2GH9A

Thermus thermophilus maltotriose binding protein bound with maltotriose
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
KITVWTHFGGPELEWLKEQARTFERTSGTKVEVVEVPFAEIKQKFILGAPQGQAADLVVTVPHDWVGEMAQAGVLEPVGKYVTQAYLADLQGVAVEAFTFGGRLMGLPAFAESVALIYNKKYVKEPPRTWEEFLALAQKLTTGATFGFLYNIGDPYFNFGFFKAFGAENVFAKDAKGNLDPTKLLIGGEVGEKALQFIKDLRFKYNLVPEGVDYGVADGAFKDGALAMILNGPWALGDYKKAKVDFGIAPFPVPPGAKNPWGPFLGVQGVVVNAYSKNKTQAVNFAKTLVTGRNLVAFNQAGGRIPVSKSAVKQLEKDPVVAGFSKVFPLGAPMPNIPEMGKVWGPWGNAISLAIQRPDSNVKKIVEDMVAEIKKAIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural adaptations that modulate monosaccharide, disaccharide, and trisaccharide specificities in periplasmic maltose-binding proteins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Thermus thermophilus
molecule keywords maltose/maltodextrin-binding protein
total genus 124
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2gh9A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2gh9A02
4AB6A 1M5FA 3I5OA 5I59B 4Q0CA 1NMUA 4G8MA 4UACA 4FATA 4ZEFA 3O6IA 1NH8A 3FVNA 1P99A 3HN0A 1JW4A 1XS5A 2RINA 5I56A 2O7IA 2ZYKA 4HCWA 1WDNA 3TTMA 4H67A 5I2KA 1IQ7A 4THIA 3EF7A 3HPIA 5F7VA 4U1ZA 2DE4A 3TODA 4BDMA 5I57B 4X48A 3MP6A 4H1XA 4QFNA 3RT8A 2O68A 1B3GA 2QMWA 1B0LA 1CB6A 3K01A 3H7MA 4POXA 5H8NA 3TQWA 2DWAA 2I0CA 1O64A 1Y9UA 3UK4A 3JZJA 4OEVA 4KR5A 2F35A 4G4PA 3ECRA 5AA1A 1RYXA 2ONRA 2ZMBA 3THIA 4ELOA 4RXLA 4KFQA 3RGYA 3S9MC 4NF6B 4KCDA 5L9MA 1JEUA 3DP8A 1N0TA 4XKNA 4C1UA 1WODA 4LONB 1P1NA 1FTLA 4MLQA 4OERA 1B2HA 3O29A 3E4RA 3RUMA 1OLCA 3KJ7A 4BDNA 2XD3A 5AA2A 3K02A 4RK9A 1LAHE 4F1YA 4KD5A 4YKJA 1YCJA 2PVUA 4H5GA 4C0RA 4LZ7A 3PPQA 2I3WA 1MH4A 1A54A 1MM7A 3H6WA 4R72A 3U8QA 2NUVA 4LATA 5DVFA 2DYXA 3Q27A 3B7DA 3FJGA 3ZKKA 2LAOA 1XOCA 5FHNA 5ISUA 4ZZEA 2I0BA 1FW0A 3OSQA 4YB5A 5H8SA 5EYFA 2QPQA 3KN7A 4LQ5A 1ATGA 2DVCA 3H06B 3T22A 2I6EA 4G2ZA 3OELA 3KEIA 3TZAA 4ZEKA 4QFKA 1Q1KA 5KCJA 1MXXA 1BKAA 1MPBA 3TTNA 1QUJA 2REJA 3HV1A 3CVGA 2HZKA 4F2OA 4NMYA 1XVXA 4GD5A 3L6GA 3PD8A 4U4SA 3KJTA 5AA2D 