2Q89A

Crystal structure of ehub in complex with hydroxyectoine
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
RDENKLEELKEQGFARIAIANEPPFTAVGADGKVSGAAPDVAREIFKRLGVADVVASISEYGAMIPGLQAGRHDAITAGLFMKPERCAAVAYSQPILCDAEAFALKKGNPLGLKSYKDIADNPDAKIGAPGGGTEEKLALEAGVPRDRVIVVPDGQSGLKMLQDGRIDVYSLPVLSINDLVSKANDPNVEVLAPVEGAPVYCDGAAFRKGDEALRDAFDVELAKLKESGEFAKIIEPYGFSAKAAMSTTREKLCAAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of the ligand-binding protein EhuB from Sinorhizobium meliloti reveals substrate recognition of the compatible solutes ectoine and hydroxyectoine.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative ABC transporter amino acid-binding protein
molecule tags Transport protein
source organism Sinorhizobium meliloti
total genus 80
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2q89A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2q89A02
4X1BA 5H8NB 5AA2B 1P1QA 3PUVE 1H44A 2NXOA 2ZYNA 2OZZA 4U22A 3TKDA 2HAUA 3KG2A 4O3AA 3S9MC 1WVJA 2CMOA 2YLNA 4EQBA 4MLVA 3M3LA 1ANFA 3QXMA 1POY1 2XXHA 3BKIB 3EN3A 2PBWA 3RN8A 1UIUA 4R6YA 4OYVA 3K6UA 3UA8A 1IZ1A 1NNFA 2ONRA 3CIJA 2RKMA 4EF1A 3K6VA 1RYXA 5KCJB 3ILUB 3PUYE 4R75A 2D21A 4KYDA 2HZKA 4WKMA 3FASA 1LLSA 1LAFE 3T9XB 1ZU0A 1MXVA 3K6WA 4MBPA 3CR9A 4NWCA 1LSTA 1IIWA 3MQ9A 1FTLA 5M2VA 3TTNA 1XVXA 5CC2A 5IKBA 3IJOB 1JW4A 4ZZAA 2RINA 4QFNA 1B5JA 1A99A 4NMYA 4H65A 4I9DA 1UTBB 1MQIA 3ECRA 2QJEA 5H8HA 3TCFA 3THIA 1MDQA 3QYTA 2PX1A 1EZPA 1FQAA 1LAXA 4KYSA 3VVDA 4MFIA 4NF6A 1Q35A 4YAHX 1DOTA 3R26A 5CBSA 2Q2CA 2DS9A 3TAJA 3N26A 2XXVA 4H5GA 1B1XA 4DXBA 3ODBA 3FVGA 4F3SA 3QK6A 1LB8A 4LZ5A 2FNCA 1AOVA 4UA8A 2A5TB 1H76A 3KJTA 4GVOA 2DWHA 2Q2AA 4YKIA 2DWIA 5ISUA 4NF8A 1OMPA 4P0IA 1MG1A 2V3UA 1URSA 1Y9UA 5TPAB 2QS2A 3PUXE 3IX1A 3IOWA 1URGA 4P11A 3VXCA 4QHQA 