2Q2CA

Crystal structures of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein artj from the thermophilic bacterium geobacillus stearothermophilus
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
KKVVVGTDAAFAPFEYMQKGKIVGFDVDLLDAVMKAAGLDYELKNIGWDPLFASLQSKEVDMGISGITITDERKQSYDFSDPYFEATQVILVKQGSPVKNALDLKGKTIGVQNATTGQEAAEKLFGKGPHIKKFETTVVAIMELLNGGVDAVITDNAVANEYVKNNPNKKLQVIEDPKNFASEYYGMIFPKNSELKAKVDEALKNVINSGKYTEIYKKWFGKEPKLDRLKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures and mutational analysis of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein ArtJ from Geobacillus stearothermophilus. Implications for interactions of ArtJ with its cognate ATP-binding cassette transporter, Art(MP)2
pubmed doi rcsb
molecule keywords ArtJ
molecule tags Transport protein
source organism Geobacillus stearothermophilus
total genus 74
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2q2cA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2q2cA02
3TELA 1B1XA 2A5SA 1OMPA 5CMKA 4RXLA 4DXBA 2DWAA 2IEEA 4QFOA 2XXVA 1EZPA 3K6UA 3O66A 3RQTA 4ESXA 5H8QB 3F11A 3KSXA 4G68C 1B3HA 3N6UA 2QPQA 1PB8A 2NVUB 3PD9A 4MBPA 4C0RA 1FQBA 4HW8A 3QYTA 1Q35A 2VP1A 3CR9A 5CRYA 3IR1A 2R71A 1WVJA 3T22A 2D21A 3OENA 3R26A 1ZBMA 1NNTA 1JW5A 4R2FA 5FHMA 1NNKA 2DWIA 3EHUA 3G7WA 4F3GA 2VD3A 2I48A 3FXRA 2XXPA 1TXFA 4F1UA 5H8HB 3QIMA 1B5JA 3G3FA 1RYOA 3IAZA 4DDDA 5I56A 1MY3A 2DP8A 2O84X 3K2DA 3SESA 1NH8A 5I2NA 3H6VA 4F31B 1UTBB 1VFDA 4RPNA 3OD7A 3I5OA 4R73A 2Y7WA 4R9GA 3CI8A 3OXNA 1MY0A 3SETA 4PFUA 4OMBA 5KDTA 1MG1A 1MY2A 3K6WA 3VV5A 2RINA 2O69A 3VVEA 2A5TA 4XKRA 3B6TA 1JQFA 3PMWA 2H5YA 3SEWA 1MDQA 1DSNA 3KZGA 2BJJX 2F8DA 4MLVA 1QVSA 3THIA 1NH7A 1LBBA 4QRZA 3PPPA 2H4IA 5AA2D 4EDPA 3T9UA 3PUYE 4GOTA 2O1LA 3W15C 5JK4A 1Y1ZA 1URDA 1MQJA 4I62A 5HM4B 3S9NC 2F36A 2OBGA 1B7UA 1US4A 2F7CA 3DM0A 1WODA 3LR1A 1MQDA 3RUMA 1P1WA 4H5GA 3SEYA 5B70A 3A3CA 2PT1A 1IUDA 1LCTA 4H1XA 1TFDA 3LSXA 4LATA 3VVDA 4JDFA 3HHFA 3MVXA 1DOTA 1FQFA 1YTVA 5FTHA 1QUKA 1B9JA 3OMBA 1I6BA 