2WKYA

Crystal structure of the ligand-binding core of glur5 in complex with the agonist 4-ahcp
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title The Glutamate Receptor Glur5 Agonist (S)-2-Amino-3-(3-Hydroxy-7,8-Dihydro-6H-Cyclohepta[D]Isoxazol-4-Yl)Propionic Acid and the 8-Methyl Analogue: Synthesis, Molecular Pharmacology, and Biostructural Characterization
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
total genus 82
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-06-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2wkyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2wkyA02
2RINA 2DE3A 4IO3A 2REJA 2ZNUA 1DPPA 3Q25A 3IOTA 3T9HB 1I69A 4TQUQ 4U2RA 1HSJA 3A3UA 2M8CA 3H6UA 4TLMB 3E4RA 3EF7A 3VXCA 4ELQA 1Z7ME 5I84A 3TAJA 4ZEBA 3IAZA 3SDFA 2GFEA 2Z23A 4RXLA 4N07A 1FTJA 1B5JA 3RT6B 1B05A 4XKNA 4FJPA 4H67A 3VLVA 4EF2A 3H3GA 3PGFA 3O29A 3TMGA 2Q9TA 4ZZEA 3MBPA 3UIFA 2B3BA 4TOZA 4JB7A 1MY3A 4IGRA 5H8HB 1MXVA 3EHSA 2DXRA 2H4IA 4YICA 2D21A 3VVFA 3S9LC 2X26A 4F2OA 3M3KA 3T66A 1NNKA 3QK6A 3KOTA 4NF4B 4UACA 4RNSA 2H25A 3UGWA 3WAEA 4L17A 2PT1A 4XTCQ 1DTZA 1Y9UA 1TWYA 1P1OA 1OIBA 4YKKA 2QS1A 5IAIA 4F29A 3FV1A 3DP8A 2DWAA 2V3TA 4IO7A 4DCXA 5ICTA 2XXHA 5EHSA 3OO6A 3H4ZA 3U8QA 2O1LA 5I2NA 3O6GA 2LAOA 3C32A 3FIRA 2O69A 3I5OA 1EU8A 3KN8A 1B46A 4R72A 5M2VA 4OVJA 3MJNA 5TPAB 1ZMGA 5H8FA 4IY5A 2F7BA 3QXMA 1EZOA 2V3UA 1IUDA 1D9VA 1RYXA 1R6ZA 1UIVA 3V89B 4IO5A 1Y1MA 2Q88A 4YKPA 2HAUA 5B7DA 3H06B 4EDPA 2YLNA 2ANJA 3CG3A 3ZKKA 4MF3A 1B2HA 3TQLA 1B3FA 1UTBB 5I58A 1OVTA 4DZ1A 1B0HA 3IK6B 4ESXA 1IXIA 3Q28A 2RCBA 3IJXB 3IOVA 2NVUB 2VD3A 1CB6A 2Z8EA 3MAMA 5DTBA 3FXQA 3FD3A 4FEBA 1GV8A 1F9BA 1SYIA 3IO4A 4ZEKA 1A8EA 3VE1B 1SVXB 3PMVA 4KR5A 3KEIA 1Y1ZA 1YCJA 