2ZXTA

Crystal structure of tim40/mia40, a disulfide relay system in mitochondria, solved as mbp fusion protein
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
451
structure length
451
Chain Sequence
EEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNSSSVPGRGSIEGRPEFAYNPDTGEINWDCPCLGGMAHGPCGEEFKSAFSCFVYSEAEPKGIDCVEKFQHMQDCFRKYPEHYAEQLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of yeast Tim40/Mia40 as an oxidative translocator in the mitochondrial intermembrane space.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, LINKER, Mitochondrial i
molecule tags Protein transport
source organism Escherichia coli (strain k12)
total genus 127
structure length 451
sequence length 451
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF06747 CHCH CHCH domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zxtA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zxtA01
1B7UA 2XD3A 3CFXA 4GWOA 1VFDA 2XXPA 2F8DA 5I2NB 4NF5B 3DLNA 5AE4A 3TTLA 3HHGA 3ILUB 1NNFA 5F1QA 4NF6A 1Y3NA 4TLMB 1LAXA 3EQ1A 1GTKA 3IAZA 1LB8A 4LATA 5CC2A 4X9TA 1B0HA 4OHNA 4RJZA 3RGYA 3PPPA 1IIWA 4H65A 3PUXE 1YCJA 1QKAA 4G8NA 4KD5A 4XKPA 2E0SA 3U94A 4OTEA 1FTKA 1PB7A 3I3VA 1B6HA 4F19A 2AL4A 3KEIA 3A3UA 1P1UA 4NF8A 3E9XA 3TCFA 3MJNA 5M2VA 1Y9UA 4QFKA 4FECA 1SW4A 4POWA 3VLUA 4YKPA 4C0RA 5I56B 3FJ7A 4ISUA 4ZZEA 3DELB 1I6AA 3T96B 4LZ7A 2QS2A 4O3CA 2R71A 1IZ1A 4IGRA 1B46A 3EPEA 3K6WA 4XKRA 5AA2A 2PX1A 1UIVA 2Z23A 1A40A 3MPLA 4P11A 2V84A 3GLBA 3L6GA 2RC9A 5FHMA 3FD3A 4PQJA 5I57B 1B2HA 4QSCA 4F2OA 4AQ4A 1LBBA 4KYDA 3VXCA 1S9TA 2KLFA 1URDA 1YPNA 3CG3A 1IXCA 4I9DA 3KN7A 3TTKA 1B40A 3FZVA 1NFTA 4L17A 2R6GE 4FATA 1QUJA 1TFDA 1BLFA 5CMBA 3KZGA 3PPOA 1F9BA 3O6HA 3UA8A 3HHFA 3C4MA 2RC8A 3V83A 3U92A 2DQVA 1M5CA 3C33A 2QJEA 4ZEIA 1MXVA 3E13X 4R2FA 4OYVA 1PB8A 3B6TA 4BLAA 1SI1A 4HW8A 4PETA 2I48A 4P0IA 3LBSA 3F11A 1ATGA 1GR2A 4U23A 4ZZAA 3EHUA 1H43A 1LFHA 1AL3A 3HPIA 4GQOA 4NE4A 4OMBA 1PDAA 4JWYA 4U2RA 3OXNA 5CMCA 3VDFA 1JW1A 1ELJA 3FV1A 3OMBA 3OELA 