2OCUA

Structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with n-(4-hydroxyphenyl) acetamide at 2.38 a resolution
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with N-(4-hydroxyphenyl) acetamide at 2.38 A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 106
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ocuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ocuA02
2O69A 2PT2A 4NF6B 1A99A 4YAHX 3EN3A 1SI1A 2CMOA 3UIFA 1SQYA 5BUUA 3TODA 2OLBA 4N6PA 2ZYNA 3L6HA 2QJEA 4YMAA 3MZBA 1IQ7A 3CSBA 3FVKA 4XKRA 4R6YA 1MXWA 1BKAA 1S7YA 1DPEA 1CE2A 4G8MA 2QPQA 3C35A 4FAJA 3VVDA 4U2RA 4OFOA 1MY3A 1US5A 4RPNA 4ECFA 2Y7KA 2XXVA 5ICTA 1MXVA 1UIVA 5DEXA 4WEDA 1IUDA 4JWOA 5TP9B 3PD9A 2XXRA 4I9DA 1FQBA 4ZE9A 4R9GA 4QFNA 3FJGA 4G4PA 4ZS9A 4FEBA 1VR5A 4NF5B 4ZEDA 3BFUA 1SW1A 4I8CA 4OZ9A 1ZJLA 2F34A 4MLVA 1H43A 3W9VA 2Y7RA 2OWSA 2XXYA 3C31A 1IXIA 2F7BA 5JEIA 4QSEA 1A8FA 1PBPA 1QUIA 1B52A 4R6HA 5I56A 3G3JA 3ODBA 4LATA 4QRZA 3TZAA 4U23A 1S50A 4H5GA 1B4HA 1IIWA 1A55A 2O51A 1MXYA 2XXIA 1LCFA 2OWTA 4O3CA 4R74A 2R6GE 1WDNA 5HBCA 1D3KA 4KYDA 5DEXB 3CRBA 3LBSA 4DXUA 3U1OA 5H8FA 2V84A 5IAIA 1Y1ZA 3HV1A 3TKDA 3K6UA 4P0IA 1FTLA 3EHTA 4IO2A 3QAXA 1PB8A 1RYOA 2QS3A 2HEUA 5BWJA 3KZGA 3USDA 4U1OA 4LZ7A 1TXFA 5CMCA 2Y84A 2V93A 3SDFA 3DP6A 5ISUA 4MF3A 4XKPA 1MS7A 3TCGA 2V3UA 3MC2A 5F1QA 1NH8A 1FQCA 1MXUA 4G2ZA 4DZ1A 1D9VA 3C4MA 2XXUA 3N5LA 2IA4A 3TPAA 2O84X 3EF7A 3I5OA 3T22A 4YKPA 3TTRA 3E4RA 2F7AA 4C1UA 3R26A 3TTNA 2HAVA 1P1NA 1B2HA 1MM7A 5H8FB 5FTHA 2I3WA 4GVOA 4IO5A 1TT1A 2HZKA 2VP1A 5H8SA 1Y20A 3N94A 2NXOA 1LLSA 5AA2A 1ZTYA 4LQ5A 4JSOA 1Y4CA 1SW2A 2F35A 1B1HA 3FATA 3MWBA 2I0BA 1MQGA 2QRYA 3A09A 4F3PA 2OJTA 2V3QA 1MDQA 4NE4A 3K4UA 3LSLA 3TFLA 3FD3A 4EQ9A 1R6ZA 4DXCA 2P1SA 5I84A 3PUYE 4UA8A 3C33A 2QS4A 3K02A 3Q25A 3WAEA 1MXZA 3H06B 1OVBA 4OHNA 3VLWA 3T66A 1MY0A 4GF8A 3PPQA 3R6UA 1BIYA 4AB6A 4GOTA 2O1LA 1HSEA 3EHUA 4GRKA 2UXAA 