2O51A

Crystal structure of bovine c-lobe with fructose at 3.0 a resolution
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Metal binding protein
publication title Crystal structure of bovine C-lobe with fructose at 3.0 A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 104
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o51A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o51A02
3FVKA 1SI0A 3MBPA 3QSLA 2DP8A 4IO5A 3U92A 1A99A 3ZSFA 3S9LC 5EHSA 4DXBA 4U2RA 4HW8A 4KHZE 3VXBA 4TLLB 2GRVA 4EXKA 5I58B 1QJMA 1JVYA 1B3FA 4G2ZA 5AA3A 4TLMB 1IXCA 3DLNA 4ONYA 2DWIA 3O6IA 4F3PA 2ESNA 4E0WA 4WEDA 1VSOA 4ELQA 3OELA 3O6GA 4F18A 3S9EA 2D5WA 4RY1A 3H7MA 4NWCA 3MPLA 2NUVA 2P1SA 4N6PA 4LP2B 1URSA 3OO7A 4F1UA 2FA7A 4F1VA 1GGGA 1HSEA 4ISUA 4JWXA 4R72A 1FQCA 4KFQA 3U94A 2BJJX 3FUZA 3FIRA 3JV9A 4QFNA 1URGA 3MC2A 3USDA 1WODA 2RINA 4POXA 4ZEBA 4RNSA 1SYHA 1S9TA 4WKMA 1AL3A 1UTHB 3IOVA 1O7TA 2QJEA 2M8CA 2PYYA 1KWHA 3PU5A 1VR5A 1ZU0A 4H8IA 5A5XA 3KFMA 1SW1A 4FAJA 4YICA 4OWDA 3QUJA 2QL3A 1B7ZA 4C1UA 4C1TA 1O63A 4G8NA 1Y4CA 3OEMA 4I9DA 3CIJA 3TTMA 1SD3A 4DCXA 4F2QA 1XOCA 4EUOA 2XXPA 1UTBB 2XD2A 3H06B 3N94A 3G3JA 1B3LA 4OERA 1NNTA 5CMKA 3RTWB 4KCDA 1XS5A 1Y3NA 4TQUQ 1Y20A 3N6UA 3O28A 1MQJA 5I56A 1A8EA 1OIBA 2QS4A 4ZZEA 3OENA 4R6HA 3IJXB 4PE5B 3G3HA 3QIMA 2VOZA 3KZGA 4GL0A 2RC8A 1Q35A 4OFOA 1USYE 4OEVA 4PP0A 2XX7A 5J1DA 3AXFA 3OMBA 1IQ7A 1ZJLA 1ZIUA 4R74A 3K1PA 1TWYA 3DP4A 4QFPA 3ZKLA 2QSXA 4R9GA 3JYRA 2A5TB 4KPTA 2DS9A 4G8HA 4LZ5A 2ONRA 4K3FA 4F31B 5I2KB 1FW0A 1DMBA 2UYFA 5AA2B 1MS7A 4U1OA 3LC8A 3QYTA 3L6GA 5H8QA 3PD8A 4GRKA 4LUBA 1CB6A 3K2DA 4IY6A 3S9NC 1LFGA 1SVXB 1ZLQA 3M3LA 4PFTA 1UQWA 4Q30B 4RPOA 1MH4A 1GR2A 3GZGA 4NE4A 5ITPA 4DXCA 3CSBA 5HBCA 4YZZA 4QSCA 3GLBA 3H6TA 4DLDA 4KCCA 2H9BA 3OO6A 3SESA 1JQFA 1USYH 2ZXTA 4R9FA 4FATA 2THIA 4WEPA 1N04A 3RTFB 3S9MC 5DVFA 2DOJA 3KSJA 1MPCA 3K6VA 3RPWA 4Q0CA 3IL1B 3T9HB 2HEUA 4EQ7A 