2I3VA

Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: structure of g725c mutant
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGCNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Measurement of Conformational Changes accompanying Desensitization in an Ionotropic Glutamate Receptor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 76
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3vA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3vA02
1MXZA 2O51A 2XXRA 3O6HA 4POXA 1B5HA 3EPEA 2D21A 1IIWA 3QUJA 5FHNA 3S9LC 2H4IA 2FNCA 4C1UA 3KOSA 4OHNA 1AOVA 1B7UA 3BFTA 3K01A 4RPOA 1LFHA 4ZE8A 3K6WA 1LCFA 3K6UA 4LQ2A 1Y4TA 3T9HB 1JW5A 2DE4A 4QRZA 4IY6A 3OSQA 3FZVA 5H8HA 2V25A 3BFUA 4THIA 3C9HA 1SI1A 4JWXA 4XKQA 2QS2A 3IO4A 4H5FA 1JVXA 1TXFA 2BJJX 2B3BA 1SW5A 4G8NA 4NF5A 1PBQA 3O2AA 4H1XA 3MZBA 4F18A 5CC2A 2DS9A 3IOUA 4G4PA 3FVKA 1TFDA 2OWTA 1Y1MA 5TPAB 4OFOA 3UIFA 5ICQA 4OERA 3O29A 2QS4A 2QS1A 3GXAA 2VHAA 2ONRA 3OO7A 2O69A 4MBPA 5L9SA 3FXRA 4PFTA 1B5IA 5ELVA 2XX7A 1ZBMA 1LFGA 4RPNA 1BLFA 3QIMA 2CZLA 2VP1A 2E0SA 3D4CA 1QJMA 2NOOA 1ZU0A 4PFYA 1A54A 4G8HA 3EHUA 5JTYA 1XT8A 2I4BA 2OK2A 2VOZA 3RGYA 3IB0A 1URSA 4H5GA 3L6HA 4KD5A 4QSCA 1PB8A 4QHQA 5HM4B 1ATGA 4NF6B 1MXWA 2XD3A 3OENA 4OTEA 5DVFA 1EZOA 4RA1A 1Y9UA 3A3UA 4R2FA 1VR5A 2P0SA 3KFMA 2Y7PA 4MLQA 4YKKA 3SEVA 4BDNA 1LAXA 1TWYA 1SYIA 3CIJA 3KJTA 4U21A 4EDPA 2RKMA 2DE2A 3RLFE 1P1QA 1N3WA 2F35A 3K0VA 4IGTA 1LB8A 2DXRA 2LAOA 1BIYA 4IO7A 1MY0A 3O66A 3TAJA 3TZAA 1S7YA 3CI8A 4PFUA 3ZS6A 1IITA 3U1OA 1JW1A 3FXUA 4GL0A 1XC1A 3PMVA 3RTFB 2NUVA 4R6YA 1JEVA 1SBPA 5HBCA 3V8XB 3T93B 3LUYA 5CMMA 1B2HA 2XXUA 1B05A 1MY3A 4LA9A 3TEPA 1HSLA 2AYSA 3ECRA 1I6QA 1IEJA 3KN3A 1D3KA 2VGQA 