2X26A

Crystal structure of the periplasmic aliphatic sulphonate binding protein ssua from escherichia coli
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
SPEALRIGYQKGSIGMVLAKSHQLLEKRYPESKISWVEFPAGPQMLEALNVGSIDLGSTGDIPPIFAQAAGADLVYVGVEPPKPKAEVILVAENSPIKTVADLKGHKVAFQKGSSSHNLLLRALRQAGLKFTDIQPTYLTPADARAAFQQGNVDAWAIWDPYYSAALLQGGVRVLKDGTDLNQTGSFYLAARPYAEKNGAFIQGVLATFSEADALTRSQREQSIALLAKTMGLPAPVIASYLDHRPPTTIKPVNAEVAALQQQTADLFYENRLVPKKVDIRQRIWQPTQLEGKQLEFRVPGNENLYFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of the Aliphatic Sulfonate-Binding Protein Ssua from Escherichia Coli
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords PERIPLASMIC ALIPHATIC SULPHONATES-BINDING PROTEIN
total genus 99
structure length 308
sequence length 308
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF09084 NMT1 NMT1/THI5 like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2x26A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2x26A02
3IR1A 2F8DA 5CBSA 1VR5A 4KYDA 4F39A 4XKRA 3TTNA 4IO7A 3TELA 5KCJB 3SKPA 3OSRA 2DQVA 3O2AA 3B6TA 4GXAA 1M5CA 3MZBA 3H03A 2XXPA 4LZ8A 1H45A 3B6QA 5F1QA 4E0WA 4KHZE 3SEUA 1AOVA 4TOZA 2REJA 1ZJLA 4DCXA 1ZLQA 4ZEBA 2UXAA 5AA4B 4PFTA 2XX7A 2GRVA 4GF8A 3FVOA 1VE4A 1Y4CA 4PP0A 1UTHA 2ONRA 1DTZA 1KWHA 4IGTA 3IOWA 1YAEA 2F97A 5ICTA 4LZ7A 3RTFB 4GWOA 2F7BA 1Y3PA 4R6HA 2O84X 3OO9A 4EQ9A 3CIJA 4MH5A 3H6WA 3RNNA 1B5IA 3N6UA 2P0SA 2D5WA 4X1DA 5AA2D 2GFEA 1ZU0A 5CBRA 3OMBA 4R6YA 3V89B 1SW4A 3TZAA 2Z8FA 3PUWE 1N3WA 3GLBA 3BFTA 1M5EA 4G68B 3HCQA 3PU5A 3KJTA 4NF5B 5JK4A 1FCKA 4EUOA 1I6AA 3K4UA 4IO6A 5B7DA 4F2QA 5EHMA 2I0CA 4KD5A 3Q25A 4ISUA 3TQWA 1LGBC 5I2KA 1L5TA 2XHDA 4X9TA 2F34A 4MF3A 1TT1A 2I4BA 5DVIA 2XXUA 5FHNA 4FE8A 4F3PA 1R1NA 4DCYA 1DSNA 1M5FA 1B5HA 1TWYA 2O51A 4WEPA 1O7TA 3G3JA 4RNSA 4ESWA 3C34A 