3T9UA 2F6PA 3SEVA 5HBCA 2O69A 1EZOA 1MDQA 3TTRA 3PPPA 1JETA 2O84X 4FORA 1ZU0A 1IITA 4BDRA 3K2DA 3S2VA 2I49A 3FGSA 3IB2A 3TMGA 4NTLA 3KN3A 3CG3A 1O7TA 1HSJA 3N5LA 2HCAA 4XXUA 3DELB 3Q25A 3JV9A 2ZYOA 4TQUQ 3E9XA 2RCBA 3TUSA 4GWOA 2RC9A 1OQHA 5DEXA 1OLAA 4M1VA 2QS4A 3G3IA 1OVBA 3PUXE 2HXWA 3DP4A 2ZXTA 4IO6A 2ALUA 2XX7A 2Y84A 3O2AA 2Q2AA 1DTZA 1EZ9A 4NF8B 1SW5A 2I4BA 4NWDA 4IGRA 4Z7EA 3UA8A 3LSWA 4GL8A 2Y7WA 1R9QA 2X26A 4OHNA 2DS9A 4ELRA 2XXUA 1TT1A 4LA9A 2DWIA 3OXNA 4OFOA 1TFAA 1XC1A 5I56B 3P7IA 3QAXA 3EHUA 3D4CA 5I2KB 2YPNA 3HO7A 3ONMA 1QVSA 3E13X 2Y7IA 1I69A 4PP0A 3OD7A 4BDQA 2DSFA 2P2AA 1GVCA 3Q26A 2DXYA 3KN8A 2Z8EA 4ZDMA 2QS3A 2Z8FA 5BWJA 3R6UA 1PB7A 4XKQA 2PX1A 3IOWA 5H8HA 3OEMA 1DTGA 3N6UA 4DCXA 2GHAA 1JEVA 4QSEA 3K0VA 4TLLB 4GIZA 4NF4B 1H43A 1N3WA 3VFJA 3T96B 1VFDA 2VD2A 4POWA 1LAGE 1URDA 4X9TA 2ZYMA 2HQ0A 2W7YA 1PC3A 4OZ9A 5JTYB 3MWBA 4KQPA 5DVJA 3IAZA 2D5WA 4ISUA 5HM4B 1MH3A 1UTBA 4H5FA 3U93A 3T9XB 3PD9A 1UTHB 3QYTA 2O6AA 4KYEA 3IO4A 1VFEA 2F36A 5JEIA 3MPKA 4XIGQ 3TFLA 3U94A 2DP8A 4PETA 3RQTA 1A99A 3HHFA 3FV2A 1ANFA 1QKBA 4M4GA 1FQFA 4X1BA 1IXGA 1AIVA 3S9LC 2NXOA 4NE4A 1XHYA 4ZZAA 5J1DA 1ZLQA 3PPRA 4IO3A 1LLSA 1S7YA 3K6XA 2F78A 3DM0A 3SDFA 1ZTYA 3MP8A 3TTKA 1DPEA 1P1OA 3SESA 1RKMA 2I58A 3TKDA 3FXQA 5KCJB 3FVGA 3RNNA 1DSNA 3GBBA 1B9JA 2O7UA 4ONYA 5H8QA 4GFRA 4OFJA 1NL5A 2PBWA 1I6QA 4ZECA 3UP9A 2Z23A 2V3QA 4YMAA 2ZNTA 2V3TA 4R73A 2IEEA 5I58A 4H8JA 2D21A 3CSBA 3QUFA 3KGCA 5IAIA 3VVEA 2G93A 3SKPA 4U1OA 4WEPA 5TPAA 3B6TA 4FECA 4Q5TA 3G3GA 3K6UA 3N6TA 3VDFA 4LZ5A 3PUYE 4OETA 4G68A 1T0KA 4ZE9A 3IR1A 3LC8A 3PUWE 1I6BA 2QSXA 2RCAA 2HZLA 1B5JA 1EU8A 1MY3A 4EQ7A 1POY1 4JSOA 3C4MA 5CBRA 3CRBA 2OLBA 3PMWA 3M3KA 1IXIA 3M8UA 4MH5A 1B1HA 4WKMA 1B05A 1B58A 1DMBA 4JWXA 3O28A 2UVGA 1LCFA 1MPDA 2FA7A 3TELA 3TDJA 3CFXA 3MUQA 3QSLA 3EHTA 1FCKA 3U72A 1N7XA 4MFIA 1UQWA 3QK6A 2E0SA 2H4IA 2X7QA 3H6TA 1FTJA 1MY2A 1PBPA 4ZS9A 4NWCA 2PYYA 1IIWA 4RPOA 3VVDA 3KOTA 3WAFA 1FTOA 4RYAA 4QHQA 4ND9A 4LUBA 3QXMA 3HCQA 4KYDA 1LAFE 1TFDA 4DXUA 3MVZA 2DE2A 1MXYA 