2GHBA

Thermotoga maritima maltotriose binding protein, ligand free form
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
373
structure length
373
Chain Sequence
QPKLTIWCSEKQVDILQKLGEEFKAKYGVEVEVQYVNFQDIKSKFLTAAPEGQGADIIVGAHDWVGELAVNGLIEPIPNFSDLKNFYETALNAFSYGGKLYGIPYAMEAIALIYNKDYVPEPPKTMDELIEIAKQIDEEFGGEVRGFITSAAEFYYIAPFIFGYGGYVFKQTEKGLDVNDIGLANEGAIKGVKLLKRLVDEGILDPSDNYQIMDSMFREGQAAMIINGPWAIKAYKDAGIDYGVAPIPDLEPGVPARPFVGVQGFMVNAKSPNKLLAIEFLTSFIAKKETMYRIYLGDPRLPSRKDVLELVKDNPDVVGFTLSAANGIPMPNVPQMAAVWAAMNDALNLVVNGKATVEEALKNAVERIKAQIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title T. maritima maltotriose binding protein open form
rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Thermotoga maritima
molecule keywords maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein
total genus 119
structure length 373
sequence length 373
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ghbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ghbA01
1FQDA 1OVTA 1ZMGA 3QUFA 2WKYA 1GGGA 1FQAA 2OK2A 1M5FA 4NWCA 4PFYA 5DEXB 3O6IA 1QW0A 2R9JA 4Q0CA 4OYVA 3TCHA 4DXUA 2DXRA 1R1NA 4OFJA 1LCFA 3SKPA 4F2OA 4JWXA 4EQBA 1ATGA 1N3WA 2XX7A 4LA9A 4QFNA 4ZE9A 1KWHA 4G68B 3MPKA 2OWTA 5AA2B 1JETA 4RNSA 4LATA 3GBBA 3TEPA 3MVYA 4E0WA 5JK4A 5I57B 1EH3A 3VDFA 4ZEFA 3C31A 2O1LA 1D4NA 2RC7A 1PDAA 4BDMA 1MH4A 2B65A 1VR5A 3S9MC 2P0SA 3FJ7A 1QUKA 2X26A 1Y3NA 5I2NB 1MQHA 4FECA 4K3FA 4F3PA 3QK6A 3JYRA 2XXUA 1N7XA 2GHAA 2I4CA 2RCBA 3KN3A 1B40A 3W9WA 1Y20A 1VE4A 3T66A 1ZKBA 1AH5A 3USDA 2F6PA 3H7MA 3DELB 1SQYA 2XXVA 4JBZA 1EU8A 4HTGA 1NFTA 1TXFA 3W15C 3QXMA 4GWOA 5KDTB 3MWBA 1O64A 4WEDA 3PPNA 1N84A 4YB6A 1B7ZA 1OMPA 1ELJA 2HAVA 2DVCA 5H8QA 4OMBA 3KJ7A 3FIRA 4H8JA 2DE4A 3KSXA 4GL8A 4BDOA 1FTKA 1JVXA 1H44A 5I2KA 2HFBA 4MBPA 2O7UA 3L6GA 2Z8DA 4R9FA 1WDNA 1SW4A 3M3KA 4M4GA 2V25A 3O2AA 5LOMA 2RC8A 3IORA 4RYAA 2PT2A 3KOSA 2HZKA 3VVDA 3T93B 5J1DA 3KEIA 1N0TA 4LQ5A 2F36A 3GBAA 4ZZEA 4IO3A 3T22A 2DS9A 4R2BA 3VLWA 3M3FA 2UVGA 3N94A 4QSEA 3IO4A 3HCQA 4G4PA 1IXHA 