2HAVA

Apo-human serum transferrin (glycosylated)
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
676
structure length
676
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The Crystal Structure of Iron-free Human Serum Transferrin Provides Insight into Inter-lobe Communication and Receptor Binding.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
molecule keywords Serotransferrin
total genus 192
structure length 676
sequence length 676
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2havA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2havA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2havA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2havA03
2H25A 4EDPA 2Z23A 3PPQA 1NH8A 1UQWA 1XOCA 3CRBA 3BFUA 4R6KA 3QXMA 4F3SA 3FXRA 1EH3A 1L5TA 4G8HA 3OO9A 4YKIA 4FJPA 3EQ1A 4I62A 4TLMB 4RK9A 1MY1A 4QF9A 3TQLA 2UVHA 1NH7A 1URDA 5EHSA 3DLNA 4LA9A 5ICTA 1TFAA 1B4HA 1MQIA 2HQ0A 5CMCA 3E13X 1IZ1A 3KG2A 3FV2A 1BLFA 4QSDA 5CRYA 4U1OA 4QFLA 2DOJA 1TT1A 4DLDA 1MQDA 3ONMA 4E0XA 3V8XB 3N5LA 1I6QA 3IORA 1AL3A 5FHNA 4DXCA 2RC8A 2F6GA 4LZ5A 1B3GA 2F5XA 2UVIA 4KQPA 1MY0A 4IO2A 3U93A 4M1VA 2QS1A 3HHFA 1ZBMA 2DWIA 1SYIA 4GXAA 2E0SA 1FCKA 2XX7A 2VHAA 1MY3A 4OESA 3QIMA 3MP6A 4OMBA 5JTYA 3FV1A 5CMKA 4LQ2A 3KFMA 4ZZAA 5EYFA 1Y3QA 4IO3A 3EPEA 2DP8A 5KDTA 1FTLA 1B51A 5BUUA 3VV5A 3MWBA 3TUSA 3K6UA 4H8JA 4WKMA 2VGQA 2I4BA 3T9HB 1JETA 1ATGA 4F1VA 4IO7A 4RJZA 4IY5A 5I84A 1Y9UA 1IIWA 2OWSA 2UVGA 4LUBA 3T9XB 3PGFA 2QS3A 1IITA 4GFRA 4H5FA 3UA8A 3VLVA 3FVOA 4EQ7A 1ZU0A 3TEPA 1USYE 2Z8DA 2PYYA 2D3IA 2P1SA 3K6XA 3UIFA 4U1ZA 3IR1A 3OELA 4OENA 3P7IA 5I59A 1WVJA 2PVUA 2Q89A 1Y1MA 3B6WA 3DELB 1B7UA 1POTA 2QMXA 1A8EA 3M3LA 1M5CA 4NF5B 4XKNA 2I3WA 4OXVA 3MUQA 3U8QA 3C35A 5L9OA 4MLVA 1MXXA 3T9UA 3GLBA 4IO5A 3K0VA 4UA8A 1Y4TA 4F18A 3PMVA 2DQVA 4JWYA 3OD7A 4X1DA 1DSNA 3PUYE 2QL3A 4MF3A 3MVWA 3U92A 3C33A 3C9HA 1B52A 4PFTA 4X1BA 3CVGA 4LONB 2DWJA 2RKMA 3T22A 2BJJX 4YAHX 4ESXA 1MH4A 1FQCA 2GFEA 