2QS3A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer in complex with ubp316 at 1.76 angstroms resolution
Total Genus 80

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYS1 (5-10)TVIa1 (13-16)TI1 (56-59)AH8 (191-199)S3 (32-33)3H1 (28-31)S2 (18-19)O1 (24-26)S4 (50-55)AH1 (35-47)AH2 (72-79)TI2 (65-68)S13 (214-221)TVIII2 (80-83)S5 (84-85)AH3 (93-97)O2 (87-89)TII2 (221-224)S7 (99-108)AH9 (226-240)S12 (204-207)O3 (183-185)S8 (110-115)AH7 (173-181)TIV3 (115-118)AH4 (123-128)TIV4 (129-132)S11 (185-190)S9 (133-137)AH5 (141-148)AH6 (152-168)S10 (169-170)AH10 (242-251)TI3 (201-204)TVIII4 (199-202)TIV1 (14-17)S6 (90-91)TII1 (137-140)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title ACET is a highly potent and specific kainate receptor antagonist: characterisation and effects on hippocampal mossy fibre function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
total genus 80
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs3A02
2F97A 2AL4A 3C9HA 2A5SA 2HZKA 4JSOA 1Q1KA 4YMBA 2FNCA 3LSWA 1R1NA 4TQUQ 2D5WA 1LB8A 2XXVA 3FXRA 1XC1A 2H98A 2Z8EA 3O6IA 4IO2A 4XKPA 4I62A 4RNSA 4ZECA 1B5IA 3PD8A 5DEXB 4LA9A 1MPDA 3V89B 3TODA 4O3CA 3K01A 1XT8A 4C0RA 5CRYA 1OMPA 1MXVA 3B6WA 3KOTA 3IJXB 1IZ1A 1B3LA 3TDJA 3RN8A 4POXA 2DXYA 3O28A 2M8CA 3FVNA 4NEDA 1UTHB 5M2VA 4N07A 4F1UA 4BDNA 3TAJA 3KOSA 1LBCA 4THIA 3EF7A 3VVFA 4AB5A 3CIJA 2ANJA 1SBPA 4OENA 3MWBA 4EQ7A 4GL8A 4DIGA 4E0XA 2GFEA 2V93A 4LATA 1FTJA 4DZ1A 5FHOA 1RKMA 2DP8A 2REJA 3GLBA 1A55A 1MH3A 1IEJA 5FTIA 4Z7EA 2Z8FA 1GTKA 5CMMA 4G2ZA 4YB6A 4QFOA 4EXLA 1AL3A 2I0BA 3PUVE 2OWSA 1LAGE 3IR1A 3UA8A 5I2KA 2NWJA 4JWOA 4LUBA 5IAIA 3MW0A 5KCJA 4OFJA 1O63A 3CG1A 1MQJA 3M3KA 4ELQA 3FASA 1T0KA 2ONKE 1S7YA 3R7XA 3HHFA 1R9LA 1IITA 3OELA 4IY6A 2F7BA 4JSDA 4X1DA 2O69A 5L9MA 4ZEBA 4X48A 3U92A 3OMBA 1B5JA 3OEMA 1US5A 2UYFA 5DYHA 4G68C 3JYRA 1NNPA 2X7PA 3M8UA 2OCUA 1POTA 2ZYNA 4IO3A 1SW4A 2XXTA 2HAUA 3HHGA 1QVSA 4O3BA 3OSRA 1WODA 2HXWA 3TTMA 3RT6B 3D4GA 4G68A 2OWTA 2ONSA 3CFXA 3VVDA 1SI0A 4Q30B 