2R6GE

The crystal structure of the e. coli maltose transporter
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a catalytic intermediate of the maltose transporter.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK
molecule tags Hydrolase/transport protein
source organism Escherichia coli
total genus 117
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2r6gE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2r6gE01
2FNCA 1FTKA 5H8HA 1MXWA 4G68C 4IGTA 1B46A 3ZS6A 3K0VA 3TDJA 3RTWB 3MP6A 2REGA 2QS4A 5FTIA 3DP6A 1OVBA 3UORA 2P0SA 4Q5TA 3PV0E 4DCXA 4YKJA 4X1DA 4G8MA 3PMVA 3CR9A 1Y3PA 1RYOA 3TKDA 4BLAA 2HEUA 3M3KA 3K02A 3V8XB 3K2DA 4OEUA 4OYVA 5AA2D 1FTLA 3LC8A 1B5HA 3T96B 5HM4B 3PPOA 3M3FA 4NF5A 2I6EA 5ELVA 1LCTA 2E0SA 3OO6A 4G77A 2QRYA 3DELB 2Q8JA 1R9LA 1XT8A 5ITPA 3PMWA 2B3BA 3KOTA 4KYEA 5TPAA 4KYDA 4IY6A 1B0HA 2OZZA 1MY4A 3PGFA 4U22A 2XXPA 3QUJA 3S9EA 1JEUA 3S9LC 4PFYA 4QFKA 2DWIA 5CM6A 4TOZA 4JB7A 5JK4A 1LAXA 3FD3A 2V3QA 2UVGA 1POTA 3Q29A 1UIUA 1GV8A 4F2QA 2F6GA 1XS5A 1P1NA 1B5IA 3TYHA 1TT1A 2A5TA 3H03A 2AL5A 4Q30B 4R75A 1QW0A 1M5FA 5F1QA 3RUMA 5ISUA 3EF7A 1RKMA 4NF8A 2O7IA 5TP9B 4DCYA 4ELPA 2THIA 3C33A 4OERA 3TTKA 4LZ7A 2I3VA 1DPPA 2DP8A 1MXZA 4ELOA 4QSCA 2DE2A 1IXCA 1IEJA 2RC9A 3RY3A 1DTGA 4EXLA 3K1PA 3KEIA 3KBRA 5FHMA 3JV9A 3CSBA 4BDLA 4ZECA 1MXYA 2PBWA 1I69A 3IB2A 4QFNA 1B0LA 3O6IA 2A5TB 4ESWA 1VFDA 2QJEA 3FXRA 1RYXA 3N26A 4JBZA 1ZMGA 4OFJA 5AA4A 2F97A 4ZEKA 3IB1A 4QFOA 4O3BA 4ZEFA 3SKPA 2RINA 1B4HA 3KSJA 1Z7NE 1XC1A 2O68A 2NVUB 3S9MC 4ZE9A 3FUZA 1LFGA 1LB8A 2H9BA 4YB6A 1MY1A 1NFTA 3GZGA 3OO9A 2DXRA 1ZKBA 4KFQA 3UK4A 1WDNA 2O84X 4ELRA 1UQWA 2ABHA 4DIGA 4LUBA 2R71A 3TQLA 3C35A 4LZ5A 4YB7A 5CMMA 3RT8A 3CIJA 3FXQA 5HBCA 1URSA 3B7DA 1QUJA 4QSEA 1IQ7A 1FTJA 3UGWA 4OETA 2I0BA 4MFIA 4I8CA 2PT1A 2HZLA 5K2YA 2PYYA 3MVXA 2D21A 2HXWA 1N7WA 3Q25A 2Z8FA 1M5BA 3H6UA 1NNPA 3T22A 4H5GA 1MPDA 4IO5A 5KDTA 1MY0A 3CG1A 5ICTA 