2O68A

Crystal structure of haemophilus influenzae q58l mutant fbpa
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
307
structure length
307
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTELTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The role of the synergistic phosphate anion in iron transport by the periplasmic iron-binding protein from Haemophilus influenzae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
molecule tags Metal binding protein
source organism Haemophilus influenzae
total genus 113
structure length 307
sequence length 307
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o68A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o68A02
4FORA 3B6TA 2R9JA 2ZYOA 3PUXE 1WVJA 2RC7A 3GZGA 2DXYA 4U4XA 2VHAA 2H98A 3UORA 2CZLA 1B51A 2F6PA 1YAEA 3TODA 1ZJLA 4POWA 2REGA 4OHNA 4YKIA 3RT6B 1LCTA 2F97A 2XX7A 2XHDA 1S7YA 1JQFA 1B58A 2CMOA 3CFXA 5ICTA 3QSLA 1MXXA 4NMYA 4JXIA 4R6KA 4U2RA 4ISUA 1FCKA 2PBWA 3QAXA 3DELB 2PX1A 1FTLA 4RXLA 1YCJA 5H8SA 3VLVA 1SW2A 1N3XA 5AA2D 4WEPA 1NNFA 3VLUA 3KN8A 1IIWA 1AL3A 1A8FA 4X1DA 4XKPA 5I2NB 4ELRA 3RPWA 1GV8A 3LSFB 3TAJA 1IUDA 5EYFA 1LFHA 1NH8A 3DM0A 4EQ7A 4YMBA 1P1NA 1TXFA 2ZYNA 4ZZEA 2XXUA 3ZKKA 3RNNA 4F3BA 5EHMA 5A5XA 3F11A 3R7XA 4HTGA 4QFOA 3TKDA 2ZNSA 1RYOA 4IGRA 1AIVA 4AB5A 4LONB 3T96B 4I1DA 3M8UA 1NNKA 3KEIA 4OZ9A 1MM7A 4IY5A 1MDP1 1US4A 5I58B 2OWTA 2O69A 1SVXB 2Y7IA 3S9NC 3EN3A 1MXZA 1LAFE 3HO7A 5JK4A 4PFTA 3SETA 3CSBA 4X48A 2DXRA 4OENA 1NFTA 3G7WA 3U93A 3C32A 3O9PA 1ZBMA 3HCQA 4XTCQ 2OLBA 3KJTA 2XXYA 3OD7A 4NF8A 3MZ9A 3PD8A 3IJOB 4DLDA 4HCYA 2ZMBA 3K01A 2O7IA 4UA8A 3K6VA 2DYXA 3VFJA 4LVQA 3IJXB 4BLAA 4YB5A 3OEMA 1B40A 2QJEA 5DVFA 1CE2A 4BDNA 4JWYA 3JV9A 3MJNA 1F9BA 4KYSA 1MQDA 4XXUA 1SYHA 4DIGA 