2QS3A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer in complex with ubp316 at 1.76 angstroms resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title ACET is a highly potent and specific kainate receptor antagonist: characterisation and effects on hippocampal mossy fibre function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs3A02
1LBBA 3IK6B 3OENA 3CI8A 4ZZEA 3KJTA 4LVQA 3RT6B 1BP5A 1N0TA 4OFJA 2CZLA 1IXHA 1TFDA 3FIRA 4ELOA 2A5SA 4R6YA 5H8FA 4YU0A 3OEMA 4LP2B 2B3FA 1JVXA 1LFGA 3UA8A 2V84A 2Z8DA 1SYIA 2YJPA 2G29A 1XT8A 4QSCA 4ZEIA 1T0KA 4RNSA 4YMAA 3R6UA 4E0XA 4DXBA 4Z0IA 4LUBA 2F97A 4WXJA 4PE5B 2Q2AA 3HCQA 1R1NA 2RKMA 1NNFA 4EF1A 5BUUA 5IAIA 3OXNA 2I0CA 5H8SA 5J1DA 3A3UA 2PT2A 4U1ZA 1B3EA 1OQHA 3VDFA 1A55A 4R9GA 3N6UA 3VLVA 4MF3A 1MDQA 2Z22A 4KD5A 1NL5A 3SEYA 3KFMA 3KN7A 1MH3A 4GOTA 4GIZA 3TEPA 4ZDMA 3C35A 4RK9A 1PB8A 5I57B 2Y7PA 5AA2D 4WEPA 2NOOA 1LAXA 4TQUQ 3TCFA 2B3BA 1H45A 2V25A 5B7DA 2Y7KA 4MFIA 4GXAA 2DE3A 4KCCA 3TKDA 2RC7A 4OMBA 2XX9A 2I4CA 1B32A 2OZZA 2HAVA 4RPOA 3TODA 3MVZA 1Q1KA 4XKNA 3W9VA 3TZAA 4N6PA 4K3FA 3N6TA 1EH3A 2D21A 4R73A 4LZ8A 1GV8A 3QUFA 3IB0A 1VR5A 3A09A 4QFLA 1I6BA 3TCHA 1B1XA 4YB5A 1DTGA 3UIFA 1JEUA 3VLWA 4Q5TA 4OERA 2XX7A 3G7WA 2DS9A 5I84A 1IXIA 3K0VA 1S9TA 5IKBA 5DVFA 3VVFA 4QRZA 1KWHA 3W15C 5F7VA 4PQJA 2DQVA 1R6ZA 1A7LA 2QMWA 5CMBA 3H6TA 1H44A 2R6GE 4BLAA 5TPAB 2DOJA 3Q25A 3RN8A 2ZYKA 3CSBA 5L9MA 1A40A 4GXSB 4YZZA 5ICQA 3ZKLA 3IOTA 3ONMA 2XXXA 4POXA 1PEBA 4ZZAA 3B6TA 1QUIA 4BDQA 1H43A 4E0WA 2D3IA 4F1UA 4N07A 3QK6A 4ZEBA 4DE8A 4NF8A 1FQAA 1N04A 4R2FA 2Z23A 1B0HA 2X26A 3PU5A 2Q9TA 2DVCA 5JEIA 1MM6A 3N5LA 4RK2A 2UYEA 4R75A 4FORA 2DWIA 3MW0A 4O3AA 3TUSA 1BLFA 