2QS2A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer in complex with ubp318 at 1.80 angstroms resolution
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Binding site and ligand flexibility revealed by high resolution crystal structures of GluK1 competitive antagonists.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 79
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs2A02
1IXIA 2B3FA 1Q35A 4MH5A 3I5OA 4FORA 3D4CA 2GH9A 3SEWA 2DWIA 4JDFA 4HCWA 3RGYA 1JEVA 4KR5A 3H6VA 4NWDA 3IL1B 3OSRA 3EHTA 2R6GE 3HSTA 4IO7A 4TLMB 2BJJX 1MQHA 4OTEA 3G7WA 3F11A 2Z8DA 3MJNA 3FD3A 4H6DA 1LCFA 1SI1A 2VGQA 1PB8A 4PE5B 4G68C 3C9HA 4M4GA 1H45A 2IEEA 3MP8A 4OXVA 5H8QA 3CVGA 4Q0CA 3OEMA 2V3QA 1MQGA 1FTOA 4RK9A 3KN8A 4F2OA 1R1NA 4Z7EA 3H6TA 3FASA 3KBRA 2H99A 4X48A 2HQ0A 2P0SA 1P1NA 3A09A 1ZIUA 2DQVA 4GL8A 4BDRA 3RUMA 2LAOA 1JW1A 1IEJA 3RTFB 3FXQA 2Q8JA 3G3JA 1ELJA 3S2VA 5HPQA 5I2KA 5I84A 1TXFA 1MXUA 1Y3QA 3SDFA 4ELPA 3IO4A 4F18A 3EN3A 4EDPA 4P0IA 1VR5A 3TCFA 2PMSA 3G3HA 4IO4A 3O6IA 2DXYA 2O6AA 3O6HA 3RT8A 1QKAA 4EXLA 5H8NB 4OFOA 3IR1A 3HPIA 4RK2A 3OO6A 4R75A 4O3AA 5H8HB 4YAHX 3AXFA 1MPDA 2REJA 1A54A 1GTKA 3I3VA 3UIFA 1OIBA 3TYHA 3CFZA 2NWJA 1D4NA 5IAIA 1CB6A 3FJMA 2I4CA 1B4HA 4DXBA 4BDMA 1A55A 4F1VA 2NVUB 3K02A 2Q89A 1EH3A 5DEXA 3O6GA 1N7XA 5JTYB 4LZ7A 4OWDA 3RY3A 3QYTA 1BKAA 3TPAA 1ZU0A 3LR1A 2HZLA 3O97A 5A5XB 4XKPA 1MH4A 4H1XA 1XC1A 3UA8A 1SD3A 4U21A 1TT1A 3G3GA 3TEPA 4MLQA 2XD2A 3LSXA 1LAGE 1TFAA 2F6GA 2ONKE 3PD9A 5DVJA 3VXBA 4U2RA 1GR2A 4RYAA 2X26A 4R6YA 5I58A 2XXTA 4QFLA 2F7AA 4IO6A 3TDJA 1VFEA 3IB2A 2HEUA 1WVJA 4OFLA 2RC9A 1B5JA 1MDP1 1NNTA 3U92A 4EQ9A 1JW4A 2W7YA 1MY3A 3V83A 2OBGA 4F1YA 3DP6A 4ESXA 1R9QA 3B6TA 2RF1A 3FVKA 3BKIB 4Q5TA 2Y7KA 2UVIA 2A5TB 4ZECA 4JWXA 2O7UA 2RC8A 4DXCA 5KDTA 3VVFA 3H6UA 4NWCA 3A3CA 4XXUA 2DSFA 1M5BA 4ELQA 4OETA 3I6VA 1MXWA 2V25A 2PT1A 2DWJA 3H4ZA 4DIGA 4NF8B 3CSBA 1QULA 4FEBA 3MVYA 2X7QA 