2XXYA

Crystal structure of the gluk2 (glur6) d776k lbd dimer in complex with kainate
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
SLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRKKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Conformational Flexibility of the Ligand-Binding Domain Dimer in Kainate Receptor Gating and Desensitization
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 248
sequence length 248
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxyA02
5BWJA 3MW0A 3IB1A 5DVFA 1D9VA 4THIA 1FTJA 3TDJA 2FYIA 4U2RA 2IEEA 2RCAA 2QMXA 4DLDA 3C35A 5H8NB 4RXLA 1JW1A 2OBGA 3GZGA 3DELB 2Q9TA 3IO6A 3VV5A 4LONB 2F6GA 1POTA 2WKYA 1GR2A 4IO3A 2DWAA 4QF9A 4YKPA 4DDDA 2ABHA 1LLSA 3PPOA 4U22A 3UA8A 3FGSA 4F18A 3IB2A 3IOUA 4MFIA 4ND9A 4I62A 2BJJX 3D4GA 1PDAA 1B0HA 3RLFE 3V5AA 1N04A 4DXUA 4JDFA 4U23A 5ITOA 3B6QA 1US4A 1JQFA 1Y9UA 1OLCA 3SEUA 1EZOA 4IO2A 4IO6A 3MWBA 4GQOA 4YKIA 1I6BA 4R75A 1Z7ME 3O2AA 5CMMA 1GV8A 1QULA 3C34A 3FASA 4XTCQ 3OELA 1MY4A 1XVXA 3E3KA 5H8QA 1GVCA 1A55A 1LFIA 2PT1A 1IITA 2D21A 4IGRA 3IOWA 3JV9A 2ZXTA 1IUDA 4XKNA 4OFOA 4NF5A 1VFDA 4P11A 4OTEA 4U1ZA 3QXMA 4NEDA 4YB7A 2B65A 4KFQA 3TTRA 2I3WA 5A5XB 3DP4A 5I59B 2XXPA 3IAZA 4ZS9A 3LSXA 1B05A 3TTNA 1B7HA 3JYRA 3Q26A 3Q25A 4F1UA 1MM6A 2A5TB 2QL3A 2ZYMA 4HTGA 3K0VA 2XHDA 4HW8A 2OCUA 4FAJA 1MRPA 3FD3A 3RPWA 3U72A 1NL5A 3DM0A 2XXRA 2O7UA 3OSRA 1UTHB 1A54A 4MLVA 3TODA 3U1OA 3U8QA 4RK9A 4G2ZA 1ELJA 5I58A 4NF8A 1QUKA 3AXFA 3T9HB 3E9XA 4TLLB 4KCDA 1BKAA 3S9EA 1N0TA 4FE8A 3EPEA 3KN8A 2QS3A 2XXTA 2UXAA 4I8CA 3S9NC 1XOCA 5I56A 3IOVA 3SEYA 5CM6A 3TTMA 1B1XA 1H44A 1ZBMA 4PQJA 2ALUA 2HFBA 5FHNA 3HHFA 4KI0E 3FATA 2O1MA 4K3FA 4JBZA 4DE8A 1SW2A 2GHBA 2F7BA 3TCFA 5H8NA 3PPNA 1NKXA 1YAEA 4F3PA 1MY1A 2QPQA 4QSCA 1MQGA 1O63A 2VOZA 1PB8A 3G3IA 3MP8A 3GBAA 5JTYB 4QSEA 1B4ZA 4DCYA 1Y1MA 1IXGA 1Q35A 3U92A 2HQ0A 4EDPA 5J1DA 1P99A 4MLQA 5CBRA 1H45A 1MXVA 5I2NA 2O51A 3O28A 4UA8A 