3OELA 4FIMA 4GOTA 2F35A 3TTLA 1MXWA 1A7LA 2E1SA 3IK6B 4NF4B 5KDTB 3FV2A 5AA1A 1FQFA 3MC2A 3B7DA 4EXKA 4F31B 1UIUA 4Q5TA 1RYOA 3SEVA 3WAEA 4RK2A 4DDDA 4KYEA 3G7WA 2ZXTA 1MS7A 4GQOA 3O66A 4OFJA 2O68A 1TFDA 1MY3A 4F1UA 4IO5A 3R26A 3H06B 5FHOA 4QFNA 4GL8A 3PUZE 3THIA 4TLLB 2IA4A 2UVJA 1UTHB 2FNCA 1QJMA 1QVSA 1B46A 4GFRA 1O63A 5DTBA 5CMKA 1MM7A 1WODA 4M4GA 1ELJA 3PPRA 4JWYA 4YB5A 4OZ9A 4QHQA 3AXFA 2Y7WA 1NNPA 3QK6A 1CE2A 1FQBA 2I49A 1USYE 4PFUA 4RK9A 3R7XA 3RLFE 1JW4A 3LSLA 4PE5B 1A40A 4HW8A 4MLVA 1Q35A 1B4HA 4FAJA 5JEIA 1DTGA 1MQDA 2O6AA 3IOUA 5I59A 1F9BA 1M5BA 2H99A 3CR9A 1DPEA 3GBBA 4KPTA 3O97A 1B3LA 4ELPA 4U1ZA 5JTYA 1OQHA 3W9VA 3OO8A 4H5FA 2R6GE 2DWAA 3IX1A 5I2KB 5IAIA 4DXCA 4KYSA 3FVNA 1MY1A 3TCHA 3CG3A 3LSWA 2DE2A 1LBCA 3HHGA 4ZDMA 4E0XA 2GHBA 4OENA 1ATGA 5ITOA 1B2HA 4R72A 1IXHA 3CFZA 1B0HA 1FW0A 4JSDA 4R9GA 3SETA 2DVCA 1P1OA 3V8XB 3MVWA 2DXRA 2Y7PA 4YZZA 3HV1A 4ZS9A 4K3FA 2OCUA 2VP1A 2UVHA 1GTKA 1B3HA 1B58A 3Q26A 2DWHA 5DVJA 4G4PA 1EH3A 2OK2A 1H43A 2VHAA 2B65A 2AL4A 1OQGA 1LCFA 3VVFA 5I58A 2O7UA 3KFMA 3H7MA 3IORA 1ANFA 1LB8A 2QJEA 1LFHA 2O1MA 4GXSB 1OVTA 3C9HA 3ONMA 4ZZAA 2Y7RA 1JVYA 1B4ZA 3QUFA 1AL3A 3F11A 3IO4A 2RCAA 3KOSA 3MVZA 1MXYA 1PB8A 3MBPA 2OWTA 3TAJA 4GL0A 4X1BA 1XHYA 1NNTA 1H44A 4O3BA 5DEXA 2I58A 1FTKA 3W9WA 4H6DA 3KG2A 2UVGA 1AIVA 3MVXA 3O9PA 4KR5A 2HCAA 4BDRA 4F2OA 1QULA 1SI1A 4U21A 3K6WA 3GZGA 2NVUB 5I59B 2XXTA 3KSXA 1N84A 4MLQA 3VXBA 3KEIA 4I62A 3I5OA 3G3IA 2V84A 3IB2A 4KQPA 3UK4A 1TXFA 2GH9A 3ECRA 1SW2A 3OEMA 2F78A 4ESXA 3MW0A 2P2AA 4JBZA 5I84A 1BKAA 5H8HA 1EU8A 4XKQA 2DOJA 1DOTA 4U4SA 1B52A 2HFBA 3N94A 3SERA 3PMWA 4DZ1A 2DWIA 4XIGQ 3N26A 2Q8JA 5HPQA 3E9XA 4JXIA 1ZTYA 3TYHA 1POY1 2PYYA 3TODA 2ANJA 3OENA 1ZKBA 1FTMA 4JWXA 2DSFA 3HN0A 4JSOA 4TQUQ 4G8NA 3OD7A 5AA2A 4EDPA 4R2FA 4RPNA 4LUBA 1MQJA 1NNKA 