2DXYA

Structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with trehalose at 2.0 a resolution
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with trehalose at 2.0 A resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 115
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dxyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dxyA02
3E13X 1FTJA 2DWIA 3QUFA 4ECFA 2ZYOA 3TQLA 4MH5A 3OD7A 1SYIA 4THIA 1B46A 3MVZA 3PUYE 2VOZA 5I57B 3RN8A 4HW8A 2ZNUA 1MM6A 1SBPA 4OFOA 3OO7A 3EHUA 3DP4A 3PMXA 2UYEA 4G77A 2DE3A 1VR5A 4RJZA 4YB6A 5I56A 2F36A 2UVJA 1QJMA 4JWOA 4Q0CA 4H65A 4QFOA 4EQ9A 2I49A 2LAOA 4F31B 3H6WA 2O68A 3MP8A 3IJXB 5DYHA 3QAXA 2Z22A 4ONYA 1PEBA 1ZTYA 3MPKA 2V3TA 4YICA 1IXIA 1LFIA 3ILUB 1URDA 4OETA 1OQGA 1FW0A 1MH3A 2QS2A 4ESWA 5DEXB 2HCAA 2DE4A 1VSOA 4G68A 3K6VA 2UVHA 4OYVA 1URSA 1Y9UA 1LBBA 4XIGQ 1GTKA 3TTNA 1NNFA 2HAUA 5CBSA 2ZYNA 2RINA 2HXWA 1FQDA 4L17A 4TOZA 2RC9A 4H67A 4FORA 1TWYA 4LATA 2R6GE 1EH3A 3IB1A 4NF6B 3QUJA 3LR1A 3SETA 3IO6A 3PD8A 2F78A 3KG2A 4JSOA 2XX8A 3FJ7A 4TLMB 4G8MA 2A5TA 3OSQA 1NKXA 2P2AA 5CMMA 1M5EA 2PT2A 3IAZA 1B4HA 1CB6A 2Z23A 2ZMBA 2V93A 1US5A 3TKDA 1MXWA 3TTRA 4MLVA 1JEUA 4LQ2A 1RYXA 3T96B 3FVNA 1RYOA 2DQVA 1TXFA 3K01A 3ZSFA 3KSXA 1KWHA 4O3CA 4RNSA 4KYSA 3G3GA 1LAFE 4P11A 3T9XB 3FV2A 1DTGA 1S7YA 4FE8A 4IB2A 5FTIA 2RC7A 3PV0E 3MC2A 5A5XB 1DPPA 4R6HA 3DELB 1FQAA 2F7BA 5I2KA 1EZOA 3C34A 3H6UA 1YPNA 4XTCQ 2DWJA 1VFEA 4YKJA 1SI0A 4YZZA 3TEPA 1Y3NA 4TQUQ 3SEXA 3IORA 2G29A 3GZGA 4M4GA 1MPDA 2HAVA 1OMPA 2OWTA 1N84A 2Z8DA 1EZPA 3CRBA 5HM4B 4IO2A 1MQJA 3W9WA 4XKPA 3KJTA 3Q28A 2NWJA 5IKBA 3S4UA 1OLCA 4R72A 1NNTA 3FATA 1MY4A 1FQCA 4OEUA 1XOCA 3H3GA 1O64A 4YKPA 3TAJA 2H5YA 4QSEA 1B1HA 5I56B 1LFGA 3VLVA 1D9VA 3FZVA 1VFDA 3V5AA 2E1SA 1OQHA 2O7IA 4POWA 4ELOA 3IO4A 3MUQA 3RY3A 1UIVA 3K1MA 1Z7ME 2XXWA 3A3CA 1OVTA 3IOTA 1IXHA 3HO7A 3QK6A 3K6XA 4F2QA 4YKIA 1BLFA 1MXYA 3MPLA 4BDQA 4KR5A 4XXUA 1VE4A 3QXMA 1JW1A 2XXPA 3KBRA 1S9TA 4ND9A 1SQYA 3FUZA 3C35A 1IXCA 3QIMA 1HSEA 4BDLA 3ODBA 3OO6A 4OHNA 5JEIA 3SESA 3T22A 1I69A 3UK4A 3MBPA 1MY0A 4KPTA 2DVCA 3CSBA 1PBQA 2VD3A 4ZECA 4F1UA 