2R71A

Crystal structure of the complex of bovine c-lobe with inositol at 2.1a resolution
Total Genus 114

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
5010015020025030030025020015010050
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Metal binding protein
publication title Crystal structure of the complex of bovine C-lobe with inositol at 2.1A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 114
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2007-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2r71A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2r71A02
3KBRA 4F31B 2XXTA 1QW0A 2QPQA 2XX9A 3PPRA 3RQTA 4FEDA 3KN3A 4RNSA 4TLLB 5M2VA 1CE2A 4R2FA 1YPNA 3ILTB 3K4UA 1Y4CA 2UVJA 2OWSA 4RYAA 4ELQA 5H8FA 5FTHA 3UGWA 4GL8A 4AQ4A 1AOVA 2Y84A 5L9SA 3BFTA 5DVFA 1H44A 4QFOA 5KZTA 2ONRA 1IXIA 3HCQA 1DMBA 3MAMA 4ESWA 1HSEA 4FEBA 4Q8RA 2ZYOA 3P7IA 1H3DA 4BDOA 1Q35A 4FAJA 1JW5A 1M5DA 3ODBA 2F6PA 4PFUA 2AL5A 3O28A 1TFAA 3MZ1A 1ZIUA 3Q29A 1JQFA 4IO6A 4DXBA 1UTHA 1MQGA 3W9VA 4ZE9A 3OO6A 4GWOA 5H8HA 3MVWA 2KLFA 4FJPA 2HFBA 1NMUA 1ZMGA 4OZ9A 4XKRA 1B3HA 3CSBA 1LAXA 4N07A 3WAEA 1LAHE 1PB7A 2ABHA 2Q8JA 3IOTA 3V8XB 3S2VA 3MBPA 1FCKA 4KYDA 1YCJA 4POWA 1MY2A 4H8IA 2OCUA 4PQJA 3OD7A 1IXGA 4UA8A 3M3KA 4KFQA 4OHNA 1XT8A 2D3IA 3W15C 4H65A 5K2YA 1EZ9A 2HQ0A 4GQOA 2OBGA 2G29A 1SI1A 2ZNSA 1H76A 3N6UA 3GLBA 4G8NA 4KI0E 2CZLA 3L6HA 4RPOA 2D5WA 2Q89A 3K1PA 4JBZA 1Q1KA 3T22A 2DQVA 3M3FA 1D9VA 5I2KB 4YMAA 4RK9A 3DELB 1WVJA 1B05A 2REGA 3K6XA 3SDFA 1B1XA 2LAOA 3QK6A 1N7WA 3PMVA 2E1SA 5JEIA 1QUIA 2V84A 4ND9A 2YPNA 3S9MC 1ZJLA 3MUQA 5FHOA 3QUJA 4F2QA 1AL3A 3R7XA 3R26A 3LSWA 4MBPA 1OQGA 1MXZA 2I6EA 3TFLA 1IEJA 2VHAA 3TELA 2H99A 3IR1A 1S50A 3CIJA 3QUFA 3HN0A 3KSXA 3JV9A 3IX1A 5KCJB 2DWHA 3C4MA 3O9PA 3VDFA 3LUYA 2O6AA 4MFIA 1Y9UA 5CMKA 3FIRA 2HZLA 4YKPA 3LC8A 4YAHX 4U22A 3FVGA 3FGSA 2UVGA 3FV1A 3FJMA 4NF4B 1A8EA 3EPEA 1MY1A 4PFTA 2OWTA 4OENA 2D21A 3D4CA 3HPIA 5H8NA 