2Q2CA

Crystal structures of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein artj from the thermophilic bacterium geobacillus stearothermophilus
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
KKVVVGTDAAFAPFEYMQKGKIVGFDVDLLDAVMKAAGLDYELKNIGWDPLFASLQSKEVDMGISGITITDERKQSYDFSDPYFEATQVILVKQGSPVKNALDLKGKTIGVQNATTGQEAAEKLFGKGPHIKKFETTVVAIMELLNGGVDAVITDNAVANEYVKNNPNKKLQVIEDPKNFASEYYGMIFPKNSELKAKVDEALKNVINSGKYTEIYKKWFGKEPKLDRLKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures and mutational analysis of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein ArtJ from Geobacillus stearothermophilus. Implications for interactions of ArtJ with its cognate ATP-binding cassette transporter, Art(MP)2
pubmed doi rcsb
molecule keywords ArtJ
molecule tags Transport protein
source organism Geobacillus stearothermophilus
total genus 74
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2q2cA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2q2cA02
3G3KA 3Q28A 1ATGA 3W9VA 1MPDA 4JB7A 1IEJA 1LSTA 3VVEA 1CE2A 1JNFA 3ZS6A 1B5IA 1IUDA 1MPBA 4H67A 2VD2A 1OLCA 1JETA 2E1SA 1A7LA 2O7UA 1RYOA 3K1PA 3P7IA 5I2KA 4U21A 2OBGA 3H6TA 3QSLA 4YKKA 4XKNA 3IOTA 3PMXA 3VXBA 3L6GA 4RJZA 2P2AA 1NFTA 3B6WA 1B58A 1VFEA 3FVNA 1B32A 1B6HA 4TLLB 2VOZA 1P1NA 3S2VA 3TMGA 4KYSA 1IQ7A 5EHMA 4XXUA 1OVBA 3FZVA 3O97A 3FATA 3C34A 3MVXA 4RK2A 2Y7KA 1FTJA 4EUOA 3CFLA 2RC7A 2XX9A 2NOOA 3SEUA 4DIGA 4GXSB 5F1QA 1QULA 1XVXA 4EF1A 3B6QA 5DTBA 3I5OA 2QMXA 3N6TA 5HM4B 3C9HA 5L9SA 1NNPA 1MQDA 1FQDA 2QS1A 3CG1A 1AL3A 4FECA 2UVIA 2ALUA 1VSOA 5EHSA 1N7XA 1VE4A 3T22A 4UA8A 5L8DA 2PMSA 3RUMA 3F11A 4TLMB 3M3FA 1M5CA 4JDFA 4POWA 1XT8A 1DTGA 2CMOA 1FQBA 4IO3A 4E0XA 1ZTYA 2H4IA 1DMBA 3W9WA 2I6EA 4R74A 1FTKA 4ZZAA 4ZE8A 2XXYA 3IJOB 2REGA 5CMMA 1JVXA 3UGWA 1B0LA 3OENA 5ICTA 