2GHAA

Thermotoga maritima maltotriose binding protein bound with maltotriose
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
MQPKLTIWCSEKQVDILQKLGEEFKAKYGVEVEVQYVNFQDIKSKFLTAAPEGQGADIIVGAHDWVGELAVNGLIEPIPNFSDLKNFYETALNAFSYGGKLYGIPYAMEAIALIYNKDYVPEPPKTMDELIEIAKQIDEEFGGEVRGFITSAAEFYYIAPFIFGYGGYVFKQTEKGLDVNDIGLANEGAIKGVKLLKRLVDEGILDPSDNYQIMDSMFREGQAAMIINGPWAIKAYKDAGIDYGVAPIPDLEPGVPARPFVGVQGFMVNAKSPNKLLAIEFLTSFIAKKETMYRIYLGDPRLPSRKDVLELVKDNPDVVGFTLSAANGIPMPNVPQMAAVWAAMNDALNLVVNGKATVEEALKNAVERIKAQIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title T. maritima maltotriose binding protein
rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Thermotoga maritima
molecule keywords maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein
total genus 124
structure length 374
sequence length 374
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ghaA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ghaA01
3CSGA 4IY6A 3QSLA 1B1HA 2P2AA 5FTHA 3ECRA 4OFLA 3D4CA 4R74A 3PMVA 4NF8A 4QFOA 2PT1A 2I3VA 5ITPA 4R2FA 2B3FA 4OMBA 2O51A 3G3IA 1MXUA 4F2OA 1PBPA 3HPIA 3TCHA 3KOTA 5AA2A 1MH3A 1A8FA 2HAUA 3EF7A 3N5LA 3T9XB 4LA9A 1B46A 4PQJA 2OLBA 3RTWB 5I58A 1SYIA 4C0RA 5FTIA 2Q9TA 3B6WA 2I49A 1B0HA 2Y7PA 3C31A 3EPEA 4ZECA 2DWAA 4HCYA 5CM6A 3FV1A 4H1XA 2DQVA 3G3FA 3HHFA 2DOJA 3W15C 3RN8A 4QSCA 5KDTA 1P99A 5A5XA 1FTJA 2DXRA 4PFUA 1Y9UA 3P7IA 4YKPA 2F8DA 3UK4A 3CG1A 3UN6A 4ESXA 2XXRA 2I0BA 3TEPA 3OEMA 3U1OA 1YTVA 2RINA 4KFQA 2B65A 1B3HA 3DELB 1UTBB 3K1NA 5I59A 2XD2A 2Y7KA 3PU5A 1MDQA 3HCQA 1US5A 4F39A 3MVXA 2HCAA 1B2HA 3GXAA 4JXIA 2QPQA 1I69A 4KR5A 4LVQA 2GRVA 2DP8A 2O84X 2Y7WA 1NH7A 2DS9A 3W9WA 4C1UA 5DYHA 4GD5A 1B1XA 3IX1A 1SQYA 1ZBMA 5H8HA 1M5FA 2DE4A 3KG2A 4U21A 1NNKA 4TLMB 4XKNA 2VP1A 4QFPA 1IZ1A 3L6GA 3E3KA 3FZVA 3AXFA 3Q28A 2HXWA 4FIMA 4H67A 2R9JA 3QUJA 3RTFB 3C33A 5FHOA 4IGTA 1MQJA 2WKYA 4BDQA 1QKBA 3ODBA 4NE4A 4U4XA 2B3BA 4MF3A 1H43A 1D4NA 4EQ7A 1HSJA 4I62A 5H8NA 1A54A 5ICQA 3OO8A 2QJEA 3PUYE 2V3TA 4ZDMA 1SW4A 1XS5A 4KYDA 