2R6GE

The crystal structure of the e. coli maltose transporter
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a catalytic intermediate of the maltose transporter.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK
molecule tags Hydrolase/transport protein
source organism Escherichia coli
total genus 117
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2r6gE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2r6gE01
5I56B 1T0KA 3U1OA 1B7UA 2VHAA 1M5EA 4YB5A 3G3JA 5I59B 3TCFA 3MVZA 4OERA 2DE2A 4G8HA 3CI8A 1M5FA 5EYFA 3U92A 3AXFA 1D9YA 2H25A 3N26A 4LZ5A 4OVJA 3OO6A 3QUJA 1AOVA 1ELJA 1A8FA 3PPOA 1JVYA 4ZS9A 4GL8A 3MJNA 2GHBA 3CSGA 4X48A 1II5A 3RN8A 4HS7A 5AA2A 4U23A 2O7UA 4FE8A 4Q30B 3VE1B 1TFAA 1AL3A 1N0TA 4PE5B 3TTKA 4ZZEA 4WKMA 5I58B 3IJXB 3HHGA 4H0WA 3FVNA 4YMBA 3VVFA 2AL4A 1DSNA 1LAXA 3TEPA 3T9XB 1I6AA 3H3GA 4P11A 2XXHA 4OHNA 4DXBA 3RNNA 3MQ9A 5I56A 5I2NA 2E1SA 5CC2A 3C31A 2UVHA 3SEXA 1VR5A 2H99A 1Y20A 5DYHA 2LAOA 1EZ9A 4ND9A 5TP9B 4OZ9A 4QFLA 1P1QA 2HCAA 2XD3A 1VE4A 4U4SA 3KJTA 4H5FA 4JWXA 3JYRA 4F39A 1PB7A 1A7LA 3EHTA 1LBCA 3TQWA 2I4CA 3Q29A 4EXKA 3O29A 3OO8A 4FATA 3CG1A 2Y7PA 4WEPA 3W15C 2DWIA 3R6UA 3FXRA 2ABHA 4OENA 3IL1B 5JK4A 3TFLA 4HW8A 3WAEA 2ONSA 1PBQA 1ZJLA 3PPNA 3ONMA 3FGSA 3N6TA 4OTEA 4NF5A 4F22A 2QSXA 2XXXA 2DE3A 1B3EA 3CR9A 2AL5A 1LGBC 1WODA 2XX9A 5DEXA 4LVQA 5KZTA 4YAHX 4F2QA 2I58A 2VD2A 1PEBA 4RY1A 4Q5TA 1XOCA 3MZBA 1MH3A 2A5SA 1B7HA 1MXYA 1UTBB 2GH9A 4KCDA 3N94A 1NL5A 2O84X 1AIVA 5TP9A 4G8NA 4KYEA 2PT1A 3KBRA 5CI5A 3MPKA 1B5JA 3FATA 5AE4A 1BKAA 1A55A 3EPEA 3O6HA 2F7AA 5DTBA 3K6UA 2RKMA 1B0HA 4F3GA 1FQDA 3PMWA 3UK4A 2UVGA 3VLUA 4FAJA 5TU0A 1SYHA 3SEYA 2XX7A 5DT6A 4R6HA 4P0GA 4TLLB 3IR1A 4BDMA 1JEUA 3CVGA 3S9NC 3CFLA 4O3BA 2OK2A 4XKPA 4EF1A 3T9VA 2NWJA 3OENA 1Y1ZA 3CFZA 2D5WA 3E4RA 3BBRA 4XTCQ 2RCAA 3O66A 2ZYNA 3RPWA 3DP8A 2Z23A 1TXFA 1AMFA 4OWDA 2X7QA 4ESXA 3RLFE 3FVGA 1DPEA 4OMBA 4EUOA 3MPLA 