2ZNTA

Crystal structure of the ligand-binding core of the human ionotropic glutamate receptor, glur5, in complex with a novel selective agonist, dysiherbaine
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
total genus 82
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zntA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zntA02
4PE5B 1UTHA 3FXUA 5I2KB 3VVFA 3RTFB 1MS7A 3GLBA 2ZMBA 1MXUA 2NOOA 3KN7A 4POXA 4G68C 3C36A 4R75A 3V89B 1AIVA 4FEBA 4Q30B 4U2RA 1L5TA 1N7XA 4BDNA 1N0TA 5JTYB 2ZNSA 3JV9A 3TQWA 1M5FA 2DQVA 3H6WA 3CSGA 2A5TB 4DE8A 5KCJB 4GL0A 2AL4A 1CE2A 1Y9UA 4KCCA 3UA8A 2AIXA 3MP6A 5EHMA 3S2VA 2KLFA 2YPNA 4DCXA 1Q35A 2F6GA 1SQYA 2DE3A 4ELPA 5FHNA 2VD3A 1P1OA 1SW2A 1SW5A 4FAJA 3LSLA 1GVCA 3IO4A 3MQ9A 3QUFA 2XXVA 3S4UA 1ATGA 3FIRA 3VLUA 2X26A 1O63A 3THIA 1LGBC 1B05A 1M5DA 3T9UA 3VDFA 3TEPA 2ESNA 2UVHA 4F1VA 2YJPA 3FVKA 3IL1B 3OELA 2VGQA 3C32A 3LR1A 4TQUQ 4JDFA 4I8CA 3B6TA 4F1UA 2Q2CA 3I3VA 1QULA 4ZZEA 2VOZA 3OO8A 4E0XA 4KPTA 3FV1A 1NL5A 2DXYA 3PGFA 5I59A 3OO6A 5B7DA 1D4NA 2I49A 1ELJA 2RINA 4JXIA 4OZ9A 1MRPA 4EF2A 5KDTB 4H1XA 3U1OA 3HSTA 2HQ0A 2DWHA 5IKBA 2FNCA 1Y3PA 1MH3A 1I6QA 2V93A 3LSWA 4TLMB 1AMFA 4IO7A 3B6WA 1IXCA 1A8EA 1KWHA 2QS4A 4NEDA 1DTZA 3PMVA 2RKMA 3N6TA 4GVOA 1HSEA 3KJ7A 3G3IA 4U23A 4ND9A 4QRZA 4KCDA 1MY2A 3WAEA 5LOMA 4NWCA 3K02A 3CR9A 1S7YA 3KSXA 3CG1A 1WDNA 2PVUA 2FA7A 2DE4A 4ZZAA 4LZ8A 4ECFA 1B52A 3K1PA 3T22A 2O84X 4G68B 3RPWA 1M5EA 4QHQA 1D9YA 1FQCA 3TKDA 2I0BA 1MDQA 4MFIA 3FVGA 2CZLA 4XKQA 4KI0E 4MLQA 2E0SA 1B1XA 1UTBB 1JEUA 3RLFE 1URGA 1GTKA 1OLAA 2FYIA 2ZNTA 1FTKA 4XTCQ 3SDFA 3HPIA 4I9DA 5FHOA 1F9BA 1Y3NA 1A40A 1XT8A 1OQHA 5AA2B 1OQGA 1POY1 2YLNA 1GR2A 1LCFA 1JETA 3OEKA 3CRBA 3OSRA 4DXCA 1FQEA 3LBSA 3ZKKA 1PDAA 1OMPA 1MDP1 3R6UA 4HCWA 4IB2A 3O9PA 3T9VA 3G7WA 1QUIA 3U94A 3TCHA 4GF8A 4G77A 3MVZA 3RTWB 2V3QA 5H8SA 3PPQA 3FD3A 5AA4A 4PETA 2UVIA 4F1YA 2ZYMA 4OYVA 2Z23A 3LUYA 