3FD3A 2RCAA 1DSNA 3MBPA 4N13A 3KSXA 4TQUQ 5TP9A 4MFIA 4QFPA 2OCUA 1XC1A 5H8HB 2HEUA 3MWBA 2HZLA 2DE2A 2GHBA 3MZBA 4QSEA 1H45A 4U22A 4Z7EA 2I49A 3OEKA 5DEXA 1PB8A 4I9DA 1B52A 3MVXA 3TQWA 1TFDA 1UTBB 1LAHE 1GTKA 3LBSA 3KG2A 1HSJA 1MQJA 1IZ1A 4OWDA 4H65A 4TLLB 1TT1A 4LQ2A 1VR5A 2A5TA 1OVBA 2KLFA 1IXGA 1PBPA 1B3HA 3KGCA 2DE4A 4R2FA 3O6GA 3IX1A 2ZYKA 1AH5A 2XXIA 3MUQA 1PEBA 2XXTA 3PUWE 3E9XA 1ZLQA 3EHUA 4F1UA 3MVZA 3TPAA 4PFYA 1JW4A 2XD3A 3IOTA 2XXPA 2NOOA 5B7DA 1A99A 5FHOA 4ZS9A 3USDA 3PUZE 4F3PA 3IK6B 4ELOA 1ZKBA 4WXJA 2O68A 4Q5TA 1JEUA 4PETA 1USYE 4C1UA 5TU0A 2THIA 1P1WA 5DT6A 4H1XA 3OO7A 1B46A 4NF6A 4IO4A 4FEBA 3SEXA 5A5XB 2DP8A 1Y4TA 2RC8A 3CG3A 3O97A 2ANJA 1IXHA 4BDOA 2I48A 3PMVA 3O6HA 3GBAA 3FGSA 1XS5A 2V3QA 4G68A 2DWIA 2E1SA 4F22A 3L6HA 3U92A 3MVYA 4JBZA 2UVGA 4AB6A 4U1OA 5K2YA 4U21A 2V3TA 4M1VA 1AOVA 4OMBA 1POY1 3GLBA 2FNCA 1EZOA 2RINA 4O3CA 1FTOA 4MBPA 3SDFA 5JEIA 3H4ZA 2RC9A 3LR1A 1KWHA 1A55A 2AYSA 1MPDA 1MY1A 1EZPA 1OQGA 3C33A 2UVJA 3MC2A 2Q9TA 4F19A 4MLVA 4H8IA 5TP9B 2UVHA 3ONMA 5DVIA 3LC8A 2AL5A 3B6QA 1JW1A 5CM6A 2R71A 1XHYA 5FTHA 4EF2A 4Q0CA 4E0WA 4H67A 4DDDA 1B7ZA 4GLIA 1A54A 4ZEKA 3C35A 5DEXB 3PPQA 2H25A 1B7UA 1MM6A 2Y7WA 3T9UA 4GIZA 4BDQA 5HPQA 2H4IA 2D5WA 3SERA 2DE3A 4IO3A 3MP6A 4Q30B 5H8NB 2F5XA 3C36A 3PU5A 5H8QB 3T93B 1Y3NA 2F36A 1B6HA 3KN3A 2A5TB 3PMXA 3VVDA 3H3GA 3U94A 3TTRA 4DXBA 4RA1A 1B0LA 2DSFA 3FIRA 2ABHA 3VVFA 2F34A 1YTVA 2RF1A 5IKBA 1D4NA 3FZVA 3K00A 2Z8DA 2QS1A 1DOTA 3QUJA 4O3AA 3DP8A 1MQGA 3O2AA 1ZU0A 3VLWA 1N3WA 3MP1A 2PVUA 1SW5A 3MPLA 3QIMA 5I2KA 3H6TA 4KD5A 3UN6A 1SQYA 4XKNA 2UYEA 1MQHA 4QFNA 2B65A 3VDFA 5AA3A 5CBSA 4RJZA 1GR2A 4AQ4A 3MAMA 5CI5A 1IXIA 3EQ1A 3M3FA 4KPTA 3K6XA 3RN8A 3CVGA 2F35A 2H9BA 3PMWA 1L5TA 4RK9A 4NF4A 1GVCA 4LATA 3CFLA 