2Y7IA

Structural basis for high arginine specificity in salmonella typhimurium periplasmic binding protein stm4351.
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
228
structure length
228
Chain Sequence
ASVSARTLHFGTSATYAPYEFVDADNKIVGFDIDVANAVCKEMQAECSFTNQSFDSLIPSLRFKKFDAVIAGMDMTPKREQQVSFSQPYYEGLSAVVVTRKGAYHTFADLKGKKVGLENGTTHQRYLQDKQQAITPVAYDSYLNAFTDLKNNRLEGVFGDVAAIGKWLKNNPDYAIMDERASDPDYYGKGLGIAVRKDNDALLQEINAALDKVKASPEYAQMQEKWFT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Arginine-binding protein
source organism Salmonella enterica subsp. enterica
publication title Crystallographic and Microcalorimetric Analyses Reveal the Structural Basis for High Arginine Specificity in the Salmonella Enterica Serovar Typhimurium Periplasmic Binding Protein Stm4351.
pubmed doi rcsb
molecule keywords STM4351
total genus 83
structure length 228
sequence length 228
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2y7iA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2y7iA02
3MZBA 4F31B 1LCTA 2P1SA 4U1OA 1US4A 1YPNA 3IB0A 1FTKA 4QRZA 3T22A 1B4HA 3G3IA 1M5FA 1XT8A 4QFPA 2ESNA 3ECRA 2X7QA 4EXKA 2DWAA 3O28A 4LQ2A 2DS9A 5I58A 2DSFA 3K2DA 3M3LA 1D4NA 2XXWA 3IAZA 1ZMGA 4X48A 2Z8FA 1YCJA 3DP8A 3SESA 2ZXTA 4XKPA 4MFIA 1ZIUA 4JWYA 3CIJA 1SBPA 1B3EA 2A5TB 4EDPA 1Z7ME 3FATA 2G93A 4ESXA 1T0KA 4YAHX 4P0GA 4G68C 5IKBA 1B05A 3FVGA 4OZ9A 4U4XA 4JB7A 1ZU0A 4OTEA 2O1MA 4Z7EA 3E4RA 3GZGA 4NEDA 3AXFA 4TLMB 4G77A 4Q5TA 2ONRA 4PFWA 3LSWA 3O29A 3TTNA 3QAXA 5H8HB 2R9JA 2F97A 1A55A 1OLCA 3O2AA 4H5FA 1B3GA 2REJA 3PD9A 1GVCA 4F19A 4F1VA 5TPAB 1ELJA 1QULA 3G7WA 1MXYA 3KG2A 3H4ZA 3PU5A 4O3AA 5FTIA 1JW1A 5AA2A 3B6WA 4G8HA 2UVHA 1MH3A 3MAMA 1Y4TA 5CMCA 2XD3A 2Z8EA 3LSLA 1US5A 3LC8A 4QSCA 2PT1A 4LZ7A 2AIXA 2DE3A 3HHFA 3FXRA 4FEDA 4N6PA 3FGSA 1OVTA 3H6VA 