2P2AA

X-ray structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with 2-bn-tet-ampa at 2.26a resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
259
structure length
258
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A tetrazolyl-substituted subtype-selective AMPA receptor agonist.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 258
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2p2aA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2p2aA02
4F3SA 3T93B 1WODA 4UACA 3VLWA 1Q1KA 1P1WA 3VLVA 5ELVA 4NF4B 3C9HA 3PPRA 4IO4A 1IUDA 5ICQA 1R6ZA 4LQ5A 4F3GA 5DVIA 5CBSA 1PB9A 5CM6A 3H7MA 3N26A 5I2NB 4E0WA 3ZKLA 1LFGA 3EF7A 3SDFA 1BP5A 1FCKA 2RCAA 1H3DA 3TODA 3R7XA 4ELRA 1Y3QA 2H4IA 3W15C 3SEVA 4GLIA 3RNNA 3B6WA 3U1OA 1XOCA 2F5XA 2DXRA 3VDFA 4C1UA 1JW4A 2OLBA 2CMOA 1HSJA 4PFWA 4OFOA 1T0KA 1LFHA 2BJJX 3UGWA 1WVJA 3I5OA 4ESXA 4ELPA 3RT6B 1MQIA 3U93A 2V3UA 1NL5A 2Q2AA 4NF8A 5H8HA 3B6TA 2P2AA 3GLBA 5AA3A 1NH8A 3EPEA 3L6HA 1BKAA 3TMGA 3N5LA 1N0TA 2F35A 4ZECA 1IXIA 3MAMA 3T9XB 2OWSA 4LZ5A 4C1TA 4YKIA 1SVXB 5I56A 2F97A 3IX1A 1SYIA 4Z7EA 4QFLA 2ZNUA 3MVZA 3FD3A 1QUJA 4F31B 4H5FA 2YPNA 1RYXA 2YJPA 4EF1A 3ZKKA 3ONMA 2HEUA 4ZZEA 1MQJA 1TFDA 5B70A 4OYVA 1MDQA 4DCXA 5I58A 1MQHA 2QS2A 3IJXB 5H8FA 4NEDA 4PQJA 2XXXA 5JK4A 4QFOA 3H3GA 4NF4A 4F39A 4XTCQ 2F34A 4XKPA 5LOMA 2ANJA 4OVJA 1IQ7A 4EQ7A 2REGA 2H5YA 3FXUA 3ILUB 1UIUA 3OO9A 1URGA 4YKJA 3CSGA 4BDRA 1JNFA 3HHGA 4TOZA 1B6HA 3M3LA 3H4ZA 4ESWA 3M3KA 1B3EA 4GXSB 3IOWA 3C32A 4ZEDA 3ILTB 1A7LA 1MH4A 1SBPA 4YMAA 4R72A 5I57A 5L8DA 1SW4A 2I4CA 3SEWA 3IAZA 2RC8A 2XXQA 3PPPA 4R6KA 2GRVA 3KSJA 1B58A 3RQTA 2R71A 3D4GA 3V83A 4ELQA 4N13A 1JW5A 2PBWA 2UYEA 3B6QA 1ELJA 1POY1 4RY1A 2UXAA 4K3FA 2XX9A 1Y3PA 3K02A 1EZOA 3FJ7A 5CMMA 1ZKBA 5FTIA 1GGGA 3MWBA 2IEEA 3DLNA 1RKMA 3EN3A 1MG1A 5JTYB 1M5DA 4JXIA 4GXAA 3VXBA 1KWHA 2XXUA 3TCFA 1Y1MA 2XXTA 4OFLA 5H8SA 3I6VA 2GH9A 3DELB 1LCTA 1B5IA 1JEUA 1R9QA 