4C1TA 1MQHA 3P7IA 2HAUA 3KJTA 3Q29A 3VLVA 2XD3A 1AIVA 3K01A 2XD2A 5ITPA 2R9JA 5AA2B 3S9LC 1VE4A 4LA9A 4Q0CA 1UIUA 4DCXA 3ZS6A 3ONMA 1B7UA 5DT6A 5FHNA 3TUSA 3LR1A 3DLNA 3OO8A 4QF9A 3LSFB 3IB2A 2M8CA 2ABHA 4BDNA 4KR5A 3OXNA 4OENA 3T93B 5DVFA 4F1YA 3K2DA 4IB2A 1QUKA 4NEDA 5H8NB 2ZNSA 2KLFA 3A3UA 1B3FA 1P1OA 3KOTA 2X7QA 2ZXTA 3PGFA 2DVZA 2F7CA 3S4UA 2AYSA 1Y9UA 4G68A 3GBBA 4UACA 2OBGA 3KSXA 2HFBA 4NMYA 4RXLA 1EH3A 2RC9A 1Y3PA 4I1DA 2UYEA 3GBAA 4YKKA 2Z8EA 2B3BA 1B3GA 1LAFE 3GZGA 1LFHA 3V83A 1QVSA 2AL4A 1ATGA 4TOZA 5J1DA 3CIJA 3O29A 2I3VA 2Z22A 3PMXA 3T9UA 3RN8A 1NMUA 4F2QA 5K2YA 3SEWA 3MPLA 3M3FA 2RKMA 4NTLA 2ZYOA 3IOWA 1TFDA 4JXIA 5EHMA 1P1UA 3THIA 3OSQA 4NF4A 3CFLA 4R75A 4IY5A 4ZZEA 2NVUB 1IEJA 1B46A 2I0CA 4NF8B 4GLIA 1HSLA 2R71A 3TTKA 1GR2A 1R9QA 3IL1B 5AA4A 3B6TA 1JETA 3OELA 1GVCA 1Q1KA 3OD7A 3VXBA 3QIMA 1B51A 1NL5A 4GIZA 1FTOA 1SYIA 4POXA 3O6GA 4RY1A 4EUOA 4NWDA 2RCAA 3G3FA 3H03A 4KPTA 1I6BA 2DVCA 1B7HA 3CFXA 3W15C 3RTWB 3FXQA 1RYXA 4F29A 3K0VA 1M5DA 3IB0A 4NF4B 2HXWA 1URSA 5KDTA 4X9TA 1UQWA 4Q30B 2RINA 1AMFA 2VD3A 3K6VA 5LOMA 3IR1A 3V8XB 5AA4B 2UYFA 1IXGA 3HN0A 2UVHA 3U8QA 1MPCA 1N76A 4EQBA 1USYH 5TU0A 3FJ7A 1N0TA 1P1WA 2O6AA 1OVTA 1EZ9A 1JEUA 1LCTA 4L17A 3MZ1A 4FEDA 1JVYA 4P11A 2I4CA 2RF1A 5L8DA 3DM0A 1SYHA 2GFEA 3G3GA 2BJJX 4F2OA 1OQGA 2F6GA 3LSXA 4QFKA 5H8QA 4DDDA 1ANFA 3B6WA 4BDQA 1B9JA 4QFPA 1Z7ME 2QMWA 2GH9A 1OQHA 4EXLA 1EU8A 4ELPA 2Q88A 1DOTA 2H9BA 1BTJA 5CI5A 5KDTB 1B5IA 2F6PA 4KD5A 2D21A 3TDJA 2Y7WA 3GLBA 3RUMA 4IO6A 4BDRA 1L5TA 2PMSA 3QUFA 3VFJA 1LFGA 2V3TA 1FTJA 1M5CA 5TPAA 1PC3A 1PEBA 1B7ZA 2GRVA 1A54A 5FTIA 3N6UA 1TWYA 1MDP1 3PUWE 1N3WA 3PD8A 4FATA 3PPOA 3FGSA 4ZDMA 5L9SA 4O3AA 3RT6B 1JEVA 4IGRA 4U21A 1GTKA 3VVEA 2UVJA 1ELJA 1QKAA 3H6VA 2DWAA 4OTEA 3PMWA 4ZE8A 1MH3A 1B4ZA 2RCBA 5CM6A 5A5XA 4THIA 3HHGA 1LFIA 3MQ9A 1I6AA 4GXSB 4PP0A 4POWA 2P0SA 4G8NA 4PFTA 5AA3A 1QJMA 2H4IA 3SERA 3O6IA 3C36A 4RA1A 3IOVA 