2RC9A

Crystal structure of the nr3a ligand binding core complex with acpc at 1.96 angstrom resolution
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
287
structure length
287
Chain Sequence
KLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAGQLCLDPMTNDSSMLDRLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEQLAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLSGTANMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTRGTELSGIHDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVQYLKNDPEKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTSNISELISQYKSHGFMDVLHDKWYKVV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular mechanism of ligand recognition by NR3 subtype glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit 3A
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 98
structure length 287
sequence length 287
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2rc9A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2rc9A02
5H8NA 4C1UA 4XKQA 5H8QB 2OK2A 4OETA 2Z8FA 2DOJA 1Y4CA 2VHAA 5FHNA 1ZKBA 3MBPA 1EU8A 3VE1B 4YMAA 3IB2A 5BWJA 4F3GA 4DXBA 4EQBA 2QS3A 1MPCA 1R9QA 4G68A 1URSA 2RC9A 2RKMA 3GXAA 4G8HA 4H8JA 1MXYA 2F6PA 3H6VA 3FJGA 1NFTA 2F36A 1LSTA 3M3FA 1WVJA 3O6HA 3S9LC 3TQLA 3TDJA 1LBBA 1MPBA 3AXFA 3TUSA 5FTHA 2DS9A 2GRVA 3RT6B 3PPQA 3T9HB 3K6XA 4OFJA 3FVGA 1NNTA 1M5FA 3Q29A 4R72A 4U1ZA 5L8DA 4OESA 3TEPA 5CM6A 2O6AA 4N6PA 5I2KB 3I6VA 4Q0CA 1FQBA 1OMPA 4ISUA 1XS5A 2D5WA 1LCFA 1P1OA 4QF9A 5F1QA 1Y3NA 1B51A 1ZLQA 2PVUA 2OWSA 4FIMA 1USYE 4GRKA 1MY3A 1II5A 2G93A 4GL0A 1FCKA 3PUXE 1WDNA 3IAZA 2XXYA 3I5OA 3HN0A 3OO9A 1M5BA 3E3KA 4GXSB 2Z8DA 4BDOA 3DELB 2Z22A 3M3KA 1GR2A 1QKAA 1N7WA 2GH9A 5I2KA 3H3GA 3P7IA 4Z7EA 5DEXA 1LFGA 4MLQA 5EHSA 4JWYA 2XXUA 3VLWA 2Y7RA 4WXJA 1B1XA 3C31A 3GZGA 4NF5B 2I4CA 2NXOA 4ESXA 4GWOA 3RN8A 1PEBA 4RY1A 3OO7A 2ZNSA 2PMSA 3EN3A 1IEJA 3D4GA 3RY3A 3G3JA 2UYFA 3IOVA 1FTKA 4LUBA 2Q2CA 3UIFA 1IXIA 3ODBA 1I6AA 3V83A 3TODA 4IGRA 1ZIUA 3V89B 2HXWA 5ICQA 1Y3QA 3OENA 4NF5A 1XOCA 