1RYOA 3MPKA 3TTRA 1MXXA 3CI8A 1B4HA 3PUXE 1B3GA 4KQPA 5B70A 5FTIA 1XS5A 4GLIA 2Y7IA 2XXRA 1MQIA 2WKYA 2V3QA 5A5XA 3TUSA 3N94A 4NF5A 1JNFA 1LSTA 3E9XA 4DCXA 5I58A 4IO4A 4QFPA 2HAVA 1DOTA 4IB2A 4PP0A 2ZNUA 2NXOA 1Y3QA 3FZVA 4XKNA 3MP1A 3N26A 5I56B 4TOZA 2Z23A 1POTA 4R6KA 4C0RA 3A3UA 1NH7A 2PMSA 3W9WA 1LAGE 4QSEA 4XKPA 4DCYA 4P0IA 3KN7A 4JB7A 5ITOA 2O84X 2XD3A 4EF2A 4MF3A 4EQBA 3DM0A 3O97A 5DVIA 4I62A 1LBCA 4ZECA 1O63A 4M4GA 5TPAB 3TAJA 2I49A 3C35A 2HEUA 3IJXB 4X9TA 4N6PA 4BDRA 2AL4A 1II5A 2QMXA 4ZZEA 3EHUA 3HHFA 1MM7A 1ZBMA 4R72A 1QJMA 3TCHA 2Q2CA 1MDQA 4XXUA 3OMBA 1B40A 1QUKA 4WXJA 4PETA 5LOMA 5FHNA 1NNFA 3RT6B 3VLUA 2E0SA 4QFNA 4U1ZA 4XTCQ 5CI5A 4BDMA 2OJTA 1NFTA 1URGA 2HAUA 3USDA 4OTEA 1PB9A 1OMPA 1P1OA 2H4IA 4X1DA 3DP8A 1LGBC 5B7DA 3MP6A 4DZ1A 1B5IA 3MVYA 3O6IA 2I58A 1H43A 1P1UA 4EUOA 4KR5A 4JWOA 5BWJA 2UXAA 5F1QA 5L8DA 2IA4A 1N04A 4ZE8A 1GGGA 4H0WA 3FVOA 3PPPA 3K6WA 2ZMBA 3K00A 3G3HA 4RA1A 4LP2B 3U1OA 1EU8A 4YU0A 3H7MA 4WKMA 4ZDMA 3PGFA 4OQOA 5AA1A 2AYSA 1ATGA 2ONKE 3I6VA 4HCWA 3SETA 1US4A 5L9OA 1TFDA 3TTMA 4OWDA 4L17A 1QKBA 2FA7A 2FNCA 1JVXA 4AB6A 3QSLA 1LCFA 3CG3A 5IKBA 1FTJA 1MPDA 2RINA 5I2NA 1LCTA 4G68B 3O29A 5CM6A 2O68A 1DPEA 1MG1A 1FQDA 5JTYB 2GFEA 5CMCA 1M5EA 1ZKBA 4DE8A 3MZBA 2XXPA 1I6AA 2PX1A 3OXNA 2A5TA 2B65A 4KCDA 3QIMA 2BJJX 5AE4A 1MY0A 4GXAA 1H45A 1IITA 1KWHA 2DE4A 4ZEKA 1B6HA 4G4PA 5AA3A 2GHBA 4TQUQ 3C34A 1NNPA 3T9HB 4GIZA 3F11A 1FQEA 4NTLA 5TP9A 2DWJA 1A8FA 3VFJA 2F7BA 2NWJA 3H03A 1N3XA 4IO2A 3O66A 1SW4A 3LBSA 2PT1A 3CFLA 1MS7A 2XD2A 3TEPA 5I59A 1SVXB 3RTWB 4U21A 3VLVA 1WODA 3IO6A 3ZKKA 3H4ZA 2H25A 1URSA 1FTLA 4DDDA 1NNTA 4NWDA 1R9QA 5HBCA 1OVBA 4MLVA 3THIA 4F1YA 2W7YA 3VLWA 4PE5B 4F2OA 1MDP1 2VOZA 1QKAA 2ANJA 3EHSA 4H6DA 3V89B 2V25A 4LUBA 4LATA 3TCGA 2DE3A 1PDAA 3RNNA 3OENA 1Z7ME 4FIMA 3FATA 5BUUA 3H6WA 4H67A 2ZYMA 1P99A 1DPPA 4OERA 4NEDA 4NF8B 4H5FA 1NKXA 4EDPA 4PFWA 1R9LA 4G8HA 3K6UA 3T93B 4UACA 1IUDA 4OFJA 3ZS6A 4U4XA 3C9HA 4ELPA 3AXFA 