3G7WA 1UTBA 1URGA 4YZZA 2Y7WA 4I8CA 1LAFE 4PFUA 2R71A 4X1DA 3H06B 3H6UA 2ONRA 3OEKA 1LCFA 1QKBA 4EF2A 2Q8JA 2REJA 1CE2A 1QJMA 3UIFA 1VSOA 2QL3A 4OXVA 1Y3NA 3G3GA 4LATA 3ILUB 1LB9A 4GXSB 3UN6A 3PV0E 1Z7NE 1PDAA 3OEMA 4NF8B 2ZXTA 3OO7A 2ZYOA 4GFRA 1P1WA 2NUVA 3HO7A 1B4ZA 3C36A 4F19A 3KG2A 2E0SA 5DVIA 4H65A 2Q2AA 4KI0E 1MM7A 3IB0A 1J1NA 4TOZA 1SI0A 3EHSA 3RY3A 1B05A 4G77A 4MF3A 3IO6A 3GZGA 3VLWA 3FIRA 2I4BA 5BWJA 1LFGA 3TZAA 2R9JA 4ELPA 3Q27A 1TFDA 4G68B 4R72A 3T9UA 4Z0IA 4YKIA 2Z22A 1BTJA 2GRVA 3HCQA 5FHMA 3FV2A 1IZ1A 3O9PA 1FCKA 3B7DA 2RC7A 3JZJA 3Q28A 1YAEA 1JW4A 1P1NA 1D9VA 3G3IA 4F1YA 3C33A 1TWYA 4HCWA 1N7XA 4I9DA 3TYHA 4YU0A 4YKJA 4DE8A 4NWCA 3RTWB 1JVXA 3BFUA 4DCYA 2B3BA 3IB2A 3VFJA 1DTGA 3QSLA 3K6XA 2X7PA 1H3DA 1ZU0A 4NEDA 4PFWA 3KZGA 4LA9A 3VXBA 3MW0A 3RTFB 5I2KB 1SW1A 4Z7EA 1QW0A 1I69A 4DZ1A 3FD3A 2DSFA 5B70A 1ZMGA 4GL0A 1NMUA 1MY1A 3KEIA 3LUYA 2I3WA 1QUIA 2D3IA 1IXIA 4G68A 2YPNA 5H8QA 3UP9A 1B1HA 2PYYA 1B4HA 5L9SA 3FUZA 3QUFA 4JDFA 5AA2D 2P1SA 4F2OA 4XKRA 3R7XA 3I3VA 4H6DA 4NF6B 4GD5A 4GOTA 4IO5A 3SESA 3RQTA 2DOJA 3FVKA 3TPAA 2GHAA 3T9HB 3IO4A 3SDFA 1PC3A 2VD3A 4ZEFA 3QIMA 2KLFA 1LSTA 5FHNA 3OSRA 5I2NB 1FW0A 2HFBA 4DLDA 4GXAA 2QRYA 3H6TA 1H43A 4R74A 4RPOA 3IORA 1N76A 4I1DA 1SW4A 4U1ZA 3ZKLA 1MS7A 1MH4A 1SW2A 3OXNA 2HZLA 5K2YA 3TTRA 2ESNA 5I2KA 3B6WA 3RT8A 2F7BA 3A3UA 1NKXA 2XD2A 3PUXE 3MAMA 2DXRA 3U93A 4R2BA 4ELRA 3T96B 4ZZAA 1H76A 4EQ9A 1MDQA 2DP8A 1BIYA 5IAIA 1I6BA 3BKIB 4NF6A 5K2XA 3ZS6A 2Z8DA 1Q1KA 2CMOA 4GRKA 4NF5B 2O69A 1LCTA 1Y4TA 3C35A 3TCHA 2F97A 1MPDA 4XKQA 3PMVA 3W9WA 2Q2CA 5DEXB 1R9QA 3ECRA 4KPTA 3C9HA 2WKYA 3T22A 1OVTA 4OFLA 4FEDA 1B5IA 4QF9A 1USYH 2B65A 3WAFA 3IOUA 4ISUA 2HAVA 3B6TA 3KN8A 3KJ7A 1FTKA 4FEBA 1FTJA 4LZ7A 3G3FA 5M2VA 1SDXA 1A8EA 4LQ2A 2VGQA 1OMPA 4H5GA 4N13A 1TT1A 3I6VA 4BDLA 3MBPA 3M3LA 2RC9A 2F34A 1YCJA 4QRZA 3ZSFA 4IY6A 1JQFA 3TUSA 1EZOA 3IOVA 1MQDA 1DPPA 4RPNA 5HPQA 1IUDA 2O1LA 2A5TA 