2DE2A

Crystal structure of desulfurization enzyme dszb
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
347
structure length
347
Chain Sequence
RDTLTYSNCPVPNALLTASESGFLDAAGIELDVLSGQQGTVHFTYDQPAYTRFGGEIPPLLSEGLRAPGRTRLLGITPLLGRQGFFVRDDSPITAAADLAGRRIGVSASAIRILRGQLGDYLELDPWRQTLVALGSWEARALLHTLEHGELGVDDVELVPISSPGVDVPAEQLEESATVKGADLFPDVARGQAAVLASGDVDALYSWLPWAGELQATGARPVVDLGLDERNAYASVWTVSSGLVRQRPGLVQRLVDAAVDAGLWARDHSDAVTSLHAANLGVSTGAVGQGFGADFQQRLVPRLDHDALALLERTQQFLLTNNLLQEPVALDQWAAPEFLNNSLNRHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure and desulfurization mechanism of 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinic acid desulfinase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Rhodococcus sp.
molecule keywords DIBENZOTHIOPHENE DESULFURIZATION ENZYME B
total genus 113
structure length 347
sequence length 347
ec nomenclature ec 3.13.1.3: 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinate desulfinase.
pdb deposition date 2006-02-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2de2A01
3.40.190.270 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 2de2A02
3CFXA 5KDTB 4FE8A 3OD7A 4OENA 3VXCA 4ZZEA 5AE4A 3MP8A 1Z7ME 1IUDA 5DT6A 4QSEA 3SETA 5DEXB 4DLDA 1XHYA 1OVTA 3RGYA 4GL8A 2B65A 1WODA 5I2NA 1NKXA 2XXIA 2HZLA 4PE5B 3KGCA 1RKMA 4ECFA 3LSFB 3B6QA 1Y4TA 3CSGA 1SI0A 3OOAA 3N6UA 4F3BA 5I56B 3E9XA 2VD2A 3OXNA 2GH9A 3S9MC 2GFEA 5KCJA 1R9QA 2V3QA 4H8IA 4KQPA 3Q26A 2XXWA 4DDDA 4YICA 3CRBA 5I84A 4AQ4A 1OQHA 4PQJA 1OMPA 4OWDA 2P2AA 1QKBA 1I6BA 3VLUA 4IY5A 4X48A 2XHDA 4KPTA 5AA2D 3O97A 4ELQA 4FORA 2XXVA 4M4GA 3OSRA 3DP8A 5TPAA 4ZE9A 2H5YA 2HCAA 3FV1A 1GV8A 2Z23A 3W9VA 4ZDMA 4MFIA 3U72A 5H8SA 4O3CA 3MP6A 3M3LA 5CBSA 3IJXB 1PDAA 4EQ7A 2X7QA 3QSLA 1L5TA 1M5DA 4U1OA 5I58B 2DXYA 4ESXA 3PD9A 4BDNA 2DE2A 4Q5TA 4ZEKA 3JYRA 4R2BA 4GLIA 