4RXLA 3LSXA 4EUOA 3FJMA 3MQ9A 4GXSB 1B6HA 1L5TA 3IOTA 4QRZA 2ZNTA 1JW4A 4HTGA 3SERA 1B7ZA 4ZEDA 2REGA 2ZYMA 3JV9A 2LAOA 1UTHA 1Q35A 1FTLA 2H4IA 4H5FA 1VE4A 1YPNA 3FXUA 1IQ7A 4YICA 3HV1A 1N7WA 3ECRA 4R72A 3ZKKA 2RKMA 3DM0A 1SI1A 3KFMA 4EQBA 1ZJLA 2R9JA 1IXCA 3MUQA 3A09A 3ZKLA 1F9BA 4GFRA 4QSDA 3USDA 4F18A 4R73A 2O1MA 5TU0A 4AQ4A 2FYIA 2OLBA 2DYXA 4H8JA 2E1SA 1Y4TA 4GF8A 1O7TA 4RA1A 4F22A 3PU5A 4DCYA 2AL5A 1I69A 3VLUA 4JWXA 1QUJA 1P1OA 1ZTYA 4DE8A 4YZZA 4XKQA 1Y20A 4H65A 4FIMA 1MXXA 3OD7A 3VXCA 2HZLA 1D3KA 3W15C 3MP6A 4OVJA 3IORA 3OEKA 4NMYA 1ATGA 3Q29A 2QSXA 4ZEIA 1SDXA 4R75A 2B3BA 3UN6A 1I6AA 1Z7ME 4TLLB 4U23A 3OOAA 3E4RA 4DDDA 5CM6A 4ZZEA 1FQEA 3MP8A 3MAMA 1QJMA 3S9NC 3AXFA 4U2RA 4LVQA 2DWHA 4R9FA 1QKBA 3OO7A 3HPIA 3PUYE 5IKBA 4GXAA 3HN0A 3OO9A 4Z0IA 1D9VA 5KDTA 1MY0A 3VXBA 3W9VA 1NNTA 4E0WA 3MVWA 4I9DA 3RQTA 3G7WA 3H4ZA 4H6DA 5KZTA 1Y3NA 3QK6A 1MQGA 1MPBA 3TTRA 3KJTA 2YLNA 4FATA 3FATA 3PUZE 3THIA 3ODBA 2X26A 4M1VA 3QXMA 2UYEA 3G3GA 2VHAA 3T93B 4KFQA 1MY2A 2XX9A 1EH3A 3TKDA 2OK2A 1LLSA 1CE2A 3CVGA 4H67A 2DE3A 4TOZA 1TT1A 3FXQA 1QW0A 3RY3A 4HW8A 3RNNA 1GR2A 1UQWA 1USYH 5H8NA 1LAHE 4LQ5A 3BFUA 2G93A 1DSNA 2GHAA 2GRVA 3VFJA 1EZ9A 3N94A 1DMBA 1JNFA 5AA2B 4R6YA 2ZYOA 2XXRA 2GHBA 2I4CA 5I2NB 2F8DA 4GL0A 1BKAA 3MVXA 2F5XA 3IL1B 4GLIA 4F19A 2VD3A 3PPNA 1VR5A 1MQDA 2DWJA 1GVCA 2OBGA 4X9TA 3W9WA 4QFNA 3O97A 2RCBA 2DE2A 3CI8A 3KG2A 1UIUA 4KD5A 3S4UA 4QFPA 1H76A 4Q5TA 3PGFA 3M3LA 5HPQA 3EHTA 2O1LA 3UP9A 1LBBA 3H6TA 2F78A 1IIWA 3B7DA 2F6GA 3KN7A 2ZNSA 5TPAB 5H8HA 1AH5A 5AA3A 2PT1A 1S9TA 1CB6A 4NF4B 1I6BA 3K2DA 5DTBA 4YKJA 4QF9A 2BJJX 3G3KA 3TQWA 3C31A 2AIXA 1XVYA 5HM4B 4MH5A 1B0HA 1TWYA 3TCFA 2DWAA 4ZS9A 2DWIA 2QRYA 4RYAA 3VV5A 2ABHA 4NWDA 1MXWA 1IXHA 2DVCA 3BBRA 3KJ7A 1RYXA 1OQGA 2O68A 2I4BA 5K2XA 1II5A 1IXIA 2P2AA 5H8SA 4OQOA 3S9EA 1MG1A 3FVOA 2E0SA 5A5XB 2RINA 5DT6A 3U94A 1VFEA 3UORA 3MZ1A 1H44A 1M5BA 2YJPA 1M5EA 2I6EA 4YB7A 1URDA 2XHDA 4PFWA 3CFLA 3CRBA 5CBRA 1AMFA 3L6GA 4H8IA 1MY1A 2Y84A 5J1DA 2D21A 1HSLA 4O3AA 3K1NA 1PBPA 3QUFA 