2XXWA

Crystal structure of the gluk2 (glur6) d776k lbd dimer in complex with glutamate
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
RSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRKKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Conformational Flexibility of the Ligand-Binding Domain Dimer in Kainate Receptor Gating and Desensitization
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 78
structure length 250
sequence length 250
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxwA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxwA02
1JNFA 3EPEA 5DVFA 5L9OA 5J1DA 3ONMA 2X7PA 3TTLA 4N6PA 1MQGA 3MPKA 4ND9A 4QSEA 3MPLA 3MVWA 3N6TA 3L6GA 4Q8RA 4KPTA 4DE8A 5I56B 1M5BA 1QUKA 1B51A 4POWA 1B40A 3I3VA 1R1NA 2DWIA 1PB7A 3U93A 5I58B 2CZLA 5I59A 3MP6A 4LZ5A 1MDQA 1LB8A 4IO7A 4C1TA 3IOTA 3TQWA 1N3WA 1SVXB 3IO6A 4TLMB 4OEVA 4G4PA 3OSRA 2O1LA 5ICQA 1ELJA 4R6HA 2Y7IA 4I1DA 1I6AA 3EHTA 2OWSA 1PBPA 1QUJA 3PUXE 2O7UA 1IITA 1IEJA 4TOZA 4ZEFA 1MDP1 4F1VA 3M3LA 4GFRA 4YB7A 3FVKA 3E3KA 1B3EA 2Y84A 4H65A 2DYXA 3SEUA 1Z7NE 3BBRA 1Q35A 2YPNA 1MPBA 4F3BA 3ZSFA 1VE4A 5KCJB 4F2QA 1JW4A 2AL5A 1P99A 3HCQA 1WDNA 3EQ1A 2Q8JA 2F97A 1YCJA 3VLWA 4YMBA 1FTLA 2G93A 3RY3A 1B0HA 4C0RA 3IB1A 2AIXA 1B7ZA 4E0WA 4H8JA 1MXWA 1N7WA 3FVGA 3HHFA 4JSDA 1BIYA 1MPCA 1DMBA 2UVGA 1AIVA 1D4NA 1B1HA 4OERA 3IB2A 4OHNA 5I58A 3RPWA 3VDFA 5JK4A 3TODA 1YPNA 1QKBA 4PE5B 4YKKA 1JETA 3LSFB 5FHMA 3IL1B 1CB6A 3KSXA 3RNNA 3QUJA 4F39A 2ONSA 1DTGA 1SW2A 2HAVA 1ZKBA 3HPIA 3U72A 1USYE 2AYSA 3H6UA 1SI1A 1I6QA 2Q88A 4O3CA 3C31A 4QRZA 1A54A 4Q5TA 2XXPA 2DVCA 1AL3A 3G7WA 3N6UA 1AMFA 3M8UA 2H5YA 1B5HA 3MP8A 4IO4A 3K1MA 4U2RA 4ZEBA 4AB5A 4H0WA 1BKAA 5JTYB 3HHGA 3LC8A 1MY4A 4BDMA 4O3AA 