4YAHX 1QUIA 2XX8A 4OERA 4R9FA 1JVXA 1TFAA 3C9HA 3IOUA 3K02A 1M5BA 4YKJA 4OMBA 5TU0A 4M4GA 3K1PA 2ZNSA 5HM4B 1MM6A 3MP6A 3RPWA 3RTWB 2UYFA 4POXA 5DVFA 4C0RA 2I0BA 3SETA 1TFDA 1B7HA 1T0KA 5DVJA 1Y3NA 4YB6A 4HCWA 1DMBA 4IB2A 2D5WA 4DXUA 1O7TA 4F3BA 4F22A 3ODBA 1US4A 1FQBA 5KDTA 3TUSA 3OEMA 4DXBA 1UQWA 2RC7A 4YZZA 3O66A 1SYHA 3LBSA 2O7UA 4EQBA 2RKMA 1PC3A 5CM6A 4EXLA 1PB7A 3UN6A 1N7XA 1MDP1 1UTHA 1H76A 4WEDA 4MLQA 1I6BA 2WKYA 2R6GE 3QAXA 2ESNA 3V5AA 3PUXE 4QFNA 4OFLA 3E9XA 3N6UA 5I2NB 1Y20A 1Q1KA 3T96B 2F6GA 1ZTYA 1A7LA 3OOAA 4RYAA 2I58A 1B52A 3GZGA 5ISUA 4RPNA 2Y7RA 3RGYA 3B6TA 2HQ0A 2Y7IA 1GGGA 2AL4A 3BBRA 5H8HA 3KBRA 4R6YA 3RY3A 3BFUA 1H44A 5F7VA 4EF1A 1MPCA 4KYEA 3W9WA 2Q2AA 4F1UA 2YJPA 2Q89A 1B7ZA 2OWTA 1B0LA 1WDNA 2XXXA 3FASA 4ZEDA 3Q29A 3U94A 4U1ZA 1N3XA 3LC8A 3T93B 5H8FB 3TTKA 4GD5A 4U21A 2YPNA 1PBPA 2ZXTA 1FW0A 2P2AA 3PUWE 3SEYA 4UA8A 4DCYA 3H6TA 4LA9A 4QHQA 1LBCA 3KZGA 1YTVA 1MXUA 2HFBA 1BTJA 2O68A 4IGTA 1NL5A 3ZS6A 4XKRA 2E1SA 2V3QA 5AA4A 2VHAA 4F1VA 3RQTA 3T9XB 2HXWA 3OSQA 4RK2A 2G93A 2P0SA 3MZBA 5I58B 4AB5A 1LAFE 2XXUA 3GLBA 5EHMA 4Q0CA 1FTOA 3UP9A 4U4XA 2F7CA 3FJGA 3ILTB 4LZ8A 2XX9A 3E13X 4G77A 4AQ4A 4ELPA 2F5XA 2DWJA 4THIA 5AA2B 3B6WA 4DIGA 3MWBA 5L9OA 4NF8A 1AH5A 3CFZA 3HSTA 1URDA 1JW4A 2PYYA 3F11A 4NEDA 2XD2A 3HHFA 3MVZA 2XXPA 4R9GA 4WEPA 4OWDA 2ZYMA 3VFJA 3KJTA 1MY0A 1A99A 3S9MC 2HEUA 1KWHA 1IXCA 4H0WA 2ZNTA 2DP8A 2XXQA 1MQJA 3KG2A 2QRYA 2GHBA 1N3WA 3AXFA 3FJMA 4I8CA 4I1DA 4HTGA 1HSLA 1FQAA 2OLBA 3KN7A 1SDXA 1XVXA 5KDTB 1Y3QA 3DM0A 4XKPA 3U93A 1FCKA 3S2VA 2I4BA 1B5HA 2ABHA 1B6HA 2CMOA 1JW1A 1P1WA 1GVCA 1MH3A 4PETA 4GVOA 1POY1 3G3JA 3IO6A 2G29A 3FXRA 1VE4A 3LR1A 2QMXA 1UTHB 1OLAA 1B3LA 1QKBA 4F1YA 1Y3PA 4QFLA 4P0GA 4GQOA 1LAHE 1S7YA 4PFYA 