2ZNUA

Crystal structure of the ligand-binding core of the human ionotropic glutamate receptor, glur5, in complex with a novel selective agonist, neodysiherbaine a
Total Genus 83

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGC

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
total genus 83
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2znuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2znuA02
3G3FA 5KDTB 3RTFB 4GF8A 3HSTA 4I8CA 5DVJA 1SI0A 4QFPA 3EHTA 4XKQA 2Q2AA 1FTOA 2PT2A 3TTKA 1B4ZA 1P1NA 2LAOA 2XXQA 2YLNA 3H3GA 1IITA 1Z7NE 3SEXA 3UN6A 3FJGA 4U1OA 3OO8A 3B6QA 2FA7A 2DQVA 3Q25A 3R26A 4Q8RA 3UGWA 5EHSA 1MM6A 2O69A 3S4UA 3S9MC 1SYIA 3FVOA 1RKMA 2UVIA 1HSLA 2ZYKA 4H5GA 4OYVA 4RK9A 4POWA 1MY4A 5I58B 3C31A 1MDP1 3FD3A 2UYEA 1ZKBA 1JW4A 5ITPA 4P0IA 3MVWA 3A3CA 1SW2A 3JYRA 3C35A 3TTLA 2XHDA 4AB5A 3TPAA 2QMWA 1B3EA 4ISUA 3IOTA 2Y7KA 3CSGA 4XIGQ 3E9XA 3EF7A 3PPNA 5H8HB 3OEMA 1P1WA 1PB8A 1HSJA 5ISUA 3KJ7A 3EHUA 3K02A 2E0SA 3OXNA 4G68A 3O28A 4G77A 1N84A 2GHBA 4H8IA 1QKBA 2ZMBA 1FW0A 1MQIA 3SDFA 3MQ9A 4QRZA 4NF4A 3IO6A 3CVGA 3T9UA 1B9JA 1PBPA 4OEVA 4F39A 2OK2A 3T93B 4KR5A 3GZGA 3P7IA 2W7YA 3W9VA 4GVOA 4LZ7A 2Q89A 5I56B 3RQTA 3C9HA 1DTZA 1QUIA 2RC7A 2Q8JA 3D4GA 5I59B 3MC2A 4XKRA 1ELJA 2PVUA 1B05A 3E4RA 1B2HA 5DVFA 4KCCA 4NF6A 2WKYA 3VDFA 3I3VA 1POY1 2H9BA 3QUJA 3KOTA 5AA2D 3PPPA 3FXUA 4F18A 3O6HA 1HSEA 1BKAA 3H7MA 3FXRA 4PFYA 5M2VA 5CM6A 3TTNA 3GBBA 1IQ7A 2DP8A 2DE2A 3FV1A 3TMGA 4N13A 2Y7PA 1NKXA 4ZS9A 3RN8A 1S9TA 2PX1A 3UP9A 3HHGA 1P1UA 1MG1A 1SW1A 3IK6B 4H5FA 4DCXA 1T0KA 3TEPA 1RYXA 2Z8DA 3KJTA 1QUJA 1POTA 1FQAA 5J1DA 3PUWE 4E0WA 2Y7WA 3FXQA 3MVZA 4DCYA 1D9VA 2PBWA 1UTBA 4FORA 3ODBA 4DXCA 5CBSA 