2ZXTA 1ZIUA 3MUQA 3PU5A 1QULA 1SYIA 3ZSFA 3DP4A 4RPOA 4JWYA 4NEDA 3PPNA 1XT8A 1OLCA 2DOJA 3ZS6A 2I3VA 2HZKA 2UYEA 2QS3A 2Z8DA 4EF1A 1D9YA 2DE3A 1H43A 1MQIA 2QJEA 1LSTA 2LAOA 4ZZAA 4FORA 4NWCA 1FTOA 4EQ9A 1FTLA 2OK2A 4LZ8A 2VD2A 4GRKA 3O6HA 3RTFB 2D3IA 2F6GA 1ZMGA 2I58A 4YICA 4R75A 4RJZA 2PT2A 4O3BA 4OQOA 1LLSA 4N13A 1LB8A 1DPEA 3M3LA 3LSFB 5TPAB 4P0IA 3PMXA 3VE1B 4OYVA 3TPAA 4ZE9A 5BWJA 3MPKA 3E9XA 3SEVA 5AA3A 4G68B 5H8NA 4X48A 1RKMA 4PFYA 3O29A 3V5AA 1P1UA 3VXBA 1MH3A 1FTJA 4DZ1A 4X1DA 1B05A 3TTMA 3O6GA 2ABHA 3T9VA 3RNNA 1Y3QA 4ZDMA 3N26A 3JYRA 2QMWA 1B52A 4JBZA 3IO6A 3G3IA 4ZS9A 2I3WA 4OERA 4AQ4A 4OFJA 1SVXB 1NNFA 3RPWA 4NF6A 5ICQA 3TDJA 4ZEBA 3S9EA 3HCQA 3KJTA 4R2BA 1YCJA 4QF9A 1NMUA 3MZBA 3SEUA 3RN8A 1O64A 4H8JA 1B4ZA 3K1NA 3FASA 1Y1MA 2DXYA 5DVJA 1N7XA 3MVZA 1FQDA 3QUJA 3KOSA 1R9LA 4WKMA 4OETA 5ELVA 2Q2AA 4KI0E 2ZNUA 1XVYA 3H6TA 3O2AA 4FJPA 3WAEA 1DTGA 2H98A 5A5XA 4PETA 5EYFA 3BFTA 3MP6A 1PC3A 1Y4TA 3G3JA 3EQ1A 4Q5TA 1B0HA 4R9FA 4F3PA 4NF8B 3GZGA 3ECRA 4TLMB 2V3UA 1M5BA 3M8UA 4DXCA 4EXLA 1BP5A 4JSOA 3S9MC 2DVCA 1ZKBA 2GRVA 3VVFA 1TT1A 1N3WA 3IO4A 4OXVA 4NWDA 2O7IA 3K6VA 4ZEIA 5KCJA 1QKAA 3Q25A 1BLFA 5F1QA 4EXKA 1A8FA 3IK6B 4XTCQ 2QS1A 3SKPA 3TODA 4G8MA 4OEUA 2V3TA 4BDNA 1MPBA 5L9SA 1O63A 2OZZA 5JTYB 4FE8A 1OVBA 3OO6A 1BKAA 4DCYA 4N07A 4I1DA 5K2XA 4PFTA 4EUOA 3U72A 5I84A 1TWYA 2YLNA 1P99A 3FVOA 3FV2A 2O51A 3C34A 1FW0A 1PB9A 2DSFA 2V84A 2YJPA 4BLAA 2F7BA 1NKXA 3N6TA 3QAXA 1ZJLA 4ELOA 5I2KB 3PMVA 4GL0A 3TCHA 1OLAA 4IGTA 4GVOA 2XXQA 2HFBA 1B58A 2RF1A 3KJ7A 1XHYA 1QKBA 3T96B 4ZZEA 4GLIA 1JETA 2G93A 2ZYNA 2QSXA 1P1NA 3UGWA 4OVJA 1PEBA 3CFLA 2XXUA 1VE4A 4I9DA 3K01A 4PP0A 1D4NA 1O7TA 1TFAA 1D9VA 3Q29A 3H4ZA 2G29A 4AB6A 1UTBA 4F39A 3EF7A 3K00A 3TQWA 1JW4A 5FTIA 5DT6A 1MH4A 1DTZA 3G3HA 2E1SA 4UA8A 2Z23A 5ISUA 4LZ7A 5M2VA 4LVQA 4GQOA 4GWOA 1M5EA 1QJMA 3RTWB 2F78A 5TP9B 5I57A 4OFLA 2PX1A 4QSEA 2XHDA 3TMGA 1R6ZA 4YZZA 5ICTA 3FGSA 5B7DA 3RT8A 1P1QA 5BUUA 1IXIA 4JWOA 5FHNA 3KBRA 1J1NA 4LP2B 4THIA 2AYSA 4U22A 1OVTA 4FEBA 4NF4A 2GFEA 4NMYA 