2XX7A

Crystal structure of 1-(4-(1-pyrrolidinylcarbonyl)phenyl)-3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1h-indazole in complex with the ligand binding domain of the rat glua2 receptor and glutamate at 2.2a resolution.
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Integration of Lead Optimization with Crystallography for a Membrane-Bound Ion Channel Target: Discovery of a New Class of Ampa Receptor Positive Allosteric Modulators.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xx7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xx7A02
2O51A 3HHFA 2QPQA 3B6QA 4GWOA 3C4MA 3H3GA 4AB6A 2DWAA 5JEIA 1LBBA 2OLBA 5ITOA 1MRPA 2F8DA 4YKJA 2NOOA 4G4PA 2PBWA 1ZTYA 3MJNA 3LSFB 3FXUA 4G8HA 1P1OA 2H98A 4OFLA 4KHZE 4U22A 5I2NB 4ZS9A 1RKMA 2RCBA 1YTVA 3H6UA 5F7VA 4KYEA 5FHOA 4X1DA 4DXBA 3MUQA 4DCXA 1H45A 4EUOA 4BDLA 5H8NB 5DYHA 4POWA 3A3CA 5EHSA 2OWTA 4MFIA 3C36A 1MQDA 1MY2A 1TXFA 3K1NA 1Y1MA 1A7LA 5EYFA 1N3WA 2O1MA 2ZNTA 3ZS6A 4GF8A 1MY0A 4U4XA 4U1ZA 4R6KA 3R26A 2Q89A 2AL4A 2FYIA 4GXAA 4TOZA 3ECRA 3VXCA 1USYH 1EZPA 3ODBA 4OHNA 3TCHA 3VLUA 3CSBA 3TTNA 1D9VA 2GRVA 2QMWA 4H5GA 4ONYA 2XXTA 4RJZA 3TPAA 2QRYA 1EU8A 4F2QA 2Q88A 2Q9TA 3G7WA 3SEYA 5L8DA 1USYE 3Q25A 1MXVA 3QIMA 3IX1A 1PB9A 1DMBA 3DM0A 3K2DA 4G2ZA 5A5XA 4TQUQ 3E4RA 5DEXA 1B3FA 4R2BA 2ZNSA 1NNPA 3FZVA 1SW4A 3FUZA 3TODA 1A40A 4BDNA 1NNTA 3KG2A 4F18A 1SW2A 4FEDA 2RC7A 1US5A 1SW5A 2IA4A 1ZKBA 1YAEA 1FTKA 3PU5A 4LP2B 1IUDA 4FATA 3CFLA 3OXNA 3D4GA 5ICTA 3VVEA 3B6WA 3VV5A 4TLMB 1JEVA 4NF6B 4ZEDA 2UXAA 2VD2A 3TDJA 1ZU0A 3G3IA 3USDA 2HEUA 2Y7PA 1O7TA 3FIRA 1ELJA 2DXYA 3RTFB 3LC8A 2O7UA 2Y7RA 2Y7KA 1Y20A 3OD7A 4H0WA 3MC2A 3IO4A 4F3PA 2A5SA 2DVCA 3LSLA 2VOZA 4E0XA 4IB2A 2PVUA 1NNFA 1Y4CA 