1Y20A 2OJTA 1B3FA 5I59A 4EF2A 2AIXA 5CMKA 3KSXA 5CMMA 1MQDA 1O7TA 4M4GA 3QXMA 4PE5B 1MQJA 2DS9A 3TCGA 1N0TA 1OIBA 1TFAA 3K6VA 4I62A 4K3FA 4LP2B 4IO3A 5I2NA 4EXKA 2DVCA 1FTMA 3H6WA 2IA4A 4NF6B 1N3XA 1PB9A 2LAOA 2Z22A 1B5JA 1M5BA 4H1XA 4QFLA 2OCUA 3VV5A 3V5AA 1SYIA 1ZJLA 4XKQA 4FEBA 4YICA 5DVFA 1JNFA 1USYE 4H0WA 3VLVA 1I6BA 5KCJB 3HV1A 5TPAB 3PUVE 3LSXA 1XVXA 4U1ZA 3JZJA 2X26A 3GBAA 4ELOA 2I49A 4WEDA 3W9WA 4DLDA 3QAXA 3OO8A 2I58A 3RT8A 3O2AA 3TFLA 4YB7A 5I56A 3RNNA 4PFWA 2Z8FA 3TDJA 3K01A 3EF7A 2HXWA 2D3IA 2UYFA 2UYEA 1Z7ME 1YTVA 1IXIA 4JSOA 5I84A 3PPNA 1NH8A 3PU5A 1FTLA 2HZKA 2OBGA 4BDMA 3OO7A 2XXTA 1JW5A 1KWHA 4C1TA 2GHBA 4RPOA 3SESA 3UORA 3TKDA 2UVGA 4RXLA 2Y84A 5AA4B 5I57A 2XXWA 4KYEA 1ZKBA 3IO4A 3B7DA 3KJ7A 1B1XA 1NL5A 1LBCA 1DPEA 5IKBA 4RPNA 4XTCQ 2CZLA 1GVCA 3SKPA 3ZSFA 2ZNUA 3OD7A 3KSJA 2XXIA 2ZMBA 3T9XB 4YB6A 1S7YA 4QFNA 2XXVA 3K1MA 3M8UA 3MZBA 2ZYKA 1DTGA 4Z7EA 1NNTA 2A5TB 3IB2A 1M5FA 4JWOA 1VE4A 3Q25A 1LAHE 1MQIA 3KOSA 2VP1A 1Y4CA 5CBRA 1AIVA 4H5FA 1MM6A 4R73A 5H8QB 1IUDA 4F3GA 3Q28A 3OSRA 1D4NA 5ICQA 3PPQA 5CRYA 3RUMA 4R9GA 4X1BA 2DE4A 1A55A 1SI0A 1T0KA 3U8QA 5I58A 3OEKA 2O7IA 4XXUA 3Q27A 3TZAA 2ONKE 1BIYA 1EU8A 3V89B 4OFLA 3CVGA 4M1VA 1XS5A 2QSXA 4G68B 1II5A 4NMYA 4OFJA 1OLAA 5H8SA 3JYRA 1JEVA 2PYYA 3CIJA 3I6VA 1UTBA 3PPRA 3R6UA 3K4UA 2V25A 4G8HA 1QUKA 3KN8A 4ELRA 2B3BA 1WDNA 4AB5A 2DE3A 2HAUA 5L9SA 1RKMA 1MY3A 1FQCA 3BFTA 1DMBA 5BUUA 3OO9A 4ND9A 4BDRA 1YAEA 2O1MA 5H8FB 3N94A 1N7XA 3G3FA 3N5LA 3FJGA 1N04A 3OO6A 1M5EA 3VVDA 2VD3A 4Q30B 4UA8A 1UTHB 3EHSA 1MH4A 3R7XA 4MBPA 3MWBA 4Z0IA 5KCJA 2F6GA 5CI5A 5TPAA 2DXYA 2WKYA 3H7MA 1OVTA 3ILTB 5L9OA 1TXFA 3RTFB 3HN0A 1B7HA 3FV2A 4PP0A 1B52A 2FA7A 1Q1KA 4RA1A 1JETA 1PBQA 3TMGA 3FXQA 3T9UA 1B4ZA 3GZGA 3G3IA 3E3KA 4THIA 2I6EA 1B0LA 1MPBA 2I3WA 1WODA 1RYXA 1SBPA 1SW5A 5FHOA 3PUYE 3EHTA 4R6YA 2GHAA 2Y7KA 1EZOA 3U72A 5DVIA 2ABHA 4LONB 2RF1A 3I5OA 3BFUA 2F6PA 5AA4A 3FGSA 3MVWA 1ZLQA 4WEPA 4KCDA 5TU0A 3MP6A 4GVOA 3LR1A 1B3LA 5BWJA 2F35A 1MY4A 1MPCA 3MZ9A 4ONYA 3TCHA 2F97A 