3TQLA 5AA3A 5I57A 3FASA 1Y4TA 3RT8A 2REGA 4FJPA 4IO5A 1J1NA 1BIYA 1LBCA 3ODBA 3V8XB 1UIVA 1SW4A 4ESWA 3UIFA 1B1HA 5CI5A 1NNPA 1Z7ME 4PP0A 4OWDA 4F19A 1CB6A 5F7VA 3K01A 1POTA 5F1QA 3FJ7A 5BWJA 3FJMA 4ELQA 2R6GE 4BDRA 4ELRA 1UIUA 1N3WA 3L6GA 3UK4A 3H4ZA 5DEXB 3FVOA 2P1SA 4F3PA 4NE4A 3LC8A 4YZZA 1LAFE 4QFKA 1MH4A 3HN0A 5H8HB 3C4MA 2B3BA 4QSEA 2H25A 1MQIA 1A8FA 2XD2A 3KFMA 4ONYA 1XS5A 3E3KA 1URDA 4IO3A 4U4XA 2VP1A 2AL5A 1SDXA 2D3IA 4GD5A 3RUMA 4NF5B 4EXLA 3QUJA 1O7TA 3K6XA 2O6AA 1MY4A 1LBBA 4OERA 2I48A 1B5IA 2XXRA 3Q26A 2XXXA 4IO6A 4OTEA 1DPEA 2UYEA 3PUWE 1M5CA 1SYHA 3PU5A 1ZIUA 5CMBA 1B5JA 1FW0A 5I2NB 3EHTA 1JQFA 3GBBA 5L9SA 1FTLA 3IR1A 4OEVA 2Y7PA 1MM7A 3KN3A 5A5XA 2XHDA 5IAIA 1ZLQA 4L17A 3DP6A 2OWSA 1ZTYA 1BKAA 1PBQA 2XXIA 2ZYOA 4OMBA 5EYFA 4H65A 3W15C 1NNKA 4F39A 4JWOA 1MY0A 2UVGA 2F5XA 1ZU0A 4EXKA 3SEVA 4LUBA 2ABHA 2XX9A 5FTHA 1PB7A 1A55A 4LP2B 3TTNA 2GRVA 3QSLA 3T66A 4LZ7A 2O69A 4GOTA 4DLDA 2ONKE 1YTVA 1P1QA 2Q8JA 4JSDA 4OEUA 3E4RA 5I56B 1H44A 1QW0A 3OO7A 1B3LA 3PUXE 4UACA 3O6GA 2P0SA 3CG3A 1QKBA 3JZJA 3PUYE 2DWIA 5H8NB 1Y1MA 2F7AA 3HO7A 4ZEFA 3R7XA 5I58A 3M8UA 1I69A 1LFIA 3S9EA 2F6PA 4KHZE 2I3WA 1VSOA 3LSFB 3H06B 4O3AA 2Y7IA 4ZS9A 4KYDA 2ONSA 4H0WA 2I3VA 2F8DA 5CM6A 1PEBA 4THIA 2I4CA 3L6HA 1US4A 1PBPA 3A3UA 1SVXB 4C1UA 1NMUA 1LLSA 1HSLA 2R9JA 3PD9A 2IEEA 1RKMA 1PB8A 3FGSA 4E0WA 1BLFA 3VXBA 3IO6A 1MM6A 4Z0IA 1US5A 3IOWA 1LB8A 5HM4B 2OLBA 5I59B 5I2KA 3VVDA 4R74A 2PBWA 1R1NA 1YAEA 4OVJA 1JW1A 3ONMA 4IY6A 1A99A 1DMBA 2XXTA 1B7UA 3BFTA 3C9HA 3OOAA 4X1BA 3KBRA 5DVJA 4H67A 3ILUB 1VR5A 1MXYA 1B2HA 2RF1A 2DS9A 4RJZA 5JTYA 2E1SA 4QSDA 2Q88A 2DWAA 3C34A 3MZ1A 4HW8A 4GFRA 1ZJLA 2A5TA 1QUJA 4G8NA 5CMMA 4YMAA 3BKIB 4QFOA 3IOVA 4POWA 4DXUA 4KR5A 4R72A 1DPPA 2XX7A 1Y1ZA 1TT1A 1NNFA 4LATA 5EHSA 2D21A 5TPAA 4MF3A 2GH9A 3IB2A 3E13X 3G3GA 4XIGQ 2PX1A 2H99A 2Y84A 4XKRA 1JVYA 2QL3A 3C33A 1R9LA 4FECA 2X7QA 1Z7NE 5H8QB 1B5HA 