2O69A

Crystal structure of haemophilus influenzae n193l mutant fbpa
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALILNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The role of the synergistic phosphate anion in iron transport by the periplasmic iron-binding protein from Haemophilus influenzae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
molecule tags Metal binding protein
source organism Haemophilus influenzae
total genus 111
structure length 308
sequence length 308
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o69A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o69A02
1US5A 1MY2A 4DXBA 5IAIA 3KN7A 2O7IA 2UVJA 2HZKA 2H25A 1B40A 3VLWA 1KWHA 2DE3A 1I6QA 1JNFA 3JV9A 3S9MC 4P11A 4WEPA 1NKXA 3FXQA 5H8FA 2I58A 3IX1A 3TQLA 4X1DA 2IA4A 4MF3A 4OEVA 1QW0A 3E4RA 4IO6A 3OENA 1LB8A 1GR2A 2XXPA 2P1SA 2AYSA 3TTRA 1JVYA 1N7WA 3W9WA 4N6PA 2AL4A 1N3XA 5TP9B 4DDDA 2GH9A 1B9JA 3T66A 5I2KB 5TU0A 4ISUA 4ND9A 3C9HA 4H67A 4H5GA 2O7UA 1JEUA 1OVTA 3T9VA 3OELA 1Y4CA 4OWDA 3OOAA 2I49A 5EHMA 2DOJA 4DCXA 3ECRA 1D4NA 2Y7IA 2V3QA 5CMBA 1MS7A 4G68A 4RK2A 3FASA 3PPNA 1S50A 3K02A 3THIA 3UA8A 2DVCA 2B3BA 3G3IA 4YKKA 3D4CA 4HW8A 2O6AA 1YAEA 2Y7RA 4R75A 4KQPA 5HBCA 3U94A 3TCHA 1BTJA 2HCAA 2PT2A 5I57A 1FTJA 4DCYA 3EF7A 1NNFA 1OLCA 5DTBA 1B52A 1UTBB 4C1UA 2QS1A 3DLNA 5JTYA 4NWDA 2V25A 2XXIA 1ANFA 1I69A 5B70A 4YKIA 3CR9A 1N0TA 2ZYMA 4DZ1A 3H6WA 4EXKA 4E0WA 3H4ZA 5K2XA 3VLVA 4I62A 1DSNA 4O3CA 1SYIA 3VVFA 1JEVA 1SW4A 4JSDA 3LUYA 4POWA 3K00A 3UP9A 3RT6B 5BUUA 2XX8A 3PD9A 3SERA 3G7WA 1MQJA 2QS4A 4EQ7A 1JW4A 3OEKA 2XXVA 1EZOA 4QFPA 1D9VA 1IXCA 2I4CA 1D3KA 3RNNA 4WEDA 1NNTA 2QRYA 3S9NC 1EZ9A 5CBSA 1XC1A 4LQ2A 2F7BA 1J1NA 2E1SA 3MWBA 3SEUA 1SI0A 3OO9A 2UYFA 3MP6A 1PB9A 3H03A 1FQAA 3C36A 2X26A 3KOTA 5F1QA 4IY5A 2Y7WA 2NWJA 3R7XA 3IO4A 4Q5TA 1Y3QA 3H6TA 3L6GA 4QRZA 3S9EA 3MVZA 1ZU0A 1ZIUA 4EUOA 5I59A 2A5TA 3SETA 2Y84A 3DP4A 3G3FA 4RJZA 2B3FA 5HPQA 4FEBA 1QUIA 1B32A 3OMBA 