1AH5A 3T22A 1B3FA 2F36A 4HW8A 4HCYA 1M5CA 4QFKA 4YKKA 3CFZA 1FQEA 2OWTA 2UVHA 3KGCA 4NF5B 1URGA 2NXOA 1JETA 1M5DA 3AXFA 1MQJA 1P99A 1URDA 5FTHA 3OO6A 5F1QA 2ONSA 2ZYNA 3C36A 2DXYA 3VXBA 4U22A 3JYRA 2D5WA 3VV5A 1RYOA 2PMSA 3A3CA 5ISUA 1B0LA 2UVIA 4OFOA 1UTBB 4DZ1A 5H8HB 3OO7A 2XXWA 1JW4A 2O69A 1MY0A 4OEUA 1LSTA 4OFLA 3PMVA 4FIMA 1QKBA 4JWOA 1IUDA 1IZ1A 1S7YA 3G3FA 2QSXA 4THIA 1UTHB 3IB1A 4AQ4A 3MPLA 2XXUA 3D4CA 4DXCA 1MY1A 4F3BA 5JTYB 2QS2A 5A5XA 4U21A 2QL3A 3CRBA 4QHQA 1B5IA 4F3SA 1B58A 2REJA 3LSFB 1Z7NE 2CMOA 2A5TB 3MP8A 3QSLA 4G68B 1H76A 1XVXA 2QRYA 1A54A 5ICTA 1CB6A 3F11A 1WDNA 3SEUA 3ILUB 1QKAA 2DYXA 1A8FA 1DPPA 4IO6A 2XXTA 4IO4A 3IJOB 3CIJA 3GLBA 1ZBMA 3SEXA 1XVYA 2O7UA 1VE4A 3N94A 4YICA 1XOCA 4NWCA 2FNCA 3C34A 1GR2A 3JZJA 4X1BA 1M5BA 3O28A 3RGYA 4FATA 4U4SA 1WVJA 3SKPA 1FQFA 4ECFA 1HSLA 5I2NA 1MQHA 3U93A 1USYH 5CMKA 3M8UA 5TU0A 2G93A 2PX1A 3RUMA 4H5GA 4ZEFA 4C1TA 2AL5A 3M3LA 1NFTA 2ONRA 4OZ9A 4ELPA 1D9YA 3G3IA 1MPDA 3C9HA 5DVJA 2FA7A 4EQBA 1HSJA 4OVJA 2IA4A 4JDFA 1OVTA 2AIXA 2AL4A 4DXUA 3O66A 2V3UA 5AA2B 2NUVA 2M8CA 3MVYA 5B70A 4H5FA 3K02A 2I4BA 4LQ5A 3S9EA 3FXQA 4GFRA 1B2HA 1Y9UA 3K4UA 4RXLA 3PPPA 3V89B 3M3KA 3O6IA 2V3QA 2E0SA 1UIVA 3S9MC 3S9LC 1MS7A 5HM4B 4OESA 1R9LA 3T66A 1YAEA 2Q89A 3G3GA 4EXLA 3H03A 1SBPA 4R6KA 3RNNA 3IO6A 5LOMA 2QS4A 3O2AA 5H8FB 4Q30B 1SVXB 2P2AA 2HZKA 3HN0A 2ONKE 4G8HA 1LCTA 3O97A 1B51A 3CG3A 2HCAA 3WAEA 3K1NA 1MXXA 1JW5A 3R26A 3CFXA 1DSNA 4KHZE 4OENA 4ZEDA 3V83A 2DSFA 1DMBA 5DVIA 1B7UA 3EHSA 1SW1A 2O6AA 4C1UA 4GVOA 5AE4A 5I58A 5ITPA 1B3GA 2ANJA 4KYEA 1MQIA 3KOSA 2RF1A 3ECRA 3SESA 2I0BA 3E3KA 3HO7A 4F18A 3IOUA 4OYVA 3Q28A 1SYHA 1EZ9A 3V5AA 3FGSA 4YB6A 4RA1A 1A99A 1GTKA 