1VSOA 3M3KA 3PMWA 1EZPA 4QF9A 4C1UA 1BLFA 4I8CA 4RK2A 1NNFA 4OFLA 3PPNA 2Q2AA 4LATA 4ISUA 1Y20A 1NL5A 5CRYA 5H8NB 5AA3A 2O7IA 1MRPA 1D9YA 2I58A 3JZJA 4G68C 2RC7A 2H25A 2ONRA 4KR5A 3DP4A 4K3FA 4YB5A 3H4ZA 3O29A 2O69A 2UVHA 1IXCA 1LSTA 4IO2A 1NFTA 1JW5A 4THIA 2PX1A 4HCYA 2H98A 1Y1ZA 2I49A 1EH3A 4PFWA 4X1BA 1P1OA 3S2VA 4JBZA 3GXAA 3CFLA 3O97A 4OQOA 5HM4B 3CI8A 4BDLA 3C35A 2RC8A 1NMUA 2O6AA 3PUYE 3TMGA 1SW5A 4RJZA 2FNCA 3C32A 1O7TA 2O1MA 5JTYA 1A99A 4DXBA 1II5A 2XX7A 5TPAB 3CFZA 4WEDA 3T66A 3G3JA 5HBCA 4YICA 3SERA 1FQEA 4FORA 2ZXTA 5CM6A 2ZNTA 5H8NA 1QVSA 3G3GA 3V89B 3S4UA 4NF6A 3O28A 1IZ1A 1R6ZA 3H3GA 3KSJA 3MQ9A 3OO8A 1UQWA 1XT8A 4RY1A 3H06B 1M5EA 4F22A 3T93B 4PP0A 1LCFA 5AA4B 4JWOA 4M4GA 2W7YA 3A3CA 3SEYA 4NTLA 3CRBA 2FA7A 4RPOA 4EUOA 2DS9A 4JDFA 1OMPA 4NWCA 1UTBA 2O68A 3MZBA 4GD5A 3HO7A 1OLAA 3HSTA 1URSA 3QXMA 1MY1A 1HSEA 2XXUA 3N26A 2HZLA 3QSLA 3I6VA 1O64A 4GOTA 3C36A 1GV8A 3K01A 3A3UA 2R9JA 5I2KB 1Z7ME 5B7DA 3G3FA 4RXLA 2NUVA 1A8FA 1Y4CA 3B7DA 5I59B 4OXVA 3FXUA 4F3PA 3KJTA 3OEKA 4KQPA 3S9LC 2XHDA 5TPAA 3VXBA 1MH4A 2V84A 1S9TA 2OWTA 2DOJA 3ODBA 5F7VA 4ZS9A 2REJA 5CBSA 1MXUA 4R6YA 1B1XA 4BLAA 3FXQA 4RK9A 5ELVA 2R6GE 1NKXA 3Q28A 3RLFE 4DZ1A 4LP2B 1URGA 3BKIB 4FECA 3CR9A 1VR5A 2UYEA 2D21A 1H76A 2QMXA 1MM6A 4NWDA 1NH7A 4KYDA 3H6TA 4HTGA 5AA4A 3KBRA 5H8HB 2OZZA 5CMBA 4QHQA 4ZZAA 1JQFA 3OO9A 1JEVA 3P7IA 3TKDA 1FQAA 4U4SA 1US5A 2Q9TA 3T9UA 3W9WA 4P0IA 2Z23A 4NF4A 4U4XA 5K2XA 2OLBA 4RNSA 2Y7PA 4GLIA 3T9VA 3TCHA 1N04A 2DWHA 2ESNA 2ANJA 3VVDA 1B2HA 3R7XA 2QMWA 4OESA 4R6KA 2F36A 4DXCA 3MJNA 1FQFA 2ZYMA 5I2KA 1T0KA 5DVJA 1B4HA 3TUSA 2I3WA 2A5TA 3VVFA 1EZ9A 1MQIA 1GTKA 4MFIA 3LSWA 1NNKA 4X1DA 2HZKA 2GH9A 4H5FA 1ZJLA 3FASA 3QIMA 3IORA 4FJPA 1B5IA 1EU8A 1LCTA 