2A5TB

Crystal structure of the nr1/nr2a ligand-binding cores complex
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
278
structure length
276
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Subunit arrangement and function in NMDA receptors
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport,membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords N-methyl-D-aspartate receptor NMDAR1-4a subunit
total genus 80
structure length 276
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2a5tB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2a5tB02
4LATA 2I4CA 1IXHA 3ILTB 1B40A 5L9MA 5CMMA 3RY3A 4EQBA 4O3BA 3GXAA 1XC1A 1BKAA 3FXUA 4K3FA 2PX1A 4LP2B 1N84A 4ND9A 4WXJA 3FUZA 3DM0A 5L9OA 4OEVA 2GRVA 1IZ1A 3K6WA 3FVOA 1LB9A 3GBAA 3RLFE 2H4IA 5FTHA 1Y3PA 1R9LA 2XX7A 2Z8EA 3BKIB 3V89B 1XT8A 2ONKE 3ZSFA 1MPBA 3VXCA 3O6HA 2VOZA 1B32A 2YJPA 1A55A 2XX9A 3FV2A 2Z23A 4YMBA 4BDMA 4Q30B 4GIZA 1UIVA 3UK4A 1D9YA 2DWHA 3HHGA 1S9TA 4IO6A 3B7DA 4LQ2A 4U1OA 4DDDA 4RNSA 3EQ1A 3K02A 3FVKA 3HV1A 1SYIA 3G3HA 4I62A 3MUQA 1MY2A 4ELPA 4NWCA 2AL4A 5CMBA 2D5WA 2ZNTA 2Y7PA 1Y4CA 4EQ9A 4R74A 1B3LA 2DP8A 2YLNA 5ICTA 4LZ8A 4H8IA 4NF5B 4RK2A 4XKRA 1IUDA 4NF6B 1HSJA 1UTBA 1O64A 1R6ZA 2DWJA 1SW5A 5K2XA 2YPNA 1QJMA 1FQDA 3T9HB 4F3BA 1BLFA 1Y20A 5CMCA 1P1OA 4DXCA 1QULA 2XXXA 3FXQA 3VE1B 3CI8A 3SETA 3TTRA 4RPOA 3KSXA 4IO2A 4ECFA 2O1MA 1B7UA 4EF1A 2DWAA 1JNFA 2VD3A 3KN8A 1OVTA 4YMAA 2ESNA 2BJJX 4N13A 4OETA 1LBBA 3OEMA 4KCCA 2FYIA 2OBGA 1LB8A 4BLAA 1IEJA 3T96B 1URGA 4IY6A 3PPQA 2XXHA 4FECA 1MY3A 1B05A 3GLBA 4OMBA 4FEBA 4LVQA 3TELA 1UTHA 2O68A 3C4MA 3H06B 4F1UA 4JXIA 1ZMGA 2VP1A 1NNFA 3M8UA 1NNTA 3PUXE 3KSJA 3T22A 1AOVA 3V8XB 3PMWA 2OWTA 2E0SA 1N0TA 2DE3A 5DVIA 4EDPA 