2XXWA 1BLFA 1B1XA 1A40A 3QSLA 5EYFA 4RPOA 3PUXE 3G3JA 4QSEA 5ISUA 1JETA 3IOVA 4OFLA 3DP4A 5F1QA 1MM7A 2H99A 2B3FA 3RTWB 1LCFA 2QMWA 1MDQA 1MH4A 4WEPA 4KR5A 1P99A 5I84A 4I8CA 3FVGA 3B6TA 4KCCA 5I59B 2Q2CA 5JEIA 5H8FA 4ESXA 1JQFA 4GVOA 4G77A 1A7LA 4KI0E 1UTBB 3K6XA 5H8QB 4Q8RA 3LR1A 4U4XA 3TTKA 4FE8A 3TZAA 1GV8A 3MBPA 3MVYA 4GOTA 1H45A 2AYSA 4BLAA 4C1UA 5B70A 4MLQA 3WAEA 4YKIA 3KGCA 1BP5A 1OQHA 4ELOA 3ZSFA 1MQHA 3HSTA 3V8XB 4JWYA 3RT8A 2PMSA 2VOZA 3KSJA 1JVYA 5TPAA 3K02A 2XXUA 4U21A 3TELA 4H5GA 4F3BA 4ZE8A 2DVZA 3SEVA 5FHNA 3T9HB 3IB2A 1ZLQA 1RYOA 2UXAA 3SEXA 3TEPA 5I56B 4YKKA 3IX1A 3U93A 3QIMA 4P0IA 3E3KA 4BDLA 1A8EA 4DXCA 5DEXA 4F31B 1LGBC 1Y1ZA 4RJZA 1PEBA 1DPPA 2F36A 3IO4A 2Z23A 4U22A 2UVGA 4PP0A 4F2QA 4EXKA 1TFAA 4NF6B 1IUDA 3MPLA 4NF5B 3BFTA 2RC7A 2A5TB 1JEVA 4GRKA 1B58A 1MXZA 2R71A 4FECA 3N6UA 3DLNA 3R26A 4AB6A 3K1PA 1J1NA 1B3FA 2P0SA 3WAFA 1B4ZA 5I58B 1LFIA 2DOJA 3JZJA 3H6WA 3C4MA 3LC8A 3PPRA 1N7XA 1DTZA 2NXOA 2PYYA 1FTKA 1ZU0A 3SKPA 3O6HA 1URGA 4F29A 1ZKBA 3T22A 1AOVA 2OZZA 4JB7A 4Q0CA 4NF8B 1PBQA 1SVXB 3K00A 1POY1 1SYIA 4F39A 4G8NA 3RUMA 2F7AA 1YAEA 4UACA 3UK4A 3KN8A 2QMXA 1VFDA 3G3IA 4QSCA 2DE4A 4DXBA 4GIZA 3RPWA 4XXUA 1Y1MA 4POWA 3DP6A 5I59A 5F7VA 5AA4B 1AIVA 1UTBA 4ZZAA 2XXPA 3IK6B 5EHSA 1R6ZA 3PD9A 4IO6A 2ESNA 3IB0A 4MFIA 4F1YA 3FV2A 1QKAA 4HCWA 3F11A 3PPPA 5BUUA 1EU8A 2ZXTA 4GWOA 4EF2A 3KEIA 3CSGA 4ELRA 3TFLA 5AE4A 3K6UA 5JK4A 2O7UA 1A54A 2DS9A 3K6WA 3VDFA 2UVJA 2QJEA 4XKRA 4IY5A 3HO7A 4PFYA 3KBRA 4FORA 2X7QA 2FA7A 3UGWA 3EQ1A 1B4HA 4WEDA 4KYEA 2Y7WA 1B2HA 3TUSA 4R6HA 3TPAA 4ZE9A 2HAVA 1PC3A 3SEWA 1SQYA 3N26A 1FQFA 3QUJA 4I1DA 2O84X 3SEUA 3O6GA 1LSTA 2R6GE 4ZDMA 1LB9A 2Q9TA 2DQVA 5TP9B 1P1NA 4G8MA 3MJNA 3KZGA 4BDRA 1OIBA 1XOCA 5LOMA 2QS2A 3PUWE 3IO6A 4IB2A 4XTCQ 5JTYB 1SW5A 3TTLA 4ELPA 3UIFA 3C35A 1B3EA 3SESA 1MY4A 5ITOA 1XVXA 4R6KA 1XHYA 4OEVA 3U72A 2F6PA 3S9LC 4MLVA 2HCAA 3IJOB 3EHSA 3G3FA 4FEDA 1O64A 4OZ9A 1FCKA 4NF8A 3N6TA 1B7UA 1PDAA 4TLMB 4LQ2A 5CMCA 3C36A 4KPTA 2RC9A 1ZBMA 1M5FA 4UA8A 1TXFA 3RTFB 5AA4A 2QL3A 