3MP6A 4U23A 2XXPA 1MXZA 3OMBA 2DVCA 2ZYOA 1GV8A 3LSXA 4KQPA 1HSEA 2M8CA 1FQFA 1MY2A 2DOJA 1QULA 2O7IA 3MBPA 3OO8A 5DVJA 4G8HA 4GRKA 4XXUA 3TYHA 3CFLA 3RY3A 3GZGA 4DIGA 1B05A 3WAFA 3FXQA 4H8IA 2ZNSA 3EHTA 5EHSA 3OENA 1D4NA 3VVDA 2O1MA 5M2VA 2GFEA 4YMBA 4H8JA 1MXVA 4OEVA 4F2OA 5IAIA 1AH5A 1DTZA 3S9EA 1TFAA 4RK2A 1UTHA 1NKXA 3PPQA 4EDPA 3U92A 4F29A 1FTJA 3IOTA 5ICTA 3OOAA 2DQVA 3KZGA 3U94A 5J1DA 1N76A 1A99A 2NUVA 3H6VA 4EUOA 3IORA 4OTEA 4YKKA 2A5TB 4NF6A 4YICA 1B7HA 3RTWB 2ONKE 2VD3A 3UP9A 3C33A 3VVFA 1PBQA 2F6PA 2I4BA 2ONSA 3IB1A 3KEIA 5AA2D 5BWJA 4PFYA 4LZ7A 1LBBA 4G8MA 4IY5A 5DTBA 4QHQA 4EXKA 2V3TA 3PUZE 3UORA 1P1QA 1VFDA 1ZU0A 4X9TA 1S50A 3VVEA 3HCQA 2DE4A 1MXYA 4R75A 1F9BA 2B65A 1QUKA 4LQ2A 4OFJA 1Q35A 3CFZA 1QKBA 4H6DA 2UVGA 4Z0IA 5JTYA 2O51A 3Q26A 3LBSA 3K1MA 1N3XA 3O6HA 3K1PA 4XKRA 4G77A 2I48A 2ESNA 5L9OA 4XIGQ 1URSA 2DXYA 5I56B 3HHFA 1A8FA 5I2KA 2QJEA 3T9UA 4EF2A 1B7ZA 4NMYA 5FHOA 3ZS6A 5TPAA 4HCWA 3PPNA 2DYXA 2O7UA 4IGTA 4I9DA 2FYIA 1LSTA 1US5A 5HM4B 2Q88A 1XC1A 1P1UA 3C36A 1ZTYA 3QUFA 3H03A 2H25A 2XX7A 1B9JA 1SYHA 2D3IA 1I6QA 4NF5B 3P7IA 2O68A 1BLFA 4ISUA 4FJPA 3TTNA 2DSFA 3V5AA 1XT8A 4MLVA 3F11A 4ZEBA 1B3HA 2Z23A 2XHDA 3KFMA 3PD8A 2V93A 3SKPA 3RPWA 2ZYMA 3RN8A 1ZLQA 2E1SA 2O69A 1I6AA 3DP4A 4X48A 3MVXA 4NWCA 2PT2A 4P0GA 1M5BA 5I57B 1SW5A 1DPEA 1TXFA 1B52A 4GF8A 1WDNA 4ZEKA 3O97A 4FORA 2QPQA 3IOUA 2DVZA 2I3WA 2A5TA 3SERA 3MP8A 2D21A 1MPCA 2H98A 3FVKA 1B0LA 1P1OA 3VE1B 5I59B 2W7YA 4GWOA 1HSLA 4RA1A 5CI5A 5JEIA 3TCGA 2HQ0A 5AA2A 4PFTA 3QUJA 1PBPA 2WKYA 3MW0A 3QXMA 1OIBA 4IGRA 1URDA 3T9HB 4JWOA 1LAFE 4AB5A 4YAHX 1ZJLA 2IA4A 2RKMA 3A09A 3GXAA 4GFRA 1TWYA 4Q5TA 4P0IA 5DVFA 5B7DA 4LATA 4PFUA 2O6AA 1IIWA 3G7WA 4ZEFA 1USYH 4H0WA 3O2AA 5FHNA 4I8CA 3Q28A 1S7YA 3TEPA 3N94A 3GBBA 4OWDA 2P0SA 4WEPA 1NMUA 2V84A 3CI8A 3H6TA 1R9LA 4MF3A 2UVJA 1JEVA 1POTA 1NNFA 4U4SA 3ZSFA 4F1YA 3KN8A 1FTMA 1YPNA 2X7PA 4WXJA 3D4CA 4TLLB 3OELA 1A8EA 4E0XA 4PE5B 