2THIA

Thiaminase i from bacillus thiaminolyticus
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
ITLKVAIYPYVPDPARFQAAVLDQWQRQEPGVKLEFTDWDSYSADPPDDLDVFVLDSIFLSHFVDAGYLLPFGSQDIDQAEDVLPFALQGAKRNGEVYGLPQILCTNLLFYRKGDLKIGQVDNIYELYKKIGTSHSEQIPPPQNKGLLINMAGGTTKASMYLEALIDVTGQYTEYDLLPPLDPLNDKVIRGLRLLINMAGEKPSQYVPEDGDAYVRASWFAQGSGRAFIGYSESMMRMGDYAEQVRFKPISSSAGQDIPLFYSDVVSVNSKTAHPELAKKLANVMASADTVEQALRPQADGQYPQYLLPARHQVYEALMQDYPIYSELAQIVNKPSNRVFRLGPEVRTWLKDAKQVLPEALG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of thiaminase-I from Bacillus thiaminolyticus at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIAMINASE I
molecule tags Transferase
source organism Paenibacillus thiaminolyticus
total genus 115
structure length 362
sequence length 362
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.2: Thiamine pyridinylase.
pdb deposition date 1998-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2thiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2thiA02
5FTHA 4QFLA 4F31B 4U4XA 4LUBA 1MXXA 2VHAA 5DVIA 1US4A 2XXUA 1LCTA 5H8SA 4R72A 3B6QA 4FIMA 2VP1A 3TCGA 4PQJA 2X26A 5H8HA 2F5XA 3JV9A 3OEKA 2Z8DA 3T93B 3S9NC 3G7WA 3RTFB 2OK2A 4RA1A 2F8DA 3IB2A 1DPPA 3O6HA 4PFTA 4ELOA 2V25A 1RYXA 3A3CA 3GBBA 4LZ7A 3N5LA 2B65A 1ZJLA 4LP2B 5I2NA 4GQOA 2O1LA 1SQYA 5I59A 2UVJA 1B2HA 4YB7A 3RLFE 4F3SA 5DEXB 4R73A 3MVYA 2P0SA 1VR5A 4BLAA 1T0KA 2HEUA 4ZE8A 1MH4A 2DS9A 2QMWA 3EHSA 3DP6A 1NFTA 1MXWA 3Q29A 4NTLA 4OXVA 2DSFA 3FD3A 2XXIA 1VE4A 1QUJA 2NOOA 4RJZA 2NVUB 2I49A 4AB5A 4KPTA 1OQHA 2PYYA 3N6TA 3KEIA 1D3KA 4U1OA 1YPNA 4EXLA 1MY0A 3T96B 4NF5A 2HQ0A 2XXVA 1DTGA 1N04A 3AXFA 1USYH 3CSBA 3LSLA 3C34A 3VFJA 2G29A 1FCKA 3MZBA 4YAHX 1MQJA 1P1WA 4FAJA 5H8NA 2H99A 2W7YA 4JSDA 3GBAA 4IO2A 3V5AA 5H8FA 3BFTA 1PB7A 1OLAA 2ZNTA 5L9MA 3B6TA 4FATA 3MZ9A 4KCCA 1JEUA 1I6AA 3TDJA 3PUWE 3UORA 5CMMA 5CMBA 1JVXA 1OQGA 3IOTA 3PUYE 3TTLA 4TOZA 2F78A 2NXOA 4GOTA 1B6HA 2IEEA 3PGFA 2ONKE 1IXCA 1Z7NE 2IA4A 2I3WA 4U22A 1N84A 5ICQA 3TEPA 4X1BA 3IOUA 5ELVA 2F36A 2UVHA 3C31A 