2VD2A

The crystal structure of hisg from b. subtilis
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
212
structure length
212
Chain Sequence
AMGKLLTMAMPKGRIFEEAAGLLRQAGYRLPEEFEDSRKLIIDVPEENLRFILAKPMDVTTYVEHGVADVGIAGKDVMLEEERDVYEVLDLNISKCHLAVAGLPNTDWSGVAPRIATKYPNVASSYFREQGEQVEIIKLNGSIELAPLIGLADRIVDIVSTGQTLKENGLVETEHICDITSRFIVNPVSYRMKDDVIDEMASRLSLVVEGET
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The Crystal Structure of Hisg from B. Subtilis
rcsb
molecule keywords ATP PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE
molecule tags Transferase
source organism Bacillus subtilis
total genus 52
structure length 212
sequence length 212
ec nomenclature ec 2.4.2.17: ATP phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2007-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01634 HisG ATP phosphoribosyltransferase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2vd2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2vd2A02
2DQVA 3M3FA 1MXYA 3C34A 2E0SA 4I8CA 2I4CA 5AA4A 4DCYA 1B3GA 5CMCA 3FIRA 3PPRA 4R9GA 1YPNA 5DYHA 3OELA 4DXUA 3FXQA 2B65A 1H76A 3B6WA 4ELQA 2Y7RA 1EH3A 3W15C 1ZU0A 5CRYA 4XKQA 4YKJA 4Q0CA 5HM4B 3Q29A 2ZYNA 5I57A 3THIA 4F22A 1M5DA 1A7LA 2I4BA 3LR1A 5JTYB 4O3BA 4THIA 4MLQA 2XXRA 2REJA 4FE8A 5IKBA 3TFLA 1PDAA 2NVUB 3CFZA 3M3LA 1EZOA 1MRPA 2M8CA 2AL5A 3KSXA 4I1DA 2B3FA 4F3BA 5KZTA 3OOAA 4LA9A 3C35A 3QXMA 4WEPA 2OZZA 3A3UA 5B7DA 1S7YA 3JYRA 3TKDA 4EQ9A 1MM7A 4ECFA 2DE2A 2XX9A 5HBCA 3FZVA 4HTGA 1GTKA 1B05A 5H8FB 1B7HA 1POY1 2Q2CA 3PPOA 3MW0A 2V93A 3CR9A 5AA2B 4JWXA 1B4ZA 3D4CA 4LZ7A 2UYEA 3EQ1A 1LBCA 2F78A 3KG2A 5JK4A 3PV0E 1IEJA 1NNPA 3RPWA 5AA3A 1NL5A 2HAUA 3FVKA 5I2NB 4DIGA 3Q25A 3SEWA 3CSGA 2HXWA 3TZAA 4EXKA 4G4PA 1B0HA 2A5TB 3MZBA 3R26A 2AIXA 4GIZA 4G77A 5CI5A 2RCBA 3MZ1A 3FV2A 2I0CA 3VVDA 4UA8A 1I6BA 5HPQA 4LONB 4NE4A 3EN3A 2QMWA 3KEIA 2YJPA 1QUJA 1DPPA 4EQ7A 4GD5A 4YB7A 2OCUA 4XTCQ 1Z7NE 2QPQA 3G3JA 5JEIA 3UORA 2CMOA 1PB7A 2DWAA 3RLFE 4ZEKA 1NFTA 1FTJA 1WVJA 4K3FA 5DEXA 2GH9A 3I6VA 3O28A 3U92A 