5I57B 2F78A 4I1DA 2XXHA 1B58A 2RC9A 2GH9A 5ISUA 1D4NA 4U4SA 3PPNA 2H9BA 1B46A 3UP9A 2HZKA 1LLSA 5DEXA 3H6VA 3T9UA 5CBRA 1Y1MA 3B6QA 1RKMA 3TDJA 1VSOA 3RN8A 2DYXA 2RC8A 3PUZE 2DOJA 4YKKA 4RXLA 1B9JA 1SDXA 1SW1A 5KDTB 5AA4A 4YZZA 1OVTA 3RY3A 4NF6B 1BKAA 4NE4A 3ILUB 1SYHA 3RTFB 4EF1A 4OFLA 1P1QA 3WAFA 1GR2A 3OELA 3L6GA 4POXA 2DE2A 2NVUB 4R6YA 2ZXTA 2O1LA 3ECRA 4XKQA 1DSNA 3OEMA 4JSDA 3I5OA 1IIWA 1QUJA 3A3CA 3S9EA 5ICQA 2I4BA 2XXQA 1BP5A 2ONSA 3SERA 4F29A 2I0BA 4F1UA 3ONMA 3FXUA 2XXIA 1I6BA 1SQYA 2XXWA 1ELJA 2Y7WA 3T9XB 3PPOA 4LZ7A 4X1BA 1JETA 1JW4A 5H8FB 1MRPA 1B5JA 4F3BA 1N76A 3SKPA 2DSFA 3IK6B 1DTGA 2R6GE 4YB5A 1MXWA 1PBPA 4F19A 5DVJA 2QS2A 3CG1A 3LSLA 2QMWA 1Y3NA 3TTNA 4QF9A 3QXMA 2YLNA 3KEIA 2ALUA 4H5GA 1MM6A 3U72A 4G77A 4MH5A 3T96B 3RT8A 1O64A 1POY1 4RJZA 1ZTYA 3SEXA 1UTHB 4F3GA 2P1SA 5H8HB 5ITPA 3IB0A 4RK2A 4RY1A 5AA2A 4GRKA 4OEVA 2B3BA 2THIA 1B7UA 1LFIA 1DTZA 3T9VA 3CFXA 2Y7RA 4QSDA 1HSJA 5CBSA 3IORA 3A09A 2O51A 1US5A 2XXUA 1B2HA 2ZNTA 1N3WA 1T0KA 2V3TA 2GHAA 3KOSA 1XOCA 4X48A 1AIVA 3GBBA 3JYRA 3DP6A 3C31A 2VD3A 3RPWA 4KPTA 1XVXA 3V5AA 2V3UA 3MJNA 1OIBA 1TWYA 1LB9A 3IOUA 4QSCA 2M8CA 3FUZA 3FV2A 1B7ZA 3IL1B 4H1XA 3IJOB 4QHQA 5DTBA 1JVYA 2HXWA 2V93A 1S9TA 3Q26A 2PBWA 4I9DA 3U94A 1MY4A 3O6GA 3IB1A 4GXSB 3S9LC 3KOTA 4ZEIA 3V83A 4FECA 2XHDA 1MPBA 1QVSA 1I69A 4GF8A 5HPQA 3KFMA 2R9JA 3GBAA 3PMXA 2RKMA 1B3FA 3CFZA 4GOTA 3BKIB 2QS4A 1LB8A 1MQHA 2DVCA 3BFUA 4G2ZA 1XHYA 1B32A 3GZGA 3LSFB 4P11A 3I3VA 1VFEA 2G93A 1UTBB 2O7UA 4E0WA 3PUVE 3VXBA 3KZGA 3DP4A 2F6GA 1LBBA 4LZ5A 4F18A 4G8MA 2PYYA 1VFDA 3LSXA 3JZJA 4ZEDA 2F8DA 1UIVA 2PVUA 5CRYA 3E4RA 2OLBA 4OMBA 1PC3A 4FE8A 1VE4A 2VP1A 1LFHA 1Z7NE 5CMMA 3TPAA 1B7HA 4N13A 3PUWE 1LFGA 5EYFA 3TMGA 1SYIA 2AIXA 2P2AA 3M3LA 2OZZA 4R73A 3ZSFA 4IY5A 3FJGA 2P0SA 4R6HA 2UVHA 3U92A 3G3JA 4YB7A 1GV8A 2RCBA 5EHSA 5H8NB 3IAZA 3PD9A 3B6TA 1JEVA 3G3FA 1AMFA 5I2KA 4ECFA 3PU5A 4KYEA 5AA2D 4OESA 4DIGA 2I0CA 3K01A 1F9BA 1USYE 5A5XB 4NF5B 4F39A 