2VOZA

Apo futa2 from synechocystis pcc6803
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
RTINLYSSRHYNTDDALYDAFGEVNLIEASAEELIERIQSEGANSPGDILFTVDAGMLWRAEQAGLFQPVRSGKLNERIPENLRHPDGLWYGFTQRARVLYYSRDRVNPADLSTYEALADPQWRGKILVRPSSNVYNLSLTASRIAIHGEPETRRWLQGLVGNFARQPEGNDTAQIRAIAAGIGDVAIANSYYYIRLQKSTDPADQEVVEKVSLFFPNTGSGERGTHVNVSGAGVLKNAPNRDAAIAFLEYLASDDAQRYFAEGNNEYPVIPGVPIDPVLAAHGQLKGDPLNVSNLGRYQPDSARLMNEVGWQ
5010015020025030030025020015010050
020406080100120Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH1 (46-54)TI3 (136-139)AH2 (64-74)AH3 (88-97)TII2 (249-252)TI1 (75-78)EMPTYTII'1 (74-77)TI6 (269-272)AH6 (183-196)AH4 (106-111)AH5 (168-181)3H1 (114-116)3H4 (154-156)AH8 (224-232)3H2 (142-144)3H3 (148-152)S4 (124-136)TI2 (118-121)TI5 (164-167)TI4 (137-140)TII4 (304-307)S5 (160-161)TII1 (156-159)AH7 (205-214)S8 (261-268)TIV1 (197-200)S6 (219-223)AH9 (236-244)TIV2 (272-275)AH12 (311-315)S1 (35-40)S2 (56-61)TII3 (253-256)AH10 (275-286)AH11 (288-297)S3 (82-86)S9 (301-302)S7 (245-248)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Metal binding protein
publication title Futa2 is a Ferric Binding Protein from Synechocystis Pcc 6803.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PERIPLASMIC IRON-BINDING PROTEIN
total genus 123
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2vozA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2vozA02
2O1LA 4YKPA 4RK9A 4QRZA 1ELJA 1MXXA 4XKQA 4ELQA 3ZSFA 2V84A 1NNTA 4EF1A 4G77A 3O97A 3B7DA 3W9VA 2THIA 3EHUA 4ZS9A 2QJEA 2AYSA 4WXJA 3S9MC 4G8NA 1B3LA 3H03A 4MFIA 3UGWA 5I57A 3F11A 4ZEFA 1MY2A 4ZEIA 1LCFA 4DIGA 2F7CA 2PVUA 1PDAA 1GV8A 1B5JA 1GTKA 3M3LA 4YICA 3ECRA 1OVBA 2O1MA 2HQ0A 4ND9A 1PB9A 5EYFA 3K1PA 3O6GA 3MQ9A 5KCJB 3MJNA 