3IR1A 3TYHA 1S7YA 3PUYE 1L5TA 3H06B 4F39A 4F1VA 3MPKA 3R6UA 4X48A 4GRKA 1LFHA 3QXMA 1Y9UA 2GHAA 1POTA 3MJNA 3G3HA 1S9TA 3MUQA 2REJA 3KN3A 4DLDA 3V8XB 1N84A 1PDAA 1H43A 4EF2A 4YU0A 4XXUA 1SD3A 4LZ8A 2QPQA 1B5IA 4GXAA 1LCFA 4FECA 3VXBA 4H6DA 2F6PA 4ELOA 3L6HA 3O6GA 2F78A 2ZYOA 4NTLA 2UXAA 1FTKA 3O28A 4BDOA 4G8HA 2QS3A 4TOZA 3TTLA 1B3EA 1UIUA 2I3VA 1AMFA 2VGQA 4G8NA 2VP1A 3EHSA 1A99A 5A5XB 4R6HA 4YAHX 3VV5A 3HO7A 2D5WA 2I6EA 1NH8A 1SW1A 2XXYA 3LSXA 2HXWA 4RYAA 4NF5B 3P7IA 4U21A 3WAEA 3K4UA 2PBWA 2UVIA 2FYIA 3H3GA 1BP5A 1M5BA 3TKDA 4NF6B 4MLQA 1XOCA 4JXIA 4FORA 4P0GA 2IEEA 1VE4A 1WVJA 1Y4TA 2ZNUA 2H5YA 3OO8A 3IJXB 3ODBA 2REGA 2XXHA 2A5SA 4XTCQ 4IO4A 1Y1MA 1PB8A 1MM6A 4HCYA 5KDTB 4NF4A 1MXWA 2Z22A 1HSJA 4NF4B 1OQHA 1YTVA 4DXCA 3I5OA 1LCTA 3FATA 4EDPA 2CMOA 1MY0A 1DTZA 3UORA 3N94A 1ZMGA 1FTMA 3C33A 2P2AA 3FV2A 5LOMA 1N7XA 4HS7A 5H8NB 4FE8A 1MY1A 2DYXA 1H45A 1FQFA 3EN3A 3DM0A 3HCQA 1QKAA 1DMBA 5AA2B 3G3GA 1P99A 3IB1A 2Z8DA 3MZ9A 4AQ4A 5FHNA 3VVEA 5I56A 4YMBA 1A8EA 3O2AA 3MP8A 3LSWA 3IJOB 1URSA 4PFUA 1B3GA 1LAGE 4YICA 2I3WA 3KSXA 1RYOA 5I58B 2DWJA 1MY4A 2AL5A 2OWTA 4O3AA 3LBSA 1M5CA 3K01A 4TLLB 1LBBA 1IXHA 3CSBA 3JYRA 3G3JA 3MZ1A 4ELQA 1Q35A 1B6HA 1CE2A 4JWYA 1GV8A 3MAMA 4U4XA 3QUJA 4GIZA 5DT6A 4NMYA 5ICQA 5L8DA 1USYE 3KFMA 3Q27A 3RPWA 1XT8A 4OEUA 4ZDMA 3FGSA 2XXRA 4R6KA 3Q28A 3K6VA 2VD2A 2O1MA 5FTIA 1B1XA 3TMGA 1RYXA 1B51A 4R74A 2YLNA 1UTHB 1SW5A 2UVGA 3N6TA 3W15C 3TPAA 4ZEBA 1Y3NA 3PPRA 4POXA 3K0VA 4KYDA 4G68C 1P1WA 4NEDA 4EXLA 3I6VA 3RGYA 2ONRA 1MXXA 3LR1A 4R9FA 3FVGA 3S4UA 1SBPA 5K2YA 4BDNA 5DVIA 4U1ZA 1VFEA 4OENA 5CBRA 2Y7PA 1PC3A 5ITOA 1Y3PA 1MPCA 4KFQA 4YMAA 5TP9A 4Q30B 3GBBA 4KHZE 3QAXA 4GXSB 3BBRA 2M8CA 4KD5A 4H0WA 2V93A 2X7QA 5I2KA 1B46A 1F9BA 4OXVA 4N07A 4X9TA 3RUMA 5H8HB 4QF9A 2PMSA 2QS2A 1NNPA 1MQIA 3CG3A 4KYSA 2Q89A 2O69A 1B4HA 1A7LA 2DSFA 1BLFA 5ELVA 4XKPA 1DPEA 2Q8JA 2O84X 4YKPA 2XD3A 1B0LA 4ZE8A 3KJ7A 1QULA 1TFDA 3MZBA 2Z8EA 1QVSA 3K1PA 3TAJA 1POY1 