4LATA 2ONSA 4H5FA 3DP6A 3G3GA 1R1NA 2CZLA 3FVOA 2THIA 3K6VA 2P1SA 4OEUA 4BDNA 3CSBA 3UA8A 4PFTA 5H8QB 3I3VA 3OO7A 1OVBA 3M8UA 4FAJA 1A8FA 1FQCA 2ZYOA 5HBCA 1NMUA 3PMWA 2DE2A 1A55A 5I56A 2F36A 3MW0A 5IKBA 3K2DA 4Q30B 4GRKA 1O63A 1B32A 4U22A 1JEUA 1MPBA 2A5TA 1MQIA 5JEIA 1MQHA 1EZPA 1M5CA 4YMAA 2O1MA 3O28A 1ATGA 2H9BA 1HSEA 1MY1A 1BKAA 5AA4B 2UVGA 3K4UA 4BDRA 4NWCA 5TP9A 4BDOA 3ONMA 2NXOA 4H65A 4YB5A 1II5A 4EUOA 5AE4A 1BIYA 1VR5A 2R71A 3SEUA 1SW2A 1Z7NE 3H6WA 3D4GA 3IB1A 3MUQA 1NFTA 2XXVA 2Z22A 4OYVA 4NF8B 1FTMA 3IJOB 4JWYA 3OELA 3C34A 3UK4A 3LSXA 1Y4TA 4NWDA 1SI0A 5JK4A 2HCAA 3R26A 5CMKA 1B3GA 2GHAA 1M5FA 4O3CA 2XXIA 3TKDA 3C35A 5CC2A 1H3DA 3CFLA 1TT1A 1N04A 1R9LA 3QSLA 1MXYA 3PPRA 4JDFA 2VD2A 4ESWA 4YMBA 3G7WA 3PPNA 2X7PA 1BLFA 1B9JA 5AA2A 1WVJA 1PBQA 1SD3A 2I6EA 2I0CA 2PMSA 5CBSA 3GXAA 1FQFA 5H8NA 4M1VA 3L6GA 3A3CA 1NH7A 4BLAA 4JXIA 4FE8A 5L8DA 2I3VA 4WKMA 3OO9A 4Q5TA 2XD3A 1MG1A 4LP2B 3IB2A 4E0XA 1GTKA 4ONYA 3EQ1A 4HS7A 4R2FA 3JZJA 2Y7WA 3TEPA 3ECRA 1JW5A 5CBRA 4X1BA 3EHTA 1ZKBA 5BWJA 5I2KA 4FIMA 1FQEA 1OLCA 4KYSA 4H1XA 1Q35A 1VFDA 4Z0IA 2Z8DA 1N0TA 4EXKA 1LFHA 3MC2A 1JNFA 1FQDA 3VVEA 2D3IA 5I59A 1XT8A 2REGA 5BUUA 3C33A 3FGSA 2DVZA 2O6AA 5I56B 3G3FA 4PFUA 4OFOA 1MQGA 2HAVA 1MY2A 1B5IA 3K1MA 1VSOA 3K6XA 4U1OA 1LBBA 3PMXA 3RLFE 3A09A 4GIZA 3RTFB 4I62A 2A5TB 3HO7A 3TCGA 4ISUA 4GXSB 5A5XA 3KSXA 3HCQA 3PD9A 5KZTA 4P11A 2PBWA 1AIVA 1PEBA 3FVKA 4I9DA 4KD5A 4LQ5A 1RYOA 3QIMA 3LUYA 4LZ7A 1POTA 4QF9A 4C1TA 3LSLA 4GXAA 5TP9B 2QMWA 3JV9A 2QJEA 4H5GA 4KFQA 1H43A 4F19A 5H8QA 3PUYE 3TCHA 3PPOA 5LOMA 4FEDA 3IB0A 3ILUB 4F18A 4G8MA 3T9UA 2GH9A 4RJZA 5CMCA 4RA1A 3M3LA 1UIUA 1A40A 1A54A 3EPEA 1NNFA 3O2AA 1CE2A 4ZE9A 1LB9A 1ELJA 4F3SA 3OENA 3K01A 1LB8A 1SQYA 4F2QA 2DXYA 3EN3A 