3QUFA 3JZJA 2PYYA 1MG1A 2DWHA 1EH3A 2RCBA 4OZ9A 4KYSA 3KEIA 3MZ1A 1WDNA 2QS3A 1UTBA 1WODA 3KG2A 1VFDA 1NH8A 4X1DA 2ZXTA 1B0LA 2F34A 1MQIA 3Q27A 5TP9A 5IKBA 2REJA 4XTCQ 4IO2A 3TQLA 1RKMA 2FYIA 1B9JA 3ODBA 1QUIA 4MF3A 1XVYA 3KGCA 2V3QA 3B6WA 2O1MA 5I57A 1N84A 2UVJA 3TCHA 2QMWA 2THIA 2ONSA 3G7WA 4M4GA 3IOVA 4O3CA 1MM7A 5L9MA 1B1XA 3PD8A 1EU8A 4OWDA 2I3VA 4FEBA 3S4UA 2A5TB 4NWCA 3CFZA 4XKRA 3FUZA 3VVFA 3FD3A 4YKJA 1D9VA 5H8NB 1LAGE 4F19A 1FTMA 4WKMA 1ZJLA 4H67A 3N26A 1M5CA 1B51A 4DXUA 3TELA 1AMFA 3FVNA 1AL3A 4GXAA 4X1BA 1A55A 1MXXA 1B7ZA 3IB2A 1EZPA 3TTNA 1MQGA 4IO6A 3PPNA 3MW0A 5ICTA 3L6GA 1ZKBA 1MY2A 2NWJA 4KCDA 3W9VA 4GVOA 3S9EA 1HSJA 4I62A 1MQJA 3MAMA 3RT8A 1OIBA 1EZ9A 3IK6B 2VD2A 1JNFA 5AA3A 1HSEA 5DYHA 5FTIA 1I69A 1OVBA 4NF5B 4F2QA 2HAUA 3B7DA 3MVYA 4F1UA 1ZTYA 1NNTA 3MPLA 1TFAA 4QFKA 2REGA 1B7HA 4FEDA 3H06B 4PQJA 1LBBA 1DSNA 4GRKA 3I6VA 4YB6A 4R74A 4FORA 5AA4A 5AA2B 3WAEA 2D3IA 5CMKA 4X9TA 1JQFA 2I48A 4NF8A 1TT1A 1IXGA 3KN7A 3HV1A 1NFTA 2Y7WA 5KZTA 2V84A 3FATA 1CE2A 4JXIA 1N3XA 4Z0IA 4FATA 1POTA 5FHOA 3MQ9A 3SESA 1MXVA 3KZGA 1P1OA 1GR2A 3HN0A 4H8JA 4NEDA 3K6XA 2XXXA 1LSTA 2Z8DA 3SDFA 3C4MA 4OEUA 4R6HA 1Y3PA 3TDJA 3G3KA 4O3BA 2F5XA 5I2NA 1Y3NA 3G3FA 3DP6A 3IR1A 3PUVE 4KYEA 4AB5A 2Y7IA 4NMYA 1USYH 2VD3A 1I6BA 3KSJA 2XHDA 4G68A 4JBZA 2RINA 1SW2A 4ZDMA 1XHYA 3DP8A 4U1ZA 4F31B 3C34A 4P0GA 3SERA 3T9UA 2OJTA 1QW0A 1FTJA 2ZYOA 4H65A 2QL3A 1B52A 3TFLA 2DQVA 3M3KA 4H6DA 3U94A 3CG3A 5I2KA 3CFXA 3BKIB 4RK9A 3SEWA 2I49A 3G3JA 1S50A 2D5WA 4QSEA 4N07A 1GV8A 3CRBA 4F1YA 4PP0A 3VXCA 3IL1B 4I8CA 2WKYA 4JWOA 4XXUA 4FAJA 4RXLA 3KSXA 2DVZA 4Q5TA 3FGSA 4IY5A 3VLUA 1MXUA 3HCQA 1P99A 2Q8JA 2O7UA 2XX9A 3OO8A 2QPQA 4XKPA 4K3FA 3G3IA 5I58A 4G77A 3EHTA 