1JW4A 2F78A 4AQ4A 1SQYA 1NH7A 5KCJB 4LA9A 4F3GA 4MH5A 5KDTA 5I84A 3HPIA 5I58A 5DEXA 4U23A 4KYSA 3N26A 1US5A 3K00A 2V84A 3H3GA 2PVUA 1UQWA 3IB2A 1LCFA 3T9XB 1VR5A 1MDP1 3EF7A 1P99A 2HAVA 3T9VA 2REJA 4OEUA 3FASA 4HCYA 4QFNA 1VE4A 2ZNUA 3TTLA 2GFEA 5H8FA 3H4ZA 2F35A 1QKAA 2OJTA 1ATGA 1B3EA 1WVJA 1B5HA 3FJGA 3K6UA 1HSLA 3A3CA 2O51A 3WAEA 1LLSA 2Y7IA 3OO9A 2ZXTA 1VSOA 1GTKA 3C36A 1BP5A 2R9JA 1MXYA 4H67A 3PUZE 3C9HA 5I59B 4KFQA 3PU5A 3CRBA 3MVZA 1A40A 3TFLA 3W9VA 4QHQA 3W15C 1MXUA 4KD5A 3SKPA 1HSEA 1RYXA 3G3FA 3I3VA 2O1LA 2QMWA 1EZPA 1XS5A 4NMYA 1BIYA 4ONYA 5ITOA 2DVZA 3G3KA 4LUBA 1FTLA 3F11A 4RY1A 1XVXA 3C33A 3SERA 3B6TA 3OXNA 1N7XA 2O69A 4YB7A 3TAJA 2X7PA 2F7AA 1J1NA 3S4UA 4DXUA 2I49A 3UA8A 5CBSA 2F7CA 3MVYA 2F34A 1N76A 4IO7A 3MQ9A 2I3WA 3V83A 1ZBMA 2ZYKA 4G8NA 3MW0A 4YAHX 4NE4A 4GOTA 2RCBA 3O66A 4ZEDA 2REGA 4E0XA 4ZS9A 4FIMA 5CC2A 1DMBA 2XD3A 1NL5A 2HQ0A 5ISUA 2W7YA 3ONMA 1ZKBA 1N04A 5I56A 1YTVA 2ZYMA 2NWJA 4ESWA 2UVGA 2CZLA 3C34A 5I2KB 3LSXA 2H5YA 5I57A 3OSRA 1ZLQA 4HTGA 3RT6B 1QKBA 3G3IA 3K1MA 3KGCA 2Y7KA 1I6BA 1SW2A 4JWXA 4NF8A 2OWSA 3FVGA 3KOTA 2IA4A 1MM7A 3KG2A 4LQ5A 2OK2A 3VLWA 1SW1A 1AL3A 1B1HA 4H65A 5TU0A 3Q28A 2Q89A 2QPQA 3Q29A 3FXRA 3N5LA 4GXAA 3JV9A 4HW8A 4GVOA 5TP9A 1POTA 4R75A 4KCDA 5AA1A 1YCJA 3PUVE 2XHDA 4G68B 4QFOA 1MY1A 1MDQA 1WODA 5AE4A 1D9VA 1LFIA 3VFJA 4G8MA 1MPDA 3H6UA 1ELJA 1DPPA 3IORA 5CI5A 4U4XA 2WKYA 2V25A 3K6VA 3C32A 1O7TA 2FA7A 4NF4A 2D21A 3H6WA 1T0KA 4PFUA 5I2NA 4GF8A 1SI1A 1F9BA 2F6GA 4H1XA 3TUSA 4I1DA 3TQWA 4OHNA 4IGTA 5JTYB 3IX1A 1M5CA 1NFTA 4ZEKA 5CBRA 4NTLA 1LSTA 1OQGA 3K01A 4GD5A 3Q27A 1QUKA 5B7DA 1TFDA 1OVBA 3LSLA 2XXRA 3EHUA 4ZEIA 1H45A 1RYOA 2RF1A 4OFJA 4OESA 4OYVA 2E1SA 3SEYA 4OZ9A 4AB5A 3JYRA 3HO7A 1URSA 3EN3A 