4IY5A 5K2XA 1WVJA 2QS1A 3TAJA 3IOUA 3V83A 4M1VA 5ICTA 3Q28A 1NFTA 5JK4A 3SERA 4R9FA 4NF8B 4EQBA 4LQ2A 3O2AA 4IO4A 4R2BA 2XX8A 4EQ7A 4YKKA 3N26A 3HCQA 5CMCA 4FIMA 1P1WA 4RY1A 1SI1A 3RT6B 4WEDA 2ZNUA 3IX1A 5DTBA 1IEJA 1SBPA 4UA8A 1B51A 5I84A 2O51A 2PT2A 3PV0E 4G8MA 3TCFA 4PFTA 4RA1A 1OVTA 4XKNA 3W9VA 2M8CA 4EUOA 4TOZA 3ZS6A 3CIJA 3KOTA 1IUDA 2P2AA 3OSQA 1MPCA 3PPPA 1B0LA 4NF4A 3U72A 4BLAA 4U22A 2Z8DA 3B6QA 3MP8A 4HTGA 3MC2A 1IQ7A 2HZLA 1USYE 4ZE8A 5ITOA 4RNSA 1H76A 1SW1A 4R73A 4LZ5A 4XXUA 4QF9A 1SD3A 2B3FA 2O7UA 1DSNA 4G8HA 3D4CA 4G68A 2I4BA 1MXZA 3TODA 5L9MA 4FATA 2G29A 4BDOA 2BJJX 4X1DA 5KZTA 2H98A 2NVUB 4XKPA 1UTBA 1B4HA 4QFLA 1LFHA 3GBAA 1B0HA 2Z22A 4YU0A 3A09A 4ZE9A 4H5GA 3LSXA 1LCTA 4RYAA 4ELOA 3DP8A 4R6YA 5AA2A 4Z7EA 3QK6A 4H6DA 3OMBA 3EHSA 5L9OA 4QFPA 1JNFA 3OENA 2HFBA 1EZPA 1A54A 1MG1A 3AXFA 3R26A 4RK9A 3EN3A 3FZVA 3K0VA 4EF1A 1LAXA 4P0IA 4LQ5A 1IXHA 3FV2A 4IGTA 5H8FB 3DLNA 1TXFA 2XXUA 1FQFA 3I5OA 4G2ZA 2OWTA 3H3GA 3MUQA 4WEPA 2IA4A 4YMBA 1M5BA 2QRYA 3TTMA 4FE8A 3EPEA 3MWBA 4OESA 1A7LA 1Y20A 1OLCA 3KN8A 3QAXA 4HCYA 2ZXTA 4FEDA 4R9GA 1XVXA 2QPQA 2OZZA 1PB9A 4BDQA 4R6KA 2F36A 4RK2A 3K4UA 1B40A 4OFJA 2HEUA 1XOCA 3D4GA 2H4IA 2DE2A 1XHYA 3WAFA 3ILTB 1GGGA 2F35A 4NF6B 1EH3A 1FQAA 3T96B 1Y4CA 2DSFA 2O68A 4U4SA 1SI0A 4N13A 4R6HA 2QSXA 2GFEA 3CFXA 3MPLA 1FQDA 2ONRA 1BP5A 1AL3A 5DEXA 5FTIA 1FQBA 1OVBA 2GHBA 2Z8EA 3PD8A 2NXOA 4N07A 4AB5A 2X7PA 2Y7KA 4KYEA 2PT1A 2A5SA 5H8HA 3BFUA 1RYXA 3FATA 3ECRA 2DP8A 4KQPA 4NMYA 3MVYA 3SEYA 3HHFA 1FCKA 4NF5A 1UTHB 3TPAA 3UN6A 4HS7A 3O28A 3K6VA 4F3SA 5I58B 3IOTA 1VFEA 3USDA 5ICQA 1QJMA 2VD2A 1B3FA 4EQ9A 2AYSA 4JB7A 4KYSA 2REJA 1LSTA 3O66A 1Y3QA 5I2NA 2V25A 4OFLA 4N6PA 1MPDA 3T93B 5CMKA 3DP4A 3H03A 4LA9A 3K2DA 3MPKA 4F3BA 3DELB 2UVJA 3U8QA 3UORA 3N5LA 3MJNA 1URSA 2DVCA 1OIBA 1ZMGA 3OD7A 5TP9A 5FHMA 3C35A 1B3EA 3EF7A 3PPRA 2QS2A 5L8DA 1DOTA 3KEIA 3FXQA 4C0RA 1IITA 3FJGA 3CI8A 