2ZNUA

Crystal structure of the ligand-binding core of the human ionotropic glutamate receptor, glur5, in complex with a novel selective agonist, neodysiherbaine a
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2znuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2znuA02
2OWSA 2P0SA 3E3KA 3T9UA 3OSQA 1IQ7A 1SW4A 3U94A 3VLWA 4Z7EA 3H6VA 4ESWA 4ZEIA 1MY1A 3IOUA 4JDFA 2PYYA 2OWTA 2XXHA 4GXAA 3G3FA 3TTNA 1QUIA 1POY1 1MY4A 4RYAA 4NEDA 2V84A 3FXRA 4PFUA 4LATA 1B9JA 2BJJX 4YB6A 3FV2A 2XXWA 4OFOA 1Y20A 3VVEA 4G8NA 4YKIA 2F5XA 3IORA 4TLMB 3FXQA 4GIZA 2VGQA 1JEVA 2F36A 3G3GA 3RLFE 5A5XA 1GTKA 4RNSA 2ALUA 4AB6A 4OERA 3MJNA 3PPOA 2QS1A 3P7IA 4ESXA 3V8XB 5TP9B 1NNFA 3RT6B 2YPNA 2DSFA 3TTRA 3HV1A 1A99A 3LBSA 4PE5B 4PQJA 3QK6A 3HHGA 4IO5A 3FVOA 5I56B 1EZOA 2O7UA 1OVTA 3MP8A 3T22A 3OSRA 4L17A 4ELOA 2XXUA 3HN0A 3KFMA 3MVWA 4BDOA 3K6XA 1O7TA 3N6UA 5FHOA 3SETA 1ZU0A 5JEIA 4F1YA 1B32A 2GRVA 3CI8A 4Q30B 3AXFA 3FASA 2DXRA 3KZGA 2B65A 2QJEA 5ITPA 1Y3QA 4N13A 3KGCA 1FQCA 1N0TA 5JTYB 2UVJA 4RPOA 1IXGA 1OIBA 4ND9A 1T0KA 1B5HA 3PMXA 4AQ4A 4F3BA 4DDDA 5F7VA 4ZZAA 4IGTA 4M4GA 2I4BA 1NL5A 3KOSA 1S9TA 3SEWA 2GH9A 2Q2AA 4O3AA 3LSLA 4YKKA 3MZBA 4OYVA 2PVUA 2THIA 4QSEA 1CE2A 2Y7WA 1B6HA 3IX1A 4U23A 1Y3NA 5B70A 5I58B 4KQPA 4R9FA 5IAIA 1VSOA 3UA8A 4EUOA 3W15C 1QULA 3EHTA 2X26A 1EZPA 2IA4A 3C32A 2UYEA 1FTKA 2LAOA 4U4SA 1MQIA 4KI0E 2PBWA 3B6TA 3F11A 5H8QA 4U2RA 1NMUA 4ECFA 3U8QA 2GFEA 1PBQA 2XXPA 1B3HA 2Z8EA 4IO7A 3Q26A 5I2NB 3WAFA 2HFBA 1TFDA 3Q29A 4FATA 2Q9TA 1QUKA 1B5JA 4TLLB 1P1UA 1RKMA 3PPQA 2PT1A 1LAHE 1P99A 4RA1A 3N6TA 2I58A 5LOMA 1I6BA 1Y3PA 4Q0CA 1NNKA 1MPDA 2DYXA 4N07A 3IJXB 3B6WA 1FTMA 5I59B 3FATA 1BP5A 