2VD2A

The crystal structure of hisg from b. subtilis
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
212
structure length
212
Chain Sequence
AMGKLLTMAMPKGRIFEEAAGLLRQAGYRLPEEFEDSRKLIIDVPEENLRFILAKPMDVTTYVEHGVADVGIAGKDVMLEEERDVYEVLDLNISKCHLAVAGLPNTDWSGVAPRIATKYPNVASSYFREQGEQVEIIKLNGSIELAPLIGLADRIVDIVSTGQTLKENGLVETEHICDITSRFIVNPVSYRMKDDVIDEMASRLSLVVEGET
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Bacillus subtilis
publication title The Crystal Structure of Hisg from B. Subtilis
rcsb
molecule keywords ATP PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE
total genus 52
structure length 212
sequence length 212
ec nomenclature ec 2.4.2.17: ATP phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2007-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01634 HisG ATP phosphoribosyltransferase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2vd2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2vd2A02
1LAGE 3OELA 1MDP1 2PVUA 4KR5A 2G29A 1A8FA 3T93B 4OWDA 2X7QA 3O6HA 1MY1A 3Q29A 4IO2A 3U93A 1PDAA 4YICA 1POY1 5CRYA 4U1OA 3IB2A 3KN8A 3IR1A 5I57A 1MQIA 1S9TA 2ZMBA 2FNCA 4XKQA 4Q0CA 1EU8A 1MRPA 3EHTA 2F6GA 1N3XA 1MXXA 1BIYA 1ZLQA 2HEUA 3U92A 4Q8RA 3DELB 4F39A 4ZE9A 4OESA 3PMXA 2AYSA 1URDA 4MH5A 2DE2A 4C1UA 1YTVA 3OSQA 3FVKA 3O9PA 4RK2A 3DP8A 4FATA 4JB7A 1FQBA 4I1DA 3OENA 4QFOA 2KLFA 4FIMA 4FORA 2OLBA 1RYXA 4EQ9A 1A7LA 3H7MA 1ZIUA 1XS5A 3FVNA 1F9BA 3TMGA 4FEDA 1NNPA 3V89B 4BDLA 1ATGA 3H06B 4RPOA 4ELPA 1FQCA 3PUVE 1IXGA 3OSRA 1O7TA 1WODA 4DXUA 2P1SA 4G8MA 5TU0A 5EHSA 3FD3A 2B3BA 1HSJA 4O3BA 2G93A 5F7VA 2HZLA 3T9UA 2Q89A 1OMPA 5H8NA 4DCYA 4AQ4A 1UTBB 4X9TA 3JYRA 3K6UA 4F2OA 4NF6A 2F35A 2D21A 1B3FA 3EPEA 1ANFA 4IB2A 3IL1B 3FV1A 4OETA 2Q2AA 5DVFA 4OYVA 5H8FA 5H8SA 5AA1A 4MLVA 2E1SA 1B3GA 3VLUA 1B0HA 1IQ7A 