4KYEA 4X1DA 4LZ7A 4C1UA 1NKXA 3O6HA 1M5BA 3WAFA 2P0SA 1MPDA 2UVIA 3FVNA 4G8NA 4RXLA 3PUZE 1MPCA 1FQCA 5F1QA 1Y3PA 3W15C 3OENA 5I58A 2ZNSA 2ALUA 1US4A 1B52A 2XX8A 4FAJA 1JW5A 4IGRA 3E13X 2FYIA 1QKBA 5H8NA 5AA2A 2F7AA 5HM4B 5FHMA 3BBRA 4H0WA 2Y7IA 4OENA 1BKAA 2P1SA 2AYSA 3IOUA 3SETA 4FIMA 1MH4A 1A40A 3C33A 1ZTYA 1QUIA 4OWDA 4WEDA 5HPQA 1D9YA 2XD3A 1IXCA 1JW1A 2OK2A 2QPQA 2HCAA 3VLUA 5KCJA 3H03A 4IY6A 1TWYA 2NVUB 1POTA 4OFJA 4QRZA 5HBCA 2XHDA 3I6VA 1BTJA 1M5FA 1Z7ME 4DXUA 1FTKA 4IO4A 1M5CA 5I56B 3SESA 1WDNA 4F22A 1PDAA 1EH3A 1EZ9A 5ITPA 4ZEDA 3KGCA 4ESXA 1MXZA 3H6UA 2Z8EA 2B3FA 2QS4A 1XOCA 3Q29A 3H6WA 1H45A 3VLVA 4FEBA 4G77A 3VVFA 1UTBA 1IQ7A 2Z8DA 2DWAA 2VP1A 1AL3A 4IGTA 2GH9A 1KWHA 1Y1ZA 3V5AA 4GIZA 3K2DA 1FQBA 4JSDA 3PPOA 4HTGA 1B1HA 2OLBA 3C4MA 3U72A 1A8FA 3MZ9A 4P0GA 5TU0A 2Q89A 3PUWE 3IB1A 3U92A 2A5TA 1A8EA 2Y7KA 3TCGA 1QVSA 3TPAA 4MF3A 1N7WA 4LATA 1IUDA 3JYRA 1AMFA 5TPAA 4ZZEA 1Y4TA 3V83A 3MVWA 3C32A 4IB2A 3BFUA 3S9LC 3H6VA 3CG1A 5TP9B 1HSJA 4R9GA 1MQHA 2VD2A 5CMCA 1OLAA 2UVHA 3DP6A 4H8JA 1LAHE 5I2KB 5ITOA 2RCBA 2NWJA 4U1ZA 2F6PA 1SW5A 3EPEA 4DE8A 4EF2A 2BJJX 3FJMA 3PPNA 1JETA 2V93A 1N7XA 3CSGA 4G4PA 4F2QA 2XX7A 2HXWA 1ELJA 4IO5A 1II5A 1N3WA 4Q5TA 1H3DA 5AA2D 4F3BA 1T0KA 3KBRA 3VV5A 5DVFA 4HS7A 1J1NA 2P2AA 1QUKA 4ZE9A 2B3BA 1FQEA 4FEDA 4O3CA 4R74A 2F7BA 1QW0A 2DWJA 1O7TA 2O68A 5IAIA 1P1NA 3OD7A 4G68B 2A5SA 2ONSA 3UIFA 3T96B 3RNNA 2ZNUA 1QKAA 4H1XA 3I5OA 1UQWA 4L17A 4ELQA 3E4RA 3W9VA 3HHGA 1IITA 5BWJA 1IXGA 2UYEA 1F9BA 1PB7A 3VDFA 3CFLA 2THIA 3C34A 4R72A 4F29A 4OFOA 3EF7A 5I56A 1AH5A 2AIXA 3FGSA 2F35A 4ISUA 1ZMGA 2DVZA 3O66A 3CG3A 5CBRA 4UACA 2I0CA 1UIVA 1LFIA 3OEKA 3ONMA 4OETA 3MWBA 3GBBA 4YMBA 4FECA 4ZECA 4DDDA 2RC8A 3IJXB 2YJPA 3SDFA 3G3KA 1OQHA 1BP5A 2QSXA 2Y7PA 2O6AA 3EHUA 4KD5A 3DELB 1Y20A 3B6WA 