3E3KA 4ZDMA 2NOOA 1MXWA 2RCAA 5L8DA 4O3AA 1YAEA 4OFJA 3TODA 4BDQA 1TXFA 4PP0A 3DP4A 2NWJA 1O7TA 1ZBMA 5TP9B 2XXVA 4GWOA 1MM7A 4LP2B 4IY6A 3CI8A 1CB6A 1R9QA 3K2DA 3C4MA 3O9PA 1JEVA 2H99A 3PV0E 1MH4A 2DS9A 2UVJA 4IO4A 4TQUQ 1N3XA 3VLWA 2XD3A 5HBCA 3RTWB 1QW0A 1H3DA 3F11A 4JWYA 3WAFA 1ATGA 1LGBC 1NL5A 4ELRA 3TYHA 5A5XA 4RNSA 1MQGA 2VD2A 4XKPA 3I5OA 4YZZA 2Z8EA 4QSDA 4YKJA 3FJMA 4R72A 5JTYB 2CMOA 1TFDA 2HAVA 1SD3A 5BUUA 1Y1ZA 4G8NA 4PE5B 4ZEFA 3IJXB 3VXBA 4LZ5A 5H8NA 2P0SA 2ONSA 2DE3A 1PBQA 4C1TA 4YB5A 3RT8A 4ZEDA 2F6GA 2D3IA 2B3FA 4GLIA 1JEUA 3GLBA 4IGTA 3HPIA 1ZU0A 1ZMGA 3K0VA 3QAXA 3HCQA 4Z0IA 1US4A 1IZ1A 2H98A 3OELA 3SEYA 5B7DA 5I57A 2O51A 4IO7A 2ONKE 4IO6A 2G93A 4F1VA 2VOZA 2I0BA 1B7HA 3RT6B 5H8FB 4RK2A 3H6VA 4YB6A 2VD3A 2IA4A 4YKIA 4JB7A 3GBAA 1Y20A 4UACA 1JVXA 4NMYA 2QS3A 3VVEA 4FAJA 3ZS6A 3KN3A 4R6KA 4HTGA 2OWTA 3ILTB 4K3FA 4PFUA 5H8QB 1Y3PA 1Y9UA 1Y3QA 2I3VA 2ALUA 2OBGA 4N6PA 2YPNA 5AE4A 1M5EA 2HZKA 2I48A 3OSRA 3VVFA 3TFLA 4PFWA 4U1ZA 4FE8A 3OO7A 4OWDA 3FASA 1OMPA 4DE8A 2GH9A 1JVYA 2PT1A 5AA2A 4NWDA 3N6TA 4X9TA 4ZZAA 4F2QA 3H06B 1B0LA 3Q27A 4BDMA 2ZYOA 3OO6A 1PB9A 3BFTA 4YAHX 4E0XA 2NVUB 2BJJX 5ICTA 3T9HB 2B65A 4BDOA 3IJOB 4WKMA 3S2VA 1Q35A 1LAXA 3IO4A 4H8JA 2DWJA 2QMXA 1JW1A 1UTHB 1B3FA 5FHNA 1DOTA 2HXWA 1A8EA 3ZSFA 3IB2A 5DT6A 4ESXA 1A7LA 2DVCA 1JNFA 3PUXE 3PGFA 3KFMA 3LBSA 3SETA 4OEUA 3MP1A 3K6UA 1DTGA 1ZIUA 2D5WA 4DZ1A 3PD9A 4DXUA 3HO7A 3H6UA 3K6WA 4U22A 2RC8A 4R75A 4PETA 4MLQA 2X7PA 4YICA 4I9DA 4TLMB 4Z7EA 2A5TB 1FQCA 4H67A 5KCJB 1AH5A 1LFGA 1XVYA 3G3JA 3U72A 1B51A 3KOSA 1MPBA 5ITOA 1XT8A 1M5DA 4THIA 3M8UA 2ESNA 1LAGE 4OTEA 3M3KA 3FJ7A 4F3BA 3QIMA 3CSBA 3KGCA 2UVHA 5AA1A 3U92A 2HQ0A 3FATA 4RJZA 1B32A 2XX9A 