2XD3A 1UQWA 1BIYA 3KG2A 1LBCA 3C9HA 4GOTA 3TFLA 3U94A 3FXRA 2QS1A 4MLQA 1N04A 5I2KA 3VFJA 4LA9A 1MQDA 4F18A 1QUJA 2YPNA 1HSJA 1D3KA 3RTWB 4GVOA 2QS4A 1OVBA 1FTMA 1MPCA 4LUBA 3I5OA 3PPOA 1PB8A 2ZYKA 3CFLA 2ABHA 4R74A 2IEEA 2Q2AA 4JSDA 2GHBA 3T9UA 1MXYA 3K1PA 3U93A 4DE8A 1P1OA 1M5BA 4EXKA 3G3KA 2QSXA 4YKKA 3TQLA 3OO6A 4G8NA 1GGGA 4F3PA 1VE4A 1B0HA 3ILUB 5L9MA 2LAOA 3PUYE 1IXHA 2F8DA 3EN3A 2DE3A 1USYH 1B1XA 3ZKLA 3ZSFA 4KCCA 1UTHA 4JB7A 4KFQA 4EUOA 4C1TA 2THIA 1EZ9A 1MM6A 1ZLQA 3SDFA 3UK4A 4ZE8A 4RPOA 3V5AA 5KDTA 3VVDA 1B3GA 4ND9A 1MXUA 2ZNUA 1BKAA 2ZYMA 4I9DA 4IO6A 3TELA 1A40A 5DEXA 1B7UA 1LGBC 4GWOA 5CMCA 3WAEA 3FVGA 2F97A 3SEVA 3UP9A 3JZJA 1P1QA 5BUUA 3OEKA 2NXOA 1FQDA 2F78A 1B1HA 2DP8A 4IGRA 1I6AA 3MC2A 4LVQA 1ELJA 3VLVA 1MY4A 1H45A 1JW4A 2I58A 5I56A 5ICTA 1B58A 3KSXA 1YPNA 3SKPA 2DS9A 3E4RA 2I3VA 3KJ7A 3RT6B 1MPDA 1ZTYA 4XIGQ 4ELPA 1Z7NE 1B3LA 2HXWA 2W7YA 1USYE 2DWHA 3VVEA 1MDQA 4OVJA 1PEBA 2F34A 1ZKBA 2O69A 1IZ1A 3TTMA 3QUFA 4GFRA 5IAIA 3TCGA 3HHFA 1N7WA 3IOWA 1DPPA 1MY2A 1POTA 5H8FB 4ZEDA 4KYEA 4IO4A 3K4UA 3L6GA 1NNFA 4OHNA 2PYYA 3TEPA 2RC7A 1ZBMA 5I58A 3C33A 2V25A 1FTOA 3W9WA 2HZKA 4TLLB 4G8HA 3O9PA 3MAMA 2OWSA 2ONSA 2YJPA 1R1NA 1PB7A 3CG1A 3FATA 1QKAA 1B05A 3O66A 4GL0A 4GXAA 3QK6A 4MBPA 2OLBA 4EF2A 3C34A 3DP4A 2Y7KA 1NFTA 4WEPA 4YZZA 2QMXA 2QMWA 3K6XA 1DSNA 4QFOA 1GVCA 3PUXE 4ZEBA 3T9HB 1Q35A 1XC1A 1US5A 1A99A 3IORA 2AL4A 4F1YA 1MQIA 4RJZA 2PVUA 3RPWA 1RYXA 4U4XA 4I62A 2O68A 4H8JA 1XOCA 2RINA 2F6PA 3QXMA 4DXBA 3UORA 4L17A 1TXFA 4XKPA 2Y7IA 1QUKA 4YB5A 1FQBA 2AIXA 3OO7A 4OQOA 2XXYA 3S2VA 3Q27A 4PP0A 5I59B 1QUIA 3N6TA 2I4CA 5CBRA 3TMGA 4YKPA 5L9SA 1XS5A 4X1DA 2F36A 1N7XA 2QPQA 4DCYA 3Q28A 4Q8RA 3FASA 4N13A 1LBBA 5B70A 1LCTA 4POXA 5JTYB 4GRKA 2XX7A 4WKMA 2KLFA 3K02A 3OENA 3PMXA 5F1QA 3DLNA 2H9BA 4JWYA 4XXUA 4KD5A 1QULA 3BFTA 4OERA 1UTBB 3KFMA 3S9NC 