2DE4A

Crystal structure of dszb c27s mutant in complex with biphenyl-2-sulfinic acid
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
DTLTYSNSPVPNALLTASESGFLDAAGIELDVLSGQQGTVHFTYDQPAYTRFGGEIPPLLSEGLRAPGRTRLLGITPLLGRQGFFVRDDSPITAAADLAGRRIGVSASAIRILRGQLGDYLELDPWRQTLVALGSWEARALLHTLEHGELGVDDVELVPISSPGVDVPAEQLEESATVKGADLFPDVARGQAAVLASGDVDALYSWLPWAGELQATGARPVVDLGLDERNAYASVWTVSSGLVRQRPGLVQRLVDAAVDAGLWARDHSDAVTSLHAANLGVSTGAVGQGFGADFQQRLVPRLDHDALALLERTQQFLLTNNLLQEPVALDQWAAPEFLNNSLNR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure and desulfurization mechanism of 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinic acid desulfinase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Rhodococcus sp.
molecule keywords DIBENZOTHIOPHENE DESULFURIZATION ENZYME B
total genus 118
structure length 344
sequence length 344
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.13.1.3: 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinate desulfinase.
pdb deposition date 2006-02-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2de4A01
3.40.190.270 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 2de4A02
1VFDA 2O84X 4YMAA 3CSBA 4DCXA 3E9XA 2OZZA 2FA7A 3PMVA 4ELOA 1MG1A 3MPKA 4ZZAA 2Q2CA 4JWYA 2OBGA 3N5LA 4R73A 3KGCA 3RY3A 4PFWA 1F9BA 3EQ1A 3SETA 3FASA 4NF6A 1Y20A 4Q5TA 3E4RA 4FEDA 3CI8A 4KYSA 1ZLQA 3JYRA 3UORA 1LB8A 1II5A 4IY6A 2O7UA 4R9GA 4G8NA 4OMBA 3UP9A 1SYHA 3MP6A 5CC2A 2DWAA 1B46A 4OEUA 1A8EA 4I62A 1P1UA 4F3PA 4HTGA 3MVYA 2B3BA 1MQIA 4U1ZA 4Q0CA 3Q27A 4Z0IA 3U94A 3ECRA 4JWOA 3C31A 3TYHA 4F18A 4AQ4A 4PQJA 1J1NA 2XXWA 1P1OA 3TPAA 3B6QA 2Y7IA 1LSTA 2HAUA 2QMXA 1B6HA 2DWIA 1BKAA 2CZLA 2ESNA 4OQOA 4YKKA 2Y84A 2XXHA 3GLBA 5ELVA 2IEEA 3G7WA 2F7AA 5FHMA 4NWCA 3U1OA 1MQGA 4ZE8A 1QW0A 1NKXA 3ONMA 4NWDA 5L8DA 1IXHA 4AB5A 2QS4A 1B51A 2Z8FA 2Y7RA 4H5GA 1IZ1A 1B1XA 5AA2D 1Y1MA 3BFTA 4N6PA 1SVXB 1I6BA 4U23A 3TTNA 3P7IA 1N84A 4WKMA 1LAGE 2Q89A 4DZ1A 4QFLA 1ZKBA 1N3WA 1YCJA 3CG1A 1DOTA 4G68B 5H8HA 2Z8EA 3QSLA 3PMWA 3C36A 3UA8A 3U93A 1Y1ZA 2PX1A 3IOWA 3KN8A 1XOCA 