2QL3A

Crystal structure of the c-terminal domain of a probable lysr family transcriptional regulator from rhodococcus sp. rha1
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
205
structure length
205
Chain Sequence
VAGPIAVGCYPALGPTILPSMLYAFTAEYPRASVEFREDTQNRLRTQLEGGELDVAIVYDLDLSPEWQTVPLMTREPMVVLGAEHPLAGVDGPVRLADLAEHPMVLLDAPPSTNHAMDVCREAGFAPRVAYRTANFETARAFVGRGLGWTLLLQRPRVDVTYEGLPVVVKPIAEPKPASVAVVVAWHQEATLSRVARAFIRFVTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The crystal structure of the C-terminal domain of a probable LysR family transcriptional regulator from Rhodococcus sp. RHA1.
rcsb
molecule keywords Probable transcriptional regulator, LysR family protein
molecule tags Transcription
source organism Rhodococcus sp.
total genus 47
structure length 205
sequence length 205
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ql3A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ql3A01
2AYSA 2G93A 1LB9A 1QUIA 4AB6A 1A8FA 3K2DA 5H8NB 1NKXA 4ZEDA 5AA2D 5DVFA 4OENA 4BDRA 2ZYMA 3VV5A 2F35A 3PUXE 1P1NA 2Q9TA 4YICA 3OO9A 2DWIA 1LAFE 1BLFA 3GXAA 1B3HA 1XC1A 2F6PA 3TYHA 5H8FA 2O1LA 4H0WA 3HPIA 1R6ZA 2FYIA 4BDOA 2H5YA 1ZMGA 2V84A 3OO7A 1OQGA 3UA8A 3H7MA 1GR2A 3B6TA 5H8SA 5AA4A 2Z8DA 3S9NC 3CG1A 3Q28A 3TDJA 2QPQA 3ZKKA 5ISUA 4LUBA 2LAOA 4LZ5A 4E0WA 1FQCA 4I8CA 1LGBC 5FTHA 3O97A 3BBRA 3GBAA 2DXRA 4DDDA 2DVCA 3HSTA 3KOSA 1SBPA 4C1UA 4KYEA 4PFYA 3K1MA 3H4ZA 3TCGA 5CBSA 2UVGA 4OEVA 1B7ZA 4YAHX 2OBGA 4PQJA 4FORA 3W15C 5CM6A 4FEDA 5B70A 3LBSA 2D21A 3O6IA 3KN8A 3SEWA 3U8QA 3G3JA 3KOTA 4GXSB 4MFIA 1NNFA 3MC2A 4WEPA 3IJXB 4HCWA 3JZJA 3OSRA 3OO6A 4EQBA 2HCAA 4EQ9A 3W9WA 3L6GA 5AA4B 3MP6A 1VFEA 5L9MA 1LAGE 1CB6A 5AA3A 1RYOA 3IOUA 5AA2A 3B7DA 1QUJA 1N3WA 1IEJA 4JWYA 1MXZA 4F2QA 1PBPA 4F3BA 3DP4A 1ANFA 3PMWA 2OLBA 5I84A 