2H4IA 4YKJA 2P1SA 1TWYA 3IJOB 3MPLA 1FQCA 3U1OA 3MVZA 1Y3QA 4G77A 1UIVA 1CE2A 3MZ1A 4ZEFA 4MF3A 4E0WA 2UVGA 4RK9A 4PFYA 2AL5A 3FJ7A 3U92A 5JEIA 2CMOA 3PUWE 2Q89A 4OEVA 4AB5A 3QYTA 1D4NA 4NMYA 3KJTA 3O29A 2O7UA 2G93A 1M5FA 4OZ9A 1NH8A 4I1DA 3IAZA 5TP9A 5H8FA 2O51A 2F7AA 4THIA 5L8DA 3W15C 4IO5A 2OWTA 4RXLA 4ZECA 2A5TB 1B3HA 4HCWA 3MVXA 1M5CA 1LAGE 4NF5B 1Y3PA 4H5GA 4KYSA 1Y4CA 4F31B 3SEUA 3RTFB 3H6WA 5FHOA 4LQ2A 3M3FA 1B46A 4ZS9A 3VXBA 4NTLA 3T9XB 4C1UA 5DVIA 3T9VA 5ICQA 2O1LA 1SYHA 2Q8JA 3H03A 3PPQA 3B6WA 2XXTA 1YTVA 5TU0A 1IQ7A 1ANFA 1TFAA 1JNFA 1GTKA 4JWXA 4R72A 2REGA 3ODBA 1H76A 5AA4B 1AOVA 3M3KA 2HQ0A 1PBPA 3H6VA 2ESNA 3FXUA 5EHMA 1MY1A 4X1BA 1O7TA 3M8UA 3EQ1A 3CG3A 1HSEA 3KZGA 1JQFA 5I59A 2I49A 5H8QB 1LAXA 1XT8A 4U21A 1ZMGA 4H5FA 4QFLA 1ZU0A 3FUZA 4QRZA 2PMSA 1MXXA 3TTKA 4MH5A 3FGSA 5JTYA 4PFWA 3IR1A 3MWBA 3HSTA 1HSLA 1URGA 1M5EA 1NNTA 3QUJA 4BDMA 1NNPA 3ZS6A 2GHAA 5H8NB 4NWCA 4QFKA 1Q1KA 1FTLA 4FECA 4RK2A 1MRPA 1SYIA 5A5XB 3F11A 1A8FA 3B6TA 1UTBA 4F2OA 1Y3NA 3PUZE 4OMBA 2XXUA 3K6WA 3KBRA 4NEDA 4NF4B 4P0IA 4ZEIA 3TAJA 1TFDA 4ELRA 4JBZA 1A54A 1LSTA 3KN3A 3C36A 3DM0A 4YB6A 2QS3A 3DP6A 3I3VA 1URSA 5J1DA 2OK2A 4RPNA 1A7LA 1B5HA 3FJMA 4UA8A 3DELB 1AIVA 2Q9TA 3H3GA 3TUSA 3QIMA 2UVHA 1VFEA 2VGQA 1IXGA 5CMKA 4LZ5A 5HPQA 2B3BA 2D5WA 3MVWA 1WVJA 2I4BA 3GBAA 3VLWA 3C4MA 1BLFA 3QAXA 3MQ9A 2A5TA 4YU0A 3CR9A 1AH5A 1VR5A 1RYOA 2E1SA 5LOMA 1SDXA 4RA1A 4NF5A 1J1NA 2O6AA 2QS2A 5FHNA 1B2HA 3PPPA 4R9FA 3TCFA 3TKDA 2I3WA 3PMVA 1SW2A 3K6VA 3PMWA 2P0SA 2I0CA 4LP2B 5ELVA 4TQUQ 1DMBA 1URDA 3PPNA 1NNKA 3G3GA 3G7WA 2CZLA 3TQWA 5CMBA 5AA4A 5TP9B 2G29A 4BDRA 1P1NA 2FNCA 2ZXTA 3KSJA 3H6UA 4R6HA 4WEDA 1B51A 3Q25A 2OCUA 3FIRA 2PBWA 1ATGA 3V83A 5H8QA 2R9JA 2Y7RA 3H06B 1LAHE 4FIMA 2F35A 1SQYA 1D9VA 2H99A 1B3FA 1SW5A 1LB8A 4OYVA 3VE1B 3G3IA 2VHAA 2HAUA 2XXHA 3VV5A 4NF8B 4OESA 2DWJA 