5HPQA 5CMKA 5DVJA 1F9BA 2VGQA 4QSCA 4KQPA 2ONRA 5DYHA 2HCAA 3OO9A 4TLMB 5FHMA 4YKJA 4EXKA 3RGYA 3O2AA 2ZYKA 3FV2A 5TPAB 2DWHA 3S9EA 2V25A 2PYYA 3KOSA 1UTHA 2VOZA 1JW5A 1IITA 3HO7A 5I56B 4N07A 2VHAA 5CC2A 1MY2A 3PUZE 1NKXA 4OMBA 1XVYA 4LQ2A 4KYEA 3VVFA 4R73A 1PB9A 4X1BA 4Q8RA 3MJNA 4ELOA 3LUYA 3O9PA 3IX1A 5I2KA 3Q27A 1FQAA 3MBPA 4K3FA 4LZ5A 1EZOA 1B3EA 4JB7A 3PUVE 4MFIA 3EPEA 1A8EA 1OLCA 3VE1B 4FIMA 2THIA 1AH5A 1LB8A 1UTHB 1PBQA 5FHOA 3RY3A 1DTGA 3UP9A 4OFJA 5B7DA 4GL8A 3A3CA 3KN7A 1SD3A 3G3HA 1XVXA 3UA8A 4OXVA 2XXXA 4AQ4A 3G3KA 3S9NC 1JVXA 1ZIUA 2I48A 2I58A 4YB7A 1MQJA 5I57A 3F11A 5I2NA 2FNCA 4JSDA 1R1NA 3W9WA 4IGTA 2PBWA 3IOUA 5I2KB 2D3IA 3SESA 1PB7A 2RC7A 4PFYA 2QMXA 2I49A 1N7XA 5I59A 1SW5A 2NWJA 4ESXA 4RK9A 1FTKA 1B3HA 3MVXA 2DQVA 2WKYA 4BDOA 3EQ1A 1WVJA 4PFWA 4GD5A 4HCWA 4F1VA 3OSRA 2UVGA 3RPWA 2VD2A 1BLFA 3SETA 1AOVA 1BP5A 1H76A 4YICA 5JK4A 4GQOA 5KCJA 4WXJA 2F5XA 4R2FA 4G68C 3OENA 1B5JA 4H6DA 5I57B 3Q26A 5I2NB 2ONSA 2O68A 4QFOA 4KI0E 3MP6A 2ONKE 1GGGA 5CBRA 1IXHA 1DMBA 4YKIA 4H0WA 1WODA 4DXBA 3UORA 5I59B 4H8IA 4F22A 4H67A 3B7DA 2IEEA 3OO6A 4E0XA 5I58A 1LBBA 3MAMA 1B05A 1ZU0A 1QW0A 3V89B 1ZMGA 4OWDA 3I3VA 2F36A 1MH4A 4RNSA 3E3KA 1USYE 1YTVA 1LSTA 3MVZA 4G68B 5KCJB 3KFMA 3CSGA 2XHDA 4YMBA 1AL3A 1T0KA 1NNPA 3D4CA 2DOJA 5EHSA 2DS9A 3U93A 4X1DA 5L9OA 1SW4A 5CBSA 4O3BA 2ZNUA 1Y1MA 3TQLA 2A5SA 2NUVA 3FV1A 5DTBA 2Q9TA 1QUJA 1URGA 1JNFA 5F7VA 1VFDA 2AIXA 3KSJA 5AA2D 3N6TA 5DVIA 2D5WA 2DYXA 3K00A 1P99A 1MY4A 1M5EA 2H5YA 3H4ZA 1ZKBA 2NOOA 5I58B 4OQOA 1NNTA 3ECRA 3K6XA 1DSNA 1NNKA 5H8HA 4IO7A 4EDPA 2X26A 3MVYA 5TP9A 1VSOA 4ELQA 4YB6A 2OK2A 3GXAA 4ZEIA 1H44A 1LBCA 2REJA 2P2AA 4MBPA 4ZEKA 3U94A 2OCUA 3FVOA 4R2BA 3SEYA 4ELRA 4BLAA 1N04A 1VFEA 4NWCA 3SKPA 2DE3A 4FJPA 3HCQA 1TFAA 1UTBA 1MQIA 3PPNA 4ZEFA 3M3LA 4F3SA 4U4SA 2XXQA 4X48A 1YCJA 2HZLA 3C32A 4PFUA 3VXCA 3TTMA 4U1ZA 1MXXA 3BKIB 4XXUA 3FXUA 3T9VA 1NH7A 3M8UA 3IJOB 2XXPA 