1MY3A 4F29A 1H43A 4R6KA 2XX8A 5H8QA 2P0SA 5IAIA 2Q2CA 3VVDA 2O69A 1PC3A 1LB8A 1OVTA 3MP8A 3FXQA 3EHUA 5L9OA 2Z22A 1O64A 2I3WA 4F1YA 1QVSA 4GVOA 4QFNA 5IKBA 3C31A 3KSJA 3V5AA 3MVWA 4IO6A 3UK4A 3QUJA 3KZGA 5I58A 3RY3A 1EH3A 4ONYA 2WKYA 2QSXA 4TLLB 2DXYA 4U23A 2F34A 4G68C 3S4UA 3G3HA 3BKIB 4R74A 3R7XA 5ELVA 5AA2B 2IA4A 2OK2A 3C32A 3BFUA 1EZOA 4BLAA 3T9UA 1MQIA 1ZJLA 3K6WA 4DE8A 1URSA 2V93A 5H8HA 2RC8A 3RT6B 3N5LA 4H6DA 5H8QB 3TTMA 2VD3A 3ZSFA 2NOOA 1IXIA 3FASA 1MG1A 3KBRA 1VFDA 3K1NA 3V8XB 5I56A 1P1QA 4LQ2A 2UVJA 3KGCA 3EPEA 5FTIA 1OVBA 3FJGA 3MPKA 1O63A 5I58B 3T93B 1SVXB 5TP9A 1DSNA 2I48A 3O9PA 4LATA 4HTGA 1SI1A 1DMBA 4GWOA 3PPRA 3FD3A 1NMUA 1ZIUA 3IR1A 4HS7A 1B32A 1BKAA 3TMGA 1B40A 3EQ1A 1P1OA 1MDP1 4YKIA 2NUVA 1BIYA 4GXAA 2D5WA 3DLNA 1MQHA 2QJEA 4IO4A 4U4SA 4R75A 3CVGA 5CMMA 3C33A 4IO3A 1UTHB 4FJPA 4N6PA 3T66A 2DVZA 4ZEKA 4OZ9A 1MRPA 2ALUA 1N7XA 1MPDA 5I56B 1MXVA 3N94A 1MPBA 1H44A 4NEDA 3JV9A 4N07A 4KYDA 2I49A 1MQGA 1JEUA 4JSDA 5TP9B 1SYHA 3C36A 4XKRA 3PV0E 3O66A 3K01A 4ZDMA 1CE2A 3AXFA 3SESA 4YB7A 2VP1A 1JW4A 2UVHA 4XTCQ 4FAJA 3M8UA 2QMXA 3PMXA 3T9VA 3FGSA 1XVXA 4XKPA 4ELPA 4ELRA 2ONSA 4U2RA 4Q0CA 3FATA 3FUZA 1OMPA 1IXHA 1NNKA 1B5HA 1MY1A 4YKKA 1MY4A 3OEKA 3Q26A 3C35A 5H8NA 3TKDA 1FQBA 2PT2A 4G4PA 2DP8A 1MH3A 4GL8A 4THIA 3UP9A 4ZS9A 1POTA 2G29A 2F97A 4IY5A 2YJPA 4PFTA 1R9LA 3UIFA 3EN3A 4IO5A 1A54A 4R6HA 3VDFA 3Q27A 1NH7A 3B6QA 5ITOA 5HPQA 3A3UA 5BUUA 2B65A 4XKQA 4LONB 1OLCA 2DWAA 1Q1KA 5I59A 1F9BA 4U4XA 1US5A 1NH8A 3VLWA 1YPNA 1SQYA 3FIRA 2PMSA 3IO4A 4YB5A 4TQUQ 3RLFE 5JK4A 4O3CA 4LA9A 3GBBA 1QW0A 2F7AA 2Z8EA 1D9YA 4JWXA 4Z7EA 1XHYA 2OWTA 3TTKA 2P2AA 2B3BA 2X7PA 3K0VA 3LSLA 2H25A 2Q89A 3QUFA 1MQJA 1MQDA 2E1SA 4R2FA 4KHZE 1LFIA 2RCAA 4BDMA 2V3TA 4H5FA 1GV8A 4POWA 4YMBA 1DPPA 3M3FA 1Y3PA 2DS9A 5K2YA 4JWOA 4X9TA 