3CIJA 1OLAA 1XS5A 4QHQA 1EZ9A 4G8MA 3GZGA 1ZMGA 2IEEA 2NUVA 2ZNSA 2XXWA 2A5TA 1B1HA 2KLFA 4WEDA 4FORA 3BBRA 3ECRA 1B4ZA 1PB8A 4BDOA 3ONMA 3A3CA 3S9NC 4AQ4A 2O1LA 3PU5A 4QF9A 1QUKA 4R9FA 2F34A 3CSGA 1JW1A 2XXUA 2F35A 4H8IA 1B05A 1PB9A 3U94A 3T93B 3OOAA 3L6HA 1UTHA 2QSXA 1QVSA 4JWOA 4LZ5A 4LP2B 1DSNA 3QUJA 1LB8A 2Y84A 4ZEKA 3R7XA 1BLFA 4F19A 1N0TA 3SEYA 1SDXA 2DS9A 1B3LA 1URDA 2DP8A 3KOTA 4RY1A 4POXA 4OERA 3FXUA 1BKAA 4Z7EA 3PV0E 3OO6A 4ZDMA 3PPPA 5JK4A 3VVFA 1PB7A 1POY1 4PFYA 3RN8A 3VFJA 2DWHA 2R6GE 4IGTA 4LQ5A 3QYTA 3DP4A 2G93A 5B7DA 1A8FA 3O9PA 2AIXA 1SW4A 5IAIA 1NNFA 5DVFA 2DVZA 2UYEA 5I56A 2Q9TA 3FV1A 4XIGQ 5JTYB 3VDFA 4L17A 3D4GA 3OEMA 2H9BA 4GL8A 4OWDA 3H6VA 2H99A 2F8DA 1N76A 4NF6B 1EZPA 5H8SA 4U1ZA 4NEDA 3PUXE 1QUIA 5A5XB 4BDQA 3O6GA 1D9VA 3LUYA 3A09A 1SW2A 1ZKBA 4RPOA 4OESA 4NWDA 3KSXA 5AA4A 3IR1A 3FVKA 2E0SA 2D21A 3E4RA 4AB6A 4U4SA 4KPTA 4JXIA 3OO7A 2GFEA 4YU0A 3FJ7A 3RY3A 3MVZA 5TPAB 3H06B 1IXGA 1SYIA 3G7WA 1B40A 1MS7A 3IB1A 5DEXA 3FJGA 1LGBC 1M5FA 3QAXA 1WVJA 5I2NA 3TZAA 1I6QA 3FVGA 3ZKLA 5DVIA 4ZE9A 4M1VA 1IXIA 1QW0A 2RKMA 3MP1A 1UTHB 2ZYMA 4WXJA 4P0IA 2D5WA 1SD3A 3GXAA 1LAXA 4F2QA 3PGFA 4IO5A 4R73A 4U1OA 3B7DA 4OXVA 1MY0A 1M5DA 2RC8A 1FQAA 4ELRA 1B3HA 3IB2A 2V25A 3PPQA 2RF1A 2I0CA 4ELPA 4GQOA 4OTEA 5I58A 2QMWA 3SERA 3G3IA 3TCFA 1R9QA 2XXPA 4F3PA 4KYDA 2DOJA 3N94A 1SW1A 2GH9A 1N3XA 2DXRA 2NXOA 2QRYA 3V83A 4RPNA 1BTJA 2PT1A 1Y3NA 1Z7NE 3ILUB 1ZLQA 3LR1A 1N84A 2OK2A 2XXRA 3ZKKA 4KHZE 3LSXA 5HBCA 4IO6A 1ELJA 1QKAA 2V3TA 3U92A 3R26A 2FNCA 4G2ZA 5TP9A 3TTRA 1OIBA 4HS7A 1B52A 1R6ZA 1BIYA 3H6UA 1MQHA 4GD5A 1NL5A 5H8NA 3M8UA 4THIA 3LSLA 4OFOA 3RTFB 2O51A 4ISUA 1XC1A 1R9LA 3MWBA 5HPQA 3E9XA 3KSJA 3TDJA 1POTA 1DPEA 1P1UA 2F7AA 2GHBA 4IB2A 5DEXB 1FQFA 3WAFA 2X26A 4X1DA 1S9TA 3H3GA 2ZNUA 3UP9A 3OD7A 1LLSA 1B7ZA 4MLQA 3FD3A 