4NF4A 3RN8A 1XHYA 4GRKA 3S9LC 5H8FB 1VR5A 2RC8A 4OZ9A 2OJTA 1B0LA 1P1OA 1Y1ZA 1B7ZA 1GTKA 2DP8A 1UTBB 4R9GA 4OFJA 1A40A 4ZEFA 4RJZA 2DE3A 5L9MA 1PEBA 4BDLA 1UIVA 3KGCA 4HS7A 1IXCA 4XKRA 3B6WA 5ISUA 5HPQA 3MPKA 3R26A 3MAMA 3TCHA 3H4ZA 1O7TA 2DVZA 4PFWA 4YZZA 2HEUA 3JZJA 3VLVA 1WVJA 3K1NA 4ELQA 3FVOA 5KCJB 3IJXB 1FQEA 1LGBC 3PMWA 3QK6A 3LSWA 3ILTB 1OVBA 3C32A 1RKMA 3HHGA 4E0XA 5A5XA 4C0RA 4GD5A 3SESA 1H3DA 4H6DA 4EXKA 2B3FA 5TPAA 3PPPA 3T9XB 3N6TA 1TXFA 3FIRA 5ICQA 2V3TA 1NFTA 5B7DA 3KN7A 3R7XA 1IXHA 2A5TA 5CMKA 3C36A 4LATA 1B58A 4OHNA 3LSLA 3I5OA 4BLAA 3OD7A 3LC8A 1J1NA 4WXJA 1VSOA 1B4HA 3TTKA 1MPCA 2OLBA 4R6HA 3TMGA 4ECFA 2V25A 2NOOA 4X9TA 3ONMA 1SW1A 2Q88A 1M5CA 3QSLA 3U94A 2H98A 3OOAA 4NMYA 3FXUA 1MY3A 3O6HA 2DWHA 4G68C 3K2DA 3Q29A 1M5DA 3IORA 3T96B 3KG2A 2V3QA 1MDQA 4JWYA 3FZVA 3OEKA 4GIZA 1EH3A 2V84A 3C9HA 1ZJLA 5EYFA 4IY5A 2XXUA 1QKAA 2F97A 3W9VA 3BFTA 3G7WA 3MZ9A 1NH7A 3TPAA 4BDQA 4BDMA 4R72A 4TLMB 1FW0A 2O69A 4YU0A 1D9YA 4XKPA 2DQVA 1ZLQA 3K1PA 4F2OA 4LQ5A 3TFLA 3L6GA 1Y4CA 4H0WA 3O97A 3E13X 3KJ7A 5F1QA 1DMBA 2AL4A 5L9SA 1USYE 4WEDA 3CRBA 4BDRA 2O1LA 3IL1B 4OERA 4KYDA 2ONSA 5I57A 2Q89A 3PV0E 5JK4A 3RTFB 2RKMA 1FQDA 1LFGA 1Y3NA 3ZKKA 3OO9A 1Y4TA 3RTWB 3MBPA 2DE4A 4G68A 3OEMA 5FTIA 3KEIA 4H67A 5JTYA 1RYXA 1JETA 4ONYA 4YMBA 3PD8A 1NMUA 3SDFA 3SEWA 3MUQA 3D4CA 3VFJA 1B7UA 1B5IA 4R2BA 3M3KA 3MZBA 1BP5A 1FQCA 3UGWA 4ESWA 5B70A 5ELVA 3QUJA 4GVOA 4RPNA 4U4SA 5H8FA 1MPBA 1AL3A 1LBCA 3HN0A 1F9BA 3N5LA 5AA2A 3T9VA 5EHSA 4C1TA 1SYIA 1N7XA 1WODA 1PBQA 1ZIUA 1PB7A 1B5JA 1A7LA 4KD5A 1AIVA 3V83A 2ZMBA 5HM4B 1FQBA 4YB6A 2XX7A 3VXBA 3K1MA 4EXLA 4R74A 1LB9A 2DE2A 1A8EA 3K6WA 4U1OA 3IK6B 2CMOA 4PFTA 3PU5A 2O84X 5KCJA 3LSFB 3KOTA 1DPPA 3VXCA 5DVIA 2NVUB 1B1HA 5K2XA 1URSA 4LZ7A 4QFLA 1N7WA 2DS9A 4GWOA 2F5XA 1NNFA 4O3AA 4RK2A 3ILUB 3MVXA 3FV1A 4YMAA 5KDTB 3OMBA 4M4GA 3GBBA 5TU0A 1URDA 4P0IA 1ZU0A 4X1DA 2PMSA 5DT6A 4BDNA 5DEXA 4U21A 4OVJA 5ICTA 3FXQA 