4HCYA 4RY1A 4G68C 4ZZAA 1A8EA 2R71A 2ALUA 4JXIA 4F1YA 5I56B 1NMUA 1GV8A 3QK6A 5I2KB 3CIJA 3G3KA 1IZ1A 2DVZA 1B3HA 3PUXE 1POY1 4OMBA 4O3AA 2QSXA 4ESWA 1LSTA 5KZTA 3N6TA 2O6AA 1AIVA 4EQ9A 2XXWA 4H1XA 4GL0A 4X9TA 3FVOA 2UYEA 4EXKA 3LSWA 5H8HB 4GFRA 2H25A 4DXCA 3H06B 3RN8A 5BUUA 1JW1A 3MZ9A 4DE8A 1WVJA 3O6IA 2V3QA 3HSTA 3S4UA 3MZ1A 1US4A 2OZZA 3OO9A 4R6HA 2G93A 3K6WA 4I8CA 4OETA 4KCCA 1MQIA 4X1BA 4YKPA 1FQCA 2D21A 1S7YA 2F7CA 1YCJA 4R75A 1B40A 3T93B 1JEUA 3PGFA 1FTMA 4LA9A 5FHNA 2OWSA 3D4CA 3O6GA 3MP1A 3QYTA 5HPQA 4ZEFA 3PUYE 4OESA 1FQFA 4U2RA 3SERA 3VDFA 2XXRA 3K4UA 3DP8A 1Y3QA 3HPIA 5L9SA 3IJOB 3JZJA 4H67A 4XXUA 2XXPA 3RUMA 1P1NA 1LB8A 3MZBA 2XXYA 1UQWA 1R6ZA 3BKIB 4BDOA 3TKDA 1JW5A 3SEXA 2HXWA 2H99A 2V3UA 3G3GA 4L17A 1NH7A 3SDFA 4F31B 4GVOA 2Y7IA 2ZYNA 3K1PA 5JTYB 1A55A 4BDQA 4POXA 1B0HA 1MQGA 4H65A 3E13X 4R6YA 3IORA 4MLQA 5DVIA 4Q5TA 4P11A 2O7IA 4H6DA 4U1OA 1H76A 3RQTA 3A09A 4ESXA 3PUVE 4I9DA 3K6XA 1Y4TA 1Y1ZA 1XHYA 3RT8A 4QFNA 5KDTB 3A3UA 4NF8A 2Y84A 2Q2CA 4WEPA 2Q8JA 3Q26A 5FHMA 3SKPA 1MY3A 3SEWA 3KSJA 4O3BA 3KJ7A 3L6HA 1T0KA 4EQBA 4LZ7A 1B7ZA 1ZLQA 3CFZA 3K01A 1SDXA 1MXXA 4F3BA 3VXBA 2GHBA 5DTBA 4RXLA 1Q1KA 5H8FB 3K00A 3KFMA 2HAUA 4LUBA 5AA4B 4E0WA 1JETA 3CR9A 3TMGA 1GR2A 3IOTA 2REGA 3TFLA 5AA2A 2QL3A 2DE3A 4YKIA 4U4SA 1MY4A 2XXVA 2QMXA 3N5LA 2V3TA 2ZYOA 4QSCA 3LBSA 1M5BA 2WKYA 4F29A 1N7XA 2M8CA 1DOTA 1DPEA 4R9GA 2FNCA 3DP6A 4NF5B 1DTGA 3FV1A 1MM6A 3MP6A 1B52A 1B0LA 1XOCA 3CSGA 4PFUA 4EF1A 1ANFA 5I58A 4F3SA 4KI0E 4IGRA 3TTRA 4GL8A 4KD5A 4MLVA 4R9FA 1M5EA 1Y9UA 1B7UA 3U92A 1GTKA 4THIA 4IY6A 1JNFA 2DXRA 1B51A 4KCDA 4JSDA 1QULA 4X48A 2O69A 4H5FA 4OYVA 1XVXA 2ZYMA 5AE4A 1JW4A 3BBRA 1SYHA 3TTMA 2I0CA 2DSFA 2F7BA 3MWBA 4PQJA 3PMVA 4R2FA 2DP8A 4M1VA 