3VLUA 4NF4A 3OENA 1B3EA 3EHTA 4O3BA 1ZJLA 4GL0A 4F3GA 4N07A 4QFKA 2DVZA 1JEVA 2P2AA 3C32A 3MC2A 2F78A 4PP0A 1D9YA 2XXTA 1AIVA 4YB6A 4F1UA 2GRVA 2VOZA 3H06B 3LSLA 4BDNA 3FVGA 1VE4A 3W9WA 3CIJA 4DZ1A 1GTKA 3KBRA 4I8CA 3IJOB 2Q88A 4GLIA 4P0IA 1LAXA 1N0TA 3CFLA 3H6TA 5KCJA 4NF8B 3CG3A 2ZNTA 3ILUB 1MQGA 1LAFE 1A40A 1B9JA 3FZVA 5TP9A 1PB7A 1OQHA 3FJ7A 4U4XA 3FGSA 2Y7KA 2Y7IA 5H8NB 3L6HA 1AH5A 1UTHA 1B1HA 3BFTA 4OQOA 2OZZA 3T93B 1PB9A 1S7YA 1A7LA 3QUJA 1S50A 3IAZA 3EHUA 1XC1A 1J1NA 1N04A 1PDAA 2P0SA 2A5SA 4GRKA 3E3KA 4ZEBA 1LAHE 4KCCA 2Q9TA 5H8FA 3RNNA 2ANJA 2DSFA 5EHMA 1URGA 2DXRA 2HAUA 2G29A 2XD2A 1JQFA 3VLWA 4IGTA 3G3KA 3PPOA 1AMFA 1II5A 5FHMA 3KOSA 3OXNA 5CMBA 4L17A 4ISUA 3E9XA 4H5GA 3MZ1A 1FQEA 2H98A 2YJPA 4EUOA 1BKAA 1O63A 2B3BA 1B5JA 1RKMA 2ZNSA 1N84A 3HCQA 1B0HA 2DXYA 1PBQA 1QUJA 2O69A 3GBBA 5I2KB 3TCGA 5AA4A 2GH9A 1B2HA 1SVXB 3IX1A 5CC2A 1ZMGA 3IOVA 3MAMA 4KYEA 4RY1A 3V83A 4BDLA 4LP2B 4U2RA 1LBBA 4NF6B 4ZDMA 3TTRA 1QUIA 1H44A 1B0LA 5JK4A 1B7HA 2PX1A 4JB7A 3RN8A 3PPRA 4EXLA 1HSLA 2V93A 3MVXA 1GGGA 3W15C 3PUZE 3DP6A 4QRZA 2B3FA 2ZNUA 3TYHA 1MM6A 2XXVA 1ZKBA 1DMBA 3B6QA 4NWCA 1MPBA 2O1MA 5ITPA 4OERA 4DCXA 3KEIA 3OSQA 5TPAA 1P1UA 2I3VA 3E4RA 1LCFA 1GVCA 4DXBA 2UYEA 4R2FA 4NE4A 3K6WA 1B7ZA 4GVOA 4KD5A 3RY3A 2KLFA 3PD8A 1CB6A 1RYXA 5IAIA 2PMSA 2NVUB 1B58A 1B4ZA 4POXA 4PE5B 5L9SA 1Y20A 1H43A 3C31A 3GBAA 4G68A 3TCFA 3DM0A 1B6HA 3VVDA 1IUDA 3FVKA 1OVBA 4NEDA 4HCWA 4H0WA 4QFNA 4MBPA 2PBWA 1NNFA 4H6DA 3U94A 1QUKA 5AE4A 5HM4B 2DWAA 4QFPA 3IL1B 3O28A 4AB5A 2DYXA 3H3GA 1SDXA 4OVJA 4ELRA 3JZJA 2QMWA 3FUZA 1Y1ZA 1R1NA 1SQYA 3FVNA 4YICA 4RPOA 1FW0A 4KPTA 3VVEA 2WKYA 5I58B 4XKPA 3VXBA 1FTMA 3UORA 1JVXA 1F9BA 5J1DA 1DTGA 1R9LA 5H8QA 2GHAA 3SEWA 2XXXA 4PFUA 4YMBA 4BDQA 3IOTA 1NNKA 2X7QA 2UVJA 4FEBA 2V25A 4TLLB 4GD5A 4IB2A 2R9JA 1LAGE 4C1UA 3RGYA 2OBGA 3V5AA 3KJ7A 1TWYA 4Q30B 3SERA 1Z7NE 1IXIA 2ONKE 3MP1A 2ZYKA 3C34A 2XX9A 2NXOA 3MJNA 1AOVA 1VR5A 1US5A 1JW1A 3HO7A 3OO8A 5H8HA 4PQJA 3FJGA 5DVIA 