2V3QA 3V89B 3SDFA 3K6UA 2QS1A 3IB1A 3Q25A 4O3AA 4GQOA 2XXWA 3VXCA 3A09A 2PVUA 2RCBA 1WVJA 3LBSA 1YPNA 3IK6B 1P1QA 3H4ZA 4ECFA 3SERA 2I4CA 4DE8A 3VLVA 3FJGA 2RC9A 4P0GA 2DWJA 3Q28A 2G29A 5ELVA 4I1DA 2AL5A 1B0HA 4F1YA 4GL8A 3DP8A 5JK4A 2V25A 3RGYA 3PMWA 4OFJA 3SEUA 3TCHA 4ZZAA 4RK9A 2GFEA 1FTKA 4XKQA 5ICTA 4NF4B 1MXXA 3BBRA 2FNCA 1IITA 2XXRA 4U1ZA 1B58A 4NF5B 1Y1MA 3W15C 3VVEA 1JVXA 3VVDA 1LCFA 3PUZE 1B52A 2UYEA 3DP6A 3B6TA 3VLWA 1Y1ZA 3TYHA 4F3BA 2ONKE 4KD5A 4ZECA 4JSOA 2ALUA 3K1MA 3R7XA 2B65A 1H45A 4ZE9A 3C4MA 3CVGA 1LAHE 5FHOA 3SETA 3CG3A 1ZMGA 4BDMA 2X26A 3EHSA 2O7UA 2ZNTA 4FE8A 2XX8A 1VFDA 1SDXA 2F5XA 3TPAA 3TUSA 4YB7A 5H8SA 4P11A 1OQGA 1OVBA 1T0KA 2Q9TA 4RJZA 2XXUA 4R73A 3U8QA 5HPQA 1NL5A 4XIGQ 4GLIA 4THIA 4FIMA 4G4PA 4R6KA 3IB0A 3FXUA 4NEDA 3GBBA 2Y7KA 4ZEDA 1FQDA 3MZ9A 4IGTA 4ND9A 4JWYA 2I0BA 2VP1A 3SKPA 5F1QA 4RA1A 4NWDA 2H4IA 4FECA 1Y4TA 5M2VA 1IXGA 5I59A 3B7DA 5FHMA 1IXHA 5ICQA 3MVZA 3PPPA 2PT1A 1MXUA 2DYXA 2Y84A 4YB6A 2Z8DA 4FEBA 3QK6A 1MXYA 3OSQA 1NFTA 1OVTA 4EQ9A 3D4CA 4JB7A 1MQDA 4POWA 4H65A 3PUYE 2Z23A 4F3GA 5DT6A 1B40A 4G77A 3PPNA 1NNFA 3IO6A 1PB9A 4GFRA 1IIWA 3HPIA 4HS7A 3SEWA 4IO4A 3O6HA 2H5YA 5TPAA 4LZ8A 2AIXA 4LZ7A 3IORA 1B1XA 2XX9A 3UIFA 4DDDA 4F2OA 2RF1A 4R2FA 4EF1A 5CRYA 4IGRA 2V3UA 1PDAA 1LAFE 1P99A 1R9LA 2Y7IA 5I84A 1SBPA 3T93B 2LAOA 4H0WA 4QFOA 5H8NA 1B3HA 5BUUA 2HAUA 3FVOA 4F29A 4NF6A 2DQVA 1S50A 3TEPA 1AIVA 3EPEA 4F19A 3QAXA 1QKAA 4X9TA 2YJPA 5KDTB 1FQAA 4LQ5A 1QKBA 3MP6A 3RY3A 4NF8B 5TP9A 1US4A 3ILUB 3RQTA 3KG2A 1OMPA 4KR5A 3C9HA 4ELOA 3UA8A 3TTRA 5DYHA 5CBSA 1DTZA 2F78A 1RKMA 4ZE8A 2F6PA 3C31A 5I57A 2V84A 2Y7WA 5FTIA 3W9VA 4OESA 3IOWA 3ECRA 1LB9A 1A54A 5K2YA 3I3VA 1II5A 3TTNA 3T9VA 5H8HB 1O64A 2Y7PA 1Z7NE 3VVFA 1P1OA 4EXLA 1M5BA 1FQEA 4OENA 4BDRA 3TKDA 1M5CA 1MY1A 3PD9A 3FZVA 3PUVE 5CM6A 1OLAA 4LQ2A 3N6TA 1XT8A 3LSFB 5L9OA 3CSGA 5JTYA 4G68A 2V3TA 3TMGA 2R9JA 4OEUA 5LOMA 3UGWA 2O1LA 2ONSA 