1XOCA 1N7WA 2FNCA 1NNKA 5DT6A 4H65A 1S7YA 4LVQA 1I6AA 4NE4A 1EZOA 3LUYA 1GVCA 3N5LA 4OHNA 5L9OA 3H03A 1FTOA 4JSDA 3DP6A 4ZZAA 5HM4B 4F18A 3TFLA 3TTLA 2O68A 1MH3A 1XHYA 4YKPA 5TPAA 2XXQA 1ZBMA 1PBQA 3BBRA 1RYXA 4OFLA 3FV1A 3GLBA 5IAIA 2RINA 1B5JA 4DZ1A 2Q2AA 3O9PA 5B70A 2V93A 4IGRA 1XVYA 4KHZE 3B6TA 1LLSA 3HPIA 4ISUA 3HN0A 3KN8A 4PQJA 3IOTA 1XT8A 4YZZA 1QKAA 3UP9A 1R9LA 1B3LA 1Z7ME 3C9HA 1B5IA 3VXCA 1I69A 1FQCA 4ELPA 5EYFA 3U1OA 5I56B 3EHTA 4Q30B 1CB6A 4KD5A 3CR9A 4NTLA 5H8FA 2D21A 2HAUA 1B3GA 2OBGA 2O69A 2AL4A 1LSTA 4R2FA 4KCCA 3OO7A 5JTYA 2VOZA 1B6HA 4F19A 2XX8A 4KI0E 5L8DA 3FVNA 2DYXA 5I84A 2I49A 1AIVA 5FHMA 5CBSA 3FVGA 4RK2A 3TODA 4X1DA 2B3FA 3DP8A 1MY3A 2H98A 5H8SA 2NWJA 1Y3QA 4NF6B 3VE1B 1DOTA 1TT1A 4X48A 3DM0A 4EDPA 1TWYA 5DYHA 1UTBA 1YTVA 3ZKKA 5FHNA 1D3KA 4FIMA 1B7HA 1QUIA 4QSDA 3SDFA 4FEDA 1DTZA 3R7XA 4JWYA 5F7VA 4FE8A 4RJZA 3RTWB 3B6QA 4OEVA 1P1OA 3N6UA 1MDP1 3GZGA 1SI0A 5AA4A 3VFJA 5CMMA 1MXXA 1AL3A 2PT1A 1B2HA 5KZTA 4X9TA 3KN7A 4ZEIA 1Y9UA 4WXJA 1FQEA 1SD3A 4TOZA 5FTHA 3MP1A 3G3HA 3A3CA 2I4BA 3SESA 5DVFA 3SEWA 1RKMA 3CG1A 4JXIA 3LSXA 2RKMA 4OFOA 3K4UA 4GD5A 3Q28A 1Y4CA 3AXFA 1P99A 3H6TA 4RK9A 1OQHA 3CFLA 4EXLA 3FZVA 1ZU0A 3K6XA 4QFPA 3RT6B 2ALUA 2ZMBA 2FA7A 1YCJA 4PETA 3PU5A 1QUJA 4AB6A 3PPRA 3TAJA 4GXSB 3E4RA 4BDRA 4L17A 4XKPA 3TCGA 1B3HA 3IL1B 3O6HA 4PFTA 5ELVA 2M8CA 1JW5A 2HXWA 2Y7KA 2X7PA 4NMYA 2O6AA 5EHMA 3SERA 3E13X 3KSJA 4ZECA 2VHAA 3LSLA 5CMCA 5H8HA 1MS7A 1Q1KA 3TELA 3ZSFA 3EHSA 4DE8A 3UN6A 4YICA 3TZAA 3IR1A 1LB9A 2CZLA 3N26A 3IB0A 3RN8A 5I58A 1LAHE 1ANFA 1DMBA 2H9BA 2XXHA 3MUQA 5L9MA 1BLFA 2UVHA 5TP9B 1NMUA 5IKBA 4ZS9A 4KCDA 5CBRA 1QJMA 2LAOA 3E3KA 2XX9A 1JW1A 1NH7A 2V3UA 3MP6A 3CVGA 1P1NA 4H6DA 4N13A 3CSGA 4RA1A 4F3BA 3W9VA 1YAEA 3KZGA 3R26A 2ABHA 1VFEA 1SW5A 1L5TA 2KLFA 4DXCA 1N76A 1SVXB 2ZXTA 3C34A 2G93A 2YJPA 4NEDA 1FTJA 3TCFA 4RY1A 1GV8A 1ZLQA 4NF8A 5CC2A 2I48A 4KFQA 4R74A 1B0HA 2Y84A 2XXRA 4U22A 4MH5A 2F35A 5AA2D 3CIJA 1OLAA 1B46A 4IB2A 4G8HA 1Y1MA 1NL5A 2R71A 1P1WA 4DCXA 1Q35A 3K01A 3EF7A 2GRVA 3MP8A 