5I58B 4E0XA 4GD5A 2X26A 2F34A 2ESNA 5DYHA 3FVNA 4I8CA 2FYIA 1ZLQA 3C33A 1YAEA 3K1MA 1P1NA 4PFYA 3Q28A 1MXUA 1FQBA 2Y7KA 4KYSA 4ELOA 2XXYA 1Y1ZA 3N5LA 2UVIA 4LVQA 1A99A 4RPNA 3MZ9A 5KCJA 1A55A 4EQ7A 1B5HA 1HSLA 1IQ7A 4QFLA 4ISUA 2RCAA 5HM4B 4QFKA 4ESXA 1D9YA 4NF4A 4LONB 1GTKA 3H6TA 5K2XA 3MW0A 2IEEA 3SEVA 2PT2A 4OXVA 3G3KA 4OVJA 1IXCA 3TZAA 4Q0CA 4LQ5A 1N7XA 3Q27A 3OO8A 4ZS9A 1FQCA 1B51A 3TYHA 3S4UA 1Y3PA 3TKDA 2Z8FA 1R6ZA 2F36A 3TTLA 3IO4A 1FTMA 4TLMB 5ELVA 2DXRA 2X7QA 3EQ1A 3DLNA 2H98A 4FATA 4KHZE 4BDLA 2Q88A 2QS3A 1O7TA 3B7DA 3O6HA 5I56A 1ANFA 1TT1A 4OYVA 5F7VA 3G3IA 4JWXA 5FHMA 3OO7A 1Y4TA 2XX7A 1L5TA 1PEBA 1CB6A 4HW8A 1BIYA 3H06B 3K0VA 3OO9A 3TQWA 3UORA 3OEKA 1QULA 1UIUA 4OEUA 5H8QB 3VE1B 3KJTA 2OK2A 1B52A 3PMWA 2HCAA 4THIA 3T66A 4EQ9A 4F3PA 3UIFA 1A54A 5TPAA 4K3FA 1VR5A 4M1VA 5I84A 3BBRA 3VVDA 2Z8EA 1Y20A 1EH3A 3KSJA 2RC7A 4AB5A 1B3LA 4NWCA 2O1MA 3H3GA 3E13X 3PD8A 1JEUA 3TODA 1FW0A 5I2NB 3KG2A 1SBPA 2VGQA 1GVCA 1M5BA 4HCYA 3PV0E 4DXCA 2Q9TA 3OSRA 2QL3A 1UTBA 2A5TB 3KJ7A 4KD5A 3UN6A 4F3SA 5EHMA 4G68C 3QAXA 4HTGA 1I6QA 5TU0A 1FTOA 2H5YA 3K1NA 2ZYKA 4JSOA 1S7YA 5CC2A 1SD3A 1SW2A 1MQJA 2QSXA 4R9GA 2REJA 3FJ7A 4OETA 4KCCA 1FQFA 3EHTA 4GFRA 4WEDA 4NMYA 4Q30B 4YICA 4WEPA 3MP8A 5TP9B 4P0GA 3PUYE 3H6UA 1BLFA 1A40A 3OSQA 3G3GA 5J1DA 2NOOA 4ONYA 3IOVA 5I59B 3R6UA 2R71A 3SESA 4U2RA 5ICTA 4FORA 4IO7A 1B0LA 1B1HA 1MXYA 2F7CA 1LAFE 4IO5A 4GL0A 4LA9A 4BDNA 3EF7A 3FVKA 3MC2A 4F22A 2F97A 3CVGA 3KN8A 3B6WA 4O3BA 5JK4A 2ZYNA 4G68A 2Y7PA 4ZEFA 3FXRA 4XIGQ 1FTKA 1ZU0A 3FASA 5JTYA 5H8SA 4MLQA 2Z22A 3HO7A 3LR1A 2I4CA 3MPLA 4JDFA 4EXLA 4JXIA 5L9MA 3SEUA 5DT6A 3C36A 1NNKA 1J1NA 3MVXA 4R74A 3ZKLA 3S9NC 4O3AA 1IZ1A 2CMOA 4R2BA 3Q25A 4EXKA 2A5SA 4JWYA 2QS1A 3M8UA 5IAIA 1OLAA 3OOAA 1WDNA 1A7LA 4Z0IA 3SEYA 4ELRA 2X7PA 2I3WA 3VVFA 1MQDA 1PB8A 2DVZA 3CRBA 4BLAA 4IO3A 2DWIA 3HSTA 2NUVA 3CR9A 3VV5A 4DXUA 1USYH 3TTKA 4R75A 2O7IA 3PPQA 3U8QA 1AH5A 5CMBA 1SI0A 4IGRA 5DEXB 1TXFA 1EZOA 