3KN8A 4H5FA 4ONYA 5AA2D 4ZEDA 5FHNA 3OO9A 1A54A 4IGRA 2I4BA 4P0GA 4RXLA 3TQWA 2OJTA 3H7MA 5CMBA 5I84A 2Z8EA 3RNNA 2XD3A 2I0BA 2XXIA 3ZSFA 1VFDA 2HZLA 3KG2A 2O84X 1HSLA 2P0SA 4PETA 1ZIUA 3TCGA 3C32A 1ZBMA 1VR5A 2LAOA 3UA8A 2DSFA 4LONB 4EQ7A 5BWJA 3BFUA 3MC2A 3EPEA 3EHSA 1I6BA 3G3FA 5CBRA 4G8NA 2GHAA 4FIMA 4NF5B 3M3KA 4YMAA 3N5LA 1NH7A 1TFDA 3U1OA 2UVHA 1O7TA 1N7WA 1L5TA 5KDTA 3LBSA 4F2OA 1P1WA 5H8HA 2Q88A 3BFTA 2X7QA 4YZZA 3K1NA 1MM7A 1Y1MA 1MXXA 2Z8DA 3TQLA 5TP9B 1SQYA 3OXNA 1JVYA 3TTNA 2F7CA 3ODBA 3HN0A 5I57A 1Z7ME 2VD3A 4X48A 4U2RA 2DXYA 1USYH 5JEIA 4JSDA 2F6PA 4DCYA 3OSQA 2Q2CA 1B0HA 3RT6B 3CI8A 2HAUA 4FEBA 5FHOA 1MXZA 3HCQA 1JEUA 4G68B 5LOMA 4PFUA 3TCHA 1XOCA 1SI1A 1UTBA 5AA1A 3MQ9A 3E13X 4C1UA 3OMBA 1B4HA 3UK4A 4OMBA 4P11A 3Q26A 2GRVA 4ZEFA 4H8JA 1JEVA 4U22A 2H98A 1YAEA 4LZ7A 4ESXA 3MZ1A 5I2KB 3PD9A 1P1OA 2XD2A 3MP6A 4K3FA 4N13A 1NH8A 3CG3A 4MLVA 4OETA 1EZOA 2XHDA 4H6DA 1LFIA 1IXHA 3O2AA 1N04A 4LATA 5ITPA 2X7PA 2F6GA 5CRYA 3IORA 5KZTA 3H6WA 5ELVA 1Y20A 3N6UA 1OQHA 3AXFA 1JW5A 2I48A 2ONKE 3MAMA 1MG1A 2I58A 2Q2AA 3QIMA 4HCWA 2Z8FA 2XXXA 1ZJLA 4FAJA 1QKBA 4OEVA 4QFNA 3TTLA 3TYHA 4BDMA 4LQ2A 1SVXB 3T9XB 1DPPA 2P1SA 3IJXB 3C4MA 1B2HA 3QUFA 3W15C 1MY1A 4R6KA 5H8HB 3JYRA 1M5BA 3IAZA 4PFWA 1B51A 3LC8A 2F78A 3MZ9A 1II5A 3HHFA 4LZ8A 4TQUQ 3WAEA 3H03A 1SYHA 2Y7WA 3V89B 4NF4A 4I62A 1SW5A 1MY4A 2ZYOA 5ISUA 3IOWA 3KJ7A 1YPNA 3K2DA 4IO7A 1H43A 1FQEA 4MF3A 5F7VA 2Z22A 3FGSA 3DELB 1LFGA 4OENA 3K01A 3TUSA 5FHMA 4F39A 2UYFA 1MRPA 2DVCA 4GL0A 5H8QA 3U8QA 2HAVA 3KZGA 4G4PA 2DE4A 2YPNA 4UACA 1B7UA 4IY6A 4NF8A 4O3BA 2QS4A 2VHAA 4ZEBA 1MXYA 3HSTA 3FASA 3EN3A 1MQGA 2A5TB 3CSBA 4OHNA 4Q0CA 4BDRA 4C1TA 4OFLA 5L9MA 1Y3QA 4RNSA 1MH4A 2AL5A 4OYVA 3FXQA 4WKMA 1KWHA 3IOUA 2RINA 3O6HA 4YKPA 2XXHA 4BDNA 3PPOA 1NNKA 3PD8A 1MQJA 1USYE 3C36A 1GV8A 4QRZA 