2F6GA 4H5FA 4QFNA 2Y7IA 1P1WA 3LBSA 3UGWA 3T9UA 3RQTA 1BP5A 3HHFA 5FHOA 2RF1A 3RGYA 4Q8RA 5AE4A 3JYRA 5J1DA 4QRZA 3TTKA 3M8UA 4R73A 3C32A 4OZ9A 4E0WA 4RK2A 3IOWA 1DTZA 1UTHA 4F3SA 1EZ9A 4JB7A 3OMBA 1MDP1 1IEJA 1R9QA 3RPWA 2A5TB 3A09A 5HBCA 3VDFA 2F7AA 4WEDA 3IJOB 3CIJA 4ZE8A 3VFJA 2Q88A 2P0SA 2ZNSA 3LSFB 1B0HA 4YAHX 3PPQA 4NF6A 1MQIA 1B05A 4ZDMA 2B65A 3THIA 1N3WA 2O1MA 1Y4CA 1LBCA 3I3VA 5L8DA 2VHAA 4GXAA 3TCHA 4NEDA 1PB9A 4KD5A 2M8CA 1UIUA 4KFQA 5KDTA 3CI8A 1QVSA 3HSTA 5L9OA 3WAEA 3SEUA 1XT8A 3B6TA 1NL5A 4I9DA 2GHAA 2XXXA 3ZKLA 4U4XA 2PYYA 3RUMA 2P1SA 1MQHA 4MFIA 4NF5B 4YMAA 1ZJLA 4GFRA 1A8FA 3ILTB 3FD3A 1A7LA 2IA4A 3C4MA 3O28A 2XXTA 1JW4A 4H8JA 1ZBMA 3LUYA 4GVOA 4XKRA 1LAGE 2AYSA 3T93B 4LZ7A 1JQFA 1AMFA 1DPEA 4FEBA 5FHNA 1P1OA 3KJ7A 5JK4A 1OVBA 1MS7A 3HV1A 5CRYA 1J1NA 4BDMA 1R9LA 1PDAA 1US4A 4AB5A 4ZEDA 3CFLA 2ONSA 4PP0A 3O6GA 1NNKA 3HCQA 3SEYA 2REGA 3EN3A 4GF8A 3UN6A 1JETA 1RKMA 1QKAA 4RPNA 4BLAA 1B5JA 3U1OA 2FYIA 2I0CA 4QFKA 2R71A 4Q30B 4GL0A 3UA8A 3BFUA 4C1TA 4EF1A 3K6WA 4DZ1A 1AOVA 3U93A 3IB2A 2XXYA 2F34A 4N6PA 1O63A 4DXUA 2DXYA 4LONB 1LGBC 1SD3A 2W7YA 4UACA 1XHYA 3TCGA 4GD5A 4NE4A 4O3BA 1BKAA 1LCTA 4ZS9A 3FV1A 1JW5A 3N5LA 2Q9TA 2FNCA 1MY3A 4JSDA 3QYTA 1FTMA 1B9JA 2VD2A 2Y7KA 2O6AA 3I6VA 3E3KA 4R6KA 3BKIB 3G3JA 2Y84A 3IOVA 5CM6A 2CZLA 2DOJA 3BFTA 3MAMA 2GH9A 3QSLA 4GIZA 5IAIA 1S50A 3ZS6A 4H8IA 3HN0A 2XX9A 4F3GA 3F11A 1Y1ZA 4QSDA 3W15C 4TLLB 3TCFA 3MZBA 4PFYA 5H8FA 1NNPA 1UTHB 2D5WA 3B6QA 4R2FA 1A54A 1II5A 1GV8A 3PD9A 2ZNTA 3OEKA 3S2VA 3FJGA 4NF8A 2NOOA 4EDPA 4P0GA 3N6TA 3S9NC 3TTMA 4ZZEA 3TODA 1P1QA 4I8CA 1MY1A 2O7UA 3OO9A 3MQ9A 5JTYB 1R1NA 2PVUA 3S9EA 5ELVA 4I62A 4PETA 2ESNA 3EHTA 3ECRA 3K4UA 5KCJB 3U92A 4QHQA 3SEWA 1Q35A 3H4ZA 1A8EA 1FTLA 3K00A 1P1NA 1B3FA 4YKKA 3IR1A 5KDTB 4DDDA 5ICTA 4M1VA 4F18A 2HZLA 3FVOA 2AL5A 1ELJA 3W9VA 5LOMA 4C1UA 4MF3A 3CG1A 5EHSA 1MPCA 2CMOA 4R9GA 3VVDA 4G4PA 3O6IA 3DLNA 2G93A 1N0TA 3HPIA 1WVJA 3OXNA 3TZAA 3Q29A 1USYE 1FQBA 2NUVA 3EPEA 3FJMA 3FVGA 2PX1A 4MLQA 1IIWA 4F2OA 5DT6A 3V8XB 3TMGA 3O66A 1FQFA 4GWOA 5H8NB 5H8SA 1MXUA 1M5DA 4NF5A 1Y4TA 3MZ1A 3B6WA 1A99A 3VE1B 1HSJA 