2ONSA

Crystal structure of a. fulgidus periplasmic binding protein moda with bound tungstate
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
GHMNVKLKVFHAGSLTEPMKAFKRAFEEKHPNVEVQTEAAGSAATIRKVTELGRKADVIATADYTLIQKMMYPEFANWTIMFAKNQIVLAYRNDSRYADEINSQNWYEILKRPDVRFGFSNPNDDPCGYRSLMAIQLAELYYNDPTIFDELVAKNSNLRFSEDNGSYVLRMPSSERIEINKSKIMIRSMEMELIHLVESGELDYFFIYKSVAKQHGFNFVELPVEIDLSSPDYAELYSKVKVVLANGKEVTGKPIVYGITIPKNAENRELAVEFVKLVISEEGQEILRELGQEPLVPPRADTAVPSLKAMVEVS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of an ABC transporter in complex with its binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords UPF0100 protein AF_0094
molecule tags Ligand binding protein
source organism Archaeoglobus fulgidus dsm 4304
total genus 110
structure length 314
sequence length 314
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2onsA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2onsA02
5CI5A 2ZNUA 3H6UA 4JWXA 4OERA 5L9MA 3DELB 4QSDA 4G2ZA 2HQ0A 3K1MA 2GH9A 4H67A 1OQHA 4U1ZA 1FQFA 1QULA 4NEDA 3JYRA 2A5TB 4GL0A 4MH5A 3HHGA 4ZZAA 3RNNA 5I56B 4EXKA 3G3FA 3EHTA 2HAVA 5J1DA 2O6AA 1L5TA 1MY4A 1PEBA 3FXUA 3C35A 5AA3A 4F1VA 3P7IA 3PD9A 3IR1A 5AA2B 3PUYE 5CM6A 5H8NA 3UN6A 1HSLA 1PDAA 2R9JA 3U93A 3IJOB 4NF4B 4QRZA 3CG3A 3SEWA 2Y7KA 1MY0A 3SDFA 2Z23A 3CFLA 3TODA 3VVFA 5DTBA 1UTHA 3FUZA 4KI0E 2I48A 4X9TA 4IO3A 3O6HA 1POY1 4KQPA 1H45A 1KWHA 4EF2A 2I58A 1RKMA 4PQJA 5HPQA 1M5CA 3OO9A 1B3EA 2DP8A 2F34A 1SW1A 5AA1A 5I59B 1B3GA 3SETA 2I4BA 3K01A 1MM6A 4GLIA 2ZNTA 4OEUA 4R6KA 3SEVA 4Q30B 2I49A 2Z22A 5B7DA 5TU0A 3CSGA 5I2NB 4FAJA 1B5JA 1LFGA 2GHBA 4LONB 3IAZA 1B1HA 1ZLQA 1ZIUA 2O69A 2D21A 2XXQA 2R6GE 4DXCA 4F19A 3TUSA 4XKNA 1N3WA 3CG1A 3WAFA 5FHNA 3QK6A 3T9UA 2B3FA 4O3BA 3O2AA 1LFHA 1USYE 3FGSA 5JTYB 3N5LA 1MQJA 2O84X 3TYHA 5ISUA 1MPCA 3Q26A 2XXVA 1GGGA 4RK2A 5H8SA 2ANJA 3S9LC 3JV9A 2NXOA 2AIXA 1OQGA 4NTLA 4XIGQ 4IGTA 5CMKA 1ELJA 3OO7A 5JK4A 2RF1A 1LAGE 5DT6A 3MVXA 4JXIA 3U1OA 2OJTA 3KG2A 4PFUA 2LAOA 4I8CA 1AL3A 3K00A 1NFTA 3KFMA 