1P1WA 1PBQA 1I6AA 3KZGA 3EHTA 1Y3QA 1MXWA 1ZLQA 3B6QA 4YKIA 3VE1B 1QVSA 5I59A 4P0IA 3I6VA 2XD2A 5M2VA 1LBCA 3PUWE 4PFUA 1IXCA 3E4RA 5CMMA 3BFTA 1ZIUA 3TTLA 3UP9A 5CBRA 1J1NA 3U92A 1LAHE 4KQPA 3EHUA 3UK4A 4JWXA 2E1SA 4O3BA 2Q2CA 4BDLA 2O84X 4P11A 4WEDA 4OQOA 2OCUA 4IO3A 2O1LA 1EZPA 4IO7A 2ABHA 1DTZA 3PV0E 5H8QB 4EQ9A 1PDAA 2H4IA 2OK2A 3E13X 5I2KA 4EDPA 5AA3A 1YPNA 1ANFA 2PYYA 3FUZA 1VFEA 1SI1A 5KDTA 1FTLA 3BKIB 3MJNA 4X48A 1IIWA 3FJ7A 3O6GA 4QSDA 4I62A 3LUYA 2XXYA 4YAHX 1DPEA 4U4XA 2RC9A 3JV9A 4OXVA 3ZS6A 1MRPA 1SW5A 2DWAA 3Q29A 2NWJA 2PBWA 4HTGA 3KOTA 3K6XA 3LC8A 1QUKA 1LCFA 5ELVA 2ZMBA 4LONB 1B3HA 3L6GA 1NNTA 5KZTA 2XXPA 4QFPA 1QJMA 4IB2A 3FXUA 3PMXA 4RYAA 2DVZA 2DWJA 3ZSFA 1N3WA 4F22A 3PPRA 2O1MA 4IGRA 4I1DA 1MPBA 1F9BA 2QMXA 5TP9B 3MZ1A 3LR1A 1OVBA 4KFQA 1MXUA 1P1QA 4FECA 3GBAA 3T9UA 4PFWA 5TPAA 2GFEA 1Y1ZA 1LAFE 4ELQA 3G3HA 4H0WA 3HHGA 4R74A 5CRYA 3D4GA 1VFDA 1MM7A 1US5A 4M4GA 4UA8A 1YCJA 4Q8RA 4IO5A 3OMBA 3RT8A 5FHOA 1RKMA 4ZE9A 3S9NC 2F8DA 3PMWA 3SEWA 3VFJA 4NF4A 2H5YA 3G3JA 4IY6A 4JWYA 4ELRA 3TAJA 1PB9A 2DE2A 3KBRA 4DIGA 1IXGA 1B9JA 1P1OA 3P7IA 1ZJLA 4NF6A 3MP6A 5EYFA 1MY4A 3IR1A 4FE8A 1SDXA 2OLBA 2O7IA 3H6VA 3OSRA 4MLQA 3KSJA 4LQ2A 1D4NA 4GD5A 3OO9A 4R72A 2I58A 4NF5A 3FVKA 1Y3PA 1LB8A 2PVUA 5FHNA 3MVWA 5KCJA 1LFIA 4F29A 1N84A 3HSTA 3EN3A 3VXCA 1SW4A 1XHYA 4Q0CA 1IQ7A 2W7YA 1QW0A 2OBGA 4NEDA 3TTNA 2UXAA 1MH4A 1AOVA 5A5XB 3DM0A 2F78A 4DDDA 1ZU0A 1SI0A 1UTBA 3SEVA 3M3FA 3PPNA 1LGBC 1FTOA 3B6WA 1JEVA 1I6QA 3LSWA 4C0RA 1B40A 3EPEA 3PGFA 3RLFE 3CVGA 1AMFA 1JW1A 3MWBA 4PP0A 4LZ5A 1O63A 2UVJA 1Q35A 3TDJA 3UORA 2H25A 2DXRA 2F6GA 1H3DA 3T9VA 4JSOA 1HSEA 4OTEA 3S4UA 1B4HA 5EHMA 2B65A 2AYSA 3H7MA 3L6HA 5H8NB 