3U92A 1UTHB 5ICTA 3K00A 3CSGA 1MPBA 4FATA 4OFOA 3QXMA 4HTGA 4YB7A 3HV1A 2Y7PA 1USYH 3FASA 5A5XA 3M3FA 3PMWA 3IO6A 5EHSA 2Q89A 3E13X 2NVUB 3K2DA 3K6XA 1FQFA 1WDNA 2OCUA 3SEUA 3IAZA 3O9PA 3N6UA 3KN8A 3V89B 4FEBA 2HZLA 1FCKA 1UIUA 3JV9A 1BLFA 4G2ZA 4ELPA 3MZBA 4YKJA 4WKMA 4RJZA 4R6KA 4BDRA 4LP2B 4N07A 4E0WA 2XXHA 5LOMA 3PPQA 2QMWA 3S2VA 1N7XA 2F78A 1PBPA 3OD7A 2DVCA 2DS9A 3K1NA 4M4GA 2XX8A 4RA1A 5H8NB 1Q35A 4O3AA 4PE5B 3HHFA 4GXSB 2CMOA 4IB2A 3S9LC 4YZZA 1B51A 3QAXA 5CM6A 1QKBA 1AOVA 5DVFA 3CFZA 1UIVA 2XXIA 2H99A 4H6DA 3SKPA 3SEXA 4I8CA 3VVDA 3KJ7A 3TCFA 3KSJA 3DP4A 3TQWA 3UORA 3B6TA 1B3FA 4C1TA 5DTBA 2PYYA 2DXYA 2W7YA 1ZJLA 5FHOA 3CVGA 4JSOA 2UVGA 4POXA 3MP8A 2DE4A 3JZJA 1IXGA 1AIVA 4NTLA 2NXOA 3HSTA 1GVCA 2UYFA 1IIWA 3KOSA 1Y4CA 3LBSA 5I59A 1SI0A 3KOTA 2O7IA 1P1NA 5ITPA 1XHYA 3U8QA 2B3BA 1XC1A 5FTHA 2I0CA 2PMSA 5I58A 4R6YA 5I2KB 3KN3A 4PETA 5EHMA 4QFOA 1ZU0A 1LBCA 3H6TA 1LFGA 4GVOA 4ONYA 1JW4A 3V83A 5BWJA 5CRYA 3SESA 3RQTA 4HW8A 2ALUA 4IO7A 3S4UA 2RKMA 1SW5A 3RT6B 2F35A 2F7BA 1B46A 3KGCA 1LAHE 2R71A 1YAEA 3MC2A 4P0IA 3G3KA 5AA3A 1BIYA 4DXBA 3VFJA 1L5TA 3U72A 1MDP1 1R9QA 5AA4A 1PB7A 1Y1ZA 1XVXA 3MUQA 2WKYA 4P11A 1IEJA 4U1OA 4U4SA 5AA2D 1EH3A 4QF9A 1NH8A 2Z23A 3TEPA 3UA8A 3PMXA 4MH5A 5HBCA 4F39A 3K02A 2XX9A 3PPPA 3N26A 5FHNA 1I6BA 3OO7A 1LSTA 1MPCA 4IGTA 4F3BA 1R1NA 1JQFA 3MP6A 3PUZE 4PP0A 1IXHA 3KBRA 3R7XA 4ISUA 1ZIUA 1Y20A 3RY3A 4NMYA 2D21A 4LVQA 2CZLA 3N5LA 3CSBA 4H1XA 5KDTA 2A5SA 4I1DA 3TTNA 3VXBA 2KLFA 2H25A 1VSOA 4H67A 5I2NB 4FAJA 3SEWA 1EU8A 2XD3A 1B40A 4PFWA 3VLVA 4KYDA 4F31B 4JXIA 1ZTYA 4LZ5A 5DEXA 2G29A 3BFUA 3VV5A 4FE8A 4HS7A 3RN8A 2UYEA 3H3GA 4BDLA 1H45A 1OMPA 1B58A 4XKPA 5I2KA 1S7YA 3KEIA 2FYIA 2O69A 4R74A 5AA1A 4IY5A 2GH9A 1URSA 3G3GA 4I62A 4F1UA 2VHAA 4PFTA 1TFAA 