1DMBA 4KYSA 3UIFA 1FQFA 1FW0A 1A54A 1D9YA 1WDNA 2O1LA 4GQOA 1LGBC 1LSTA 4FORA 3TTRA 4NTLA 2B3BA 3WAEA 3MZ9A 4OEVA 4C1TA 4ZE9A 3SDFA 5EHMA 5FTHA 4R2BA 5AA4B 3L6HA 4I9DA 2DYXA 5FHMA 4DZ1A 2XX7A 5I2NA 1NNTA 1GV8A 3SEWA 4ZZAA 3PPOA 3IOTA 3OO7A 1MXZA 5BWJA 1O7TA 3K1MA 3IJXB 3B6QA 2F8DA 2QS3A 3LR1A 3SETA 3M8UA 1RYOA 2VHAA 1AOVA 2QMWA 5H8FB 1DSNA 3ZKKA 2F6GA 3LSXA 3WAFA 3UA8A 4ECFA 2GRVA 2DVCA 5DYHA 5H8NB 2E1SA 1EZOA 1O63A 4ELPA 5ITPA 1PB7A 3K4UA 4YKPA 1H76A 3N5LA 4EQ9A 1PEBA 4GL0A 3K02A 2NOOA 2UVGA 1VFDA 3LSFB 1Y4CA 3RT8A 3CR9A 4JBZA 1KWHA 3KN3A 1H45A 1JQFA 5DVFA 3K6WA 1D3KA 2Q9TA 3VLWA 5F7VA 4ESWA 2HFBA 1M5CA 3S9MC 1B3HA 1MXXA 3GXAA 2YPNA 1OVBA 3EF7A 1N3WA 2I49A 2LAOA 1JNFA 1B0LA 2ABHA 2V25A 4QSEA 2V84A 1Z7NE 3GLBA 2OWTA 5CMBA 3VVEA 1B5HA 1P1NA 4KFQA 2OJTA 2QS2A 3HV1A 1Q35A 1S9TA 3KGCA 1SYHA 2ZYNA 4GWOA 5AE4A 1BIYA 1MM7A 3K6XA 2ZNUA 4I62A 4BLAA 2UXAA 1Y1ZA 5H8NA 1R1NA 3PPRA 2HAVA 4OENA 4WKMA 3SEUA 4YZZA 3IO4A 4YU0A 2H99A 4ZEDA 4FIMA 4JSDA 4NF8A 3K6UA 1PC3A 1LFGA 3LBSA 1UTHB 1IZ1A 4H0WA 5K2YA 2I4CA 4NF6B 4RY1A 4F2QA 3U93A 4TLLB 3G3HA 1M5EA 4F3PA 2P2AA 2RC9A 2FNCA 1URGA 4BDRA 2GFEA 1I69A 1M5DA 5ITOA 3MUQA 2CZLA 1JEVA 2DOJA 4LATA 2ONKE 2O68A 3OELA 5I57B 4F22A 3EN3A 3K0VA 4YICA 3VLUA 4QFNA 4IGTA 4DXUA 2M8CA 1NL5A 4L17A 3DP6A 3OXNA 4BDMA 3H06B 4YMBA 1IQ7A 1I6AA 2VGQA 1IEJA 1NNFA 1OQGA 4RK2A 4G68A 4BDNA 3PGFA 4U21A 2PMSA 4O3CA 2REGA 3V89B 1SI1A 3MVXA 1Y3PA 1XC1A 3T9XB 2XXQA 1GTKA 1NFTA 3C36A 2VD2A 3CG3A 3CFZA 4OHNA 5TP9B 2Z8DA 1FQDA 3GBBA 3K6VA 3LUYA 1NH7A 2UYEA 3EHSA 4OESA 4F2OA 4PETA 1UTHA 4KYEA 4GVOA 1OIBA 3IR1A 4TOZA 4LQ5A 3TQLA 1WODA 3PUYE 3VLVA 4QFOA 3L6GA 4R6HA 3H6UA 3RN8A 3FV2A 4EQBA 3C4MA 3ODBA 3QUFA 3KN7A 5I57A 3W9WA 3MPLA 4F1UA 1B40A 1Q1KA 4FECA 3USDA 1EZPA 3QK6A 3MW0A 3PUWE 2V93A 1BKAA 3N6TA 2O6AA 2UVJA 4FATA 3FJ7A 4F3BA 2AL5A 