2Z23A 1YPNA 2Q2AA 5DVJA 4U22A 2F8DA 2XXVA 4UACA 4DCXA 3Q29A 4IO5A 3KBRA 4ZEBA 2Y7RA 4TLMB 2O68A 3B6QA 2UYEA 2RC9A 2R9JA 3C36A 4C1TA 4POWA 3IOWA 2AL5A 1UTBB 2ZMBA 2OCUA 2ZYNA 3TMGA 4OFJA 1MM6A 4OVJA 2HFBA 4YZZA 3MVZA 5AA2D 5I59A 3EN3A 2ALUA 3K02A 2HAVA 3QSLA 3W9WA 5I57B 4OESA 4GD5A 3H03A 2Z22A 3N5LA 3M3LA 5DEXA 3RN8A 3RUMA 3B6TA 5A5XA 2H98A 3OMBA 1YTVA 1A7LA 3R26A 1FQCA 4QFOA 1VFEA 3QAXA 3TPAA 4ISUA 1NNKA 3PUZE 4GF8A 1I6AA 5I56A 1MXYA 4LATA 3O97A 2PVUA 4F29A 2PBWA 2I0BA 2XXPA 3USDA 3OSRA 4FJPA 3TTLA 4YMAA 1Y20A 1P1UA 1MDQA 3FIRA 1VE4A 2H99A 3CSGA 3GBBA 4WEPA 2V93A 4EXLA 1AIVA 1N7WA 1AH5A 1N7XA 2DE3A 3LSLA 5H8FA 2ESNA 5CMCA 1DTGA 2PX1A 1SW4A 3TTKA 4P0IA 5ITOA 3FV1A 1RYOA 3OEKA 3GBAA 4GLIA 2X26A 3C35A 3PU5A 3E9XA 1JW4A 2H9BA 2H5YA 2I58A 3TTRA 1KWHA 3TQWA 2UVIA 3MC2A 2OBGA 4GIZA 2HZLA 1P1NA 2IA4A 3MWBA 3I5OA 1RYXA 5JK4A 5AA4B 1SDXA 5TPAA 4EF1A 4F3BA 3K2DA 1B4HA 3IX1A 1II5A 4TLLB 4OENA 2A5SA 3QK6A 4PETA 2DVCA 5K2YA 1M5FA 3GLBA 3T66A 5B7DA 1H3DA 1PDAA 4EUOA 4LUBA 1NH7A 2NXOA 3CVGA 3TUSA 3K1NA 4LZ5A 3O9PA 4R72A 3RNNA 4FECA 3JYRA 3PPQA 3P7IA 1GTKA 3Q28A 4N13A 4XIGQ 4H8IA 1NNFA 4OYVA 3V83A 5I2NB 2Q89A 1PC3A 2OWSA 3UA8A 3EQ1A 4NF6A 1DTZA 4G68B 3DELB 1Y3QA 4GQOA 4BDMA 1A99A 4OETA 1NNPA 3M8UA 4JSOA 2W7YA 4DE8A 2I6EA 3V5AA 2X7PA 2P2AA 1FTLA 4ZE9A 3K1PA 2B3FA 2QMXA 3RQTA 4P11A 2HQ0A 2XXHA 4YKIA 1ELJA 4JWYA 4NWDA 5I2KB 2ONKE 4EQ9A 1US5A 3K4UA 4I9DA 1YCJA 2ZYMA 3MUQA 4MFIA 1M5BA 1FCKA 2G93A 2R6GE 4BDLA 3HPIA 1F9BA 2DWAA 4KCCA 2OZZA 4F3PA 1QKAA 3G3GA 1A8FA 4MLVA 5H8HB 1FQEA 1QULA 1LBCA 5H8QA 3D4GA 4GWOA 3FJ7A 1O7TA 1FQBA 2F78A 3MZ9A 3MBPA 3OD7A 5I58B 2I0CA 3MP6A 1D9YA 2X7QA 1N0TA 4OXVA 4X48A 4XKNA 4HS7A 1URDA 1VSOA 1SI0A 1B3HA 3RT6B 3SEXA 