4X48A 2H4IA 3TCFA 1LSTA 4H5GA 1OVTA 4Q5TA 3O28A 4QF9A 3SERA 3ILUB 4LP2B 3E13X 1B4HA 4BDQA 4R6KA 4GFRA 3FJMA 3W9VA 2NOOA 3GBBA 5KCJA 4E0WA 4QFPA 3WAEA 5KZTA 3THIA 1SVXB 3U1OA 1LCTA 3MZ1A 2PT2A 4I62A 3IOTA 3P7IA 2Z22A 3W9WA 2P0SA 2ZNTA 3KN7A 3OO9A 3KJ7A 3MVYA 3IOWA 3B6WA 2ONKE 2V84A 4NF4A 5H8FB 3ZKLA 1URSA 4H8IA 1EZOA 5AA3A 3S9LC 3BFTA 4MBPA 1B2HA 4OEVA 5LOMA 3C4MA 3MJNA 3T66A 2F7BA 1B5HA 5CBRA 3H6WA 4F3BA 4PFTA 3K6VA 4ELOA 2ZYNA 2V25A 1EZPA 3FZVA 3KSJA 4POXA 4GL8A 4R2FA 2DWJA 2UVHA 3K01A 4PFUA 3KN3A 2ESNA 4DLDA 3ODBA 3A09A 4TLMB 4C1TA 4JXIA 4ZDMA 2O69A 1MQGA 3G3IA 1LBBA 4GL0A 5ITOA 3B6QA 3CSGA 4N6PA 1H43A 3T9HB 4OFJA 3TTMA 1B7UA 4U2RA 4QHQA 1MPBA 1GTKA 2AL5A 4PETA 3UIFA 4R6YA 4KI0E 3PMVA 2XX8A 1IXHA 2RCBA 2DXYA 4JSDA 1O63A 3HHGA 3SEWA 4M1VA 5AA2B 4YMBA 1PBQA 5K2XA 3EHSA 1FQAA 2XXPA 1MS7A 4THIA 4ELQA 3W15C 4C0RA 2H98A 4Q30B 5I58A 4RJZA 2ALUA 4P0GA 3UA8A 4O3AA 1R9QA 4FJPA 3C31A 3KJTA 3LC8A 3IJOB 4G8NA 4IGRA 1N0TA 5HM4B 3M3KA 3B6TA 4F3GA 3FATA 3MVWA 3RQTA 1MY4A 3T9XB 5KDTB 1RYOA 4EUOA 1B1HA 2VGQA 3RT6B 3TPAA 2LAOA 4ESXA 4JDFA 1A99A 4L17A 4EXKA 1TXFA 2PYYA 4KCCA 2RKMA 3TODA 2Q9TA 3GLBA 4R9GA 1YCJA 3H4ZA 1Y4CA 1YPNA 5AA2D 1JVYA 3G7WA 1ZJLA 5AA4B 3E4RA 3HSTA 2RC9A 3PPPA 3PPRA 1DOTA 5I56A 1OIBA 2GFEA 1T0KA 4H8JA 4K3FA 3AXFA 1H45A 3K2DA 2F97A 4JWXA 5L8DA 4FEBA 1JEUA 2DWHA 3ZSFA 3TTNA 4NMYA 5I2NB 1QULA 4XXUA 3IO6A 1PC3A 2XXXA 3GZGA 1SYHA 4YB6A 1A40A 3V5AA 4XKNA 3HN0A 1UQWA 3IORA 2ZNSA 3D4GA 3O6GA 2F6PA 4LZ5A 1B6HA 1DSNA 1P1OA 4NF8A 3CFLA 2QS1A 1GGGA 2RF1A 2DYXA 4GOTA 4IO6A 1MG1A 1H44A 2VD3A 1US4A 1P1NA 4R2BA 5I2KA 2FA7A 3K02A 3MC2A 3KOSA 1N76A 3HCQA 1D3KA 3MVZA 3PGFA 1OQHA 1SW1A 2XXWA 3QSLA 3ZS6A 4ZS9A 4KD5A 5I56B 5ITPA 1MXUA 4ECFA 2B65A 1LFIA 4MFIA 4TLLB 2OK2A 4WKMA 3GBAA 1NFTA 1MY3A 1Y20A 1NNKA 2O84X 1AL3A 1JNFA 3FJ7A 3QUJA 