3IOWA 2DXRA 2I6EA 2ABHA 4OYVA 2X7QA 1BP5A 3VDFA 2HEUA 2O68A 4U2RA 4NF6B 3C9HA 3FIRA 2F36A 2LAOA 3T96B 3TODA 5H8HB 2V93A 5JTYA 3PU5A 1OLAA 1LFIA 2F34A 1USYE 2F7AA 4ZEBA 4EUOA 4R9FA 3OO8A 3T9UA 1P1UA 1HSEA 1PBQA 3H6UA 4LA9A 3MAMA 1Y3PA 2NWJA 3C34A 3TKDA 4RK2A 3E9XA 4UACA 1A7LA 4HCWA 3VVFA 4ECFA 2V3QA 5TPAA 3KG2A 2I4BA 1RKMA 4KYEA 4U21A 1POTA 1N84A 4GQOA 4LATA 2F6GA 4KD5A 5AA2A 3N6TA 1B5HA 1IITA 4F2OA 4LONB 1ZMGA 4G4PA 5CC2A 4RYAA 5I56B 4EQ9A 3RTFB 1AL3A 4EDPA 2DQVA 4OERA 5H8FA 1MXVA 4RPNA 2Y7RA 2QS4A 3IOVA 4JBZA 1LCTA 2XHDA 4R6HA 3TCGA 4R2BA 4U1ZA 1NMUA 4EQBA 4XIGQ 5ISUA 3FVGA 5CMCA 2GFEA 1I69A 2QRYA 3PPOA 3IB2A 5TP9A 1NL5A 4YB5A 1MXZA 2ZNTA 1MDQA 4NF8B 2I58A 4MLQA 2XXWA 2DP8A 5F7VA 4K3FA 1CB6A 3DP6A 4F19A 5AE4A 1SW2A 4GRKA 3LR1A 4G68B 4JWXA 2XXXA 4ZZAA 1FTLA 3OO9A 4MLVA 3FD3A 4M1VA 5ELVA 3OSQA 1ATGA 4YB6A 4KFQA 2RINA 4E0XA 1NKXA 4BDQA 4H65A 2RC8A 1UTBB 3TPAA 1DMBA 3H7MA 1SD3A 4KR5A 3G7WA 5H8QA 3OSRA 2QS1A 3MVZA 4R72A 2Q2CA 1MY0A 1Y3NA 1N3XA 3I3VA 2ESNA 3OO6A 1R6ZA 3HCQA 3O66A 2QL3A 1VE4A 2A5TA 1P99A 1F9BA 3DLNA 1OLCA 4GL0A 4NF4B 4YMAA 4OETA 2F97A 3SEVA 1JVXA 1SYIA 2Y7WA 3BKIB 3TTLA 2ONSA 3C32A 1N76A 1CE2A 4F3GA 1I6QA 3K1MA 1T0KA 4IO4A 1MS7A 1URGA 2UXAA 4OESA 3B6WA 4X1DA 4YAHX 1MXYA 2ZNSA 1B0HA 1IXIA 1MRPA 3GXAA 4R9GA 4TLLB 1B32A 3PUYE 4BDOA 4BDNA 1D3KA 3O6HA 1URDA 4FEDA 2V3TA 2DSFA 4PFUA 4NE4A 2V25A 1NNFA 1TFDA 3OELA 1QUKA 3LSWA 3TDJA 3KJTA 3S9EA 2VP1A 4FECA 1MQIA 3VLWA 3RPWA 3TUSA 3AXFA 3MW0A 1O63A 4ZDMA 3K6VA 2Z22A 4X48A 3H06B 4F1YA 4Z0IA 4R2FA 2BJJX 2Q9TA 2O84X 1B0LA 4QFPA 3S9NC 4X9TA 1D9VA 4OEVA 2Q8JA 3IO4A 2H9BA 4GOTA 2GRVA 3C35A 2ZNUA 5TU0A 1D4NA 1MQDA 2RC7A 3C31A 3D4GA 4LQ5A 3MWBA 2OBGA 2IEEA 2YJPA 4IO3A 2R6GE 1TXFA 2ANJA 3P7IA 5HPQA 1MY4A 5KCJA 1JW5A 3VVEA 3V8XB 