2QJEA 4R6YA 3B6WA 3ECRA 3TTNA 4P0IA 1B3GA 3O6IA 1MG1A 3S9LC 4RPNA 5B70A 1R1NA 1B4HA 1OQHA 2RKMA 1UTBB 5DVFA 2XXWA 2Z8DA 2HFBA 3RPWA 2HEUA 1SVXB 5ELVA 5CMKA 5H8QB 3MC2A 3T9UA 4O3AA 2DSFA 1AH5A 4KI0E 2I48A 1B6HA 4G68C 3EHTA 4X1BA 4TLLB 3G3JA 1L5TA 1R9QA 5FHOA 3MAMA 2AYSA 4G77A 3THIA 3OO6A 4R6KA 3C31A 3WAFA 2FNCA 1EZ9A 4QFPA 3IOTA 2O7IA 1MY0A 2QS1A 1B3FA 3G3GA 4BDQA 2I0CA 3CFLA 1JVYA 1H3DA 2HZLA 5AA2A 1YAEA 2Q8JA 2F8DA 3TCHA 4QSDA 3MVXA 1OLAA 4ZECA 3T93B 1Z7NE 2Q88A 1JW1A 4R2BA 3IO4A 4EXLA 4U1ZA 1CE2A 3R6UA 5L8DA 3RTWB 3FGSA 3KJTA 1JEVA 4E0WA 1LAHE 2QL3A 3K6XA 4YKKA 2HXWA 1A8EA 4FORA 3CSGA 5K2YA 5DT6A 4H0WA 5H8NA 3E13X 4GWOA 2HZKA 5HM4B 3KN3A 4C1TA 4F18A 2QS4A 4RXLA 3VVEA 3M3LA 4ELQA 3O29A 3ZKKA 4F1VA 4TOZA 1B1XA 2B3BA 3TTKA 4HCWA 5A5XB 1JEUA 4DCXA 1RKMA 4WEPA 2P2AA 3VDFA 5AA3A 5DVJA 5J1DA 4AB6A 3CFZA 2A5TB 3TEPA 1PB9A 3U93A 1DTGA 2PT2A 5H8SA 1GVCA 4I8CA 1DSNA 4TLMB 4NF5A 3OOAA 1MH4A 2M8CA 4NF6A 1GV8A 4R9FA 3BBRA 1ANFA 4KYEA 1QUIA 1NMUA 3VLVA 1A99A 4X48A 2PBWA 5L9SA 1UIUA 2B3FA 3GBBA 3OSQA 1S7YA 1FQFA 1N3WA 2GHBA 4OENA 4JWYA 4YB5A 2UXAA 3QXMA 3FJ7A 3H7MA 1JW5A 3G7WA 1B58A 3HCQA 4BDNA 2XXTA 3SEWA 3QIMA 2RINA 5BUUA 3TPAA 4FAJA 1USYH 1AMFA 3SEVA 3DP6A 2UVHA 4GFRA 2O84X 3KN7A 2QS3A 4OWDA 2ONSA 4QFKA 4XKQA 1MS7A 1Q1KA 2DXRA 4MBPA 2CMOA 3B6QA 2ONRA 3I5OA 3I6VA 4PP0A 1EU8A 2V93A 5DYHA 2Y7WA 4YZZA 1PB8A 2F36A 2Y7RA 1SDXA 1M5DA 1USYE 3VXBA 4OERA 4UACA 1POY1 3DELB 3M3FA 5TPAA 4XXUA 4PFTA 5KCJA 3TODA 3VVDA 3MPLA 3H6TA 5I57B 3LUYA 4RA1A 3VLUA 1H76A 4UA8A 5AA4B 3IK6B 2DYXA 4QFLA 2THIA 3TCGA 2OLBA 4ZEBA 2XD2A 4I9DA 4IO5A 4XKPA 2ALUA 2Q9TA 4ZEFA 1M5BA 4KR5A 3LBSA 3R26A 4BDLA 4EF2A 4PFWA 1FTOA 1LCTA 3EHSA 3ZKLA 1FCKA 2Q2AA 2UVIA 4G2ZA 4MFIA 2QRYA 2RC7A 3N6TA 4JWOA 