5I2NA 4OFLA 3CG3A 2O1LA 5DEXA 5L9SA 2Q9TA 2UVGA 2OWTA 3HN0A 1QUKA 3CR9A 4I1DA 4TLLB 2QSXA 2VP1A 4ISUA 1FQEA 2AIXA 2P0SA 2O1MA 1B5JA 1IEJA 3R26A 4LATA 2XXUA 3CVGA 2ONRA 1OQHA 4JBZA 2RCBA 3OEKA 4RY1A 3KSXA 4OYVA 3W9WA 4IO7A 4JXIA 1PDAA 2Q88A 3UK4A 4QFNA 3O66A 1FQFA 3TQLA 3SERA 4FE8A 3MUQA 2O7IA 1EU8A 4EUOA 3V83A 3T96B 1HSLA 5KDTB 5IKBA 1QKAA 2NXOA 3Q26A 5H8FB 3KG2A 4ELPA 4F3BA 3IJOB 3TQWA 1OLCA 4NF4B 3FXUA 3PUYE 1JEUA 2QS3A 1HSJA 1OQGA 1RYXA 1QVSA 1O7TA 3ILTB 4KCDA 4FATA 5ICQA 5JTYB 3K2DA 3S9EA 1AMFA 4F3SA 2ZMBA 2GFEA 1Y3PA 3TTMA 3DP4A 1YAEA 4YB7A 4POWA 1VFEA 2FNCA 3FD3A 2H4IA 1PBQA 4H8JA 1NH7A 4ZE9A 4IO6A 4IGRA 2XX9A 1FTMA 5H8QB 1DPPA 1A99A 2H98A 1H44A 3PUVE 2Z23A 1A8FA 3M3KA 2H99A 5M2VA 1Y3QA 1MXXA 1SW2A 3DLNA 1CB6A 1YPNA 5DVFA 4HCYA 4P11A 1ZU0A 1LFGA 1BLFA 5EHSA 2AL4A 1SW5A 1VR5A 1MS7A 2ZYKA 1P1QA 4ZEDA 5I59B 4TQUQ 4U22A 3H6WA 4GVOA 4EQ7A 2OLBA 5I57A 2ABHA 5I2KB 5A5XA 2QS2A 3H7MA 3W15C 4YAHX 1MM6A 2Y7WA 4C0RA 4YKPA 3O6HA 3CIJA 1JNFA 1GGGA 2DSFA 1EH3A 3DELB 2PT1A 3TTLA 4XKQA 3ZKLA 3FVKA 3FUZA 2I0BA 3MW0A 3PUXE 1LB9A 3KBRA 3LR1A 4G68C 2E1SA 3IX1A 3U72A 1MPCA 1P99A 2DP8A 3PPNA 2M8CA 5ISUA 1MY2A 2AYSA 1AH5A 2E0SA 5BUUA 4LP2B 3PMXA 2XHDA 1FTLA 3FATA 4OFJA 2QJEA 3H4ZA 2ZYOA 1R6ZA 3KN3A 3PU5A 3WAFA 2A5TB 4GL0A 3QUFA 3OSRA 3RT8A 5H8NA 2DWHA 3OEMA 1WODA 2O6AA 4UA8A 1MH4A 3MAMA 4U1OA 4RJZA 4H67A 5B7DA 2R9JA 3JV9A 3VXCA 3K6UA 1D3KA 3FGSA 4ELQA 3CFXA 2PBWA 5HBCA 3MZ1A 5JK4A 5AA4A 2XXXA 1IXIA 5CM6A 5DVJA 3FIRA 1XC1A 4NF6B 3VVEA 3K1MA 1NNPA 3VXBA 5CBSA 5TPAA 3IB0A 1UTHA 5K2YA 4EF1A 3PUWE 2Z8DA 3G3JA 2D5WA 1IITA 3VLVA 4GRKA 4LZ5A 3KEIA 2HZKA 1B58A 3FV1A 1B4HA 3TKDA 3KOTA 4XTCQ 1H43A 2ZYMA 4OHNA 5F7VA 4RK9A 3TCFA 3T66A 5K2XA 2VD3A 2XXVA 4ZEBA 1EZPA 4THIA 5HPQA 4MF3A 1VSOA 1QULA 2D21A 1TFAA 3PPOA 3TTRA 2REJA 4YICA 1FCKA 3FJGA 4F2QA 1A40A 3K4UA 4OENA 3S9MC 2ZNTA 3H06B 4BLAA 4IO4A 1LLSA 1FTOA 1BTJA 2F5XA 3C32A 4GOTA 1B3GA 4RYAA 3IOVA 2V84A 2HAVA 2I0CA 1EZOA 1URGA 4BDOA 3T9VA 1HSEA 1MH3A 1BIYA 3MZBA 5FHOA 3VV5A 2V3TA 2CMOA 4HCWA 4RPOA 3R7XA 2AL5A 4X1BA 5H8SA 1LAXA 3QYTA 3TCHA 4E0WA 