2M8CA 5JTYA 1FQDA 1JQFA 5L9SA 4F19A 3OO8A 1TXFA 2PBWA 3O66A 1VSOA 1RYOA 3MVXA 2AYSA 3Q25A 1WDNA 5L9OA 4QFPA 3K1NA 3S9EA 3KSJA 1IXHA 1CB6A 1QW0A 3V8XB 3TTRA 4KFQA 3TUSA 3ONMA 4ZE9A 3TQWA 4ECFA 4XKPA 1NKXA 2H4IA 3PUZE 3MC2A 5TU0A 1EU8A 3M3FA 2AL5A 1EZ9A 1D4NA 4R9GA 4EF2A 3EF7A 3OENA 4YKIA 4GF8A 1MQGA 3ILTB 1ANFA 4Z0IA 5AA2D 4DE8A 3VLWA 1ELJA 4RY1A 4RK2A 2GHBA 4XKQA 2I48A 4DXCA 4OMBA 3H6WA 1XHYA 1M5FA 3O29A 5JK4A 3RT8A 3TTMA 1PBQA 1MY3A 4R2FA 4TQUQ 2DXRA 2NUVA 1ZKBA 1B4HA 4OEVA 1O64A 4KI0E 4U2RA 3OO7A 1IZ1A 3T9XB 1IEJA 4FORA 4UACA 4DXBA 5CBSA 1LAHE 3RN8A 3MW0A 2Y7PA 1H43A 3K00A 5I57A 3B6WA 4M1VA 1DPEA 1URGA 5AA2B 3A09A 1I6BA 5CI5A 5KZTA 3THIA 2R9JA 4R74A 3PV0E 3RT6B 2B3BA 3ZKKA 4X48A 3C33A 4OWDA 4MH5A 4RK9A 4GFRA 3IOVA 2RC8A 4DCYA 1WVJA 5CRYA 3U72A 3JZJA 3OELA 3UGWA 4ZZAA 4EUOA 1VFEA 2HFBA 3KZGA 2O1MA 2H25A 3KN7A 2RC9A 2YPNA 2QS2A 4ONYA 3N6UA 4UA8A 2O7IA 4WKMA 3SEUA 2DWHA 1LGBC 2AL4A 4LONB 3LC8A 3OSRA 4U1ZA 3GLBA 2DE2A 1KWHA 1LBBA 1NNFA 3DM0A 3S9LC 2Y7IA 3SEVA 1AIVA 3KG2A 3U93A 1MQHA 3RTWB 2HCAA 5EHMA 1UIUA 2Q89A 4O3AA 3K6VA 4X9TA 3FGSA 2REGA 3P7IA 3E4RA 1MG1A 2P1SA 2Q9TA 3SESA 3MJNA 4F1UA 1I6QA 1R9LA 5AA1A 4EQBA 2V3UA 4G68C 2DVZA 1B46A 2V3QA 3RPWA 2FNCA 3PMVA 2PT2A 3PPNA 2F7CA 4YKPA 4O3BA 1D9VA 3PUXE 4R6KA 3UP9A 4RPOA 3FVNA 3FZVA 3MVWA 4P0IA 1QUKA 4IO3A 4QFKA 4LA9A 3PU5A 4WXJA 2O51A 1JW5A 3K0VA 4QFNA 2REJA 3GXAA 3EQ1A 4QSDA 3K2DA 5TPAA 1QUIA 2ZYNA 4IY6A 1ZBMA 3N94A 3PPOA 1H45A 2H9BA 4F22A 2V93A 4H65A 2DWIA 1ZLQA 3RY3A 2F97A 3G3KA 4F3BA 1OIBA 3V89B 3IJOB 5A5XB 4ELQA 2DP8A 3MAMA 2RC7A 4NWDA 1OVBA 4YMAA 4H5GA 4H8JA 1TFDA 3KGCA 1A8FA 3FV2A 3FV1A 1N3WA 2HAUA 4YICA 5DVJA 2UXAA 2V3TA 5FHMA 3ZKLA 3I6VA 1IQ7A 4IO7A 4OETA 3C32A 3QUFA 2DOJA 1SW4A 3MP6A 1SW2A 2FYIA 2F7AA 2F6GA 4MBPA 5I58B 5AA2A 5CC2A 5IAIA 4POXA 3OO6A 4TLLB 4QF9A 5DYHA 3IO6A 3H3GA 3TODA 4MLQA 5ICTA 3C35A 4R6YA 2P2AA 1Q1KA 4KYSA 5KDTA 4NEDA 4ZEBA 2ESNA 1IXIA 3S2VA 2A5TB 2ZNUA 3LSFB 1MDQA 4F2OA 3FVGA 3HCQA 4NF6B 1FQFA 2AIXA 1N76A 2ZNSA 1EZOA 3JYRA 4G77A 5FHOA 1MM7A 3TZAA 4E0XA 