3EHUA 3UIFA 2I48A 2I58A 3UORA 2CMOA 2HQ0A 1LCTA 4NEDA 4ELPA 4UACA 2I6EA 2PT2A 4WXJA 2RINA 1GVCA 2RF1A 3PD9A 2PMSA 2ZNUA 4NF4A 4M4GA 4EDPA 3WAEA 1LAHE 3HN0A 5H8QA 3O2AA 3T66A 5I57B 4IO3A 3N26A 1P1QA 1URDA 2YLNA 2UVIA 3KN3A 1ZJLA 4FORA 2PT1A 2OCUA 4YICA 3FASA 4OWDA 3FV2A 1CB6A 1Z7ME 3RGYA 2UVGA 3PPNA 4EF2A 2F36A 1ZBMA 3G3HA 4QSEA 2O68A 3I5OA 4HCWA 3OENA 1B1HA 2Q2AA 5I84A 1IIWA 3HO7A 4UA8A 3PMWA 4I1DA 4GXSB 5J1DA 1JVYA 5DT6A 4PETA 5B70A 5CBSA 1J1NA 3OO8A 1MDP1 2ONSA 3OEMA 2B65A 4P0GA 3IOUA 3KSXA 4ZDMA 1MXZA 2O1LA 2I4CA 3N6UA 5CMKA 1M5FA 3TCFA 5JK4A 2H9BA 3AXFA 1OQHA 3G3JA 4F22A 4IO5A 4RPNA 3IB2A 3OEKA 2F97A 1HSJA 4P0IA 1OLCA 1VFEA 3FXQA 4RYAA 5TP9B 1OQGA 4RK9A 4IO2A 4QSDA 4LVQA 5L9MA 3E3KA 3T9HB 3E9XA 3GBAA 5I59A 5KCJB 3S9NC 1SI0A 4JSOA 4KQPA 1B32A 1MS7A 3S9EA 2XD2A 2VP1A 4LQ2A 1LLSA 5EHMA 3OMBA 5H8NA 4Q30B 4R74A 5M2VA 3OO6A 3SEVA 4H8IA 2PX1A 2XHDA 1N0TA 4Q0CA 5F1QA 4PE5B 2DQVA 3TZAA 1B3LA 2ABHA 3S2VA 4G8MA 4KYDA 4G8NA 4JBZA 4DZ1A 1TT1A 1Z7NE 3GBBA 1LCFA 3VFJA 2B3FA 1IXIA 2H4IA 3O97A 1BIYA 2RCAA 3RY3A 2AYSA 1B9JA 1H44A 2DWJA 4LONB 3M3KA 4C1UA 4RA1A 1LAXA 4DLDA 3H6TA 1FTOA 1NKXA 3U8QA 3KZGA 2I3WA 2PYYA 3QUFA 1VE4A 5L9OA 2AL5A 1B4HA 3FGSA 2A5TB 1OMPA 4JDFA 2RKMA 1ZMGA 3CG3A 3EHSA 3PD8A 5CMCA 3KOSA 5TU0A 3TQLA 3MP8A 2YPNA 4OTEA 3FD3A 2X7QA 1B7HA 1XC1A 2HZLA 4OFJA 3B7DA 3O28A 5K2XA 3K6UA 2REJA 1LFHA 2NXOA 5IAIA 3R6UA 2QS3A 4KFQA 1UTBB 1UIVA 2E0SA 3LR1A 1H3DA 5CI5A 3IL1B 1XVYA 1B5JA 4NF6A 1B58A 3FATA 3LSXA 3W9VA 4QFOA 3CG1A 2V25A 3V5AA 1A99A 3UA8A 4ISUA 1POTA 5AA2B 1BTJA 3Q27A 1CE2A 2DS9A 4H8JA 5DVJA 3U94A 4Z7EA 1O64A 1RYXA 2D3IA 3KEIA 1PC3A 2Z22A 1WODA 1LGBC 1B05A 1H43A 1ZIUA 3N94A 3PMXA 1BLFA 2O84X 1D4NA 2OBGA 3RNNA 5I56A 4HS7A 2UYFA 1LFGA 5I2KA 1UTHB 