3KJTA 1NH7A 5H8FB 2I4BA 1FTLA 1FCKA 4QF9A 1N0TA 3FJ7A 2OLBA 4AB6A 3B6WA 1FTJA 3OD7A 3FXQA 2DE4A 3HCQA 2FYIA 4PFWA 3E4RA 4H8JA 5I2NA 4DXUA 4NTLA 2F35A 1I6AA 2I3VA 2O51A 4TOZA 3OSRA 4QSEA 3KOSA 4YKPA 4P0IA 2PMSA 4M1VA 2O69A 3ZS6A 4U21A 2WKYA 4RK2A 2H25A 1LLSA 1I69A 1MH3A 3MVXA 1N3XA 1XVYA 2B3BA 2YPNA 5H8NB 2ZYOA 3TELA 4YKKA 3TDJA 3OO9A 5L8DA 2I58A 1LAGE 3T22A 4MFIA 1FTOA 4BDQA 3LSLA 3C35A 1MRPA 4ESWA 3U93A 4MLVA 4IY5A 4MH5A 1LCTA 3OXNA 4DZ1A 1SW5A 3E13X 1H3DA 1PB7A 4R6YA 3PPOA 4OHNA 2YLNA 1CE2A 2HZLA 3IJOB 1N3WA 3IR1A 1QUKA 1JEUA 2QS2A 1IEJA 5A5XB 1MPDA 5F7VA 4OXVA 4ZDMA 3PMVA 3Q27A 2DVCA 4YAHX 2OWTA 2KLFA 4KYEA 3O9PA 3PPQA 4G8MA 2VD2A 1LFIA 2VHAA 2ZYKA 2Q2AA 2Z8EA 4QFKA 5JTYB 5KCJA 3L6HA 1VE4A 1LB8A 1MM6A 2E0SA 3O2AA 3TQLA 4I62A 5AA4A 3MP8A 3MWBA 4X1DA 1N7XA 3K6XA 4IO2A 2I48A 3HV1A 3MP1A 2HCAA 3M3FA 1B9JA 5I56B 1JW5A 2O1MA 3CFLA 4WXJA 1XHYA 3K0VA 3IX1A 4RPNA 4X48A 4AB5A 1YCJA 2Y7RA 5AA1A 1QVSA 1LSTA 3H03A 2ZNUA 3FATA 1P1WA 5DVIA 3K02A 3RT6B 5DEXA 3IOUA 3RT8A 2I0CA 3FJMA 1UIUA 1JW4A 3T9UA 4QSDA 2X7PA 4UACA 1B32A 1MY2A 4OQOA 1WDNA 1I6QA 2F7AA 3TTLA 3G3GA 2ABHA 2H99A 2PT2A 1PBPA 1UIVA 3O29A 1PEBA 1SW2A 1TT1A 5B70A 2HFBA 2OWSA 5H8QB 3HSTA 3V83A 2PBWA 2DE3A 3PMXA 4IO3A 1FQBA 5CC2A 4RXLA 1US5A 5AA2D 1SQYA 5I58A 2XHDA 3KN8A 2UVJA 1QUIA 2GHAA 3G3KA 1LFHA 1MQGA 1DPPA 1D9YA 3THIA 2ANJA 2XXXA 4H6DA 1A8FA 1H43A 2G93A 1N76A 5FTHA 1BKAA 4O3BA 2Q88A 3C36A 2RC7A 3C34A 2QMXA 4C0RA 2HAVA 1EZOA 5CMCA 3OO8A 3KSXA 2HXWA 3UN6A 4YMBA 4FEDA 2XXYA 5CMMA 1MPBA 2DXRA 2Z22A 1B46A 2QRYA 3FD3A 4OYVA 2Z8FA 3CG1A 2UXAA 3H6UA 3IAZA 3E3KA 3LSWA 3E9XA 4HCWA 4OTEA 4OFLA 1R9QA 5CI5A 1H44A 2REJA 4IO6A 3FASA 3P7IA 4GOTA 3IO4A 3ZKKA 4ELRA 1UTHA 3KBRA 3K00A 2O6AA 4H5FA 2NVUB 3EQ1A 4JDFA 1IZ1A 2DVZA 3O97A 2NXOA 2OK2A 4EQBA 3KJ7A 5EHMA 1XVXA 2RCAA 3VLUA 1M5EA 2OCUA 4OZ9A 4XXUA 4YB5A 1EZPA 1SW4A 1RYOA 1NKXA 3G7WA 4JWOA 3Q29A 4BDNA 3TCGA 3HHGA 1BTJA 1DPEA 2A5SA 4XKNA 