4DXUA 1M5EA 2X7QA 4Q8RA 1A8EA 3FJMA 3FUZA 1JW4A 4HW8A 1FQCA 2HZLA 4EQ9A 1FQEA 1LFIA 3PPQA 2YJPA 2A5SA 1PB9A 1LAFE 4YKJA 2Z8EA 1P1NA 3VDFA 4MLVA 4FEDA 1Y1MA 3U94A 3MVZA 4G4PA 1QKAA 2Y7KA 5BWJA 2O6AA 3KOTA 1AOVA 1OVTA 3SEYA 3ILUB 3VLVA 1UTBA 4NF8A 1A99A 3MUQA 3Q26A 1A55A 3HO7A 1DSNA 1ZU0A 4RNSA 5FTIA 1B51A 1LB8A 3SEXA 4IGRA 1IIWA 1S50A 3RGYA 3TKDA 5H8QB 3K6UA 1QVSA 3SDFA 3QYTA 4FE8A 4LATA 3TPAA 3CFZA 1S7YA 3QSLA 3M3LA 4XTCQ 1DMBA 1OMPA 3T9VA 1JVYA 1ZIUA 4ELPA 2OLBA 3USDA 3H6TA 4NE4A 3O6GA 3DP8A 3EHUA 4HCWA 4Q5TA 4KR5A 2DVCA 1N3XA 1B9JA 5A5XA 5I2KB 3FXUA 2Q88A 5TP9B 3RNNA 4GD5A 4RXLA 5HPQA 5AA4B 1B5JA 4R75A 2XXRA 3OD7A 2CMOA 3W9VA 1B5IA 5J1DA 2CZLA 3ECRA 3O97A 3CG1A 4BDLA 1Y3PA 1YAEA 1SI0A 5B70A 1YCJA 1NL5A 1B05A 4F1YA 1S9TA 2ZYMA 4ISUA 1XT8A 1FTMA 5EYFA 1EZPA 1BP5A 4F2QA 1LFHA 4OESA 4C0RA 1B0HA 2A5TA 3FVKA 4PP0A 4NF6A 5L8DA 2GRVA 1MQDA 1B52A 2F35A 3L6GA 5BUUA 4OFJA 5DEXA 3TTNA 1R6ZA 2D21A 4G68B 4ZDMA 4EF1A 5KCJB 2O84X 4IY5A 4OZ9A 3QUJA 4EDPA 5CMKA 3MP1A 1CE2A 2R71A 3T9UA 2XD2A 1FQAA 4F29A 1ZTYA 1M5CA 2VD3A 1TWYA 2UVGA 3F11A 1GGGA 2DE4A 2OBGA 2H5YA 1US5A 2Q2AA 1YTVA 4H0WA 4L17A 4YU0A 3C9HA 3DP4A 1FTLA 4ZEDA 4KYEA 1FTJA 3K6WA 3S4UA 1SI1A 5CMCA 1Y4TA 5H8HB 4QFOA 2XX8A 3KFMA 2BJJX 4NMYA 5ITPA 3PMXA 4QHQA 1B32A 4FEBA 4U23A 1TT1A 4IO6A 1B4ZA 4GXAA 1JEVA 4DDDA 3EHTA 4IO5A 3K1MA 2I3VA 4ELRA 1B58A 4N07A 4YB6A 2XX7A 4OENA 5I2NB 2GH9A 2OCUA 2ONSA 3TCFA 3K01A 4LQ5A 2I0BA 3H4ZA 5DVFA 1LSTA 4I1DA 2DWJA 4H6DA 1MPCA 2E1SA 3OO9A 2ALUA 4AB6A 1QJMA 3SKPA 2XXTA 2Q2CA 4JB7A 4R2BA 3O6IA 5F7VA 1NNTA 3VLUA 3CIJA 3TYHA 3LBSA 2Y7WA 4DCXA 3EN3A 3IB1A 4XIGQ 3SETA 3LSXA 2HXWA 4Q0CA 3VV5A 3Q27A 1LCFA 2DXYA 2RF1A 5TP9A 1TFAA 3IB0A 2XXYA 4C1UA 3QIMA 1N7XA 4F1VA 3KN8A 1URSA 4O3CA 1DTZA 4JBZA 4MFIA 3KSXA 3OSQA 4KHZE 3O2AA 3PMWA 3T9HB 1Y20A 2QRYA 3CRBA 4NF5B 3G3JA 4DZ1A 4R9FA 2QS1A 3M3KA 2I4BA 3UK4A 2B3FA 5HBCA 1SYIA 3KN3A 1VFDA 5JEIA 5LOMA 1BKAA 1DOTA 5H8NB 3QK6A 3TFLA 4E0WA 3HPIA 2PVUA 1N0TA 4JWXA 4OFOA 5H8FB 2RCBA 1B3GA 4ZEFA 3MBPA 3MPKA 3Q28A 3SERA 2ZYKA 2XXWA 1Y1ZA 