4QHQA 1N04A 1SI1A 2F7CA 1FTJA 3OOAA 2YLNA 3K00A 5H8HB 4BDMA 1R1NA 2I4BA 4N07A 1NNFA 3C9HA 2OJTA 1QJMA 3FJMA 1JVYA 5I2NB 1IUDA 5AE4A 3IB1A 3I3VA 1MY4A 3IOUA 1IQ7A 1LFHA 3G3GA 4MLQA 4H65A 1OVBA 5FHNA 1B3FA 4R75A 2I58A 2PMSA 2HXWA 2HCAA 4OERA 1WVJA 1S9TA 2XXIA 1BP5A 1B52A 3K6VA 2F78A 2HZLA 1PB8A 1B9JA 3PGFA 2OK2A 3OO9A 4F31B 2Q2AA 4G77A 2B65A 5IAIA 1NNTA 2ALUA 2GH9A 1N76A 3A3UA 2QS1A 1EZ9A 1N3XA 2I6EA 3O2AA 2Y7KA 4GF8A 2LAOA 3H3GA 2A5SA 1USYE 3RN8A 3BKIB 3B6TA 3LSLA 1NFTA 4BDLA 1LFIA 3N26A 4RNSA 4YKIA 4M1VA 1M5CA 2P2AA 1MQHA 2F34A 2I3VA 3S2VA 2X7PA 1MY1A 1XS5A 3KFMA 2W7YA 1OIBA 4ZZEA 3UIFA 2I49A 3N6TA 2THIA 4NF5A 2DYXA 1JW1A 3TELA 1MXVA 3LSFB 3SEXA 3K6WA 1O64A 1B40A 4DE8A 2DE2A 1B5IA 3EPEA 4PETA 4WEDA 3U92A 2ZNSA 2I48A 2XXQA 3FJ7A 1MXZA 4IB2A 3RPWA 1T0KA 4DDDA 1URSA 5ITOA 4X48A 4R2BA 3D4CA 4F19A 4NMYA 3PPRA 4IO3A 3MQ9A 2H9BA 3EN3A 3LC8A 5KCJA 4ESXA 3USDA 1NMUA 4Q30B 2XD2A 4NEDA 3T9UA 1MM7A 4RXLA 2UVJA 4O3AA 3CFLA 1FQDA 1B0HA 2XX8A 4RA1A 3RNNA 3OENA 3TTKA 4G68A 4KPTA 4OXVA 4YU0A 1S7YA 2RCAA 1FTKA 2O68A 1MDP1 4G8HA 3TFLA 2XXPA 1Q35A 4DIGA 4O3BA 3F11A 4MBPA 3SEWA 4OETA 2X7QA 1ELJA 1H76A 3H6TA 1NNKA 1B32A 3HPIA 3SEYA 3HCQA 1SI0A 5AA2B 5DT6A 5LOMA 5EHMA 4U4SA 5DYHA 3HV1A 3SESA 1MXWA 4F1YA 1JQFA 4PP0A 1JVXA 1QUJA 4IY5A 4EDPA 1DTZA 3PV0E 4MH5A 4R9FA 2QPQA 1B05A 1PEBA 4H5FA 2VD2A 1N0TA 4WEPA 5I56A 3CFZA 4XKPA 4ZEIA 1JETA 3A09A 2UYEA 1B3LA 4I8CA 1NH8A 3H03A 1DPEA 4KYEA 2NUVA 4FAJA 1DTGA 1POTA 3BBRA 4NF4A 5AA4B 2ZYNA 3EF7A 1GV8A 3PD9A 1TWYA 3IAZA 2QMWA 2RINA 5I58A 3Q25A 4TLMB 1UTBA 1UTHB 4KI0E 4C1UA 3KZGA 3HO7A 4U2RA 3FZVA 1MXUA 2DQVA 4H6DA 2DE3A 1B7HA 3LBSA 4BDRA 5KZTA 1TXFA 3SDFA 4P0IA 3QUJA 3D4GA 3C34A 4GD5A 1M5DA 3IK6B 3TAJA 3I5OA 3KN7A 1MY0A 3FVGA 3H6VA 3O28A 1LCTA 4K3FA 3BFUA 2I4CA 1FW0A 4KQPA 3LUYA 3K1PA 3V8XB 4KYDA 3S9NC 4GFRA 4QSDA 1PC3A 4R6YA 1VE4A 2G93A 3S4UA 4RK2A 4Z7EA 2UXAA 2FYIA 3HHGA 2QL3A 3K02A 2DVCA 4LZ8A 3EHUA 1R9QA 3TMGA 5BWJA 3JZJA 4R6HA 4LZ7A 4MFIA 4JWXA 1MRPA 3LSWA 1I6AA 4ZS9A 1ANFA 1WDNA 1L5TA 1GVCA 3LSXA 4QFOA 3Q29A 4JSDA 1D4NA 3AXFA 4AB6A 2ANJA 4QFKA 