2OJTA 3VE1B 1SDXA 4RXLA 3FXQA 3KN8A 3TAJA 3MBPA 5CMBA 4EUOA 2Z8FA 3O66A 4H65A 1FQAA 1PB8A 3ZKLA 5H8QB 4RPOA 3PUZE 3FXRA 3CIJA 5JK4A 4X48A 1XT8A 4Q0CA 4QFLA 3V89B 2Q2AA 1MPBA 3O29A 4OWDA 5EHSA 1MQIA 4G8MA 2DYXA 3BKIB 1PC3A 5FHMA 1NFTA 5I56B 3ZKKA 3TYHA 2NOOA 1YAEA 4AB6A 4F31B 3OO6A 4C1TA 4JSDA 3TELA 4LQ5A 4RYAA 3K2DA 1EH3A 5J1DA 4NF5A 3TZAA 4RY1A 4WEDA 2HQ0A 1OIBA 4NWDA 4ELOA 4H5FA 1MQGA 4LZ5A 3VDFA 1RYXA 3N26A 1NKXA 1B40A 2DE3A 4YB7A 1SD3A 3G3KA 1MY2A 3R6UA 1MY3A 2VHAA 4ZE8A 4FE8A 2E0SA 3PMXA 2OZZA 1UIUA 4NF4B 1Z7ME 1YPNA 3KEIA 4R72A 4YZZA 4ELQA 1IXIA 1DOTA 1QVSA 1IXCA 1B3FA 3IK6B 2PVUA 1N7XA 3OEKA 1P1WA 2D5WA 4TQUQ 1HSLA 3JZJA 2ALUA 3SESA 5AA4B 4ZS9A 1XC1A 2XX8A 1D9YA 3IL1B 3PD8A 2ONRA 3ONMA 4POWA 3IOTA 2DWJA 4G68B 1POY1 4ZZEA 4GL8A 3DM0A 4QFKA 2CZLA 2UVIA 3ILUB 1WVJA 3UP9A 5DTBA 3PPPA 1AL3A 1J1NA 2QS1A 3IR1A 4G2ZA 4IY5A 4F19A 4FECA 5L9SA 1ZLQA 3T9VA 4Z0IA 1IUDA 1DTZA 2LAOA 1LB8A 1FQCA 4X1BA 3MP1A 1B5IA 1O63A 1DPEA 1LAHE 4IO2A 4FEDA 2ONKE 4NEDA 3OOAA 4OTEA 1POTA 1Y20A 1A40A 2NVUB 4ONYA 1R1NA 3TKDA 2I4BA 2QL3A 4GQOA 5TPAB 1B4HA 4F1UA 3T9HB 4ZEKA 4YICA 2O1LA 4LATA 3S9EA 3LSWA 4ISUA 1FQEA 5I57B 1TT1A 1IXHA 3T66A 4QFNA 1Y4CA 3ZS6A 2ABHA 1QW0A 2XX9A 1A55A 1NNPA 1AIVA 1SW1A 1XVXA 1PBQA 4G8NA 2F7BA 4KCDA 3LSXA 3I3VA 4JBZA 4JWOA 1I6AA 1BKAA 3RQTA 2V84A 3KJTA 1F9BA 1FQDA 3TCFA 2QMXA 4GL0A 2I6EA 1XOCA 5K2XA 4KD5A 1A7LA 4Z7EA 3G3JA 1MY4A 1Y3PA 2PX1A 3VXBA 4ZEFA 4ECFA 1H44A 4BDOA 1H76A 2A5SA 2Q89A 1P1UA 4BDRA 4XKQA 3HN0A 2XXUA 3MZ9A 3SEXA 3C32A 3RT6B 3WAFA 1USYH 1BIYA 3H3GA 4WKMA 1NL5A 2O7UA 3DLNA 3O6HA 3V83A 5CMKA 1LBCA 4DCXA 4M1VA 4QSDA 3MZBA 3DP8A 4LUBA 1D3KA 1VE4A 1B0LA 2HZKA 3TTLA 1DTGA 2QS3A 3A3UA 5I2NB 3CSBA 3MVYA 1LGBC 3S4UA 4NWCA 2RCAA 5H8FB 4FJPA 4DLDA 2W7YA 3QYTA 1OVTA 1TFAA 1FTKA 2OWSA 2R6GE 3K6XA 3G3HA 1BP5A 2XXPA 1OQHA 1ZU0A 3VLUA 3D4GA 2UVJA 4OYVA 3FXUA 1MRPA 2I58A 5I2KA 4IO7A 2XXHA 4R75A 2IA4A 1SYHA 3RY3A 4OETA 4G4PA 3DP4A 2UYFA 4H8IA 1A8EA 4I8CA 3N6TA 4BDMA 1NMUA 4GXAA 1MH4A 4F2QA 3A3CA 4XKPA 3IOVA 5CC2A 3UA8A 2XXQA 