3RT8A 3HN0A 3TMGA 3KGCA 1UTBA 4ELOA 3OO6A 3OEKA 2ESNA 4IGRA 3CSBA 4GIZA 4JSOA 3O9PA 3TKDA 4ZECA 2DWHA 4Z0IA 1YPNA 4R6HA 2Q8JA 1NKXA 2V3TA 2QSXA 3H7MA 1O7TA 2DE3A 5AA2D 4WXJA 1MS7A 3K00A 4I9DA 3S2VA 2XXIA 2A5TA 5KDTB 2ALUA 1DPPA 1DOTA 1LFHA 1Y3NA 1DPEA 3PMWA 1FTOA 1HSJA 1TXFA 3D4GA 4EF2A 4G68C 4F31B 5I57B 3KN7A 1LSTA 3S9EA 2H9BA 3TDJA 4DXUA 4F3PA 1PB8A 3CSGA 3H6VA 3PUWE 1XS5A 3TTLA 5I56B 4KR5A 2OCUA 3OOAA 2QS2A 1N7WA 4G8MA 1OVTA 4TOZA 4ECFA 3PUXE 1A8FA 2DS9A 4GQOA 3T96B 3Q26A 4LQ5A 2HAVA 4LATA 2O7UA 3W9VA 3PUVE 2B65A 3TFLA 1DTZA 4E0WA 1IXCA 4O3CA 1QKAA 1B46A 3U1OA 4EF1A 2QPQA 4YKPA 4KI0E 3VE1B 3FIRA 1FQFA 4N6PA 3UK4A 3H03A 1D3KA 2ZYOA 2YLNA 2G93A 3PV0E 3S9NC 2XHDA 3G7WA 3N6UA 3UGWA 5H8NA 3MBPA 4YU0A 5A5XA 4H65A 4O3AA 4LVQA 1Q1KA 2AYSA 1B3FA 5K2XA 1VSOA 4QSCA 5DVJA 1POY1 5DEXA 4YB7A 3TQWA 4DIGA 2XX8A 1VFDA 3R6UA 2XXRA 3B6TA 4R9FA 2I49A 2O7IA 4PETA 2O6AA 4NF4B 4U23A 3K02A 4KFQA 1OLAA 4FAJA 2O68A 1WODA 4RA1A 3LR1A 5HPQA 3RTWB 2X26A 3QYTA 4BDMA 4C1TA 3RPWA 1FQBA 4X9TA 3IJXB 1URSA 3S9LC 3S4UA 2H99A 3ZKKA 3A09A 3FATA 1OLCA 3R26A 1B40A 2O1LA 5ISUA 4Q8RA 4RNSA 1ZTYA 3K2DA 2F8DA 3RT6B 3MP8A 5DYHA 3VVFA 1FQAA 4U21A 5M2VA 1B3LA 3K1NA 1M5FA 1MM7A 1PEBA 1Q35A 4JBZA 2XXQA 2ZYMA 3CFZA 3JV9A 4KHZE 4MLQA 4ZEFA 5KCJB 1RYOA 3KN8A 4F22A 1D4NA 3KJTA 1Y3PA 4OEUA 2F34A 4FECA 1ZLQA 2Y7PA 2D21A 2THIA 4JSDA 1MPDA 5ICQA 3BBRA 2XXUA 4QSEA 4RYAA 3TODA 3G3HA 2Q2CA 3SEXA 3C36A 3RUMA 5AA2B 3HPIA 4Z7EA 3Q28A 2NOOA 2QRYA 2ZYNA 3Q29A 5I2NB 2R6GE 4NMYA 3LUYA 1BP5A 4HTGA 2V3QA 5H8FB 1MH3A 1JVYA 2PT2A 2I6EA 4OFJA 2XXYA 4AB6A 4N13A 4U4SA 4POWA 1VFEA 3N26A 3O29A 3M8UA 1P1OA 4F39A 1SI1A 1MXWA 2UXAA 4ELQA 3K01A 3QK6A 3VFJA 2NUVA 4FE8A 3O2AA 3I5OA 4ND9A 4R72A 5ITOA 2X7PA 4K3FA 2RC9A 4PFWA 2XXHA 3FASA 2I58A 1ELJA 4R74A 3WAEA 3QAXA 4YZZA 2QJEA 1MY4A 3U72A 1P1QA 4M4GA 4OTEA 1A55A 1A99A 1MDQA 5B7DA 4OWDA 2Y7RA 3KZGA 5F7VA 3KOTA 4U22A 4KYDA 1Y4CA 5CM6A 3PPPA 1YCJA 2HZLA 4R2BA 1B1XA 5F1QA 3DP4A 3IO6A 1A54A 2Z22A 2AIXA 3LSXA 