1GVCA 4LONB 1ZTYA 2Q8JA 3RLFE 3VE1B 1QW0A 4EF2A 4YKIA 4ESXA 1UTBA 4LVQA 1EU8A 3K4UA 1XC1A 2XXQA 2UVIA 2OBGA 4HTGA 1JETA 1B1HA 3SEVA 1MY0A 1S7YA 3D4GA 1URDA 2VD3A 1MQIA 2Q2CA 1ELJA 3RNNA 3KOTA 3W9WA 1BP5A 1GTKA 2XD3A 4O3CA 2F6GA 3BFUA 4N13A 1Y3QA 2QMWA 1B05A 3UP9A 4KYSA 1MDP1 2DSFA 1ZKBA 4FJPA 1Y3PA 1RYXA 3LR1A 1PBQA 3G3FA 1VFEA 3I5OA 2A5TA 2O84X 5FHNA 1R6ZA 1AH5A 3TTKA 3VV5A 3G3IA 1IXIA 4U23A 4MF3A 5IAIA 4GF8A 3MUQA 2R71A 3EHUA 3A3UA 1A7LA 5I2KA 3M3KA 1EZ9A 1B7UA 3MVYA 2QPQA 5AA2A 1SI1A 2IA4A 3FV2A 3N5LA 3S2VA 4YMAA 2B3FA 1LAXA 4OETA 2CZLA 3FV1A 5I59B 1HSLA 4JBZA 5DTBA 2ZYMA 4GVOA 3FVGA 1B7HA 3V5AA 1JW1A 1B5JA 1AMFA 1R1NA 5BWJA 3HN0A 1MM7A 4Q8RA 4PETA 1POTA 1MXZA 3TFLA 1M5DA 2CMOA 2XXVA 1A55A 3CRBA 1N84A 5TU0A 3H6WA 2V93A 2IEEA 1MY3A 1MQHA 5TPAB 1DOTA 3TAJA 3MAMA 4PQJA 1EH3A 4FORA 3U1OA 5IKBA 1D3KA 1MDQA 2F8DA 3KN7A 2F7CA 3FGSA 2O68A 4JXIA 4KQPA 4KYDA 1B51A 2DWHA 1FTMA 3TCFA 3TQWA 3UORA 1B5HA 3H3GA 5HM4B 3FXRA 3KGCA 4XKPA 2OJTA 2UVHA 3PGFA 4QRZA 1A40A 3PUWE 4MBPA 4NF6B 1DSNA 3CI8A 4ZEKA 5B7DA 3ODBA 3WAFA 2ZMBA 2OZZA 1ZBMA 3WAEA 5K2XA 2F7BA 3R26A 3MJNA 3GBAA 1TFAA 1B0LA 1M5FA 1B3EA 3A3CA 1BIYA 2GHBA 3HO7A 4NF4A 4IO7A 5TP9B 4R2BA 1DTGA 2H98A 3TODA 1NNPA 3MW0A 1HSJA 4R75A 4NF5A 5I57B 3C33A 2XXTA 4H1XA 4RYAA 1PB8A 1GV8A 2QS3A 4F3SA 1MY4A 3SEYA 3VFJA 4Q5TA 1QULA 3LSXA 3MPKA 3FVNA 4GIZA 2F34A 3K6WA 1L5TA 1MXVA 3IB2A 4U4XA 3ONMA 2DXYA 1NH8A 4DIGA 2I6EA 3CFXA 3IOTA 3QUFA 3MVWA 1YAEA 4ZS9A 5KZTA 5JEIA 1B5IA 2R6GE 4ZEIA 4L17A 1F9BA 4G68B 3T66A 3BFTA 4E0XA 1MG1A 1Y9UA 1YTVA 4X1BA 4UA8A 4M4GA 3I6VA 4AQ4A 3KEIA 4HCYA 2NWJA 2E1SA 3HHFA 4BDOA 3U72A 3PPRA 4F39A 1JNFA 4N07A 2Q89A 2VGQA 1QUJA 4IB2A 2I49A 4GXSB 5I2NB 3T96B 3OEKA 1B2HA 2XXIA 4MLQA 4PFUA 3R6UA 3O66A 1BLFA 1P1NA 2P0SA 5EYFA 2ZYNA 4QFLA 1ATGA 4GD5A 3F11A 2RKMA 2F97A 1I6BA 4G68C 4OVJA 2PX1A 3TZAA 3MZ1A 3EN3A 3MQ9A 4QHQA 3N26A 4LATA 2ZNSA 2HQ0A 1OLCA 5DVJA 1SYIA 5L9MA 1B3GA 