3TQLA 2QMWA 3HO7A 3S9NC 4BDNA 4NEDA 1H45A 3GBBA 4EDPA 4FJPA 4H6DA 3CSBA 1FTOA 4YAHX 2P0SA 4HCYA 5H8NB 2XHDA 1SYHA 3K2DA 1A99A 1FQDA 3ODBA 4WXJA 4DE8A 4DDDA 1LB9A 2ONRA 4ZEFA 4E0WA 3QK6A 3QSLA 2A5TA 5EHMA 2Q8JA 2HAVA 1D9YA 1VR5A 2O84X 2REGA 3KBRA 1N7WA 4YMBA 2REJA 4ESXA 4NWDA 3S2VA 1ZMGA 1MQGA 3SDFA 1JEUA 1Y1MA 4G68C 4JB7A 3C36A 3L6HA 3G3GA 4QF9A 5H8QA 1XT8A 2V3QA 1Y4TA 3TTMA 1UIUA 2DWHA 2P1SA 4H5GA 4IO6A 3IO6A 4F1VA 3HCQA 2QS3A 2QS1A 1Q35A 2ZYNA 2X7QA 3G3HA 4F29A 5HM4B 5I58B 3KG2A 2GFEA 4MH5A 2Z8DA 4R6HA 3TPAA 1DTZA 1OMPA 3DP4A 4RYAA 2Y7RA 3FVNA 5FTIA 4KCCA 2OLBA 1R9LA 5J1DA 1HSJA 4OVJA 5DEXA 1JW4A 4H67A 1LGBC 1A54A 4QFOA 3B6WA 4ZEDA 4G68A 3IL1B 1B9JA 4F3BA 3CG1A 4OXVA 4DZ1A 1UTBB 4GRKA 1DOTA 4OEVA 5JTYB 4YZZA 3VLWA 4XIGQ 4ZE9A 2R9JA 5ELVA 2Q9TA 1IXGA 1LFGA 1USYH 2G93A 3KOTA 5AA3A 4U22A 1B3GA 2GH9A 3PUWE 5H8FA 3C34A 1SW2A 1H44A 4R2BA 4ZE8A 1IEJA 2UVHA 1UTHA 1B5HA 3K0VA 5DTBA 4GIZA 2W7YA 1XOCA 3FASA 3MVXA 4F18A 4IO5A 3IB0A 4QHQA 2BJJX 5CBSA 2HCAA 3OSQA 4BDOA 4R6KA 4F39A 3Q29A 1D9VA 4G8MA 1B4HA 1EH3A 3N26A 4Q5TA 4NF4A 3C32A 3PGFA 2PVUA 5FTHA 2I3VA 2Y7WA 4F2QA 4G77A 5LOMA 4F3SA 4R72A 2FNCA 3IB1A 5EYFA 4FEDA 4HCWA 3A09A 2ZYMA 3Q26A 4P0GA 1FQBA 4G4PA 2DVZA 4YKIA 1IITA 5FHNA 3K1PA 4I8CA 4EQ7A 2O6AA 4RK9A 3SEWA 1R9QA 1M5DA 4OERA 4H8JA 1ZU0A 2F7CA 4MFIA 1Y3QA 4IO2A 4X48A 4OZ9A 4RK2A 2DSFA 5DT6A 2PBWA 1BP5A 3CSGA 2NVUB 5DYHA 1XC1A 4NWCA 2VOZA 4XKNA 4IGTA 3T9VA 2Q2CA 4IB2A 3DP8A 4OETA 4TQUQ 2P2AA 4LQ5A 3IORA 1PC3A 1I6QA 1B51A 2HZLA 3LSWA 1MXUA 3IJXB 1CE2A 5H8NA 4IO7A 1NNPA 2YPNA 3VE1B 1R1NA 5B70A 5KDTB 1JVXA 4F1UA 3KN3A 3O6IA 2F36A 4QRZA 3MPKA 4U4XA 2F7AA 4EQ9A 3WAEA 2RCAA 3W9VA 3T22A 3UIFA 2UVJA 4DXCA 1MQHA 1QUIA 4EF1A 3SEUA 2ZXTA 3AXFA 4JWXA 1EZPA 3IX1A 4GXAA 3RT6B 3PMXA 3IJOB 4HS7A 3PD9A 2HQ0A 1B05A 2HFBA 4YMAA 1O64A 1ANFA 3LSLA 4QSEA 4YKKA 4F1YA 1MG1A 2E1SA 4EXLA 3MAMA 4BDQA 1HSLA 3UP9A 3MUQA 1P99A 1US4A 3R26A 2Y7PA 1GGGA 3MVYA 5KZTA 5DEXB 3ZKLA 3IOTA 4MLVA 3O97A 1ZBMA 1B3HA 2DP8A 1NH7A 3W15C 4YU0A 3FUZA 3PMWA 3TODA 3H4ZA 