1Z7ME 3PPPA 3T9XB 1FQAA 3CFZA 3KJ7A 3OD7A 4I1DA 3TFLA 1TXFA 3U92A 4R9GA 5EYFA 5M2VA 3FXRA 3TELA 3SERA 1GVCA 1PDAA 2ZYKA 4RJZA 5I59B 2F5XA 5KZTA 3N6UA 4MBPA 2O7UA 2HAUA 4WEDA 2KLFA 4PFWA 2XXHA 2NWJA 3TCHA 3W9VA 5I2KA 3MZ9A 3MZBA 1P1WA 2BJJX 3TTLA 3I6VA 5LOMA 2PX1A 4PE5B 4GRKA 3G3KA 1VE4A 1Y4TA 1UIVA 4H65A 4ELOA 2X26A 3CG3A 1IITA 3TQLA 2XD3A 4R6YA 3T22A 4IO7A 2I4BA 2PBWA 4EF2A 3EHSA 1A40A 4OXVA 3S9MC 2HFBA 4LZ8A 3IB0A 1TFDA 4NWDA 2H98A 5DYHA 3CI8A 3DP8A 5ITPA 4OMBA 3Q25A 3SKPA 3KEIA 3E4RA 1MY2A 2H9BA 1MM7A 1QJMA 2RC7A 4NMYA 2V3QA 4XXUA 1A8EA 3K4UA 1B6HA 5AE4A 3DM0A 5I2KB 1N0TA 3HCQA 2A5SA 4PETA 4Z0IA 4F1UA 4M4GA 4OQOA 2A5TA 2O7IA 1IXGA 4O3BA 3TTRA 1UQWA 1M5EA 4FIMA 4N13A 3CSGA 1JQFA 3N6TA 3O2AA 3E9XA 2XX7A 2REGA 4YKPA 1B7HA 1HSJA 3FVGA 4GD5A 3VLUA 3N26A 2RF1A 4IGTA 4NWCA 2O51A 4G8NA 2XXUA 3KN7A 3R6UA 3U93A 4QSCA 4JB7A 3MVYA 2VGQA 1LBCA 4YKJA 2QRYA 2GFEA 3VXCA 2QS1A 3TTNA 2Y7KA 1UTBA 2PT1A 4LVQA 4X1BA 4ESXA 3H3GA 4LZ7A 1HSEA 4EDPA 5L9SA 4OWDA 4QFKA 3RQTA 1ATGA 3M3LA 4I9DA 1MS7A 4QFPA 1SW5A 4TLMB 2A5TB 4TOZA 4KD5A 5KCJA 1UIUA 3SETA 4EUOA 2HQ0A 4NF5A 2M8CA 4QSDA 2GHBA 4NF4A 4OEUA 2VD2A 4GF8A 3IO6A 4HCYA 1JEVA 1FCKA 3CSBA 5L8DA 3B6WA 5CMBA 1SD3A 3A09A 3TCFA 1NFTA 1I6BA 4GOTA 4Q8RA 1B5JA 2XXRA 3SEYA 4RXLA 1MY0A 1LLSA 1UTHA 2ZYOA 4AQ4A 3THIA 4KPTA 4DLDA 1URGA 3LUYA 1D3KA 2D3IA 3O6GA 1FQFA 3MVXA 5AA1A 4UA8A 5JEIA 1JW1A 4BDNA 2XD2A 3SEUA 1S50A 1DOTA 1UTBB 3IK6B 2F7CA 1OLAA 4EXKA 3FV1A 4KQPA 3D4CA 3MPLA 3PUVE 1JVXA 2O1MA 3FXUA 5DEXA 2CZLA 4M1VA 1S7YA 4YMAA 2QS4A 4LQ5A 3PPQA 1N04A 2XXQA 5KCJB 2Y7PA 5F1QA 3LSXA 4NF5B 2DE3A 2HZKA 3OO8A 4IB2A 2X7QA 4NF4B 1H3DA 1ELJA 3O29A 4QFOA 3H06B 1BTJA 1M5BA 4IGRA 4DXBA 4AB5A 3RN8A 1N76A 5CBRA 3ILUB 5J1DA 1B7UA 4RNSA 3EF7A 2XXWA 5EHSA 2XXXA 2DOJA 3IX1A 2ZNUA 4YU0A 2I6EA 1H76A 4DIGA 3G3GA 2NXOA 