4YICA 2F34A 5K2YA 3OXNA 1IEJA 2HZLA 5CMKA 3H7MA 2Z8FA 3TMGA 3HSTA 3HCQA 3QIMA 2XXYA 1SI1A 1LCTA 1VFEA 2QS1A 4U4SA 3FJGA 1VE4A 1I69A 2REGA 3PD8A 3RQTA 1USYH 5CMMA 3U93A 3FXUA 1GR2A 1MY2A 1R9QA 4BLAA 4Q8RA 3OSQA 5TP9A 3ZKLA 4QFOA 4KCCA 2QMWA 3VVEA 2XX9A 3KJ7A 4R6KA 5L9MA 3QSLA 4PP0A 3K00A 2ONKE 5I2KA 3RUMA 2ZYMA 5DVIA 3G3HA 4RK2A 2PVUA 3KSXA 1PB9A 4GFRA 3K1NA 3O97A 5KDTB 2DSFA 3PGFA 3C31A 4LONB 4DIGA 1B3EA 1MPBA 4M1VA 1RYOA 1I6AA 1MY0A 1ZIUA 4U1OA 1Q1KA 3FUZA 4HW8A 1B0LA 3PMVA 4RK9A 4IO7A 5B70A 5CMBA 1JVXA 3SEWA 5CM6A 4ONYA 5DTBA 4PFYA 4ZE8A 1B5HA 2FA7A 2Z22A 2IA4A 3PD9A 4GLIA 3LSLA 4G68A 4LZ8A 1B4HA 4NTLA 3TCHA 1FQDA 1MRPA 3KEIA 4F3GA 3MP1A 1B3LA 1N3XA 5I2NB 4JWYA 3FATA 2DYXA 4OHNA 3MZBA 1SW2A 1PBQA 3VXBA 3MVXA 3RPWA 1FW0A 1JNFA 3S2VA 3USDA 4ZEKA 3OEMA 4OEUA 2RF1A 3SKPA 2D3IA 1B58A 2AL5A 3KN3A 2R71A 2ZNTA 2O1MA 4PETA 3O6GA 1A55A 5J1DA 2V3TA 3EQ1A 3ZKKA 4ELPA 1SD3A 3GXAA 4F1UA 3MZ1A 3N94A 4G2ZA 2Y7WA 2XXIA 4FORA 3W9WA 3F11A 2WKYA 2QMXA 4THIA 2KLFA 4H5FA 1SYHA 2VOZA 3FVOA 3KFMA 2DE3A 1ZKBA 1B7ZA 1M5DA 1OVTA 5H8FB 5I59B 5A5XB 4KFQA 1B5IA 2O69A 3MC2A 4AQ4A 1O63A 5FTHA 4XKQA 4U23A 4O3BA 4HCYA 4EDPA 4XIGQ 4IO3A 2O7IA 2NUVA 1FTOA 3Q25A 2OWTA 3N6TA 1B40A 3AXFA 2H5YA 1UTHB 2F5XA 1R6ZA 1QUJA 1GV8A 3R6UA 3TZAA 1JEUA 1TT1A 1DSNA 3VFJA 5FHOA 2VGQA 3TQWA 4MLQA 1R1NA 4PQJA 3GBAA 1GVCA 5DT6A 2XXUA 3K6XA 2F7CA 1N0TA 4Q0CA 1CE2A 1NH7A 3IO6A 1QULA 5KDTA 3UP9A 5L9SA 4JB7A 5AA1A 4OESA 3RT6B 3B7DA 1H43A 4N07A 3GZGA 4BDMA 4QSDA 3TTKA 3H6TA 3MW0A 1N76A 2DE4A 3N5LA 1LBBA 1PC3A 4QFLA 3R7XA 5CRYA 4GF8A 4TLMB 2IEEA 4POXA 4KCDA 2O1LA 4QF9A 1P99A 4XKPA 3LC8A 4WEPA 4GRKA 4JBZA 1MQDA 1NNPA 1NMUA 4OVJA 3FZVA 2DXYA 1OLCA 2I6EA 4NWDA 3MAMA 3IAZA 2V25A 2GHBA 1YCJA 4XTCQ 3RGYA 3QAXA 3TDJA 1LCFA 3DLNA 3K0VA 4I1DA 4YU0A 3T9HB 5I2NA 2F36A 2Y7RA 