2QS1A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer in complex with ubp315 at 1.80 angstroms resolution
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Binding site and ligand flexibility revealed by high resolution crystal structures of GluK1 competitive antagonists.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 78
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs1A02
3EN3A 3CSBA 3H6WA 3K6UA 1UIUA 4GQOA 2Y7PA 1FTOA 2UVGA 4MF3A 2XX9A 3O6GA 4GL8A 3RLFE 4KR5A 2O7UA 4NF6A 4OEUA 3RPWA 2DYXA 1NNPA 1URGA 1R9QA 1GTKA 1JEVA 4R9GA 1RYXA 1MXUA 1B7UA 4FECA 3O28A 1JETA 1QKAA 1PB7A 3PPRA 4TLLB 1LBCA 3IO6A 2I58A 1FTLA 1N3WA 2XX7A 2E0SA 1SW2A 3SKPA 2V3QA 4OTEA 3L6GA 4QFKA 4C0RA 2GH9A 1QW0A 4KYDA 1H43A 4G4PA 1B3LA 4RYAA 3CI8A 3CG3A 1MQHA 4XKQA 1MRPA 2DP8A 2ESNA 3N94A 3MP1A 2P2AA 4TLMB 4RPNA 4M4GA 5TP9A 5KCJA 2DE2A 3K6WA 3LSFB 4MH5A 5F7VA 3IORA 1MM7A 2VD2A 2P1SA 1B52A 2D21A 5H8FA 3VXBA 3VVEA 1JW5A 4G8HA 3PPQA 2OBGA 2NXOA 4ZZAA 5ISUA 2ZNUA 3FXQA 4FE8A 4DXUA 4NF5B 5CMBA 1JNFA 3RN8A 3UIFA 1IIWA 5L9SA 1IEJA 5KZTA 3FVKA 1XHYA 1TT1A 2O84X 5LOMA 3S9LC 4JXIA 2UYFA 2OCUA 4OHNA 1B3EA 2FA7A 3PUZE 4UACA 3OOAA 3DELB 4GD5A 2F78A 1B5HA 4KFQA 2O1MA 3QXMA 1PEBA 1B46A 2PVUA 1MPBA 4OETA 2Q2AA 4PE5B 3MVWA 5I58A 4WXJA 1URSA 3C32A 1QKBA 3Q26A 2REGA 4KD5A 2XXRA 5A5XB 3MWBA 4DIGA 5ITPA 1HSJA 2CMOA 2FYIA 3IB2A 1JQFA 3USDA 3QIMA 2NVUB 2QS1A 1A8FA 4H0WA 3DP6A 4BDLA 3O6HA 3R7XA 2I3WA 1SVXB 3CRBA 4G8NA 4QHQA 4LZ8A 4UA8A 3KN8A 3K4UA 3N26A 3C35A 1LFHA 4YKIA 1S7YA 4ZEFA 3FATA 3PV0E 3L6HA 2AYSA 1EH3A 4F19A 4H1XA 1H76A 3PPPA 5AA4B 4JWOA 3RT6B 4ONYA 4GXAA 4RY1A 5BUUA 3KEIA 1NL5A 4EQBA 5HPQA 1CB6A 3C36A 1NH7A 5I56B 2V3TA 3GLBA 2QS3A 1HSEA 4GXSB 5ITOA 2F6GA 3IO4A 4NWCA 2DVCA 1OVTA 4U1ZA 2XXYA 3C33A 2DOJA 3I6VA 3FXUA 1A40A 5CMCA 1N84A 4I9DA 3MC2A 1MQDA 3OO9A 3Q25A 2Y7IA 2Z23A 2XXVA 4LONB 4X1DA 3UK4A 3KSJA 4H8IA 4ZEDA 2H4IA 3G3JA 5F1QA 2VGQA 4ZEBA 