1MY3A 2Z8DA 3FJGA 2GHBA 2ONKE 1Y20A 1UIVA 5H8QA 2QMXA 3U8QA 4YMAA 1P1OA 1B05A 3PPNA 3MAMA 4KYSA 3ZKLA 1R9QA 4U21A 3HPIA 3M8UA 2A5SA 3F11A 4BDMA 4I1DA 5I2KA 3VVEA 1MQIA 5DEXA 3UN6A 3RGYA 3OXNA 3N6UA 4E0WA 1CB6A 1JETA 3K6VA 3KZGA 3THIA 2VD2A 1IIWA 1YTVA 4GF8A 5FTHA 5KDTB 5L9OA 1B3HA 2O1MA 2UVIA 5AA2B 2NWJA 3IX1A 3HN0A 3KN7A 4OFLA 2Z23A 3BBRA 3O6HA 2OK2A 4NF4A 3H6TA 4H8IA 2ZYOA 4RK9A 3L6GA 2F7AA 3G3FA 4IO4A 4F18A 4ZZAA 5F7VA 1JW5A 1P1WA 4LQ5A 2Q9TA 4G68A 4QRZA 2V25A 1MPCA 5DYHA 1XVYA 2X7PA 4HTGA 4F3BA 5A5XA 1T0KA 3DP8A 4F3GA 5DT6A 5AA1A 1QULA 1ELJA 1B7HA 1D9VA 3IL1B 5KCJB 1NNTA 1BP5A 5BWJA 4RK2A 4H1XA 1D4NA 4MLQA 2OCUA 3HCQA 4OWDA 2Q2AA 2DQVA 2XXYA 4HCYA 1SI1A 3KN8A 3MBPA 3UIFA 1I6QA 2VHAA 4IO6A 1GVCA 2H25A 3TTRA 2XX8A 2CZLA 2VD3A 1ZJLA 1R1NA 3VLVA 2UYEA 2YPNA 1DSNA 1AH5A 1ZLQA 5CMKA 1BTJA 2XXXA 3SEWA 4R2BA 4QFPA 5H8FB 5A5XB 4GLIA 1LFHA 2G29A 2P1SA 3DM0A 5IAIA 4IGRA 1A99A 2IEEA 4GOTA 1GTKA 3RLFE 4HW8A 2OLBA 3OOAA 3QAXA 1N3WA 1JNFA 1PC3A 3IOTA 3UA8A 4LP2B 4LVQA 3TTNA 4PE5B 3PUZE 3FXUA 4GD5A 3N5LA 3VFJA 4EQBA 2GH9A 4F22A 4OENA 4F2OA 2DVCA 3OEKA 5JEIA 3FV1A 5LOMA 4ND9A 3U93A 3FJMA 2Q89A 5JTYA 1B4ZA 2HQ0A 2ZMBA 5I58A 1B6HA 3V89B 3A09A 4RPNA 2DOJA 3Q26A 5I56A 4IO2A 2O51A 3Q28A 1D3KA 4XKQA 3K6WA 4G2ZA 1JQFA 1Q35A 3TCHA 4FORA 1H3DA 3Q27A 1LAGE 2BJJX 4EUOA 1EZPA 5I2NB 4R6KA 3V5AA 2ESNA 4C1TA 3TTMA 5I58B 4U4XA 1LAFE 3LSLA 4GL8A 1B1HA 4P11A 4P0IA 1MXUA 1WODA 2LAOA 4QHQA 3BFTA 1B52A 1MDQA 4KCDA 1A54A 5J1DA 4ONYA 5H8HB 3S4UA 4YKKA 2Y7RA 1URGA 4UA8A 1Y4CA 5CRYA 4N6PA 1TFDA 5ITOA 3TCGA 2M8CA 4ZEIA 3CSGA 1EU8A 3QXMA 3H7MA 4RA1A 3T93B 3T9UA 3ONMA 3A3CA 3K1NA 1US5A 4M1VA 1FTMA 1B51A 1Q1KA 2Y7KA 3RQTA 3SDFA 1Y3QA 4O3CA 5AE4A 4GFRA 1US4A 4F39A 4FECA 2PT2A 4KHZE 5L9SA 4ZE8A 1VE4A 4KQPA 1B3LA 3CG3A 1BLFA 1FQFA 4NF5B 4YU0A 3PUWE 3GBAA 3TEPA 1GR2A 2I0CA 4EXKA 2O1LA 2QL3A 3HHGA 3V83A 1PB9A 1B32A 3C4MA 5TPAB 1FQDA 1USYH 2X7QA 1Y3NA 4F1UA 2F8DA 1SW4A 