1LAGE 3M3KA 4LVQA 4DE8A 4C0RA 3FXRA 1B5HA 1O7TA 1SVXB 2GHAA 5H8HB 3FZVA 4ZECA 2XXWA 3MVWA 3S2VA 1LAHE 2DE2A 3CG1A 4XTCQ 3LSWA 3CI8A 3TCFA 4G77A 1FQDA 5CMBA 2YPNA 3AXFA 1JW4A 3T96B 4DLDA 1CB6A 3QUJA 4P0GA 1UTBB 3ILTB 2O7UA 3PPRA 3O28A 1KWHA 1I69A 4U22A 4Z7EA 1POY1 1MRPA 5H8QB 3RT8A 4F1UA 1DTZA 3U72A 4ZEBA 1B6HA 2HQ0A 2XXTA 4M1VA 3OEMA 1SBPA 3OOAA 1R9LA 5AA1A 3H6UA 4JWXA 2H99A 2G93A 4F3GA 4HCYA 4LUBA 3G7WA 3JZJA 4ESWA 3E13X 2DWIA 3RQTA 2FA7A 4RJZA 2ANJA 3CVGA 1FW0A 3DP4A 4JBZA 1N7WA 3TCHA 4R6KA 4H1XA 4KYSA 1FTMA 5ICQA 2H25A 3H3GA 1XOCA 1H45A 1RKMA 3V5AA 3K1PA 3K1MA 3VLUA 3KJ7A 1B32A 4FE8A 3VV5A 3UGWA 1B3LA 4YB5A 4RYAA 4E0WA 1O64A 3IB1A 3JV9A 1YPNA 2X7PA 1Y3QA 5A5XB 4BDMA 3KN8A 2DWJA 1IXCA 2PVUA 3SEXA 4BDLA 3QYTA 2YJPA 2Z8DA 1PDAA 4MH5A 4OEUA 4PETA 4IO4A 4M4GA 1GV8A 2Y7PA 3CR9A 1MG1A 4XKNA 5K2XA 3R7XA 1Y4TA 3N26A 1O63A 1B40A 4KCCA 3FJMA 1N3XA 3PU5A 4XIGQ 1Z7NE 1POTA 4N13A 3I6VA 2W7YA 4LZ8A 3IOTA 4OESA 1II5A 3RTFB 1XT8A 3O97A 4YU0A 2RC8A 3SEUA 1MM6A 2F97A 4Z0IA 4GWOA 2DE4A 3H7MA 5AE4A 3KGCA 2XXHA 4YZZA 1YAEA 1LGBC 4QSDA 1D9YA 4H5FA 4R72A 1MY1A 1S9TA 1Y3NA 5HM4B 3MW0A 2ALUA 1J1NA 1XS5A 3PV0E 2G29A 4OVJA 2F78A 1B0LA 5H8NA 3L6GA 2Q2CA 1SI0A 4TQUQ 3TEPA 2XX8A 3IAZA 1OMPA 2Z23A 2YLNA 3MP1A 2REGA 1DPPA 4ZZAA 4DCYA 3DP8A 2Q8JA 4I62A 5IKBA 2E0SA 3ZSFA 3KBRA 1NNFA 1MPBA 3KEIA 3FIRA 3BBRA 4HTGA 1LAXA 3IJXB 3IO4A 4KFQA 4MLQA 2QL3A 3B6QA 4RK2A 2O1MA 3WAFA 4ONYA 2B65A 4ND9A 3HPIA 3OMBA 4DIGA 3C34A 4F31B 1Q35A 2H98A 2PX1A 1US4A 1JQFA 1IZ1A 1FQFA 3K1NA 4IY6A 3BFTA 5JTYA 3ZKLA 3PUXE 2FYIA 3OO7A 2ZMBA 1XC1A 3IORA 4NF8A 1A7LA 1MQDA 1N84A 1HSJA 3TQWA 3CG3A 1MPDA 4HW8A 2DP8A 2GHBA 1OLAA 4RPOA 3MPKA 3KG2A 3O66A 4FECA 1LB9A 5ITOA 5ELVA 2PT1A 4ISUA 1M5BA 1H3DA 1FCKA 1QULA 3KN3A 3JYRA 4U4XA 3TYHA 4F18A 4GFRA 3SEVA 3H6WA 5B70A 1XHYA 3QSLA 3U92A 2DSFA 2Q89A 1EZPA 3K6WA 4EF2A 1NFTA 2ESNA 2AL5A 1B58A 3DELB 4OETA 3VDFA 4H65A 2I4BA 1D4NA 3LC8A 4KCDA 