1MXZA 5AA4A 3RTFB 2DWHA 4EQ7A 2Z8FA 1M5EA 2VD3A 4IY5A 1LFHA 4F31B 2I3VA 4NMYA 4F1VA 3HHFA 1MXVA 3C33A 4U2RA 2IEEA 2P0SA 3ZKKA 3DP6A 3O6HA 5I56A 1MQGA 3C31A 3C32A 1B3LA 4FEBA 3ODBA 5K2XA 3DP4A 4P0GA 3SERA 2XXHA 2QS3A 2ZNTA 1Y4CA 2R71A 1OQGA 4ESWA 3T9HB 4R6HA 1GVCA 3S2VA 4FAJA 1SD3A 2HZLA 3LSXA 4PETA 2XD3A 2DP8A 1PB7A 4X1DA 2ALUA 4M1VA 3FXRA 3N26A 5HPQA 1CE2A 4G2ZA 1B5JA 2GRVA 2F7AA 1Z7ME 1D9VA 4OWDA 2ZNSA 3QXMA 1B7HA 2HQ0A 4RY1A 2NVUB 3TCGA 2I6EA 3V8XB 4OETA 3DP8A 3IX1A 3G3KA 3FATA 3UN6A 2F7BA 3FJGA 2RC8A 2O68A 4NWDA 4JXIA 2XXRA 4GRKA 4AB5A 2ESNA 3KSXA 2Y84A 4ZECA 3OEKA 3PD9A 3O29A 3PUZE 3PUVE 1UIUA 2I49A 2XXQA 3MVXA 3FZVA 5I58B 2UVGA 4HCWA 3IOWA 3VVDA 3U94A 1MQDA 2UYFA 5DEXA 1N76A 1N3XA 3GXAA 2F7CA 4KPTA 1OIBA 1XS5A 4LATA 3LBSA 3TTKA 3IOVA 4BDNA 4XKPA 4QF9A 3K01A 1NNPA 3QAXA 1I69A 5AA1A 4MLVA 3FJMA 4XKRA 4EF2A 4G8MA 4GF8A 5K2YA 5I59B 3FD3A 3TELA 4ZE8A 2F35A 4ND9A 4XXUA 1B5HA 2RCBA 3PUYE 4I8CA 3IAZA 4DCYA 4H1XA 4YKJA 2XX8A 1QUJA 2F5XA 5HBCA 4H65A 4F19A 4UACA 2Y7WA 4FJPA 1R9QA 1USYE 1JVYA 3SDFA 5JK4A 2GHBA 3FVGA 5L8DA 3OELA 2XXIA 3T9XB 2VD2A 3TYHA 2HAUA 4RPNA 3K2DA 5I2KB 3CFLA 3MC2A 2XHDA 2F6PA 3H4ZA 1MY2A 5KDTB 1O64A 4POWA 1AL3A 5I57A 1ZMGA 2Y7RA 4F2QA 2Q88A 2GH9A 1GGGA 5FHMA 3R7XA 3TFLA 3VVEA 1N7WA 3TPAA 2I3WA 3O9PA 4JSDA 3RPWA 1TWYA 2QJEA 3MUQA 1YTVA 3K6UA 5H8QA 1OLCA 2P1SA 5CC2A 2V93A 3CR9A 3KN8A 2FYIA 4F2OA 1M5FA 1FQCA 3U72A 4GL0A 1OMPA 3EF7A 2DE4A 4H8IA 5ITOA 3OSQA 4XIGQ 1Y4TA 1SQYA 3PPOA 3TMGA 3FV2A 4TLLB 4NF8B 1NKXA 4GL8A 1Y3NA 3K1MA 2Y7IA 4NE4A 1P1UA 4R2BA 2V3TA 4KR5A 3BBRA 3IB2A 4L17A 4X9TA 1PBPA 3GZGA 3KJ7A 3Q27A 5EHSA 1WODA 1EZOA 4BDRA 4F3GA 3MBPA 2THIA 1OLAA 4NF4B 1FCKA 2OWSA 4Z7EA 3FV1A 5L9OA 