1KWHA 1SQYA 4P11A 4H5GA 3UIFA 4H67A 1XT8A 3B6TA 2XXYA 1LCTA 2XXUA 2Q2AA 4G8MA 3BFTA 3SERA 1XVXA 4QRZA 3WAEA 2Q88A 2ZYOA 2P1SA 3K1PA 1B0LA 5H8HA 1DTGA 2XHDA 2ZNSA 3TUSA 1CE2A 3SEYA 1FW0A 4DZ1A 2Q8JA 4JXIA 4LQ5A 1D4NA 4ISUA 4F18A 2I6EA 1MPDA 1QUKA 1JW1A 1LBBA 3K4UA 2NWJA 3MJNA 3RGYA 4ZEIA 1FQBA 4OENA 3UA8A 4NF6B 1PC3A 1OLCA 3MVXA 3K00A 2OWSA 1QJMA 3FJGA 2F6GA 2O7IA 3UP9A 4QFNA 2I48A 3FXUA 4KCCA 2AYSA 2UXAA 3FVNA 1DTZA 4BDNA 4LP2B 4X9TA 2UVGA 3H6TA 2HEUA 3O2AA 5FTHA 1QUIA 3C36A 4KFQA 5EYFA 3DP8A 1N04A 1YTVA 1B5JA 1TFAA 2H4IA 4M1VA 2RC7A 3TELA 3M8UA 1P1WA 2O1LA 2ONRA 4YMBA 3GXAA 1MY2A 1MQGA 3OEMA 5BUUA 2REGA 1FQCA 1LSTA 1ANFA 3H4ZA 4GXSB 2P0SA 1Y1ZA 2ZYMA 3N26A 3LC8A 4ZS9A 3RTWB 2R9JA 1MQJA 1BIYA 2ZNUA 1CB6A 4WKMA 4POWA 2D3IA 4O3AA 5TPAB 4OETA 1B52A 5I58A 3PGFA 2VD3A 2O6AA 4H0WA 2XXWA 3CI8A 4XKRA 1R1NA 1JQFA 4PQJA 2FYIA 3KJTA 3EHTA 4GL0A 2OJTA 3TTLA 4IY6A 2H5YA 3K6WA 4ZE9A 1ZIUA 4TOZA 4RXLA 3ZKKA 3E3KA 2DWHA 2Q89A 4F3GA 4G8NA 4LZ5A 3BFUA 4XKNA 1JEUA 4WXJA 1MXWA 2XXQA 3PMXA 3KGCA 3MWBA 1BP5A 3G3HA 4RNSA 3FD3A 1YAEA 1OQGA 3PUWE 3G3KA 2OK2A 5H8NA 1LAGE 4BDMA 4ZECA 4OFLA 1FQEA 1O7TA 1Y4TA 3VV5A 1N84A 4DDDA 2WKYA 3FVGA 4H8IA 5I56A 1UTHB 3RQTA 4M4GA 4FJPA 3H03A 5KDTA 2R6GE 1WDNA 3KZGA 1ZKBA 5I59A 3MP1A 1N0TA 3WAFA 2YLNA 2XX8A 3TYHA 2Z22A 3SEVA 4NEDA 1B5IA 1XC1A 1TFDA 4KQPA 3L6GA 1QKBA 1UIUA 4XKPA 4C1TA 3VVFA 3FUZA 1ZBMA 2I3WA 4R74A 4F19A 3GLBA 3N6UA 3VXBA 2GHAA 3O97A 3PPNA 3S9NC 1SBPA 1ZLQA 4ZZEA 1ATGA 3TTNA 3TDJA 4GOTA 1N7WA 3H6UA 4RK2A 3LSLA 1Y20A 4YAHX 3MP8A 1MDQA 4OYVA 1XVYA 1Y3NA 4X1DA 3A09A 2RINA 4R9FA 3G7WA 3TCFA 2QSXA 3PD9A 1IIWA 1PEBA 4DXCA 3IJXB 4Q5TA 1BTJA 3T9VA 2UVHA 5CMMA 3KOSA 5J1DA 5K2YA 5DVIA 2QMXA 3G3IA 3O29A 1DPEA 3BKIB 3P7IA 1B51A 1SW2A 1NNKA 2V3UA 4F2QA 2YPNA 1SDXA 3SETA 1UTBB 3U1OA 3OSRA 3PD8A 1IZ1A 1TT1A 3T9HB 1M5CA 3U94A 1A8EA 3PPPA 3SEXA 3UN6A 3F11A 5LOMA 2Y7WA 5CBSA 4PETA 2HFBA 3QAXA 4Z7EA 3U93A 2W7YA 1LGBC 4KD5A 3KJ7A 5CMBA 4ESXA 1OMPA 4ONYA 3FXRA 3W9WA 4R73A 4C1UA 1FQAA 2F7CA 3MP6A 4OMBA 1S50A 1B7UA 2XXPA 2X7PA 3VLVA 1PBQA 