1H43A 1UTHA 3FXRA 2OWTA 4U22A 3IJOB 2DE3A 2ZYMA 3H6VA 3A3CA 1IUDA 3FUZA 3K0VA 4P0GA 1VR5A 2F6PA 4FJPA 3FV2A 3R6UA 4IGRA 4NF5B 3C36A 1LFHA 2ZMBA 3FVOA 3PUWE 2NUVA 1GR2A 3TQLA 2F5XA 2ZYOA 4H5GA 1Y1MA 5K2YA 3TCHA 2XXVA 3TFLA 3IORA 3DELB 1IQ7A 1ZKBA 4NEDA 3U93A 2HZKA 1FQDA 3EHSA 2IA4A 1HSLA 2RCAA 3VXCA 3LUYA 3EHTA 5JK4A 3Q27A 2O7UA 1JNFA 1XT8A 4DCYA 5H8NA 1MXWA 2Z8DA 4H8IA 4L17A 4OVJA 1AH5A 2XX7A 2XXTA 5L8DA 1YCJA 4ZE9A 2P0SA 4GL8A 1PB8A 1N7WA 1H44A 3QYTA 3RNNA 3MVYA 1HSJA 3E4RA 3BFTA 3HN0A 3CG1A 1MXUA 2Z8FA 3QK6A 4YMBA 4N6PA 2OK2A 3RGYA 4KHZE 5CBSA 1VFEA 3QUFA 1DTZA 1M5BA 1MH4A 1QUJA 4KCDA 5L9OA 2NOOA 4H5FA 2Y7IA 3MBPA 3CR9A 1B9JA 1IXCA 1FQEA 1ANFA 3FXQA 4MBPA 1QJMA 1LAGE 3VLUA 1FTOA 1N0TA 4NWDA 4FORA 3ZS6A 1Z7NE 4F18A 1A40A 2RCBA 1JW1A 4F1VA 1P1WA 3ODBA 3TAJA 3M8UA 3LC8A 4DCXA 1JVYA 5CBRA 1WVJA 5CMBA 1LBBA 2B65A 1B7HA 1NNPA 1B1HA 4ESXA 3C4MA 3MP1A 4GWOA 4OFLA 1B7UA 5M2VA 1Q1KA 3T66A 5I57B 2UVIA 1B3EA 4DE8A 2O51A 3THIA 2YLNA 1PC3A 3B6QA 3GLBA 4WEPA 3GBBA 2OWSA 2XXQA 1B4ZA 3T9HB 1SYHA 2XXRA 3OOAA 2DVZA 1N04A 3T93B 4H8JA 2RF1A 5DVIA 4QFLA 3ILUB 3OEMA 1JEVA 1SBPA 3T22A 1FW0A 3EF7A 3L6GA 4EF2A 1MQGA 1SW1A 4Q5TA 1TWYA 1YTVA 1DPEA 3IK6B 3K4UA 4C0RA 1FQAA 3IJXB 1A54A 2D3IA 4Q8RA 2I49A 1WODA 5A5XB 4GXAA 2I3WA 1POY1 2I0BA 4RY1A 2FNCA 5DVJA 3KSXA 4H0WA 2QMXA 1DOTA 3PUXE 2H98A 1SI1A 2Z8EA 2Q88A 4IY6A 1B3HA 4XKRA 1AMFA 3ONMA 1R9LA 2QS2A 1M5DA 3RLFE 3TTRA 3DP8A 4FIMA 4LQ2A 1KWHA 3PV0E 5ICQA 4OMBA 4XXUA 3N94A 3M3KA 1BKAA 4IO5A 2D5WA 1J1NA 1MQJA 1S9TA 3I6VA 2PBWA 1M5CA 3TTKA 3CG3A 3IB0A 1OQHA 3T9XB 4OWDA 4G8HA 5H8SA 3Q29A 4JSDA 4XTCQ 3GZGA 2GHBA 3TELA 1B2HA 1H3DA 1XOCA 1M5FA 3G3FA 5I2NA 5BUUA 1OVTA 1B5IA 5B70A 3E3KA 3Q28A 3H4ZA 4NWCA 3IL1B 1ZBMA 2ZYKA 2XD2A 2ONRA 4IO6A 2DOJA 4OZ9A 1QVSA 4C1UA 