4P0GA 2I6EA 1DTZA 1M5EA 4JSOA 1MH3A 2QSXA 1B2HA 3OELA 4QSEA 5ITPA 1H43A 1QW0A 3KOSA 4G8HA 3D4GA 3JZJA 3KFMA 4U21A 5HPQA 1FTKA 3MZBA 1US4A 1OLCA 1DPEA 3KZGA 1OIBA 2ABHA 3PPPA 3S9MC 4H5FA 1FQCA 1D3KA 4QF9A 3MPKA 3S2VA 1B5JA 3K2DA 3QUFA 1LGBC 4Z7EA 2DXYA 1MY4A 2H98A 2DE4A 1YPNA 1VFDA 3O28A 4YKPA 4THIA 5KZTA 3IB0A 4O3CA 2R6GE 2ZMBA 1TWYA 1I6AA 4XTCQ 4LONB 3D4CA 1B52A 2QMXA 2GHAA 3BFUA 1MRPA 2F7BA 1PEBA 4JB7A 1MQGA 4RJZA 1MQIA 2DS9A 2UYFA 1IITA 2P1SA 3ILUB 3C35A 3S9EA 1B5IA 3FZVA 3VV5A 4KHZE 2LAOA 5F7VA 4GRKA 4R73A 3KJ7A 3QUJA 1P1WA 4OVJA 3CVGA 5H8HA 2PT1A 1BTJA 2V3UA 3SEXA 1IIWA 4DE8A 1P1NA 4ZZEA 5I2KA 2XXPA 2R71A 3RGYA 1EZOA 1I69A 2GH9A 4RK9A 3TYHA 3QK6A 3OD7A 3ODBA 1SI0A 4OFOA 1EH3A 4QSCA 1LAXA 4BDRA 5AA2B 1DOTA 3PUWE 4YICA 1FQAA 2NXOA 3TDJA 4TQUQ 2Q2CA 3OO8A 5IKBA 3KEIA 1B51A 1TFAA 3SEUA 1JETA 2X26A 3PUYE 3UORA 4ELRA 1FQEA 4G68A 1A8FA 2NVUB 2G29A 3A3UA 2OCUA 1JVXA 4LZ5A 4POXA 4MF3A 4U4SA 1FTJA 1ZIUA 3PGFA 1N3XA 1Y9UA 4X1DA 4JDFA 3OEKA 1SBPA 3U72A 2H99A 1KWHA 1Y4TA 3OMBA 3L6HA 3E4RA 3K1PA 4ZE8A 1NKXA 1LBCA 1B3HA 1B46A 5H8NB 1B4ZA 1P1QA 2RC9A 1B7ZA 3U8QA 1MXVA 1PBPA 4F2OA 3AXFA 5HBCA 1SD3A 4RYAA 4LZ7A 1VFEA 2DE2A 3LSFB 3TKDA 3K0VA 3TMGA 4KPTA 3O6GA 5JTYA 2DVCA 3N6UA 4PE5B 1SW4A 2D3IA 1UTHB 3IO6A 3TTMA 3QSLA 1IXCA 5FTIA 3U94A 2VHAA 1TT1A 3P7IA 4L17A 3R7XA 2I0BA 1JQFA 3QYTA 2I3VA 3IOUA 1IQ7A 4YKJA 1LAFE 3IJOB 2VGQA 3MP6A 4QRZA 5EHSA 4M1VA 5CRYA 4MLQA 3A09A 4Q5TA 4OTEA 3IR1A 3TQLA 3MZ1A 4BDOA 5KDTB 4DCYA 5I58B 5DEXB 5H8QA 2XX8A 4YU0A 3LC8A 3MP1A 4PQJA 3FV1A 4PETA 2UVJA 2HCAA 4R72A 1XHYA 3E9XA 2F6PA 5DTBA 4ZZAA 5AA2D 2RC8A 4N6PA 1URDA 2AIXA 1XVYA 5H8FB 3DP4A 2Z22A 3MP8A 3CSBA 3T66A 4H8JA 3MVWA 5F1QA 4F29A 5LOMA 4DXBA 2OZZA 4GLIA 1AIVA 5FHNA 3DLNA 4WKMA 