4PFWA 1B9JA 5H8SA 2YLNA 3IJOB 1B5JA 3A3UA 2D3IA 3JYRA 3O6GA 5IKBA 2ONRA 4XTCQ 1XHYA 3E13X 4JDFA 1Y1ZA 3SEVA 4O3AA 5B70A 1O7TA 5DVIA 4H67A 3PPPA 4HCWA 5H8NA 2XXWA 1JVYA 2ALUA 3H6VA 2Y7PA 4H8JA 4NF8B 4QSDA 1QJMA 2F7CA 4U1ZA 4EF1A 1S50A 4F29A 1N04A 2I48A 3KFMA 3MP1A 4G8NA 4IB2A 3SETA 4F19A 2UYFA 1B58A 1B2HA 2QS1A 4EF2A 2CMOA 1FTOA 3OMBA 3ODBA 2NOOA 4GRKA 4Q0CA 3MC2A 2Q2CA 2HAVA 3MVWA 3PD9A 3FVNA 1OVTA 4C0RA 1JW4A 4KI0E 3U92A 1NL5A 4JSDA 3D4GA 3OEMA 3TZAA 4WXJA 1M5CA 1SQYA 4ESXA 1IXIA 1PBQA 1II5A 2NUVA 1BIYA 1B7UA 3EN3A 2Y84A 1LCFA 3B6WA 3DP4A 3TPAA 3C36A 4ZEBA 5AA4B 1B3FA 3PPRA 3HSTA 2DWJA 4R74A 1NNKA 1SI0A 4P0GA 4R73A 5CBSA 1Z7ME 3KJ7A 4NF6A 3PUXE 3IR1A 2DVZA 2AIXA 3IJXB 3K00A 3FIRA 4F31B 3QUFA 3ILTB 2B3FA 4U4SA 1SD3A 3TFLA 4N13A 2W7YA 4ZZEA 4R9GA 3SEUA 2VP1A 2O69A 4EDPA 1WVJA 4R6YA 4ECFA 1YAEA 4NE4A 2F36A 5I84A 1POY1 3C9HA 1P1UA 1NKXA 2O6AA 3MZ1A 4PFTA 1HSLA 2F6PA 1H44A 1SW5A 4PP0A 3MPLA 3EHTA 3LSWA 3FGSA 4OTEA 4RY1A 4YKPA 1IITA 4OHNA 3W15C 3E4RA 2I4CA 4M4GA 4RYAA 1N84A 1FW0A 3VV5A 4XKPA 3MUQA 4Z0IA 3SERA 3MVZA 4MLVA 5H8QB 3LR1A 4X1BA 3MW0A 3I6VA 4KR5A 4LQ2A 2F5XA 3IOVA 3ILUB 1N7XA 3WAEA 4YKIA 1TFAA 5DVFA 1ZBMA 1R6ZA 5I2KB 3EQ1A 1OMPA 5FHOA 3ZKKA 4OFOA 5DEXB 4K3FA 1MXVA 2OWTA 4U23A 2AL4A 4XKRA 1LLSA 4FEDA 5BUUA 3FJ7A 2D5WA 1OQHA 4X9TA 3C31A 1DOTA 2DE4A 3OD7A 1UTHA 2QSXA 4RNSA 1ZIUA 1A8FA 1HSJA 2P2AA 2YJPA 1FQCA 4NF4B 4POXA 2RCAA 1XVXA 2QMWA 2Z22A 4Q8RA 2OBGA 2UXAA 3HHFA 5I57A 1IUDA 4GIZA 4F3SA 2XXQA 4BDRA 4F1VA 2H4IA 2R9JA 1UTBA 3TQWA 3W9WA 2DSFA 2H98A 1LFIA 2F78A 4IO3A 4G68B 1DPEA 3MPKA 2V84A 2RF1A 3TUSA 1H45A 1PB7A 3GXAA 3SEXA 1VR5A 3N94A 4NMYA 1CE2A 3G3JA 1JVXA 1OLCA 4OMBA 1MY2A 1MG1A 4G8HA 3U72A 2ZXTA 5K2XA 4FE8A 3RNNA 1MXXA 5I59A 4WEPA 1L5TA 2I49A 4POWA 3WAFA 3RT6B 3S2VA 2XD2A 4Z7EA 3VLWA 5DTBA 4GQOA 2DXYA 3HO7A 3CFXA 1DTZA 1NMUA 1LGBC 2ZYMA 1AIVA 2RC8A 1P99A 3P7IA 5EYFA 1O64A 1PB8A 3K01A 2UVHA 5HPQA 3W9VA 2ANJA 2GFEA 