1MPDA 2XXWA 3DLNA 4ZDMA 3BKIB 1GR2A 3W15C 3I6VA 3GBBA 1LAXA 3SEVA 3TPAA 4JWXA 1N84A 1DPEA 1MXXA 4X1DA 1B3EA 2OWSA 4KI0E 4TLLB 1IITA 3FV2A 1MM7A 4OENA 4ND9A 4F31B 3PPQA 3CFXA 3TFLA 2V93A 4DDDA 4YKIA 5L9MA 1VFEA 4G2ZA 3FVGA 1QKAA 4GL8A 2I49A 4XXUA 1FTKA 1XVYA 3H7MA 4NF6A 4EQ7A 4F3GA 4ZEFA 4AB6A 3PD8A 3TQWA 3U1OA 4R74A 3B7DA 2H5YA 2X7QA 3PV0E 1USYE 2O7IA 3TYHA 1MDQA 1ANFA 1SW5A 1LAGE 2I48A 3MZ9A 3PUVE 5H8NB 4OZ9A 3VV5A 3E3KA 3FXUA 4QFOA 4DE8A 5AA2D 3RNNA 5CI5A 4ZZAA 4G68A 3U72A 3Q27A 2NOOA 4R6HA 3C31A 4DLDA 4YB7A 2DE4A 4G4PA 2DYXA 1D9YA 3O6HA 5HPQA 1D3KA 3MZ1A 1B40A 4BDQA 1P99A 3N94A 4F39A 2ALUA 5ELVA 4RK9A 3K0VA 3LSWA 2B65A 5I2KB 2VOZA 1B51A 1QUKA 3S9NC 1XC1A 3OSRA 4KQPA 3O97A 4U23A 2A5SA 4G8NA 1M5EA 1WODA 5I59B 4N6PA 3N6TA 3T9VA 4IO4A 2UVHA 3T22A 2FNCA 3IOWA 1NH8A 4JSOA 3VLUA 1P1UA 3W9VA 1H45A 3TTRA 2Z8FA 4GWOA 2H98A 3R7XA 3V8XB 5FHNA 5A5XB 3LSFB 3SEWA 3TTLA 3VXBA 2HZLA 1OQGA 3OMBA 1XHYA 3OXNA 1AMFA 1B1XA 3KGCA 2VGQA 5ITOA 2V25A 5DEXA 1JVYA 2F6PA 1N76A 4FATA 3ZSFA 2PT2A 1L5TA 1P1NA 3VLWA 2GRVA 2FA7A 4HCYA 1QVSA 3THIA 3MVWA 3IL1B 4IO6A 4R75A 4Z7EA 5ICQA 1B3HA 4KPTA 1O64A 4RPOA 5DT6A 1XOCA 1IZ1A 3G3KA 5FHMA 5I57A 3DP4A 1JEVA 1SBPA 4NF5A 3QUJA 2O51A 5CMBA 4BDMA 3CR9A 3HHGA 1QUJA 1ZBMA 2UVJA 1LSTA 1N7WA 1NNTA 3O6IA 2XXRA 4WXJA 4H8JA 4MBPA 3MP1A 1YAEA 4PE5B 2RC9A 3IX1A 5KCJA 3G3HA 2R9JA 3TELA 3CG1A 3S9EA 4LUBA 3PU5A 4LONB 1B4HA 5AA1A 4KHZE 1MY4A 4JWOA 4GL0A 2QS2A 4NF6B 4ELRA 1ZU0A 2RF1A 1R9QA 2DVCA 2OBGA 3D4CA 1M5DA 4DXCA 2W7YA 3HN0A 3O9PA 1PB9A 3N5LA 2RC8A 4ZEIA 5EYFA 3BFTA 2AL5A 4G68B 3IR1A 4MH5A 4G8HA 1EH3A 4FECA 3USDA 3GBAA 3KFMA 4R2BA 3G3IA 1OMPA 2HZKA 4KYDA 2F7AA 3FJ7A 5J1DA 5B70A 3DELB 3N26A 2DSFA 1IEJA 2E0SA 2XXTA 3Q26A 2DWIA 4QFPA 3FATA 1ZIUA 5K2XA 