4F3PA 3KOTA 1SW2A 4LATA 2UVHA 2O69A 4MLVA 4F31B 3E4RA 4ZEBA 4YAHX 3R6UA 3FXRA 3HPIA 4U22A 3PMWA 3M3LA 1DTGA 2HCAA 3K2DA 3K01A 2CMOA 2HAUA 3FZVA 1IXHA 1JQFA 4ZS9A 1FTJA 1MXVA 3TTRA 4DDDA 2OBGA 3MZBA 4KCCA 2BJJX 4H5GA 3G3HA 3Q26A 2E0SA 3DP6A 3IX1A 4RYAA 1FQAA 4DCYA 2Y7PA 2O7IA 5KDTB 2O1LA 1SW5A 4FEBA 1BIYA 2GHBA 3OSQA 4H0WA 2QJEA 4OEUA 3DP4A 4PETA 3LBSA 2QMXA 1FQDA 2X7QA 2P0SA 5K2YA 2XXIA 1LAXA 4LVQA 4L17A 4EXKA 2RINA 4O3AA 3MC2A 1NKXA 2OWTA 3VLUA 4Q30B 4LZ7A 3T93B 3KBRA 3IJOB 2ANJA 3VFJA 5HPQA 2OCUA 1JW1A 4IY5A 4QSDA 1P1NA 2ZXTA 3FJMA 4X9TA 4F1UA 5H8FB 4G4PA 2F6GA 1Y20A 4G8NA 4KYSA 3O9PA 1ZJLA 2ZYKA 4ZEKA 4WKMA 4BDLA 3MJNA 4HTGA 3TCGA 2VD3A 4ONYA 1ANFA 5DVIA 1URGA 4AB6A 4GFRA 3IR1A 2G29A 4OZ9A 4F2QA 4JSDA 3PUWE 1YCJA 2M8CA 3K1PA 3OOAA 3S9NC 1SD3A 4ELOA 3O29A 4Q5TA 1XC1A 4FATA 1ZTYA 4YMBA 2O1MA 2DWJA 4IO5A 2V84A 3N6TA 3OEKA 3VDFA 1B7HA 3DP8A 5H8FA 1Z7NE 3ECRA 3T9UA 2RCAA 4YU0A 2ZYNA 5L9OA 4TLMB 2IA4A 1LGBC 1SDXA 1I6QA 1N0TA 2I0CA 5CBRA 5J1DA 2I6EA 1B3GA 4KYEA 2D21A 1ZMGA 1PBQA 1MY1A 1FQCA 1OQHA 3S2VA 3T9VA 1A99A 2H5YA 2CZLA 2VP1A 1MG1A 4KI0E 3MVWA 5ELVA 1MQDA 3KZGA 5EHMA 2ZMBA 3IJXB 2UVJA 3UA8A 4KCDA 2XXPA 1R6ZA 5AA2B 3QIMA 1MXXA 5JTYB 1HSEA 3LC8A 4EF1A 1N84A 3KEIA 1N3XA 4EDPA 2QS2A 4OVJA 1LCTA 1Y3PA 4F18A 3VVFA 2Y7IA 4F29A 3SEVA 3PPPA 2F5XA 2H9BA 4YKJA 3G3KA 3PUZE 1OIBA 1D3KA 5CMCA 4NF8A 3FGSA 2REJA 3EHSA 3Q27A 4P0IA 3MVXA 4POWA 3C4MA 5AA2A 4F3SA 1M5CA 4F1YA 5H8NB 3QUJA 4AB5A 1RKMA 3SETA 3TTKA 4OERA 3QXMA 3OO6A 2NUVA 3O66A 2HAVA 3MP6A 3CG1A 2DE4A 2V25A 3MUQA 4QSEA 1MM6A 1UTHB 4RA1A 3FASA 4G68B 4QSCA 5CMMA 3C9HA 5HBCA 4PP0A 1MH4A 2REGA 4KFQA 3HV1A 3U93A 1XVYA 3LSFB 1O7TA 2OLBA 2XXHA 3JV9A 4IGTA 3CSBA 3HHFA 4M1VA 2NOOA 3TMGA 2QL3A 1IIWA 2ESNA 4O3BA 4U4XA 1TT1A 1SVXB 5AA4B 5I2NB 1B5JA 5AA2D 2I0BA 3B7DA 3RGYA 1UTHA 3UORA 4HCYA 1SI1A 3N5LA 1AH5A 4GOTA 3G7WA 4H6DA 1GV8A 1USYH 3CVGA 3RLFE 3UGWA 3IB1A 4BDMA 1RYOA 2VOZA 1LAHE 4XKPA 1JEVA 4H67A 1RYXA 4N07A 1MQGA 3EPEA 1Q35A 5L9SA 3VXBA 5AA4A 3N94A 5I2NA 1M5EA 1PC3A 4C1TA 4AQ4A 1B7UA 3QUFA 1MRPA 