4JWXA 1FQCA 1D9YA 2NUVA 5CMMA 4BDRA 4XKQA 2QMXA 2DP8A 3TCFA 1N04A 1UTBA 4FEDA 4GFRA 4RY1A 3TTNA 1DPPA 3B6WA 1IZ1A 2Q2CA 5B7DA 4G2ZA 1SQYA 4IGRA 3FD3A 2DE4A 3HV1A 4OFOA 3UIFA 3BFTA 3PMWA 1Y20A 1O63A 2Y7KA 4HTGA 3M8UA 4KR5A 1M5EA 5M2VA 2DXRA 2OJTA 3FXRA 4F3GA 3PPOA 5AA2D 1B4ZA 2ZNSA 3CRBA 1MQGA 3U8QA 3GXAA 3FUZA 3QUFA 2NOOA 4LZ5A 4OZ9A 3MVYA 4GLIA 3MW0A 3QIMA 3M3KA 3ILUB 3KG2A 3W9VA 4ZEFA 4MLVA 2QL3A 2ZNTA 4ELRA 1IUDA 1B1HA 4KCCA 4IY6A 5TPAB 4ECFA 4KI0E 3A09A 3FJ7A 4QSDA 3CG1A 4GF8A 3V83A 4M4GA 3SEYA 3Q26A 4F18A 2H4IA 1GVCA 5I84A 4H65A 2HZLA 3TQWA 3N6UA 1B3FA 3O9PA 3Q25A 3OO6A 1B7ZA 4LQ5A 3FZVA 1P1NA 2F7CA 5EYFA 1JW1A 4ESXA 1IEJA 3A3CA 4LATA 1PBQA 5J1DA 1P1QA 4RPNA 2ZYKA 4DE8A 1LBCA 3PPQA 1MXYA 3KGCA 3VLUA 3M3LA 2O1LA 1NMUA 2ZMBA 2XD2A 5H8SA 4M1VA 3QK6A 3PMXA 3O29A 5L9SA 3C4MA 3EPEA 4F19A 1B3LA 2ZXTA 1DTGA 3FVOA 2F36A 1GGGA 4C0RA 4OYVA 3T22A 4PE5B 3KN8A 1RKMA 1IQ7A 4MH5A 1M5FA 2G29A 2D21A 2DXYA 3GLBA 1YPNA 4L17A 1BIYA 3E9XA 2F7AA 4KCDA 3R26A 3OSRA 5KCJB 1OLAA 4OHNA 3KEIA 4MFIA 4U1OA 4QFKA 4LVQA 1NNKA 3E3KA 2V84A 2H99A 5A5XA 3OO7A 2I48A 3H6UA 1EU8A 2WKYA 4Q0CA 1B7HA 1CB6A 3DELB 4H8JA 3E13X 4NF5A 1B5JA 3C34A 5CC2A 3U1OA 4XKNA 2RKMA 3PUVE 3TEPA 4R9GA 4NF6A 2H98A 5DEXB 3OD7A 4H8IA 3ZKLA 2ALUA 4RA1A 1ZKBA 4IGTA 2XXXA 1QUJA 1UQWA 4GQOA 1FTLA 5JK4A 1LSTA 2Z8FA 4QFLA 2DWAA 4F2OA 1A54A 3GZGA 5KDTA 2B65A 1N76A 1A55A 1B58A 2RINA 2AIXA 1M5DA 3B6TA 1O64A 4GL8A 3T96B 2ABHA 1JVXA 3C35A 4LONB 4ZEKA 4F2QA 1SYHA 4QSEA 3RN8A 1LB9A 4RNSA 3LC8A 3EQ1A 3VVDA 4F22A 5AA4B 4EQBA 1EH3A 3BKIB 5H8NA 4H1XA 4R2FA 2RC9A 4GD5A 1WODA 3KBRA 3VXCA 2F34A 2X7PA 2P0SA 3PUZE 3TODA 3T9XB 3QSLA 2DQVA 4GWOA 5H8QB 5AA2A 3SEXA 4AB5A 1ELJA 4PFYA 4G77A 1B7UA 2CZLA 3KSJA 4NF8B 3K1MA 1AOVA 3UK4A 2LAOA 5I58A 4THIA 1IXIA 1MQHA 3TTMA 3C32A 3UN6A 2DE2A 1SVXB 2OCUA 5I2NB 2VD3A 5IKBA 5L9OA 2XHDA 3TTKA 3OXNA 1OQGA 1MPBA 1MRPA 2FNCA 3H7MA 4C1TA 1VR5A 3T93B 3V5AA 3FV1A 3AXFA 1MPDA 3O6HA 3MBPA 1R9QA 1IIWA 2R6GE 4LZ7A 