1WVJA 4EXKA 4U23A 2GFEA 1B32A 3PMVA 3H03A 1LB8A 5CBSA 1B4HA 1B3LA 1IXCA 1IEJA 5H8FB 4H8IA 1FQDA 5H8HB 1NNTA 1N7WA 3BKIB 2RC8A 3EQ1A 5B7DA 3TYHA 3IB0A 2V84A 3RT6B 4O3BA 5F1QA 2QS2A 3CIJA 4OYVA 3PU5A 5AA4B 1IXHA 3FJ7A 3VXCA 1LFGA 2XXHA 1OQGA 5M2VA 1Y3NA 1TWYA 1FQCA 3SERA 1B3EA 5EHMA 3A3CA 5CMKA 3OO8A 3A09A 1UTBB 2QS1A 5FTHA 5KDTA 4RJZA 1EH3A 3FASA 3R7XA 4LVQA 4JDFA 4K3FA 1B5IA 4GLIA 2Q89A 1A55A 3LSLA 2AL4A 5ELVA 2XX9A 3UGWA 5DTBA 3GZGA 2X7PA 3LSFB 2PMSA 3CR9A 3N94A 3V89B 1Z7ME 3MQ9A 1PB9A 5KZTA 1LBCA 2H25A 4LQ2A 4FEBA 2CMOA 3RY3A 3W9VA 2XX8A 2V93A 5FTIA 3MPLA 2A5TB 2R6GE 2XXWA 1VSOA 2NVUB 4IO7A 3IOVA 3TPAA 3R26A 4RPNA 1SI1A 2P1SA 2GH9A 3VLVA 2XXVA 1VR5A 4X1DA 2FNCA 3F11A 1ZJLA 3GBAA 3CFZA 4LP2B 1D9VA 3MVXA 4R2FA 4F31B 1MY1A 2Q88A 3QUJA 4OMBA 2V3UA 4U2RA 3EN3A 2ONKE 2P0SA 2UVJA 3M3FA 2OWSA 5CRYA 4FIMA 4F3GA 3G3KA 4OESA 4GL0A 1UIUA 4ELQA 4YKPA 4I1DA 4EF2A 1AL3A 4DZ1A 1B3FA 2QL3A 4G8NA 4R6KA 5I58B 2F8DA 4FAJA 4PFUA 4KPTA 1SBPA 4G77A 4H6DA 4MLVA 4BLAA 4NF5A 1H3DA 3FD3A 2QJEA 5TPAB 1NH7A 3C36A 4RY1A 3OO6A 5JK4A 3MAMA 1H45A 2REGA 3FATA 5K2XA 1PBQA 4P0IA 2F7CA 1B3HA 2QRYA 4NEDA 3Q29A 5L8DA 2ZNSA 2OZZA 4Q8RA 1QUKA 1B51A 4RNSA 5L9SA 5AE4A 5DYHA 4EQ9A 1ZKBA 5IKBA 3TTLA 4DCYA 4XKRA 1ZBMA 1PDAA 4PQJA 4GF8A 4F29A 4NF6A 3IJOB 4N6PA 3S4UA 4AQ4A 1FQBA 1LSTA 1URSA 5TP9A 5H8NB 1B52A 3USDA 1M5BA 2XXQA 5HPQA 1YAEA 4KYSA 3MVWA 2RKMA 1ZIUA 3VXBA 1Y3PA 5DVIA 3RPWA 1P1UA 3HHGA 4HW8A 4KI0E 3FZVA 2KLFA 3O6GA 1GR2A 4JSDA 1J1NA 3EHSA 3RTWB 1AH5A 3K1PA 5I84A 4H65A 1Y20A 3MJNA 5AA2B 4QSCA 4GOTA 5I2NA 1MPCA 4DDDA 2XXXA 3TQLA 5FHOA 1TXFA 4N07A 3W15C 4F3PA 3U1OA 3T9VA 3K6VA 2H5YA 3OOAA 4WXJA 4OTEA 2ANJA 1N04A 1D4NA 3W9WA 1JW1A 1FTKA 3WAEA 2YLNA 1Q35A 1MDP1 4YAHX 1SW2A 5ICQA 1MXVA 3T93B 1AMFA 3C32A 1DPPA 3TCFA 1A8FA 3VVFA 4QRZA 2BJJX 5K2YA 1Z7NE 4JB7A 1PB8A 4OENA 5KDTB 1MQHA 3ZS6A 1SDXA 3KFMA 4EF1A 1XT8A 3G3JA 2Q9TA 1P1QA 2Y7PA 2XXRA 3SETA 3DLNA 1D9YA 3MW0A 3TAJA 2F6GA 3MVYA 1B7HA 2HAUA 1PEBA 4TOZA 3LR1A 1GV8A 3BFUA 4I9DA 3K00A 4XTCQ 1JQFA 5CMMA 4ZE8A 3PMXA 