1LCFA 2VP1A 5EYFA 5AA2B 1B9JA 1ZJLA 1R9LA 1MY3A 3K1MA 3OO9A 5H8NA 1LFHA 2O7IA 3H7MA 4BLAA 4X9TA 3P7IA 4H0WA 1JETA 5H8HB 3T66A 2O1MA 5A5XA 3IOUA 4IB2A 4OFJA 4NF6A 5ITPA 2V84A 3UIFA 4KR5A 4HTGA 4IO2A 2B3FA 4U1ZA 3C31A 1FQEA 4NF4A 1B5JA 4ELOA 3SEXA 4ESWA 3K1NA 3T22A 2RCAA 2NOOA 3TDJA 1Y1ZA 5I57B 2ZNSA 2UVIA 3SERA 4QFNA 1FCKA 2HAVA 2OZZA 4FATA 1WDNA 4LQ5A 4UACA 3I6VA 3O28A 3UN6A 2NVUB 1B6HA 1LFGA 3TTLA 5IKBA 3KOSA 4FEDA 3PV0E 4AB6A 2ZNTA 3LC8A 4LATA 1S50A 1SW1A 2DQVA 1O63A 3THIA 4LZ8A 5BWJA 4QHQA 5B7DA 1BTJA 3IO6A 3R6UA 4GXSB 4YB7A 2IA4A 5K2YA 5CC2A 4IO3A 3FJGA 4R2FA 4HCYA 4EXLA 3A3CA 5FTHA 3IB1A 1DTZA 2FYIA 3GXAA 3S9LC 4DXUA 2I48A 1A8EA 4Q0CA 3O6IA 1MPBA 4G68C 2DWIA 3K0VA 2RC9A 1B40A 4EDPA 3OEMA 3G3HA 3V89B 3TTRA 1II5A 1B4HA 1SD3A 5L9OA 4Z0IA 1GR2A 2F5XA 2UVJA 3JV9A 2DSFA 3H4ZA 4ISUA 3EHUA 3EPEA 3IK6B 1XVXA 2FA7A 3TTNA 3C35A 3K2DA 2REJA 4F3GA 4XTCQ 1POY1 2H98A 2XXRA 3CVGA 1T0KA 2GRVA 2QRYA 2NWJA 4FAJA 2E0SA 1MXWA 2I0BA 1MG1A 3LR1A 2UYFA 3UGWA 2RC8A 1B0LA 1IIWA 2XXQA 3MZ9A 1MS7A 1NL5A 1JEVA 3RT8A 4G68B 5DVFA 3BFUA 4NF8A 1SBPA 4QF9A 4G8MA 5AA2A 2M8CA 2Q2CA 3FVOA 2UYEA 1ZIUA 3MUQA 4R6KA 3Q29A 1P1WA 4OFOA 5H8HA 1CB6A 4KCDA 2F7BA 3BKIB 4JWOA 1MY0A 3G3JA 3MVYA 3MP1A 1DOTA 3E3KA 3CFZA 4N07A 3IB2A 3ECRA 3K6UA 3FV2A 4QFPA 4R6YA 1AL3A 3CIJA 3T93B 5JK4A 3V8XB 5I57A 1VFDA 4MLVA 2V3TA 1S9TA 5CMMA 4U2RA 3B7DA 2R71A 3TPAA 3GLBA 3BBRA 4O3AA 4IY6A 3E13X 3IOTA 1N76A 1OLAA 2Z8DA 1JEUA 4TOZA 4YMAA 3MJNA 1QVSA 2Y7WA 4H6DA 4PFTA 2XX9A 1DTGA 1FTKA 1Y20A 3T96B 4DZ1A 4K3FA 3IB0A 2Y7PA 5KZTA 1AMFA 1SI1A 3G3FA 2D21A 3KN7A 2X26A 3A3UA 3OMBA 2V93A 2F7CA 2X7PA 3RN8A 3H6TA 1N84A 3TZAA 1H43A 4H65A 4FJPA 4ZZAA 3HO7A 2OJTA 3O2AA 4NF6B 5CM6A 1B32A 5AA3A 2AYSA 3RQTA 1LAFE 1QW0A 3PU5A 4BDQA 1H3DA 2ALUA 3MZBA 2ZYOA 5DVJA 4PFUA 1Y9UA 3TYHA 3SESA 3VDFA 2V3UA 2DVZA 3LSXA 3CI8A 5HBCA 3ONMA 