2ZYNA 4F3SA 3IB0A 4N13A 4JWYA 4OFJA 3O6IA 2F36A 3MVZA 1QUJA 3KZGA 1Q35A 3M3KA 1R9QA 2QS2A 2VOZA 2XD3A 1MDP1 4R6HA 1MPCA 4KYEA 5TP9A 3GBAA 2H25A 1JEVA 3V8XB 5HBCA 1MS7A 1IITA 3CFZA 3T9UA 1S9TA 4YAHX 3FUZA 1URDA 2Y7RA 4GVOA 4U22A 3W9VA 4YKJA 4NF4A 3T22A 3U94A 2DVZA 4JB7A 1LCFA 5ITOA 1LFGA 3KJ7A 4H5GA 1VR5A 4QRZA 2GHAA 4N07A 1XHYA 1OLCA 4GWOA 2VD3A 2HAVA 4THIA 2AYSA 1UTHA 4ZZAA 1AMFA 1MY1A 2PMSA 1LAXA 4DE8A 1B7ZA 3TTMA 3OD7A 5AA4A 4GIZA 1JVYA 5DEXB 5AA1A 3SEUA 4R6KA 5DVJA 1M5EA 2GH9A 2QS4A 1ZIUA 1EZOA 4MFIA 5K2YA 1SVXB 3FD3A 2Q2CA 3IOUA 2NUVA 3PPQA 2Z8DA 3C9HA 2UVHA 4EXLA 1JVXA 4PFWA 3MW0A 4F3BA 3SETA 2OWTA 2X7QA 3H6UA 3T93B 3I6VA 3PPRA 1ATGA 1LBBA 1B4ZA 5FHNA 3LSLA 4YKIA 3EN3A 5KDTB 3MAMA 1QJMA 2QRYA 3CG3A 2F78A 1Y1ZA 5KCJB 4HCWA 4UACA 3VFJA 1YCJA 4GFRA 4ELRA 1JNFA 3KGCA 1FW0A 3MZ1A 4NF6B 5TU0A 3G3GA 1SBPA 1BTJA 2ANJA 3HHGA 1UIVA 4RK2A 2O69A 4RK9A 3MC2A 3O6GA 5F1QA 4RA1A 5TPAA 4P0GA 4IO6A 1MM6A 4FEBA 2ZNUA 3IJOB 2UVGA 4ESWA 3OENA 5I59B 1P1OA 1FQBA 3RPWA 2V93A 2NWJA 2RF1A 1AH5A 1OVBA 2KLFA 3IOWA 2PYYA 1IEJA 3UGWA 2ZYOA 3OO7A 1PEBA 2A5TB 1I6QA 1ELJA 4YKKA 3QK6A 4IGRA 3FVGA 1N84A 1MM7A 4DZ1A 1US4A 4F3GA 3RT8A 3IO6A 3DP6A 5H8HB 2NXOA 3PUXE 3KSJA 1LLSA 4EQBA 1AOVA 4R2BA 4X1DA 2FYIA 4EF1A 4G77A 4FORA 1GGGA 1II5A 3VVFA 3FIRA 4O3AA 1EU8A 3MWBA 4BDLA 2XXXA 3S9MC 3SKPA 2HFBA 2V3UA 3PUWE 3TCGA 1L5TA 1Y1MA 1P1NA 3PUVE 1GR2A 3PGFA 4F29A 1O64A 2XXTA 4OQOA 3LC8A 1H3DA 4IO4A 4L17A 4KCCA 2REJA 4DXBA 4MLVA 4XIGQ 4DDDA 3F11A 3TMGA 1NNTA 2DXYA 4OZ9A 4OESA 3QXMA 3FVOA 2DE2A 1BLFA 3EHUA 5CMCA 5HPQA 2UXAA 3K6UA 4H0WA 2F7AA 1B51A 4XXUA 2O1MA 1LAGE 5I2NA 2H4IA 5DT6A 3O2AA 4H8JA 1NH8A 1JW1A 1ZJLA 4TLLB 2ZYKA 5H8FA 2PBWA 2AL5A 4F18A 4YMAA 3L6HA 3GLBA 2XHDA 5AA2D 3THIA 4R73A 3O9PA 2Z22A 1CE2A 2O6AA 3M3FA 4P0IA 4EDPA 3MP6A 4Q5TA 4KPTA 2XXWA 3USDA 3SEYA 4NF5B 2RCBA 3CFXA 2VGQA 1R9LA 2OCUA 2DWHA 3K1PA 3Q27A 2IEEA 2F35A 4KHZE 5IAIA 2YPNA 3TTRA 4OENA 2I3WA 4FAJA 1DPPA 1N3XA 3K02A 4E0XA 2CMOA 1M5DA 3LR1A 4PE5B 4GLIA 4ZEIA 2OBGA 3IORA 1UTBA 1MPDA 3SDFA 