4ECFA 2Z8EA 3H7MA 3N5LA 3I5OA 3FXQA 4F31B 4DIGA 3L6HA 5EHMA 2QS4A 4AB6A 4N07A 5L9MA 2V84A 1A40A 4OEUA 1Y1MA 1ZTYA 3DLNA 3TELA 4WXJA 2XXWA 4NE4A 2XXIA 4X9TA 2V3QA 4C1UA 2VP1A 3GBAA 2FA7A 4EXLA 1CB6A 3CIJA 3SEUA 1EZPA 1WVJA 5H8HB 5CRYA 3CG3A 2Y7IA 2P2AA 4DDDA 1LAHE 2ZYKA 2CZLA 4H1XA 3C34A 3U8QA 1WDNA 4OFOA 3QYTA 5A5XB 3B6QA 4R9FA 4QFOA 4BDNA 1NNTA 4NMYA 1I6QA 3PUVE 1B5HA 1UQWA 1S9TA 2RCBA 3LBSA 4IB2A 4NWDA 4JBZA 2OCUA 4IO2A 2DS9A 3KFMA 1SBPA 4GQOA 3TQLA 1SW5A 5CMCA 2XXQA 2XX8A 1MQJA 3V83A 1FTLA 3MVXA 4ESWA 5CMMA 4XKNA 2H5YA 3MVWA 4I62A 3D4GA 5BUUA 3VVEA 3OMBA 1QUKA 2OLBA 3DP4A 2VOZA 1N04A 2F6PA 4GIZA 5AA3A 1IITA 3K02A 1GGGA 3SEWA 1OIBA 2RF1A 2REGA 2RC8A 3QAXA 1MPCA 4ZE8A 1B1XA 2W7YA 5H8HA 1B3LA 1MY2A 3K1MA 1MRPA 1N7WA 3HV1A 5CM6A 1UTHB 5AA4B 2F7CA 1M5DA 4FIMA 2UYEA 1NH8A 4JWYA 1L5TA 1FTMA 1P1UA 1DOTA 3TTNA 3PD8A 3PD9A 1B52A 5A5XA 5L9OA 3TTLA 5F7VA 1LB8A 3HSTA 3QK6A 1N3WA 3N6UA 3L6GA 1Y3PA 4QFNA 5ICQA 4PQJA 4F1UA 1FQCA 3A09A 4K3FA 3K6VA 3O6GA 4EDPA 1RYXA 1RKMA 4BDOA 2YLNA 1B7ZA 4LP2B 3JV9A 1YPNA 1NH7A 2P0SA 2R6GE 1MY4A 2XXYA 4DXUA 1URSA 2F35A 4PETA 4QHQA 5CBSA 1N84A 3MZ1A 2O68A 3OELA 3R26A 4ONYA 1XHYA 3KOSA 3LC8A 1PB8A 2D21A 4UACA 2OWTA 3O2AA 3EQ1A 4KYSA 3FXUA 1HSLA 4OESA 4PFYA 4ELQA 2DYXA 1UTHA 5AA4A 5H8SA 4F29A 1BLFA 4XIGQ 1URDA 3W9VA 4BDRA 5H8QB 3FVOA 4KD5A 4XXUA 3G3HA 3UGWA 3E13X 2QMXA 1FQAA 3GLBA 4X1BA 3S2VA 2O51A 1B9JA 1UIVA 1ZLQA 4F3SA 1US5A 3KGCA 4N6PA 1US4A 2PMSA 3T66A 5ICTA 2AIXA 4JXIA 4RNSA 3ILTB 2G93A 2PVUA 3EN3A 4LQ5A 1JW1A 2I6EA 3KOTA 1MM6A 2IEEA 3HHFA 3GXAA 3MZ9A 3PU5A 1S7YA 1B3FA 4MLQA 4QFPA 1B40A 1MXWA 1H45A 2ONKE 1Y3QA 1OVBA 4GF8A 3TCGA 4IO3A 3PPRA 3TTMA 3IK6B 3TODA 3C32A 1OLCA 1XVYA 3PPPA 2M8CA 5KCJA 4JB7A 1JW5A 3VLVA 2Q89A 2ANJA 2F8DA 3S4UA 5LOMA 4KCCA 1GV8A 5ISUA 2QMWA 4RK9A 4RK2A 4LONB 1O7TA 2OJTA 3PUWE 4FECA 3MUQA 4OEVA 3FJMA 4TQUQ 2F5XA 1QVSA 5I57A 2I48A 2Y7RA 3PUYE 1MXXA 1ZIUA 5HBCA 1AH5A 5DVJA 2XHDA 