3C31A 2P1SA 4GOTA 3USDA 4N07A 4P0GA 1UTBB 4R6KA 3B6WA 1Y20A 4N6PA 3IJXB 5I57A 4YU0A 3EQ1A 3MPLA 2KLFA 2OJTA 1AMFA 4H8IA 1EU8A 3R26A 2R71A 4RPNA 2ANJA 5AA4A 1B7HA 4QHQA 2AL4A 1N84A 1O7TA 4E0WA 3TQWA 2I0BA 3W9VA 4OVJA 4IGRA 1UIUA 3H06B 4GWOA 2VP1A 1NFTA 4KPTA 2NOOA 3ILUB 1OVBA 3B6QA 1URDA 2QJEA 5K2XA 3K01A 2QS2A 3KN7A 3E13X 4YKIA 2O51A 1O63A 4NTLA 2FNCA 2RC7A 1PB9A 1N0TA 3S9EA 1I6BA 5I2NB 1ZKBA 4TOZA 2AIXA 3OO7A 3QUJA 2XX7A 3RT6B 3C32A 1JNFA 3ZSFA 4K3FA 4KYDA 4WXJA 1XHYA 2A5TA 3OO9A 4Z0IA 4DCXA 3LSFB 1DPEA 3MWBA 3FXUA 4ZE9A 1PEBA 4UACA 4JWOA 3TAJA 5DVIA 4YB5A 4LUBA 2AL5A 4LVQA 2OCUA 3ODBA 1N04A 1N3WA 2XX9A 5AE4A 5CC2A 2Q2CA 2I6EA 3U94A 3L6HA 5AA1A 2ABHA 2ZYKA 4ZE8A 4F1UA 3BFTA 3FATA 2OWSA 4HS7A 4THIA 2XXHA 3T22A 1P1OA 1MXZA 3MC2A 4PQJA 3ECRA 1S50A 3O66A 1L5TA 3P7IA 1B51A 2Y7PA 1A40A 4YMBA 3LSLA 2UXAA 3Q29A 4F22A 3RPWA 1JVXA 1LAXA 2Y7IA 4BDQA 3N6TA 3VVEA 3G3FA 5L9OA 3THIA 4F2QA 1JQFA 4AB6A 5B7DA 5BUUA 1Y3NA 3OD7A 3T96B 1H44A 3GBBA 2I48A 4GLIA 3JZJA 4C1TA 4JSDA 2QPQA 1BP5A 5ITOA 2XXRA 4G77A 1MH3A 1KWHA 3SEYA 4QFOA 2WKYA 2O1LA 5DYHA 1QVSA 3MP6A 3TMGA 4RNSA 1IITA 1LFIA 5FHMA 1DSNA 3R6UA 1O64A 1UTHB 2DE2A 2OZZA 1A7LA 1MY0A 4G2ZA 2V93A 3PMWA 1MQJA 3IOVA 5DVFA 4G68B 5L9SA 1FQCA 4C0RA 1SYHA 3BFUA 3H3GA 4GRKA 4NF4A 1BTJA 3SESA 4FAJA 1J1NA 3OELA 3OEKA 2ALUA 1XVYA 1URSA 4WEPA 4ZEFA 3HCQA 4LQ2A 1DMBA 1MXYA 3S9MC 5TP9B 2CZLA 2X7PA 1ZMGA 2AYSA 3A3UA 4IO3A 3N6UA 3O2AA 5CM6A 1B3FA 1H76A 2B65A 3TODA 3CFLA 1PC3A 4TLLB 4PFUA 4NF6B 4QSEA 2XX8A 3SKPA 2RKMA 2O7IA 3PPRA 1II5A 2GHBA 3N26A 1LAHE 2GHAA 4ZS9A 1DOTA 4GD5A 1NL5A 5AA2B 5I56A 2ESNA 4ZEDA 2GRVA 1MY1A 1Y9UA 2DS9A 2PBWA 4OQOA 3WAFA 4OZ9A 4H0WA 3MUQA 2XXUA 1UIVA 4BLAA 1JVYA 3PUYE 2A5SA 1FQDA 2V84A 3TQLA 4XIGQ 3PPQA 5DT6A 2ZXTA 2OLBA 1IUDA 3QAXA 3K0VA 3FJGA 2E0SA 1B0HA 1TWYA 5CMMA 5H8FB 4YKJA 3FUZA 3H03A 4FIMA 4LQ5A 3CR9A 1N7WA 4QFNA 1B5IA 3M3FA 1QJMA 1B1XA 1YAEA 5TPAB 3LBSA 1R6ZA 4H65A 