1Y3NA 4OMBA 3FIRA 3TTRA 1AIVA 1A40A 4QSDA 3V89B 4OERA 3V8XB 1LAXA 3PMVA 4H67A 3CVGA 3HSTA 1D9YA 1UTHB 5CMCA 4O3AA 4NF5A 4H5GA 1OMPA 2Y7WA 3Q25A 3O9PA 4BDOA 3FVGA 4BDLA 4F3PA 3LSFB 3MZ1A 1B1XA 1VE4A 1RYOA 4ZDMA 2UVHA 3T66A 2XXYA 4GOTA 1SW2A 4NF6B 5KDTB 1Z7ME 1VSOA 2ABHA 4ZZAA 3PUVE 3OSQA 4MLQA 2B3BA 5DYHA 2XXRA 3S9NC 4MH5A 3KSXA 1H76A 2HAVA 3CR9A 4Q0CA 2X26A 1IITA 1AOVA 5TP9B 1LAHE 3OXNA 3C35A 3IB2A 4U22A 3TPAA 3H06B 3LUYA 1IXGA 4R2BA 2ZYKA 5I59A 3MQ9A 3CRBA 3QSLA 4FEDA 3U8QA 4M4GA 2I6EA 5DT6A 2PT1A 1MY3A 4PETA 3PPOA 1VR5A 1LGBC 1QVSA 3C31A 3FGSA 4G8NA 5KCJB 1N84A 1AMFA 3IK6B 4ZE8A 1ZBMA 1Y20A 2QRYA 1MY0A 4YB6A 3U72A 2RINA 5DEXB 1FQDA 2XXWA 4RJZA 1D3KA 1B1HA 2VHAA 5I2KB 5K2YA 1UIVA 1Y4TA 3FXRA 4KYSA 1LLSA 3L6GA 3K4UA 5TPAB 3G3FA 4HTGA 1XS5A 1MM7A 2Z22A 1B3FA 3E9XA 1OQHA 5CRYA 4N6PA 3OD7A 3IOVA 1SW1A 3TUSA 3OEKA 1R1NA 1FQAA 3JYRA 3KN3A 4XKNA 4G2ZA 4P11A 1PC3A 4OXVA 3BFTA 4YU0A 3DM0A 3WAEA 3O6IA 2D5WA 2RC9A 3S4UA 4R73A 4IO5A 4I1DA 3TDJA 3FVNA 1D9VA 4QRZA 1DPPA 3VXCA 1B5HA 4LA9A 1M5FA 3TTLA 5EYFA 3R6UA 1J1NA 2DS9A 4O3BA 3FASA 4TLMB 2Y84A 1B3GA 1MS7A 2QS1A 4JWXA 2ONRA 2XXHA 3TCHA 2UYFA 1ZMGA 3DP8A 3RGYA 4U21A 4N07A 1AL3A 4ONYA 3LR1A 2RF1A 2Q2CA 2FA7A 3AXFA 3MVYA 4DXUA 3BFUA 1O7TA 2PMSA 3E13X 4G68B 2NOOA 3A3CA 5KDTA 4QFPA 2B3FA 2ZNTA 1N04A 3LSLA 3W9WA 1S9TA 1N7WA 5AE4A 5TP9A 1MH3A 4MBPA 3E3KA 5AA2B 3FV2A 2ZYNA 1PB8A 5HBCA 4EQ9A 2OBGA 3RTFB 3C4MA 2DWAA 3K6UA 2DWHA 4IO3A 2PVUA 5KZTA 1FQEA 1UTBA 4OHNA 2HZLA 1OVTA 2Z8DA 5KCJA 1QJMA 3UK4A 1CE2A 1ZIUA 1PEBA 1NNPA 2F78A 1MXUA 2V3QA 4PP0A 4IB2A 2F8DA 4NTLA 2OCUA 3K6WA 5DEXA 3KN7A 4OZ9A 2FNCA 3M3FA 2RCBA 3KOSA 3BKIB 4AQ4A 1B4HA 3K2DA 3QK6A 4GIZA 4RPNA 4LUBA 1OVBA 1GR2A 3B7DA 2NVUB 1CB6A 1QUIA 3HV1A 1ATGA 4HW8A 2O1LA 4R6HA 1UQWA 1JW1A 1OLCA 1MXXA 2HZKA 3IB0A 2XXVA 2NXOA 4KCCA 4ELOA 3TQLA 3A3UA 3RUMA 5F7VA 1LFIA 4IY6A 1USYE 5CMBA 4IO6A 4LZ8A 1M5EA 5HPQA 1NNKA 3IO4A 3PU5A 3E4RA 4OESA 2DE2A 2G93A 