4E0WA 3HSTA 5TU0A 1IXGA 3R7XA 2ZYMA 2OLBA 5I58A 4KYEA 3G3KA 1A55A 3MPLA 3MC2A 2Q8JA 2HXWA 2W7YA 4LQ2A 1H44A 4BDQA 1SD3A 2DYXA 3CIJA 3IORA 4DXUA 4LA9A 4R6YA 4WEPA 4F19A 1FQEA 2REGA 3C4MA 3TCFA 5EHSA 3DP6A 1CE2A 4JXIA 1XVXA 3Q26A 1Y3PA 4ELRA 4JWXA 1DPPA 2GH9A 3ILTB 1AMFA 3PPOA 4MFIA 1LAHE 5I56B 3RLFE 3CSGA 1B2HA 3FVNA 4RNSA 5I2NB 1UIVA 1A8EA 2XD2A 1RYXA 3D4GA 2RC9A 4FEDA 4OESA 4DLDA 2X7QA 3GBBA 5JEIA 1NFTA 4ZE8A 1USYE 4OEVA 2CMOA 4DCXA 5KDTB 3H6UA 4QFKA 3FXQA 3CG1A 2IA4A 4M1VA 3UA8A 4KR5A 1FTKA 1LFHA 3IJOB 3H3GA 2OWTA 4ELPA 4F2QA 5TPAA 1UIUA 2B3FA 4TQUQ 3EPEA 4FIMA 3OO8A 4E0XA 4QSCA 1Y3NA 2D5WA 3VXCA 3B6QA 2VHAA 3C9HA 1LB9A 4G68A 2O6AA 4H65A 3Q28A 4O3AA 3IX1A 3EHTA 3PUXE 2UXAA 5AA2A 1N7WA 2DWHA 1YAEA 3LSWA 4HS7A 3O6IA 3PD8A 4YMAA 1ATGA 4EQBA 4KD5A 5AE4A 3KG2A 4GIZA 3O97A 4LQ5A 1JVYA 4P11A 4X1BA 1HSEA 1S7YA 4F1YA 1S50A 1B7HA 4G4PA 4IGRA 1SW5A 1SYHA 1B1HA 1B32A 4QFPA 1B46A 2XD3A 4I8CA 3GBAA 5CC2A 2WKYA 4G77A 4U4XA 5I59B 2V25A 4YB7A 3JZJA 2AL4A 4GFRA 2XX7A 4ECFA 2H25A 3TUSA 4O3CA 1LFIA 2ONRA 3DLNA 4XKQA 4IY6A 4KYSA 1ANFA 3SDFA 4G8HA 4OWDA 4H67A 2ZMBA 2P2AA 4K3FA 3FXUA 2R6GE 1M5DA 4QFNA 4NE4A 2QS4A 4WEDA 1B6HA 4EF2A 3TTKA 1MXWA 4Q8RA 4GXAA 1LAXA 4YKKA 3TFLA 3CRBA 1MDP1 3MJNA 4H0WA 4IY5A 3HHGA 1MXZA 3ZKLA 4Z0IA 3MP8A 1PDAA 2XXIA 2AIXA 3MP1A 3IOWA 1IEJA 2RCAA 3EHSA 2XXTA 5ITOA 3SERA 3PUWE 3OEKA 1SDXA 2H99A 5H8FA 4F3SA 5CMMA 5L9OA 4KYDA 2X7PA 3MVYA 5DEXB 3IB0A 3ONMA 3GXAA 2X26A 2DE4A 3VLWA 3FIRA 4MF3A 4IO2A 1WDNA 3H03A 1B3FA 2ZYOA 3HN0A 4ONYA 4RYAA 2I0BA 3KN8A 2AL5A 4HTGA 1A7LA 4RK2A 2UVJA 1MRPA 2XXHA 2Y7KA 4ZEDA 2HQ0A 1ELJA 2B3BA 4KHZE 3V8XB 2OWSA 1XS5A 4F1VA 3AXFA 3FD3A 1ZU0A 3C36A 4JB7A 4MLQA 3C33A 1LAGE 3ODBA 2YPNA 5AA4A 1FQCA 1GTKA 1T0KA 4F2OA 1B4HA 1URGA 1MXYA 1Z7ME 4GF8A 1B40A 4C1TA 1P1OA 3LUYA 3HV1A 3E3KA 3GLBA 4U2RA 2V3QA 3O9PA 1QUIA 3TZAA 3C32A 4H6DA 5A5XB 4HCWA 3OO7A 2THIA 3QSLA 2Y84A 5F7VA 3BKIB 4KCCA 5DVIA 2I6EA 1EZOA 5K2YA 2ZNTA 1A40A 1QUJA 4RY1A 4OHNA 3RY3A 3UORA 1LGBC 1LAFE 1SW4A 4YMBA 4R6KA 1B3GA 5H8QA 3LC8A 1CB6A 5L9MA 1L5TA 