3O9PA 4POWA 4M4GA 4Z0IA 3VVFA 4KYDA 2ANJA 2DOJA 4ELOA 1B7HA 1FTMA 2ZNSA 4NEDA 2UYEA 3RT8A 3O2AA 2XXYA 1TXFA 4ESXA 4Q8RA 1ZU0A 3PD8A 3K4UA 3ZS6A 5TPAB 2F97A 3CIJA 4YKIA 3EPEA 1S50A 4GXSB 1NH8A 3PPOA 3QAXA 2NUVA 3IJXB 4EXKA 4GL8A 3FATA 3PD9A 4ISUA 3UIFA 5ICQA 2XXUA 3U1OA 3RTFB 4OQOA 2KLFA 3S9NC 4NWDA 4PFYA 4IO3A 4KQPA 3FD3A 3MBPA 4GQOA 2V3QA 4R6HA 3K1NA 3CR9A 1MPCA 3RN8A 3USDA 5EHMA 2I4BA 5A5XA 4FEDA 3E3KA 4G4PA 3IB1A 4EQ7A 3FVNA 1MQJA 4IGRA 2Y84A 2A5TA 4Q0CA 4F3SA 1SYHA 3TZAA 1ZJLA 3HN0A 5BWJA 3L6GA 1O63A 1GR2A 1QVSA 4IB2A 3IOVA 4XKNA 1XOCA 5I56B 1ZTYA 5JEIA 3PMVA 4FATA 2XXQA 3DP8A 1Z7ME 1Y3NA 3H6VA 2H9BA 2VD2A 1A7LA 3KBRA 4DIGA 4F22A 3LR1A 1Y1ZA 1PC3A 4NF8B 4YB6A 2V3TA 4R9GA 1H44A 4FE8A 2P0SA 1MQDA 4DZ1A 3IL1B 1PB7A 3IOWA 2ZYOA 3MWBA 5TP9B 3CG1A 1OMPA 2X7QA 1IXGA 2PYYA 1LFHA 4F2QA 5JK4A 3PPRA 2F5XA 3UGWA 1Y1MA 3UP9A 3O97A 1FQBA 4ZE9A 3BFTA 4OXVA 3V5AA 2XXVA 3MJNA 2DQVA 2O6AA 5I59A 4HS7A 3TCFA 2G93A 3UN6A 2NOOA 4X9TA 5EYFA 2QS2A 4U2RA 1Y3QA 4NF4B 4IY5A 5H8HB 1WDNA 4WEDA 4XIGQ 3RQTA 5I2NB 4OFLA 3PPNA 4F1YA 1MQHA 3H03A 1Q35A 1MXXA 3PV0E 4DLDA 1MXZA 4C0RA 5AA4A 2DWIA 1QUJA 3MZ9A 3Q25A 3M3KA 2RCAA 5IAIA 3N94A 4H5GA 4F39A 1B0LA 3FJMA 1MM6A 1NNPA 2Z8FA 3FIRA 4GL0A 1MXWA 1CB6A 1LFGA 4U22A 1N7WA 1IXIA 2A5SA 3HHFA 5FHMA 3OO7A 1II5A 4EUOA 4P11A 1A54A 1LAGE 4MLVA 4JBZA 4F31B 3PMXA 4H6DA 2XXIA 4ZDMA 1GGGA 2I58A 1I6QA 1M5FA 1B9JA 3CG3A 3U92A 2HAUA 1D4NA 4C1UA 4N07A 3SDFA 3RNNA 4IO4A 3RUMA 5M2VA 1PBQA 2B65A 4FJPA 2O7UA 3HSTA 2IEEA 2ZYNA 3OENA 1B0HA 4JSDA 2AL5A 1P1UA 2H25A 3Q26A 3GZGA 4R2FA 3IAZA 2PMSA 1FW0A 3CFXA 4F19A 4F3PA 5CM6A 1PDAA 3W9WA 3SESA 1NNKA 3LSWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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