4QSCA 5I84A 3OENA 3ILTB 4F29A 3TYHA 2DWAA 1FTJA 2REGA 3USDA 2VD3A 3A09A 3FVKA 1NH7A 4JB7A 1I6AA 3FJ7A 3MZ9A 3A3UA 5I59B 1DSNA 4NF6A 3OEKA 1PEBA 5F1QA 1Z7ME 5H8HA 3MVWA 4F22A 3OXNA 2AL4A 4JWOA 2HAVA 5I58B 2B3FA 4GFRA 3Q26A 1SVXB 4KPTA 3EQ1A 4ZECA 1FQBA 3SETA 3G3IA 2X7PA 4AQ4A 1B05A 3FZVA 3DM0A 2RC9A 2X26A 1II5A 3WAEA 2QPQA 1P1QA 2DWHA 4GIZA 2E0SA 3G3HA 3SERA 1LAFE 3W9WA 1FTKA 4OEUA 5I56A 5AA4B 3PD9A 4DZ1A 4ESWA 4OFJA 1B3GA 2OJTA 2Y7KA 5L9MA 1QUIA 4F3SA 3O2AA 1QKAA 5CMMA 1Y4TA 4JWYA 4ELOA 1DPPA 3H6WA 3HPIA 4AB5A 3MVXA 1XVYA 4F3PA 4GD5A 1H76A 1B1XA 1DTGA 1EZ9A 2QS3A 1A55A 1MY1A 2UVHA 3IB1A 3C33A 3OMBA 4R73A 4QSEA 3ZKKA 3EPEA 5K2XA 4NF8A 4U23A 4N13A 1OQGA 3HO7A 4R75A 4KQPA 3KZGA 4TQUQ 5KDTB 3FGSA 1IZ1A 4OTEA 2H4IA 2AIXA 2DE2A 4G68A 5DT6A 3PPRA 3EN3A 3V5AA 1Y9UA 3IOUA 2I3VA 1UTBA 1B4HA 2R9JA 3KN7A 4QSDA 5DEXB 1Y3QA 1YPNA 1FQCA 4MF3A 1UQWA 1A99A 2ONKE 3PPNA 1FTMA 1LLSA 3CFXA 3U1OA 3L6HA 2DWJA 3IR1A 2V3UA 3ZKLA 2GHAA 4DLDA 4POWA 1SQYA 1B7ZA 1MY3A 1O7TA 3PD8A 1LB9A 2HAUA 4NF4A 3MPLA 3U94A 3O6IA 3MZ1A 1NFTA 2P1SA 4YU0A 1MH3A 2VD2A 4THIA 4TOZA 4JDFA 4LZ8A 1S50A 2PT2A 3CI8A 5L9SA 3IOTA 1M5EA 4ZE8A 4EXLA 4ZEDA 2M8CA 2XXUA 3LSXA 3G3JA 4YKIA 4LUBA 1N3WA 1LAXA 2AL5A 4LZ7A 5JTYB 3D4CA 1MG1A 3R26A 4RNSA 3TZAA 3TMGA 1US5A 4KI0E 4X1BA 4HCYA 4BLAA 1OIBA 5CMKA 3LSLA 3K6UA 4I9DA 4OHNA 2HFBA 2DYXA 1BTJA 3Q25A 2YPNA 3UN6A 2HCAA 2VOZA 4U4XA 3UIFA 3QSLA 3RTWB 1TT1A 3WAFA 2Q2AA 2E1SA 4KYSA 3QUJA 1EZPA 5TPAB 3IX1A 3SDFA 5AA2B 2I48A 3QIMA 4OENA 2Y84A 3GBAA 2ZYNA 4GF8A 3LSFB 5B7DA 5J1DA 1MQHA 1MM6A 4IO2A 4YKKA 5H8FB 3W15C 4EQ7A 4BDMA 1LB8A 4Z7EA 2H5YA 2PX1A 2ZXTA 1A8FA 4RPOA 1O64A 4F2QA 4QFKA 1ZLQA 3FV1A 1NNKA 1QULA 1MPDA 3FJGA 5FHMA 4GLIA 4OXVA 1B52A 3FATA 4RXLA 5TP9B 3JYRA 4G8MA 4EXKA 3CIJA 2I4CA 3KFMA 