3TFLA 1B58A 1JW5A 3KSJA 3GXAA 4Q0CA 2B65A 3Q25A 4DZ1A 2UXAA 3TTRA 1R6ZA 5DVFA 3SEXA 1S50A 4RPOA 2HAVA 3EHUA 3SKPA 3TDJA 5CBRA 1I6AA 5I56A 4X48A 3T9XB 4KFQA 1GV8A 4PFYA 1NNTA 4F29A 1B7HA 4F18A 4H5FA 5TU0A 5H8NA 5ISUA 3MZBA 2ANJA 1TWYA 5TPAB 4WXJA 5J1DA 3SEWA 2Y7RA 1N3XA 1YCJA 4OXVA 4BDLA 2XXYA 1MY3A 2OJTA 3TTLA 1IIWA 1B9JA 5DT6A 4OENA 4AB6A 1B6HA 1BTJA 4U1OA 5KCJA 3UGWA 3GZGA 1IXGA 3KG2A 3VXCA 2WKYA 4WKMA 2D5WA 2OCUA 1VFDA 3BBRA 3KOSA 2ZYNA 1JW4A 3VLVA 5BUUA 3VV5A 1MQHA 4JWXA 3SETA 1NKXA 2O7IA 4X9TA 4GXSB 4GIZA 3K6WA 3Q29A 1MXWA 1RYOA 2XD3A 3G3JA 4KD5A 1B3GA 1ZKBA 4AQ4A 4Q8RA 4FORA 3S9LC 4G4PA 3KGCA 1B7ZA 3QXMA 4GQOA 4MH5A 1NH8A 3CFLA 3DM0A 4PFWA 1QVSA 2H9BA 3H6VA 3O97A 4H8JA 4MBPA 4NF4B 3PPOA 3CFZA 3UP9A 4GL8A 2F97A 2Q89A 3IJXB 3FVNA 2Q9TA 5CC2A 3CSBA 4PQJA 1B46A 5KDTA 2RC7A 2F34A 2R71A 4F22A 3VFJA 1R9QA 3K1MA 1EZ9A 2XXHA 4RXLA 3TCGA 1QKAA 4F2QA 1H43A 3HV1A 4ZEKA 2GHAA 1FTOA 2HCAA 5DYHA 5H8QA 1MXXA 4LONB 1AOVA 4RPNA 2NWJA 1P1NA 1T0KA 1N04A 1WODA 3IORA 1LB9A 4ZEIA 3TYHA 4NF8A 3PUVE 4YB5A 1EZOA 1P1UA 3IAZA 2VHAA 2V3UA 4OQOA 3RN8A 4OFOA 2HZKA 2UYFA 3K00A 4Q5TA 5CRYA 2F7CA 3VE1B 3O6HA 1O64A 3RQTA 5AA4B 4YICA 1N76A 3MP1A 1QUKA 3G3KA 3P7IA 4P0GA 3K1NA 1EU8A 2QMXA 1VE4A 4ZEBA 3S9NC 5I57B 4BDMA 3JYRA 3N6UA 2QMWA 3MW0A 3OO9A 2HAUA 4R2FA 3TTKA 3FUZA 1II5A 3KZGA 1ANFA 3SESA 2THIA 3IJOB 3Q27A 4U21A 2DWJA 1MQJA 3PMWA 2RCAA 1LAGE 1N7WA 4DIGA 3U93A 3PUZE 2LAOA 5AA2D 1H45A 2Q2AA 1TFDA 1PC3A 3EQ1A 1HSJA 4F3GA 3SEUA 2OK2A 1ZBMA 2Y7WA 1IZ1A 4OHNA 1I6BA 3HHGA 5B70A 2H5YA 3N94A 3MVXA 1D9VA 4NTLA 2I0CA 4K3FA 3VLWA 1JEVA 1YPNA 1S9TA 3MZ9A 2OBGA 4I1DA 1MQGA 1B32A 2G93A 3IK6B 4DDDA 2RC8A 3E9XA 2PYYA 4QFNA 3TMGA 2QJEA 4O3BA 3H7MA 3IB1A 2W7YA 4NWDA 5JEIA 1SYIA 2DXRA 1MY1A 4JBZA 2O1MA 2F78A 3TUSA 4U1ZA 4F2OA 3RGYA 4H8IA 4JWYA 4GRKA 4ZDMA 5ITPA 2XXPA 2DVZA 3C31A 4YB6A 1XC1A 3S9MC 3W9WA 4O3CA 3T9HB 4YKJA 1JVXA 3PMXA 5DVIA 4LVQA 1IXIA 