3F11A 4U2RA 1UTHA 3HSTA 1TXFA 3FIRA 3EHTA 4OETA 4JWOA 4RXLA 4R2BA 4ZZAA 4ZECA 2RC7A 4UA8A 4I1DA 2Q9TA 1MH4A 4YZZA 4GL0A 3SEWA 3S2VA 4OVJA 4OESA 4QHQA 4U4SA 5EHSA 1LAHE 4YB6A 2GRVA 1TWYA 3VFJA 2GFEA 3MC2A 1TFAA 4F1YA 2E0SA 3CVGA 2FA7A 3IB0A 5H8FB 4MBPA 1QKBA 3RQTA 5ITPA 2I0CA 1XS5A 4EF1A 5FHOA 2R9JA 3LSLA 5CMCA 4JDFA 2HFBA 2UYEA 3U72A 5H8HA 4OMBA 1A8FA 2NVUB 2DVZA 2QMWA 1FCKA 3M3FA 1NFTA 1MDQA 1VFDA 4F3PA 3C31A 2I4BA 1TT1A 4JBZA 1ZJLA 2HAUA 5JEIA 4BDLA 2ESNA 2XXWA 3USDA 2BJJX 1XVYA 1B05A 4QFNA 4IO7A 5L9MA 2R71A 1OVBA 1R1NA 1LAXA 3PPPA 1FTOA 1MDP1 4R6YA 3S9LC 1FQEA 2F97A 4G68B 2Z23A 4JSOA 3ZKKA 3PUWE 3PMVA 4F3SA 3GBAA 4IO3A 3JZJA 3IOUA 2ONSA 3IORA 4FATA 5AA1A 2PT1A 2Q2AA 1URGA 1Z7NE 4YB7A 2ANJA 4G4PA 3I3VA 1DOTA 3O66A 2HQ0A 5DVJA 3IO6A 4U22A 4BDQA 5I57B 4P0IA 4F31B 1Z7ME 3HHFA 1B2HA 4QFOA 4WKMA 2NXOA 3LSFB 1AH5A 3DP6A 4Z7EA 4F29A 1FW0A 4PETA 5JTYB 3PGFA 5DVFA 3HN0A 2HAVA 3CFLA 4R72A 4TLMB 1ZTYA 3FVNA 2RF1A 3CI8A 2Q88A 3HPIA 2UVHA 2OWSA 1II5A 1SI1A 3MQ9A 3D4GA 3N26A 4XIGQ 4GOTA 3MVWA 2V3TA 1PEBA 2THIA 4YKJA 4R73A 1ZLQA 1R6ZA 5KZTA 5BWJA 3SDFA 3FJGA 4OERA 1I6BA 3OSQA 4E0XA 3RTFB 2PX1A 3B7DA 1FQDA 2VHAA 1GTKA 5TPAA 4FAJA 2XXTA 4PP0A 4JB7A 4ESWA 1MXVA 3SKPA 2QSXA 1USYH 2RCBA 1I6AA 3IOVA 2OBGA 5CRYA 3K6UA 4NE4A 1NH7A 4LA9A 4KPTA 3CIJA 3TFLA 1MQDA 3BFUA 3KZGA 2RCAA 3FJMA 1LGBC 4LUBA 1JW5A 3VE1B 4GVOA 1H76A 1MXZA 1LFGA 4NWCA 1MY3A 3ONMA 4AB6A 1H3DA 3MPLA 1VSOA 3U92A 4BDMA 4BLAA 3RTWB 2D3IA 1NL5A 1JETA 5AE4A 5I59B 2A5TB 3G3KA 1P1OA 4EQ9A 3FXUA 4F1UA 1MG1A 3ILTB 2XXUA 1H44A 3K6XA 3O97A 1O7TA 5ISUA 3V89B 2VOZA 4ONYA 5KCJA 1URDA 4KYEA 3U93A 3RLFE 2XX9A 1SW2A 4IO2A 4OFJA 4O3BA 3A3UA 1T0KA 4U23A 3TCGA 4TQUQ 4ZS9A 4I9DA 1HSLA 1B3HA 4UACA 4X1BA 2YJPA 3HHGA 4WXJA 3N5LA 3CFXA 5FTHA 5F7VA 1LLSA 3IL1B 5DEXA 1PBPA 3IOTA 1ATGA 4ZE9A 1AIVA 2F8DA 3MVXA 4HCWA 5ICTA 3FVKA 3K2DA 1IXGA 4DIGA 2F35A 2GHBA 2O51A 4YB5A 1FQBA 4RPOA 4ZEIA 3RY3A 4G8MA 1LAFE 3KOSA 3UGWA 1LFIA 4ZZEA 3KJTA 3SESA 3K1NA 