3MBPA 1FTOA 4XKRA 2I3VA 3VV5A 4DXUA 3VLUA 3MUQA 1JQFA 4PQJA 4F1VA 4U4XA 2HQ0A 1I6AA 3TAJA 1LAGE 2Q8JA 3QXMA 4GVOA 3MVYA 3C35A 1PC3A 2ZXTA 3TODA 1PBQA 4O3AA 3K6VA 3TPAA 3O66A 2F36A 3E3KA 3MW0A 5AA3A 4DDDA 3S9EA 3I6VA 1FTLA 4GXAA 3UIFA 4G8HA 3EF7A 2V93A 1S7YA 4ECFA 3O6IA 1MQIA 1RYXA 3IO4A 1N3WA 3MJNA 2O68A 3UORA 2R71A 2V3QA 3O29A 3TTMA 3K02A 3K1MA 3CR9A 1AIVA 5CMKA 4F18A 3SEXA 5I56B 1H45A 1MXVA 1QUJA 3GLBA 2O1MA 3SETA 1Y9UA 4YKJA 5CMCA 4ELOA 3VXCA 1OVTA 3IO6A 3LSFB 4JWXA 4YB5A 3PUYE 3KGCA 1DTZA 1A40A 3K4UA 3OEKA 1D3KA 4RA1A 1LAHE 3G3HA 3K6WA 4DCXA 1LCTA 5H8QB 3OO8A 2B3BA 3KFMA 4R72A 4NF8B 1O64A 1MY2A 2F5XA 3Q25A 5AA4B 4ZECA 2REJA 4HW8A 1S50A 1DOTA 2OLBA 2CZLA 1RKMA 4BDLA 2NWJA 3PMVA 2HZKA 1IITA 2XX8A 3CRBA 1IXCA 5B70A 2ZMBA 3S9MC 1ZU0A 2FA7A 4R2FA 4YAHX 3O28A 3RT8A 3PPNA 4OEUA 3QK6A 4X1BA 2ESNA 5I2NB 3VLVA 3SKPA 4EF2A 3S9LC 1UIVA 2V84A 4H0WA 4LUBA 3PUWE 1TFAA 3SDFA 2R9JA 3JZJA 3FUZA 2QJEA 1GGGA 1FCKA 2OWTA 2W7YA 1B5JA 1B9JA 1JW4A 1Y4CA 1B5HA 1B3GA 1B7HA 1M5EA 4DXCA 5ICQA 4JBZA 1Y4TA 2YJPA 1NNTA 4LA9A 4RYAA 3TFLA 1XVYA 4YB6A 3IL1B 2VGQA 5I58B 1MXUA 4MFIA 4QFKA 4I9DA 3SEVA 3RLFE 2O6AA 1B3FA 3VLWA 2UVGA 4EXKA 3SEWA 2QS3A 2DWIA 1Q35A 1IIWA 2XXQA 4JWYA 1LB9A 3IOVA 2OCUA 4C0RA 1F9BA 1MH3A 4WEPA 1EU8A 3FVOA 3TTKA 3C31A 3V8XB 5KCJA 5CC2A 1D9YA 1Y1ZA 3Q29A 2IA4A 4F1UA 2DE2A 1WODA 3Q27A 3PMWA 3JV9A 5AA2A 5H8NB 2HCAA 4XKQA 4PFTA 3DP6A 2I4CA 3B6TA 3V5AA 5EYFA 2Y7PA 1PDAA 1J1NA 1QJMA 5DYHA 2A5SA 4QFLA 4HCYA 4GFRA 5H8FA 4GF8A 3MZBA 3FJMA 1B46A 5AE4A 2HFBA 2HEUA 1Q1KA 5ITOA 3T9UA 5JTYA 1TWYA 4LVQA 1EH3A 4G77A 4TOZA 1GVCA 3CFZA 5I59A 4ZS9A 3K6XA 2BJJX 2VP1A 4NF6A 2ANJA 2DWAA 2I49A 4EXLA 3M3LA 2ZYNA 4KD5A 4N07A 3THIA 2OZZA 2XX7A 1Y3PA 4U23A 4KFQA 5A5XA 4F3BA 3TKDA 2PX1A 2FYIA 1MPCA 4GLIA 2QPQA 4YKIA 4HTGA 1P99A 4ZEIA 3PUZE 4OZ9A 2I3WA 4N6PA 