2R71A 1DPPA 3C32A 5BUUA 2V3UA 3IO6A 1FTKA 2RF1A 4QF9A 3A09A 3R7XA 4EF2A 1O64A 4YB5A 5K2XA 4YMBA 4R75A 3OO6A 4PFWA 2ABHA 3S2VA 3ONMA 3Q26A 5AE4A 1N76A 1B40A 5CI5A 4Q8RA 5J1DA 1MDP1 2Y84A 1QUKA 4ZS9A 4R9FA 4ELPA 3PPRA 1IXIA 3UGWA 2NVUB 1B3LA 4AQ4A 4LP2B 4F2OA 5I59B 3C31A 5JTYB 1UQWA 1M5EA 3N94A 1XS5A 2Q2CA 2O6AA 3N6TA 4C0RA 1DOTA 2Z8EA 4N6PA 4KHZE 3S9MC 5ISUA 1L5TA 3KOTA 3OOAA 1B3EA 4HCWA 2V3TA 3E13X 1LCTA 1H44A 4DCYA 2Y7KA 4GFRA 1SW1A 5A5XB 1BKAA 4KI0E 3ZKKA 4U23A 1FW0A 4R73A 2F97A 5TU0A 3PD9A 4U4SA 2UYFA 5HPQA 4FE8A 4ZEDA 3OEMA 5EHMA 4ZEIA 2RC7A 4ND9A 4BLAA 5H8NA 1OQHA 5I56B 1LB9A 1O63A 2GHBA 1LGBC 4QSDA 4OQOA 1QVSA 4YICA 1NMUA 5L8DA 4U1OA 2DP8A 3PMXA 5CBRA 3T9XB 2QRYA 3SEUA 2IEEA 3PPPA 4OEVA 4BDRA 2I4CA 3U92A 2ZNSA 1H76A 5H8FB 3K00A 3N6UA 1Q1KA 2DSFA 1R9LA 1N04A 1IQ7A 2ZYKA 3TCGA 3VXBA 5EHSA 5DVIA 2FA7A 3BBRA 4HCYA 1UTHA 5I84A 3H3GA 2HCAA 4ELOA 4QFPA 3QYTA 1ZIUA 4YKPA 3SETA 4I1DA 1SVXB 3UK4A 4ELQA 4ECFA 3EHSA 3TODA 3ZSFA 3PUXE 1B6HA 3T96B 1FQDA 3OELA 3IJXB 1OVTA 3ZKLA 4OMBA 5AA2A 5KCJA 4UA8A 3A3CA 3MP8A 3G3HA 1Y4CA 5AA1A 2P1SA 3U8QA 4ZZEA 2F6GA 4YB7A 4NF4A 5TP9B 2DXYA 5CM6A 2XD2A 3UP9A 3M3FA 1OMPA 3K1MA 2E1SA 4O3AA 4F3GA 1IXHA 3WAFA 2F6PA 3HHFA 1B32A 2HXWA 2YLNA 4GL8A 4LONB 2PT1A 5KDTA 1XVXA 2CMOA 2ZNTA 5JEIA 4G8MA 4AB6A 2F7CA 4H0WA 1MY1A 1NKXA 1GVCA 1QKBA 3QXMA 1M5DA 4GXSB 5FTHA 4KR5A 2PMSA 3VLVA 4IB2A 3CG1A 4RJZA 5F1QA 5H8SA 4U4XA 4LVQA 3TKDA 1MH4A 4WXJA 1URGA 4R2BA 4DIGA 3SKPA 3IJOB 1D4NA 3DLNA 3E3KA 1H45A 5ITPA 5LOMA 4ESWA 1DPEA 3IAZA 1GGGA 3ILTB 4RY1A 1SYHA 1FQAA 3PPOA 4DLDA 2XXTA 4RNSA 3OXNA 1LLSA 4F1VA 4BDOA 3W15C 3V89B 1H43A 1BP5A 4DDDA 2F7BA 5H8QB 1QUJA 1A8EA 1PB7A 2F36A 4LZ7A 2GRVA 4EQ7A 4JDFA 3I3VA 1B3FA 1S9TA 4KPTA 