1MY0A 1Z7ME 4JDFA 2AL5A 1AH5A 1XS5A 2Z8EA 3S9EA 4NF6A 4NEDA 5I58B 3MP6A 4U23A 1IXCA 3H6UA 5FTHA 3IJOB 4IGRA 2QPQA 1MQHA 1ZIUA 1SQYA 4YKKA 4RY1A 2YJPA 1BTJA 3FIRA 3H4ZA 3VFJA 5H8FA 3FGSA 3FJ7A 2F5XA 5HBCA 2R9JA 5L9SA 5L9MA 3C33A 3T93B 1MPBA 3VDFA 4G77A 2H5YA 4R2BA 1P99A 5I57A 4OWDA 2Y7IA 1DPPA 3K01A 3MQ9A 3FV1A 5DEXB 3TFLA 4Q30B 3G3KA 3IB1A 1P1QA 4C1UA 3RY3A 2XXVA 3SEXA 4KI0E 2HEUA 2Y84A 4GIZA 4ZEKA 3MVYA 3FZVA 1JEUA 1S9TA 4H5GA 4ELQA 2IEEA 4YAHX 2H9BA 4XTCQ 1MRPA 3S9LC 4ECFA 2OBGA 1MPCA 3K6XA 1D9YA 4FEBA 2XXHA 5H8SA 5CMCA 2ZNUA 4G8MA 1SYHA 3T9HB 4F1VA 5H8HB 1P1WA 1P1UA 4UA8A 4OERA 3MUQA 4Q8RA 2FA7A 3K1PA 5EHSA 3RGYA 2OLBA 3IB0A 4F3BA 1LLSA 4NTLA 1RYXA 3TUSA 2RCBA 4M1VA 4ZECA 4EF2A 4BDOA 2G93A 2UYFA 4I9DA 2XXYA 3B6WA 3M3FA 3OO7A 3CRBA 4X48A 5H8NA 3TKDA 3EPEA 5ITPA 1XT8A 4H65A 3I3VA 4R6KA 1OLAA 3VVDA 3EN3A 4ZEDA 1US5A 1R6ZA 2DP8A 4O3CA 1Y3NA 1GR2A 4NF6B 2DWJA 4QFKA 1IQ7A 1LAGE 3KJ7A 1TFAA 1FQAA 2QS3A 2ZYNA 3EQ1A 4BDNA 4RJZA 1NMUA 5H8FB 2QS2A 4NWDA 3QUJA 2QS1A 1SW5A 1A55A 1LSTA 2QMXA 2I3VA 1N76A 2PVUA 3O6IA 1MXUA 3S9MC 5KZTA 3RUMA 1J1NA 1EZ9A 1GVCA 5I57B 3SEWA 1DMBA 4RXLA 5A5XA 4RPOA 1OLCA 3DLNA 4XKPA 2F36A 3O6GA 3S4UA 3HPIA 3PPPA 3PPOA 5I56A 1B1HA 1OVBA 4WKMA 2X7PA 4ZE8A 1MXXA 3KN7A 4QSEA 3Q29A 3OSQA 1B3GA 4F29A 1FQDA 3T9VA 3C4MA 3FATA 1MQGA 3IJXB 3K2DA 3H6VA 1LAXA 4EQ7A 4C1TA 3MPKA 2YLNA 4P11A 4OXVA 1FTLA 3OO6A 1GV8A 4G2ZA 3ZS6A 2A5TA 1MQIA 4IY5A 1MDQA 1QKAA 2Q88A 4WEDA 1N04A 4HS7A 4OYVA 4QRZA 3UIFA 4H0WA 1FQEA 3FJMA 2QRYA 2RF1A 2NXOA 1HSEA 4DIGA 4BLAA 4NMYA 1POTA 5TP9A 5H8NB 4QFPA 4P0IA 4U2RA 2ZNSA 3T9UA 1FQCA 4GRKA 1R9LA 5AA3A 2XX8A 3WAFA 3V5AA 4I8CA 2V3TA 2Y7KA 4UACA 2Z23A 3U93A 3K0VA 1PC3A 5CRYA 2P1SA 3ZKLA 1US4A 5KCJA 3Q28A 3UORA 2I4CA 1NKXA 2Z8DA 3BFUA 4KCDA 1PBQA 1BIYA 3I6VA 3ILTB 1I69A 5CMBA 3M3KA 3N5LA 4P0GA 3T22A 