1LAGE 3T96B 3SEYA 1XVYA 3QIMA 1B3LA 5FTHA 3KJ7A 4U4XA 4IO2A 3JV9A 4JSOA 2H9BA 4BLAA 1B51A 3O6GA 1US4A 1I6BA 3UA8A 3K00A 1XHYA 1FTKA 1PB7A 4POWA 1B4ZA 5L9MA 4G68A 4YZZA 3TTKA 1YAEA 3TAJA 1M5CA 1FW0A 2QS3A 5FHMA 2UVIA 2ZMBA 1NNTA 3VFJA 3Q27A 1FQCA 1I69A 3C34A 3SESA 4DE8A 4F1UA 5ISUA 1O64A 4GVOA 4X1DA 3MZ9A 1SI0A 3CSBA 2DWIA 3N6UA 2F7CA 1Y4CA 4G68C 4IO7A 4U1ZA 4F1VA 2E0SA 3T22A 1NFTA 1IXCA 4AB6A 4KYEA 4FE8A 1YCJA 1LCFA 5ITOA 2G29A 3MVWA 2VD2A 3H6WA 2AYSA 3KOTA 3MUQA 2GHAA 2OZZA 4QFNA 5F1QA 3FV1A 1SI1A 1B46A 3ECRA 3Q29A 1MPDA 2HXWA 1N7XA 1EZ9A 2QS4A 4Q8RA 5H8NB 4HS7A 2HCAA 4DZ1A 5H8QA 4M1VA 3HN0A 5AA4A 3MP1A 4ZE9A 4G4PA 3O29A 2A5SA 5CBRA 4ND9A 4KPTA 4U1OA 1Z7NE 4R9FA 2Y7PA 2ALUA 1B40A 3G3KA 3TQWA 3S9MC 2PX1A 1JETA 1LBCA 2XXIA 3EHUA 4DLDA 3OEMA 3OO7A 3OSRA 2QSXA 2PYYA 3SEUA 4BDQA 1BIYA 4WEDA 4FAJA 4U2RA 4F22A 3GBAA 1ANFA 4QF9A 3MPKA 3PMWA 1JVYA 1BTJA 1O63A 1QKAA 3CFXA 1B32A 4UA8A 3K0VA 3T9VA 1MQDA 3KGCA 1Y9UA 1MPBA 1NH7A 3CG1A 3ODBA 2RC7A 1MXWA 3OO6A 3RT8A 3UN6A 3K6XA 1SDXA 2HAUA 5I2NA 1L5TA 4OQOA 1MY1A 1MRPA 3R26A 4RYAA 3G3IA 2OK2A 3S2VA 3FUZA 1N3WA 2X7QA 5EHMA 3FJMA 1P1NA 1TT1A 1EU8A 4EQBA 1XVXA 3TELA 5CMKA 2QMWA 4ZEIA 3G3HA 4FIMA 1DOTA 4LP2B 3TZAA 1UTBB 4H1XA 1DTGA 2AIXA 3USDA 3EQ1A 5IKBA 1B0HA 2Y7IA 3DP6A 4HCYA 1EH3A 4DDDA 5A5XB 2Y7RA 4BDNA 3EHSA 1QW0A 2AL5A 2O84X 3N6TA 3HPIA 4Q30B 3M8UA 2Q9TA 1B5JA 4QFKA 1MM6A 2YLNA 1LB9A 1H45A 3QYTA 4X1BA 4KFQA 4JDFA 2HFBA 4MFIA 2ZXTA 4OENA 4KR5A 3PMXA 3TKDA 1LB8A 3IO6A 4TQUQ 3HO7A 1VFEA 4KD5A 4FEBA 3H6UA 2THIA 4JB7A 4KHZE 2VOZA 3PD9A 5H8NA 1MQGA 4YKPA 2XD2A 3TFLA 5CC2A 3PUWE 3PUXE 2P1SA 2F7BA 3KBRA 4KCDA 1IXHA 2I58A 5ITPA 1DSNA 2I3VA 3RLFE 1OQGA 4F3BA 3PUYE 4FATA 3FATA 4DXCA 3IR1A 5I84A 4NE4A 4OETA 2R6GE 1GTKA 5AA1A 4KI0E 3JZJA 1A55A 1FTLA 4NWDA 3O66A 3K6VA 1B7UA 1H44A 2DWJA 3PV0E 1IEJA 1MDP1 2CZLA 4DXBA 4JSDA 5L9SA 2OJTA 3KJTA 2QL3A 4GL0A 4EXLA 4JBZA 4FECA 3UIFA 2LAOA 2OWTA 3KG2A 4THIA 4GQOA 4WKMA 