5L8DA 3QIMA 2PMSA 3DP8A 1QUIA 2IA4A 2ABHA 2XXWA 1ZU0A 4JBZA 4LQ5A 1LBBA 4TOZA 4F3GA 2HAUA 1P1NA 2XXRA 1FTKA 2PX1A 3EHUA 4HTGA 4OYVA 3V83A 1S9TA 4Q8RA 5IAIA 5CMCA 1B1XA 3R26A 4FJPA 3M8UA 1MRPA 3V5AA 5TPAA 3KOTA 5ELVA 1IEJA 3CSBA 1T0KA 3PMVA 4GQOA 2G29A 5DVFA 2HZKA 3V89B 1QJMA 4H5GA 3TMGA 1P1OA 3B6QA 2ONSA 1VFEA 3LUYA 1IZ1A 1OIBA 4BDOA 1BIYA 2RC7A 4I1DA 3S2VA 1LAHE 2DVZA 3K1PA 4PE5B 3OXNA 3H6VA 3O97A 1VR5A 2FA7A 2QS1A 5H8NB 1AH5A 2XXTA 1Q35A 5B70A 3UK4A 1LBCA 3FVOA 1BP5A 4F3BA 1MQDA 3TTMA 3IOVA 1UTHB 3PMWA 4R6YA 3RPWA 3Q29A 2V3UA 5LOMA 3E9XA 1N3XA 4RPNA 4YMBA 1JW1A 1J1NA 2QRYA 3LSXA 2QS3A 2NWJA 3JZJA 1URGA 5ITPA 1A8FA 1OLAA 3MUQA 3KSJA 2P0SA 2V25A 2Q8JA 2QPQA 4M4GA 3H3GA 3HO7A 2AL5A 3U94A 4FE8A 1II5A 2G93A 3H03A 1SW4A 3HPIA 2DWIA 4RNSA 1A7LA 4F1YA 5BWJA 4U4SA 4HS7A 1POTA 3ILUB 1DPEA 4IY5A 3K02A 3K6WA 3E4RA 1B7ZA 4N6PA 1VFDA 2YLNA 3QUJA 1EH3A 1IXCA 3G3GA 1AIVA 4XKQA 1PC3A 2DE4A 3EF7A 3IOWA 2REJA 3RTFB 4ECFA 1XC1A 2DE3A 5I2KA 3O66A 4P0GA 2AL4A 4KD5A 4X48A 1O7TA 1OMPA 1MQIA 1NNTA 4GXSB 1LAXA 2F6GA 1H43A 5CBSA 4NF5A 4OXVA 1XHYA 2Z8FA 4RJZA 1PBQA 4R73A 2H25A 3VVDA 3W9VA 3B6TA 5I58A 4U22A 4DZ1A 5CRYA 3N94A 1Y3PA 3PUZE 3G3KA 2X7PA 4R74A 1B0HA 5K2YA 3M3LA 4M1VA 1B40A 1JW4A 1GTKA 1FW0A 1JETA 2HZLA 4LZ5A 1URSA 1Y20A 2O7UA 4DCYA 4QFPA 2VHAA 3KJTA 2PT1A 2XXUA 1UIVA 2YPNA 4EQ7A 1SBPA 1B4ZA 4GD5A 3OEMA 3QAXA 2DS9A 3C33A 5ICQA 3IX1A 3CIJA 3PPRA 4GFRA 4YKKA 3E3KA 5H8QA 2ZYOA 1MDQA 2Z8EA 1B5IA 3VVEA 2P1SA 3UGWA 1MDP1 1P1WA 2H4IA 3FV1A 2THIA 4ZS9A 1XVYA 2V3TA 4TQUQ 1IXIA 5TPAB 1RYXA 4EUOA 4U4XA 1TT1A 3TCGA 3Q27A 2Q2CA 3U72A 4F22A 3PGFA 4RYAA 2V3QA 2Z8DA 1GV8A 1B3HA 1UIUA 4MLVA 1A55A 3OENA 4EF1A 3VLWA 3A3UA 4UA8A 2RINA 4LZ8A 4RY1A 1CE2A 3EN3A 3MVYA 2QMXA 4EXLA 1B52A 1SYHA 3MVZA 4U2RA 1B0LA 3VLUA 3K6XA 4THIA 3IK6B 5KCJA 4KR5A 1R9LA 2I3WA 1NKXA 1MXUA 3MC2A 4YB5A 1UTBA 4ELPA 4YKIA 3I3VA 4KPTA 4GXAA 3DP6A 3TQLA 4ZE8A 4POWA 4YU0A 4LVQA 1ATGA 1SQYA 1SW5A 1MXZA 1QKBA 3O6GA 4QSEA 3TZAA 2DXYA 3C32A 1BKAA 1Q1KA 1ZBMA 1F9BA 4G8NA 1WVJA 4LUBA 3I5OA 