3E9XA 1MXZA 2GHAA 2HZLA 4IGRA 5AA2A 1OQHA 2IA4A 4WEDA 3LBSA 4GIZA 1Y20A 4GFRA 3A3CA 1GR2A 4X9TA 2F35A 3TFLA 2HAVA 3QAXA 4JDFA 1ZTYA 4IB2A 5H8HA 5JTYA 3UGWA 5H8NB 5AE4A 3UN6A 1FTKA 3A09A 3OSRA 5H8QA 2ZXTA 2I0CA 2O51A 2F7CA 4P0GA 4PFYA 3S4UA 5TPAA 1ZJLA 4U2RA 1LCTA 3H6TA 4AB6A 2ONKE 4ZS9A 3T22A 2DQVA 3LSLA 3B6TA 2GFEA 2UVIA 5AA3A 1B3FA 5JEIA 3VVDA 4AQ4A 2O69A 2UVHA 4F29A 3VE1B 3KN7A 3RTFB 3TMGA 3T93B 3U93A 1R6ZA 1NH8A 1UTHB 2A5TB 3PD8A 5KDTA 3LC8A 1XVYA 1B7ZA 4TQUQ 1ZMGA 4DCYA 5B70A 1YAEA 4QSEA 2YLNA 2F36A 1D4NA 1MDQA 4DE8A 1VE4A 2XD3A 4I1DA 2UYEA 2VP1A 2H25A 3MJNA 3CFZA 5CC2A 4OWDA 2RC7A 4OFOA 1MXWA 3JYRA 4DXBA 2ZYNA 4F3BA 1VSOA 4MBPA 4L17A 5I59A 1UTBB 3B6QA 1ZBMA 1QULA 3CSGA 1DTGA 5K2YA 2H5YA 3IJXB 1B3GA 2W7YA 4OENA 2F97A 4QFPA 2ZYMA 4NWDA 2RINA 1SI1A 1GGGA 3EPEA 4GRKA 3H3GA 5DT6A 3ZSFA 3E3KA 4Q30B 1QVSA 2QMWA 3MZBA 3OEMA 1TXFA 4IO5A 1MXXA 4ZECA 4Z0IA 3THIA 1B05A 3TKDA 4GOTA 3U72A 3OO8A 4I62A 1M5EA 1FQBA 1US5A 1Y3QA 4MFIA 1QUKA 2O68A 3SEVA 1DMBA 4POXA 1JW4A 1OLAA 4IO3A 3RT8A 4NEDA 1SW4A 3KJ7A 4OERA 1TWYA 4RNSA 5DVFA 5CMKA 1ZLQA 3KOSA 3G3KA 1B1HA 1II5A 1AOVA 1YTVA 4FATA 4QFOA 3ONMA 5DEXA 1DSNA 2F6PA 4EF2A 1WDNA 3GZGA 3GXAA 2HAUA 4F2OA 4YB6A 3HO7A 4OYVA 4F1YA 4U23A 1MQJA 2XXHA 4IY5A 4NF6B 5FTHA 4G68A 2E1SA 3UP9A 1H3DA 4ELOA 1PB9A 1P1QA 2X26A 5HM4B 3KG2A 4ZZEA 2QL3A 1LAHE 4GL0A 3KGCA 3TYHA 1B5JA 2PBWA 2F7BA 1Y3NA 4YMBA 4HTGA 4YZZA 1POY1 4ISUA 2ALUA 3HV1A 3IR1A 4GLIA 4IGTA 1FQAA 4R6YA 4X1BA 1P1NA 5FHNA 2XXIA 4O3AA 2DS9A 2Z22A 2H9BA 1RYOA 2Y7WA 3O6IA 4NF4B 4QRZA 3MVZA 5H8SA 2QJEA 5TP9B 5KCJB 3PD9A 3ZKKA 4ELRA 4OMBA 3BFTA 4I8CA 2B65A 4KQPA 1BKAA 5H8FB 3UORA 1PC3A 3W9VA 4GVOA 3FGSA 1QUJA 3HPIA 1IXIA 1VFDA 3RY3A 4DCXA 3E13X 3MPLA 1ANFA 4F3SA 4N6PA 3EF7A 2HXWA 3QK6A 3TCHA 4N07A 1B0HA 3TAJA 1FCKA 3VDFA 4F3PA 3PMVA 2QS2A 3QUFA 3TELA 5AA2D 3CFXA 1FQEA 2XXTA 1DOTA 4JSDA 4PQJA 3ILTB 5I84A 1LFIA 4G68C 5CM6A 1Y9UA 5EYFA 4NF5A 4YKPA 