2V3UA 2F36A 1NMUA 2ZNUA 3FZVA 4RXLA 1US4A 4MBPA 1MXVA 5KCJB 1PB7A 1B32A 4BDNA 5ELVA 1B3HA 3FV1A 1B4ZA 5CRYA 5KZTA 3Q28A 4M1VA 1S9TA 3RN8A 4YKPA 5CI5A 4R2FA 1SW1A 3FJ7A 1GGGA 1LCTA 4H5FA 1TFDA 1B46A 3CG3A 1MQIA 1B0LA 2HXWA 4ZEIA 3ZKLA 1P1WA 5DTBA 2XXWA 3MPKA 2F7CA 3QXMA 2DOJA 3T9VA 1FW0A 1H43A 1DTGA 3QUFA 4RJZA 2RINA 1MQDA 1SBPA 4KHZE 1A99A 4GF8A 3CG1A 4RY1A 4C1UA 1RYOA 5BWJA 3RNNA 1QW0A 1MPCA 3S9LC 3TKDA 1B6HA 4G8HA 3DLNA 3PV0E 1VFDA 3KJTA 4H5GA 4QFKA 4QFPA 1M5CA 5I59B 4MF3A 2HZKA 4LA9A 4HCYA 3K6WA 3PMVA 2NXOA 5H8NA 1S7YA 4OENA 2Y7WA 5ICQA 2DE4A 2O84X 4WEDA 3IORA 4IY6A 1T0KA 1A8FA 1EZPA 3PMXA 2RCAA 5H8HA 5JEIA 4ZEKA 4KCDA 4X9TA 3C34A 4ZEBA 3N5LA 1P1QA 3FVOA 5KCJA 2QS3A 5EHMA 4ESWA 5JTYA 2Q2AA 4ELRA 5ISUA 1OMPA 3VLWA 5CBRA 1HSLA 1LAFE 2ZNTA 3E9XA 3T93B 1POY1 4F3GA 4GXSB 2UYEA 5A5XA 4R9GA 2D3IA 3MVZA 1Z7NE 1IQ7A 5HM4B 4RPOA 2HCAA 3MBPA 3ZS6A 1LB9A 2QMWA 3K1NA 2ONRA 4OESA 2UVHA 4WKMA 4LZ5A 4KCCA 1IXCA 2H9BA 1LBBA 1Q1KA 3UP9A 3MVWA 4ONYA 5ITPA 2F35A 4ISUA 5L8DA 1AH5A 1UQWA 2VD2A 5H8SA 2ZNSA 4LATA 3HO7A 3PU5A 1I69A 1JW5A 2UYFA 3FVNA 4KFQA 4F3BA 2G29A 1B7ZA 3K6VA 1LBCA 2OK2A 4OHNA 3IB0A 3O29A 4FJPA 3QSLA 3W9WA 3VLVA 2I58A 5J1DA 5JK4A 2I3WA 4I9DA 1N3XA 3KG2A 3PUWE 3D4GA 4GVOA 5K2YA 2DXRA 4Q30B 4ZZAA 4H67A 4QRZA 1USYE 1HSEA 2F7BA 4NF5B 4JWYA 1DTZA 1BIYA 3JV9A 3LUYA 3KGCA 1N76A 1MM7A 4NF8A 2THIA 3ZKKA 3EHUA 3FXRA 3CSGA 3G3KA 3HV1A 1MPBA 2VOZA 2UVJA 1UTBA 3GZGA 3T9HB 2XXPA 4OFJA 3GXAA 2I4BA 2QS1A 3OXNA 1ZTYA 5EHSA 3CRBA 2IA4A 3C35A 1QUIA 4JSOA 1WODA 1I6QA 3PGFA 1FQEA 4YKKA 3C4MA 3C36A 4U1ZA 4PFYA 3RLFE 3VV5A 2D21A 4JB7A 2UVGA 5LOMA 3JYRA 4HTGA 4GQOA 1MG1A 1ZLQA 4EUOA 4LONB 4EQBA 1YPNA 1MXXA 3CI8A 2XXQA 4PFWA 4R9FA 2QRYA 3TUSA 1B3LA 2F6PA 1PBQA 1RYXA 5H8QB 2XHDA 4G8NA 5CMCA 3TTRA 3OMBA 4X1BA 3H6WA 2Z23A 2XXXA 1Y1ZA 4XKRA 3EPEA 4IO5A 3S9NC 3U72A 1A8EA 5FTHA 1FTMA 3MZ9A 1B7UA 4O3CA 4QF9A 3T9XB 4F29A 5I2NA 1JEUA 4F39A 2HFBA 1XVXA 