2DXRA 3EN3A 2O1MA 3LBSA 1PB8A 2X7PA 1XC1A 2RC7A 4RPNA 1MXZA 4IO3A 2QMWA 3PUWE 4JWOA 3ILTB 4KPTA 4NF8B 5H8QB 4N07A 1TT1A 2ZYMA 5EYFA 1VE4A 1DTGA 4IO7A 3C34A 3V8XB 3FXRA 4GXSB 2XX7A 2A5TA 1D9YA 2VD2A 4KYDA 4PQJA 2FYIA 1MXWA 2DP8A 3U94A 2QSXA 2RINA 4NWCA 2ZXTA 1LAFE 3IX1A 1MM6A 1DTZA 1L5TA 4XTCQ 2PBWA 1B46A 4G68C 4ONYA 3Q26A 1S50A 5FTIA 3K6WA 3CVGA 4JBZA 4I9DA 3BKIB 4GWOA 1MM7A 3QUFA 1A55A 1B1XA 2I58A 1B0LA 3QAXA 4GD5A 3MWBA 3RTFB 3O29A 3CSBA 1N7XA 2GHAA 5I59A 1AMFA 2REJA 5ELVA 1IXCA 4IGTA 2GH9A 5ICTA 2A5TB 3T22A 4H0WA 3VLWA 4OXVA 4ZEDA 3TYHA 3OMBA 1MH3A 1J1NA 3SEVA 1ZBMA 5DVJA 2XHDA 4ZEFA 2H5YA 1GVCA 3H6UA 3MP6A 3VDFA 2GHBA 3I5OA 4E0XA 3V83A 4RXLA 3D4CA 2HZKA 4QSCA 3SEUA 2ONSA 1B7HA 2VP1A 5I57B 3VVDA 1TFAA 4KHZE 4F18A 2UYEA 3A3CA 3ECRA 2ONRA 3LR1A 4ELRA 3N5LA 4TQUQ 3K00A 3U8QA 1H76A 1Y3NA 1LFHA 4QFNA 4HCYA 3SDFA 3KFMA 4QFLA 1NNTA 4BDOA 3C36A 3A3UA 3VLVA 2DWIA 4H67A 1B3LA 4YKJA 3C33A 1ELJA 1FQEA 3OEKA 3H6VA 4H1XA 5DEXA 3Q27A 1MXYA 4ZECA 4ND9A 3UK4A 3TTRA 1B7ZA 4H5FA 4RYAA 4JWYA 4KYSA 1QKBA 2XXRA 1B52A 5H8NB 4LZ7A 2ZNUA 1Y9UA 5TP9A 4F1YA 4U4SA 3HHFA 4DZ1A 1SD3A 3O66A 4NF6B 4F2QA 1UIVA 3RTWB 3CR9A 3FJGA 5CMBA 5FHOA 2HAUA 1A54A 3N94A 4PFYA 4EDPA 1FTJA 2DOJA 3EQ1A 1Y4TA 4HTGA 2IEEA 2A5SA 2DE3A 1GV8A 5ISUA 3KEIA 2O6AA 2ANJA 3S4UA 4F1UA 4F19A 2Z8DA 1MDQA 1VSOA 2V93A 4H6DA 1SBPA 4YKKA 1USYH 4QSEA 4BDRA 1IITA 1XVXA 2OZZA 1D9VA 2XXHA 1JW1A 3S2VA 4U1ZA 3UGWA 1Y1MA 2H99A 2XXYA 4R73A 2UYFA 5KCJB 4NE4A 2F7CA 2THIA 2OCUA 1O64A 3CG3A 4YB7A 5DYHA 4XKPA 1XHYA 2AIXA 2W7YA 4N13A 3CFZA 4LQ2A 1Y3PA 4GRKA 5TP9B 4LQ5A 1EZ9A 3ONMA 3RLFE 1CB6A 3L6GA 1WVJA 1XT8A 3S9MC 4QSDA 5HPQA 5FHMA 3PUYE 2R71A 1LCFA 2QS3A 3MZ9A 4NF4B 2OBGA 3IO4A 4RK9A 3PPQA 3TDJA 1FW0A 3HO7A 3G3GA 4NWDA 4G2ZA 1DPEA 5H8HA 3KZGA 3UN6A 3T9VA 4FE8A 3RUMA 1B3HA 2I3VA 1LB9A 3K1MA 