1URDA 4TLLB 1DPPA 1POTA 4HCYA 3D4GA 4HCWA 3K1PA 5TPAB 2XXYA 4KYEA 5DVIA 3PUZE 4EF1A 3S9NC 4U1ZA 3FV2A 3THIA 5CM6A 1PC3A 2F34A 1H3DA 5FHOA 2DE2A 1TFAA 4QFOA 4FEBA 5K2YA 2FYIA 1NKXA 5H8NA 2OWSA 4U2RA 5B7DA 4QFLA 4O3BA 3TTMA 4XKQA 4H67A 1UTHB 4DXBA 4LZ7A 3K6UA 5DEXA 5L9SA 1MY4A 1B1XA 4BDLA 1IZ1A 2F7AA 4Q8RA 2F97A 2QS3A 3RUMA 2DWHA 2VGQA 1S50A 3IOVA 2DVZA 2OCUA 3QSLA 2YLNA 1N04A 4XKRA 3IJOB 4WKMA 1B3FA 4GVOA 3EN3A 4G68A 2GFEA 1PB7A 4H8IA 5AA2A 3G3GA 2BJJX 3TMGA 1WVJA 4PE5B 2V84A 4C1TA 5I57A 2QJEA 3OELA 1IIWA 2B3BA 2VP1A 2I3VA 4R72A 2D3IA 1USYH 4ZDMA 2F78A 2QL3A 3K6VA 2AIXA 5I2NA 2UVIA 1IITA 1XC1A 3FJGA 3VLVA 2Q89A 1JEVA 3G3FA 3G3IA 1QVSA 3SEVA 1B58A 1ZIUA 2ZNSA 3MW0A 1T0KA 1EZ9A 4F2QA 2IA4A 3K2DA 4F39A 2XXIA 4WEPA 4YKJA 1US5A 4H5FA 1URSA 5EHSA 1MPCA 3MPLA 2Q88A 3A3UA 2DE3A 4NF5B 3DLNA 3V83A 3K0VA 1PB8A 5FTIA 2A5TB 5AA4B 3L6HA 3U94A 3IOWA 5AA3A 2UXAA 3H06B 1PBPA 5KDTA 1LFIA 2O84X 4OWDA 4F1UA 4DIGA 4OTEA 1B05A 1HSLA 3C4MA 1H45A 1MY0A 3FVOA 4G77A 4PFWA 2ESNA 4F3GA 2QRYA 3MZBA 4NF4B 3MVXA 3HV1A 3PMXA 4BLAA 4U23A 1AMFA 4RXLA 5ISUA 1PB9A 1HSEA 4OERA 2NUVA 1MRPA 4MLVA 4YB7A 4BDQA 1NH8A 1A40A 4GOTA 4NWDA 4OXVA 2OZZA 1JVYA 3T9XB 4QRZA 2I6EA 5AE4A 3PPQA 3SETA 2Q2CA 4F1VA 1NNTA 4EF2A 5KCJB 5CMKA 4OETA 3TUSA 1O7TA 1BTJA 3M8UA 5K2XA 4OVJA 3B6WA 2H4IA 5A5XA 4JWOA 4KPTA 3KFMA 3BFTA 2G29A 4JDFA 2VD2A 2H25A 4IO2A 3OEMA 4OZ9A 3VVEA 3K02A 1A8EA 1QULA 3SEXA 3U93A 3OSQA 2Q8JA 4ELQA 2AL5A 1MXUA 5CI5A 2PYYA 1A54A 4QSCA 3SEYA 1A7LA 2XXWA 1FW0A 3H3GA 2CMOA 1URGA 2Z8EA 1NNFA 2NOOA 5I58B 1M5DA 3PD9A 2PVUA 3LSWA 4C1UA 4GXAA 1JQFA 2DP8A 4GL0A 3HHGA 3RT8A 5ICQA 2ZYKA 4YMBA 4M1VA 3K1NA 3O6GA 2DXYA 4LQ2A 4ND9A 4Z7EA 3TTRA 1A8FA 3HSTA 1N3XA 3VLUA 1H76A 4FJPA 3PMWA 1B52A 2QSXA 4R6KA 3V5AA 1LFHA 4UACA 2V3QA 1I6BA 5I56A 2VD3A 1MQGA 5F1QA 2QS2A 4U4SA 3ONMA 4P11A 3VV5A 1Y1ZA 3T96B 4I9DA 4YAHX 3FXRA 4F29A 2REGA 2Y7PA 3UORA 3TQWA 3O29A 1BIYA 3PPPA 4OQOA 3S2VA 4NF8B 5CRYA 4LZ8A 2ZYOA 3MC2A 3QUJA 4Z0IA 1B9JA 1YPNA 2O51A 1XVXA 4LONB 3ILUB 1I6QA 4F3SA 3H6UA 2I58A 3HHFA 1HSJA 