1QKBA 4N13A 4XKQA 1SW4A 3VE1B 3EQ1A 1LFHA 2XXIA 3M8UA 4ZEDA 1B6HA 5FHOA 4JSOA 3C4MA 4HCYA 3CFZA 2I49A 3ZSFA 5TP9B 3UIFA 4RYAA 4GL8A 4JB7A 4X48A 2THIA 3MVZA 2I3VA 3LBSA 1B3EA 3KZGA 4NWDA 4AQ4A 4C1UA 3BKIB 1BLFA 3IB0A 3OENA 2V93A 3HV1A 2ESNA 2DYXA 2P0SA 4NF6B 1QW0A 3OSQA 4OENA 4HCWA 2F78A 3FJ7A 1JVYA 2AL5A 4NE4A 2F34A 3G3FA 3VLWA 3O6GA 4F3BA 3KFMA 3SETA 3M3LA 2Y7PA 1P1UA 4FJPA 1MY0A 3LUYA 3VLUA 2RF1A 3HSTA 2F8DA 3RY3A 4KHZE 4OEVA 5AA3A 4H8IA 1UIUA 5EHMA 2ZNSA 2RC7A 1CB6A 4EF1A 4ELRA 4DXCA 2F7CA 3H6UA 3TUSA 1B3FA 4Q0CA 1YPNA 3O9PA 1B3HA 3QUFA 5M2VA 3T66A 2PYYA 4R2FA 4E0WA 1FTOA 4AB5A 2M8CA 3I3VA 1MQHA 4R6YA 5I2KB 1FTKA 2LAOA 4KPTA 1MXUA 1I6AA 2KLFA 3H3GA 5CMCA 3TKDA 1BIYA 2R9JA 2RINA 3K6VA 4PP0A 3CG3A 2HZKA 1LCFA 2R6GE 4H65A 4H8JA 3S9MC 1Y20A 3C33A 2P2AA 1SQYA 4F22A 4FEDA 3L6HA 4G4PA 3OO8A 3PMXA 1AH5A 1LAXA 1OVTA 2UYEA 2QSXA 4FIMA 2XX9A 2GHAA 5JEIA 1FTMA 3G3JA 1SDXA 1DPEA 5K2YA 5LOMA 1R6ZA 2B3BA 4LP2B 4RNSA 1N3XA 2HCAA 5F7VA 1NH8A 1OIBA 2ZYNA 1S9TA 3RGYA 3R6UA 3KOSA 3SEXA 3OXNA 2XXVA 2H9BA 1Y3PA 4X1BA 2VHAA 3CIJA 2YLNA 3FXRA 5ITPA 4OQOA 2UVJA 3K01A 3MVYA 3THIA 3W15C 2GH9A 3A3CA 4GL0A 4IY6A 1OQGA 1CE2A 1HSEA 1YTVA 4F31B 1UQWA 1IIWA 3PUWE 3N26A 4LZ8A 5I84A 3HPIA 5BUUA 4F3GA 4O3CA 1B3LA 2XD3A 3G3GA 4IO7A 4ELOA 3M3FA 4F1YA 1SI0A 1MDP1 3W9WA 1PC3A 4PETA 3E4RA 4LVQA 4M1VA 3DP8A 5H8HB 2W7YA 1JVXA 1FQFA 1SVXB 3CSGA 4TOZA 3TZAA 1L5TA 5IAIA 2Z23A 3CVGA 3V8XB 4EQ9A 4OEUA 3PPRA 4DCXA 3UN6A 4O3BA 1MQDA 5L8DA 5I59A 1GGGA 1PB9A 3USDA 1IQ7A 1LCTA 4ELPA 2XXQA 3DP6A 2ANJA 4DIGA 1I69A 2G29A 2F6PA 4NF5B 5TP9A 2OWSA 3TELA 3H06B 2OK2A 4F3SA 1MPDA 3UK4A 1D4NA 4OWDA 3RT6B 1H43A 2HXWA 2PVUA 3PUXE 5HBCA 4H5GA 4QHQA 2QMWA 4KQPA 2ZNUA 4QFPA 1O64A 3MP6A 1AMFA 2F7AA 1UTHA 4NTLA 5AA1A 3KSXA 2PT2A 4RY1A 3Q27A 1XT8A 4PFYA 1B9JA 1XS5A 3A3UA 4R9FA 4MBPA 4G8HA 2OWTA 1OMPA 2X26A 2O68A 4G8NA 3ECRA 4QSDA 1Y3QA 4EF2A 3A09A 1MM7A 3RUMA 3G3HA 4FEBA 3MPLA 3O6IA 3LR1A 2CZLA 4Z0IA 