2VGQA 1JETA 4Q30B 1LGBC 4G68C 4OQOA 4QHQA 4DDDA 2F8DA 4AB6A 4PQJA 3I5OA 4NF5A 4QFNA 5KZTA 4ZEKA 3VE1B 1MM7A 4PFYA 1VFDA 3TTMA 1RYXA 1EZOA 4KCCA 2P2AA 4UA8A 5IKBA 4ZZEA 1RYOA 2QSXA 4Q0CA 4XKNA 1SW4A 3PGFA 1QW0A 3UP9A 2XXPA 3UK4A 5H8QB 1A8EA 1GGGA 3FVNA 2OLBA 3SEYA 3MPKA 1D9YA 3CFLA 4O3BA 3RT8A 5ITOA 1JEUA 2OZZA 2A5TB 2HXWA 3T9VA 2REJA 2FA7A 5DYHA 3RUMA 3PMVA 5HM4B 3O28A 2UVJA 3BBRA 4DXCA 3HHGA 5IAIA 3CRBA 5CI5A 3K01A 1B6HA 3O29A 2XXYA 2G93A 4DXUA 3K6WA 1P1OA 3PUVE 4ELRA 1US4A 2DWIA 1XS5A 2PT1A 4O3CA 1SDXA 3FJMA 5FTIA 2O6AA 4WEDA 5JEIA 3FXUA 4TLMB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O1LA 4YKPA 4RK9A 4QRZA 2FBPA 4H45A 1ELJA 1MXXA 4XKQA 4ELQA 3ZSFA 2V84A 2HXRA 1NNTA 4MJOA 4EF1A 4G77A 3O97A 3B7DA 4QBAA 3W9VA 2THIA 2XA5A 3EHUA 4ZS9A 2QJEA 2GQ1A 4XF5A 2AYSA 4WXJA 3S9MC 4G8NA 1B3LA 3H03A 4MFIA 3UGWA 1RDYA 3F11A 5I57A 4ZEFA 1MY2A 4UABA 4ZEIA 1LCFA 4DIGA 2F7CA 2PVUA 1PDAA 2WX9A 1B5JA 1GV8A 1GTKA 4GX3A 3IFCA 3M3LA 4YICA 3ECRA 1OVBA 1RDZA 2O1MA 2HQ0A 4ND9A 1PB9A 5EYFA 3K1PA 2FIXA 3O6GA 1FBCA 3MQ9A 5KCJB 4HE1A 3MJNA 3U92A 1UTHB 5ICTA 3K00A 3CSGA 1FBPA 1MPBA 4FATA 4OFOA 3QXMA 4N4UA 4HTGA 4HE2A 4YB7A 3HV1A 2Y7PA 1USYH 3FASA 4MX6A 5A5XA 3M3FA 3PMWA 3IO6A 4GWUA 5EHSA 2Q89A 5ET5A 1FPBA 3E13X 2NVUB 3K2DA 3K6XA 1FQFA 1WDNA 2OCUA 3SEUA 3IAZA 3O9PA 3N6UA 2WBDA 3KN8A 3V89B 4N15A 4FEBA 2HZLA 1FCKA 1UIUA 3JV9A 4MEVA 1BLFA 4N17A 1KA1A 4G2ZA 4ELPA 3MZBA 4YKJA 4WKMA 4RJZA 4R6KA 4BDRA 4LP2B 4N07A 1NV2A 2XXHA 3KC1A 4E0WA 5LOMA 3PPQA 2QMWA 3S2VA 1N7XA 2WYKA 2F78A 1PBPA 1FRPA 3OD7A 2DVCA 2DS9A 3K1NA 4M4GA 2XX8A 4RA1A 5H8NB 5EQ9A 1Q35A 2VPNA 1NUXA 4O3AA 4PE5B 3HHFA 4GXSB 2CMOA 4IB2A 3S9LC 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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