2V3QA 4IB2A 5CC2A 1NFTA 1N3WA 3T66A 4DXBA 2O6AA 2Q2CA 1IXCA 3FIRA 4FATA 3MP8A 5ELVA 1MY1A 2THIA 1GV8A 2O7UA 2P2AA 1OQGA 4LA9A 1Y3NA 3DLNA 4PQJA 5I2NA 1MXVA 2FNCA 1GGGA 3MVXA 4KQPA 4TOZA 4NF8B 2O68A 2RCBA 3UIFA 3FVKA 4RYAA 4R73A 1DMBA 1AL3A 3SESA 5I2KB 5CMMA 3KEIA 1VE4A 5CMBA 3ZKLA 3IR1A 2O84X 3V5AA 1LBCA 4AB6A 5BWJA 3IOUA 5IAIA 1TFAA 1YCJA 4F3PA 4OHNA 4OERA 2V84A 3G3IA 4X1BA 3KZGA 4F1UA 5FHOA 4WEPA 3SEVA 1US5A 4QHQA 3L6GA 2P1SA 1DSNA 1B5JA 3DELB 2V93A 4WXJA 1NMUA 1IXHA 1YPNA 1D3KA 1I6BA 4YU0A 1EZ9A 2AYSA 2AIXA 4NTLA 1A8FA 1A99A 4QFKA 1JW5A 1MPCA 1Y4TA 4OFLA 2PYYA 1YTVA 4POXA 3MBPA 4EXKA 1PC3A 3IOVA 1LB8A 2F8DA 4KI0E 3TQWA 2R9JA 5HPQA 5H8SA 4ZEKA 2QS2A 2XXXA 2O1MA 4NE4A 4OENA 2XD2A 1S50A 4AQ4A 3PPRA 3L6HA 1I69A 2H5YA 4G68B 3W15C 3MZBA 2I4CA 2DXYA 2REGA 1A40A 3PPOA 3K6VA 3HHFA 2IEEA 3C34A 3RPWA 4NF4B 4XKNA 3K4UA 2ZYMA 4Q5TA 2ABHA 3OOAA 1LLSA 1NNTA 2XX7A 1XHYA 1VSOA 2QS1A 3MPKA 2OCUA 3OENA 3VV5A 3TTRA 3SKPA 2ZNTA 1MQDA 1WODA 3KG2A 1N76A 2A5SA 1B5HA 4FJPA 5H8FA 3O6GA 2OJTA 4KCDA 4RPNA 1Y4CA 4NF6B 1MQHA 1TWYA 3TAJA 2RC9A 3PUYE 2UVGA 4EQBA 1I6AA 2DSFA 4F3SA 3QUFA 1IUDA 4F19A 2GFEA 5TPAA 2ZXTA 1PDAA 2F78A 4G8MA 4BDRA 1DPPA 2XXPA 3PMWA 4F22A 1PB7A 4QF9A 2XXRA 3LSWA 1A55A 1UIUA 5L9SA 2V25A 1USYE 1OIBA 4GRKA 4H65A 2D21A 1F9BA 3U8QA 5ICQA 2I49A 1EU8A 4ZZEA 4FEBA 3BKIB 4NWCA 3CRBA 3BBRA 2ONRA 3U1OA 3TELA 2QRYA 3C33A 3AXFA 2QPQA 3PUZE 4ZEBA 4ZE8A 3O97A 5CBRA 2XXYA 4LZ8A 1LCFA 2NUVA 1FTMA 1UTBB 1FQEA 2HFBA 3Q28A 5EYFA 3QK6A 3CR9A 2RINA 1LFHA 4IO3A 1LSTA 3RNNA 4ECFA 4EF1A 4GL0A 4ND9A 1N7WA 3VFJA 1H43A 2Z23A 4MLVA 1J1NA 3M3LA 4ONYA 4NF5A 1H45A 1UTHA 4L17A 3U94A 4R2FA 5AA4A 1OQHA 3G3HA 3PD8A 3V89B 5I84A 4OZ9A 3O2AA 1FTLA 4OFOA 3T9VA 