3LBSA 3TTLA 3BFTA 2O84X 2HFBA 4PFUA 1TFDA 3OO6A 3L6HA 4PE5B 3MVZA 4K3FA 1S9TA 4NEDA 3S9NC 2B65A 4RYAA 2XXWA 1XS5A 1RKMA 1MXYA 3HV1A 3L6GA 4OTEA 2UXAA 3RTFB 4LA9A 4LQ2A 4GL0A 2QRYA 3KOSA 1JQFA 4G68C 2ANJA 3OELA 2XXPA 4E0WA 1D9VA 2QS3A 3V8XB 2GRVA 5EHSA 3UK4A 4NF4B 3SERA 2I3VA 4FATA 3OMBA 4QSCA 4U4XA 2ZMBA 3U94A 3K1MA 4TQUQ 1XC1A 3S9EA 3MUQA 3O29A 4PFWA 2E1SA 1DTGA 3DM0A 5H8FA 5I59A 4EQ7A 1I6QA 5A5XA 1Y1MA 4U21A 3MJNA 3GLBA 5AA4B 1XHYA 3PU5A 5DEXB 3FV1A 3Q28A 2GFEA 3G3GA 3FVKA 4ECFA 3SEXA 3T22A 4GQOA 4N6PA 4YB5A 1UTHA 1OQGA 3S4UA 2ABHA 3QUJA 2HQ0A 3IO4A 1LAGE 1US5A 4C1TA 4BDLA 4KQPA 3DP8A 1SDXA 5BUUA 3MP8A 2DE2A 2X26A 1PBPA 2PYYA 3RLFE 3JV9A 3M8UA 3M3KA 1GGGA 2H4IA 3OO7A 2PT2A 4YB6A 4G8HA 3P7IA 3LSWA 3A3CA 4XKNA 3PMWA 1ZJLA 4N13A 3IB0A 3I3VA 1B4ZA 3TYHA 4LVQA 1Y3QA 4ND9A 2F6GA 1IXIA 1SQYA 3UORA 1EU8A 2HAVA 2HEUA 1YPNA 4GXAA 3IOTA 4R2BA 5LOMA 2UVGA 4F3PA 4ESWA 4ZEFA 3EHTA 4JXIA 4EQ9A 1MDP1 2DP8A 4QSEA 3E3KA 3K02A 1SYIA 3T9UA 4YKKA 3TEPA 3OO9A 3IK6B 3WAEA 4I62A 3H3GA 3HHFA 4FE8A 1B05A 1O64A 1Y4CA 2XXXA 1B6HA 4IY5A 4MH5A 2I4BA 2Z23A 3G7WA 4X9TA 1XT8A 3PMXA 3MP6A 3O9PA 3FXRA 3RY3A 3QUFA 2AL4A 1DPPA 1VFDA 2PT1A 1URDA 4POWA 1FCKA 1MQJA 2XXQA 4R73A 1NH8A 1NL5A 1P1OA 2M8CA 3H4ZA 3T9VA 4BDNA 1L5TA 5AE4A 4F1VA 3EHSA 1LB9A 1MH3A 2XXTA 1MY1A 1S50A 5DVJA 5CI5A 4DZ1A 2E0SA 5JTYB 2DXRA 4FJPA 2G93A 2LAOA 1LFHA 4NF5B 2GHAA 1P1WA 4WXJA 3PPPA 2OWSA 4NF4A 4HCWA 5ICQA 4ZEBA 3N6UA 2F8DA 1N04A 1OIBA 4GOTA 2D5WA 3VLWA 5F7VA 1FTJA 3M3FA 4XKRA 2OCUA 5ELVA 4I8CA 3RTWB 2ESNA 3K1PA 3HO7A 3FXQA 4GXSB 4ELRA 1MM6A 5AA4A 3PPQA 5EYFA 1XVYA 5DEXA 1A54A 4H6DA 2OJTA 2XXRA 3MBPA 3TODA 3KZGA 1MY4A 3K01A 4YKJA 3KN7A 1LFGA 4OFLA 2REJA 4LUBA 2Y84A 3HN0A 2VHAA 4GL8A 4OEVA 1B32A 2G29A 1EZOA 3IL1B 4LQ5A 2CZLA 4OZ9A 3FD3A 1QJMA 1HSLA 4KI0E 1MY3A 2X7PA 