2F5XA 4C0RA 4OTEA 4G2ZA 2V25A 4DXCA 5FTHA 3VXCA 1UQWA 1T0KA 1B6HA 4DCYA 5I58B 3A3UA 4R6YA 1NH7A 3WAFA 1CE2A 4NWCA 1B40A 1ZLQA 2Z8FA 4HTGA 4X1DA 1LAHE 1PB8A 5DVJA 4YB5A 3IOUA 2YPNA 1LLSA 3UORA 4JBZA 3TUSA 2H99A 4NF4B 4RXLA 1MM7A 2BJJX 2Q89A 3JV9A 3CFZA 4FATA 2F6PA 4Q5TA 3V83A 3OEMA 4ISUA 1TFDA 1TFAA 1D4NA 4PFTA 4EQ7A 4GLIA 2ANJA 3PPOA 1WODA 2F97A 3H06B 3O6HA 2IEEA 4POXA 1JEVA 5AA4A 4U1OA 1LFHA 4N07A 4EUOA 1B7HA 4LZ5A 3U94A 3SDFA 1GR2A 2F7CA 4F1YA 2XD3A 3PMWA 2I4CA 3OO8A 1IITA 2OLBA 4OQOA 5BUUA 4JWYA 5H8QA 5TPAA 5DVIA 5H8FB 3CR9A 5EYFA 4G68C 5FHMA 3RT8A 4FECA 1R6ZA 3Q27A 2RC8A 5AA2A 4NF8B 4Z0IA 2O69A 5HPQA 2DVZA 3M3FA 1MXZA 4ZEIA 2I48A 2AL4A 3TQWA 1MRPA 4OESA 3C31A 1AL3A 3MP1A 1UTBA 3OSRA 3H6VA 2B3FA 4H0WA 3USDA 4F19A 1LCFA 5F7VA 1AH5A 2O51A 3K6UA 1P1UA 2QS1A 2I3WA 4U2RA 1Q1KA 1H76A 1Z7NE 1MDQA 4PQJA 3E9XA 5AA1A 3I5OA 4LVQA 4PFWA 3KSJA 3D4CA 1FCKA 3VVEA 1LB8A 1B32A 5JTYA 3O9PA 3RT6B 3MWBA 1M5BA 3MVYA 4JDFA 2H9BA 3GBBA 1O7TA 1QW0A 5CMCA 3TPAA 5KCJA 4RY1A 2ZYKA 4ZEKA 2I3VA 1B58A 2F8DA 1JVXA 2KLFA 2UYFA 3PPPA 3CSGA 4UA8A 4X9TA 4RA1A 5L9MA 1YAEA 3DP6A 4IO5A 3KN3A 1DOTA 1MG1A 1XS5A 4AB6A 1GGGA 2Y7RA 3PUZE 5K2YA 3EHSA 2QRYA 4K3FA 4OERA 1TT1A 4RK9A 3LSLA 3MZ9A 2DSFA 4OXVA 3PUWE 3N94A 4YB7A 3C9HA 1XC1A 3AXFA 2DYXA 1IXGA 1PB7A 3LC8A 4IGRA 4ELQA 2X26A 1JNFA 1QULA 4KQPA 3KEIA 1NH8A 3DP8A 3PUXE 5H8NA 5ICQA 3O97A 2PT1A 2AIXA 3H7MA 4FIMA 3FGSA 1L5TA 2XHDA 5DVFA 4ELPA 4ESXA 1ZKBA 4EQBA 4MBPA 4GQOA 4PFUA 5I58A 4F3BA 1N3XA 2HEUA 1LAXA 4EXKA 2THIA 1ZIUA 1B1XA 4JWXA 1A40A 1I6AA 3CFXA 2QMXA 3C33A 2B3BA 3K02A 4HS7A 2O84X 4QFLA 3VLUA 2H98A 1N04A 2ZYMA 4FEDA 2UXAA 2VGQA 2XXVA 3PPNA 3TDJA 3IK6B 3OOAA 4NF4A 5AA4B 3KFMA 2QL3A 5CBRA 4IGTA 3HHGA 1B3HA 2QJEA 1PBPA 4YU0A 2I4BA 2OJTA 3G3FA 3ZKKA 1B3LA 2GRVA 5KZTA 4LP2B 5H8QB 5H8HA 5TPAB 1MH4A 4XKNA 5B70A 4R74A 4OEVA 3G3IA 5AA3A 3K2DA 4LUBA 2GHBA 2ONKE 3C36A 1BTJA 3MW0A 5BWJA 3UP9A 1MXVA 5AA2B 5I59A 1POY1 3LSWA 3IB0A 4GL8A 1Y1MA 3O2AA 3IL1B 4KCDA 2OZZA 1MQDA 4GXSB 3KZGA 1USYH 5ISUA 2VP1A 4IY5A 1WDNA 1B0LA 5ITPA 3RTFB 1UTBB 3KOTA 1LSTA 2V84A 3KN7A 3N26A 5TU0A 3RNNA 2FA7A 1OLAA 1M5CA 1N76A 