2ANJA 2XXXA 4X1BA 3PUXE 1H43A 4O3AA 2P1SA 1FQFA 3TYHA 3MJNA 1FTLA 4ESWA 1MDQA 3IAZA 3H6WA 4O3CA 3KBRA 4GF8A 4IGTA 3UK4A 3I6VA 3WAEA 3PPOA 3CFZA 4AB5A 4EQ7A 3B7DA 5TU0A 3LSFB 3I5OA 2DQVA 3ZKLA 3ZS6A 2QPQA 4POXA 4EXKA 2ONSA 1DSNA 3CG3A 1DTGA 3FD3A 3CI8A 2HCAA 5H8QB 1Y3PA 2DSFA 1LBCA 2Y7WA 1US4A 4LUBA 4QF9A 2ONRA 4KYSA 1SDXA 3FXUA 2ZNUA 1M5CA 1MQJA 5I2KB 3O97A 5JEIA 4KQPA 3G7WA 3Q26A 1B4HA 3U8QA 4U1OA 3OD7A 4AQ4A 3T9VA 4G8NA 2YPNA 3MAMA 1Z7NE 3S4UA 3KG2A 1RYOA 4FORA 3FASA 3FATA 1MY1A 3C36A 3QYTA 3RPWA 2H5YA 3VVFA 1B7UA 5I59A 3MQ9A 1MXZA 3EPEA 4H5GA 2P2AA 1D9YA 4MLQA 2F7BA 3HO7A 4U4XA 1SYIA 1SI1A 1NNPA 4YU0A 2PX1A 1SBPA 4MF3A 4ECFA 1VFDA 1GTKA 4U21A 4OEUA 4EUOA 3TDJA 3BKIB 2E0SA 3OOAA 1A99A 3SEUA 3QIMA 3MZ9A 4GQOA 2ONKE 3G3JA 1B3EA 1II5A 1LFGA 4F22A 4OESA 1M5EA 3V8XB 1MPBA 3H6VA 2RF1A 1B5HA 1DPEA 4KYDA 3Q27A 1LGBC 3H4ZA 3T9UA 4F1YA 1MM6A 1OQGA 1D9VA 3TTNA 2Z8FA 1A55A 3FVKA 3F11A 1FTMA 3LC8A 1TFDA 3U92A 5CMBA 4OENA 2HEUA 3IK6B 1P1QA 3OO9A 1EZPA 3PUYE 3KOTA 4YMAA 2DWIA 3OXNA 1MXYA 3OSRA 2X7QA 3PUWE 3IB1A 3CRBA 1MPDA 5TP9A 3KGCA 5H8FB 4RPOA 4Q5TA 1B4ZA 3K00A 2F5XA 1IUDA 1O63A 2Q9TA 4QFKA 4HW8A 1SYHA 5DVJA 2Z23A 2RC9A 4H0WA 2UVJA 5JTYB 3RNNA 3UA8A 5ICTA 1Y4TA 1B51A 2QS1A 3WAFA 3IJXB 3JZJA 4F31B 1OLCA 3JV9A 2QMWA 3I3VA 3IOUA 1SW2A 4POWA 1IXIA 4I1DA 3C32A 4QHQA 1LAXA 3Q25A 5ITPA 1J1NA 3LBSA 3OO6A 5A5XB 4TQUQ 4G68C 3G3KA 4H1XA 3TQLA 4JB7A 4EQ9A 2ZYNA 2QMXA 3T9HB 3OEKA 4GFRA 1MXWA 1UTBB 4MFIA 3EHUA 4R75A 1CE2A 3ILTB 3R6UA 2OJTA 3LR1A 4LP2B 5BUUA 2XXPA 3RLFE 5AA1A 4XXUA 1P1UA 4N07A 2IEEA 4P0IA 2XHDA 2QS4A 2O1MA 4BDNA 1LBBA 2A5SA 1UIUA 1ZJLA 2V3TA 3TTKA 1IXGA 3MVZA 2XD2A 2NVUB 1OVBA 1ZTYA 1QKBA 4TLMB 1IQ7A 2I0BA 3PV0E 1UQWA 3C35A 3N6TA 1F9BA 3ODBA 4IO7A 2XXTA 4FATA 4DLDA 1UTHA 2GH9A 4THIA 3CSBA 2PMSA 1OIBA 2DWJA 2R6GE 1FCKA 3IO6A 4R73A 3O28A 4ZEDA 3P7IA 3E9XA 3RQTA 3IB2A 3OO8A 2OLBA 4FAJA 3OENA 3RTFB 3UGWA 1MQIA 1R6ZA 3FUZA 4LZ5A 4G8MA 4YB5A 4YKIA 1B1HA 1MG1A 1WODA 2REJA 3FGSA 3VXBA 2Y7RA 3QAXA 1IEJA 2F7CA 5HPQA 1LAGE 4GRKA 4XTCQ 4IY6A 3EQ1A 3BFUA 