3SERA 3EHSA 2F97A 4DIGA 1MXZA 3C36A 3VV5A 4IO5A 3MUQA 4I1DA 2Y7IA 2F7CA 1B7HA 3PPOA 3GBBA 3RGYA 4KYSA 1M5CA 3C4MA 2YJPA 4HS7A 3B7DA 1N0TA 1T0KA 2FA7A 1GTKA 1VFDA 1OMPA 4YU0A 4K3FA 3TTKA 1TXFA 3MPKA 4XTCQ 3PMWA 2P1SA 3R7XA 1TFDA 1SI0A 4GF8A 3OO9A 2ESNA 4KI0E 3MJNA 3K6VA 4F1YA 3IB2A 1MQHA 2HZLA 3EQ1A 3RNNA 1JETA 3FVNA 2REGA 1S50A 1D9VA 3M8UA 4PETA 2Q88A 5DEXA 3QAXA 4LONB 1H45A 4NMYA 3U93A 1SW5A 2F6PA 2V25A 1B3LA 1MY0A 3H6TA 2P0SA 3EHTA 1N04A 2F6GA 3O97A 3VVDA 2DSFA 3H4ZA 3IB1A 2YLNA 1QUIA 3E13X 5H8QA 1MXWA 5EHMA 3Q29A 4F22A 1B5HA 1Q1KA 4QSEA 1ZMGA 3VVEA 5KCJA 1FQFA 3FJGA 3JV9A 3H03A 3B6QA 3FVKA 1B3EA 4OFOA 5CI5A 3C35A 1Z7NE 1MXYA 1JW5A 4MH5A 4X9TA 4NF6A 1RKMA 3VXCA 4GRKA 5I56A 4LP2B 3LUYA 3OSRA 1M5BA 4JDFA 4PP0A 1QULA 3C34A 5F7VA 4I9DA 1FTOA 4ZE9A 2AIXA 3PD9A 4WXJA 3FJMA 1IQ7A 4BDNA 1B3GA 3FJ7A 2ZMBA 4POXA 5JTYB 3MPLA 4RJZA 4FATA 2XXYA 1OQGA 2A5TA 4JWXA 4AQ4A 1XVYA 1HSEA 5CMMA 1B7UA 3VLVA 2Z23A 4U2RA 5KZTA 2RKMA 1JQFA 2DVCA 1ANFA 3U92A 4NF8B 4RPNA 2BJJX 3E9XA 3JYRA 1LFIA 2G93A 3MVWA 4H6DA 3CI8A 2I0CA 3HO7A 1B52A 2DWIA 2VD2A 5CRYA 5AA3A 1Y4TA 2UYEA 1FTMA 3B6TA 4DCYA 5I84A 5AA2B 2H5YA 3TTNA 4U23A 4MBPA 4WEPA 4IB2A 3T96B 5B70A 3IJXB 1USYE 4PFTA 4OERA 1FCKA 1OLAA 3HSTA 2V3QA 5I58B 4G68A 3BFTA 5LOMA 1B9JA 4F1VA 3KBRA 2F34A 2FNCA 3BBRA 3U72A 2D21A 3G7WA 4F3PA 2OK2A 4Q30B 3TFLA 1SW2A 3KSXA 2H9BA 4O3BA 3K6WA 5I2KB 3OELA 2AL4A 4OEUA 3V5AA 5A5XB 3Q25A 4EF2A 1VFEA 3HV1A 1EZPA 4AB5A 2Y84A 4ZEDA 3K00A 3FGSA 3RUMA 4R6YA 2ZYMA 1QUKA 2RC9A 2O68A 4U4SA 2XXVA 1RYOA 1PB7A 5B7DA 4ND9A 1R6ZA 3RLFE 3K01A 1ZTYA 3KN3A 1Y3QA 4N6PA 4PFYA 2THIA 3IO4A 5JEIA 3TDJA 5M2VA 5I57A 3Q26A 3FASA 3VLWA 1O7TA 1URSA 3UIFA 1A99A 5TP9B 3KFMA 1MXVA 4HTGA 3TQWA 4EXKA 1WDNA 3PPNA 2F5XA 3LSFB 5L9OA 3H06B 3OXNA 3S2VA 1I6BA 3A09A 1N3WA 1WODA 1B6HA 4QHQA 5ELVA 5IKBA 1FTLA 3I5OA 1Y3NA 3KN7A 1GVCA 3U8QA 3SEWA 4EQ9A 3R26A 4OEVA 1MG1A 3TPAA 5L9MA 5DVIA 3FATA 1LFHA 3WAEA 5CBSA 1DMBA 1UTHB 2H98A 5ISUA 1NNFA 4LZ8A 5H8SA 3CVGA 4E0WA 1ZKBA 2XXIA 5DVFA 5H8NB 1N76A 4XKRA 2QSXA 4MLQA 