5DEXB 3IORA 2PMSA 3H03A 1MH3A 4GXAA 2KLFA 5HM4B 1Q1KA 5KDTA 3RY3A 1Z7ME 2O1LA 4OETA 2B3BA 2QL3A 1B1HA 1B7ZA 4QFNA 4JSDA 1H44A 1WVJA 4EXLA 4IO5A 1AMFA 4X1DA 4YKKA 1VR5A 2Y7RA 2QJEA 4ZEIA 3WAEA 5A5XB 3MPLA 1MPDA 4M4GA 2X7QA 3PUVE 1MXZA 1OLAA 4IGRA 2OZZA 4UA8A 4C0RA 2I3WA 2QSXA 5H8NB 1P99A 1RYOA 5I58A 1EZPA 4G8HA 1FTJA 2G29A 2ZNSA 3EPEA 4R2BA 1I6QA 1IIWA 2Y7IA 2F7BA 3TQLA 5DTBA 4BLAA 2REJA 3I6VA 1Y1MA 2HCAA 3KN8A 1OVBA 3OMBA 3MVYA 2XX8A 4KD5A 1XOCA 1BP5A 1URDA 2H25A 1B0HA 5H8HA 4ELOA 4LUBA 3IOWA 2DWAA 1N7XA 3K1MA 4Q30B 3FZVA 1XS5A 1N0TA 5DVIA 1OVTA 4RY1A 2I0CA 3M3FA 4NF8A 1B58A 3SERA 2F7CA 4KPTA 5I2KA 1USYH 4R9GA 1SW5A 4NEDA 3B7DA 3ZKKA 3N26A 2O7IA 3G3KA 2CZLA 4F1YA 2DXRA 5I56A 1VFDA 2OWSA 4R9FA 4OXVA 5I59A 4I1DA 1N04A 3MZ9A 1MXXA 4GQOA 4MH5A 1TT1A 5AA2B 1LCTA 3PU5A 1VFEA 4H0WA 3ONMA 1BLFA 1L5TA 4F2OA 4DLDA 3VLVA 1MXUA 1IEJA 4JWXA 1DPEA 4HCYA 1JQFA 1B1XA 4JXIA 2NXOA 2VHAA 4GD5A 5FTIA 3VE1B 3OD7A 4R6YA 4P0GA 4FEDA 1IXGA 3LSLA 1SDXA 3TCHA 3BFUA 3R7XA 4KYEA 3RLFE 3KSJA 3MWBA 1PEBA 3FUZA 2F97A 2DOJA 1NNPA 2V3UA 3K6XA 4R6HA 3IX1A 4MF3A 3Q29A 4YKPA 2XXTA 3O66A 1MQJA 3K00A 4R74A 3IB0A 3KN7A 2DVZA 1MDQA 1BTJA 1OLCA 3QSLA 4LATA 3THIA 4U21A 3T96B 4OQOA 5CI5A 4GIZA 2V3TA 3H4ZA 1MY3A 1R1NA 1FTKA 2GRVA 3IL1B 4LQ2A 4YMBA 1IXIA 1LFIA 1QJMA 4JWOA 5DYHA 5KZTA 2X26A 1AIVA 2F5XA 3SEWA 4HS7A 1S7YA 3UA8A 5TP9A 4KHZE 2I6EA 2AL4A 1UQWA 1QUKA 3G3GA 4QSEA 3ILUB 1LAFE 4F3GA 4BDLA 2AL5A 2HZLA 1GR2A 4U23A 3PMXA 1QVSA 1D4NA 1FQDA 1GVCA 1LB9A 1ZLQA 4ESWA 3K01A 5EHMA 4OMBA 3HN0A 4QFLA 3N5LA 1LAHE 5TU0A 1B52A 2Q88A 3TCGA 1M5CA 3S9EA 1NNKA 1B3GA 3FGSA 3MP6A 5JTYA 3E13X 5I2NB 4U2RA 4JDFA 3GXAA 2R6GE 3MAMA 1URGA 3PMVA 5IKBA 4HW8A 1URSA 1FQBA 1B40A 2YJPA 