1URSA 3TAJA 1H45A 1MQGA 1UTHB 3A3UA 4H8IA 3A09A 2KLFA 3PPRA 4BDMA 4ESWA 1MXVA 3HO7A 3PUVE 2RCBA 5CM6A 5KCJB 4GD5A 4NF5B 3BFUA 4WXJA 2REJA 3MVWA 3H7MA 1H76A 3TQLA 2NUVA 2DQVA 3S4UA 5TP9A 4QSDA 3UN6A 4YU0A 5H8HA 5CI5A 1EU8A 3K4UA 1GGGA 4ZEFA 1B5IA 2M8CA 2XX9A 5FHOA 3KOTA 5CMCA 4X9TA 3K0VA 2HEUA 1VFEA 1N76A 1US5A 4PQJA 3O28A 3IOTA 2NWJA 1JW1A 1SQYA 1A99A 3VFJA 3MQ9A 2DWJA 2VOZA 3TKDA 1HSJA 2XXXA 3B6WA 2O7UA 4LUBA 3D4CA 1OIBA 1Q1KA 2I4CA 4LZ5A 2XXRA 4OENA 4PE5B 3C35A 4RK9A 3I3VA 5ITPA 1NL5A 1SW1A 4U21A 4ISUA 3U92A 1XC1A 1I69A 2PMSA 4KFQA 3IB1A 2RC7A 3IL1B 1PB7A 4BDRA 5CMBA 1LFGA 3E13X 4IB2A 2FYIA 4YKJA 1B7ZA 4BDLA 3UK4A 4M4GA 4DE8A 3HPIA 4NTLA 3M3FA 4GXSB 3V89B 1H3DA 4F18A 3ILUB 3KGCA 4Q30B 4UACA 1YPNA 4HCYA 1N0TA 5I57B 5H8SA 4YB6A 2F35A 3K6XA 1I6AA 3KEIA 2I0CA 1IITA 1B5HA 3T66A 1SI1A 3UIFA 1IQ7A 1F9BA 3L6GA 1PBQA 4RA1A 1EZ9A 2P0SA 5DYHA 3TTLA 3H06B 3T9XB 3FZVA 1JEVA 2Q89A 4XKNA 4NF4B 3MZ9A 3U94A 5I58B 1AL3A 2Z22A 2A5TB 3PGFA 1BIYA 2OCUA 1FQAA 1VSOA 3WAFA 1B51A 3MBPA 2O1MA 1M5FA 5CBRA 4BDOA 2E0SA 2R9JA 2HCAA 2HAVA 4IO6A 1R9QA 1Y20A 4GL8A 4AB5A 2PVUA 3Q27A 1II5A 4XKPA 2Z8EA 4C1UA 2F6PA 3FVKA 4OTEA 4DIGA 4QHQA 1IIWA 3CVGA 4FAJA 4TOZA 3K1MA 5I59A 1SI0A 4FATA 4F29A 3ZKKA 2VGQA 2Q2CA 1MPDA 1PBPA 3IOUA 4IO3A 1A54A 3OSQA 4ZECA 3IOVA 1MXXA 2F5XA 2ZNSA 2ONKE 4H5FA 4YKPA 2PYYA 1AIVA 3LBSA 4LONB 3VLVA 4KPTA 4ZEKA 4U23A 4XIGQ 4F22A 2FNCA 1FCKA 1HSLA 4Q0CA 1M5CA 3SEXA 1MS7A 3K1PA 3PV0E 3CFZA 4Z7EA 2QS2A 1DMBA 2DXRA 4N6PA 4TLLB 4IO7A 3FJMA 3U1OA 2DVZA 3U8QA 1BTJA 4XXUA 1MPCA 2ANJA 3QUFA 2DE2A 3VDFA 1POTA 3N94A 3TTRA 4G8NA 2QMXA 2FA7A 2UVHA 1MM7A 3G3GA 3M3KA 5AA2B 5IKBA 2Y7PA 2Y7IA 2I49A 3FV1A 3LSLA 2Q9TA 3MZ1A 4YB5A 5KZTA 1QW0A 1OQGA 3U93A 5DEXA 3T9HB 1XOCA 2F97A 4R72A 5CBSA 1MQHA 3CSBA 4YKIA 2O68A 5HPQA 4NF8A 3S2VA 4EQ7A 3C31A 1B3EA 3PPQA 2Z8FA 1JEUA 2NXOA 4IO5A 4U4SA 5H8NB 1AH5A 2RC8A 4KCDA 4PFWA 2UVIA 4OZ9A 2B65A 3VLUA 1B3LA 1B0LA 1MY4A 2XX8A 2XXYA 2CZLA 1JNFA 3JV9A 4R6HA 3N5LA 1LCFA 1MXUA 3P7IA 3OEMA 3OO9A 1D3KA 3DP8A 3KFMA 2GHAA 1FTMA 3QK6A 