4OFJA 1YTVA 4FATA 3EQ1A 3FXRA 4EQBA 2XXTA 5TPAA 4NMYA 4R9GA 2ZYKA 3DP8A 4ESWA 3RPWA 4O3CA 1A99A 2F7BA 4NE4A 4F3SA 1B3EA 2B3FA 1A8EA 3K0VA 1HSEA 4DZ1A 3T9VA 3TELA 5KDTB 3CFXA 1URSA 2B65A 1OMPA 2H25A 3A3UA 4JSOA 1I69A 4NTLA 3RQTA 3OSRA 1GR2A 3D4CA 1MDQA 5KCJB 3HV1A 3EHTA 2Z23A 5I57B 4R6HA 1TT1A 1AOVA 4F3GA 4F22A 4OVJA 3TEPA 2Q89A 1OQGA 2PBWA 3HHGA 2ONRA 2ABHA 4AB5A 5AA2B 1LFHA 2RCBA 2PYYA 4R2BA 3T9HB 5DVJA 5FTIA 2UXAA 1AMFA 4IY5A 4YICA 3KN3A 3IX1A 2HXWA 1URGA 5CBSA 4FE8A 2PVUA 4PP0A 2V3UA 3LSWA 1UTBB 3MP8A 5IKBA 2OWSA 4I8CA 1H3DA 4GWOA 1UIUA 5H8FB 4ZZEA 2NVUB 3T66A 2H5YA 1ANFA 3U93A 4KQPA 3USDA 2YLNA 5I59B 4KI0E 2DQVA 4F1YA 1YCJA 4KCCA 1NMUA 4QSCA 3GBBA 4X9TA 2Y7IA 3C33A 5FTHA 4MBPA 5K2XA 3KN7A 3KJTA 1SBPA 3IB0A 4R6YA 4G68C 1LBBA 5M2VA 4E0WA 3K00A 1MY3A 3KOSA 1TXFA 2Y7RA 1O63A 4F31B 3H4ZA 3FV2A 4DLDA 2RC9A 2PT2A 4QSDA 3G3JA 2O69A 4XTCQ 1H76A 1P1QA 5J1DA 2ZNTA 3I3VA 1GTKA 4ELQA 4YB7A 3N26A 3HO7A 1BP5A 1MXWA 1US5A 2AYSA 4QFPA 5CI5A 3KBRA 4GIZA 3GBAA 1FQCA 4H1XA 4I1DA 3K6UA 3UN6A 4YMBA 1HSJA 3PUVE 4KYEA 1AH5A 2XXVA 2M8CA 4H5GA 4DE8A 2AL4A 4Q30B 1B1XA 3CVGA 1LBCA 2WKYA 3IK6B 3MPLA 4NF4B 4QFOA 2QL3A 4NWCA 4ND9A 1D4NA 4RK9A 3VVDA 3EHUA 4F29A 4KCDA 1US4A 4Z0IA 3R6UA 4OQOA 4R75A 2DE3A 4FEDA 4KR5A 4IO4A 4M4GA 3T96B 4Q8RA 1FTMA 1LAFE 4PE5B 4NF5A 1LCFA 2THIA 3HPIA 5CM6A 1H44A 3OELA 3PPRA 1MM6A 1FW0A 4IO2A 2ONSA 3RGYA 1SI0A 5L9OA 1T0KA 5DT6A 1XHYA 1IZ1A 1UQWA 3S4UA 2DWJA 2RCAA 4FJPA 4H65A 3G3GA 3DM0A 3SESA 1CB6A 1PBPA 1PEBA 3KEIA 4EDPA 1WDNA 4XKPA 2G29A 3MPKA 5TU0A 4DXBA 3U72A 1NKXA 5K2YA 5BUUA 2D3IA 3RTWB 2QS2A 2O7IA 3DLNA 3FIRA 2DYXA 4BLAA 2F97A 3MVWA 4GOTA 4Q5TA 3BKIB 3ILTB 4EQ9A 1R1NA 4GRKA 1MDP1 4QSEA 4MH5A 4G68A 3VE1B 2UVJA 1A55A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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