2A5TA 1YAEA 3IK6B 1JETA 1OQHA 4UACA 1R9QA 2UVHA 3K02A 4OZ9A 1GGGA 2X7QA 4FEDA 5DEXB 4QFKA 3TZAA 3KJTA 3KBRA 4AB5A 4H1XA 1URSA 4YICA 3FIRA 4H5GA 4H8IA 1IIWA 2O69A 1JW4A 4XKQA 4H65A 2XXIA 2NOOA 4EQ7A 5I57A 4ZZEA 1N3WA 1B46A 3MZ1A 5J1DA 4G8HA 3RNNA 2QS3A 4R6HA 1IXCA 1VFDA 4EQBA 4BDLA 5BWJA 4GL8A 4R72A 4LZ8A 1SD3A 4OMBA 2OK2A 4JWXA 3ZKLA 1I69A 4POXA 4JSDA 1PB7A 3K6WA 3SEXA 3D4CA 4P11A 4F3PA 5FTIA 3UN6A 2F7BA 3C34A 3ONMA 4Q8RA 2I4CA 2DXYA 1D9YA 2AL4A 3FZVA 1MPBA 1JEUA 2Z23A 1ZMGA 4ELQA 4IY5A 4U1OA 2I3WA 4NF4B 2A5SA 2OZZA 2W7YA 1XVXA 3ZS6A 4OTEA 2REGA 1AIVA 1R9LA 5TPAB 1P1WA 3B7DA 3KSXA 1FTJA 1MG1A 3OO6A 4KYSA 2ZXTA 3C35A 2H99A 3VE1B 2NUVA 4LA9A 1SI1A 1GV8A 4P0IA 1A7LA 4YU0A 1P1NA 2F7AA 2UYFA 1SDXA 2R9JA 3H06B 3Q27A 2RCAA 3FVKA 3HO7A 2D5WA 3MP6A 3D4GA 2HZLA 3IO4A 1WDNA 1B1XA 2Q2CA 3GBAA 3MQ9A 5L9SA 1NH8A 5TU0A 4E0WA 3S9LC 3H4ZA 1MY2A 2ZYNA 3IOWA 2B3FA 2XXVA 4THIA 1XVYA 4BDMA 3RY3A 1USYE 3M8UA 3O66A 4G68B 3TELA 1IITA 2XD2A 2G29A 4G8MA 5I2KB 3MW0A 4OEUA 1IXHA 4QSDA 2UVIA 1LAFE 5DT6A 1LLSA 4C0RA 3RTFB 4GWOA 4IO6A 3KN7A 5I56A 4ELRA 3FVGA 3EQ1A 1MXVA 1OLAA 4R75A 4F18A 3IB0A 2I3VA 2R71A 1UIVA 3KSJA 4LQ5A 2ZNTA 2XXTA 2E0SA 3BFUA 2XHDA 5EYFA 4NF8B 1TXFA 3O6HA 5L9MA 3OMBA 1QW0A 2E1SA 2YLNA 3BBRA 3TTKA 3IOVA 3TAJA 1NNPA 3FJGA 2D21A 3O6GA 4NWDA 3KEIA 4YB7A 4KCCA 4JSOA 3FV1A 1CB6A 4YZZA 3FD3A 1BKAA 4R74A 1FQFA 3OXNA 3I6VA 3OO7A 1O64A 1YPNA 2XX9A 3U92A 3K6UA 1Q35A 3VDFA 3E9XA 4OXVA 4G4PA 4DCYA 4XTCQ 3TQWA 1UTHB 4IB2A 3E4RA 4GVOA 3LR1A 3TFLA 4FORA 4OFJA 1FQEA 4GFRA 1D4NA 4H0WA 1A54A 3V83A 4KR5A 2DP8A 2F35A 2OJTA 4Q5TA 4R2BA 2DE2A 1IUDA 4DCXA 5I58A 5CBRA 4QF9A 3V5AA 3PU5A 1MH4A 2I0CA 3DM0A 1LAXA 3OOAA 3RT8A 4U4XA 