1LAFE 3MVWA 2DSFA 3S4UA 3EHTA 2NXOA 4EQ7A 3VDFA 5CBSA 4OETA 4MH5A 2AYSA 2H25A 4U4XA 4NF8B 5I58B 4ZEBA 2XXXA 4F1VA 2P1SA 3H7MA 3PMVA 2YPNA 1EZ9A 4QRZA 2Q2AA 3S2VA 4OYVA 3BBRA 2Q8JA 3OO7A 4TQUQ 3GXAA 1MQJA 2Z22A 5I56B 2I6EA 3GLBA 3VVFA 4ESXA 1P1WA 2DWJA 3CI8A 4Q5TA 4AB6A 2UYFA 5DYHA 3EHUA 4EQBA 3UORA 5CC2A 1OQHA 3H6VA 2PX1A 3T93B 4FECA 5AA4B 1T0KA 1IEJA 3EF7A 3WAEA 2UVHA 4LQ2A 1TFDA 1N3WA 1MY2A 3RQTA 3N6UA 4YKJA 1II5A 2RC9A 2QRYA 2D5WA 3QYTA 4GF8A 3IX1A 2DVCA 1H76A 4NWCA 3CR9A 4DXBA 1XVYA 1SD3A 3EHSA 1UTBA 4IO4A 3RNNA 4F2QA 4QFOA 2VP1A 3UP9A 1MXWA 2Z8DA 4FATA 3FVGA 4F19A 3KBRA 3VVEA 1XC1A 3V89B 1JEUA 5I2NB 4NF4B 2REGA 4PE5B 1FTLA 1URGA 4H1XA 4QFKA 4XXUA 3MC2A 3MJNA 3FV2A 2QS2A 2VD3A 4GFRA 1SI1A 1R1NA 2VD2A 5H8HA 2XXYA 2GFEA 2QJEA 2Y84A 3CFLA 1D3KA 3FVNA 1WDNA 1ZKBA 4ZZAA 2NUVA 4ZZEA 2QS1A 4FORA 2REJA 4BDOA 2DWIA 2Y7RA 1EZPA 4G8MA 2Z8EA 3SKPA 2X7QA 4POXA 3K4UA 2XXWA 4RPOA 1AOVA 5H8SA 4UACA 2DXRA 1N76A 1B46A 2YJPA 2X7PA 1DOTA 2V3UA 3MP1A 3FVKA 1SW5A 3G3KA 4ZEIA 4F39A 4ZECA 2HAVA 1MH4A 3TQWA 1QUJA 4KR5A 1N84A 2ZNTA 5TPAB 2NWJA 1TWYA 2ZYOA 2DOJA 1RYOA 3FUZA 2H4IA 2I4CA 3Q28A 1NNTA 5KZTA 4P0GA 2I4BA 2VGQA 1IZ1A 2PBWA 1SYHA 2GRVA 3U93A 4IO5A 2E0SA 4Q8RA 3P7IA 1B51A 4WEPA 1MXZA 4H5FA 3OO6A 3TEPA 3ZKLA 4JWOA 2Q2CA 5CI5A 3PUVE 5FTHA 3TTLA 1VFEA 1ATGA 3PUZE 1B3GA 1DTGA 1PBPA 4OFLA 5CMBA 4I1DA 3H03A 4GOTA 2HAUA 4LZ5A 3K02A 3F11A 3TAJA 1QJMA 4ZE8A 3IJOB 1JW4A 2XXHA 3HCQA 5AE4A 2G93A 1B52A 1NNPA 4YB5A 1S7YA 2FNCA 3H6WA 3DLNA 1MQIA 3CSBA 5AA4A 5I57B 1EU8A 4G77A 2ONRA 1MH3A 1P1NA 4Q30B 4EUOA 3QIMA 1DTZA 3CG1A 2DXYA 1M5BA 1US5A 3B6TA 5AA2D 4G68B 1QUIA 1M5EA 5IKBA 3B7DA 2RCBA 1ZMGA 1LSTA 2I0BA 2F36A 3SEVA 4MF3A 1B32A 4ISUA 3IOTA 3T22A 5FHMA 2ONKE 4KYSA 4RA1A 1HSJA 4JSDA 4QFNA 4ZEKA 1B5HA 4R6KA 3SERA 4GXSB 4PFUA 2Y7WA 2H5YA 2O7IA 1LBBA 2XD2A 3N94A 3ODBA 3TCGA 3O29A 4OMBA 4DZ1A 3I6VA 3H6TA 3CFXA 3PPQA 5AA2B 1OLAA 5DTBA 1M5FA 3T9UA 2HZLA 3KN3A 2OZZA 1POY1 1TT1A 