3RQTA 1I69A 4KYDA 2RINA 3O9PA 5HM4B 1JETA 3IJXB 3MWBA 1SD3A 4RPNA 4P11A 3UA8A 4GXSB 4GIZA 4JSOA 1MH3A 4G8HA 2PX1A 4BDMA 4IB2A 1Y3QA 3CFLA 4KCDA 4GWOA 1MS7A 2ZYOA 4OEUA 4R6HA 3LSWA 3U1OA 3GZGA 3KJ7A 4H8IA 1XC1A 4BDRA 1II5A 4OERA 4G68A 4F39A 1HSLA 5I56B 1J1NA 4BDOA 4JDFA 5JTYB 1WODA 4Q30B 2QSXA 3K1PA 4QSEA 4ESXA 2PMSA 1MY1A 4P0GA 3U92A 1LAGE 2PT1A 1BIYA 3R6UA 4KD5A 4OHNA 4TLMB 1ZMGA 3VE1B 1B5HA 2F6PA 1UTHB 1MY4A 1FTOA 1B7UA 3FASA 1MY2A 3BFUA 2UYEA 3QXMA 3FJ7A 3ZS6A 4K3FA 1Q35A 3B7DA 3CI8A 2E0SA 1IUDA 1B3HA 3UIFA 1NH8A 4WEDA 4IO4A 4IGTA 4NWCA 4LZ8A 1B7HA 1B1XA 4N13A 1B40A 2I4CA 2F7BA 1AH5A 1O63A 5AE4A 2KLFA 3IAZA 5DTBA 3O28A 1HSEA 2ABHA 4JWOA 3IL1B 2ANJA 1PC3A 3R7XA 3K6XA 2O68A 3E13X 3FJGA 3VVFA 4PFYA 4F18A 1MDP1 1NNPA 3DELB 2QMXA 1PEBA 3SEWA 2ONRA 3T22A 4YMBA 2ZXTA 3G3IA 1IITA 3KBRA 2XHDA 1GTKA 2HZKA 5IKBA 1H44A 2Y84A 3CG3A 4F3PA 1Y9UA 4LZ5A 2UYFA 2VGQA 4QSCA 3W9WA 5I57B 3OEMA 1HSJA 4X1DA 5EHSA 2DWAA 5ITOA 1B3FA 4U4SA 4ESWA 1GR2A 2V84A 3VVDA 2GFEA 2XXHA 4XKRA 4OYVA 4LVQA 3TELA 2QL3A 3MQ9A 1Y3NA 4FECA 1LFGA 1B0LA 2WKYA 1PBPA 3W15C 4ZEKA 5K2YA 1POY1 3E3KA 4HTGA 1SW5A 1IXGA 4JXIA 1PDAA 4EXKA 1JNFA 3TTKA 4I62A 4DIGA 2QS4A 4ND9A 2LAOA 1POTA 4G8MA 1MRPA 2XXPA 4MF3A 3WAFA 2Z8FA 4M4GA 2XX9A 3T66A 1P1OA 3LUYA 3FIRA 3VXCA 1P99A 1MM6A 4XKNA 3PPRA 1AMFA 3CR9A 3E9XA 3IR1A 4GRKA 5ISUA 2R6GE 1MPDA 1H76A 2I6EA 4G8NA 4THIA 3L6HA 1SW1A 3TAJA 5I56A 1GV8A 1N7WA 1FTKA 3C4MA 2F34A 3ODBA 4OFLA 2VD2A 1L5TA 1MXZA 3QAXA 3IK6B 5I84A 1R9QA 3VVEA 1B1HA 3I5OA 3RUMA 3V83A 4AQ4A 4ZZEA 1NH7A 5I58A 4C1TA 1UTHA 3H6UA 1RKMA 2RKMA 4NF4B 3S9MC 4H67A 3TQLA 3PD8A 1LAXA 5AA3A 1XS5A 1SVXB 3D4GA 3OMBA 1F9BA 1PB8A 3VXBA 1MXYA 1UIVA 4POWA 3H06B 3FXRA 1GVCA 1A40A 1M5DA 1MPBA 3MPLA 5TPAB 3OOAA 1QULA 2OWTA 3IX1A 3IORA 4PETA 4OQOA 4GVOA 2O69A 4GL0A 2NWJA 3EPEA 1QKBA 2VOZA 3DLNA 1A54A 4PE5B 1P1UA 2DQVA 3LR1A 4I8CA 1FW0A 5DT6A 2O7UA 4QRZA 1XVYA 3HHGA 3K4UA 2FA7A 4HS7A 4XXUA 4ZECA 4ZEIA 1UQWA 3HSTA 2DYXA 3A3UA 3PD9A 4YB5A 1SYHA 3UN6A 2XXQA 2XXXA 1H3DA 3CSGA 1SDXA 2OJTA 1LB9A 1Z7ME 