2DWIA 3DP8A 3EHUA 1IITA 1US4A 1PB7A 4Q8RA 1Q1KA 1OMPA 2QJEA 4DXUA 1MH3A 4PFTA 4IO5A 1SDXA 4K3FA 3MP1A 2G93A 1B5HA 5FHMA 4XKRA 3IK6B 2DWHA 5AA4A 3O6IA 5CI5A 5DYHA 1R9LA 4OFLA 4LP2B 3RT8A 1MM7A 4PQJA 2OZZA 2OLBA 3TDJA 3WAFA 5AA3A 3VDFA 2KLFA 5H8QA 1N3WA 4OQOA 2F5XA 2YPNA 3T9HB 2XX7A 4ZEDA 1XVXA 3TZAA 3QYTA 2V3UA 4NF8A 1A40A 1UIVA 2PVUA 3PU5A 2I0BA 4QSCA 2HEUA 2O68A 4FIMA 3TUSA 4N13A 3H6VA 4Z0IA 3PD8A 2ZYNA 1MXUA 1B0HA 2DS9A 2RC8A 5I2NA 5I56B 3B6QA 2H9BA 2PYYA 1HSEA 3SEVA 3CSGA 3IAZA 3PV0E 1YCJA 4ELPA 3ZS6A 1P1UA 5HM4B 1XHYA 4FJPA 3TELA 4F3BA 4IB2A 3IB2A 5CMKA 3T9UA 3OEMA 2OK2A 3K6WA 1Y1ZA 3Q29A 3IOWA 1QUKA 3PUXE 2XXQA 2F6GA 2W7YA 4RK9A 5CM6A 1AL3A 1EZPA 1ZBMA 4H5FA 1OIBA 3CFZA 1QJMA 3ZSFA 2ONKE 4OTEA 4I8CA 4PFWA 1JQFA 1BKAA 1WDNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I3YA 4PGNA 1US5A 1IMFA 3B50A 1MY2A 4DXBA 3MYUA 5IAIA 3KN7A 1FSAA 2O7IA 2UVJA 2HZKA 2H25A 1B40A 3VLWA 1KWHA 2DE3A 1I6QA 1JNFA 3JV9A 3ROJA 3S9MC 4P11A 4PAIA 4WEPA 1NKXA 3FXQA 5H8FA 2I58A 3IX1A 3TQLA 4X1DA 2IA4A 4MF3A 4GBWA 4OEVA 3FBPA 1QW0A 3E4RA 4IO6A 3OENA 1LB8A 1GR2A 2XXPA 2P1SA 2AYSA 3TTRA 1FPBA 1JVYA 1N7WA 3W9WA 4N6PA 1NUYA 2AL4A 1N3XA 5TP9B 4DDDA 4P1EA 2GH9A 1B9JA 3T66A 4XEQA 4NG7A 5I2KB 5TU0A 4ISUA 4ND9A 4P9KA 3C9HA 4H67A 4H5GA 2O7UA 1JEUA 1OVTA 3T9VA 3OELA 1FPKA 1Y4CA 4OWDA 3OOAA 2I49A 5EHMA 2DOJA 4DCXA 2VPOA 1D4NA 3ECRA 4PF6A 2Y7IA 2V3QA 5CMBA 1MS7A 4G68A 4RK2A 3FASA 3PPNA 1S50A 3K02A 3THIA 2DVCA 3UA8A 2B3BA 3G3IA 4YKKA 3D4CA 4FBPA 4HW8A 2O6AA 1YAEA 2Y7RA 4G61A 4R75A 4KQPA 5HBCA 3U94A 3TCHA 1BTJA 2HCAA 2PT2A 5I57A 4NQ8A 1FPEA 1FTJA 4DCYA 3EF7A 1NNFA 4GWWA 1OLCA 4MNIA 5DTBA 1B52A 1UTBB 4C1UA 2QS1A 3DLNA 2B4LA 5JTYA 1EYKA 4NWDA 2V25A 4P56A 2XXIA 4HE0A 1ANFA 1I69A 5B70A 4YKIA 4JVDA 3CR9A 1N0TA 1NV7A 2ZYMA 4DZ1A 2GQ1A 3H6WA 1LBWA 4EXKA 4E0WA 3H4ZA 5K2XA 2OX3A 3D1RA 3VLVA 1NV3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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