5I84A 1MY3A 3QYTA 1B5JA 4XXUA 5FTHA 4LUBA 5L9MA 1GGGA 1B3HA 2F78A 4P11A 2XXHA 4WEPA 4YKJA 3FV2A 2P2AA 3VVEA 3N5LA 3KGCA 3H6WA 5H8HA 2G29A 4R73A 1B3FA 1O63A 3I5OA 5AA2D 3IOVA 3UIFA 4POXA 3WAFA 3WAEA 5DVIA 3V8XB 4DIGA 1MY2A 4EQ7A 2NOOA 2XXTA 3SESA 3VE1B 3U8QA 3FUZA 3K6VA 4OENA 4QFKA 1ANFA 1NNTA 1B3LA 1P1NA 4EXKA 4YKPA 4U1OA 5JEIA 1LFGA 2D3IA 2Q2CA 5IKBA 3OD7A 2GFEA 3ZKLA 2QPQA 1M5CA 5DT6A 4ESWA 3CFXA 1IXIA 1OLCA 1IUDA 5ICTA 4OVJA 4GQOA 4X9TA 2UVJA 4PFYA 3MVZA 2IEEA 3H7MA 3O66A 1VFDA 4ECFA 2F6PA 4MF3A 3KOTA 3KN7A 3S9MC 3MC2A 1ZMGA 4BDNA 3BFUA 3Q27A 2XD3A 3FV1A 1OVBA 3G3HA 2RF1A 4LVQA 2A5SA 4F31B 2OJTA 1RYXA 1YTVA 5CMCA 3TELA 1GVCA 3TTMA 2PT2A 1PDAA 4IO6A 4PFUA 3O6IA 1PEBA 4LZ8A 1PBQA 4KCCA 3K00A 2GHAA 2HFBA 1FCKA 3PMXA 2ONKE 4YAHX 2LAOA 2F34A 3IB0A 4N07A 4GL8A 3QK6A 3FJMA 2O51A 4OYVA 3RT8A 1ZIUA 4F3SA 1N7XA 4OTEA 4RA1A 5IAIA 4ESXA 2D5WA 5ITPA 1SI0A 1MQDA 4OFOA 2DSFA 4YU0A 3TZAA 3K4UA 3D4CA 5B70A 5CI5A 2YJPA 3EHUA 4IO3A 3IK6B 3F11A 2E1SA 4UA8A 4NF6B 5FHOA 3THIA 3DP6A 1DPEA 3K6UA 4EQ9A 3R26A 4NMYA 4H5GA 2GHBA 5I2NA 2DE2A 2VD3A 3MUQA 3S9NC 2OCUA 2I3VA 1US4A 4KYSA 3CG1A 4IY6A 1QW0A 3ECRA 4Q0CA 1I69A 2PT1A 2HXWA 2DE3A 1ATGA 1A40A 3KN8A 1UTBB 3GZGA 4ELOA 2XXWA 4OMBA 1RKMA 3K0VA 1BP5A 1YAEA 3PUWE 2VHAA 4MBPA 4MLQA 5H8FA 3T96B 3IAZA 4IY5A 4G68B 2QS3A 4F1YA 1FTKA 1LBCA 1SBPA 3UK4A 3QAXA 1NNPA 1B3GA 1TT1A 3RUMA 2XXRA 3U1OA 1JVYA 4GL0A 3SDFA 1SDXA 1R9QA 2QRYA 2R71A 1N76A 4IGRA 1B7HA 2RKMA 2Y7RA 1H45A 1IXHA 4F2OA 1TFDA 4UACA 3KN3A 4M1VA 1B58A 1MQHA 1OIBA 1P1WA 2V3UA 4ONYA 1P1UA 3FVNA 4R74A 3GBAA 1A55A 1DSNA 1GR2A 4ZZEA 1HSJA 3UP9A 2XXYA 3Q25A 2H9BA 2DQVA 3EHSA 1QULA 3V83A 3LR1A 1SYHA 2QS2A 2BJJX 5KZTA 3OOAA 3PPPA 1B0LA 4H6DA 2I48A 4NF4B 2YLNA 3TAJA 2XXVA 1KWHA 