2X7PA 2M8CA 3CRBA 3OSQA 5BUUA 2E1SA 3QUFA 1SI1A 3KOSA 2XX7A 3O28A 2PT2A 2I48A 3CR9A 1B05A 1JEUA 3N6UA 4OVJA 3TQLA 3ILTB 1B5JA 4P11A 1S7YA 3CFLA 3ZSFA 2RC8A 2GFEA 2HEUA 3IAZA 1TWYA 2RC7A 4M4GA 2QMWA 2D3IA 4GOTA 1JW4A 4QF9A 3GZGA 1DSNA 2ONSA 3MP8A 3N94A 4U1ZA 3UORA 2GHBA 1LAFE 1B32A 3E4RA 3H6WA 4R9GA 2O7IA 3LBSA 4OXVA 3TODA 1VSOA 1UQWA 2I4CA 1LB9A 3SEVA 4YMBA 2ZNTA 4G68C 5EYFA 3FV2A 1EZ9A 3K4UA 1LSTA 5L8DA 4G8HA 1MXXA 2ZNSA 5AE4A 2H99A 4RNSA 4ELPA 1URGA 1PDAA 1PB9A 3K1MA 4UA8A 3QIMA 4Q8RA 5ICTA 4YB6A 5CBRA 2G29A 1QKAA 1GV8A 1IXGA 4KQPA 4DXUA 2X26A 3K0VA 3MQ9A 1LCTA 1MQDA 1P1QA 3S9NC 4IO3A 2ZXTA 3H7MA 3TUSA 1IIWA 1B58A 4R9FA 2R71A 3H6VA 5HM4B 4GXSB 4LZ7A 1KWHA 4TOZA 4HW8A 3OMBA 2Q8JA 2Z8EA 3PV0E 4NTLA 4JSOA 4DXCA 4BLAA 5BWJA 1N7WA 4LQ2A 4U1OA 5JTYA 3S9LC 1CB6A 4YB5A 4ZEBA 3BFUA 4O3CA 4OHNA 3M3LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CSGA 4IY6A 3QSLA 1B1HA 2P2AA 1FPEA 5FTHA 3KC0A 3ECRA 4OFLA 3D4CA 1FPFA 4R74A 3PMVA 4NF8A 4QFOA 2PT1A 2I3VA 4NAPA 5ITPA 1FBHA 5EYGA 4R2FA 2B3FA 4OMBA 2O51A 3G3IA 1MXUA 4F2OA 1PBPA 3HPIA 3TCHA 3KOTA 5AA2A 1MH3A 1A8FA 2HAUA 1NUZA 3EF7A 3N5LA 2WX9A 3T9XB 4LA9A 1B46A 4PQJA 4GWXA 2OLBA 3RTWB 5I58A 1SYIA 4C0RA 4I3YA 5FTIA 2QVUA 2Q9TA 3B6WA 2I49A 1B0HA 2Y7PA 3C31A 3EPEA 1IMEA 4ZECA 2DWAA 4HCYA 5CM6A 3FV1A 1RDXA 4H1XA 2DQVA 3G3FA 3HHFA 2DOJA 3W15C 3RN8A 4QSCA 5KDTA 1P99A 5A5XA 1FTJA 2DXRA 4PFUA 1Y9UA 3P7IA 4YKPA 2F8DA 3UK4A 3CG1A 3UN6A 1FPIA 4ESXA 1NV5A 2XXRA 4MX6A 2I0BA 3TEPA 3OEMA 3U1OA 1K9ZA 1YTVA 4MNPA 5LTCA 2RINA 4KFQA 2B65A 1NV2A 1B3HA 2Y5KA 3DELB 4MMPA 1UTBB 3K1NA 5I59A 2XD2A 2Y7KA 3PU5A 1FBGA 1MDQA 3HCQA 1US5A 4F39A 3MVXA 2HCAA 1B2HA 3GXAA 4JXIA 2QPQA 1I69A 2FHYA 4KR5A 4OVPA 5IZ3A 4LVQA 2GRVA 2DP8A 4H45A 2O84X 2Y7WA 1NH7A 2DS9A 3W9WA 4C1UA 5DYHA 4GD5A 1B1XA 1CNQA 3IX1A 1SQYA 1ZBMA 5H8HA 1M5FA 2DE4A 3KG2A 4U21A 1NNKA 4TLMB 4XKNA 2XWOA 1D9QA 1FBDA 3MSTA 2VP1A 4QFPA 1IZ1A 3L6GA 3E3KA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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