3CFXA 1OLCA 5B7DA 2I58A 1B3EA 2D5WA 4FJPA 1B3LA 1SBPA 1NMUA 2THIA 1MXUA 3H03A 5H8QA 2HAVA 4HCYA 4BDNA 1BLFA 2UVIA 3IO4A 5KDTB 4H1XA 2GHAA 3FVOA 2G93A 3HN0A 3OXNA 5I59B 3CVGA 1A7LA 1FQBA 3HHFA 3KJTA 4ZS9A 5K2XA 3M8UA 4Z7EA 5CM6A 3BKIB 2XD3A 3G3GA 1M5BA 2H98A 2QJEA 4RYAA 5I2KA 3PUVE 1O7TA 3TMGA 1BTJA 5F1QA 3D4CA 3C36A 5CBRA 4F3GA 2Q8JA 3HV1A 2RCAA 5AA4A 3I3VA 1XOCA 3MP8A 3U8QA 3H6VA 3IOWA 3K02A 1D9YA 1ATGA 1JW1A 1UTBB 4NF8B 5M2VA 3KOSA 1URDA 4PFWA 4G2ZA 2YLNA 4H5FA 4YKKA 2D3IA 4NF4A 2OZZA 2QPQA 3MZ1A 4WEPA 3PPPA 5FHNA 3FATA 1XVXA 4U21A 4OTEA 3WAEA 3H7MA 4BDQA 1B7ZA 2DE3A 1P1QA 4OVJA 1NNKA 4GL8A 4PFUA 3TCHA 4GLIA 4EQ7A 2ZMBA 1LBCA 2Z22A 4I9DA 1EH3A 3BBRA 2QS3A 1Y4CA 4YZZA 3G3FA 4KQPA 4LQ2A 1LLSA 5KCJA 2Z23A 3ZSFA 1USYE 4DLDA 4N6PA 1AL3A 4JWYA 2OWSA 3FXQA 1MXVA 1R1NA 2X7PA 3R26A 2I0CA 3G3HA 2Y7RA 3N26A 1MQIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FTHA 4QFLA 4F31B 4U4XA 4LUBA 1MXXA 2VHAA 5DVIA 1US4A 2XXUA 1LCTA 1FBDA 5H8SA 4PDHA 4R72A 3B6QA 4P3LA 4FIMA 2VP1A 3TCGA 4PQJA 2X26A 5H8HA 2F5XA 3JV9A 3OEKA 2Z8DA 3T93B 3S9NC 3G7WA 3RTFB 2OK2A 4RA1A 1FPLA 2F8DA 3IB2A 1DPPA 3O6HA 4PFTA 4ELOA 2V25A 1RYXA 3A3CA 3GBBA 4LZ7A 3N5LA 2B65A 5EQ9A 1ZJLA 4LP2B 5I2NA 4GQOA 5F24A 2O1LA 1SQYA 5ET6A 5I59A 2UVJA 4O8MA 3CHGA 1B2HA 4YB7A 3RLFE 4F3SA 5DEXB 4R73A 3MVYA 1NI9A 2FHYA 2P0SA 1VR5A 4BLAA 1T0KA 2HEUA 4ZE8A 1MH4A 2DS9A 2QMWA 1LEVA 3EHSA 4PF8A 3DP6A 1NV6A 1NFTA 1MXWA 3Q29A 4NTLA 4OXVA 2DSFA 5I7IA 3FD3A 2XXIA 1VE4A 1QUJA 2NOOA 4RJZA 1KA0A 2NVUB 2I49A 4AB5A 4KPTA 1OQHA 2PYYA 3N6TA 3KEIA 1D3KA 3IFAA 4U1OA 1YPNA 4EXLA 2XWIA 1MY0A 3T96B 4NF5A 2HQ0A 2XXVA 1DTGA 1N04A 3AXFA 1USYH 3CSBA 5EQ7A 3LSLA 3C34A 3VFJA 1IMBA 2G29A 1FCKA 3MZBA 4YAHX 1MQJA 1P1WA 4FAJA 5H8NA 2H99A 4GWXA 2W7YA 4JSDA 3GBAA 4IO2A 3V5AA 5H8FA 3BFTA 1PB7A 1OLAA 2ZNTA 5L9MA 2QFLA 3B6TA 4XF5A 4FATA 3MZ9A 2KR0A 4KCCA 4NAPA 1JEUA 2BJIA 1I6AA 3TDJA 3PUWE 3UORA 1NV5A 5CMMA 5CMBA 1JVXA 1OQGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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