 4YICA 3Q28A 2HCAA 2Z8FA 3C31A 1NNTA 4KR5A 3HO7A 5L9MA 3MQ9A 2IEEA 1A99A 3K1PA 2RC8A 4JXIA 5IKBA 5AA1A 3VLWA 3EHTA 3Q27A 4G77A 1B52A 5CBSA 1WVJA 4OERA 1MM6A 3TAJA 4ZECA 4IB2A 3BKIB 2H5YA 3WAEA 3FXUA 1ZLQA 2P0SA 1J1NA 3FV2A 1US4A 2W7YA 1Z7ME 3PMVA 1Y3NA 1EZOA 3MUQA 1HSEA 3O9PA 1S50A 3FVOA 1LAFE 1YCJA 4OTEA 2QPQA 3VXBA 2PX1A 2F34A 3MC2A 2PYYA 2PT1A 2V25A 3RPWA 5HBCA 4I9DA 3CG1A 4LONB 5JEIA 1D4NA 1UTHA 4G8MA 5I57B 3TODA 1OQHA 3S9EA 5TP9B 1LAXA 5CM6A 1UIVA 2I49A 4F2OA 1Y3QA 1JEVA 4HCWA 4ZE8A 2UVIA 5CC2A 3R26A 1XVYA 1FTKA 2ONKE 1BTJA 1URGA 3C4MA 4YB7A 1MS7A 4EQ7A 1N76A 2HXWA 3HHFA 1JEUA 1ZKBA 3S2VA 2H25A 4GL0A 2PMSA 1SI0A 3ILUB 2Z22A 2FNCA 1Y4TA 4EF1A 4R9FA 1MDQA 4JWXA 1EZ9A 4U22A 3K6WA 5B7DA 2Y7IA 3VLVA 5I84A 1LBCA 2NXOA 4PFTA 1MXZA 5I58A 4NF6B 1A40A 4ELRA 4YMAA 2QL3A 2HAUA 4ELPA 4YAHX 3SEWA 4YKIA 1KWHA 2DWHA 3V8XB 4KD5A 2HQ0A 3IJXB 2OCUA 2VHAA 1B3FA 3IB1A 1EH3A 3OOAA 3O2AA 2OJTA 1DPEA 4OYVA 1Y3PA 5ITOA 4OENA 3FJGA 2XX8A 3KG2A 5B70A 2UVJA 4IO7A 2ZYKA 1A8EA 2YJPA 1MH4A 4EUOA 3SERA 2ZNTA 3BFTA 1LFHA 3OMBA 5CMKA 1A7LA 2O6AA 3KN8A 4OFOA 3HCQA 4H67A 1B4ZA 3SKPA 2ALUA 4XKNA 1BLFA 3PUWE 2Q88A 4X48A 4XIGQ 5CMCA 2PBWA 5KDTB 3EPEA 1IITA 4Q8RA 2NOOA 4H5FA 4M1VA 2I0CA 3OELA 5H8FA 1WDNA 4BDRA 3OO9A 1AOVA 4G68A 3LUYA 3S4UA 4XKQA 3MZ1A 3FIRA 4R74A 4FIMA 4IO5A 4GIZA 1JW5A 3N5LA 4R73A 4IGTA 1ATGA 2NVUB 4JWYA 3T96B 1SI1A 1TFAA 2OWSA 4LUBA 2DS9A 1Y20A 1N04A 4WEPA 5FTHA 2HZLA 3T9HB 4RXLA 5AA2A 1N3WA 3G3GA 4ZS9A 1QKAA 4L17A 2QS2A 3USDA 4RPOA 1DPPA 3FVGA 3O6IA 4UA8A 3VDFA 3HHGA 1ZTYA 4DXBA 4C0RA 1B6HA 1AH5A 2QRYA 2Q8JA 4DIGA 4GXSB 3MVZA 1QJMA 1Y1MA 2XXUA 1O64A 1MY2A 1SQYA 4DCXA 2CZLA 4PFUA 1B5JA 4F1VA 4FAJA 3UGWA 3MZBA 