5AE4A 3OENA 3RTWB 4XKNA 4R2BA 4DLDA 3UN6A 2XX8A 1MH3A 4X48A 4G68A 4RPNA 2F8DA 3TDJA 4EXLA 1POTA 3PU5A 4KI0E 3KZGA 3PPRA 2QS4A 2O84X 1PB9A 2Y7WA 1JEUA 1CE2A 2PMSA 2DXYA 4FEBA 2P0SA 2DP8A 4QSCA 1UTHB 2CMOA 1Y3QA 2PBWA 2A5TB 3ILTB 1WODA 3MWBA 4JWXA 4ZECA 5HPQA 2DVZA 1URDA 3OELA 1B7UA 3T22A 4OZ9A 1MXVA 4KCDA 4DCXA 1SYIA 2OK2A 4WKMA 3IOWA 1FQCA 2KLFA 4WXJA 2ABHA 2QL3A 4BDOA 1Y9UA 2OBGA 4BDRA 4Q30B 2IA4A 2WKYA 2I0BA 2V3TA 4FATA 1UIVA 1H43A 2ZMBA 3G3KA 3UGWA 4AQ4A 1SD3A 1LAFE 2F35A 4O3BA 4NF5A 3FXRA 3G3IA 3O2AA 5FTIA 3MAMA 4E0XA 1IQ7A 4HS7A 1XVXA 4EF2A 3OO6A 3IJXB 2RCBA 5ITOA 1FTJA 4FIMA 4KFQA 5FHNA 4LA9A 1ZBMA 2QJEA 2I0CA 3K6WA 3Q29A 3KG2A 1UIUA 5KDTB 4PETA 3FGSA 5CMMA 3PD8A 2H99A 1FTOA 3T9HB 3FVOA 4N13A 1UTHA 2X7QA 3OSQA 1LAXA 3IX1A 4YMAA 3LUYA 4RYAA 3VXCA 5AA2B 4H1XA 1MM7A 2B65A 3GLBA 4DDDA 2HQ0A 1H44A 3T9XB 3VV5A 3BFTA 2VP1A 3K1PA 2XXQA 1Y3PA 2RCAA 4F1UA 1MQJA 3TEPA 1L5TA 4ZDMA 4Z7EA 1XVYA 3DLNA 2XX9A 3PD9A 3TCGA 3O6GA 4JXIA 3CIJA 1B9JA 1PC3A 1AOVA 4NF8B 3W9VA 3LSXA 1I6BA 2ZNSA 1FQBA 5TP9A 3QUFA 3IO4A 4IGTA 1SQYA 3A09A 3S9EA 5TU0A 5EHSA 2AL4A 2F7BA 4GXAA 3RGYA 3CG3A 2B3BA 1TFAA 1S7YA 3DELB 5ISUA 2QSXA 2Z8FA 4F19A 1XS5A 1TWYA 4I9DA 3B6WA 1XOCA 2V93A 2F7CA 5DEXB 4LZ7A 5KDTA 3O9PA 1AH5A 4IO5A 3CSBA 1XHYA 4ZEKA 1M5DA 4OETA 3PPOA 2Z22A 4P0GA 5A5XB 2Z8EA 2P1SA 5I2NB 3HN0A 4QFPA 1N3XA 3B6QA 3FZVA 3R6UA 3RN8A 1LGBC 3OMBA 4EDPA 5I56A 4G8NA 1Q1KA 5H8SA 4FEDA 3KOSA 4DXUA 1IXGA 4F18A 2NXOA 2QS1A 1A8EA 5AA2A 3N94A 1M5FA 4ELPA 3GBBA 1FQDA 3MZ9A 3DP8A 1DTZA 2Z8DA 1LFIA 2M8CA 2XXXA 1ZLQA 5BWJA 5EHMA 2DWAA 3USDA 1H3DA 3K1NA 1IIWA 3IR1A 3VFJA 5H8FB 3ZKKA 1A7LA 2HEUA 5EYFA 3TCFA 4QFNA 4G8MA 1OVTA 3SKPA 2Y7KA 2ZYOA 4KD5A 3Q26A 1MY0A 4NF8A 1MXYA 4U1ZA 2XD2A 2ZYNA 3U92A 