2QS4A 1R6ZA 3OO9A 1O63A 3SEUA 4EDPA 4ZECA 2FYIA 5LOMA 3LSFB 4H1XA 3A09A 2I4BA 5FTHA 2Y84A 3DM0A 1B3LA 1SYHA 1CE2A 5F7VA 3TUSA 3TZAA 4LQ5A 3MZ1A 3LUYA 2Z8FA 3LSXA 4O3CA 3C36A 1NH7A 3EQ1A 1P1QA 2I58A 5L9OA 4C1UA 2XXHA 4RPOA 1LBBA 4F31B 1QKAA 3RUMA 5DEXA 1JETA 1AOVA 4HCWA 2E1SA 4QFOA 1B6HA 4GL8A 2DE4A 3DP8A 4JSOA 3CFLA 4MBPA 5H8QA 1B5IA 3DP6A 4FECA 3IB1A 5CMCA 1M5FA 1QULA 4EUOA 3TDJA 3U93A 1NH8A 3O29A 1MS7A 3H6WA 3RGYA 3KBRA 2ZYNA 3PPQA 4H6DA 1ANFA 3IAZA 4X48A 2VGQA 3S9NC 3R6UA 1H76A 1WDNA 3QXMA 3N6UA 3CIJA 3HV1A 4XXUA 1EZOA 1MY0A 3B6TA 1SW4A 1B46A 5AA3A 4LONB 2XXIA 4PFTA 3VVDA 1A54A 2DWHA 1UIVA 2F34A 4P11A 4IY5A 1MY2A 5JEIA 1ZTYA 1R9LA 1XC1A 2RKMA 3V83A 2Q9TA 2R71A 3V8XB 3EHSA 2XXWA 3TKDA 4DDDA 4DIGA 1B7UA 2DYXA 4QSCA 3MUQA 4RA1A 4F29A 2RF1A 2F7AA 4G4PA 3T22A 2UYFA 1FCKA 2M8CA 1SBPA 2OLBA 2ZNUA 4GXSB 4ELPA 3A3UA 1KWHA 3K1PA 5K2YA 3T9XB 4GOTA 3CG3A 4ZE9A 3D4CA 3EN3A 4KFQA 1SVXB 3OSQA 3CFXA 4U4XA 1FQFA 3W9WA 5CRYA 3VLUA 2F35A 3B6WA 1O64A 5TPAB 4O3BA 1MXYA 1P1OA 3USDA 3TCFA 3VXCA 4RXLA 3S9LC 4YB7A 3MJNA 4G68C 2A5TA 4MFIA 5KCJA 3FVGA 3CFZA 4OESA 2GHAA 4JBZA 1EH3A 5FHMA 3LR1A 5L9MA 3UORA 1XVXA 4YMAA 2HEUA 2UXAA 1NNFA 4LVQA 2DWIA 2Z22A 4IO2A 4N07A 1M5BA 3K1NA 2VP1A 3H6TA 1B3HA 2F6PA 5K2XA 3KSXA 3FVNA 5JK4A 4GFRA 3O6IA 2F36A 4EQ9A 4G2ZA 4WEDA 4ELQA 3C32A 4U4SA 1II5A 3LC8A 4EF2A 4XTCQ 5CMKA 3TTMA 1SI1A 4KYSA 3OEKA 2ANJA 4FIMA 5I57B 3Q26A 3JZJA 4BDNA 4NF5B 4Q0CA 4I62A 5AA4B 1SQYA 3JV9A 2HAUA 2H4IA 3FV2A 1BIYA 1MRPA 1D9YA 4EQ7A 3N94A 4TLLB 4KYDA 3UK4A 2XXUA 3QYTA 3ECRA 4M1VA 4OVJA 1GTKA 1B4HA 5F1QA 1ZJLA 3CG1A 3G7WA 3MW0A 5B70A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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