3CR9A 5CMKA 4F3SA 3H7MA 4YAHX 1D9YA 2IEEA 1BTJA 4OFOA 3L6HA 3C33A 2V25A 1OLCA 3FJGA 1SD3A 3TYHA 1N76A 4R74A 1DOTA 2Q8JA 1FTOA 2XXIA 1N3XA 1QULA 4PQJA 1P1WA 1IXGA 5AA1A 1Z7NE 1MXYA 2O7IA 1B46A 1B32A 3P7IA 2Z8DA 4NWCA 4H1XA 2PBWA 4F2OA 1PB9A 3M3FA 1BIYA 4G68B 1H43A 4OYVA 1NMUA 2I0CA 3MC2A 3PPOA 4R9GA 3KSXA 1GGGA 1KWHA 4ZEKA 3I6VA 4R2BA 3TMGA 1B05A 2QS3A 4OEUA 3MPKA 3T66A 1ZIUA 3SEYA 5TP9A 3S2VA 2XX8A 2V84A 3EPEA 3OO8A 4R2FA 4LZ8A 2F7CA 4PFTA 4IO7A 4PE5B 1JEUA 1FQCA 2HEUA 2Q89A 5L9OA 4IO4A 1D4NA 4EDPA 2H9BA 3FUZA 1B3GA 1M5CA 1MY3A 5CC2A 3MP1A 5JTYA 3H06B 4WXJA 3OO6A 2DSFA 1R9QA 1QUKA 4IGTA 4U4SA 1SYHA 1NL5A 5CI5A 5AA2A 4IO5A 3PMVA 1B5HA 3U8QA 5I2NA 2PT2A 1M5DA 1B1HA 4GQOA 3K0VA 2RF1A 3QAXA 1FW0A 4JBZA 3R6UA 3K6VA 3C34A 1USYE 3FVKA 3O2AA 2KLFA 2NUVA 1P1QA 1OVTA 4DCXA 4BDOA 1NKXA 2F34A 2IA4A 3B6QA 1OVBA 1Y9UA 3H3GA 1YCJA 2VP1A 5ELVA 2OJTA 4X1BA 1B40A 1B52A 4IGRA 3A3UA 2ALUA 3RGYA 1P1UA 4N6PA 3LBSA 1FTMA 2H25A 4WKMA 3SETA 2VD2A 3MZBA 5DVJA 3LSFB 5CBSA 4LONB 3Q25A 1FQAA 1N3WA 3BKIB 4YU0A 4NF4A 5I57B 3OXNA 4YB5A 1Y3PA 3V5AA 1B7HA 4ESWA 2GH9A 4QFLA 3EHUA 3IOWA 1WDNA 4LZ5A 1LAFE 3ILTB 5KDTB 5L9SA 2XD2A 3S9MC 4RPNA 1LFHA 4ISUA 3CFZA 4KHZE 4EF1A 1I6QA 2Y7KA 4HS7A 3T96B 4P0GA 3CSBA 4G4PA 3C32A 2F35A 4OTEA 1MRPA 1JW1A 5ICTA 4G8HA 4C1TA 5A5XA 3V83A 3VLVA 1URSA 1MM6A 1A8FA 3FZVA 4F3GA 1EZPA 4MF3A 3Q27A 1TFDA 2XD3A 5L8DA 2I3VA 4KQPA 4OXVA 1YTVA 3O29A 2QPQA 3E9XA 4RK2A 2V3QA 4K3FA 3VE1B 2ZNUA 3I3VA 4FEBA 3IAZA 2YPNA 2XXHA 5B7DA 1ELJA 4MBPA 5H8NB 2ONRA 5FHMA 5DVIA 3A3CA 3DP8A 2Y7RA 1B9JA 2QS4A 3K1MA 3GXAA 3PMWA 4PETA 3N5LA 1OLAA 4FJPA 3PMXA 2B65A 1B0LA 4XKNA 3FGSA 5AA2D 1MDP1 1NFTA 4LP2B 3TCGA 2WKYA 3QYTA 1B3HA 1US4A 4F1VA 2Z22A 3TCHA 5CMBA 2I48A 1EZOA 2XX7A 3U1OA 4OETA 4OWDA 4RK9A 2H5YA 4BDMA 3Q28A 1MS7A 4P11A 3H03A 1SW1A 3ONMA 5H8QA 1XS5A 1MQIA 1WVJA 2O51A 2ZMBA 3FV1A 2P1SA 1N04A 4JXIA 3T9UA 4OMBA 1S50A 4KYSA 1Y3QA 1N0TA 4M4GA 4XIGQ 2Y7PA 3SDFA 1HSEA 2PX1A 3TQLA 1A99A 2I3WA 1NH7A 3IB1A 2CMOA 1QUIA 3ILUB 5H8HB 1ZMGA 1JVXA 4QFKA 2RCAA 1N84A 4OERA 