3R6UA 3CR9A 3LC8A 3H6VA 3UORA 1MPCA 1R1NA 1Z7ME 4ESXA 1OLCA 2Z8FA 2HZKA 3KN8A 4TQUQ 3VLWA 1JVYA 4Q30B 2RC8A 1LAFE 4LQ5A 3VVEA 2Q88A 2XXYA 5BWJA 3H4ZA 4EXKA 2DYXA 4NF8B 4JB7A 3RTWB 2DOJA 4EQBA 2GHAA 3TCFA 4ELRA 2YJPA 3CSBA 4U2RA 5FHMA 2H25A 1BTJA 4DXCA 3MJNA 3O6IA 1B1HA 1B3GA 1YAEA 4PE5B 3PMWA 3U93A 3VFJA 3O28A 3O6GA 2O84X 4IO3A 1SD3A 1MY4A 4BDQA 3H6TA 3ILUB 2UVGA 4ZEKA 2OLBA 4RK2A 3PV0E 3FXQA 1Q35A 3PGFA 3VE1B 3H6WA 1MS7A 3OO9A 4KQPA 4R9GA 2M8CA 4ONYA 4R6KA 3HHGA 2HEUA 4IGRA 1JEUA 1ANFA 3MPKA 4KFQA 1NL5A 4GOTA 1R6ZA 2AL4A 3TTMA 4G2ZA 3FVGA 1B0HA 4F39A 1PB9A 2GH9A 1WVJA 2XXIA 2G29A 3LSWA 4IO4A 3LR1A 3LSFB 3DP4A 3MVWA 3VVDA 4E0WA 4Q0CA 1T0KA 3VDFA 3IB1A 4QFLA 2Q9TA 4QFNA 3FJMA 2ZNUA 1J1NA 3FASA 2UVHA 5CBSA 3F11A 1B4ZA 1B58A 1LAHE 2XXQA 4G68C 3MVXA 1CB6A 4KYDA 1B5JA 1PEBA 3VV5A 4LZ8A 1B46A 4ZEFA 3LSXA 3DM0A 1US4A 2AIXA 4DXBA 3HO7A 3T9VA 4FIMA 2XXWA 3JV9A 3T22A 1JETA 1MPBA 3UN6A 5DT6A 3SEYA 5M2VA 1UTHB 4RYAA 1IXCA 3Q25A 1ZLQA 4WEDA 4NTLA 2O7IA 5CRYA 3PUYE 4TOZA 3HSTA 1ZMGA 3C33A 3THIA 2GFEA 2DWIA 4MH5A 3CFLA 2XX8A 4YAHX 3H7MA 1Z7NE 3RY3A 1OQGA 1MQDA 3H6UA 1MH3A 3PUWE 5KCJB 1FTOA 1FQFA 2F7AA 4YU0A 1P1WA 1OLAA 1POY1 3LBSA 3RPWA 4NE4A 3FV2A 5EYFA 4HTGA 3MP1A 3FJGA 4NF4B 2KLFA 5IAIA 1IZ1A 2PT2A 1SQYA 4Z7EA 4OFLA 5L9OA 2I3WA 2QSXA 2B65A 3U72A 3S9NC 4DZ1A 3K6VA 2QJEA 2ANJA 1IUDA 3IORA 2UXAA 4ZECA 4ZZAA 5CMBA 1UIUA 3KJ7A 4L17A 1USYE 2DWJA 3AXFA 5F7VA 3FVOA 5DEXB 5KDTB 2O1LA 3GZGA 1A40A 4E0XA 4F22A 2YPNA 1MPDA 2A5TA 1UIVA 1MRPA 3E4RA 1LFIA 3IOTA 5DTBA 3EF7A 3TYHA 2RCAA 4F3SA 1DMBA 4HW8A 1MQHA 1Y1ZA 1PBPA 1R9QA 4M1VA 5B70A 4JSDA 1XOCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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