4WKMA 3VE1B 2X7PA 3OO9A 2DQVA 1Y3PA 1Y20A 1B4HA 1MH3A 3IO4A 3VVEA 4OERA 4DCYA 2QMWA 3R6UA 1N0TA 5M2VA 3Q26A 3EPEA 3ZSFA 4G68B 4LA9A 1SYIA 3SEVA 1MQIA 3PPPA 4F2OA 3T22A 4KFQA 3TCGA 4FEDA 1M5DA 4PFUA 4H0WA 4Z0IA 4YKPA 5H8FA 2O1LA 4N07A 4L17A 1DPEA 1DPPA 3P7IA 4YZZA 3KOSA 4PE5B 4IO2A 1UTHA 1N7XA 4PP0A 4DE8A 5I57A 1MPBA 4EXLA 1POTA 2QSXA 3TYHA 3CFZA 1B3LA 1Y1MA 1S50A 2IEEA 3R26A 2QS4A 2BJJX 2PT2A 4IO6A 1YPNA 3TDJA 1PB9A 1R1NA 2F6GA 5I56A 1FQBA 4QHQA 4ZE9A 3FXQA 2Q88A 1MY2A 1D9VA 3WAFA 4RYAA 3IL1B 4F1YA 1MXUA 4P0GA 3K1MA 3H6UA 3RT8A 3K4UA 3S2VA 1SDXA 1A7LA 2DOJA 1VFDA 2ESNA 3PPNA 2F7CA 3OO6A 3KJ7A 1LBCA 2Z8FA 4RK2A 4KHZE 2P1SA 1XVYA 1N04A 2X7QA 3B7DA 4OTEA 1Q1KA 3VV5A 3DP4A 5DTBA 1QUIA 2QL3A 3LSLA 3M3LA 4YKJA 3O29A 5ITPA 4G2ZA 3H6WA 4WEDA 3S9LC 1D3KA 4JWXA 2W7YA 3PUYE 3FATA 4POXA 4F29A 1R9QA 3OENA 5AE4A 5I2KB 2Z23A 4GVOA 3K6WA 3MPKA 3JZJA 1B5IA 3D4GA 3IORA 2XXVA 1IQ7A 3FASA 2NWJA 5I59A 4G4PA 3TCHA 4H5FA 4PFWA 3TEPA 3GBBA 4NF4B 3TUSA 1URSA 3O66A 5ICQA 3T9XB 1EZ9A 3KBRA 1O63A 3O28A 3G3JA 2IA4A 2OBGA 4I8CA 4RNSA 4MH5A 4ESXA 1QUKA 3C31A 3PD9A 2I4CA 3I5OA 3IB1A 5K2XA 3N94A 3Q25A 3D4CA 5AA4A 4TLMB 2VD2A 2HXWA 1NL5A 5L8DA 3RY3A 2Z8EA 4XKRA 4OVJA 5FHMA 1B05A 4R9FA 3Q29A 4OETA 4OEVA 4JDFA 2F7AA 3CRBA 3W9VA 4G8MA 3TZAA 4EUOA 4FE8A 3OELA 1PBQA 3CG1A 1HSLA 3G3IA 4DXCA 3CR9A 1PDAA 3HHFA 4RPNA 3G3HA 1MXYA 1QKBA 2ZYMA 1B0HA 1QKAA 4KI0E 2YLNA 2VP1A 3ODBA 1UTHB 2R6GE 3TCFA 2Q8JA 1I6BA 1SW1A 4JSDA 5I57B 4F3GA 3QK6A 3O6IA 1NMUA 4G8HA 1B3FA 3LSWA 2DWJA 1I69A 4ESWA 1URGA 3FV2A 4F1VA 1D9YA 2ZNTA 3E3KA 4JSOA 2DVCA 4X1BA 1II5A 1B2HA 2AL4A 3N6UA 5I56B 2F8DA 2UXAA 1NH7A 1MY0A 3I6VA 2I4BA 1P1QA 3CIJA 1FQCA 4F3SA 1MY3A 2FYIA 3MZ1A 4OFJA 1B9JA 3A09A 1T0KA 2Q2AA 1FQEA 2Y7PA 4IY6A 3FVGA 2I6EA 1J1NA 1QULA 