3PD8A 2DWAA 3UA8A 4HW8A 4DXCA 1KWHA 4GIZA 2QJEA 1R6ZA 4E0XA 1B5IA 3HV1A 1S7YA 2O84X 1P99A 4OTEA 2RCBA 3EHSA 3ZKKA 2ZMBA 1MQGA 2I6EA 4OETA 1EZOA 4KHZE 2WKYA 4XKRA 4P0GA 1B7HA 1N3WA 1XVYA 2HFBA 1IEJA 3SEYA 2Z22A 3FZVA 3AXFA 2YLNA 5M2VA 4TLMB 1I6QA 4FEBA 4F2QA 1YCJA 2F6GA 3RNNA 2HEUA 4XKNA 4F39A 4KYDA 1B3EA 3HHGA 1OIBA 4HS7A 4G68A 5ITOA 3RLFE 3IL1B 3OO8A 1FQFA 4I8CA 1IITA 3MBPA 3OELA 4KI0E 2A5SA 1H44A 3HCQA 2DYXA 3O6GA 5CRYA 3RY3A 4U4SA 1MXZA 4H1XA 4DCXA 3GBBA 1OLCA 1JW1A 2Q88A 2DOJA 4EF1A 3R26A 4BDOA 2Z8EA 3FXQA 4RYAA 1FW0A 3L6HA 2H25A 2XX8A 2XXPA 4OFLA 1PBQA 4EQBA 4JSOA 2DE4A 5ISUA 4JDFA 1MDP1 3K01A 2DXRA 3PPRA 1QJMA 2RKMA 1MH3A 3D4CA 5CI5A 1YAEA 2ANJA 1FTJA 5I2NB 1LLSA 1O64A 3TCHA 1SVXB 4F1VA 4F19A 1JW5A 5DTBA 2OBGA 4R75A 4GF8A 4U22A 3HPIA 5FTIA 1D9YA 1NH7A 5KCJB 3EF7A 4IO7A 3N5LA 4G2ZA 3O6HA 2DVCA 3IO4A 4YKIA 4YMBA 1PC3A 4JXIA 3A09A 2VOZA 4POWA 5AA1A 1Y1MA 2NUVA 4OXVA 4EQ9A 4XKQA 4PETA 1B4ZA 3R7XA 3U8QA 3SEWA 1MH4A 3RUMA 3GZGA 4LZ7A 5TPAB 3USDA 3EHTA 2PT2A 1MQHA 4NWDA 3LSLA 1BP5A 3KN8A 1B7ZA 3PGFA 1A55A 3OSQA 4OEUA 3N94A 3CSBA 2XD2A 4F29A 1N0TA 2ZYNA 1IXIA 3LSWA 2RF1A 1JVYA 4RNSA 3IOVA 1US4A 4GQOA 4YAHX 3D4GA 4IGTA 4P11A 1N3XA 2ONKE 3MW0A 3HN0A 4F1UA 1B52A 3TODA 1I69A 5I2KB 1FQAA 1DPEA 4ONYA 1TT1A 1MXVA 1OQGA 1SW4A 5EHSA 4BDLA 1PB9A 4LONB 1IXCA 3IX1A 4F3SA 2Y84A 5FHMA 3FVNA 1NMUA 4M1VA 2R6GE 1JVXA 5K2XA 3K00A 1VSOA 5F7VA 1EH3A 1EZPA 4RY1A 4F22A 5DYHA 3FVKA 1F9BA 5HM4B 3FD3A 3WAFA 4Q30B 4QSDA 1MM7A 4Z7EA 2UXAA 4DIGA 2XXXA 2BJJX 2PT1A 3N26A 3S9EA 2ONRA 1LFIA 3S4UA 4R9GA 1LB9A 3LUYA 4C0RA 2PX1A 2D3IA 1P1UA 1EU8A 2QL3A 2VD3A 4O3BA 3C32A 1UIUA 4R73A 3VVFA 3ILTB 1UTHB 3LBSA 3PUVE 4WXJA 4H67A 4N6PA 4GD5A 3MPKA 4U23A 2Z8FA 4QSCA 1MQJA 4NE4A 3KOTA 4G4PA 3KEIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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