3JZJA 1IUDA 3RN8A 4GXAA 1TXFA 1JEVA 2W7YA 1AOVA 4XKRA 3BKIB 3C32A 3SEXA 1ANFA 1B4HA 5AE4A 4F22A 2GH9A 1LBBA 3EF7A 3UK4A 2DWAA 4DCYA 2AYSA 1TFDA 3ILTB 1FQFA 3Q26A 4I8CA 1OQHA 3PUXE 4Z7EA 5L9SA 3MZBA 1B4ZA 1LGBC 1B6HA 1J1NA 1POY1 3DELB 4XTCQ 3RUMA 2D3IA 2X7QA 4GWOA 3CFZA 2D21A 5KCJB 2XXHA 4NMYA 5AA4B 3LUYA 1H76A 4ELPA 3V8XB 5KDTA 3DM0A 4BDLA 4BLAA 3S4UA 5ITOA 4NF8A 3B6QA 3OOAA 4JSDA 1NNKA 3QXMA 2NOOA 3EHTA 3M8UA 5CBRA 3VDFA 1N7WA 2I3WA 2AL4A 3GXAA 4U22A 3KN3A 4H5GA 2DE2A 2F36A 4OMBA 1NMUA 5H8HA 3H6VA 4KI0E 3PV0E 1D9VA 5DEXB 3CR9A 1PC3A 3T9XB 4YU0A 5ISUA 4YKJA 4PFYA 5CMBA 4Z0IA 4LA9A 1Z7ME 4EDPA 1Q1KA 2REGA 2O7IA 4U4SA 1LBCA 1MXWA 3K1NA 3K01A 2HZKA 1D4NA 4ZEFA 5H8FA 1P1UA 2UVGA 2P2AA 4H67A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FVKA 4DI4B 5IZ3B 1SI0A 2GQ1A 3MBPA 3QSLA 2DP8A 4IO5A 3U92A 2B4LA 1A99A 5LTCA 3ZSFA 3S9LC 5EHSA 1FRPA 4DXBA 2F3DA 4U2RA 4HW8A 4KHZE 3VXBA 1DBZA 4TLLB 2GRVA 4EXKA 5I58B 1QJMA 2WBDA 1JVYA 1B3FA 4G2ZA 4MCOA 5AA3A 4TLMB 1IXCA 1FJ6A 3DLNA 2DWIA 4ONYA 5DW8A 3O6IA 4F3PA 2ESNA 4E0WA 4WEDA 1VSOA 4ELQA 3OELA 3O6GA 4F18A 3S9EA 2D5WA 4RY1A 3H7MA 4NWCA 3MPLA 2NUVA 2P1SA 4N6PA 4LP2B 1URSA 3OO7A 4GWUA 4F1UA 2FA7A 5ET8A 4F1VA 2OWZA 4OVRA 1GGGA 1HSEA 4ISUA 4JWXA 4HE1A 4R72A 1FQCA 4KFQA 3U94A 2BJJX 3FUZA 3FIRA 4NAPA 2Y5KA 3JV9A 4QFNA 1URGA 1FBEA 3MC2A 3USDA 1WODA 2RINA 4POXA 3SZPA 4ZEBA 4RNSA 1SYHA 1CNQA 1S9TA 2Y5LA 4WKMA 1AL3A 1UTHB 3IOVA 1O7TA 2QJEA 2M8CA 2PYYA 1KWHA 3PU5A 1VR5A 1ZU0A 4H8IA 3E78A 5A5XA 3KFMA 1SW1A 4FAJA 4YICA 4OWDA 3QUJA 2QL3A 1B7ZA 3KC1A 4C1UA 4IR8A 4C1TA 1O63A 4MIJA 4G8NA 1Y4CA 3OEMA 4PDHA 4I9DA 3CIJA 3TTMA 1SD3A 4DCXA 4F2QA 2XWKA 1XOCA 4EUOA 2XXPA 4X8RA 5ET6A 1UTBB 5EQ8A 2XD2A 3H06B 3N94A 3G3JA 1B3LA 4OERA 1NNTA 5CMKA 3RTWB 4KCDA 4GX3A 1XS5A 1Y3NA 4TQUQ 1Y20A 3N6UA 3O28A 1MQJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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