2F7BA 2ZXTA 3T66A 1LB8A 1MDQA 1NNPA 2Y84A 2HFBA 1OQHA 3IOWA 1JVXA 4NF8B 1QVSA 3HHGA 3TTNA 4ONYA 3PUVE 3HSTA 2I0CA 4QFKA 5ITOA 3TTLA 2ZNUA 4ZZAA 2H99A 4IO5A 5CMCA 2Q89A 3S9EA 1JETA 2OJTA 4QFLA 4THIA 2YJPA 4ZECA 3MQ9A 5L9MA 4O3BA 1FTMA 2OZZA 4NE4A 2G29A 4YICA 1JW5A 1I6QA 1PC3A 5HBCA 1TFAA 1SI0A 4DZ1A 1B7HA 1FQFA 5FTIA 3OMBA 4N6PA 2GH9A 4FIMA 3V8XB 1MRPA 4GL0A 1MS7A 1OMPA 4GOTA 4HW8A 2UVIA 2I0BA 2XXXA 4H8JA 1FQAA 1Y3QA 5AA2A 1DTGA 4JB7A 2O51A 3TELA 4R2BA 3SKPA 5CC2A 4GQOA 4R9GA 4ZEIA 4MLQA 4EQ9A 5JTYA 5I59B 1HSEA 2ONKE 3QYTA 4IB2A 3WAEA 2ALUA 3A3CA 1BTJA 3FVNA 1M5CA 1SI1A 4R75A 4F2QA 2V84A 2NVUB 3B6WA 2O6AA 1DTZA 1N84A 5ELVA 2RKMA 5AA4B 4OEUA 1MH4A 5HM4B 5BWJA 4YB6A 2M8CA 4LQ5A 2I58A 2X26A 3U1OA 1MXVA 5KDTA 5H8HA 3TQLA 2P2AA 1SBPA 3UP9A 1FW0A 3EHTA 1JEVA 1Q35A 3IOVA 5KZTA 1WDNA 3PPOA 4G77A 1LAGE 2OWSA 1UTBA 1EU8A 2VD3A 5J1DA 4BDMA 4QRZA 3RQTA 1Z7NE 4DXUA 1EH3A 3T9VA 2I3WA 5KCJA 2Y7KA 3IB0A 3K02A 2GRVA 4NF6B 1H43A 1LFGA 4ZDMA 4M4GA 5BUUA 5L9SA 3G3FA 3GXAA 1IITA 2XD2A 2QPQA 1I6AA 4H5GA 3EHSA 3ZS6A 3PGFA 3LUYA 3FVOA 2E0SA 1UIVA 3S9MC 3JYRA 2HAVA 4OFLA 2H5YA 1XT8A 4EQBA 1LAXA 1R9LA 3K6UA 4FJPA 1B3EA 1ZTYA 4MF3A 5F7VA 3U8QA 1Y1ZA 3KOTA 3V83A 3OOAA 2ONRA 1ANFA 1R6ZA 3FXUA 4U4SA 3TMGA 3VXCA 1B5HA 3AXFA 4K3FA 4ZEBA 4R73A 3UK4A 3THIA 3OXNA 3FJGA 1H76A 4PQJA 1JNFA 1BP5A 3IB2A 1M5EA 4HS7A 1IXCA 4EF1A 2V93A 4RPOA 4DCXA 3IAZA 1OVTA 3H6VA 3E4RA 4ND9A 4P11A 3RTFB 2PT1A 3DLNA 4YB7A 5ISUA 5TPAA 1XVXA 4ZEFA 1VE4A 1B3GA 4NF5A 3ILUB 4GXAA 5AA2B 5LOMA 2O7UA 3C9HA 4G68C 3ZKLA 1H3DA 2VGQA 5JTYB 1VSOA 3T9HB 4HCWA 3C34A 1ELJA 2XXHA 2QS3A 4F31B 3EF7A 2REJA 3OSRA 4U23A 3G3KA 3PPRA 3E13X 3FV1A 3M3KA 5F1QA 5L9OA 1LBBA 4LZ5A 1LCFA 4QF9A 4YMAA 3SEWA 4ELQA 4Q8RA 3BKIB 4GFRA 4XIGQ 3KZGA 2XXWA 3K2DA 5CMKA 