2XXIA 1LAXA 2DOJA 4DE8A 1QULA 3KSJA 2H98A 3HSTA 3TCHA 2F97A 3U92A 1NNFA 1BIYA 3VLWA 4JWOA 4WEDA 4MF3A 2UYFA 3C35A 3C34A 3ILUB 4RK2A 3CFLA 3G3FA 3SEUA 2DWHA 4UA8A 2ESNA 2I3VA 3VV5A 3K1MA 2V25A 1LGBC 2H99A 5DEXB 2WKYA 4ZEDA 1MXZA 1US4A 2Z8DA 3O66A 4GXAA 4G8HA 1EZPA 5LOMA 1US5A 1F9BA 3PGFA 1A8EA 2I48A 4EDPA 1NFTA 2Z22A 4NF5B 3FJMA 4QF9A 3IK6B 5CM6A 2F5XA 3OSRA 2NOOA 1XVYA 4OWDA 1B46A 4XKPA 1A40A 2IA4A 4PFTA 3PUZE 3V8XB 2D3IA 3L6HA 4LZ8A 1M5EA 1SYHA 4G68C 4E0XA 2VD3A 4FJPA 3PPNA 2DWJA 3EPEA 4R74A 4EQBA 1UIVA 3IOUA 1LBBA 1N76A 1S9TA 3V83A 4U22A 3VLUA 5CI5A 1II5A 3CSGA 4H0WA 4EUOA 4P11A 2VGQA 1H76A 4NF4A 4FEDA 2CZLA 4E0WA 3BBRA 3G7WA 1OVTA 2Y7KA 5TP9B 3IOTA 1KWHA 2AIXA 2NWJA 3E3KA 3C31A 4ZEBA 1YPNA 5FHMA 5JTYA 1LB9A 1FTMA 5ICTA 3MZ1A 3I6VA 3GLBA 5AA3A 4FE8A 3RTFB 1B6HA 2B3BA 1MQDA 1UTHA 1MQIA 3DP6A 1OIBA 4PFWA 3SEYA 1N84A 4F3SA 4F18A 2HAVA 3C9HA 4PFYA 2DXRA 3TEPA 3LUYA 4I62A 2DVZA 2R71A 2VHAA 4ESWA 5A5XA 2UVIA 4JBZA 3FUZA 1SD3A 3KZGA 2F7AA 4ELPA 5I2NB 4N13A 4GVOA 3UIFA 2PT2A 3IL1B 5DT6A 4YZZA 1NNKA 3GXAA 3M3LA 1MRPA 3ZKLA 3N26A 1BP5A 2VP1A 4F1UA 4L17A 5CMCA 2HFBA 4GXSB 4RA1A 2O1LA 4JWYA 1B5HA 1IUDA 3QIMA 2A5SA 1HSLA 1LCTA 3H3GA 1MQGA 1SVXB 3PV0E 3FXUA 3K6WA 3FVOA 1ZMGA 3BFTA 4YU0A 2QMXA 4U21A 2B3FA 4P0GA 4MBPA 1JVXA 1I6AA 4Z0IA 3OO9A 3MZ9A 2GRVA 5B70A 4BDLA 2XXPA 1GTKA 1URGA 2XHDA 4QFPA 5H8QB 4QFOA 4IO4A 5I59A 3O6HA 2OBGA 1IZ1A 3LBSA 1QKAA 5TU0A 4YB6A 1MM6A 3A3UA 2Q8JA 4PE5B 1MY0A 4JXIA 3C33A 1N3XA 1S50A 1MG1A 1M5CA 4I8CA 3K4UA 3H6UA 1B40A 1H44A 2ONSA 4G68B 3H6VA 3AXFA 4OFLA 3UORA 3VE1B 5I57A 1B1XA 3FIRA 4IY5A 4DIGA 1D3KA 3KSXA 1SQYA 1AOVA 2R9JA 3K1NA 4GRKA 1JNFA 4IGTA 3MC2A 4IY6A 2AL5A 2UYEA 1M5DA 1YTVA 2UXAA 2RC7A 4F1VA 3SEXA 1MXWA 2FYIA 1BLFA 4EXLA 4F22A 1MS7A 1LFIA 3ODBA 1MXUA 2Q2CA 2O1MA 3FVKA 1O63A 3CG1A 4U4XA 1L5TA 3OENA 1R6ZA 2XD2A 3IB1A 2E1SA 4DLDA 1FQAA 2OJTA 1POTA 3FXRA 2GHBA 3T9HB 5H8FA 4YKIA 3H4ZA 4OQOA 1MY4A 1GGGA 4KHZE 2G29A 4R75A 4R6HA 1Y4CA 3KBRA 3IX1A 2M8CA 3Q28A 1USYH 3UN6A 1BTJA 4F2QA 1ELJA 1B7ZA 5BUUA 4HTGA 5CMBA 