2NWJA

Structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with disaccharide at 1.75 a resolution
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with disaccharide at 1.75 A resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 112
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2nwjA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2nwjA02
5TU0A 4BDQA 5A5XA 1LAFE 2REJA 4IGRA 4F1VA 3PUYE 3K1PA 3T9HB 5H8HA 3PPPA 4M4GA 1Y3NA 3F11A 3TCFA 1QKAA 3KSXA 4THIA 4AB5A 4I1DA 1LFGA 4F31B 4JWXA 2Q9TA 2P0SA 1B4HA 4ZECA 2XXTA 4G8HA 2RCAA 3E3KA 2QL3A 2QMXA 1PDAA 4IO2A 1FCKA 2X7PA 1OIBA 2WKYA 2XXQA 2NXOA 3C35A 4YZZA 2GHBA 4ZEDA 4TLLB 1M5DA 4YKJA 3FASA 3M3FA 3KFMA 1FQEA 1II5A 4KYDA 4G2ZA 1MY1A 3FVOA 5H8QA 2ZNUA 3L6GA 4RJZA 4GL8A 4LZ7A 4F1UA 5I56B 4ELPA 4H0WA 1FQCA 4LA9A 5I2NB 5I58A 3FXQA 3OO7A 3UN6A 2H99A 3CI8A 4OENA 2GFEA 2QS1A 3DP8A 3H3GA 4X48A 4ZE8A 3IR1A 1QUKA 3TELA 2ZXTA 5HBCA 3LUYA 1LB8A 1MM7A 1TFAA 3EN3A 4O3CA 5ITPA 4EQ7A 1OQHA 1URDA 4I8CA 3ILUB 1LFIA 2I0BA 4OZ9A 1S7YA 4NE4A 1YPNA 1UTBA 3T96B 2O84X 3OSRA 1R6ZA 2F78A 4K3FA 4MFIA 5KCJA 1YAEA 1MXWA 2BJJX 3TTRA 4NMYA 5IKBA 1MQJA 2XX8A 1US5A 4EXLA 4F18A 2PBWA 4QSDA 4OESA 4GD5A 3B6QA 1B5HA 1B3HA 1SW5A 1HSJA 2Y7KA 4NF6B 3DELB 4LZ5A 1I6BA 3Q27A 4KR5A 1UIUA 3LR1A 4IO6A 2R71A 2AIXA 3HO7A 1NNPA 1RYXA 4H6DA 2YJPA 4RNSA 3Q25A 3HSTA 1MXYA 1HSLA 1NH7A 3B6WA 3SESA 3N26A 3KGCA 3MVWA 5TPAA 2H4IA 3HN0A 3QXMA 4YAHX 2DE2A 2ONRA 3RLFE 3T9UA 4DLDA 3O2AA 1EH3A 3FVKA 3KJ7A 4YKIA 2I48A 1MQIA 1PB9A 4ZEIA 2F97A 1USYH 3UP9A 3C4MA 5ICTA 1BKAA 4PFTA 3FV1A 2V3TA 3IOWA 3TKDA 1PBQA 2UVIA 5F1QA 4EDPA 1B1XA 4KYSA 3BKIB 1B46A 3KG2A 4YU0A 4QFLA 4QRZA 4H5GA 2LAOA 1WVJA 1S9TA 2DXRA 3PPRA 3S9LC 1UTHB 1B58A 4EQBA 4OETA 1B6HA 4OYVA 3K4UA 2Z22A 3H6TA 3WAEA 2GH9A 4ZZAA 4G77A 2XXRA 1B51A 2VGQA 2CZLA 2I49A 2OWSA 4C1TA 3PPQA 2VP1A 1IXCA 4F22A 4OVJA 1LFHA 1MY4A 4AQ4A 3OMBA 3Q26A 2Z8DA 2GRVA 1GR2A 4U2RA 2HQ0A 2ZYOA 4LVQA 4N6PA 4DCYA 3G3JA 3USDA 1XVYA 1EZPA 1R1NA 4ELOA 1VR5A 3OENA 1PB7A 1KWHA 3E13X 1XT8A 4MBPA 4GVOA 1YTVA 3T9VA 4IO7A 5JTYB 2G93A 4HTGA 4DE8A 1CB6A 3PMVA 1MY3A 2XXUA 4NF4B 4WEPA 2I6EA 3IORA 1N76A 2O69A 1ZU0A 4QHQA 1N84A 4GXAA 4IY5A 1FTJA 1MY2A 2CMOA 3U8QA 2OCUA 5CI5A 2F36A 2XXXA 5ITOA 3BBRA 4P11A 3ZS6A 3EF7A 4X1DA 1SVXB 1IEJA 3VVFA 1DPEA 2XXIA 2XXYA 