3VVFA 4JWOA 3H06B 4GWOA 4R9FA 1MQGA 4QFLA 2ZNTA 1O63A 4ISUA 4JWYA 3CFZA 3AXFA 3CVGA 5I59B 1TXFA 2F35A 4ZS9A 4FIMA 2Y7WA 1XOCA 4PETA 4THIA 5L9MA 1AOVA 4FJPA 1EH3A 3L6HA 5JTYB 4TLMB 3KN3A 4TQUQ 1JEVA 5EHMA 1ANFA 3FVOA 1EZ9A 2KLFA 3T9XB 2I58A 5I56B 4H5FA 3EPEA 2QS3A 1GGGA 2X26A 1IXHA 1FCKA 3VXCA 1OLAA 4I9DA 1LAHE 4TLLB 2PMSA 4FEBA 4DXUA 2I4BA 4ZEDA 4OVJA 5DVJA 3K6UA 4YAHX 4OQOA 3TTLA 4AB5A 1MQJA 2XXHA 2XHDA 1MRPA 2O7UA 1SBPA 2I3WA 3PD8A 5TP9A 4OXVA 2QPQA 1KWHA 2V3UA 3RTFB 1N76A 3CRBA 2HCAA 5EHSA 3VVDA 1OQGA 2GHAA 1P1QA 4BDOA 4F3PA 1Y4TA 2HFBA 4WKMA 1NH8A 3QK6A 2FYIA 2RCBA 3JZJA 4DDDA 4WEDA 4JXIA 3PUYE 3VXBA 2V93A 3TMGA 4JSOA 1H43A 3RN8A 5M2VA 4EQ9A 5FHNA 3B6QA 4XXUA 1VFEA 3MVYA 1H76A 3BKIB 3ZSFA 2NXOA 1S9TA 3K1MA 1MM7A 1QKAA 3O66A 2DWAA 1ATGA 3KG2A 2G93A 3IO6A 1HSEA 2E1SA 3IORA 3IK6B 3H6WA 4YZZA 3QYTA 1B3GA 1PBPA 3OSQA 4EQ7A 1QUIA 3PMXA 1J1NA 1MM6A 1IZ1A 4F1YA 4KCCA 1S7YA 3C32A 1TWYA 2XXUA 1M5DA 3MJNA 3FASA 3RPWA 1A40A 4L17A 3EHSA 4ELQA 3VLUA 1I6AA 4AQ4A 4R6HA 3I3VA 4LATA 1EZOA 1I6BA 3EHUA 4IO7A 4U1OA 3T9VA 2XD3A 4LA9A 3M3LA 2XXIA 2F7BA 3SESA 4DE8A 5H8NB 3FATA 5CBRA 5B7DA 3N6TA 1PEBA 1F9BA 1DMBA 4XKNA 3OO7A 1VSOA 3FVGA 4DXBA 3KJTA 3IAZA 4LONB 4E0XA 4MBPA 4PFUA 3T9HB 3MP8A 3VDFA 3O29A 4ZDMA 1NNFA 3MZ9A 4XIGQ 1MH4A 3MQ9A 3G3KA 3KSXA 5CMBA 2F34A 3TELA 1FQEA 2VGQA 1QKBA 3S9NC 3LUYA 2UVJA 4GXAA 5L8DA 3GBBA 2XXVA 3FV2A 3LSFB 2RC7A 2XX7A 4UACA 3C34A 4PQJA 3G3HA 1N3XA 4H65A 5AA2A 1URDA 1D9YA 3MZBA 2PVUA 1YCJA 1JW1A 4N07A 4FATA 3QIMA 5TU0A 4NF6B 2ONSA 2DWHA 3GLBA 1Y9UA 3OENA 1A7LA 2PX1A 1YPNA 3UP9A 2FA7A 4YB5A 1LBCA 1SDXA 1MQHA 3G3IA 1MPBA 3IOUA 2V3TA 3TCFA 3PUVE 2WKYA 4C1UA 3BFUA 1ZTYA 3R6UA 2GRVA 3H4ZA 3HV1A 3G3GA 3VE1B 3OELA 4AB6A 2XX9A 3B6TA 4IY5A 2DE3A 2ZYNA 5KCJA 1Y1MA 2VOZA 1AMFA 3LSXA 4R2FA 4YICA 3PPQA 1LSTA 1LBBA 4NWDA 4H0WA 3I5OA 3FVKA 4RJZA 2DYXA 2QS2A 3U1OA 4X48A 2R6GE 4LZ8A 1B40A 2RKMA 3OSRA 3DLNA 1PDAA 4HS7A 4KPTA 1B7ZA 1A55A 