2ZYNA 4YB7A 3KOSA 4HS7A 3S9NC 1FQEA 1QJMA 4F3BA 5AA4A 1Y3QA 3IORA 4YKKA 4R6YA 2B65A 1R9LA 3OEKA 5EHSA 4AB5A 2VOZA 4F39A 4OEUA 3MP1A 1USYE 3TCGA 2XXTA 3CI8A 3KG2A 4HCYA 4ZEIA 3T66A 3D4GA 1OMPA 2YJPA 2ABHA 1JW5A 1RYOA 4QFLA 2XXYA 3JYRA 3S9EA 4Q30B 2DQVA 3LSXA 4YICA 3PUVE 4R9FA 3V5AA 1CE2A 4IB2A 5A5XB 1LFHA 3PPOA 4OVJA 2THIA 4IO2A 2AYSA 3OMBA 1VE4A 1B0HA 2A5TA 1SI0A 5ITOA 3FV1A 4F19A 1Y4TA 2F34A 4O3CA 4OXVA 3MZBA 3G3HA 4QSDA 1MQJA 3RLFE 2OWTA 2OK2A 2UVHA 4O3AA 2RF1A 2H9BA 4ECFA 4KCCA 2ZNUA 1SYIA 4R2BA 3IO6A 3B6QA 1Y1MA 4R9GA 1NNPA 2I4CA 1Y1ZA 1B7UA 2PT1A 5L9OA 2HEUA 3I3VA 1QUIA 1HSEA 3MBPA 3ILTB 3RN8A 4BDOA 1A7LA 2F7BA 1NKXA 3IJXB 2OCUA 1DOTA 3ZSFA 2Y7RA 1P1WA 4ESXA 4GQOA 4DXCA 1SW1A 4YMBA 1JVYA 5CC2A 3O9PA 1B4ZA 4DXBA 3SEWA 2O51A 3O97A 3B6WA 4IO5A 3OO7A 2DE3A 4C1TA 4TLMB 4NF8A 1SW4A 1R1NA 5ITPA 1QW0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AB6A 1M5FA 3I5OA 5I59B 4XF5A 4Q0CA 3ISPA 1NMUA 4G8MA 4UACA 4FATA 1FJ6A 4ZEFA 3O6IA 1NH8A 1LEVA 3FVNA 1P99A 3HN0A 4MNIA 1JW4A 1XS5A 2RINA 5I56A 3MYUA 2O7IA 2ZYKA 3PTYA 4HCWA 1WDNA 3TTMA 4H67A 5I2KA 2QFLA 1IQ7A 4THIA 3T0JA 3EF7A 3HPIA 1IMAA 5F7VA 4U1ZA 2DE4A 3TODA 4BDMA 5I57B 4X48A 3MP6A 4H1XA 4QFNA 3RT8A 4PFRA 2O68A 1B3GA 2QMWA 1B0LA 2KR0A 1CB6A 3K01A 3H7MA 4POXA 5H8NA 3TQWA 2DWAA 2I0CA 1O64A 4MNCA 1Y9UA 1RDZA 3UK4A 1FPDA 3JZJA 4OEVA 4KR5A 2F35A 4G4PA 3ECRA 5AA1A 4NN3A 1RYXA 1YYZA 2ONRA 2ZMBA 3THIA 4ELOA 4RXLA 5IZ3A 4N6DA 4KFQA 3RGYA 3S9MC 4NF6B 4KCDA 5L9MA 1JEUA 3DP8A 4HE1A 1N0TA 4XKNA 1FPJA 2Q8MA 4C1UA 1WODA 4MCOA 4LONB 1P1NA 1FTLA 4MLQA 4OERA 1B2HA 3O29A 2Y5KA 3E4RA 3RUMA 1OLCA 3KJ7A 1FPGA 1FBDA 4BDNA 2XD3A 5AA2A 3K02A 4RK9A 1LAHE 4F1YA 4KD5A 4YKJA 1YCJA 2PVUA 4H5GA 4C0RA 4LZ7A 3PPQA 2I3WA 4OA4A 1MH4A 1A54A 1MM7A 3H6WA 4R72A 3U8QA 5ET7A 2NUVA 4LATA 5DVFA 2DYXA 3Q27A 5LDZA 1KZ8A 3B7DA 1LBXA 3FJGA 3ZKKA 1INPA 1FBPA 2LAOA 1XOCA 5FHNA 5ISUA 4ZZEA 2I0BA 1FW0A 3OSQA 4YB5A 5H8SA 5EYFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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