1OLCA 4IGTA 3MWBA 3K6VA 4C1UA 1URDA 1MXVA 4YMBA 3IOWA 2XXXA 3MQ9A 3SEWA 1MH3A 4Q5TA 2UYFA 3RGYA 3TCFA 4LZ8A 5AA4B 3FXQA 4U23A 1D3KA 3IB2A 2O69A 2RF1A 2B3FA 2QJEA 4LQ2A 1SW5A 2I48A 3K2DA 4ZEBA 3U93A 2I3VA 3HHGA 1OQHA 1B3EA 2YJPA 1EZPA 1MPCA 3UA8A 4YKJA 3E3KA 2F7AA 3RUMA 3CSGA 4GVOA 1BTJA 1FQAA 3EN3A 4NF8A 2F5XA 3VXCA 1MH4A 4O3CA 1XC1A 3MVZA 1N84A 2DXYA 1JW1A 3RLFE 2XX8A 3TQLA 2DWAA 4R9FA 3KGCA 3K02A 2QRYA 4YKIA 4DLDA 5I57A 1P1WA 4U1OA 2UYEA 4YB6A 2DS9A 1R1NA 4OFOA 3UK4A 3G7WA 4BDQA 1M5CA 5H8QA 4HS7A 2VD2A 1MY3A 2DP8A 3D4GA 3QYTA 3VVEA 4ZZAA 1NL5A 2F35A 2Z8DA 1RYXA 3O2AA 4H8JA 1N0TA 1XVYA 1UQWA 1B4ZA 3N6TA 4F1VA 4Z7EA 4C1TA 4IY6A 1NH8A 2Q2AA 2GRVA 5AA2B 1B0HA 1PBQA 3GXAA 5KDTA 3HV1A 1IXHA 1M5FA 3C32A 3FD3A 1YTVA 4NF6A 4QRZA 2XXVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KBRA 4F31B 4X04A 3MYUA 2XXTA 5IZ1A 4PGNA 1QW0A 2QPQA 2XX9A 3PPRA 3RQTA 4FEDA 3KN3A 4RNSA 4TLLB 5M2VA 1CE2A 4R2FA 1YPNA 3ILTB 3K4UA 4XF5A 1Y4CA 5EQ7A 3PTYA 2UVJA 1NV0A 2OWSA 4RYAA 4ELQA 4NX1A 5H8FA 2PFYA 5FTHA 1XI6A 3UGWA 4PDHA 4GL8A 3T0JA 4OVRA 4OVTA 4AQ4A 1AOVA 2Y84A 5L9SA 3BFTA 5DVFA 1H44A 4QFOA 5KZTA 2ONRA 5EQ9A 1IXIA 3HCQA 1DMBA 3MAMA 4ESWA 1HSEA 4FEBA 4Q8RA 2ZYOA 3P7IA 1H3DA 4MIJA 4BDOA 1Q35A 4LN5A 4FAJA 1JW5A 1M5DA 3ODBA 2CEYA 4GBVA 2F6PA 4PFUA 3RYDA 1FSAA 2AL5A 4N91A 3O28A 1TFAA 3MZ1A 1ZIUA 3Q29A 1JQFA 2P3NA 4IO6A 1FPFA 4DXBA 1UTHA 1MQGA 3W9VA 4ZE9A 3OO6A 4GWOA 5H8HA 3MVWA 2KLFA 4FJPA 2HFBA 5J16A 1NMUA 1ZMGA 4GWSA 4OZ9A 3MSTA 4XKRA 1B3HA 3CSBA 5IZ3B 1LAXA 4N07A 3WAEA 4P9KA 1LAHE 1PB7A 2ABHA 2Q8JA 3IOTA 4PFIA 3V8XB 3S2VA 3MBPA 1FCKA 2PCRA 4KYDA 4GWUA 1YCJA 4POWA 1MY2A 4H8IA 2OCUA 4PQJA 3OD7A 1IXGA 4UA8A 3M3KA 4KFQA 4OHNA 5I3SA 5LTCA 1XT8A 2D3IA 3W15C 4H65A 5K2YA 1EZ9A 2HQ0A 5IGAA 4GQOA 4N6KA 4PAKA 2OBGA 2G29A 1SI1A 2ZNSA 1H76A 3N6UA 3RPLB 4MJOA 3GLBA 4G8NA 4KI0E 2CZLA 3L6HA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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