1N76A 3FJ7A 3Q28A 2I3VA 1M5CA 3TTKA 3SESA 4XKNA 5TPAB 2F6GA 3U72A 1QKAA 4JB7A 1MG1A 2LAOA 5H8HA 4R73A 4OENA 4YB5A 5B7DA 1DPPA 4ND9A 1MXYA 4R72A 1PBQA 2F6PA 5AA1A 3FVGA 3G3FA 3QAXA 3CVGA 5ISUA 3KBRA 4U23A 3THIA 1TWYA 3WAFA 2H5YA 5ELVA 1XT8A 2F34A 3C33A 4KR5A 1UIUA 1ATGA 2RC9A 2QS2A 1EZOA 3CI8A 3Q29A 4NF4B 4BLAA 3T96B 1IQ7A 4OEVA 5H8QB 1SYIA 4O3CA 5DVFA 2W7YA 4ZE8A 3I3VA 2OJTA 4GQOA 3MVXA 4YB7A 2GHAA 1FTLA 3K6VA 1NL5A 4IO4A 1FQEA 2Z8EA 3TEPA 1VR5A 3O29A 3QUJA 1S50A 1EH3A 2I4BA 5ITPA 1PB7A 3CFXA 3HCQA 2XXUA 3VE1B 4JWYA 1BKAA 5JTYA 3ILTB 1B46A 3TYHA 3C32A 4XIGQ 3W9WA 4XKRA 3FJGA 1MXWA 1WDNA 5A5XB 1FQBA 5DEXB 3L6GA 1N7WA 3T9VA 1Y3NA 1URGA 3M3FA 5KDTA 1MH3A 3BFTA 3TCGA 4Q8RA 4OXVA 4G68A 3KN7A 1II5A 1OVBA 1TFDA 4DIGA 1B4ZA 5H8SA 3T9XB 5CC2A 2P2AA 1RYOA 3CRBA 3UN6A 3IJXB 4YZZA 3OSRA 5FTIA 3MAMA 3M8UA 4LZ8A 2CZLA 4MBPA 3DELB 5I59B 4QFLA 1MPCA 3OELA 3IOWA 4YAHX 2THIA 2Y7WA 4ELRA 2VGQA 1N04A 1B2HA 1SD3A 3SEUA 2V93A 5H8FA 4ZZEA 3PUWE 4C0RA 2DWIA 3MQ9A 3VVFA 4PP0A 3RLFE 5AA4A 1AH5A 4LZ5A 5CMBA 2V84A 3QSLA 5IKBA 3B6TA 3R7XA 1FQDA 4N07A 3TTLA 1VFDA 1KWHA 3MPKA 2ZMBA 1LBCA 4PFWA 4U21A 3SETA 4F39A 2QS4A 1URSA 1LAGE 3MVZA 4XKPA 3ZKKA 3K1MA 1SBPA 5K2YA 3KJTA 4NF5A 3C35A 3EN3A 3H4ZA 4KPTA 1A8FA 1B3GA 1SW1A 1IXHA 1I6QA 4BDRA 1OIBA 2XXIA 1MY1A 1DSNA 4DCYA 1P99A 1LB9A 3V89B 4KYSA 3DLNA 3LUYA 4XTCQ 4OEUA 3MBPA 4FAJA 2XD3A 3ILUB 4RNSA 1D9YA 4F3GA 3C9HA 1N84A 3IB1A 2ANJA 3K0VA 4QHQA 4ELQA 1LFIA 1QUKA 3TQWA 1S9TA 1TFAA 4Z0IA 4C1TA 4DXUA 3PUZE 1QW0A 3K02A 5HM4B 3T9UA 3P7IA 5I2NA 2DOJA 3FVKA 3RT6B 2P1SA 1R9QA 1F9BA 1QUJA 1I6AA 4WEDA 3VVDA 4EXLA 2G29A 3IO6A 1IXCA 4ZEBA 3EQ1A 2Z23A 1O63A 2DWHA 2X26A 3O66A 4IO6A 4N13A 5I57A 2HAVA 4HW8A 2ONRA 1YPNA 2XXXA 1L5TA 4DDDA 1P1UA 