2I0BA 1XHYA 3MPLA 3ILTB 3TELA 3MZBA 1WDNA 1FQDA 2HFBA 1TFDA 4C0RA 4G8NA 3M3FA 1I69A 3I6VA 3SKPA 3UN6A 3Q25A 4ZZEA 5TU0A 4FEDA 4ESWA 4P11A 3CG1A 2DE4A 3MPKA 3HHGA 3TPAA 1IEJA 4RXLA 3GXAA 1NMUA 2YPNA 4TQUQ 1SI0A 1ANFA 3O66A 3GZGA 1EU8A 2E1SA 2H5YA 2R71A 3SEYA 3H4ZA 3LSFB 4QHQA 4ZS9A 3O97A 2RCBA 1Z7ME 1JW4A 3MQ9A 1JEUA 5TPAB 1R9QA 2RCAA 4DE8A 1EZ9A 1B5IA 4PFYA 1H45A 1SD3A 1H3DA 3DP8A 4R73A 3SEVA 1SW5A 1YAEA 1S9TA 3C4MA 4EQ9A 4H8IA 1QW0A 2F7CA 3VDFA 2CMOA 4HW8A 3ODBA 3UP9A 4G68B 3AXFA 3TTNA 3O6HA 1MXYA 1SW1A 1UIVA 3RTFB 3PU5A 4ZEDA 3R7XA 1N76A 2HXWA 3ZKLA 4XKQA 3S9MC 3CR9A 4OEVA 5CMMA 2OWTA 4F1YA 1T0KA 2IA4A 4DDDA 3B7DA 4R75A 4GOTA 5AA3A 4F19A 3T9VA 2FNCA 2AL5A 1MXUA 2F35A 4JXIA 3IB2A 3FXQA 2OK2A 2Y84A 3USDA 2RC7A 4IO6A 2VD3A 5DTBA 4NF5A 3N94A 3IK6B 1US4A 4FIMA 1GV8A 1R6ZA 4GXSB 1NNTA 5H8QB 3D4CA 4G2ZA 5I57A 5IKBA 4ELPA 3G3GA 2V3UA 1IXGA 2O51A 4ONYA 4F29A 2NWJA 3IOUA 1P1NA 4THIA 1XT8A 4GF8A 4XIGQ 5I56A 3JYRA 4HS7A 1MG1A 5JTYB 2QS4A 3THIA 1QVSA 2I4CA 2ONRA 5B70A 4Q0CA 4G77A 3RLFE 3FD3A 2PT1A 3H6WA 5JEIA 1CE2A 3HSTA 4MFIA 3BKIB 1P1WA 1EZOA 2HZKA 5H8HB 5FTIA 5CBRA 2DVCA 5L8DA 3K4UA 4GWOA 2I0CA 3EF7A 1UTBB 3OO7A 2DE2A 1FTJA 2FA7A 2Z8EA 2M8CA 1QJMA 5LOMA 3M3KA 3T66A 4OZ9A 3TTMA 4RK2A 3V89B 1UIUA 3SDFA 1OMPA 2O84X 4LZ8A 3HV1A 3G3JA 3L6GA 1QULA 2FYIA 1M5DA 5K2YA 5I59B 3CI8A 2A5TB 5DT6A 4NF8A 2REJA 2F7AA 3FXUA 2ONSA 3MVYA 1USYH 4ZE9A 1IXHA 1LLSA 5FTHA 3KSXA 3G3FA 3ZSFA 1SW4A 3PD9A 3MZ9A 2OJTA 2HCAA 1P99A 1PBPA 1HSEA 2REGA 4F3BA 2F6PA 1PC3A 2Q2AA 4YB5A 2I48A 4R9GA 1B32A 4G4PA 2LAOA 3KN3A 4F2QA 4R6YA 4WEDA 1MQHA 4OHNA 4EXKA 3MW0A 2F97A 3EHSA 2AL4A 2W7YA 3FJMA 1M5EA 1LCTA 4NWDA 4JWOA 3IB1A 2HEUA 3CFXA 3ZS6A 3IOWA 1BTJA 1N3WA 3I3VA 1MDP1 1EZPA 1MPCA 1ZIUA 3IO4A 4XXUA 1SW2A 3K1MA 1QKBA 4DCYA 1D9VA 4F2OA 4I1DA 4ZEKA 3TTKA 3F11A 3G3IA 4YKKA 1LB8A 1NL5A 5A5XB 1SBPA 5CBSA 4IO4A 3VXCA 4OETA 1MXZA 4XKRA 2RF1A 5FHOA 5AA2A 4UACA 2GHBA 5CI5A 3IB0A 4H1XA 5DEXB 4HCYA 1IQ7A 5I2NA 1B5HA 3O6GA 2XXWA 