1FQDA 2B3FA 2UYFA 1TWYA 4G77A 4NTLA 4OFLA 4FE8A 4GLIA 3FJMA 1SI0A 3PUWE 3A3CA 2ZNTA 1A55A 1URDA 1EZPA 2VOZA 4IO2A 3SEVA 4P11A 5DEXB 2HEUA 4KI0E 1FW0A 2R9JA 3MZ1A 3BFTA 1ZKBA 3KFMA 4F22A 2CMOA 3R26A 3MWBA 1B4HA 1S9TA 3IOVA 3OENA 1IQ7A 2IEEA 5FHMA 1FTLA 4U21A 1NL5A 1Q35A 3Q29A 2OWSA 1LAXA 1XS5A 1B05A 1JNFA 1VR5A 3UN6A 2NVUB 1B0HA 4H8JA 2P1SA 3PD8A 1PB7A 4G8HA 2GHAA 3KSXA 1RKMA 1B58A 4QRZA 3CR9A 4RPNA 3L6HA 4OHNA 5CI5A 1ZLQA 3LR1A 3TEPA 4O3AA 1B9JA 1YCJA 4PP0A 3V89B 4ZEIA 3PPOA 4MH5A 1MPCA 2DE2A 2PVUA 3ILTB 3QSLA 3KJTA 1PB8A 1FQEA 3DELB 4F19A 1MXWA 2O6AA 4OVJA 3VVFA 1B1HA 2GRVA 3IL1B 2ESNA 4UACA 3C4MA 4G68A 2Q2AA 5ICQA 1US4A 2ZNSA 4LP2B 3G3IA 5KDTA 3ECRA 4QFLA 2DSFA 3T9HB 1B2HA 3QXMA 1N84A 2I3VA 4R9FA 3U1OA 3MUQA 3KG2A 2QL3A 4QHQA 1NNTA 1AH5A 3SEXA 4ZE8A 3ONMA 1MH4A 1M5DA 2F36A 3HV1A 4MLVA 1N7WA 4ZZAA 2GH9A 3RNNA 3C34A 4OFOA 1PBQA 3ODBA 3SDFA 5A5XA 1LCTA 4P0IA 4XKNA 4F1VA 1Y1ZA 2E0SA 1B3EA 1JVYA 4X1DA 2R6GE 3K6UA 3PGFA 2AL5A 2AIXA 2OJTA 4G68B 2RC9A 2DWJA 1SW4A 3ZKLA 1B51A 2Q8JA 1MM6A 1FTMA 3OXNA 1II5A 4I62A 4F39A 3IOTA 1AMFA 5DVIA 1IIWA 3USDA 5DT6A 4ND9A 4ZEBA 5KDTB 1O7TA 1B3LA 1RYXA 1M5CA 1B3FA 3S9EA 1GTKA 3LC8A 1FTJA 5BWJA 4RK9A 2F8DA 2REJA 4P0GA 3IJOB 4F31B 1A7LA 3RTFB 3HN0A 3QIMA 1NNPA 3MAMA 3H03A 5TU0A 1L5TA 4G8MA 1EZ9A 5I2NA 1HSLA 3FVKA 1OIBA 2VHAA 3PU5A 4H8IA 3VE1B 2DQVA 3CIJA 4ZECA 1J1NA 1AIVA 5HM4B 1B0LA 1OQHA 2F7BA 1D9VA 5ICTA 1LBBA 3QK6A 2UVIA 4H1XA 3EHTA 3K02A 3S9LC 5A5XB 1MXUA 1VSOA 4JXIA 4DCYA 1R1NA 4L17A 4HW8A 5H8FB 2XXVA 4BDLA 1ZU0A 4IY6A 4GL0A 1FTOA 3OMBA 2QS2A 2UYEA 4NE4A 3E3KA 4ZE9A 2Y7IA 2QMWA 4EQ7A 1B5IA 1XOCA 3FZVA 1LSTA 3GLBA 4F3GA 1IXCA 4Q5TA 4ELQA 3P7IA 2ONKE 2XXTA 4JSOA 5FHNA 4U22A 2HXWA 1Z7NE 4OERA 3H6VA 4XIGQ 4RYAA 3DP6A 5CMCA 3V83A 1Y20A 4K3FA 4FEBA 4RA1A 5I2NB 1EU8A 3TZAA 4OETA 4NF8A 