3MP1A 4IO6A 1OLAA 3EHTA 3TZAA 5DEXB 2I49A 3FXUA 4OFOA 2V3UA 1I6BA 3K00A 4PFTA 4EF2A 2O84X 3RT8A 3H6UA 2XXWA 1MQJA 3PD9A 3RTWB 2XX7A 5I57A 4XXUA 1MXZA 4XTCQ 2O68A 3SEUA 5IAIA 2DSFA 3T22A 3IK6B 3KSXA 3MW0A 3K0VA 3MPLA 1QW0A 4LP2B 1WODA 2F7CA 1B58A 2UYEA 3MAMA 2UVGA 1NH7A 1Y1MA 4Z0IA 1B46A 1HSLA 1D9VA 3C33A 1SW1A 3A3UA 4TLLB 3U72A 3RTFB 3TPAA 5CBSA 3UP9A 3U92A 2O51A 1IQ7A 2QPQA 2HZLA 1UTBB 4R9FA 4U4SA 1T0KA 4E0WA 4BDQA 3OXNA 1NMUA 5M2VA 4ZE9A 4F39A 1O64A 5BUUA 3LSXA 1B6HA 1VE4A 3H6TA 1SW4A 4KYDA 3KN3A 1UTBA 4U23A 4G68C 1P99A 2Q88A 2B65A 4ZECA 3CSGA 5TP9A 1H44A 4N13A 1BTJA 4HS7A 3SERA 3VLVA 3W9VA 1N04A 1F9BA 4YB7A 5DYHA 1PDAA 4LQ2A 1HSJA 1N3WA 1MQHA 1ZBMA 5HM4B 1FW0A 3LR1A 3IO6A 4U1OA 3B6QA 5I56A 1I69A 1O63A 3KN7A 4I62A 4IO7A 2NVUB 2YJPA 1B2HA 1QJMA 2FYIA 3TCHA 4DXCA 1SYIA 2UVIA 4YB5A 1B5IA 1YPNA 1EZPA 5I59A 3PUVE 4GL8A 4GXAA 4PQJA 1JNFA 3OD7A 1H43A 2B3FA 3H6WA 2GFEA 4YKIA 1FTOA 3Q28A 1H76A 2LAOA 4IB2A 1JEUA 4OYVA 5TU0A 2ZYMA 3GBAA 3T66A 1QVSA 2R9JA 3PMVA 1QUJA 2R71A 3BFUA 4ZEDA 4I8CA 1AIVA 2V3TA 1EZOA 2DE3A 4YKPA 4UA8A 1VFEA 3MVYA 1IZ1A 3MPKA 1MY4A 3LSWA 4NWCA 4RK9A 4E0XA 2AL5A 3KJ7A 1A7LA 4XKRA 2Z23A 3H06B 1LBCA 4TQUQ 1B32A 5DT6A 4F19A 3IOUA 4PFWA 4U21A 1MS7A 4FECA 4ZE8A 1B0HA 3QAXA 4C0RA 4H5FA 3UN6A 1AMFA 3RNNA 4THIA 3LSLA 3KFMA 4R74A 5ICTA 5KZTA 1B52A 3QSLA 3PV0E 1NNPA 4H1XA 1MY0A 5FHOA 3OO8A 5A5XB 4MF3A 2F78A 3N26A 3O6IA 4QHQA 2Y84A 5F7VA 2F7AA 3W15C 4OMBA 4G8MA 1B1HA 4RJZA 1NH8A 2Q9TA 4HW8A 3UK4A 5DVJA 3TCFA 3SKPA 4KD5A 4NF8B 3KSJA 1TWYA 5KCJA 1IITA 3SEYA 4R6YA 3B6TA 1YTVA 4Q8RA 3S9EA 2XXVA 1URDA 1TXFA 4OFLA 5A5XA 4YKKA 1A54A 1B4HA 1B05A 4WEDA 3FVKA 2VGQA 1LAGE 3KN8A 3G3IA 3K6WA 4UACA 3ILUB 4P11A 1B4ZA 1R9LA 3BKIB 4ZEIA 3PUYE 5FTIA 4TOZA 2FNCA 5I58B 4I1DA 4R73A 1MM7A 5CI5A 1AOVA 4FAJA 2WKYA 1P1QA 1UIUA 4U2RA 2E1SA 1B3HA 1FQFA 2XX8A 4GF8A 3VVEA 1ELJA 1D9YA 5H8SA 1FQEA 1DMBA 4NTLA 4OEVA 3C36A 3HO7A 4NEDA 1QUKA 3ZSFA 2A5TB 4ELQA 3K1MA 1PB9A 4ZEFA 4ESWA 5AA3A 3K02A 1OVBA 4WEPA 4RPOA 1OQGA 3ZKKA 1MY2A 2RC7A 1LB9A 2Y7WA 1MDP1 3WAEA 