5A5XB 1FTJA 5HPQA 1LFGA 1MPBA 2I6EA 3H6UA 5AA1A 1B4ZA 5M2VA 2PMSA 3M3LA 4F31B 1B3HA 4DCYA 1Q1KA 4IO2A 4GXAA 2XXWA 3U92A 1XVYA 3H6TA 5H8FA 1UQWA 2RC9A 3TELA 1MXVA 1H3DA 1USYH 4I62A 3I6VA 4IGRA 3G3FA 1NH7A 3O6IA 3M3KA 3FXRA 2DYXA 3G3HA 5ELVA 2RCBA 2V84A 3KJTA 1D3KA 4GLIA 4EDPA 2Z8FA 4PFUA 5AE4A 5CBSA 3ZKLA 4ZEDA 3O29A 1LAHE 3IB0A 2HXWA 2F7BA 5HBCA 1P99A 4YKIA 4OETA 3MVWA 1AH5A 4YB7A 3A3CA 4GWOA 3V5AA 4MLVA 1FTMA 2O1LA 3CVGA 3MBPA 3RNNA 4JSOA 4TLLB 2DOJA 5TP9B 2I58A 3QYTA 3PPNA 4M4GA 1TFAA 2V3TA 4YKPA 3VVEA 4NF6A 1DTGA 3M3FA 3OXNA 3B7DA 4QSCA 4ESXA 3MAMA 1MQDA 4ZECA 1N84A 4ISUA 4C1TA 2CMOA 2XXQA 4DXBA 2ZYKA 3QIMA 3ZSFA 3RY3A 4P11A 5K2YA 2NUVA 4YAHX 3F11A 3OEMA 3K6UA 2ALUA 3TZAA 2QS3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PE5B 5IZZA 1UTHA 4MAGA 3FXUA 5I2KB 3VVFA 3RTFB 1MS7A 3GLBA 2ZMBA 4GX4A 1MXUA 2NOOA 3KN7A 4POXA 4G68C 1AWBA 3C36A 4R75A 3V89B 1AIVA 4FEBA 4Q30B 4U2RA 1NV0A 1L5TA 1DBZA 1N7XA 4BDNA 1N0TA 5JTYB 2ZNSA 3JV9A 3TQWA 1M5FA 2DQVA 3H6WA 1EYIA 3CSGA 2A5TB 4DE8A 5KCJB 4GL0A 2AL4A 1CE2A 1Y9UA 1FPEA 3PTYA 4KCCA 3UA8A 4PFRA 2AIXA 3MP6A 2Y5LA 5EHMA 3S2VA 2KLFA 2YPNA 4DCXA 1Q35A 2F6GA 1SQYA 2CZKA 2DE3A 4ELPA 3E79A 5FHNA 2VD3A 1P1OA 1NV6A 1SW2A 1SW5A 4FAJA 3LSLA 4OVSA 1GVCA 3IO4A 3MQ9A 3T0JA 3QUFA 2XXVA 3S4UA 1ATGA 3FIRA 3VLUA 2X26A 1G0IA 1O63A 3THIA 1LGBC 1B05A 1M5DA 3T9UA 3VDFA 3TEPA 2ESNA 2UVHA 4F1VA 2YJPA 3FVKA 3IL1B 3OELA 4OVQA 2VGQA 3C32A 3LR1A 4TQUQ 4JDFA 4I8CA 3B6TA 4F1UA 2Q2CA 3I3VA 1QULA 4ZZEA 2VOZA 3OO8A 2GQ1A 4E0XA 4KPTA 3FV1A 1NL5A 2DXYA 3PGFA 1RDZA 5I59A 3OO6A 2BJIA 5B7DA 1D4NA 2I49A 1ELJA 4GWUA 2RINA 4UABA 4JXIA 4OZ9A 1MRPA 4EF2A 5KDTB 4H1XA 3U1OA 3HSTA 2HQ0A 2DWHA 5IKBA 2FNCA 1Y3PA 2XXKA 4GX3A 4P9KA 1MH3A 1I6QA 4GX6A 2V93A 3LSWA 4TLMB 1AMFA 4IO7A 3B6WA 1IXCA 2QFLA 1A8EA 1LBXA 2FIXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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