4U21A 3U8QA 3K1NA 4X48A 4F3PA 3R6UA 1D3KA 3U72A 2PMSA 2I58A 1B7UA 3CG3A 2RKMA 2Y7PA 3LSXA 4N13A 1B5HA 5I84A 4IO4A 3KN8A 4IO6A 3OELA 4NTLA 3PPRA 3T66A 1ZMGA 1Y3PA 4OENA 4KYDA 2UVGA 3G3HA 1A55A 2DXRA 4IY6A 2O1LA 4OFJA 2Y7WA 1N7WA 4NWDA 2XXIA 4KCCA 1MQGA 2QS3A 1QKBA 3H03A 4EF2A 4NMYA 1Y3QA 5CMKA 3FASA 4R9FA 3R7XA 1LB9A 2GFEA 2UVIA 1MPBA 2DP8A 4I1DA 4R2BA 4RPOA 4ZE9A 2OWSA 3L6HA 5I2NA 2E0SA 1I6BA 2ZXTA 3PGFA 1P99A 3SERA 3T9VA 3OENA 4BDOA 4FJPA 3Q25A 2D3IA 1FTOA 1H45A 3PU5A 1B4ZA 4OFLA 1MY2A 5CC2A 4QSCA 4WKMA 1FQEA 2X7PA 2RCBA 2NXOA 1XVYA 1AIVA 4G8HA 4HCYA 3SEVA 1HSLA 1B7ZA 1YTVA 1IZ1A 5CMBA 1SW2A 2RCAA 2YLNA 3H6TA 3BBRA 3S9MC 2ABHA 3VXBA 4QF9A 3VVFA 2A5SA 3FIRA 2QS4A 4ZZAA 4DE8A 4RYAA 4BDNA 1QUKA 3RLFE 2REJA 4XKQA 2ALUA 4H5GA 1M5FA 2DWAA 3EF7A 1B3GA 4OVJA 2OCUA 3ONMA 4HCWA 3GBAA 3RTWB 1EU8A 1ZU0A 1BIYA 5TP9A 2I6EA 1SI1A 3G3KA 3UIFA 4AQ4A 5H8HB 2V3UA 2Q2CA 2QPQA 1Y20A 2OBGA 1B5IA 1ANFA 4O3AA 5I57A 4KI0E 4ZEBA 3MP6A 4LZ8A 4WEPA 4F1VA 5I59B 5K2XA 2XXUA 3M3KA 3E4RA 2ONRA 1FTKA 1NMUA 4F39A 4QFPA 4EXLA 3CVGA 2YJPA 3B7DA 3L6GA 1F9BA 1H43A 5EHMA 2PBWA 4LQ5A 3K0VA 5B7DA 4U23A 1H44A 1DSNA 3PUVE 3TFLA 4H6DA 3TELA 4LA9A 1H3DA 2OK2A 2XXQA 3TYHA 4IO7A 4GRKA 1SW5A 4G68B 3N6UA 2DE2A 1GVCA 1SW1A 4DCXA 1POTA 3K1PA 1B2HA 3FVKA 1SDXA 4P0IA 2Z8EA 3D4GA 2DS9A 3VV5A 4YMBA 5F1QA 1MXXA 1NFTA 5AA2D 1I6QA 4KYEA 2HFBA 3V89B 5DEXA 2Q8JA 3EQ1A 1XVXA 5M2VA 4G8NA 2X7QA 1QUJA 1B51A 1ATGA 2QMWA 1YCJA 5DTBA 3JZJA 4PE5B 1JVYA 4IO3A 3MVXA 1QUIA 3GXAA 4U4SA 4DLDA 4BDRA 1B52A 2NVUB 2Q2AA 3O29A 5I2NB 2H25A 2XX7A 4DXBA 3KGCA 1N7XA 3GLBA 2H4IA 2DWHA 2XXHA 2WKYA 3KOSA 1SYHA 4ZEFA 3MJNA 2F35A 2V3QA 3MVWA 5CI5A 1URGA 2XXRA 2HZKA 4FAJA 4GOTA 1B3EA 3T9HB 4OMBA 3FXQA 3PMVA 1SW4A 4KHZE 4X1BA 1D9YA 3G7WA 3M3LA 3VLWA 3DM0A 4WXJA 5I2KB 4H1XA 4OWDA 5ITOA 3IX1A 1PC3A 1IUDA 2I0BA 1SVXB 2HQ0A 3Q26A 2R9JA 4Z7EA 3P7IA 2XD2A 3SKPA 5A5XA 2D21A 3FXRA 4ELRA 4U22A 1OIBA 3FXUA 4DIGA 1IQ7A 3S9LC 3TTLA 4JXIA 2QSXA 4F29A 1DMBA 5L9SA 5TP9B 4U1ZA 3R26A 4E0XA 4F22A 4R75A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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