3R7XA 2XXXA 1XT8A 1A55A 5I58A 4FEDA 2O7UA 3CFLA 3FVNA 1PBPA 3T96B 4QFPA 3FATA 2DXYA 4ECFA 2AIXA 1NNKA 5JK4A 2F8DA 3V8XB 4IY6A 1DOTA 2I58A 3G3FA 3K6UA 2A5TA 4F3BA 4QFNA 4OQOA 2HFBA 3CFXA 2XX9A 4K3FA 1MQIA 4MBPA 3BFTA 3FIRA 1JETA 1AL3A 4QFOA 1DTZA 3PD8A 1OLCA 1CE2A 4RNSA 1KWHA 2QS4A 5H8HA 4R9GA 3I3VA 3CG3A 3ILTB 2F34A 3PGFA 4P0GA 3TYHA 4R6HA 1BP5A 3CR9A 4XKNA 1SBPA 1BLFA 4QFKA 1A40A 4EUOA 5ISUA 1B40A 1P1WA 3L6GA 5I57B 1JW4A 4LA9A 5H8QA 2DWHA 4LONB 2ONKE 1B0LA 1FTMA 2OJTA 3VVDA 2YLNA 2X26A 3JZJA 4LZ8A 4NF6B 4DE8A 1JVXA 4X48A 1QKBA 3EF7A 4BDRA 4POXA 1POTA 3OSRA 3WAFA 4X1BA 1DSNA 5CMKA 2DVCA 3CFZA 1IXCA 4RPNA 2ALUA 2GHAA 3S9MC 1B9JA 2HZKA 4PFUA 2ONSA 3EHUA 3S4UA 1B5HA 1LAFE 4PFYA 2RF1A 1M5DA 3VV5A 1PB8A 2QMWA 4NF6A 4NF4B 4OWDA 2I48A 3RUMA 4R2BA 1CB6A 1GTKA 3MQ9A 1Q1KA 2XD2A 4ZDMA 1JVYA 3IOWA 2DVZA 3KG2A 2H4IA 2AYSA 4MFIA 3SEWA 3CRBA 3O6GA 3TELA 2FA7A 3ONMA 4G2ZA 5JEIA 1B3LA 4DCXA 2HEUA 5LOMA 5TP9B 2AL4A 3T9XB 1H45A 4JXIA 2W7YA 3K6VA 4NF4A 1XVXA 1B7ZA 2H99A 3U1OA 2F7BA 2ZNTA 3CI8A 1L5TA 2DP8A 2VD2A 5ITOA 2PT2A 2XHDA 2XXQA 4JWXA 5I56B 5EYFA 3LUYA 1N7XA 4ZZAA 4FJPA 2PX1A 1NL5A 3GBBA 4HCWA 2D3IA 3MP8A 4F2OA 2QRYA 2H25A 2ZYOA 4FE8A 3MWBA 4RXLA 1MDQA 4DXUA 3SEXA 5AA1A 5I59B 5B70A 2KLFA 1POY1 4QFLA 3HHGA 3IORA 3O97A 4ELRA 1UIVA 1BKAA 1XHYA 4DZ1A 2DE2A 3L6HA 1LFIA 1Y1ZA 1VR5A 1B3EA 1SI0A 1MXUA 3PPRA 2DWAA 2I4BA 3HSTA 4OTEA 2IEEA 4RK2A 1DPEA 1A8EA 3FD3A 1SYHA 1QUIA 5FHMA 3USDA 1UQWA 3FV1A 3V5AA 4H8IA 2ONRA 4PE5B 3MZ1A 3E13X 3KGCA 3PU5A 3TTMA 2XXTA 3C32A 3FUZA 1TFAA 1LFHA 4OENA 1S9TA 2DXRA 4EQ9A 4JWOA 3O2AA 3KJTA 5DVFA 4NMYA 3HCQA 4ZZEA 2V3QA 4ND9A 2PYYA 3VXCA 4O3CA 4DIGA 2HQ0A 1PB7A 1MXWA 3TTNA 3SDFA 4NWDA 1B3FA 4KPTA 1S50A 3PPNA 4BDNA 1YAEA 2ZNUA 4IO3A 3IOTA 4G77A 3D4CA 3MZ9A 3N6UA 1IXGA 1IUDA 4GD5A 5IKBA 2F97A 2X7PA 1TFDA 2I3WA 3MVZA 2P2AA 2QSXA 1D4NA 4XIGQ 5KDTA 4IO4A 3IB0A 4GIZA 3A09A 3FV2A 2I3VA 4GLIA 2RC8A 4BLAA 1JW5A 3A3CA 1US5A 1FTLA 4QRZA 5KCJB 4LZ5A 2H98A 3H7MA 1EZ9A 1Y4TA 1DPPA 4F1VA 3BBRA 3IO4A 3K1NA 4MH5A 3THIA 1N76A 3PMXA 4GQOA 