3VDFA 1MY2A 2XX9A 4IO6A 1A99A 2REGA 2XXHA 1MY1A 4GL8A 2F7AA 1P1UA 2YJPA 3QYTA 4L17A 2VP1A 2HCAA 3VLVA 1N84A 1IQ7A 5FTIA 2NUVA 3IB0A 3OD7A 5H8FA 1DMBA 2B65A 5EHMA 1Y9UA 2V84A 2OCUA 1MXXA 4R75A 1O63A 5I2KB 4U1OA 4TLLB 5L9OA 1SI1A 3KGCA 3MBPA 1AMFA 4C1UA 4MFIA 1S50A 1O64A 3H7MA 3PPQA 4KYDA 1YAEA 4NF8A 4NF5B 4P0IA 2ALUA 5I57A 4ZE9A 5HM4B 5I58B 1P1QA 3TTLA 1SW2A 3USDA 2ZNSA 4I62A 3UP9A 1QUJA 2UVIA 1DTZA 2V93A 4LZ7A 4H0WA 2H99A 4OQOA 1H76A 2FYIA 1LB9A 1US5A 1VE4A 4F3PA 1R9QA 2PYYA 2BJJX 4GOTA 4GRKA 3MZ1A 2M8CA 1MG1A 2OLBA 2O68A 4ZECA 4Q0CA 2H9BA 4FEDA 2DXRA 3VFJA 2XD3A 1IITA 3FJMA 4NE4A 4PP0A 3A3CA 1TFDA 5H8QB 5A5XA 5BUUA 4G77A 4F31B 4N07A 5ITOA 4YICA 3O9PA 3K2DA 3RQTA 4OENA 4H8JA 1JVXA 1HSJA 3MPKA 3IO4A 3W9WA 1FTMA 3HHFA 4TLMB 2ESNA 3ECRA 4IB2A 3HSTA 1FQAA 4HCWA 4ESWA 1B4HA 2Y84A 5CMMA 4QHQA 2X26A 2XX7A 4MLQA 3H6WA 3MP8A 1QW0A 1XT8A 3Q25A 1VSOA 5KCJB 4PFTA 4QFLA 5EHSA 3SEYA 3EQ1A 1UTBB 4GVOA 3PUXE 3ODBA 1B51A 1LGBC 3IJXB 4O3CA 3FXRA 2RC8A 1MS7A 4ZEKA 3MQ9A 4OZ9A 4F2QA 2E0SA 1R6ZA 3RLFE 4F3SA 4OFJA 2UXAA 4G8MA 3RT8A 5FTHA 1EZ9A 1D9VA 1TXFA 4KCCA 3OO8A 1B9JA 1MPDA 4P11A 4OETA 3SEUA 1DSNA 4RXLA 2ZYNA 3BKIB 5H8FB 3B7DA 1IIWA 1IXHA 2DYXA 4KYEA 2B3BA 4IGRA 5AE4A 4Z7EA 2UVHA 1B3FA 3K6VA 4DXUA 4ZDMA 1DOTA 5EYFA 3PMXA 4FEBA 3O29A 2F5XA 4NF8B 4C1TA 5I57B 1S7YA 5I84A 5FHOA 1EZPA 2E1SA 3M3FA 4IO7A 4X1BA 3R6UA 3DM0A 3N26A 4KCDA 3IO6A 1URDA 1D9YA 2DE2A 3KOSA 1OVBA 2Y7WA 3C36A 2OZZA 4G4PA 3G3HA 3KJ7A 3VXCA 4BDNA 5AA4A 1SI0A 3GLBA 2F7CA 4BLAA 1NMUA 3LSFB 4NMYA 4ONYA 3LSWA 1OLCA 4JSOA 3T9VA 4K3FA 1FQDA 1LCTA 1Z7NE 1IUDA 4C0RA 2O1MA 4NF6A 3ZSFA 5F7VA 3C34A 4ZZEA 1IXGA 4JDFA 4I9DA 3T66A 1N0TA 3KSXA 4H6DA 3FATA 3VXBA 3W15C 5A5XB 4N13A 3C9HA 4BDMA 4ELRA 3HV1A 3RN8A 3CI8A 4JSDA 1LCFA 3K6UA 2DWJA 4DE8A 2Y7RA 3N6TA 4JB7A 3OSQA 2KLFA 3K1NA 1MXWA 2X7QA 3TTRA 4YKJA 1BTJA 2XXIA 2ZYMA 3UIFA 2XXYA 1QVSA 5F1QA 1UQWA 3TTKA 2D5WA 4H5FA 3MP6A 3QXMA 3MW0A 1NH7A 3THIA 5K2XA 2UVJA 4MBPA 4BDLA 4IY6A 3FJ7A 3UORA 4AB6A 1A40A 4WEPA 4XKPA 3PD8A 2P2AA 5ICTA 1MXVA 