5KZTA 5I2KA 1NFTA 1OIBA 2Z8FA 5TP9B 1YTVA 4MH5A 3MVZA 4YMAA 3PMXA 5L9MA 5HBCA 1LFGA 1O64A 2ZXTA 4FATA 1LB9A 4Q5TA 2V84A 1UTHB 4ZEIA 4NF6A 3RQTA 4BLAA 3K1PA 2H4IA 5ELVA 1JW5A 4IY6A 4OYVA 3A3CA 1XVXA 2Y7WA 1B05A 3H6UA 4LZ7A 3K6VA 4BDOA 2ABHA 3KSJA 2IEEA 3QUFA 4FORA 4WEPA 4JWXA 2CZLA 5DVFA 1H76A 1GR2A 1I6AA 2ZMBA 1N3XA 1MQJA 4AQ4A 2VP1A 1MXVA 2F36A 4OFLA 3SEUA 1M5BA 3SETA 3N6TA 4X48A 2RINA 1JNFA 4OFOA 4QFOA 1OQGA 1N7XA 4KCDA 2VD2A 5H8SA 3TCHA 3ECRA 1KWHA 3TAJA 1B3HA 1LBCA 4H67A 3OSRA 3O6IA 4ZE8A 3A3UA 3LBSA 3PPNA 4P0GA 1NNPA 3SESA 5BWJA 4EQBA 1MY2A 4RPNA 5AA4B 4GL8A 3Q27A 2D5WA 4XTCQ 1I6BA 1BIYA 2XXPA 3LC8A 1MRPA 3TZAA 3EN3A 3LSWA 3WAFA 4NTLA 1XVYA 5AA1A 4KYSA 3QSLA 2XD3A 2F7BA 1LFIA 2UYFA 4YKJA 2OLBA 3OEMA 1LGBC 1FTKA 4JDFA 3OMBA 4BDRA 1SYHA 5I58A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2H25A 4EDPA 2Z23A 3PTYA 3PPQA 1NH8A 1UQWA 1XOCA 3CRBA 3BFUA 4R6KA 3QXMA 4F3SA 3FXRA 1EH3A 1L5TA 4G8HA 3OO9A 4YKIA 4FJPA 3EQ1A 4I62A 4TLMB 4RK9A 1MY1A 4O94A 4QF9A 3TQLA 2UVHA 1NH7A 1URDA 5EHSA 3DLNA 4LA9A 5ICTA 3T0JA 1TFAA 1B4HA 1MQIA 2HQ0A 5CMCA 3E13X 1IZ1A 3KG2A 3FV2A 1BLFA 2F3BA 4QSDA 5CRYA 4U1OA 4QFLA 1NV3A 2DOJA 1TT1A 4DLDA 1MQDA 3ONMA 4E0XA 3V8XB 3N5LA 1I6QA 3IORA 2CEYA 1AL3A 5FHNA 4DXCA 2RC8A 2F6GA 4H45A 4LZ5A 1B3GA 2F5XA 2UVIA 4KQPA 1MY0A 4IO2A 3U93A 4M1VA 2QS1A 3HHFA 1ZBMA 2DWIA 1SYIA 4GXAA 2E0SA 1FCKA 2XX7A 2VHAA 1MY3A 1CNQA 4OESA 3QIMA 3MP6A 4OMBA 5JTYA 3FV1A 5CMKA 4LQ2A 1FJ9A 3KFMA 4ZZAA 5EYFA 1Y3QA 4IO3A 3EPEA 2DP8A 5KDTA 1FTLA 1B51A 5BUUA 3VV5A 3MWBA 3TUSA 3K6UA 4H8JA 4WKMA 2VGQA 2I4BA 3T9HB 4MMPA 1JETA 1ATGA 2OWZA 2QVUA 4F1VA 4N17A 4IO7A 4RJZA 4IY5A 5I84A 1Y9UA 1DK4A 1IIWA 2OWSA 2UVGA 3RPLB 4LUBA 3T9XB 3PGFA 2QS3A 1IITA 4GFRA 1FPFA 4H5FA 3UA8A 3VLVA 1LBYA 3FVOA 4EQ7A 1ZU0A 3TEPA 1USYE 2Z8DA 1FPIA 2PYYA 2D3IA 2P1SA 3K6XA 3UIFA 4U1ZA 3IR1A 3OELA 4OENA 2FIEA 3P7IA 4N8YA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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