3OO9A 1ATGA 4ZEBA 1MQGA 3H6VA 1NNFA 3C4MA 4HTGA 4OETA 3MWBA 3KSJA 2FNCA 3M8UA 4OYVA 2ZMBA 3RGYA 4KQPA 1VFEA 1B2HA 4NF4A 2V93A 2QS2A 5JTYB 4F3PA 4Q8RA 3BFTA 3LSWA 4RJZA 2OZZA 4HCYA 4YB7A 3Q25A 1R6ZA 2IA4A 1LBBA 1A54A 5KDTB 2XXUA 3EF7A 3MP8A 1EH3A 2OWSA 3MP1A 3SEVA 4AQ4A 3FZVA 5FTIA 1FQBA 2A5TB 5ITOA 2NOOA 4H8IA 1SD3A 4YB6A 1SI1A 4JSOA 3IX1A 1RYOA 2HEUA 1F9BA 4NTLA 2DE4A 3HPIA 4MFIA 1IXHA 1Y4CA 4E0WA 4YICA 3K1PA 1KWHA 2I49A 3O6IA 4U2RA 2HAUA 2FYIA 4KFQA 4G4PA 1MQHA 2QPQA 4IY5A 1DTZA 3S9EA 2Q88A 5JTYA 1QUJA 5EHSA 3CRBA 4H67A 5I59A 4R2FA 2UVJA 3Q26A 1UIUA 1IEJA 5KDTA 4FJPA 5CMBA 1B0LA 2ZYMA 1MG1A 2F78A 3MC2A 3CFXA 1B3GA 4FORA 1MXVA 4C0RA 3KN7A 3MP6A 3RUMA 4O3AA 3D4CA 2XXTA 4YMAA 4JSDA 3K2DA 3EHUA 1MQIA 3KSXA 5FHOA 4IO6A 1S50A 3RT6B 2AYSA 3OOAA 1B6HA 4BDQA 1SYIA 3DELB 3U72A 3QXMA 3FASA 4G8MA 1LFHA 2DVCA 3MVYA 3VV5A 4MLVA 3K0VA 3H6WA 5B7DA 1R1NA 5I58A 4M4GA 3SERA 3HN0A 2Y7KA 1R9LA 3KN3A 3T93B 1D4NA 5H8NB 1QKAA 3F11A 2X26A 4POXA 1PBPA 1FTOA 4OFJA 3OSQA 2UYFA 4TLMB 3M3FA 1VFDA 1XS5A 3VVDA 1JETA 2H9BA 1IQ7A 1LFIA 1QULA 3IOTA 3THIA 1XC1A 5I84A 4M1VA 5ELVA 2I0CA 4RA1A 4YKPA 4LZ8A 1EU8A 3UORA 4GWOA 3E9XA 1GR2A 1HSEA 2B3FA 1MXUA 2ZNTA 2QS3A 2DWAA 3SETA 1Y9UA 2F36A 3LSLA 1JNFA 3K6WA 1GTKA 3A3CA 5HM4B 4F18A 2Z8FA 2DWHA 1SQYA 4AB5A 1ANFA 1O64A 4H8JA 5IKBA 1IXCA 4ZE9A 3FJ7A 5CMKA 1H44A 2HZKA 1ZBMA 1B58A 3K00A 1NNKA 4IO7A 5JEIA 5H8NA 2HQ0A 1ZKBA 4Q0CA 2XXPA 1POY1 5F1QA 1USYE 3IAZA 3DP6A 4KHZE 4KR5A 1N3XA 3V89B 4R6KA 1POTA 1MY0A 3E3KA 5H8FB 5TPAB 1B51A 2NXOA 1HSJA 2Y84A 1P1OA 3K4UA 2ZNUA 4R9GA 1XVXA 1B32A 4G68C 2UVIA 3ZKKA 3PGFA 3S9LC 4KYDA 4QSEA 2RINA 2YJPA 5DVFA 4U1OA 3H4ZA 1IIWA 2V3UA 5FTHA 1FQFA 4R73A 4PP0A 2QJEA 3K01A 1B3HA 2NVUB 5AA1A 1M5CA 3PMXA 3USDA 4QFKA 4RXLA 4GLIA 4R75A 2I0BA 1MXZA 2QS1A 2XXVA 2I3VA 2V3TA 2BJJX 4LUBA 3IJOB 3PPQA 4P0IA 3FJGA 3M3KA 3TKDA 3O97A 4U22A 4DCXA 4F3BA 2OBGA 5KCJB 4OQOA 4UA8A 3O28A 1IXGA 4QSDA 1BP5A 4MH5A 3UA8A 