3EF7A 1SVXB 1OLCA 1D9YA 1XOCA 2DWHA 3WAEA 5I2KB 3R7XA 4UA8A 3KFMA 3VVDA 3M3KA 4I1DA 4P11A 4U4XA 3RQTA 3KEIA 3KOSA 2XXVA 2Y84A 3T9UA 1VSOA 1XS5A 4RA1A 2NUVA 5IKBA 1FQBA 4F19A 3DP4A 4IB2A 4XKQA 4JXIA 1ZJLA 3ILTB 1PDAA 3U1OA 2XD3A 3O28A 5F7VA 4NEDA 2FA7A 2Q88A 3KN3A 3UORA 4XTCQ 1NNPA 4F3SA 3LC8A 2DVZA 2DE3A 1AOVA 2ZMBA 3SEUA 2B3BA 1R9LA 1LLSA 5DEXB 3BBRA 1YTVA 4I8CA 1IXHA 1B05A 3OSQA 1Y3PA 2PYYA 3SEXA 1MRPA 3RTWB 3VLUA 1DPPA 4JBZA 2DVCA 3DP8A 1FTJA 4LP2B 4NMYA 3PPPA 4Q8RA 1FQAA 4ND9A 2E1SA 4PP0A 1Y4CA 4BDOA 4YICA 5I58B 3IOWA 4MLVA 5FHOA 4G8MA 3TTKA 4YZZA 3VDFA 2H5YA 4MFIA 3K1MA 4N13A 2DWAA 1URGA 4BDLA 2VHAA 1M5DA 5AA3A 3K1PA 3ONMA 4L17A 2M8CA 2H25A 3MP1A 2F78A 3DM0A 1UTHA 1H3DA 4FATA 1B1HA 5ICTA 5TU0A 3DELB 2PT2A 4NE4A 5KDTB 2HAUA 1NNFA 3MW0A 4G68A 2R9JA 1USYH 2QS4A 3G3IA 3KOTA 3CFXA 3IJOB 3IO6A 3HHGA 3PD8A 1SW2A 3GLBA 1AL3A 1XT8A 2Z8FA 4ZDMA 1SW5A 4POWA 5FHNA 1B52A 4DE8A 3OENA 1FQFA 2I0CA 5TP9A 2HAVA 4KD5A 3S4UA 3FGSA 1WDNA 3E4RA 2VD3A 4FE8A 4IGTA 1QUJA 1POTA 3SERA 2I3VA 4NF6A 5I57B 4U22A 1LFHA 1I6AA 1OQGA 2CMOA 1B40A 3PPNA 1LSTA 5AA4B 4EQ7A 1P1UA 4FECA 3U8QA 2H4IA 2QMXA 5CMBA 4ZZEA 3V89B 2D5WA 5AA2A 4H8JA 3HN0A 4KQPA 3SETA 1SDXA 4R74A 1ANFA 2RCBA 3QIMA 2ZYOA 3VXCA 2DYXA 1SI0A 3Q27A 2H98A 1EZOA 4GL0A 4YMAA 3KSXA 4YB7A 3H7MA 4IY5A 1FCKA 5L9MA 3EHSA 4KYSA 1ATGA 4DLDA 5H8FA 2ZYMA 2QSXA 3K4UA 5TPAA 4R2BA 4R6HA 3Q25A 4GIZA 1JETA 4OMBA 2ONSA 4YB6A 1RKMA 3M8UA 3PUXE 1MS7A 4U4SA 1ZBMA 4F3PA 1AIVA 3OO8A 2YPNA 4DDDA 3IOUA 1VE4A 2XXYA 5EYFA 4FEDA 1B9JA 3IB1A 5B70A 1GV8A 2XXIA 4E0XA 1QKBA 3IK6B 4TQUQ 3TZAA 3TCGA 5M2VA 4QSDA 4X1DA 1D3KA 3MVXA 1NKXA 1SW4A 2ZYNA 4OEUA 3MZBA 3MAMA 1MDQA 3PPOA 3LSWA 3TCHA 1B2HA 1NNKA 3TTMA 2REGA 1HSJA 3U93A 1US5A 4IO2A 1F9BA 2F5XA 4DZ1A 4KI0E 3PUZE 4PFTA 2V3TA 1EZ9A 1M5FA 3FVGA 1FTLA 2F34A 3IAZA 4DCYA 1Y4TA 3O9PA 1YCJA 3QK6A 5F1QA 3K6XA 4U1OA 2G93A 3CIJA 2I49A 1CE2A 1SQYA 4O3BA 3Q26A 5I59A 5AA2D 1IZ1A 