3OMBA 4H8JA 3QK6A 4NF4A 1B40A 4EF2A 1NMUA 3V83A 3Q28A 4QFKA 1Y3QA 4KYSA 3C33A 3QIMA 4YMAA 3K1MA 1QVSA 1HSLA 3CSBA 1GGGA 5H8SA 4P0IA 3K2DA 2ABHA 3DLNA 2HZKA 4U21A 4XXUA 1MH4A 5I58B 5I2KA 2NOOA 3O6HA 1LAHE 2OBGA 1RYXA 3N94A 4R6HA 2P2AA 4BDOA 2XXIA 4QF9A 4NF8A 4MF3A 5DT6A 2O84X 4BDLA 5A5XA 1IXIA 1FTKA 5FTIA 3OXNA 1LFIA 3H06B 4GWOA 3TEPA 2DXRA 4X1BA 1EZ9A 2HQ0A 4IO7A 4U2RA 3OEKA 5KCJA 1P1OA 3QSLA 3SKPA 4FEBA 1A55A 2G93A 5AA1A 5ISUA 4G68B 3V5AA 1MXUA 3CIJA 4LZ8A 1P1UA 1D9VA 3K01A 3IL1B 3M3KA 5CBRA 1URGA 1ZJLA 2NUVA 3RT8A 4NF5B 1N76A 1OVTA 4F1YA 1AMFA 1TWYA 1R9LA 2DP8A 4UACA 3L6HA 1IQ7A 1T0KA 2F7AA 2HAVA 4RA1A 4LQ2A 2DYXA 3VE1B 1LLSA 4KYDA 3I3VA 2ANJA 4IB2A 2FNCA 4QSDA 3G3FA 1UQWA 5F1QA 4AB5A 3TCHA 1DOTA 5F7VA 3LBSA 1URSA 4U1ZA 2QJEA 4I62A 1P1NA 3QUFA 4PFWA 3LSFB 4ZE8A 1H45A 1AIVA 4GF8A 5ITOA 4QHQA 4TQUQ 1B46A 4G2ZA 1SW1A 3FGSA 5AA4B 3IOVA 4X48A 4LUBA 1MQDA 5CC2A 1A54A 3E13X 1J1NA 3RN8A 1HSEA 3PUZE 4IGTA 3UK4A 5DTBA 3KN7A 3R7XA 4HW8A 4GQOA 3RT6B 4GFRA 4MFIA 4BDRA 5BWJA 4F29A 5I57B 3MVWA 3E4RA 1QKAA 4F3PA 2G29A 1MM6A 2PX1A 5JTYA 3VLWA 4EF1A 4L17A 4OERA 1SW5A 2QS1A 1OVBA 4C0RA 1PB9A 1USYH 1NH7A 4IO3A 2XD3A 2QRYA 3MVYA 3ZSFA 2NXOA 4GRKA 3A3CA 4N07A 4YB5A 3HSTA 1NH8A 3IB2A 1BLFA 2VHAA 1LCFA 1MXZA 1QW0A 3IOTA 2DE4A 4N6PA 2DOJA 4OXVA 4RPNA 3CG1A 4IO4A 1S9TA 1NNTA 4U22A 3PMVA 2XD2A 4QSCA 4G68C 3CFLA 2I3VA 3OO8A 4HCWA 3V89B 4ESWA 5I84A 1B58A 3MBPA 4MH5A 4IO2A 1VSOA 5AA2A 3FV1A 3U8QA 3MPKA 3PPQA 4RY1A 1VR5A 1URDA 2F97A 4ZEFA 1SYIA 2ALUA 1XS5A 4KHZE 1UIVA 3OENA 2GHBA 2ZXTA 4OFJA 3TAJA 1MY4A 3K6XA 2Z8EA 2THIA 2ONKE 5I2NA 2DE3A 1RYOA 4KR5A 4PFYA 2E1SA 4YB6A 1B1HA 4NWDA 5TP9A 2A5TA 1GR2A 3K1NA 3PMWA 2PVUA 2KLFA 1LFGA 3ONMA 3O6IA 4IGRA 5AA2D 3HN0A 4DE8A 4H6DA 2H9BA 2BJJX 4RYAA 3MPLA 1LAXA 1MPCA 3SEUA 2ZYKA 4DCXA 3GBBA 3E9XA 1VFDA 2F7BA 2XXTA 2GFEA 3IJOB 5L9OA 4LATA 2HCAA 3OSQA 1B3HA 2AL4A 5M2VA 5TU0A 3SDFA 4QFLA 5L9MA 4GVOA 2UVJA 3CRBA 3OD7A 2ZMBA 5ELVA 1O63A 4R72A 1NKXA 2XX7A 4POXA 3T9XB 3H6VA 4DLDA 1P99A 3MC2A 2XXVA 3TTKA 5DEXB 4R6YA 2DSFA 2V25A 4OESA 