2F7AA 2DP8A 4KYDA 4RNSA 4OEUA 1MY4A 3SETA 2NWJA 1H43A 4RK9A 4C0RA 4I62A 2Z8EA 3O28A 2XX8A 1OLAA 4QSEA 1P99A 1SQYA 4YB5A 1FQBA 2VP1A 4F18A 3PGFA 4RXLA 1Y1ZA 3I3VA 1IZ1A 4RPOA 3IJOB 3MC2A 4R2FA 2GHBA 5K2XA 1SD3A 1EZPA 4F19A 2Q8JA 4BDMA 3S9LC 2KLFA 3MPLA 2Q89A 4GD5A 3VLUA 5A5XA 4NF8B 4LONB 5H8HB 3FVOA 3G3JA 3MJNA 3TTMA 3QAXA 1JVXA 2AL4A 4H65A 4POXA 1B2HA 3W9VA 3BBRA 3CIJA 2I0CA 2I49A 3G3GA 2XD3A 2REJA 2F36A 1YTVA 5TU0A 4O3CA 1PDAA 1A54A 4ECFA 1FTOA 4DCYA 5H8QB 4XKQA 5AA4B 2F6GA 3VV5A 4R9GA 4L17A 1II5A 4R6YA 2Y7KA 3IL1B 3LSWA 2I0BA 4R74A 3THIA 3CG3A 3LC8A 1DMBA 2QMXA 4F2QA 4GL8A 1GVCA 1JQFA 3SEXA 3K1NA 5BUUA 4JWYA 4LVQA 3MZBA 2R9JA 2H99A 4YB7A 5I58B 4QSCA 2Z8FA 3K01A 2DE3A 5H8FB 4ZS9A 3FJGA 3FZVA 2VGQA 2V25A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F3SA 3T93B 1WODA 4UACA 3VLWA 1Q1KA 1P1WA 3VLVA 5ELVA 4NF4B 1VDWA 3C9HA 3PPRA 4IO4A 1IUDA 5ICQA 1R6ZA 4LQ5A 4F3GA 5DVIA 2DDKA 5CBSA 1PB9A 5CM6A 3H7MA 3N26A 5I2NB 4E0WA 3ZKLA 4PFRA 1LFGA 3EF7A 1INPA 3SDFA 4N81A 2FIXA 1BP5A 1FCKA 2RCAA 1H3DA 3TODA 3R7XA 4ELRA 1FBGA 1Y3QA 2H4IA 3W15C 3SEVA 4GLIA 3T0JA 3RNNA 3B6WA 3U1OA 1XOCA 2QFLA 2F5XA 4I3EA 1FPIA 2DXRA 3VDFA 4C1UA 1JW4A 4NQ8A 2OLBA 2CMOA 1HSJA 4PFWA 4OFOA 1T0KA 4NAPA 1LFHA 1IMCA 2BJJX 3UGWA 1WVJA 3I5OA 4ESXA 4P1EA 4ELPA 2MKZA 2XWVA 3RT6B 1MQIA 3U93A 2V3UA 4MNIA 1NL5A 2Q2AA 4NF8A 3B8BA 5H8HA 3B6TA 2P2AA 3GLBA 5AA3A 1NH8A 3EPEA 3L6HA 1BKAA 2WEFA 3TMGA 4JVDA 3N5LA 1N0TA 2F35A 4ZECA 1IXIA 2CEXA 3MAMA 3T9XB 2OWSA 4LZ5A 4C1TA 4YKIA 1SVXB 2HPGA 5I56A 2F97A 3IX1A 1SYIA 4OVTA 4Z7EA 4QFLA 2ZNUA 1IMEA 3MVZA 3FD3A 1QUJA 4F31B 4H5FA 2YPNA 1RYXA 2YJPA 1FSAA 4EF1A 3ZKKA 3ONMA 2HEUA 2BJIA 4ZZEA 1MQJA 1TFDA 5B70A 4OYVA 1MDQA 4DCXA 5I58A 2FBPA 1MQHA 2QS2A 3IJXB 1NV1A 5H8FA 4NEDA 4PQJA 4P9KA 2XXXA 5JK4A 4QFOA 3H3GA 4NF4A 4F39A 4XTCQ 2F34A 4XKPA 5LOMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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