2QS1A 3G3GA 5TPAB 3TQWA 2Z8EA 3ZKLA 1A8FA 4KR5A 3ZS6A 3RPWA 3FXQA 4JSOA 1ZU0A 1EH3A 1VSOA 3KOSA 5CC2A 2DYXA 2OZZA 1LB8A 3GLBA 2YPNA 3B6WA 1Z7ME 3RQTA 3H4ZA 2R6GE 3FJ7A 1MPDA 4YZZA 1LLSA 2P1SA 4H65A 3SESA 5I84A 4X1DA 3IL1B 2DQVA 3QK6A 4R2FA 4YB6A 2B3BA 5CRYA 3QYTA 4F22A 1NNFA 2A5SA 5ITPA 4DLDA 3OMBA 2PT1A 3CIJA 3Q25A 4EXLA 5TPAA 3C35A 1Y9UA 4OXVA 5K2XA 4JDFA 2V93A 3W9WA 5DTBA 2RCBA 3JYRA 2PBWA 1GVCA 4IO2A 3U94A 4R75A 2Q8JA 2Y7KA 1OVTA 1J1NA 3R26A 2Q89A 4JB7A 3FVOA 4GVOA 3C34A 3H03A 1VFDA 3TKDA 1QULA 4R6KA 4FORA 2ABHA 2DWIA 1P1UA 5B7DA 3M8UA 4ELPA 4KQPA 2XD3A 4NE4A 1ATGA 3DM0A 1GGGA 3F11A 2THIA 1R1NA 2F35A 3TTLA 3U8QA 1US4A 5JTYA 4LQ5A 5AE4A 2UXAA 4I9DA 3OELA 2XXRA 3TFLA 3DLNA 4YICA 5CMBA 2NWJA 3K4UA 4EQ7A 3EQ1A 1MH3A 4KHZE 5H8HB 4M4GA 1S7YA 3E9XA 2Q2AA 3O28A 1SQYA 3TAJA 4JBZA 3OEMA 5L9MA 4OHNA 1H3DA 3PPOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QBAA 5H8NA 4C1UA 4XKQA 3E78A 5H8QB 2OK2A 4OETA 2Z8FA 2DOJA 1Y4CA 5I7IA 2VHAA 4PF6A 5FHNA 1ZKBA 1FBCA 3MBPA 1EU8A 3VE1B 4YMAA 3IB2A 5BWJA 4F3GA 4DXBA 4EQBA 2QS3A 1MPCA 1R9QA 4G68A 1URSA 2RC9A 2RKMA 3GXAA 4G8HA 4H8JA 1MXYA 2F6PA 3H6VA 5EQ7A 3FJGA 1NFTA 2F36A 1LSTA 3M3FA 1WVJA 3O6HA 3S9LC 2MKZA 3TQLA 4N6KA 3TDJA 3BIGA 1LBBA 2B4LA 1MPBA 3AXFA 3TUSA 5FTHA 1K9YA 2DS9A 2GRVA 3RT6B 3PPQA 3T9HB 3K6XA 4OFJA 3FVGA 1NNTA 1M5FA 3Q29A 2WX9A 4R72A 4U1ZA 5L8DA 4OESA 3TEPA 3PTYA 4N15A 5CM6A 2O6AA 4N6PA 5I2KB 3I6VA 2F3DA 4Q0CA 1FQBA 1OMPA 4ISUA 1XS5A 1LBWA 2D5WA 4MNCA 1LCFA 1P1OA 4QF9A 2ZZVA 1YZ0A 4IR8A 1LBVA 1B51A 1Y3NA 5F1QA 1ZLQA 2PVUA 2XWOA 2OWSA 4FIMA 1USYE 4GRKA 1AWBA 1FJ6A 1MY3A 1II5A 2G93A 4GL0A 1FCKA 3PUXE 1WDNA 3IAZA 2XXYA 3I5OA 3HN0A 4GBVA 3OO9A 4PCDA 1M5BA 3E3KA 4GXSB 2PCRA 2Z8DA 4BDOA 4XF5A 3DELB 2Z22A 3M3KA 1GR2A 2FBPA 1QKAA 5FBPA 1N7WA 2GH9A 5I2KA 3H3GA 3P7IA 4Z7EA 5DEXA 1LFGA 4MLQA 5EHSA 4JWYA 2XXUA 3VLWA 2Y7RA 4WXJA 1B1XA 3C31A 3GZGA 4NF5B 2I4CA 2NXOA 4XFEA 4ESXA 4GWOA 3RN8A 1PEBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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