4QSEA 4O3CA 5TP9A 1NNKA 4GLIA 4JBZA 1JNFA 4G4PA 4NF6B 3QUJA 2F34A 3TTRA 1FTKA 4QFNA 2R9JA 1DOTA 5DT6A 3K6VA 4XKQA 3K00A 1LB9A 1NH7A 3I5OA 4KCDA 1AIVA 4U1OA 4GQOA 3RQTA 3FVNA 1VSOA 3TTMA 2WKYA 1BTJA 1O7TA 3USDA 1MG1A 4ONYA 5KCJB 3I3VA 3H3GA 1POY1 4H8JA 1UQWA 3MAMA 3CSGA 3HV1A 4QFOA 1ELJA 3KEIA 2VGQA 2VOZA 3ILTB 3MP1A 4BDOA 3OOAA 4ESXA 4PFYA 1FW0A 1PC3A 5L9SA 3FASA 2ZYMA 3K1PA 5FTIA 3PPQA 1MXYA 4BDMA 4PFTA 3VLUA 4NTLA 2ZXTA 4AB6A 4LZ7A 1P1NA 1MPCA 2PT1A 3BFUA 4ISUA 3IJXB 1Y1MA 1ZTYA 1B7ZA 3QYTA 3FVOA 4F1YA 5H8HA 3GBBA 3E9XA 5CM6A 5DTBA 1POTA 1TFAA 2YPNA 3CG1A 3U1OA 3IORA 2I48A 4G77A 3TQLA 2X7QA 2HXWA 1LLSA 3H6UA 1TT1A 1B05A 1MDP1 4OHNA 1LAGE 3B7DA 3WAFA 1L5TA 3K6WA 3DLNA 3EQ1A 1IITA 1B52A 1UTHA 1XC1A 4I9DA 5BWJA 5AA4B 3KN3A 4MH5A 2KLFA 1II5A 2HFBA 2ZNUA 1Y20A 1BKAA 2Q8JA 5CMCA 2ZYOA 5JTYA 2RINA 2XXVA 4JB7A 3UGWA 5I2NB 1ATGA 2BJJX 4H67A 3T96B 4U23A 1TXFA 2VHAA 1URSA 1N7XA 3HPIA 5I56B 3PD8A 2QPQA 4IO2A 3MZ9A 3MQ9A 3RTWB 2A5TA 4FEDA 3MZBA 4KYSA 4G68A 4IGTA 4EUOA 2O51A 2H9BA 4GWOA 4EXKA 1D3KA 1IEJA 1B4ZA 1EU8A 4G68C 5DYHA 5CBSA 2LAOA 1S50A 3U8QA 1NMUA 4R9FA 3OO8A 2X7PA 2QS1A 1B1HA 3IL1B 4RJZA 5H8NA 4KI0E 1FQBA 4F39A 4ZEKA 4N13A 3W9WA 1MY3A 3THIA 2YLNA 3QIMA 3DELB 3H6WA 2H99A 3KG2A 2RCAA 1SW2A 3SETA 5CI5A 3OD7A 4KYDA 1FTJA 4DLDA 2VP1A 2GHAA 3LSLA 4OEVA 1ZKBA 4HS7A 4WKMA 1FQDA 4H6DA 2OJTA 1B46A 3Q26A 3IO4A 1US4A 4TOZA 3MPKA 4XTCQ 1JQFA 3TQWA 1BIYA 5AA2A 3H06B 1RYXA 4F3PA 1FTMA 4ZS9A 3RY3A 4DCXA 1QULA 3T93B 1NH8A 2REGA 4LA9A 2Z8EA 3PUXE 3C4MA 4YMBA 4MBPA 4TLMB 1A8EA 4YB7A 2HEUA 4G8NA 4YKPA 5DEXB 1B6HA 2H98A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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