1MPBA 2H25A 1TT1A 1XVYA 4LVQA 1USYE 3SKPA 3T9HB 4C1UA 3U8QA 3IB1A 4XIGQ 3Q27A 1BLFA 5ICTA 5EHSA 2PBWA 1JW4A 1EH3A 3FVKA 5KCJB 2RF1A 1B7HA 1QW0A 1CE2A 4BDLA 2BJJX 1UQWA 4HS7A 5A5XA 4DCYA 5FHOA 2O51A 1P99A 3PMVA 1P1QA 1VSOA 3E13X 2VOZA 2XX8A 5AA2B 1N7WA 3KOTA 5CI5A 4AB5A 3A3UA 5CBRA 4DE8A 1EZ9A 1LFHA 4ZE8A 2VD3A 2XXVA 3KJ7A 4RK9A 3KZGA 4MH5A 2OWSA 3HHGA 2G29A 4YKJA 2UYFA 1B7ZA 1F9BA 2FA7A 3HN0A 2THIA 3TELA 5B70A 4DXCA 2F36A 1MQJA 1MRPA 3N94A 4QHQA 3UN6A 4F3GA 5ISUA 2HCAA 1H43A 1R9LA 3Q29A 2ONSA 5I2NB 4KPTA 1S50A 1JVYA 3EQ1A 4MBPA 3HSTA 4OEUA 4ZS9A 3C33A 3FUZA 3BKIB 1Y3NA 3ZKLA 5KCJA 3VFJA 4G4PA 1QKBA 3O6GA 4PFYA 2QPQA 3T96B 1BTJA 4RA1A 5LOMA 3MWBA 4XKRA 1TFDA 4NF4A 1NKXA 5I84A 1IXCA 1ANFA 5ELVA 1A8EA 2DXRA 1LB8A 1DPPA 4O3BA 5J1DA 3PMWA 3R7XA 3K00A 4KHZE 3T9UA 3MVZA 1MS7A 1D9VA 5L9SA 4LZ5A 3IB2A 1SVXB 1S7YA 3D4GA 4RPOA 3OENA 2OZZA 1O64A 3OEKA 2R6GE 1QKAA 3VV5A 5L9MA 3JZJA 5DEXA 2DWJA 4NMYA 4H65A 1L5TA 4YMAA 4F3SA 3IORA 4PQJA 4P11A 3GBAA 3SEXA 1P1WA 3MC2A 3H6TA 1FTJA 2WKYA 1AH5A 4YB6A 3DM0A 4MLQA 1Y9UA 5CC2A 3H7MA 3CSGA 2F34A 2DE2A 4XKNA 3ONMA 1MQHA 4N07A 3TAJA 4R6YA 4PFUA 1NH8A 4RYAA 2QJEA 2Q88A 1MQGA 4XXUA 4F1YA 3O6IA 3MPKA 3VVDA 3U92A 1PBQA 3M3FA 2ZNSA 1SI0A 2H4IA 1N3XA 1SW4A 1B1HA 2PVUA 3OOAA 1UTBA 2I58A 1B5JA 4YKIA 4H5GA 3K1NA 1JW5A 2X7PA 4ZEBA 4OETA 3TCGA 2XX9A 4RPNA 4JSOA 3G3FA 1I6BA 3FJGA 2I4BA 1NNKA 1USYH 3E9XA 3TEPA 1SW2A 1MDP1 2HEUA 1BP5A 4R74A 3MVWA 4PFTA 2H5YA 5ICQA 2Q2CA 4KD5A 1LBCA 1JVXA 1II5A 3UGWA 2OLBA 3FXQA 1TWYA 4NF8B 2I0BA 5AA3A 1CB6A 3OSRA 3TCHA 2QMXA 3PPNA 3BFUA 1NNPA 5CMMA 3HO7A 1SYIA 3C34A 3O66A 4RNSA 3MP6A 5BUUA 1B6HA 3KJTA 1GR2A 5AA1A 4H67A 4WEPA 5DTBA 4PE5B 4RJZA 1AMFA 3V5AA 1DTGA 1N7XA 4GOTA 2NUVA 2PYYA 4U22A 1B2HA 3TUSA 1B58A 4ZEKA 1QUJA 2RINA 3IL1B 3I6VA 3FXUA 4G68B 2PX1A 1ZKBA 1DPEA 1A8FA 4ELRA 2HQ0A 