1LB8A 2WKYA 2PX1A 1ZKBA 3F11A 3DP4A 2F78A 5K2YA 1QUIA 2F36A 2BJJX 3SKPA 2XD3A 3R26A 4R9FA 2UVGA 3KGCA 3DP6A 5B7DA 5DT6A 4OMBA 2OJTA 2HCAA 4KCDA 3I6VA 3MP8A 1LFGA 2YPNA 1NKXA 3UP9A 1FTKA 1UTHA 4ZEBA 2VOZA 1MXVA 4R74A 4GXAA 4IO5A 4WEPA 1FTOA 3PD9A 1IZ1A 1PBPA 2PT1A 2E0SA 2DE4A 5CI5A 3VVEA 1HSEA 2Y7WA 4ZE8A 5IAIA 1SW2A 2XX9A 5I58B 1NMUA 5CBSA 1M5EA 2O1LA 3RN8A 5ICQA 3OO6A 4U23A 3R6UA 4PE5B 1UIUA 2O7UA 1RKMA 2XXQA 3CI8A 4IO4A 4KYEA 1B32A 5EHMA 1P1WA 1B5IA 2XXTA 1BLFA 1QUJA 5L9MA 3QYTA 4YMAA 3RT8A 3FXQA 1B9JA 3FUZA 4G68A 1P99A 3OOAA 4U4XA 3MPLA 2Z23A 4DIGA 3PUXE 3IK6B 1KWHA 1SW4A 4EQ7A 3TEPA 1IXIA 1OLCA 1QUKA 4EF2A 5TPAA 3LUYA 4OQOA 3KG2A 3K0VA 2ZYKA 5AE4A 1SI1A 4AB6A 1VFEA 3C32A 2Y7PA 2I4BA 1NH8A 4XIGQ 4F29A 3GXAA 2NWJA 1B58A 1R6ZA 4YKPA 2Z8FA 3MQ9A 4LZ8A 3N26A 3WAFA 1XOCA 2Y7KA 2X26A 4OVJA 3T96B 1N84A 1M5FA 3SEYA 3PPNA 4ZEKA 1P1QA 2UVIA 1SQYA 1BTJA 3VFJA 3G3HA 4G77A 5IKBA 2V3TA 2RCAA 1M5CA 2QJEA 5CMCA 3IOVA 1B4ZA 4QRZA 3E9XA 3MVXA 5I2KB 1Y3QA 4BDMA 2DQVA 3SEXA 2VHAA 1SDXA 3IB1A 1ZU0A 1SYIA 2QL3A 4KQPA 4OENA 4F31B 1MY2A 4HS7A 4POWA 4GIZA 1MQHA 2Y7RA 1MPDA 3M3FA 3KBRA 3HV1A 2Q8JA 4FAJA 2I4CA 2R9JA 3H6TA 1N7WA 3VXCA 1UTBA 1H3DA 5F1QA 2DWAA 2RC8A 1DMBA 1IUDA 4YZZA 3IOUA 4PFWA 4RNSA 4MLQA 3OO8A 2Q88A 1Q35A 1JVXA 4EQBA 4F3SA 1PB7A 2R6GE 2YJPA 3K1NA 1XVYA 4JSOA 3TELA 3MUQA 1DPPA 1URGA 3TCHA 4GQOA 4XKRA 3VV5A 4BLAA 1JQFA 4OHNA 3FVOA 2UXAA 2XXUA 2HFBA 3N6UA 3VVFA 3TTKA 1FTLA 3FXUA 3MPKA 3PUZE 3OO7A 3EF7A 4WEDA 3Q28A 1QKAA 3TFLA 4TOZA 3MAMA 4O3CA 3FIRA 4OEUA 5CM6A 1POTA 4LVQA 2F8DA 4G8HA 5JK4A 2QPQA 3JZJA 3EHUA 5I59B 5DVIA 1MPCA 3TTLA 1NNFA 3BFUA 5J1DA 3MW0A 1N04A 3QK6A 4RA1A 1B40A 4OFLA 3USDA 4OERA 2I0CA 5M2VA 4WXJA 1HSLA 3G3KA 4F22A 3VXBA 3PMWA 1LBCA 4G4PA 3TQWA 2XXIA 5A5XA 5B70A 2Y7IA 4NEDA 1YAEA 4AB5A 3C9HA 3O6IA 5JEIA 1IEJA 