5AA4A 4YKPA 2I0BA 1XC1A 3FVKA 5H8QA 1Y1ZA 2XX9A 5TPAA 3T9XB 1B51A 1MXVA 4R74A 3VLUA 3EHSA 3JZJA 3LC8A 5F7VA 4ONYA 2YPNA 2UYEA 1LFIA 3QAXA 4EXLA 5A5XB 3PUVE 1VSOA 3KSJA 5HM4B 3GBAA 4OVJA 4QSDA 2REGA 3DM0A 1IIWA 1PDAA 3HSTA 3MZ1A 2DS9A 5I56B 1H3DA 3GXAA 2QMWA 1SW1A 3VLWA 4TLMB 1BP5A 1NH8A 4XKNA 2M8CA 1YPNA 3OXNA 4N07A 1OIBA 1QW0A 2F6PA 4F18A 3C35A 2Q2AA 4H8IA 2ZYKA 2CZLA 3S9NC 4PFWA 2ONKE 5JTYB 1FTOA 3ZSFA 3M8UA 4GD5A 3LSXA 1URSA 4H8JA 4R9FA 1LB9A 3TCFA 2A5TB 1Q1KA 2KLFA 1FTJA 2DE4A 3IOTA 2VD3A 1IXIA 4LQ5A 1LCTA 1A8FA 2H4IA 1B3FA 2ZYMA 3RTWB 4THIA 1LFGA 1UQWA 2R71A 3E3KA 3USDA 3U72A 5BWJA 1JNFA 4N13A 4YMBA 2V93A 1IZ1A 2XD3A 4U22A 5TP9B 3TCGA 4OFOA 1JEVA 5CM6A 2D21A 3QXMA 4LQ2A 1O64A 4YICA 2F7AA 1B9JA 4C0RA 2V3QA 4QFLA 3PV0E 4O3AA 1Y9UA 4MBPA 4XXUA 2QS4A 1B7ZA 3UN6A 3FVGA 4R75A 3U94A 1MPDA 3U1OA 3RN8A 2XXRA 3CVGA 2G29A 3S2VA 1HSLA 1AMFA 4AB6A 4PQJA 3KOTA 2AIXA 4ZEIA 1MXZA 3JYRA 1MY4A 4KFQA 5H8QB 2VGQA 5TPAB 2PT1A 2HAVA 2OWSA 2Z22A 4BDLA 1N7XA 2ONSA 1Y20A 3EF7A 4FORA 5J1DA 2XD2A 5I2NA 1CB6A 2NOOA 4G8HA 3QIMA 2OZZA 3H6TA 1NL5A 1I6BA 3ZKKA 3ILUB 4NE4A 2DXYA 2X7QA 4ZE9A 4IB2A 3E4RA 4L17A 5K2YA 1B3EA 2PBWA 4IO4A 1IUDA 3KZGA 3HO7A 4DLDA 3VV5A 4DE8A 4H1XA 3CSGA 2O1LA 1SBPA 3O29A 3EHTA 3PMXA 3MP1A 3CG1A 5FHMA 2ALUA 3G3FA 4I1DA 4AB5A 4YKIA 3DP4A 5L8DA 1QUJA 3TTRA 3LUYA 4RYAA 3PUYE 3FUZA 5CI5A 2XXXA 1A54A 4LP2B 4FEDA 4WXJA 5DT6A 1B05A 4YB7A 3LBSA 4NWCA 4IY6A 2DYXA 4HTGA 1ZMGA 1LAHE 2Q9TA 3LSFB 4JB7A 1B6HA 1B7UA 4IO3A 4F1YA 3KBRA 1EZOA 4EF1A 1MH3A 3IAZA 3BKIB 4F19A 3KGCA 2QSXA 3VE1B 3IO6A 3TEPA 3FXQA 1JW1A 3EHUA 5AA2B 1Y3QA 4OEUA 4MFIA 3P7IA 4F3SA 3CFXA 1OMPA 3FJGA 4OHNA 4N6PA 2BJJX 5M2VA 4LONB 2PX1A 2HZLA 4RA1A 4EQBA 1N3XA 3N6TA 1SYIA 4OTEA 3L6HA 1B5JA 4H67A 4LA9A 2O69A 3RT6B 3K1MA 2GHAA 2O7IA 2F6GA 3A3CA 3D4CA 5FTIA 4F22A 1UTBA 1Z7NE 