5FHNA 4ZEFA 4IO6A 4OWDA 2KLFA 3Q28A 3FVOA 1VR5A 2D5WA 4RXLA 2Q8JA 5M2VA 3Q26A 1MG1A 1B4ZA 3MBPA 4YKKA 3RLFE 2XXTA 3Q25A 3A09A 1GGGA 3IOWA 2QRYA 3S9NC 4BDQA 5JTYA 3D4CA 4E0XA 2GHBA 5L9OA 2CMOA 3CI8A 4ELQA 2F35A 2XXUA 1UIUA 4IB2A 5CMKA 2O69A 5CRYA 5HBCA 3OO8A 4IO3A 4EF1A 1B3LA 2DQVA 3THIA 4OERA 4GD5A 3IJOB 1WVJA 4JWXA 4Q30B 2QS4A 4P0IA 2YLNA 5I56B 2DVZA 4FEBA 4FE8A 4GL8A 1B46A 3FZVA 4QFLA 2R71A 2A5SA 4U23A 3TCFA 1XS5A 1UIVA 1SW1A 4LZ8A 3RGYA 3UORA 3ILUB 3UP9A 1SW5A 1FQCA 2OCUA 1SQYA 3FIRA 1MY4A 4DXBA 4HW8A 3KEIA 4M4GA 3U1OA 1HSJA 3IOVA 3G3GA 1DTZA 5A5XB 3T9VA 2D21A 4OVJA 3H03A 4U4SA 5KZTA 4PP0A 2ZMBA 1IXGA 2E0SA 3T93B 1FQAA 4Z0IA 2ZYMA 1A40A 1XHYA 3QSLA 5TU0A 3FJMA 3SEYA 4TQUQ 1N76A 4R2FA 3OSQA 1LCFA 3TFLA 2H98A 2OK2A 2RCAA 1FCKA 5I56A 4OYVA 1J1NA 5CM6A 3DP4A 4DIGA 4LONB 4AB6A 3MJNA 3VVFA 4OXVA 4DDDA 3H6WA 1YAEA 1TXFA 3CRBA 3FD3A 3C35A 5CBSA 2HXWA 1JEUA 1B0HA 3R6UA 4IGRA 5JK4A 1SD3A 3U94A 5HPQA 3I3VA 2HZKA 2RKMA 1MQDA 3RTFB 1LFIA 1ZLQA 1OQHA 4GXAA 1SDXA 1ZJLA 3O6HA 2RCBA 1FQBA 5DT6A 3N6UA 4R73A 4NF4B 4I8CA 3HPIA 3SEVA 2Y84A 4OFLA 3IK6B 4KCCA 1IUDA 1TFAA 3PUXE 4IO7A 4IY5A 2FYIA 3PUZE 3QYTA 3TMGA 3K01A 2RC7A 1LAGE 3VE1B 2HZLA 2NVUB 1B5IA 4XTCQ 2ANJA 2O7IA 3RT6B 4WEDA 5DEXB 1H44A 3QIMA 3PPQA 1MY2A 4EXLA 2DP8A 1QUKA 3FASA 3HCQA 3DLNA 1LLSA 5H8SA 1AL3A 1MDQA 3PUVE 3RUMA 1B51A 3N26A 1IXHA 4POWA 5DVJA 2I3WA 3VXBA 3CFLA 1RYXA 4X1DA 3KOSA 3OD7A 1LAFE 3V8XB 3RNNA 4LP2B 5KDTB 4HCWA 2B65A 4EQ7A 2F7BA 1N04A 2DXYA 1UTBB 2ZYKA 3C32A 3E3KA 2IA4A 3MVYA 5H8QB 3MZ1A 1VE4A 3G3JA 4UA8A 3CFXA 3C31A 3F11A 2X26A 4IO5A 3PD8A 2O84X 3BFTA 1XVXA 3EHUA 2D3IA 3U72A 4R72A 2Q2AA 3UK4A 2A5TA 4N13A 4NF5B 1MY1A 2Y7WA 2XD2A 4MLVA 2I48A 1PB9A 1QJMA 1Y3QA 5EYFA 1ATGA 2V3TA 4FJPA 2QL3A 2P0SA 2VP1A 1XOCA 2ZNTA 2GH9A 1IXIA 1MM6A 2YJPA 5KDTA 2Y7IA 4GXSB 5H8HA 4ISUA 5HM4B 