1FTMA 3MPKA 4RA1A 4JWOA 3E9XA 3IOVA 3PPRA 1B0HA 2W7YA 5K2XA 3C36A 3SEUA 3IORA 3B6TA 4X48A 2I58A 2F78A 1B7UA 2RCAA 3B6QA 3T93B 2O7UA 2Q9TA 5L9OA 1HSEA 1MXXA 4RNSA 2F97A 4M4GA 3FJ7A 5DYHA 4NE4A 3FIRA 3OOAA 3LUYA 1MS7A 1LBCA 3LR1A 2OBGA 1OVBA 4R9FA 4DCYA 3G3FA 3A09A 1B51A 2RC7A 3OO8A 3FV2A 4F31B 5JEIA 1SW4A 3TUSA 3LSFB 4ZEIA 3T66A 4BDOA 1LGBC 4OQOA 1B3HA 4BDRA 1I6BA 4XXUA 5I57B 4H8IA 4QFKA 3TFLA 1SBPA 4H67A 1M5EA 1NNTA 4TOZA 3MVYA 5L8DA 3C35A 5AA3A 4EXKA 4F2OA 1PB8A 5JTYA 1YTVA 1MQGA 3UN6A 1ATGA 4NF5A 4G8MA 4GD5A 1DPEA 2ZXTA 1MXUA 3O28A 3H06B 3JZJA 2DVCA 1TFAA 3KN8A 4AB6A 4Q30B 4F1YA 1ZLQA 5H8QB 2PMSA 1AIVA 4YMAA 4R6HA 4IO2A 4RPNA 5ICTA 1R9LA 1A7LA 4OXVA 4EUOA 4LP2B 3Q27A 3CFXA 4DCXA 1Z7NE 4ZS9A 3U1OA 1S7YA 1PEBA 4F39A 4JWXA 1NNKA 3IB2A 3CFZA 1CB6A 4KHZE 3PV0E 2R6GE 1B9JA 1BIYA 3SEYA 3DP4A 2H25A 1P1UA 1VSOA 4KPTA 4PFTA 2DQVA 4OERA 1GTKA 1MM7A 3CI8A 4RPOA 3D4GA 3ILTB 5FHNA 1YAEA 3G3IA 4R2FA 5JK4A 1Y3NA 4QFPA 4Z7EA 3VE1B 1DTZA 1MXWA 3CVGA 2H9BA 1ZBMA 1USYE 3TQLA 3UGWA 1B2HA 1SI0A 1B3GA 3LSXA 2X7QA 3RT8A 4E0XA 1NFTA 5H8HB 3A3UA 1TXFA 1FQFA 2QL3A 3OSRA 4C0RA 4Z0IA 3Q26A 4NF6B 1B46A 5EHMA 5B7DA 3O6IA 1VR5A 4TLLB 4RJZA 1WODA 2H99A 5FTIA 4ELOA 5KZTA 2VD3A 3ZSFA 3SEVA 2DOJA 3TTMA 4JDFA 2NOOA 2I4CA 2I0BA 3TELA 4BDQA 4AB5A 1D4NA 4OMBA 4U2RA 4DXCA 3U8QA 3HPIA 2ZYOA 1D3KA 1JVYA 1SW1A 3KOTA 4F19A 4NF8B 2I48A 2ZYKA 1SVXB 5I57A 4KR5A 3KSJA 3ZS6A 4F18A 2R9JA 3D4CA 3MPLA 1JEVA 3CRBA 4JSOA 5I84A 3CSBA 4ZDMA 2O51A 1B7HA 2UVJA 1B3FA 4IO6A 4YKPA 4EXLA 2H98A 2Q88A 2UYFA 4GWOA 3V89B 2XD2A 2YPNA 4YB7A 3G3JA 4YZZA 1BLFA 2I49A 2RC9A 5I58B 4RY1A 3TTRA 4DLDA 2V84A 1IXHA 1N84A 3IR1A 5H8QA 1DMBA 3O2AA 5H8SA 2I3WA 2V3QA 2Q8JA 3C9HA 3K4UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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