4ND9A 3ODBA 1DSNA 1YCJA 2DXYA 4JBZA 1JW5A 3EHSA 1VFEA 4XIGQ 3K02A 2QS4A 1MQIA 2VD2A 1MY0A 5FHNA 1SD3A 2F36A 1GV8A 4OFOA 1H3DA 4EDPA 1SVXB 3IK6B 4YKPA 1B7ZA 3D4GA 4RPOA 5H8HB 1B3EA 2RKMA 4KYEA 1B2HA 3DM0A 3N5LA 1MS7A 3CVGA 3OO7A 3OO9A 1BKAA 1WODA 4YKIA 2PT1A 3N6TA 1IXHA 4P0GA 1M5BA 3B7DA 5DVJA 4F1VA 1AOVA 3RUMA 1B3LA 4ELOA 4JSDA 1D9YA 4NF6A 3TTRA 1Y3PA 2QS2A 5L9SA 3S2VA 3IX1A 1FQFA 1MG1A 4KCDA 1ZTYA 1JEVA 3TTMA 2F6PA 3ILTB 4QFOA 2A5SA 2QS3A 3R6UA 5L8DA 1B1XA 3SESA 4O3CA 2V3TA 2FA7A 3MUQA 4FIMA 1R9QA 1MXVA 4IO6A 4OHNA 1I6AA 1MXXA 3K0VA 5CMKA 1A40A 4BLAA 4ZEDA 2IEEA 4YU0A 5FHOA 1SYHA 3TODA 3T22A 3MZ9A 3H6WA 5IAIA 3DELB 3B6QA 3DP6A 5EHMA 4R6KA 3ILUB 3IORA 1JVYA 1PBPA 4PFUA 3ZKLA 4OWDA 3S9LC 3S4UA 4OEVA 1HSJA 2O1MA 2I0BA 3Q26A 1LAFE 5TPAA 3IB0A 1FQDA 4Q8RA 1OIBA 1RKMA 5CM6A 3T96B 2F5XA 3KFMA 3O9PA 4OTEA 2D21A 2O69A 3HCQA 3USDA 4GL8A 3LUYA 2GRVA 2ZNTA 3UGWA 4EQBA 4EUOA 3I5OA 2RF1A 1MY3A 5ITPA 1M5FA 4KI0E 1IITA 4PFTA 1N3XA 3JV9A 3EHUA 3TCGA 3HV1A 1N7XA 5TP9B 4MLVA 1EU8A 3IOUA 1US4A 4OVJA 5H8NB 4KPTA 5H8QA 3C4MA 1UTHA 4I9DA 5I56B 1MY1A 1H44A 1LFHA 3S9EA 5KDTB 1OQHA 4ZDMA 4RJZA 5I59B 5K2XA 1VE4A 3IB1A 4HS7A 1SI1A 3TQWA 1IXGA 2UVIA 2Z8DA 1Y1MA 2F34A 4JB7A 1SW4A 3T66A 5ICTA 4N13A 1TXFA 3LSXA 4FATA 3OO6A 2O51A 1II5A 3FVOA 4F2OA 3W9VA 4FEDA 3T93B 1AH5A 3RNNA 2IA4A 4ZZAA 1MH3A 4R2BA 4R2FA 4MBPA 4E0WA 3VDFA 2I49A 3O66A 4BDQA 2HZLA 3IOWA 4Q30B 3PUYE 3PUXE 1FCKA 1B4HA 4AQ4A 2DVZA 2DWIA 3IO6A 2UYFA 2XXXA 3VVEA 3KSJA 3RY3A 1JVXA 2DWJA 2PBWA 4JSOA 1R6ZA 2V84A 2PYYA 2PT2A 1JW4A 3IO4A 2DVCA 1QULA 3C32A 2OWTA 1I69A 1AL3A 1B3FA 1A99A 2O68A 3VLUA 2X7QA 2H99A 3HO7A 1EZPA 2RCAA 4JDFA 1D3KA 4H1XA 1FTMA 1UTBA 2VP1A 3FATA 3JZJA 2OLBA 2Y84A 1IXCA 3KN8A 4H5FA 3PU5A 4OEUA 2Y7IA 1F9BA 2ESNA 4IY5A 3DP4A 2D5WA 3VFJA 2H98A 3EPEA 1XHYA 4PP0A 4EXLA 3VXCA 3PUVE 2CZLA 1SI0A 3MAMA 3CFXA 4QSEA 2Z8FA 4U4SA 1P1QA 1B5HA 4H65A 4DXBA 2VOZA 4NWCA 3MVZA 1FTLA 1B32A 3HHFA 4NF4B 5H8FA 2F8DA 2PMSA 3K6VA 1LB8A 1JNFA 1O64A 1POTA 3EF7A 1USYE 1LB9A 3FJMA 4YICA 3IAZA 4U1OA 4Z0IA 1I6QA 3LSWA 4HCYA 