2I0BA 3PPPA 1A54A 4FIMA 4IO4A 1MXYA 4FECA 3L6GA 3SESA 3IB2A 3I6VA 3RT6B 2I4CA 2QMWA 1LB8A 4MF3A 5FHMA 5DEXA 1FQCA 3KN3A 1JEVA 1OVTA 3L6HA 4DCXA 3CFZA 1JQFA 1MM7A 3C31A 2GRVA 1JEUA 2XX8A 2I3VA 3CR9A 3PU5A 1YTVA 3KBRA 4DLDA 3MP1A 1PB7A 3H6TA 1ZKBA 2QS4A 3CVGA 1M5DA 2UYFA 1CB6A 4YZZA 1JNFA 3K0VA 2OWTA 3MJNA 3OO6A 4GWOA 4OMBA 3DLNA 2Y7IA 1FQEA 2QJEA 1ZMGA 3LR1A 2F97A 3MPLA 2RCAA 4NWDA 3ZS6A 5HBCA 3FIRA 1PB8A 5DVJA 1B7UA 1FTJA 1HSEA 1JVYA 1PBPA 2O51A 4F2OA 4GF8A 5CC2A 4WKMA 5AA4B 1AOVA 3S9EA 5L9SA 1Y3NA 4ZEFA 3TQWA 5JEIA 2H5YA 4LA9A 3U8QA 3PUWE 2NOOA 1B05A 4WXJA 1EU8A 4NF6B 2VOZA 1XS5A 1B58A 3SERA 2XHDA 4EDPA 4KYSA 2PVUA 4O3AA 2RKMA 3A09A 1Y1MA 3CRBA 3S9MC 3V8XB 4R72A 1XOCA 4OWDA 5KDTA 1B7HA 3KN7A 1SVXB 3CFXA 1JW5A 5AA2D 4F1UA 4EQBA 4X1DA 3RY3A 1FCKA 1NH8A 3FXQA 1M5EA 4ZEDA 3G3IA 3G3JA 3SEXA 3GXAA 1MH4A 1MY3A 3RGYA 3IL1B 2A5SA 1H44A 4IO5A 2Q88A 3VV5A 1ANFA 2CZLA 2I6EA 1NNPA 3T9HB 4QSCA 1NNFA 3T96B 3TDJA 1YPNA 3KZGA 2RC9A 2XD2A 2DWHA 3FVNA 3MWBA 2H98A 4NWCA 1R1NA 3KN8A 2DVCA 1TFAA 4UACA 4G68A 3G7WA 2ZYKA 1US4A 3TKDA 4EQ9A 5CMBA 2VD3A 4H8IA 3HCQA 3DP4A 5H8HA 4YKPA 2Q89A 2QSXA 4LATA 1P99A 5IKBA 2HEUA 1TWYA 3R7XA 3M3KA 1LSTA 2PT2A 1WDNA 3O28A 3HN0A 4PETA 1N7WA 4OFOA 3D4CA 2CMOA 4KFQA 3FVGA 1FQBA 2HXWA 1LLSA 5DEXB 2Q2AA 4F39A 3K4UA 4U21A 1D4NA 1LFIA 1I6QA 3IOUA 3T93B 3QSLA 2XXXA 4ZEIA 4OESA 4R6HA 4JWOA 4F29A 4BDQA 1MQGA 1LAFE 2D3IA 1Y3QA 1NL5A 4G8HA 1RYOA 4OVJA 3IORA 1GVCA 1B5HA 5TP9A 2OWSA 3BBRA 2DSFA 1PB9A 4F18A 3B6WA 3OEKA 4LQ2A 4DIGA 4XXUA 5KZTA 4ELOA 1SYIA 4QFKA 1Y4CA 3TEPA 2OK2A 4Z0IA 2PBWA 3BFTA 1MPBA 2ZXTA 1ZTYA 4R2FA 3GZGA 3MZ9A 1YCJA 2W7YA 4AB5A 1SDXA 1Y1ZA 4JWYA 2QL3A 3E13X 4G68C 3TCHA 3OOAA 1DTGA 5DYHA 2A5TA 2WKYA 3MVWA 3FJGA 5I56A 3S4UA 2AYSA 4E0WA 1N7XA 3EPEA 1H3DA 1B6HA 2UVGA 4R9GA 2F8DA 4XKRA 1N04A 3SKPA 4IO2A 3RTWB 3C4MA 4OFLA 5KDTB 2QS2A 2VD2A 4FORA 4DXBA 5AA2A 4ELQA 1MQHA 3OELA 4YAHX 3FD3A 4U23A 4RA1A 3GBBA 3BFUA 4NF4A 3FVKA 1I69A 2F7BA 3ZKLA 1B3LA 3U92A 1NNKA 1DPPA 4H1XA 4POXA 3RUMA 4LP2B 2O1LA 4GIZA 3ONMA 