3M3FA 2H4IA 3T9HB 5JTYA 4N07A 1QJMA 3TEPA 3K1NA 1US5A 4LUBA 4DCYA 3G3KA 2AL5A 3TAJA 2O7UA 1SW1A 2Y7IA 3UGWA 4EQBA 3QUFA 3U93A 2XX9A 2Q2AA 4N13A 3JV9A 3DM0A 3THIA 2IEEA 2NWJA 2DWIA 1FQEA 3IOWA 4IY5A 4FORA 1DPPA 1URGA 1SQYA 2O1LA 3MQ9A 4UACA 3OENA 1P1OA 1D3KA 2I0BA 2RINA 2RKMA 3TELA 4MF3A 4ZECA 3KJTA 4BDLA 1P1QA 3VVFA 4GXSB 3RPWA 1P1NA 2ZNSA 4KFQA 2PT1A 4NF4B 2V3TA 3UK4A 3K6XA 2H99A 3CFZA 3H03A 1MS7A 1H76A 1LFIA 2XX7A 3FXRA 2ZNTA 3SEVA 3MP8A 1PBPA 4PFTA 3H6VA 5EHSA 1LAGE 4QFPA 4PFUA 3PUZE 4TLLB 3U1OA 3ECRA 3S9EA 3O9PA 3PMVA 1SD3A 3C9HA 1S50A 3H3GA 4GL0A 4ZDMA 3SETA 4RNSA 2UXAA 5K2XA 3BBRA 2XX8A 2V3UA 1QVSA 2D21A 4FAJA 1P1WA 5H8HB 1AOVA 3D4GA 1IXHA 1FTJA 4EUOA 2FYIA 1LLSA 2DWJA 4X1DA 2QL3A 4U1OA 2ALUA 1LAFE 1B32A 2ONSA 3SEYA 4OFOA 2H5YA 1MY0A 4GFRA 1N76A 1POTA 1QKBA 5L8DA 2X7PA 4KI0E 3C35A 2DE2A 1B1HA 1SDXA 5AA1A 1UQWA 3A3CA 3K02A 1N3WA 3ONMA 1BKAA 3SEXA 3T93B 3USDA 3MW0A 4KPTA 1LCTA 2O69A 5IAIA 4LQ2A 3VVEA 1NKXA 4N6PA 1Z7NE 4U4SA 5KDTA 5K2YA 1VFEA 1TWYA 1HSEA 1LCFA 4R74A 4DXUA 3O6GA 2UVIA 3S9MC 4GL8A 4FE8A 4JSDA 4ELQA 5TP9B 4LA9A 3LSFB 4TOZA 4DCXA 2QPQA 2VD2A 2YJPA 1MM7A 5DVJA 3WAFA 1FQFA 1MXWA 1JQFA 3LUYA 3IOVA 1QULA 1B7ZA 3RN8A 3TTNA 2XXUA 4C1UA 4ZEBA 5ISUA 4DXBA 2DYXA 1N84A 5A5XB 2XXXA 5HBCA 3MZ1A 4LZ8A 3TYHA 1A8EA 2I0CA 4LZ5A 5I2KB 3FXUA 2B3FA 3G7WA 3HSTA 3O29A 2QMXA 2V93A 2Q88A 3KFMA 3CRBA 2VHAA 4KR5A 3O66A 4HTGA 1MH3A 4JDFA 2HEUA 1NNKA 4G2ZA 1I69A 3MP1A 4U21A 1Y3PA 4OEUA 2Q89A 4OWDA 1OVBA 3IK6B 3DP6A 1ZTYA 1FW0A 3FATA 2RC7A 4Q8RA 2O68A 4ZEKA 4ESWA 4KHZE 5ICTA 4JXIA 1B5IA 4NF5A 3UN6A 1FQAA 1L5TA 1FCKA 4IY6A 4ZS9A 1RYOA 5JEIA 3CR9A 3IOUA 3VXBA 3FVKA 3D4CA 1MDP1 4YB5A 1XVYA 4R9FA 2CMOA 1MY1A 2YLNA 1SVXB 4JBZA 2ESNA 4DIGA 2D5WA 3CI8A 2I4CA 1MPDA 3H06B 1CB6A 3RY3A 4LVQA 4I1DA 4OENA 4PFYA 2H9BA 3KGCA 2GRVA 1MXZA 3E4RA 1AH5A 2NUVA 3TTRA 1O63A 3PD8A 4H8IA 2AYSA 1ZIUA 1LSTA 2ANJA 2B65A 4MLQA 4NF8B 4ELPA 3H6TA 1POY1 3EN3A 1AMFA 1GV8A 4OQOA 2OWTA 4F3PA 4QSDA 3M3LA 3S4UA 2Z8EA 3FVOA 2THIA 2QS4A 5ITPA 4GLIA 2H25A 2OK2A 