3FATA 3RT6B 2HAUA 4JSDA 4YAHX 3PUZE 3USDA 3IJXB 1MY1A 4POWA 1EH3A 1IZ1A 1GVCA 3UP9A 4NF6B 4ELQA 2V93A 1IXCA 3V83A 3DELB 3W9WA 1MM6A 5JTYA 1I6QA 3TCGA 4MH5A 1KWHA 1GV8A 2ONSA 4G2ZA 4L17A 3KN3A 1N3XA 2XXWA 3W9VA 2GHBA 3S9LC 3KSJA 5LOMA 3OSRA 1UQWA 3OOAA 3T93B 3CG3A 3RGYA 2H9BA 1SBPA 3QXMA 5IAIA 3FJ7A 3BBRA 5AA1A 1Y9UA 4POXA 5HBCA 1UTHA 3MWBA 5H8FB 1LBCA 1N84A 1OQHA 3I6VA 1VR5A 5I2KA 1ZTYA 1ZLQA 3IB2A 4FECA 1SW2A 3CFXA 4NF5A 5DVFA 3E4RA 2F7AA 1POY1 3EN3A 5L8DA 4U1ZA 1NNPA 2F34A 2UYFA 2ALUA 2OJTA 3B7DA 4QFLA 4R74A 2QRYA 3H6WA 1JVXA 1GR2A 2UVGA 4ND9A 2DS9A 1IXHA 4KQPA 2Q88A 2HZLA 3OELA 2ESNA 1R1NA 5EHMA 1Y4CA 4IO4A 1N04A 1AOVA 3R6UA 3TTNA 2Y7RA 1S9TA 5DTBA 3KN7A 1USYH 4OFOA 5AA4B 3FJGA 1Z7NE 4U1OA 3FVGA 5J1DA 3TYHA 2QL3A 2RKMA 2ZYKA 4F3BA 2P1SA 2NOOA 3MW0A 3FUZA 2I4BA 3L6HA 3MAMA 3TEPA 4P0GA 3K02A 2PBWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FBPA 3TELA 1B1XA 2A5SA 1OMPA 5CMKA 4RXLA 4DXBA 2DWAA 2IEEA 4O94A 2FBPA 4QFOA 2XXVA 1EZPA 2KR0A 3K6UA 3O66A 3RQTA 4ESXA 5H8QB 3F11A 1FBFA 4PE3A 3KSXA 4G68C 1B3HA 3N6UA 4GBVA 2QPQA 1PB8A 4HE2A 1FPKA 4MHFA 2NVUB 3PD9A 4MBPA 4C0RA 4GWYA 1FQBA 1IMEA 4HW8A 3QYTA 1Q35A 2VP1A 3CR9A 5CRYA 3IR1A 2R71A 1WVJA 3T22A 2D21A 3OENA 4PGPA 3R26A 2CZKA 1ZBMA 1NNTA 1JW5A 4R2FA 5FHMA 2WBDA 1NNKA 2DWIA 3EHUA 3G7WA 4F3GA 4MX6A 2VD3A 2I48A 3FXRA 2XXPA 1TXFA 4F1UA 5H8HB 4OVSA 3QIMA 1B5JA 3G3FA 3A29A 1Q9DA 1RYOA 3IAZA 4DDDA 5I56A 1MY3A 2DP8A 2O84X 3K2DA 3SESA 1NH8A 5I2NA 3H6VA 4F31B 1UTBB 1VFDA 4RPNA 3OD7A 3I5OA 4R73A 2Y7WA 4GBWA 4R9GA 3CI8A 3OXNA 1MY0A 3SETA 2Y5KA 4PFUA 4OMBA 5KDTA 1MG1A 1MY2A 3K6WA 3VV5A 2RINA 2O69A 3VVEA 2A5TA 3B6TA 1JQFA 3PMWA 4XKRA 2H5YA 3SEWA 1MDQA 1DSNA 3KZGA 2BJJX 2F8DA 4MLVA 1QVSA 3THIA 1NH7A 1LBBA 5J16A 4QRZA 3PPPA 2H4IA 5AA2D 4EDPA 4PAFA 3RYDA 3T9UA 3PUYE 4GOTA 2O1LA 3W15C 5JK4A 4NF0A 1Y1ZA 1URDA 1MQJA 4PAIA 5EYHA 1INPA 4I62A 5HM4B 3S9NC 2F36A 2OBGA 1B7UA 5DW8A 1US4A 2F7CA 3DM0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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