3VE1B 3PV0E 3T22A 4HW8A 3Q28A 1MH3A 3ILTB 5M2VA 1QUKA 2ONKE 1M5BA 2GHAA 3AXFA 4G68B 5I59A 1BLFA 2RCBA 1Y4TA 5H8HB 3PPOA 3TPAA 3H4ZA 1FTLA 4OTEA 1D3KA 4PFYA 2NVUB 2DQVA 1FTOA 2F36A 4QF9A 5I2NA 2ONRA 3LSLA 4YB6A 3N6UA 4QFNA 3S9NC 4WEDA 5DVIA 2F35A 3IOTA 1A8EA 4YMAA 4ZEBA 2IEEA 4Q5TA 2ZMBA 1QKAA 2GFEA 3FASA 3FZVA 4RPOA 1I6AA 1B32A 4AQ4A 2HFBA 4OEVA 3OSRA 3LBSA 1B2HA 1ZJLA 2F6PA 3WAEA 3UA8A 5JTYA 4BDRA 2Q9TA 2FNCA 2Y7PA 4ESXA 2VGQA 2XXPA 3GBAA 3LC8A 4FATA 4DDDA 4OHNA 3QUFA 4RK9A 4R2BA 1XVXA 1USYH 2OBGA 4E0XA 4R9FA 4HCYA 2UYEA 1GR2A 1M5FA 5TP9B 2DWAA 1Z7ME 3H06B 4ISUA 3T9XB 3FV2A 4H65A 4XTCQ 4KHZE 3PUVE 3O6IA 3F11A 1EZOA 2F78A 1WODA 2I0CA 4QFOA 3TAJA 3TELA 3TTNA 3IB1A 3PPNA 2R71A 2O7IA 3D4GA 4ND9A 1B46A 3TFLA 4PFWA 5CBRA 2DOJA 3MAMA 3TCFA 1N76A 3KEIA 4YB7A 3OMBA 3EHSA 1I6BA 1SD3A 3ZKKA 3MZBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CI5A 2ZNUA 3H6UA 4JWXA 4OERA 5L9MA 3DELB 4QSDA 4G2ZA 2HQ0A 3K1MA 4N6KA 4I3EA 2GH9A 4H67A 3E78A 4X8RA 1OQHA 4U1ZA 1FQFA 1QULA 4NEDA 3JYRA 2A5TB 4GL0A 4MH5A 3HHGA 4ZZAA 3RNNA 5I56B 1NUZA 4EXKA 3G3FA 3EHTA 2HAVA 5J1DA 2O6AA 1L5TA 1MY4A 1PEBA 3FXUA 2VT5A 3C35A 5AA3A 4F1VA 4GBVA 3P7IA 3PD9A 4MAGA 3IR1A 5AA2B 3PUYE 5CM6A 3B50A 5H8NA 3UN6A 1HSLA 1PDAA 2Y5KA 1KA1A 2R9JA 3U93A 4PGPA 3IJOB 4NF4B 4QRZA 3CG3A 3SEWA 5ET7A 2Y7KA 1MY0A 3SDFA 2Z23A 3CFLA 3TODA 3VVFA 5DTBA 1UTHA 3FUZA 4KI0E 2I48A 4PDDA 4X9TA 4IO3A 3O6HA 1POY1 4KQPA 1H45A 1KWHA 4EF2A 2FBPA 2I58A 1RKMA 4PQJA 1YYZA 5HPQA 2KQZA 1M5CA 3OO9A 1B3EA 2DP8A 2F34A 1SW1A 5AA1A 5I59B 1B3GA 2B4LA 3SETA 2I4BA 3K01A 1MM6A 4GLIA 2ZNTA 4OEUA 4R6KA 3SEVA 4Q30B 2I49A 4NHBA 2Z22A 5B7DA 5TU0A 3CSGA 1DBZA 5I2NB 4FAJA 1B5JA 1LFGA 4QBAA 4P1LA 3KC1A 2GHBA 4LONB 3HFUA 3IAZA 1B1HA 4FBPA 1ZLQA 1ZIUA 2O69A 1NV3A 2D21A 2XXQA 2R6GE 1IMAA 4DXCA 4F19A 4P3LA 3TUSA 4GWWA 4XKNA 4N8YA 1N3WA 3CG1A 3WAFA 5FHNA 3QK6A 3T9UA 2B3FA 1SPIA 4O3BA 3O2AA 1LFHA 1USYE 3FGSA 5JTYB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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