2RC8A 4LVQA 1HSJA 3MWBA 1D3KA 3VVEA 5CC2A 2X26A 3FASA 1JVXA 2D3IA 1N7WA 3U8QA 1MG1A 1EZPA 1SDXA 4POWA 2AYSA 1LAFE 4HCYA 1B7HA 2Q2CA 3E13X 3QYTA 3C32A 4OETA 4OEVA 5I2NB 3U92A 4QSCA 4R73A 1ZBMA 3LR1A 1R9QA 3PD9A 1QUIA 3OEKA 2H98A 3FXUA 1URDA 3SDFA 2LAOA 2XXWA 1JQFA 1NH7A 1M5DA 4ZEFA 3RT8A 1A8EA 1NNFA 3KN3A 4YB6A 2OJTA 4ZZEA 4BDMA 5IKBA 3G3GA 2Q89A 3HHFA 3H3GA 1SD3A 1VFDA 1S7YA 3A3UA 4PFYA 4OQOA 1D9VA 2A5SA 2PT2A 4OFLA 1UIVA 3MZ9A 5ICQA 1PBPA 1URGA 3MP8A 3L6GA 3PGFA 2HQ0A 5K2XA 3SEYA 2QL3A 3TTKA 2ZYOA 2NUVA 4G68C 1IITA 4F3GA 1MDP1 1YTVA 1B0LA 2DVZA 4OMBA 3T66A 5LOMA 4JWOA 5B70A 3C36A 1QKBA 3PMVA 4FECA 3PD8A 5DYHA 1B32A 4NF8A 2ESNA 1D4NA 4Z7EA 4YKJA 3TQLA 3UP9A 3TDJA 3D4GA 5ELVA 4KCCA 5DVFA 2RC9A 3G3HA 3PPNA 4FJPA 4DXUA 4Z0IA 1IEJA 3DP8A 3K6UA 5CMMA 4QF9A 1N0TA 1IXGA 4Q0CA 2DE3A 2NWJA 4DXBA 1VFEA 3OOAA 1PB7A 5ISUA 1RKMA 3M3LA 3CFLA 3JV9A 1SVXB 4POXA 2V3UA 4OESA 4YU0A 4LZ5A 3A09A 2H25A 4PETA 1B1XA 2WKYA 3CI8A 3K6VA 3DP6A 3K1NA 1SI0A 4GLIA 1UTBB 2V25A 1GGGA 3V83A 2ABHA 2PMSA 3PPQA 3FD3A 1LBBA 2HAUA 5EYFA 1JW5A 4GVOA 3UA8A 3IOVA 4QFOA 4BDQA 1II5A 4ELRA 1BLFA 4FATA 2I6EA 1Y1MA 3QSLA 3VLVA 3PUXE 1Y4TA 5TU0A 3MPLA 2B3FA 4U1OA 3TTMA 2FYIA 3TPAA 2THIA 1PB9A 4HCWA 4AQ4A 1B40A 2W7YA 1XOCA 3FXRA 3MJNA 1USYH 1MY2A 3O28A 1PEBA 2XXIA 1NFTA 2B3BA 2HXWA 2RINA 3RQTA 3R6UA 5AE4A 2VD2A 3VXCA 1XVYA 2F7CA 2ZNTA 1MH4A 1MM6A 4G68A 3CSBA 3T96B 3BBRA 3IL1B 4ELOA 3C31A 2CMOA 1WVJA 4NF5A 2I48A 1H76A 1WDNA 3DELB 1QUKA 5L9OA 1S50A 1I6QA 3MAMA 3K02A 2HZKA 4NF8B 4YMAA 2RKMA 3O6HA 3RPWA 3UGWA 1XVXA 2XXQA 4ND9A 1T0KA 1A99A 1YCJA 3TMGA 4LATA 3ODBA 1P1NA 4IO2A 2VOZA 5BUUA 2UVIA 3Q27A 1JETA 3K00A 2E0SA 3W15C 3SESA 4NF4A 2RC7A 2ZMBA 5KDTA 4U4XA 2I3WA 3KN8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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