1JNFA 2XX8A 4QFNA 3K1MA 3VVDA 3H3GA 1A8FA 4HW8A 3GLBA 2O1LA 4YB5A 4RJZA 3T9HB 4X48A 1O63A 3PGFA 1LCTA 2CMOA 5HPQA 3QXMA 1VR5A 1FQBA 3FXUA 1B4ZA 5I2NA 3K2DA 1ELJA 1LSTA 2DWJA 3U72A 1LFHA 3HPIA 1ZLQA 1XOCA 3O97A 1ZJLA 4DIGA 3K0VA 2F7CA 1A8EA 5CMBA 3CR9A 3M3LA 5CC2A 1EU8A 1YCJA 4KPTA 4XXUA 1Q1KA 1FTLA 2DWHA 3CIJA 1R6ZA 5I59A 4IO3A 3IOTA 1QUJA 3VLUA 3BKIB 2Q88A 3V89B 2GHBA 4FAJA 4GLIA 3KG2A 1Z7NE 2H5YA 3TEPA 3TCGA 2ZNSA 2ZYKA 5AA2A 5DTBA 3EF7A 4IO4A 3K01A 3ILUB 4KD5A 3SDFA 5DEXA 1B7ZA 1MQJA 1AOVA 1Y1MA 5AA2D 4EXKA 3HSTA 3A09A 3S2VA 5HM4B 3QAXA 2Z8FA 1KWHA 2VD2A 4FECA 3TTMA 3RTWB 3O9PA 1NFTA 5DVJA 3H6TA 1RYOA 4EQ9A 5KDTA 4NWCA 2QPQA 3FJ7A 1EH3A 4X1DA 3K6VA 4H8JA 1LFGA 4LP2B 3CFXA 2O68A 1VE4A 1Y4CA 3QIMA 2Q89A 4ZE8A 2Z8DA 3JYRA 1MXYA 1B1HA 1GVCA 4H6DA 1MXUA 2B3BA 1M5EA 4O3BA 1MDP1 4MLQA 3O29A 3TPAA 2Q8JA 3C4MA 3TODA 4K3FA 5DYHA 2HQ0A 4OETA 1MXXA 5IKBA 3B6QA 2F8DA 3EHUA 2DOJA 2XXXA 1NKXA 2Y7KA 3MVYA 2RF1A 4JWOA 2NXOA 4OVJA 4F19A 4NF4A 3UP9A 4LONB 4LQ2A 1I6QA 2Y7PA 4DLDA 3QUFA 4R6KA 5H8SA 4F2OA 1D9VA 1QVSA 5L9OA 3KOTA 1R1NA 2V3QA 2REJA 4RY1A 3OO9A 1P1QA 1MQDA 2H4IA 5JK4A 5I84A 3MPLA 4QFLA 1N7XA 4GF8A 3PUVE 3DELB 4H5FA 1DTZA 1B0HA 1UQWA 3OD7A 1LAGE 2QL3A 1BLFA 2RC7A 1OMPA 1N3XA 3T66A 3C9HA 2V3TA 1URDA 1MDQA 2AIXA 4QFOA 2O1MA 3GZGA 2NWJA 3VV5A 4ELPA 2PX1A 3LC8A 4QHQA 5L8DA 1PBPA 4PFTA 4M1VA 2OBGA 1JW1A 1M5DA 4GOTA 2OCUA 1B52A 1LBCA 3UIFA 4KFQA 1B3EA 1GR2A 1SYIA 4G68A 3S9EA 1SI0A 4R2FA 4E0XA 3SESA 1ATGA 5I2KA 1H45A 1RYXA 3MPKA 1FQDA 1PB8A 1B7HA 1H43A 3PPNA 3N5LA 3QSLA 5H8FA 3S4UA 1PB9A 5CMKA 2VOZA 4F29A 3TYHA 5KCJB 2I6EA 1JVYA 3LUYA 3G7WA 4KHZE 1UTBB 4POWA 4EDPA 5B7DA 1LBBA 4QRZA 2I48A 4WEPA 2KLFA 