3GBAA 2P2AA 4G4PA 3VE1B 3TTLA 3K2DA 3OOAA 1NH7A 2OWTA 2Z8EA 1MM6A 3T66A 4POXA 1OLAA 1P99A 4R72A 5CBSA 3IX1A 4OYVA 4I62A 4AB5A 3B7DA 3N94A 4OERA 4DXUA 2Z22A 4GXAA 3UN6A 1NH8A 4OEVA 5HBCA 4NF4B 3UGWA 2Y7RA 1OVTA 1LGBC 5FTIA 3E3KA 4EF1A 1GVCA 1Z7ME 4KYEA 4XKNA 2PX1A 2YLNA 1PBPA 3MZ1A 1FTKA 1M5EA 2YJPA 1B5HA 3TELA 3MQ9A 4AQ4A 4ECFA 3FV2A 1SYIA 1IXGA 3L6GA 3UK4A 4F31B 3SEVA 2QL3A 2F97A 5I56B 1LB8A 2PVUA 1B58A 2O1MA 3K00A 3TFLA 4HW8A 1D9VA 2O69A 3KJ7A 3V8XB 3PUVE 2F8DA 2O68A 2GFEA 1IIWA 4U23A 3IOTA 1LFGA 2Q9TA 3K6UA 1MY4A 3C33A 3KZGA 1B3GA 3HHFA 3KSJA 1BLFA 4QSCA 5CMKA 1QUKA 4GFRA 1MY2A 4EF2A 4NF5A 2FYIA 3VFJA 4ELOA 1Y1MA 3TTNA 3W15C 2DP8A 4R73A 4PETA 3FIRA 4EXKA 3V5AA 1B3EA 1OQHA 4LZ8A 3M3LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IXIA 2B3FA 1Q35A 4MH5A 3I5OA 4FORA 3D4CA 2FIXA 4OANA 2GH9A 3SEWA 1RDYA 2DWIA 4JDFA 4HCWA 3CHGA 3RGYA 1JEVA 4KR5A 4PCDA 3H6VA 4MAGA 4NWDA 3IL1B 3OSRA 3EHTA 2R6GE 3HSTA 4IO7A 4TLMB 2BJJX 1MQHA 5IZZA 4OTEA 3G7WA 3F11A 2Z8DA 3MJNA 3FD3A 5ET7A 4H6DA 1LCFA 1SI1A 2VGQA 1PB8A 4PE5B 4G68C 4NAPA 3C9HA 4M4GA 1H45A 2IEEA 3MP8A 4OXVA 2Y5LA 5H8QA 1KA1A 3CVGA 4Q0CA 3OEMA 2V3QA 1MQGA 1FTOA 1NV4A 4RK9A 3KN8A 4F2OA 3ISPA 1R1NA 4Z7EA 3H6TA 1SPIA 3FASA 5LTCA 3KBRA 2H99A 4X48A 2HQ0A 1EYIA 2P0SA 1P1NA 5I3SA 3A09A 1ZIUA 2DQVA 2WBBA 4GL8A 4PE3A 4BDRA 3RUMA 2LAOA 1JW1A 1IEJA 1FPIA 3RTFB 3FXQA 2Q8JA 3G3JA 1ELJA 3S2VA 5HPQA 5I2KA 5I84A 1TXFA 1MXUA 1Y3QA 3SDFA 4ELPA 3IO4A 4F18A 3EN3A 4EDPA 4P0IA 1VR5A 3TCFA 2PMSA 2KQZA 3G3HA 4IO4A 3O6IA 4N4UA 2DXYA 2O6AA 3O6HA 3RPLA 3RT8A 1QKAA 4EXLA 5H8NB 4OFOA 3IR1A 3HPIA 4RK2A 3OO6A 4R75A 4O3AA 5H8HB 4YAHX 3AXFA 1MPDA 2REJA 1A54A 1GTKA 1NI9A 3I3VA 3UIFA 1OIBA 3TYHA 3CFZA 2NWJA 3SZPA 1RDZA 1D4NA 5IAIA 1CB6A 3FJMA 2I4CA 1B4HA 4DXBA 4BDMA 1A55A 4GX3A 2NVUB 4F1VA 3K02A 2Q89A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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