3K6WA 2RCAA 2DWAA 2THIA 4XKNA 1IXCA 4IY5A 2GHBA 4G2ZA 5H8HB 3S9LC 4ZE8A 1BKAA 3MBPA 1M5BA 2AYSA 4GLIA 3PD8A 5BWJA 4ZEBA 2E1SA 3PUVE 1JNFA 4N6PA 5DTBA 3GXAA 4PP0A 5M2VA 3ECRA 4JSOA 1R9QA 3TKDA 1GR2A 2DOJA 1POY1 2HZLA 4NF5A 2Y7IA 4C0RA 1PEBA 3TPAA 2A5TA 1LCTA 4I62A 4HS7A 4PFUA 3U72A 2H99A 2I3WA 3DP4A 1MM7A 4RPNA 3K1MA 4UA8A 4ELRA 4YKKA 1LB8A 4DDDA 2NXOA 1AOVA 2Z22A 3D4CA 1MY2A 1LAFE 3S9EA 3FJMA 4R6YA 4ESXA 1B0LA 4I8CA 1UIVA 3UIFA 4R6HA 4NF4A 3MVWA 2ZYMA 2O7IA 4IO5A 2D5WA 1FQBA 5I59B 1VSOA 2F6GA 1JW4A 4ZEKA 1USYE 2PBWA 2XD3A 4DCYA 1XS5A 4XIGQ 1MQDA 3A09A 3Q29A 3IX1A 1S9TA 3C33A 3O66A 4ONYA 3CFXA 4E0XA 2F8DA 3RGYA 3RY3A 4IO4A 2ZNTA 4P0GA 5KCJA 4R9GA 3OMBA 4IO6A 1B32A 2W7YA 2I0CA 3V89B 2UYFA 3PGFA 1SW1A 1JEUA 4KR5A 2HQ0A 5HBCA 3FXQA 2UYEA 1MXVA 4NF6A 3M3LA 4ELOA 5H8NB 3KJTA 1BP5A 3PMVA 4GIZA 3MZ1A 5ITOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DBZA 1FQDA 1OVTA 1ZMGA 5IZ3B 3QUFA 2F3DA 2WKYA 1GGGA 1FQAA 4XF5A 2OK2A 1M5FA 4NWCA 4IR8A 1FBEA 4PFYA 5DEXB 3O6IA 1QW0A 2R9JA 4Q0CA 4PFBA 4P3LA 4OYVA 3TCHA 4DXUA 1FBDA 2DXRA 1R1NA 4OFJA 1LCFA 3SKPA 4F2OA 4JWXA 4EQBA 1ATGA 1N3WA 2XX7A 4LA9A 4QFNA 1FBHA 4XEQA 4ZE9A 3MYUA 1KWHA 4G68B 3MPKA 2XWIA 1YZ0A 2OWTA 5AA2B 1JETA 4RNSA 4LATA 3GBBA 3TEPA 5DW8A 3MVYA 4E0WA 2XA5A 5JK4A 5I57B 2B4LA 1EH3A 1QGXA 3VDFA 4NN3A 5A5LA 4ZEFA 3C31A 2O1LA 1D4NA 2RC7A 5ET8A 1PDAA 4BDMA 1MH4A 2B65A 4NGUA 1VR5A 3S9MC 2P0SA 3FJ7A 1QUKA 2X26A 1Y3NA 5I2NB 1MQHA 4FECA 4K3FA 4F3PA 3QK6A 3JYRA 2R8TA 2XXUA 1N7XA 2GHAA 2I4CA 2VPOA 2RCBA 3KN3A 1B40A 4JVIA 4NHBA 3W9WA 1Y20A 1VE4A 3T66A 1ZKBA 1AH5A 3USDA 2F6PA 3H7MA 3DELB 5LTCA 4G61A 1SQYA 2XXVA 4JBZA 1EU8A 4HTGA 1NFTA 1TXFA 1NV0A 3LV0A 3W15C 3QXMA 3A29A 3HFUA 4GWOA 5KDTB 3MWBA 1O64A 4WEDA 3PPNA 1N84A 3CHGA 1B7ZA 4YB6A 3KBZA 1OMPA 1ELJA 3KC0A 2HAVA 4KXPA 2DVCA 4DI4B 5H8QA 4OMBA 3KJ7A 3FIRA 4GWYA 4H8JA 2DE4A 2MKZA 3KSXA 4GL8A 4BDOA 1FTKA 1JVXA 1H44A 5I2KA 2HFBA 4MBPA 2O7UA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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