4NF8A 3SEUA 1Y1ZA 2X7PA 4DE8A 4DXCA 3KJ7A 2H25A 4FJPA 3RN8A 1IZ1A 1AL3A 4FIMA 3C31A 4NF6B 3U1OA 5M2VA 3EHSA 4MFIA 5FTHA 1MXZA 4OFLA 4IY6A 3MVZA 3CFLA 4ONYA 3Q25A 1XT8A 4PFYA 4ZE9A 5H8HB 4R9GA 1OQGA 3A3UA 3E13X 3M3FA 2PT2A 5KZTA 3L6HA 3MVXA 2UVGA 3DLNA 5ICQA 3USDA 3PV0E 4WEDA 3DP4A 4BLAA 4Z0IA 1J1NA 2XX7A 1M5BA 1JVXA 3VXBA 1DOTA 1B51A 1ZIUA 2F6PA 4FEBA 3EN3A 3VFJA 1UTHA 1Y9UA 3DP8A 4F1VA 5TP9A 1SVXB 4G2ZA 1MQGA 4ZEKA 2ONRA 4N6PA 3CG1A 1US5A 4OEVA 5ELVA 4BDNA 1B7UA 1N84A 1OLCA 1S50A 3HHFA 4F31B 1A40A 4F39A 2O51A 1AH5A 3MP1A 4PFWA 3SERA 4OENA 2ESNA 1N76A 1QKBA 3VVFA 1OVBA 2XXQA 2DWAA 1MY0A 4OESA 4ZEDA 4I8CA 2ZYOA 4WKMA 4NF5B 3FGSA 4YKJA 5DVFA 3BFTA 2QMWA 5JTYA 3T9VA 1DPEA 3H03A 1IEJA 3DP6A 5AA4B 1PC3A 4ZEBA 2R6GE 2NVUB 1QKAA 4OWDA 4I62A 4NTLA 2DQVA 3PUYE 1BIYA 2UXAA 3JV9A 1URGA 4ZECA 4U22A 3LSWA 3TMGA 3T96B 3CG3A 3SEYA 3FJMA 1D3KA 2V25A 1WVJA 3A3CA 4I9DA 2PMSA 4X9TA 2DS9A 3L6GA 3U93A 3RPWA 1IXIA 4R73A 1XS5A 3TKDA 4KYEA 5BUUA 1P1OA 3LSXA 4OHNA 4X1BA 1LCFA 1MY3A 2AYSA 3MWBA 4C1UA 1POTA 2RC8A 3RUMA 3C36A 2I0BA 5CI5A 3G3JA 2ABHA 4NE4A 1LFIA 1FTOA 5FHMA 3S9MC 2VHAA 2QSXA 3N94A 4U21A 3R26A 4DXUA 4YMBA 3KN8A 5H8NB 4ZDMA 3O28A 1NH7A 2O84X 5CM6A 4EXLA 1H76A 1MM7A 4QFPA 1LB9A 4R6YA 2CZLA 2IEEA 2AL5A 4UA8A 1FCKA 3SKPA 3CSBA 2VD3A 3ZKKA 4EF1A 1N7WA 3ZSFA 3SEVA 5CMCA 2HAUA 4LZ5A 4DZ1A 4GRKA 1B2HA 2HZKA 3MBPA 5AE4A 2I49A 2FNCA 4YKPA 1DSNA 4KCDA 3IB1A 4OQOA 3KN3A 3K1PA 1HSJA 1ZBMA 5A5XB 4F3GA 5FHNA 3M3KA 4LVQA 4F22A 5ISUA 3H6UA 3RQTA 3Q28A 5ITOA 2XXRA 2P1SA 4MF3A 4RK9A 4GQOA 5DVIA 4XKNA 1TT1A 3VLVA 1US4A 4C1TA 4GL0A 1UIUA 3R7XA 4DXBA 3I5OA 4EF2A 3MUQA 3OEMA 1MQHA 1YTVA 3PMVA 4U1ZA 2Y7IA 5AA1A 4H67A 4F2QA 