3W9VA 1UTHB 3MPLA 1B0LA 4F22A 4LZ5A 1B5HA 4QFNA 5TP9A 2Q89A 4OETA 3BBRA 3B6QA 4QFOA 3K00A 1P1NA 1B51A 1B2HA 2Z8EA 3C32A 3OD7A 1S7YA 4OWDA 3GBBA 1R9QA 3IOUA 3GBAA 4O3AA 2ESNA 2REJA 3ZKKA 1N7WA 3VVFA 1AL3A 1LCTA 2YLNA 4KYEA 4OXVA 5DYHA 1MQHA 4HCYA 3TEPA 2RF1A 1WODA 3H03A 1BKAA 1P1OA 4PE5B 1ZU0A 4LZ8A 1FW0A 2O69A 3S9NC 4AQ4A 5I58B 1DMBA 2GH9A 4GL8A 3A3UA 1P1WA 4GRKA 1SW1A 4ZE9A 1XS5A 2V84A 1I6AA 3RY3A 3TFLA 3TCGA 5H8QB 1NH8A 3RT8A 3RTWB 4NWDA 1NNKA 4UACA 3KN3A 1LBBA 4U4XA 4KPTA 3CFZA 4HW8A 2DE3A 4RPNA 3M3KA 3D4CA 4EQ9A 4Q30B 4XTCQ 2QS1A 3IK6B 3N6TA 4LATA 1B40A 1B7HA 3SEYA 2B3FA 2R6GE 3FVKA 3IO4A 5FHMA 2XXIA 2UYEA 2AL5A 1MG1A 3CSGA 5H8NA 2O1LA 2B3BA 3G7WA 2GHAA 3T9UA 4KFQA 3DP8A 2DE4A 3PGFA 3C34A 3MW0A 1MQJA 1P99A 1FQDA 2YPNA 4QF9A 4GXAA 4F29A 1BP5A 1N84A 3RTFB 4DDDA 4P11A 2DP8A 1Q1KA 4GQOA 5IAIA 1Y9UA 1A54A 4YMBA 1QUIA 5H8FB 3DLNA 3EQ1A 3IL1B 1RKMA 2FA7A 1JVXA 4G4PA 3KN7A 4EQBA 4ZEDA 2UYFA 4E0XA 2I4CA 3B6TA 5I59B 4YKJA 5ISUA 3OXNA 3QUJA 1ZJLA 5K2XA 4G8HA 4DLDA 1XT8A 1H43A 4NF4A 4M4GA 3HV1A 2M8CA 3DELB 5A5XB 3GLBA 4U1OA 3I6VA 5H8SA 4Z7EA 4FE8A 5AA2B 5BWJA 3Q26A 3FASA 5DTBA 1T0KA 3K1MA 4OFLA 1QUJA 3K02A 1NH7A 2RC7A 4IO4A 4IY6A 3KJ7A 3SESA 1LLSA 3N6UA 2XHDA 3DP6A 4PP0A 4ZEIA 3IB2A 4TLLB 3K01A 3PPOA 2F7BA 3U8QA 5ICTA 4KCDA 4MLVA 4BDLA 2R9JA 3PPNA 1A55A 2ZYOA 3S9MC 3D4GA 4NE4A 2RCBA 3KOTA 2H99A 4C1UA 4F39A 3TDJA 2GFEA 3MVYA 4QFKA 5EHMA 3VLUA 2AL4A 4G2ZA 3TELA 3E3KA 5DEXA 1M5FA 3SEXA 2Y7RA 2XX9A 2GRVA 3FD3A 4R2BA 4OVJA 2O7IA 1Z7NE 1LAGE 1JETA 4I62A 2OBGA 5I2KA 4NF5A 2I3WA 4I8CA 2F6PA 3A3CA 4TLMB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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