4ZE9A 2XXHA 2I49A 3RPWA 1FTJA 1MDQA 1IITA 1MH4A 3FVNA 4OQOA 4ZECA 4OVJA 5CBRA 1MXUA 2QS1A 5LOMA 4XKQA 3M3LA 2FA7A 1QVSA 1MQHA 2D5WA 4NF8B 4GOTA 1PB8A 3PPRA 3JV9A 4YMBA 1NH8A 1DTZA 4F1VA 3GZGA 1QUIA 3RTWB 4NTLA 4LQ5A 1OLAA 3W15C 2RC8A 2XX7A 3TAJA 1GGGA 1PBPA 4TLLB 4YMAA 3GLBA 3VLWA 1SQYA 4N6PA 1R9LA 1A54A 1Q35A 5CRYA 2DE2A 2R9JA 3C31A 3S9LC 4G77A 4AQ4A 3TUSA 2HCAA 3PPPA 2IEEA 1IEJA 2GFEA 2X7PA 1SI1A 2ZXTA 1OVTA 1MQJA 5TP9A 3OO7A 5FTHA 2R6GE 3ZKLA 3UGWA 2Z8DA 3HV1A 2XX9A 3FJMA 4YU0A 4NMYA 5KCJA 2BJJX 4ZEKA 3V8XB 3O6HA 3H6WA 4ELOA 3BFUA 1EZ9A 1I6BA 1LAFE 3UP9A 3U93A 4ZEIA 1R1NA 2I0BA 3VLVA 3C34A 2UVJA 3OOAA 3H03A 2ESNA 2Z8FA 2F5XA 3PV0E 4OZ9A 4IGTA 4F19A 5I58B 5AA3A 4K3FA 1VSOA 3FXRA 2E1SA 4MF3A 3H6VA 4FJPA 3MVWA 2OK2A 2UVHA 4GD5A 2F78A 4GLIA 4NWDA 1AOVA 3O9PA 1I69A 4I62A 4RK2A 1N3XA 3MPLA 2KLFA 1AL3A 1B6HA 2HFBA 3S9MC 4IY5A 2DE4A 2NUVA 3H7MA 4YB6A 4JWOA 3V83A 3QXMA 2QJEA 3EHTA 1B5HA 1FW0A 1B3EA 1NFTA 1AMFA 1JVXA 1P1WA 4G68B 1JQFA 2GH9A 2ONKE 1D3KA 1PDAA 2A5TA 1Y3PA 3HHGA 2P0SA 4JWXA 4OERA 1MPDA 2ZYKA 4YKKA 3UK4A 1M5DA 3ZSFA 1QKBA 5HBCA 2F7AA 1B1XA 4AB5A 3OSQA 3IAZA 1MM7A 2XX8A 3I6VA 3ONMA 1PEBA 2HZKA 2B3BA 3EPEA 1B5IA 4PFTA 1HSLA 1UTBA 4F2OA 2VHAA 3KN8A 3F11A 4QFKA 3U1OA 4MH5A 3T22A 4NE4A 4FE8A 4BDMA 1MPBA 2XXQA 4FECA 3EF7A 3MW0A 3IR1A 4RPOA 4WKMA 5CMMA 2F35A 3GXAA 5ICQA 5BWJA 1HSEA 3PPOA 4F1UA 1NNKA 4QRZA 3MVYA 4HTGA 2NWJA 1SVXB 3IB0A 3TELA 1XS5A 4QF9A 1FCKA 5CM6A 2YJPA 4FIMA 3IOVA 5AA2D 4EQ7A 4QFPA 2VD3A 3PPQA 4OFOA 1IXGA 3JYRA 1QJMA 3DP4A 4GRKA 4PFYA 4GIZA 1UTHA 4FEBA 1BP5A 2DYXA 3KOTA 4LATA 4NWCA 1FQAA 2AIXA 3IK6B 5TPAA 4IO7A 4ECFA 2NVUB 3KGCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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