3VLVA 2V3UA 3KSXA 5I58B 3LR1A 5EHMA 4G77A 1USYH 4G8MA 3D4CA 1P1UA 1MS7A 2Y7RA 3VLUA 1IXHA 4WKMA 4HCYA 2DWIA 3G3FA 5CMMA 4NF8A 2Q9TA 4THIA 3Q29A 5J1DA 3AXFA 2HFBA 3LSWA 2XXXA 1MPDA 2OJTA 2Q89A 3OD7A 1LFGA 4DLDA 1O64A 3ILUB 1KWHA 1AL3A 3LSXA 4P0IA 3T9XB 1WODA 2UVJA 5A5XA 4QFNA 1MQGA 2DWAA 1IXGA 3TQWA 1FQDA 5EHSA 2D5WA 3V89B 1RKMA 1SBPA 1NNTA 4R9FA 5TU0A 2PYYA 1B1XA 3EHSA 1DTZA 4EUOA 4QSCA 2HZKA 1H45A 3KFMA 1B5IA 4EF1A 1B3HA 1L5TA 1LCFA 4F3GA 1SD3A 3H03A 3PPNA 4XKNA 4H5GA 1FQFA 4H8JA 3IK6B 4AB5A 3JZJA 2H98A 1WVJA 4POWA 4RA1A 4MLVA 4RXLA 4BDQA 2ABHA 1NNKA 3K1MA 1B2HA 1MH3A 5I2KB 4HCWA 2O1LA 4RPOA 3MZ9A 1DPPA 1USYE 4O3BA 5M2VA 4YKKA 3VVFA 1P1OA 5FHMA 1ZKBA 4U4SA 3TTLA 4ELPA 3B6WA 3TODA 3VV5A 1JEUA 3KN3A 4BDOA 4MLQA 2DE4A 4X48A 1N7XA 5H8HB 2PMSA 5JTYB 2AIXA 3FV1A 5FHOA 4EQ7A 3TCFA 4ESXA 1B9JA 5I2NA 3W9WA 2Q88A 5CBSA 3QUJA 4F22A 3P7IA 2VD3A 3OELA 1D9VA 4JWYA 1FW0A 4H5FA 4O3CA 4Q0CA 3U92A 5TPAB 4G2ZA 3SETA 3G3IA 3KBRA 4JB7A 1LAFE 1F9BA 4C1UA 3SEWA 5H8NA 1ATGA 4OQOA 1A7LA 4N13A 1A8EA 4EXKA 1UIVA 4WEPA 1P1WA 3FJMA 4F1VA 4KPTA 3IL1B 4OFLA 3SERA 1UQWA 3DP4A 2XD2A 1SYIA 4ECFA 3SEUA 2RKMA 2QSXA 2F7AA 4GF8A 2AL5A 5AA1A 5L9OA 4OEVA 4IO7A 4LQ5A 2VHAA 3C31A 3N6UA 4BDMA 3M3LA 4KYEA 1SQYA 1MG1A 2I6EA 1DPEA 1MQIA 1CE2A 1XT8A 1EZOA 5I59B 3RTWB 4DZ1A 1O7TA 4R72A 1MY1A 4R74A 2NUVA 3U94A 1GVCA 3K1NA 3K00A 5DVJA 2RC9A 1OVBA 3IX1A 3OMBA 3D4GA 4R6KA 1FTMA 1PDAA 3K2DA 4C1TA 4F2QA 4XKRA 2D3IA 1B0LA 1I6QA 3OENA 4P11A 4ZDMA 1BTJA 3Q28A 2HEUA 4NE4A 2XXPA 1IQ7A 1JW1A 4H6DA 3K6XA 1MY2A 2ZNTA 4HW8A 1NMUA 2Z8DA 2I0BA 4PFWA 3DP8A 1VR5A 1AH5A 3M3KA 4YB7A 3TDJA 2REJA 3T66A 1B32A 3PUWE 4IO2A 3FJ7A 4KCCA 1NNFA 4KHZE 4JSOA 5FTIA 3GBAA 5I57A 2GHBA 1US4A 4Q8RA 1XS5A 3MAMA 4RK9A 1J1NA 2PX1A 2RF1A 3OO6A 3EQ1A 2R6GE 4NMYA 3KZGA 4KI0E 1QJMA 3K02A 1IUDA 1R9LA 3H06B 1M5CA 5DEXB 1EU8A 5ICQA 2Q8JA 3RUMA 1IITA 2RC8A 1M5FA 3HSTA 1LLSA 5ICTA 1Z7ME 5K2XA 1H44A 3U8QA 3E4RA 