4OYVA 3UA8A 5CMMA 4QSDA 5CBRA 4R6HA 4BDRA 5KDTB 1RYXA 4FECA 3OO8A 3CI8A 2RCBA 1Y4CA 3KSJA 2D21A 5B70A 3QXMA 4LZ8A 2PYYA 3VXBA 2DWHA 2HCAA 1B4ZA 3MW0A 4R72A 1MY4A 2ONSA 5KCJB 5H8NA 3BFUA 5I84A 4G8NA 3SEUA 5H8QA 4ZEDA 3BFTA 1JVYA 3UIFA 3MP8A 2DWAA 2O84X 3SEYA 3N5LA 4P0IA 1N7WA 3W9WA 4ELPA 4UACA 3W15C 3V5AA 3IR1A 3U72A 1Z7ME 4E0XA 1MXWA 3HPIA 1UQWA 4LZ7A 4EXKA 3IO6A 1LLSA 4RY1A 4YAHX 3N26A 5H8FB 4GRKA 3OSQA 1SD3A 3Q28A 2DVZA 1B1XA 4FATA 4BDLA 3UGWA 4X9TA 3G3GA 3FVKA 4GF8A 4C1TA 1M5FA 4R74A 1XOCA 2B3FA 3FJ7A 1IEJA 4IO7A 3FJMA 2NUVA 3PV0E 1SW4A 4TOZA 3ECRA 1H44A 2YPNA 2FA7A 4H6DA 4IGTA 2Q2CA 2V3UA 4OXVA 1NKXA 1P1UA 4YKKA 1RKMA 2XXQA 2PMSA 2XXRA 1FTKA 2OK2A 3K1NA 1GGGA 3RLFE 3LSXA 3K0VA 4FAJA 5TPAB 3K1PA 3N6TA 1CB6A 3L6GA 2GHAA 1QW0A 3FUZA 1BLFA 4OFOA 5EHSA 1B32A 1TWYA 4NF5B 1Y9UA 4NWDA 3IOUA 3H03A 5I2NA 2I3VA 4JWOA 3QUFA 4GWOA 3CSGA 4ZE8A 1FQDA 2WKYA 1QUJA 2A5SA 5AA1A 3TTKA 3H7MA 3ILTB 3DP6A 1DMBA 4F18A 3S4UA 1MG1A 4R6YA 1A40A 3SESA 3HN0A 1S9TA 2O1MA 4QSCA 4NEDA 1AMFA 2V25A 1WODA 2XX8A 1FTJA 4LUBA 4ECFA 3I3VA 2HAUA 5FHNA 3TTMA 2QRYA 2G93A 1P99A 4NWCA 4KQPA 1M5BA 2HQ0A 3MVWA 2Z22A 3RTWB 5I58A 1A8EA 5DVJA 1BIYA 3BBRA 4OQOA 1O7TA 4I62A 3RUMA 3C4MA 4F39A 2HZKA 4KCDA 1VFEA 1B1HA 2F78A 3A3UA 2UYFA 4KCCA 2AIXA 1P1OA 1URDA 1LGBC 1OLAA 4KR5A 1PB7A 3TFLA 3V89B 1NNTA 2LAOA 4GXSB 1ATGA 1OIBA 1ZMGA 1QJMA 2XX9A 4U1ZA 2GFEA 4KYEA 1LB9A 1OLCA 1O64A 1ZIUA 1UIUA 1MPCA 2VOZA 3KFMA 3KN7A 2QMXA 5CMBA 2D3IA 2NXOA 2Y7RA 5IAIA 1US5A 1B5JA 5DYHA 1LFIA 3FXRA 4GL8A 1LSTA 4OESA 2B3BA 4GD5A 2QS2A 2P0SA 4C0RA 1N76A 5CRYA 4XKQA 3HV1A 3RGYA 1USYH 4KYDA 1BKAA 4NTLA 4YU0A 3Q27A 4EDPA 2DS9A 3H06B 4LP2B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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