3ZKKA 4NF8A 2F35A 4GXAA 2V25A 4R2FA 1PB7A 3DP8A 4JDFA 2UYFA 4ZEFA 3R6UA 3T9HB 1ZTYA 3UN6A 1LCFA 3T9XB 3G3HA 3GXAA 5CBRA 3T93B 4ND9A 3M3FA 2DXRA 3FXQA 4EXLA 4E0XA 4HW8A 3IR1A 4DXUA 1RKMA 1N7WA 3PD8A 3HSTA 3SEUA 1UIVA 3H6UA 2A5TA 2Y7PA 4H8IA 3MBPA 3T22A 3GBBA 2RC9A 1LBCA 1SW1A 5AA3A 3MVZA 5ICTA 1XVYA 2Z22A 1Q1KA 1ATGA 1LBBA 3IORA 1JEVA 1YTVA 3N94A 4OEVA 2HEUA 3VE1B 3THIA 1DMBA 4FEBA 3KSJA 3ILUB 2DXYA 3SKPA 4YKJA 4KFQA 4QF9A 4I9DA 2XXRA 4QRZA 3MP1A 2I3WA 4PFUA 2DS9A 3FVOA 1MDQA 2RC7A 4F22A 3KJ7A 4RPNA 3TEPA 3I6VA 5FTIA 2RKMA 4H1XA 2V3UA 5TP9A 1JW4A 3UGWA 2DOJA 4NF5B 4XXUA 4L17A 5DEXB 5CMMA 4R72A 1B4ZA 2VOZA 5EYFA 5I84A 4DCYA 4UACA 1FQCA 3EHTA 4GL8A 2NWJA 4WXJA 3ZS6A 2O69A 4FECA 1A55A 5CMBA 4F39A 4TOZA 2GHAA 2BJJX 3QAXA 1I6QA 3PPPA 3OMBA 1IXGA 1LGBC 3IO4A 4MLVA 3MZ9A 2F97A 4ZEKA 4F3GA 5HM4B 5CMKA 1TT1A 1URDA 4QSCA 2B3FA 1Z7NE 3C33A 4QFPA 5KCJB 1POY1 4P0GA 1US4A 3RLFE 3FV2A 4X9TA 2R6GE 3L6GA 3OSQA 3MPLA 4EQ9A 3G3IA 3OELA 1A7LA 2XXYA 1H45A 2KLFA 3QK6A 2P1SA 5CRYA 2GHBA 3PPQA 1B7ZA 3TCGA 4PE5B 4PFYA 4OZ9A 3IL1B 4N13A 3MC2A 4LONB 4FORA 3TODA 1B2HA 5CMCA 3C4MA 3S9LC 4NTLA 1ZBMA 4LA9A 2O51A 1R9LA 1ZJLA 2OCUA 3M8UA 4GQOA 2XD3A 1PB9A 4G8MA 3K6XA 4ZECA 1B1HA 2F36A 3IOTA 4G4PA 3PUZE 4QSEA 3N6UA 2NOOA 1SDXA 4ELRA 2OWSA 3B7DA 3QIMA 1XHYA 3VVFA 2RF1A 5JEIA 1TFDA 3DP6A 4EF2A 1B3EA 4IO2A 4XIGQ 4ONYA 5L9OA 1SW4A 4LQ5A 1OLAA 3GZGA 4FJPA 3U8QA 2ONSA 1QKBA 1S50A 1MPDA 1CE2A 1MXYA 5B70A 4JSOA 3OO7A 4R6KA 5CI5A 1M5BA 5I57B 3TUSA 5I56B 3OXNA 3CRBA 5A5XB 1LAFE 3FVNA 3MJNA 3CSGA 4DLDA 3RQTA 4EXKA 1LAHE 2VHAA 1RYOA 4ECFA 4C1TA 3G3FA 1XT8A 4KR5A 3MWBA 2UVHA 3O29A 4YB5A 5DTBA 5DVIA 1SBPA 5I58B 4OVJA 1UTBB 1SQYA 3K01A 4BDNA 3EHSA 4O3CA 2X26A 2QRYA 2V93A 4YZZA 3RGYA 1MQJA 4OTEA 3M3LA 1USYH 2UVIA 1AL3A 3A3CA 3B6WA 3V5AA 5J1DA 3W9VA 2PVUA 2XX7A 3MVWA 4HS7A 1QUIA 3L6HA 2PYYA 3VLUA 2REGA 1IXCA 3SEVA 3ODBA 4Q8RA 5H8NB 2R71A 2XXTA 2ZXTA 1B5HA 4EQBA 4DXCA 4F29A 2YPNA 5TU0A 1OVTA 1M5EA 3O97A 3E13X 2YJPA 1SYIA 2F7BA 3TDJA 1GR2A 3C35A 1US5A 4BDQA 5KDTA 3ZSFA 5H8FA 4LVQA 2ZNUA 4U21A 1B0LA 4DXBA 4YMBA 2VGQA 