4TQUQ 1LFHA 4F29A 1RYOA 4Z0IA 1JVXA 2ALUA 4R72A 1LAHE 2VD2A 4OEUA 4XKQA 3C4MA 1N0TA 4JB7A 3H6VA 5KCJA 4OWDA 1B05A 2I4CA 3EF7A 4OFJA 4PFTA 3OEMA 5I57B 3TFLA 5DEXA 4I62A 3JV9A 2I6EA 1MG1A 2HCAA 2F7AA 2UXAA 5A5XA 3RQTA 5CMKA 1NH8A 4MH5A 2F5XA 3KJ7A 2HAUA 1QKAA 1WVJA 4H8IA 3PPQA 1B4ZA 1MXXA 3E13X 2THIA 4ZE8A 3ZS6A 3UORA 5DTBA 4LQ5A 3CVGA 4G77A 1BTJA 3L6HA 4QFLA 1POY1 3PMVA 1LAGE 4XIGQ 3MP1A 2V3QA 4U23A 4H67A 1N84A 4FE8A 4LONB 4NE4A 2DWJA 1XC1A 3OO7A 5K2YA 2ZNUA 1QJMA 4G2ZA 4EF1A 3TPAA 4R75A 5DYHA 1QUIA 4EQBA 4GXSB 1Y3NA 1S50A 4MLVA 4HW8A 4TLLB 1F9BA 3MZ1A 4KHZE 4ZE9A 3PV0E 2H4IA 1JW1A 1PB8A 3FATA 1DOTA 4XTCQ 1OQHA 4U22A 2NWJA 3LBSA 4YKIA 3H03A 3PGFA 4PQJA 2F6GA 5CBRA 3PUZE 1B46A 3TTRA 4XKRA 5I57A 1OQGA 3FD3A 2REGA 5M2VA 4G8HA 1HSLA 4JSOA 4F3GA 3MW0A 3AXFA 3OXNA 3TTNA 3SEVA 2UVIA 1Y4TA 3SEXA 3TQLA 2NVUB 4GRKA 5L9SA 2B3FA 3CSGA 4QSDA 3MVXA 3B6TA 3K2DA 1MPDA 1FW0A 2V25A 1SW1A 3O6HA 3UA8A 4NF5B 4GIZA 4GVOA 1D9VA 1MXZA 5AA1A 4R2FA 2VGQA 3M3FA 5BUUA 4GF8A 1EZOA 3LSLA 3RTFB 3IOUA 2I4BA 3E9XA 1VFEA 5H8QB 5CC2A 5LOMA 4ELRA 3SEWA 3ILUB 1R9LA 4ELQA 4FAJA 3VLVA 2PYYA 3HV1A 3V5AA 4KYEA 4L17A 3U94A 3W15C 2RINA 4JWYA 3K6XA 4QFOA 4GWOA 3SETA 2FYIA 3FJ7A 4NEDA 2DXRA 2DE4A 1MS7A 2PVUA 1TXFA 3TYHA 3MVYA 3JYRA 1B32A 3K02A 3C9HA 3FIRA 3FJGA 4R9GA 3KFMA 4ZEIA 1SW4A 4U21A 3DM0A 3C34A 4R9FA 2ZYKA 1Y1MA 3IJOB 3PUVE 3VLUA 3KEIA 1D3KA 2VOZA 1B6HA 2UYFA 1DPPA 1USYH 2RC9A 1FTMA 1LBBA 3EN3A 2XXIA 4YB6A 4BDQA 1LLSA 3RT6B 3TTKA 1B52A 4ZEDA 4DCYA 5L8DA 1ZU0A 5TP9B 4XKPA 3E4RA 2X26A 4LQ2A 2Q89A 4IB2A 4AB6A 3D4GA 4HCWA 1LB9A 1J1NA 2GRVA 5F1QA 3C33A 4YZZA 1P1QA 5H8QA 3MBPA 1ZTYA 2E0SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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