1IIWA 4YB7A 5I2KB 4XKQA 4K3FA 4ZDMA 5TPAA 5L8DA 1FTOA 1MQIA 2I0CA 3TZAA 4OFJA 4R75A 5H8QA 4POXA 3R26A 1POTA 3TTMA 1EU8A 4GF8A 3TQWA 4BDOA 3S2VA 2F7CA 3MP1A 1IITA 4UACA 1P1OA 2O7UA 3PMXA 1N84A 4R6KA 3SERA 2F7AA 4X1BA 2Q89A 2XXRA 4F39A 3JYRA 4NF5A 4HCYA 1QUIA 3DELB 3TTKA 3BBRA 3B6TA 1FTMA 1VFEA 5JTYB 3KN8A 3W15C 4KR5A 3OO9A 5AA4A 5JEIA 3TKDA 3KBRA 5I59B 4LUBA 1A99A 2OBGA 4JWOA 3P7IA 4ZEIA 1URDA 4KCDA 3A3CA 5I2KA 3KSJA 4G2ZA 1ZTYA 5AA2D 1LBBA 2F78A 1FQEA 4ZECA 1PB8A 4R9FA 1Y1MA 4QF9A 3W9VA 4DLDA 1LAHE 1NMUA 4IY6A 1A7LA 1YTVA 2B3FA 5F1QA 4KI0E 3O9PA 1Y20A 1POY1 3EHTA 1HSLA 2V3UA 5H8FA 3B7DA 3FVNA 4F18A 4ELOA 4M1VA 2AYSA 4H1XA 4GRKA 2XXPA 1R6ZA 3PPPA 4NWCA 3CSBA 4ND9A 4KYDA 1LB9A 4X9TA 1OMPA 5B7DA 3VXCA 4F29A 4THIA 3TODA 3TPAA 4H6DA 3PV0E 4OMBA 2XXYA 5IAIA 1I6QA 2H9BA 1PDAA 2F6PA 2XXHA 4ONYA 1B7UA 4U2RA 3MQ9A 3IO6A 4R9GA 5I59A 3IOUA 3I5OA 3MP8A 2W7YA 4G8NA 3KSXA 1FTLA 3RTWB 5DVIA 2DE4A 3OEMA 4NE4A 1B1XA 3ZSFA 3H3GA 1MXVA 2QSXA 2I6EA 1P1UA 1RKMA 3TTLA 4EF2A 4QSDA 4AQ4A 4GFRA 2F5XA 1PBPA 2XXIA 4HTGA 4QFKA 4OQOA 1AIVA 3EPEA 4E0WA 4JDFA 1B52A 4Q8RA 3RY3A 3CG1A 2Y7PA 3JV9A 2PT2A 4H8JA 3CVGA 2I3VA 3QUJA 4KQPA 5K2XA 4GLIA 1MPDA 4OFOA 3S9EA 3TDJA 1MXWA 4EUOA 4G8MA 3K1PA 4IO2A 4JXIA 4DCXA 4WXJA 1HSEA 3G3KA 1H3DA 3FV1A 1M5BA 2NXOA 1MY3A 2GHAA 4H8IA 4NWDA 3IX1A 1OLAA 4FAJA 3C9HA 3RPWA 3QXMA 3T66A 3OO6A 1MXUA 2IEEA 2NWJA 1MPCA 2QS1A 3ZS6A 2Y7KA 2V3QA 3KFMA 4NF6A 2ALUA 1MY0A 3V83A 4C0RA 2XHDA 2XXXA 5I58B 1B32A 1MH4A 4YB5A 3O97A 4Q0CA 4LA9A 3ILTB 1QVSA 3RQTA 4IO4A 2UVIA 3VDFA 4U1ZA 3S4UA 3OMBA 2Y7RA 1B3FA 1URSA 2HAUA 2ZYOA 2Z23A 3TYHA 1DOTA 4MF3A 3S9LC 1B9JA 1LAXA 4I1DA 1JETA 1N0TA 1ZBMA 2RC8A 1R9QA 2AL4A 2DWHA 4ZZEA 2DWIA 2Z22A 5TP9A 4GIZA 3M3KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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