4F2OA 2F6GA 4POXA 2Y7WA 2Q88A 5TPAA 3E13X 1USYE 4ESWA 4GIZA 3IB1A 5HBCA 4BDQA 3QYTA 2DE4A 2RCBA 3T96B 4U1ZA 1SYIA 1ZTYA 2XX9A 4FATA 3I3VA 3UGWA 3H6TA 1Y3NA 1TFAA 1JW5A 2XXPA 2OCUA 3MJNA 3HHFA 1KWHA 1MXXA 1I6QA 1D4NA 1LCFA 1WVJA 1P99A 3G3FA 4F3SA 4R72A 5B7DA 1SW2A 1Y1MA 1B1XA 2R71A 3MBPA 1PEBA 4OTEA 3CFXA 1QKAA 1B4ZA 3PUZE 4NF8B 4MF3A 2HAVA 1LFGA 2XXIA 4KYSA 4FECA 5TPAB 1P1UA 4KCCA 2O68A 2FA7A 3GZGA 3MQ9A 4RPOA 3RPWA 2FNCA 3RT8A 3HHGA 3K6XA 5CC2A 1Y3QA 5I57A 3K1PA 3FVOA 2QS3A 1IUDA 3TAJA 4YB6A 2Y84A 2I4CA 1Y4CA 3C9HA 3OSQA 4RK2A 1PB9A 4E0XA 2H4IA 4EF1A 4G2ZA 4OFJA 3I5OA 4PFUA 3FVNA 3O6HA 2RINA 4R73A 2Y7RA 1IZ1A 1SDXA 2XXYA 3OELA 3PMVA 4QSEA 2I0BA 4U1OA 2V3UA 3S2VA 5H8HB 4DXUA 3FV2A 2V25A 1XT8A 2H99A 1AL3A 1YAEA 3VFJA 4R2BA 4DCXA 4F18A 3MVZA 4OESA 3PPNA 3TQWA 1A99A 1FTKA 2OZZA 4NF6A 2F78A 2ZMBA 1QUKA 1I69A 1QKBA 1DTGA 4KR5A 4GQOA 3G7WA 1AOVA 5FHOA 4KCDA 1M5FA 2UXAA 4MLQA 5I57B 1B3GA 1MDQA 3RUMA 3IB2A 4OYVA 4C1TA 3KN3A 2RKMA 2O84X 2PYYA 1LAHE 4X48A 4ISUA 4DXCA 2ABHA 1POY1 2ONRA 3TUSA 1XVYA 3VVEA 5JTYA 1B52A 3PD9A 4YZZA 5EHMA 3QAXA 4F3PA 3H6WA 4QF9A 2YLNA 3K6VA 1ZBMA 3JYRA 4ZZEA 3LSWA 4RY1A 2HZLA 4ECFA 5DVJA 2W7YA 4H5GA 1YTVA 3H6UA 2YPNA 1QULA 1N3XA 3VXBA 2XHDA 3MP1A 3WAEA 3ZS6A 3TPAA 1R9QA 1I6AA 2Z23A 2I0CA 4WXJA 5CMKA 3HO7A 3IAZA 3WAFA 1WDNA 2ZYNA 3FJ7A 2DYXA 4NF6B 3U94A 4C0RA 4H67A 1SW1A 4Q30B 4ZEFA 3OEMA 2DWHA 2AL4A 3M3KA 3IOWA 3O28A 3MW0A 3D4GA 3CFLA 2I58A 1TT1A 1MXYA 3IORA 4WKMA 3CRBA 5F7VA 4JDFA 1DPEA 3PUYE 2ANJA 1DTZA 3K00A 1LFHA 1BP5A 1Y9UA 2ZXTA 1T0KA 5JTYB 2THIA 4EXLA 1USYH 3U72A 1GGGA 4JBZA 3F11A 3OOAA 5DTBA 1H45A 2Z8FA 5CRYA 4GFRA 5K2XA 1B46A 4KFQA 3UORA 4DZ1A 3TODA 3LSFB 3RTWB 3VLVA 3RGYA 1WODA 1JETA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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