2PMSA 1R6ZA 4O3AA 3MBPA 3SERA 4E0XA 2NOOA 5AA2B 1B3EA 1XHYA 5H8HA 3BKIB 1EZ9A 4Q0CA 3OEMA 2XXYA 2XD2A 3MVZA 2F5XA 2F34A 1OLCA 3MC2A 5JK4A 2F7BA 1H3DA 1NMUA 4NTLA 3VFJA 3FIRA 1TT1A 3TQWA 1A7LA 3K00A 1BTJA 4YKJA 4GF8A 1PEBA 4KYSA 4IO4A 3V8XB 2I4BA 1URSA 3FVGA 2A5SA 3O28A 1IQ7A 2XXRA 5F7VA 3OOAA 3H6UA 3QUJA 3LC8A 4KQPA 3G3JA 3K6UA 5B7DA 4F31B 3M3KA 5L9MA 2DXRA 4R75A 1MRPA 1WVJA 4F22A 1A8FA 3N6TA 1JVYA 3C31A 5CM6A 1VSOA 2H98A 1OQGA 1QW0A 1MY2A 1MXXA 2F78A 2ZYOA 4O3BA 5TP9A 4ECFA 5ITOA 2DWAA 1MXYA 2M8CA 2NXOA 2QRYA 3QYTA 4RY1A 3P7IA 1J1NA 4FIMA 2XXQA 3ZS6A 3RQTA 5A5XA 3PV0E 3N6UA 3B6QA 2VGQA 4OESA 3RTWB 2RCBA 5I2KA 3S9LC 1Y1ZA 2OZZA 4GD5A 3CFLA 2XXHA 3IR1A 3TUSA 5I59B 3GXAA 5AA2D 3FJMA 2G29A 3T66A 2DOJA 1DSNA 1MDQA 2OWSA 4AB6A 3RLFE 3ZKKA 2O51A 1B58A 4WKMA 4POXA 2PT2A 4GOTA 5HPQA 3QIMA 1OQHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MAGA 1B7UA 2XD3A 3CFXA 2HXRA 4GWOA 1VFDA 4GX4A 2XXPA 2F8DA 5I2NB 4NF5B 1NUYA 3DLNA 5AE4A 3TTLA 3HHGA 3ILUB 1NNFA 5F1QA 4GX3A 4NF6A 1FPBA 1Y3NA 4TLMB 1LAXA 3EQ1A 1GTKA 3IAZA 1LB8A 4LATA 5CC2A 2V4CA 4X9TA 4N4UA 1B0HA 4OHNA 3IFCA 3HFUA 4RJZA 3RGYA 3PPPA 1IIWA 3E78A 4H65A 3PUXE 4PDDA 1YCJA 1QKAA 4PC9A 4G8NA 4KD5A 4XKPA 2E0SA 3U94A 4OTEA 1FTKA 1PB7A 3I3VA 1B6HA 1NV2A 4F19A 2AL4A 3KEIA 3A3UA 1P1UA 4NF8A 3E9XA 1FPGA 3MJNA 3TCFA 5M2VA 1Y9UA 4QFKA 4FECA 1SW4A 4POWA 3VLUA 4YKPA 4C0RA 5I56B 3FJ7A 4ISUA 4ZZEA 3DELB 1I6AA 3T96B 4LZ7A 1AWBA 2QS2A 4O3CA 2R71A 1IZ1A 4IGRA 1B46A 3EPEA 1FTAA 3K6WA 4N17A 4XKRA 4UABA 5AA2A 2PX1A 2R8TA 1UIVA 2Z23A 1A40A 1FBCA 3MPLA 4P11A 2P3NA 2V84A 3GLBA 3L6GA 2RC9A 5FHMA 3FD3A 4PQJA 4JVIA 5I57B 1B2HA 4QSCA 4F2OA 4AQ4A 1LBBA 4KYDA 3VXCA 1S9TA 4H45A 2KLFA 1URDA 1YPNA 2BJIA 3CG3A 1IXCA 4I9DA 3KN7A 3TTKA 1B40A 3FZVA 1NFTA 5LTCA 4L17A 2R6GE 4FATA 1EYJA 1QUJA 1TFDA 1BLFA 4NGUA 5CMBA 3KZGA 1RDZA 3PPOA 1F9BA 3O6HA 3UA8A 3HHFA 3C4MA 2RC8A 3V83A 3U92A 2DQVA 1M5CA 3C33A 2QJEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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