4POWA 4XIGQ 1MXXA 3EN3A 3TYHA 1VE4A 2I48A 1MXYA 4Z7EA 4LUBA 1LB8A 2Y7KA 5H8QB 1YCJA 2UVGA 5KDTA 1FQAA 4OESA 3K6XA 4IB2A 1JNFA 3PGFA 1JW5A 1R9QA 1A8FA 4L17A 1Q1KA 4OXVA 3PD9A 1HSLA 1R9LA 4I9DA 1QVSA 2F35A 2D3IA 1FCKA 3K6UA 4N07A 3KJTA 1LAGE 1BTJA 3FJGA 3WAFA 2Y7IA 1MG1A 3RT8A 3O66A 4IGTA 2A5SA 4WKMA 3MQ9A 5DEXB 2E1SA 3IO4A 1B40A 1IXIA 2I0CA 5L9OA 1I6QA 2O6AA 4YKKA 4F29A 4KYEA 1USYH 1LAHE 4NF6A 2I58A 3BFUA 3QAXA 1Z7NE 4ZDMA 1ANFA 1MS7A 1SBPA 2Z8FA 1S50A 2XX8A 4YAHX 2AIXA 3ZS6A 1B2HA 1A99A 3HO7A 2QS4A 1KWHA 3C31A 4R73A 3K00A 2ZYKA 3TQLA 3FJMA 2H99A 3KSJA 1JEVA 2R71A 4YICA 3PUYE 1P1QA 3VVDA 5DVJA 3MZ1A 4GLIA 4ZE9A 4KCCA 1NNKA 2IA4A 2UVIA 1TFAA 4LA9A 4JWXA 1ZTYA 4N6PA 5CRYA 5I2KA 2FA7A 3IR1A 4JXIA 1DSNA 4GXAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4P8BA 3IFAA 5BWJA 3MW0A 3IB1A 5DVFA 1D9VA 4THIA 1FBEA 5EYHA 1FTJA 3TDJA 2FYIA 4U2RA 2IEEA 4GWWA 2RCAA 2QMXA 1FBCA 3B50A 4DLDA 3C35A 5H8NB 4N81A 4RXLA 1JW1A 4GWXA 2OBGA 3GZGA 3DELB 2Q9TA 3IO6A 4GX4A 3VV5A 4LONB 2F6GA 1POTA 2FIEA 1LBWA 2WKYA 1GR2A 4IO3A 2DWAA 4QF9A 4YKPA 5I5PA 4DDDA 1NUXA 2ABHA 1LLSA 3PPOA 4FBPA 1FPDA 4U22A 3KC0A 3UA8A 3FGSA 5T3JA 5ESYA 3IB2A 4F18A 4N6DA 3IOUA 4MFIA 4ND9A 1SPIA 4I62A 2BJJX 3D4GA 1PDAA 1B0HA 3RLFE 3V5AA 1N04A 4DXUA 4JDFA 4U23A 5ITOA 3B6QA 1US4A 1JQFA 3GYYA 3CHGA 1Y9UA 1OLCA 3SEUA 4GWSA 4LN5A 2CEXA 1EZOA 4IO2A 1FPBA 4IO6A 3MWBA 4GQOA 4YKIA 4P3LA 1I6BA 4R75A 1Z7ME 3O2AA 5CMMA 1GV8A 1QULA 3C34A 3FASA 4MEVA 4XTCQ 3OELA 1MY4A 1XVXA 3E3KA 5H8QA 1GVCA 1A55A 1LFIA 2PT1A 1IITA 2WX9A 2D21A 4IGRA 3HFUA 3IOWA 3JV9A 2ZXTA 1IUDA 4NF0A 4XKNA 4OFOA 4NF5A 1VFDA 4P11A 4OTEA 4U1ZA 3QXMA 4NEDA 4YB7A 2B65A 4X04A 4KFQA 3TTRA 2I3WA 5A5XB 3DP4A 4MNCA 5I59B 2XXPA 3IAZA 4ZS9A 3LSXA 1B05A 3TTNA 1B7HA 5IZ3A 3ISPA 3JYRA 5LTCA 1DK4A 3Q26A 3Q25A 4F1UA 1MM6A 2A5TB 2QL3A 2ZYMA 4HTGA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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