4EQ7A 5J1DA 1OQHA 4EQBA 1MY3A 3FV1A 3V5AA 4GVOA 3DM0A 2HXWA 4G2ZA 1M5BA 5H8FA 4R6YA 5TPAA 2DVZA 1P99A 4ELOA 1Z7ME 3VDFA 3CSBA 4ZDMA 5I57B 2F6GA 4RYAA 3TAJA 4THIA 4ZEDA 1O63A 3V8XB 1DMBA 1D3KA 2PBWA 3U94A 3P7IA 4IGTA 1JEVA 2DXYA 2O7IA 2H4IA 3SKPA 3GBBA 1MDP1 5CBRA 4BLAA 4L17A 2PT2A 2Q9TA 4NF4B 2V25A 4ZEKA 4U4XA 3LSXA 5L8DA 4WEDA 4IO4A 4F1VA 2THIA 4NF8A 3OD7A 3TMGA 1OLAA 4ZEIA 2DWJA 2O1MA 2UXAA 4C1TA 1OQGA 1LAGE 4ZECA 3IB1A 3K1NA 1SVXB 1LLSA 3S9MC 3VXCA 2ALUA 4PFTA 2H98A 4YKKA 2O6AA 2DQVA 1XT8A 4U21A 1NFTA 2G29A 4POWA 1NNPA 5AA2B 2GFEA 3H03A 1YTVA 1MPBA 3ODBA 1FQEA 2PX1A 4IGRA 2XXRA 3G3KA 4QSCA 4O3CA 1GVCA 3TDJA 3LR1A 4JWOA 1Q35A 1B46A 1PB9A 4E0XA 5ITPA 4DXCA 2ZNSA 3IOWA 3LSFB 1A99A 4MBPA 3PUZE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I56B 1T0KA 3U1OA 1B7UA 4PC9A 2VHAA 1M5EA 4YB5A 3G3JA 5I59B 5ET7A 5J16A 4GWXA 3TCFA 3MVZA 4OERA 4P47A 2DE2A 4G8HA 3CI8A 1M5FA 1IMCA 5EYFA 2P3VA 3U92A 3AXFA 1D9YA 2H25A 3BIGA 3N26A 1K9ZA 4LZ5A 4OVJA 2Q74A 3OO6A 3QUJA 1AOVA 1ELJA 1A8FA 3PPOA 1JVYA 4ZS9A 4GL8A 2XWVA 3MJNA 2GHBA 3CSGA 4X48A 1II5A 3RN8A 4HS7A 5AA2A 4U23A 4O94A 2O7UA 4FE8A 4Q30B 3VE1B 4GWUA 1TFAA 1AL3A 1N0TA 4PE5B 3TTKA 4O7IA 4ZZEA 4WKMA 3U65A 5I58B 3IJXB 2XWOA 3HHGA 4H0WA 3FVNA 4YMBA 3VVFA 2AL4A 1DSNA 1LAXA 3TEPA 3T9XB 1I6AA 3H3GA 4P11A 2XXHA 4I3EA 4OHNA 4DXBA 3RNNA 3MQ9A 5I56A 5I2NA 3KBZA 2E1SA 5CC2A 3C31A 2UVHA 1NUWA 3SEXA 1VR5A 2H99A 1Y20A 5DYHA 2LAOA 1EZ9A 4OVTA 4ND9A 5TP9B 1IMEA 5I7IA 2CZHA 4OZ9A 4QFLA 1P1QA 2HCAA 2XD3A 1VE4A 4PBQA 4U4SA 1YYZA 3KJTA 4H5FA 3KC1A 4JWXA 3JYRA 4F39A 1PB7A 1IMFA 1A7LA 3EHTA 1LBCA 3TQWA 2I4CA 3Q29A 4EXKA 3O29A 4NN3A 3OO8A 1DBZA 4FATA 3CG1A 2Y7PA 4WEPA 3W15C 2DWIA 4PF6A 3R6UA 3FXRA 2ABHA 2WBDA 1FPKA 4OENA 3IL1B 5JK4A 3TFLA 4HW8A 3WAEA 2QVUA 2ONSA 1PBQA 1ZJLA 3PPNA 1Q9DA 3FGSA 3ONMA 3N6TA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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