4GD5A 3THIA 1MRPA 3FVNA 4YAHX 1TWYA 3MC2A 3IJOB 4QSCA 4KYDA 1M5FA 4XIGQ 4YMAA 2ZMBA 3S9NC 3TCFA 2O6AA 3O2AA 3T9XB 3N26A 1TFAA 1HSLA 1II5A 5HBCA 1DMBA 3IR1A 1JW5A 3TDJA 1LGBC 1B0LA 1SQYA 3ILTB 2ZYMA 2H9BA 1SBPA 1Y4TA 3VXCA 4I1DA 1MS7A 3IAZA 3PD8A 4F1UA 3CVGA 2F6GA 1SW5A 1WODA 5F1QA 2QS4A 4JB7A 4F3SA 3G3KA 4PETA 2H98A 2XD3A 3GBBA 1HSEA 5AA3A 3PUXE 4MH5A 2F34A 1I6AA 5TPAA 3PD9A 2RCBA 4BDRA 3CFZA 5AA2B 2ZNUA 2VP1A 2V3UA 1B40A 5KCJA 2ONSA 2FA7A 5ICTA 4RXLA 1VFEA 1BTJA 4NMYA 5CBSA 4ZEFA 1DTGA 4JBZA 1UTBA 5K2YA 3OEKA 3PUWE 5H8QB 1B3LA 2XXYA 1S7YA 1SW2A 1M5CA 1Z7ME 2M8CA 2DE3A 4MLVA 1AMFA 2RINA 5CRYA 3PUZE 1A55A 3K4UA 5KDTB 4NF6A 4ISUA 1B5IA 4IO2A 1MH3A 1PEBA 3OO8A 1LB8A 4RK2A 1FW0A 2P2AA 1B4HA 4G77A 1PDAA 2QRYA 5H8HA 1H3DA 3H6WA 3TQLA 1H44A 4GXSB 4TOZA 4IGRA 3TCHA 1N04A 1B3GA 1B3FA 3UK4A 3G3HA 3GXAA 4LZ7A 3IL1B 2A5TB 3QYTA 3WAEA 3CRBA 1EZ9A 2Z22A 1NNTA 2DWIA 2GHAA 2D3IA 3H7MA 3T93B 3RGYA 1B58A 3FUZA 2HCAA 4TQUQ 5EHMA 3MAMA 2YJPA 3C33A 2Y84A 3TTLA 2DVCA 1B05A 4G68C 4BDQA 4XKPA 4P0GA 1FQAA 3MZ9A 1MXWA 3HCQA 3I3VA 2QS2A 4WXJA 1SYHA 4MBPA 4O3CA 3LSFB 5I57B 4XKRA 4HCWA 1XC1A 4LUBA 4NF5A 3K00A 1USYH 3UORA 3OELA 4JWYA 1ZTYA 1L5TA 1MPCA 2V93A 3IB2A 4FE8A 4HTGA 1MM6A 2F78A 4RPNA 2OLBA 5AA4A 2HAVA 3W9WA 3IO6A 1SW1A 3UGWA 1QJMA 3PPPA 3R6UA 3ODBA 2Y7RA 1ZKBA 3PMWA 2DE4A 2F97A 3CSGA 3PPRA 5K2XA 3OENA 4ZS9A 2RKMA 3TUSA 2HEUA 5EHSA 1XHYA 3JZJA 3EPEA 2DVZA 2HXWA 3O6IA 2WKYA 2ANJA 2ONKE 1F9BA 3W9VA 2G93A 2QMXA 3QUJA 4PP0A 2FYIA 5CMMA 5H8FB 2RC9A 3K1NA 4HCYA 2O7IA 4JXIA 3G3IA 4HS7A 1ANFA 1DPPA 5H8NA 1JQFA 3ECRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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