4DXUA 5K2YA 3DELB 3E13X 3PV0E 4PFUA 5I57A 1UIVA 1MXUA 3TTNA 3FD3A 4OHNA 4YKPA 2VGQA 2Q88A 2Y7IA 5ITPA 3GZGA 4ONYA 3HCQA 4BDQA 5I56A 1NNKA 3VLWA 2NVUB 1HSJA 4N13A 2ZYKA 1LCTA 2O6AA 3MZ9A 5EHMA 1FQBA 2THIA 4NTLA 1VSOA 1Y4CA 1NNFA 3H6VA 4ND9A 4U1OA 2W7YA 3FIRA 4H0WA 5ICQA 4NF6A 4F3PA 3GBAA 4NF5A 4KYDA 1PB7A 2A5TA 1ANFA 3T9XB 3VVEA 4FAJA 2UVIA 2V3TA 3LUYA 5BWJA 4YMAA 3H6UA 4EQ9A 5I58A 4DLDA 1DTGA 1MPCA 1FQDA 2HFBA 2Q2AA 4GD5A 2D3IA 4RY1A 3I5OA 3MVZA 2QS1A 3KN3A 3EN3A 3D4CA 3RLFE 2HQ0A 1H3DA 3O9PA 3IOUA 3T9VA 3GBBA 1LFGA 5HBCA 3OSQA 3G3HA 1NH8A 1JW5A 2CZLA 3CG3A 2G29A 4ECFA 5I2KB 2NOOA 2RC8A 1PB8A 2XXYA 3PPQA 4ZEFA 4NE4A 5DVFA 3LSLA 2XXQA 3OENA 5KCJB 1DPEA 2DXRA 4QHQA 3O66A 2I49A 1LAXA 3FJ7A 4JDFA 2I58A 1SW2A 4LZ7A 1B51A 5H8FB 3K4UA 5FTHA 4OESA 2V3UA 4HCYA 2XXXA 2UVHA 4KCDA 2PVUA 4L17A 3ZS6A 3Q26A 4U1ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F97A 2AL4A 3C9HA 2A5SA 2HZKA 4JSOA 1Q1KA 4YMBA 3A29A 2FNCA 4N8YA 4PC9A 5EQ9A 3LSWA 1R1NA 4TQUQ 2D5WA 4NF0A 2PFZA 1LB8A 4N6DA 2XXVA 3FXRA 3ROJA 1XC1A 2H98A 4HXVA 2Z8EA 2B4LA 2QVRA 3O6IA 4IO2A 4XKPA 2ZZVA 4I62A 4RNSA 4ZECA 1B5IA 3PD8A 5DEXB 4LA9A 1MPDA 3V89B 1FBFA 3TODA 4O3CA 3K01A 1XT8A 4C0RA 5CRYA 1OMPA 1MXVA 3B6WA 3KOTA 1FBPA 1FPEA 3IJXB 1IZ1A 1B3LA 3LV0A 3TDJA 1K9ZA 3RN8A 2WYPA 4POXA 1NUWA 4AS5A 5A5LA 2DXYA 3O28A 2M8CA 3FVNA 2V4CA 4NEDA 1UTHB 5M2VA 4N07A 4F1UA 4BDNA 3TAJA 3KOSA 3RPLA 1LBCA 4THIA 3EF7A 3VVFA 4AB5A 5ET8A 3CIJA 4N17A 2ANJA 1SBPA 2FIXA 4OENA 3MWBA 1LBZA 4EQ7A 4GL8A 4DIGA 4E0XA 2GFEA 2V93A 4LATA 1FTJA 4DZ1A 5FHOA 1RKMA 2DP8A 1NV6A 2REJA 3GLBA 1A55A 1MH3A 1IEJA 2F3DA 5FTIA 4Z7EA 2VPOA 2Z8FA 1GTKA 5CMMA 3T1BA 4G2ZA 4YB6A 4QFOA 4EXLA 1AL3A 2I0BA 2KQZA 3PUVE 2OWSA 1LAGE 3IR1A 3UA8A 5I2KA 2NWJA 4JWOA 1CNQA 4P8BA 4LUBA 5IAIA 3MW0A 5KCJA 4OFJA 1O63A 2WBDA 3CG1A 1MQJA 3M3KA 4PF6A 4ELQA 3FASA 1EYKA 1T0KA 2ONKE 1S7YA 4I3YA 3R7XA 3HHFA 4O7IA 1R9LA 1IITA 4PAKA 3OELA 4MNPA 4OANA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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