2E1SA 2A5TA 3MUQA 2B3FA 4R9FA 4WKMA 3CFZA 5KZTA 3E9XA 2Q2AA 2UVIA 5M2VA 2LAOA 3FVGA 1B0HA 3FVNA 4QHQA 1ZLQA 1I6QA 2QS2A 4OFLA 5JTYB 1M5FA 4KHZE 1ZBMA 4LP2B 4LONB 1B1XA 3QXMA 2Z8FA 2QSXA 2I6EA 3FASA 2F8DA 4TLLB 4Q5TA 4OYVA 4NF6A 5CMMA 3FUZA 2DXRA 5CRYA 4PE5B 3MP8A 4PQJA 2ZNTA 3ILUB 4XKQA 3PPPA 2OZZA 4JWYA 3ZKKA 4G8HA 1FQEA 3HSTA 2CZLA 3OEKA 3EHSA 4EF1A 2DXYA 4FORA 2XX7A 3QK6A 4EQ7A 1SDXA 3RLFE 4GL0A 4F39A 3RNNA 2O7IA 3T9HB 3PMVA 3TAJA 3T9XB 1P1QA 4F19A 3O6HA 4OEVA 2ZYMA 4IO3A 3H6TA 5EYFA 3HHFA 1A40A 2Y7IA 4HS7A 5L9MA 1JW1A 3TELA 3UN6A 3IK6B 2A5TB 3C9HA 4AB5A 4QFLA 3S9MC 4JDFA 3TMGA 3MZ9A 1QKBA 4F3BA 4H8JA 3IO6A 3Q28A 3D4GA 4NF5A 3G3IA 2XX9A 4OERA 3UK4A 1URDA 3TTLA 4WEPA 1OIBA 4GXAA 2QS1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O69A 2PT2A 4NF6B 4OVTA 1A99A 4YAHX 1D9QA 3EN3A 4N8GA 1SI1A 2CMOA 3UIFA 1SQYA 5BUUA 3TODA 4NAPA 1FPKA 2OLBA 4N6PA 2ZYNA 3L6HA 2QJEA 4YMAA 3MZBA 1IQ7A 3CSBA 3FVKA 4XKRA 4R6YA 1MXWA 1BKAA 1S7YA 1DPEA 1CE2A 4G8MA 2QPQA 3C35A 2VPOA 4FAJA 3VVDA 4U2RA 4OFOA 1MY3A 1US5A 4NX1A 3KC1A 4RPNA 4ECFA 2Y7KA 2XXVA 5ICTA 1MXVA 1UIVA 5DEXA 1KA1A 4WEDA 1IUDA 1FPFA 4JWOA 5TP9B 3PD9A 2XXRA 4I9DA 1FQBA 4ZE9A 1EYIA 4R9GA 4HE1A 4QFNA 3FJGA 4G4PA 1YXIA 4ZS9A 4FEBA 1IMCA 4P47A 1VR5A 4MHFA 4NF5B 4ZEDA 3BFUA 1SW1A 4I8CA 1NUYA 4OZ9A 1ZJLA 2F34A 4MLVA 4H45A 1H43A 3W9VA 2Y7RA 2OWSA 2XXYA 4PFIA 3C31A 1IXIA 2F7BA 5JEIA 4QSEA 1A8FA 1PBPA 1QUIA 1B52A 1FPGA 4R6HA 5I56A 3G3JA 3ODBA 4LATA 4QRZA 3TZAA 4O94A 4U23A 1S50A 4H5GA 1B4HA 1IIWA 3E79A 1A55A 2GQ1A 2O51A 1MXYA 1FPDA 2XXIA 2F3DA 4P1EA 1LCFA 2OWTA 4O3CA 2V4CA 4JVIA 4R74A 2R6GE 1WDNA 5HBCA 1D3KA 4KYDA 5DEXB 3CRBA 3LBSA 2XWKA 4DXUA 3U1OA 5H8FA 2V84A 5IAIA 1Y1ZA 3HV1A 3TKDA 3K6UA 4P0IA 1FTLA 4PAKA 3EHTA 4IO2A 5ESYA 3QAXA 1PB8A 1RYOA 2QS3A 2HEUA 5BWJA 3KZGA 3USDA 4U1OA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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