2QMXA 2V3UA 1FTMA 1QW0A 2Q2CA 4LONB 1Z7ME 4LATA 4H65A 4LA9A 1MY0A 4R75A 1I6AA 2I3WA 2GRVA 3RPWA 4EXLA 4UACA 4IY6A 1CE2A 4GLIA 3N6TA 1WDNA 2NXOA 1B05A 5BUUA 5AA2A 3RY3A 1QVSA 4F1VA 3H3GA 2NVUB 1B51A 3CG1A 1JW4A 1LAXA 1Y1ZA 4UA8A 3B7DA 5CMMA 3JV9A 3OD7A 5L9SA 3MP1A 1I69A 2F7AA 3DM0A 2CMOA 3LSWA 2OWSA 3G3FA 5DEXB 4YU0A 1D4NA 3LSXA 2D5WA 5FHNA 3LSLA 5KDTA 1EH3A 4X1DA 5A5XB 3FV2A 3G3JA 1FQFA 4ESWA 3M3LA 3S9EA 1AH5A 2DVCA 3FVGA 4X1BA 2NUVA 2UVJA 3TCGA 2V3QA 4GVOA 1IIWA 3TUSA 4F3PA 4QFKA 4DCXA 3IB0A 5AA4A 3OXNA 4RY1A 1ZTYA 3CIJA 2O68A 4YAHX 3CRBA 2OWTA 1MQJA 2XXVA 2IA4A 3IAZA 2HQ0A 2I48A 1OLAA 3O97A 5JTYA 1N3WA 2F34A 1M5DA 4DE8A 1ZMGA 1B5JA 3S9NC 3HPIA 3UORA 3RNNA 2H9BA 1LAHE 5I2NA 1A8EA 2P2AA 3TAJA 2HXWA 2QS2A 3OEMA 3MZBA 4OFOA 1PB9A 3CFXA 3RGYA 1FQDA 1QJMA 4ZEIA 2M8CA 2ABHA 1B3EA 1BP5A 1P1UA 3FGSA 4ISUA 4U21A 4P11A 3PD8A 4R72A 3L6HA 4ZZAA 3O2AA 4HCWA 4DDDA 3U72A 1OQGA 2CZLA 5BWJA 2H25A 2Y84A 1LLSA 3K1PA 2DVZA 3R7XA 4DXBA 1S7YA 1NL5A 4NTLA 1NH7A 4ZZEA 1Z7NE 3K6XA 3MBPA 4IY5A 5H8HB 5JTYB 4NF5A 4OZ9A 1AIVA 4R6HA 1VFDA 2I49A 3FASA 1Q1KA 2F5XA 1US5A 4GF8A 5L9OA 2Z8EA 3LSFB 4EF1A 3H03A 3PU5A 4HW8A 4M4GA 4PP0A 1I6QA 1VR5A 2PMSA 5H8QA 2ZYOA 2B3FA 5CMKA 2REGA 3C35A 4OTEA 4U22A 1LGBC 1GR2A 4Z7EA 5FTHA 1UTHB 4DXCA 4YKIA 2HAVA 1JW5A 1BKAA 2I0BA 2AL4A 4FECA 3DLNA 2O7IA 1JETA 1MH4A 1R1NA 1TFDA 1R9LA 1USYE 3PV0E 2QS4A 4MF3A 3SETA 1JEVA 3M8UA 3KOTA 4P0IA 1PEBA 3I3VA 3IJXB 5CC2A 4I8CA 1M5BA 3VE1B 2DSFA 4NF5B 2O51A 2QRYA 1OVBA 5HBCA 3ZKKA 1I6BA 3TKDA 1AOVA 4BDNA 2DS9A 1II5A 3E3KA 1MQDA 3TZAA 4G68B 2YLNA 3QIMA 3BBRA 5I84A 3K4UA 3QXMA 4LUBA 1FCKA 3KSXA 4YB5A 3TQLA 2I6EA 5DTBA 4KFQA 3PPOA 3Q25A 1SW5A 4Z0IA 2D3IA 2XD2A 1SI0A 1TWYA 3SESA 5TPAB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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