3U72A 5AE4A 3GZGA 3ZS6A 1XOCA 3TPAA 1N3WA 3O6GA 5B70A 2XXHA 3GBAA 3KBRA 1Y9UA 3QYTA 3H3GA 3FASA 1MDP1 1B9JA 1Y4CA 5I2KB 1ELJA 5EHSA 1GVCA 2Y7PA 4ELPA 1Q35A 1MQHA 2Y7KA 3IR1A 1NNFA 5FHMA 3H7MA 4IO5A 4RK9A 1L5TA 4NF8B 4F1UA 3T9UA 4TLMB 4QFPA 5A5XB 4NTLA 3V8XB 1DMBA 1H43A 4FORA 4OQOA 2LAOA 2B3BA 4E0XA 2R71A 1A8FA 3KOTA 2ONSA 4G8HA 4TLLB 2I58A 4ELRA 5KCJB 5H8QB 4F3SA 4F39A 3CG3A 4U23A 3AXFA 4F31B 3Q27A 4JWOA 4AB6A 4G68A 4U4XA 3G3GA 2H25A 3MQ9A 2F35A 4YKKA 4OZ9A 1MPBA 4GLIA 4YZZA 1IUDA 4NF5A 2Q9TA 3TMGA 2RC9A 3K6UA 1OLAA 3ECRA 4JWYA 1ZMGA 3TQLA 1FTOA 3KN3A 4R75A 5DVFA 4WEDA 3RTFB 5ICQA 2V3QA 4PE5B 3QUJA 3S9MC 1Z7ME 3HHGA 1US5A 1M5EA 2QL3A 1JETA 1Q1KA 3BBRA 1PB8A 4LVQA 2DS9A 2X26A 3C31A 3HPIA 2VGQA 2O7UA 4ZEBA 3FJ7A 3C9HA 4FAJA 2Z23A 1B6HA 4GXAA 2RC8A 4NMYA 4FECA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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1I6BA 5HPQA 4LONB 4N15A 4NE4A 3EN3A 2QMWA 3KEIA 4DI3D 2YJPA 1QUJA 1DPPA 4EQ7A 4GD5A 4YB7A 2OCUA 4XTCQ 1Z7NE 2QPQA 3A29A 3G3JA 2V4CA 5JEIA 4XFEA 3UORA 2CMOA 1PB7A 2DWAA 3RLFE 1FPLA 4ZEKA 1NFTA 1FTJA 1FJ6A 2QVUA 1WVJA 4K3FA 5DEXA 2GH9A 4GX4A 3I6VA 3O28A 3U92A 1KWHA 1SQYA 2VPNA 2XWKA 4P11A 4X8RA 4H5GA 3UIFA 3LV0A 4H67A 1XT8A 4PAFA 3B6TA 4AS5A 2XXYA 1LCTA 2XXUA 2Q2AA 4G8MA 3BFTA 3SERA 1XVXA 4QRZA 3WAEA 2Q88A 2ZYOA 2P1SA 3K1PA 2CZHA 1B0LA 5H8HA 1DTGA 2XHDA 2ZNSA 3TUSA 1CE2A 3SEYA 1FW0A 4DZ1A 2Q8JA 4JXIA 4LQ5A 3SZPA 1D4NA 1LBWA 4ISUA 1FPBA 4F18A 2I6EA 1MPDA 1QUKA 1JW1A 1LBBA 3K4UA 2NWJA 3MJNA 3RGYA 4ZEIA 4FBPA 1FQBA 4OENA 3UA8A 4NF6B 1PC3A 1OLCA 3MVXA 2F3DA 2CEXA 3K00A 3IFAA 2OWSA 2WYPA 1QJMA 1IMBA 3FJGA 2F6GA 2O7IA 3UP9A 4QFNA 2I48A 3FXUA 4KCCA 2AYSA 2UXAA 3FVNA 3KC0A 1DTZA 3BIGA 3D1RA 4BDNA 2CZIA 4LP2B 4X9TA 2UVGA 3H6TA 4I40A 2HEUA 3O2AA 4PTKA 5FTHA 1QUIA 3C36A 4KFQA 5EYFA 3DP8A 1N04A 1YTVA 1B5JA 1RDZA 1EYIA 1TFAA 2H4IA 4M1VA 2RC7A 1SPIA 5LTCA 3TELA 1G0IA 3M8UA 1P1WA 2O1LA 2ONRA 4YMBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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