2UXAA 4TOZA 4G68B 1XOCA 2HCAA 3FIRA 3I5OA 1A54A 1FQCA 1Y4CA 2AL4A 4QSDA 5DVIA 4OXVA 4PFUA 1Y3PA 2I48A 3O29A 3EHTA 1I69A 3KOTA 1NFTA 1SW1A 3CG1A 3TQLA 2F5XA 2Y84A 5DTBA 2YJPA 3QSLA 5JK4A 4DXCA 3IJOB 1O63A 3TTMA 3PPOA 4ZE8A 4IO6A 1Y1MA 2F34A 1ZU0A 3G7WA 1S9TA 1R1NA 3B7DA 4Z7EA 2M8CA 3ZKLA 4LZ7A 1MM6A 2ONSA 1Z7NE 1T0KA 1SYHA 1B58A 3JV9A 4PETA 4NF4A 3RQTA 3MPKA 2V93A 2XXWA 3FJGA 1AMFA 1GV8A 3HHGA 4EQ9A 3KJTA 3CIJA 4RJZA 3T9HB 3HN0A 1FTJA 2XXQA 3LUYA 3PGFA 3N6TA 3SDFA 4YB5A 1A55A 1TFAA 3PMXA 1SW5A 4R73A 4R75A 4QFLA 1LAGE 3OXNA 1B40A 4F39A 4YICA 3MQ9A 5CI5A 3O2AA 4ND9A 4LQ2A 5BWJA 4KYSA 5DYHA 3IOUA 3V8XB 3FVOA 1A99A 4NF8B 1ELJA 4ELQA 2XXUA 4U1OA 3BFUA 3TCGA 3MVXA 4U22A 4DDDA 4OESA 1M5BA 2HQ0A 1LSTA 4XKPA 2ZNSA 2PT2A 2OZZA 1Y4TA 1M5DA 2BJJX 4XXUA 4H65A 3H7MA 1LBBA 2O7IA 1MY0A 4LVQA 3FXRA 2NWJA 4K3FA 3CFLA 4FEBA 1N04A 4U21A 1TFDA 2ANJA 3OSQA 5B7DA 3A3UA 3R6UA 3MP8A 1IZ1A 2RCBA 3C34A 4YU0A 3S9MC 3H4ZA 2GRVA 4KCDA 4Q5TA 3DLNA 2NOOA 1B51A 4EXLA 4BDRA 1NKXA 3H6VA 3IOVA 3IOWA 3CVGA 3ECRA 4LP2B 3TUSA 2WKYA 3FASA 2XHDA 3ZS6A 1B4HA 4ESWA 4HS7A 2Z8FA 5AA4A 3G3GA 3K1PA 2Q2CA 3RGYA 1XC1A 3IOTA 4R6HA 2ZYKA 3M3FA 2I49A 1YPNA 2DVZA 3WAEA 3T9UA 5I56A 4LUBA 3IB1A 2OLBA 2CZLA 2DSFA 4E0XA 2QS4A 2YPNA 5AA2B 2FNCA 4IO4A 4QF9A 3MBPA 2X7PA 2R71A 4JBZA 3DM0A 1OMPA 1Q1KA 1SI0A 5IKBA 2PT1A 3OO7A 5I2NB 3R26A 5I2KA 3BBRA 1PBQA 3MVYA 2F8DA 5L8DA 3MUQA 5HBCA 3FV2A 3N5LA 5H8QB 1LB9A 3VFJA 5L9MA 3BKIB 2THIA 3T9VA 2OWSA 4U4XA 1I6BA 1MXVA 2OWTA 1P99A 4R2FA 1AIVA 3UA8A 2H99A 4ZE9A 2LAOA 3SEXA 3FVGA 3HHFA 3S9NC 4ZEKA 3ODBA 4GWOA 3K6VA 3FZVA 2QRYA 1ZIUA 5ELVA 1EZPA 3PMWA 1N3XA 3OEKA 3TTNA 3TPAA 2X7QA 2ONRA 5KDTB 4H67A 4XTCQ 1I6AA 1D3KA 1VFEA 3MZ1A 4YMAA 3FVNA 4PP0A 4BDNA 2B3BA 1XVXA 2G93A 3S9EA 1MH4A 4ZEIA 2OK2A 3C4MA 3H6UA 2IEEA 3WAFA 4E0WA 3TZAA 3TEPA 3GBBA 1OIBA 4R2BA 1LB8A 1UTHA 2A5TA 3M8UA 3PUVE 4M1VA 2I4CA 1BP5A 2DXRA 2P0SA 3K0VA 2DWJA 4FEDA 4RK2A 3MW0A 