3OO6A 3O6IA 4GLIA 1AIVA 1MQDA 3KOSA 2DVZA 3MP8A 5TPAB 4F1UA 1SD3A 1AOVA 4ZDMA 1MY3A 2ONKE 1P1WA 2D3IA 5JTYA 4ESWA 4NF8B 4OESA 1GTKA 4JB7A 3FXRA 1ZIUA 4G2ZA 2IA4A 1B3HA 1D9VA 3K0VA 2F6PA 4LUBA 1Y4TA 2NVUB 3IO6A 4GWOA 3VLWA 2PT2A 2Q8JA 3OD7A 3RTFB 2WKYA 5H8QA 5L9MA 4GIZA 5F1QA 1O63A 5AA2A 2HQ0A 3IB2A 3GBAA 4LQ2A 2HFBA 2H25A 4XKRA 1Y4CA 1Y9UA 3IJXB 3QXMA 4GXSB 3DM0A 4F1VA 3O6GA 2F8DA 4KCCA 3OO8A 1XVXA 1FQAA 1KWHA 1IIWA 3VDFA 2V3QA 1ZMGA 4OWDA 1DSNA 2F6GA 3WAEA 2RC8A 5FTHA 1Z7ME 5I59A 5AA1A 2G29A 3G3KA 5I2KA 2DWJA 3MVXA 1D9YA 3KJTA 3Q28A 1UIUA 1MPBA 4POXA 1Y3NA 3VFJA 3TZAA 4R74A 4H0WA 4YB6A 3K1NA 1JW5A 4F2OA 3RUMA 1FQBA 1I69A 1PBPA 4KHZE 4OFOA 3O9PA 4IGTA 3VVDA 4IO5A 3E3KA 1H3DA 2H5YA 1OMPA 2DE4A 4U4XA 2GRVA 3V89B 1NL5A 3RT6B 5TP9B 4X1DA 4PFTA 4KD5A 3HHFA 1A54A 4XKNA 1B7UA 3RTWB 4M4GA 1P1NA 1N7XA 4NE4A 1UQWA 5ITPA 4FIMA 1M5FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1VFD A;  2O84 X;  4YMA A;  3CSB A;  4DCX A;  3E9X A;  2OZZ A;  2FA7 A;  3PMV A;  4ELO A;  1MG1 A;  3MPK A;  4ZZA A;  2Q2C A;  4JWY A;  2OBG A;  3N5L A;  4R73 A;  3KGC A;  3RY3 A;  4PFW A;  1F9B A;  3EQ1 A;  3SET A;  3FAS A;  4NF6 A;  1Y20 A;  4Q5T A;  3E4R A;  4FED A;  3CI8 A;  4KYS A;  1ZLQ A;  3JYR A;  3UOR A;  1LB8 A;  1II5 A;  4IY6 A;  2O7U A;  4R9G A;  4G8N A;  4OMB A;  3UP9 A;  1SYH A;  3MP6 A;  5CC2 A;  2DWA A;  1B46 A;  4OEU A;  1A8E A;  4I62 A;  1P1U A;  4F3P A;  4HTG A;  3MVY A;  2B3B A;  1MQI A;  4U1Z A;  4Q0C A;  3Q27 A;  4Z0I A;  3U94 A;  3ECR A;  4JWO A;  3C31 A;  3TYH A;  4F18 A;  4AQ4 A;  4PQJ A;  1J1N A;  2XXW A;  1P1O A;  3TPA A;  3B6Q A;  2Y7I A;  1LST A;  2HAU A;  2QMX A;  1B6H A;  2DWI A;  1BKA A;  2CZL A;  2ESN A;  4OQO A;  4YKK A;  2Y84 A;  2XXH A;  3GLB A;  5ELV A;  2IEE A;  3G7W A;  2F7A A;  5FHM A;  4NWC A;  3U1O A;  1MQG A;  4ZE8 A;  1QW0 A;  1NKX A;  3ONM A;  4NWD A;  5L8D A;  1IXH A;  4AB5 A;  2QS4 A;  1B51 A;  2Z8F A;  2Y7R A;  4H5G A;  1IZ1 A;  1B1X A;  5AA2 D; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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