1BKAA 4RPOA 4RXLA 3USDA 3G7WA 4NEDA 5H8FA 2ZNSA 3R7XA 4H6DA 1A8EA 2H99A 3SEYA 2Q88A 1SW1A 3T66A 1FQBA 4FAJA 3TAJA 4DXCA 1QVSA 1MQDA 1MDP1 1B1XA 3O28A 1B3EA 4KD5A 1SYIA 3MWBA 2XXTA 3LBSA 1FQAA 3O2AA 2ZYKA 5CC2A 4BDNA 1SW2A 2OWSA 4NWCA 4R72A 4NTLA 1M5EA 4GL0A 3IB0A 3OO8A 4OEVA 1NH7A 4MH5A 3KGCA 3O97A 2B65A 3TODA 2DS9A 3H3GA 1MS7A 4MF3A 1AL3A 3CFLA 3D4CA 1UTHB 4JWXA 2HAUA 2REJA 4QF9A 4GXSB 2ZNUA 3KOSA 2HZKA 2OJTA 2H5YA 3R26A 2Z8EA 3E9XA 5CMCA 5CI5A 1ZU0A 5I57B 3QSLA 3IO4A 4I62A 1LB9A 1IXGA 1QUKA 1UTBB 4G4PA 4YMBA 3ECRA 5KZTA 3K6XA 3PU5A 3IOWA 4DZ1A 5I2NA 3FZVA 1SVXB 1SYHA 4BDQA 4OZ9A 2XXRA 2AYSA 3O9PA 2IA4A 4U2RA 1OIBA 4GVOA 2Y7IA 3U94A 3K4UA 1N0TA 4DLDA 5ICQA 3CI8A 5AA3A 4OESA 3E3KA 1MH3A 1USYE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FNCA 1FTKA 5H8HA 1MXWA 4G68C 4IGTA 1B46A 4N17A 3ZS6A 4PFIA 3K0VA 3TDJA 3RTWB 3MP6A 2REGA 5ET5A 2CZKA 2QS4A 5FTIA 1IMCA 3DP6A 1OVBA 3UORA 2P0SA 3KC0A 4Q5TA 3PV0E 4DCXA 4YKJA 4X1DA 4NHBA 4G8MA 4P56A 3PMVA 4KXPA 4PTKA 4DI4B 3CR9A 1Y3PA 1RYOA 3TKDA 4BLAA 2HEUA 3M3KA 3K02A 3V8XB 3K2DA 4OEUA 2XA5A 4OYVA 5AA2D 1FTLA 4NAPA 3LC8A 1NV0A 1B5HA 2B4LA 3T96B 1IMFA 3PPOA 5HM4B 3M3FA 4NF5A 2I6EA 5ELVA 1LCTA 2E0SA 3OO6A 5LTCA 4G77A 2QRYA 3DELB 2Q8JA 1R9LA 1XT8A 5ITPA 3PMWA 2B3BA 3KOTA 1XI6A 4KYEA 5TPAA 4KYDA 4IY6A 1B0HA 2OZZA 3B50A 1MY4A 3PGFA 4U22A 2XXPA 3QUJA 3S9EA 1JEUA 3S9LC 4PFYA 4QFKA 2DWIA 5CM6A 3A29A 4TOZA 4JB7A 5JK4A 1LAXA 3FD3A 2V3QA 2UVGA 1POTA 3Q29A 1FBEA 1UIUA 1GV8A 4F2QA 2F6GA 1XS5A 1P1NA 1B5IA 3TYHA 1TT1A 2A5TA 2FHYA 3H03A 2AL5A 4Q30B 4R75A 1QW0A 1M5FA 5F1QA 4GWSA 5ET8A 3RUMA 4P47A 4I40A 2CZHA 5ISUA 3EF7A 2CEYA 1RKMA 4NF8A 1KA1A 2O7IA 1KA0A 5TP9B 4DCYA 4I3YA 4ELPA 2THIA 3C33A 4OERA 4GX3A 3TTKA 4PDDA 4LZ7A 2I3VA 1DPPA 2DP8A 1MXZA 2WX9A 4ELOA 4QSCA 2DE2A 1IXCA 1IEJA 2RC9A 4MMPA 3RY3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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