4F18A 4OZ9A 2V25A 1N0TA 3TTRA 4LATA 3VLWA 2O6AA 1MDP1 4OFJA 2ZYOA 4BLAA 3IAZA 2B3FA 2R9JA 5CBRA 3FD3A 1N7WA 3C9HA 3SEYA 3QYTA 2V84A 1SDXA 4YKJA 2DWHA 2Z8EA 1D9YA 1UTBA 3RNNA 4LZ5A 4F1UA 3O66A 3MP6A 4LA9A 2XX8A 2G29A 3F11A 3K01A 1N76A 3V83A 1QUIA 3HCQA 2QPQA 2VOZA 4NTLA 4JWXA 1BIYA 3VXCA 2Y7KA 1YCJA 4FAJA 1EZ9A 4FORA 1PBPA 4IY6A 1JVXA 1MY4A 3G3HA 4OVJA 1MXYA 3Q27A 1MPCA 3V5AA 5I57B 5IAIA 3S2VA 3CR9A 4XIGQ 2RCAA 3TTKA 2DXYA 3IB0A 1OQGA 2QMXA 1JVYA 1PB8A 4F31B 3W15C 1IXCA 3SESA 4FIMA 1B7HA 3I3VA 1MY3A 1B6HA 2ZMBA 2I4BA 1B4ZA 1Q35A 3U1OA 3O9PA 1S50A 4FJPA 1POTA 2DE3A 3PUYE 4EDPA 4PFTA 1URDA 4YAHX 3O97A 1LAXA 1Y1ZA 2I3VA 1OLCA 1BLFA 2KLFA 2A5SA 3PUXE 1HSLA 3PU5A 3EHUA 1LGBC 3FUZA 3T96B 5CRYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EN3A 1IMAA 3CSBA 3H6WA 3K6UA 3T1BA 4OVQA 1UIUA 4GQOA 2Y7PA 5EQ9A 1FTOA 2UVGA 4MF3A 2XX9A 3O6GA 2WEFA 4GL8A 3RLFE 1Q9DA 2O7UA 4KR5A 4NF6A 4OEUA 3RPWA 2DYXA 1NNPA 5IZ1A 1URGA 1R9QA 1GTKA 1JEVA 4R9GA 4HE0A 4MCOA 1RYXA 1MXUA 1B7UA 4FECA 3O28A 1JETA 1QKAA 1PB7A 3PPRA 4TLLB 1LBCA 3IO6A 2I58A 1FTLA 1N3WA 2XX7A 2E0SA 1SW2A 3SKPA 2V3QA 4OTEA 1IMEA 3L6GA 4QFKA 4C0RA 2GH9A 1QW0A 4KYDA 1H43A 4G4PA 1B3LA 4RYAA 3CI8A 3CG3A 1MQHA 4XKQA 1MRPA 2DP8A 1JP4A 2FIXA 2ESNA 3N94A 3MP1A 4NGUA 2P2AA 4TLMB 4RPNA 1FPIA 4M4GA 5TP9A 5KCJA 2DE2A 3K6WA 3LSFB 4MH5A 4GX3A 5F7VA 1NUWA 1CNQA 3IORA 1MM7A 2VD2A 2P1SA 1B52A 2D21A 5H8FA 2WYPA 3VXBA 3VVEA 1JW5A 1EYKA 4G8HA 3PPQA 2OBGA 2R8TA 2HHMA 1LBYA 2NXOA 4ZZAA 1YXIA 5ISUA 2ZNUA 3FXQA 4FE8A 5EYHA 1KZ8A 2B4LA 4DXUA 4NF5B 5CMBA 4FBPA 1JNFA 1KA1A 3RN8A 3UIFA 1FBHA 1IIWA 5L9SA 1FBGA 1IEJA 5KZTA 3FVKA 1XHYA 1TT1A 2O84X 5LOMA 3S9LC 1NV0A 4N91A 4JXIA 2UYFA 2OCUA 4OHNA 1B3EA 2FA7A 3PUZE 4GWWA 4UACA 3OOAA 3DELB 4GD5A 4PAKA 4LN5A 2F78A 1B5HA 4KFQA 2O1MA 3QXMA 1PEBA 1B46A 2PVUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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