1PB8A 4GOTA 2AYSA 1DTGA 1MXZA 4IO2A 3MPKA 3TODA 4OESA 2B3FA 4QFKA 4H8IA 3IORA 3FUZA 1B7UA 4PQJA 3PPPA 1YPNA 2OZZA 4OETA 4ECFA 1MRPA 2AIXA 1IIWA 2XHDA 3HPIA 1FTLA 3TDJA 2I4CA 3K1NA 3FVNA 1USYH 4X48A 2Y84A 4P0IA 1I6AA 1QJMA 4C1UA 1RKMA 3K6UA 3SKPA 5DEXB 3K00A 3UORA 4ZECA 5F1QA 3KSJA 3V83A 3MQ9A 1DOTA 3HV1A 3JYRA 3FZVA 2F97A 3CVGA 1QW0A 1I6QA 4Q8RA 4LQ2A 4MLVA 3M3FA 3MPLA 4IY6A 5JTYA 1NNPA 4OHNA 1P1QA 5DVIA 1URSA 1AL3A 2ONRA 2ONKE 4NE4A 5I57B 2DWHA 2XXYA 4RY1A 3RT8A 4NF5B 4NMYA 1DSNA 1SW4A 2ZYKA 2Q8JA 1LLSA 2I3WA 2VP1A 1MH4A 3H03A 3ZKLA 1LGBC 3MP8A 4KCCA 2KLFA 5AA3A 4O3BA 1MS7A 4OQOA 4X9TA 5FHOA 2FYIA 4YU0A 1EZ9A 5CMMA 2F35A 2OJTA 4LZ5A 2Y7PA 2QPQA 1AOVA 5KCJB 1US5A 2Q2CA 4XKQA 2Y7KA 4QSEA 1SW1A 2UVIA 1J1NA 3OD7A 4N13A 2XX7A 2OCUA 1OQHA 1SI1A 2ZMBA 3KOSA 4OEVA 1B4ZA 2UXAA 4BDLA 3C4MA 1IXHA 4ZS9A 4QSCA 2IA4A 3RN8A 2QS4A 3WAFA 3QUFA 4NF4A 5CRYA 5K2YA 2PVUA 4U4SA 3TTMA 3RUMA 3KN3A 3R6UA 3L6HA 3OO8A 3TZAA 4E0WA 2O84X 5FTHA 4GFRA 3VVDA 4QRZA 4LVQA 2DS9A 2F8DA 2V84A 3TTNA 1LCTA 1XS5A 4H6DA 2NWJA 1TXFA 4R73A 3CI8A 1LCFA 1B58A 1MQDA 4R6KA 1LFGA 3H6VA 2DQVA 4FORA 4MFIA 4GLIA 5H8SA 2F78A 5DYHA 3C36A 4JBZA 3B6QA 4POWA 4OXVA 4NTLA 4ZE8A 4O3AA 1D4NA 3P7IA 2OK2A 4K3FA 1JQFA 4XIGQ 1LFIA 4EQ9A 5FTIA 3EHUA 2QL3A 4OTEA 3SEXA 1URGA 5TPAA 1S50A 3S4UA 2DOJA 3CRBA 4JSDA 3QYTA 2QSXA 3U92A 2ZYNA 3OEKA 2QS3A 3CSGA 1IQ7A 3VDFA 1IXGA 4HW8A 1ZLQA 4G68C 2IEEA 1Y4CA 1BP5A 2BJJX 4GF8A 1ZJLA 4PFWA 1MXWA 2RCAA 2PX1A 4F3PA 1S9TA 5L9SA 2H99A 3SESA 4ELOA 3TCFA 3MVXA 1JETA 1NKXA 3K6WA 1UTBA 2UYEA 1PDAA 3MVYA 5ITPA 2NUVA 3PUZE 3CIJA 4OFJA 4KCDA 1QULA 4QSDA 5JTYB 3KJ7A 2F34A 4PP0A 1B1HA 3SERA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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