3KSJA 1QKBA 4IO3A 1IXIA 4UA8A 3R7XA 1B40A 1Y9UA 1MXXA 3MVYA 1LBCA 2UVJA 4NF8B 3IOUA 1FTOA 1MXUA 3GXAA 4ZS9A 3W9VA 4JWYA 5IAIA 4U23A 5B7DA 3UORA 3ZKLA 3CVGA 3S9NC 2DE4A 3MWBA 1Y1ZA 4P0IA 4KPTA 2OBGA 3KN3A 5M2VA 1O63A 3QUFA 2A5TB 3OO8A 1B5IA 3M8UA 4WXJA 5CM6A 2Q2AA 1P99A 4ZEKA 3T93B 4DXCA 3H6UA 5AA3A 3C32A 1B32A 1M5CA 1H43A 4JB7A 2QMWA 1ZKBA 1UQWA 3PV0E 4FEDA 3A3CA 3RTWB 3U92A 2H25A 3EPEA 3G3HA 3TUSA 3FATA 4TOZA 4LUBA 2UYEA 1B7HA 4LP2B 4EQ9A 1A40A 3VXCA 4JXIA 1ELJA 1QUIA 1FQDA 4U1ZA 4BDRA 1AOVA 1N0TA 1FW0A 3KN7A 1Z7NE 5K2YA 3VVDA 1Y1MA 1Y3QA 1OMPA 3D4CA 2QSXA 2O1MA 3E9XA 3L6HA 1NNTA 2V84A 1P1OA 2HAUA 4MLVA 4ZDMA 3S9EA 2PX1A 3R6UA 5CBSA 1D3KA 2RKMA 3OO9A 3MVZA 4M1VA 2ZMBA 1OVTA 2UXAA 3SEVA 2QS4A 3C31A 3G7WA 3EHSA 1AH5A 1XOCA 3IB0A 4GRKA 3ECRA 3SKPA 1RKMA 2AL4A 3FJMA 4EUOA 4OERA 4FAJA 4YB5A 1JW1A 3N6UA 3G3GA 4QSCA 3T9XB 3QSLA 2DE3A 3A09A 2XHDA 3HCQA 4RYAA 5KDTB 2V3UA 2DS9A 2QRYA 2DWAA 3UA8A 2P2AA 3PD8A 5I59A 4H8IA 4LZ8A 4PQJA 3C9HA 1A99A 3Q28A 4R75A 3PD9A 1Y3PA 3QUJA 5FTHA 1MPCA 3OEMA 4E0WA 4OEUA 5H8NB 4G4PA 3ILTB 4NF4A 3RGYA 5DEXB 3OSQA 2HFBA 1I6QA 4R2BA 1ZJLA 4LATA 3KJTA 4XXUA 1VFEA 2O1LA 3FXRA 1USYE 1SW4A 4H8JA 3PGFA 2I3WA 2XD2A 3GBAA 1H45A 4HS7A 4G68B 1D9YA 1POY1 1SYHA 1Y20A 4RA1A 1IIWA 2Y7RA 1I69A 4QFOA 2DVCA 1QULA 3H6VA 1MQGA 3JYRA 2Z8EA 3THIA 2XX7A 3S2VA 1FQBA 2XXVA 3MPLA 1LAGE 4NWDA 5AA4A 4E0XA 3CRBA 4X1BA 1O7TA 4POXA 4KHZE 1IUDA 3CFXA 4BDMA 5I2KA 1ZLQA 2F7AA 3HV1A 1AL3A 3MJNA 1URGA 4LQ5A 4LONB 3N6TA 5CMCA 5HPQA 4R9FA 5FHNA 3DP4A 3C33A 4OQOA 2NVUB 1LGBC 2R6GE 2B3FA 1SW1A 3TMGA 3G3FA 4QFNA 1N7WA 4FECA 2PT1A 1A8EA 4F3SA 1LAXA 3CIJA 4IO5A 4G8MA 4Q0CA 1JETA 3RN8A 3TFLA 3SETA 4DDDA 5TP9B 1Z7ME 2DWIA 1UIVA 2O6AA 4R72A 1JW5A 2I4BA 3VXBA 4RPOA 1A54A 1NMUA 5CMKA 4F19A 4OTEA 3MQ9A 1PC3A 5KZTA 3ONMA 4IB2A 5DVIA 5CBRA 3QYTA 4JWOA 5DT6A 1SI1A 3CSGA 3LBSA 1T0KA 1D4NA 4N07A 1MXZA 1SYIA 1LCTA 1WDNA 2PT2A 2Y7PA 4BLAA 1BP5A 3RPWA 1XS5A 5I84A 4HCWA 4U22A 2FYIA 1ZIUA 4RY1A 1SDXA 1PBPA 2ZYKA 1M5EA 2H5YA 2DYXA 1B3LA 4YB6A 4TQUQ 2OZZA 1MPBA 1ZTYA 4DXUA 4IGTA 2F5XA 1O64A 2OJTA 1NNKA 5F7VA 3FJ7A 5BWJA 4BDOA 1B4ZA 5H8HB 3MP6A 4DIGA 5H8FA 4XKRA 1D9VA 1MXVA 4EXKA 5JEIA 1A7LA 4YMAA 4ESXA 2F7BA 3I5OA 3K01A 3TQWA 3O6IA 4JSOA 4YMBA 4NTLA 1YCJA 3OELA 2F7CA 3ZSFA 3TQLA 4GIZA 2R9JA 3H03A 4GLIA 2YLNA 2HXWA 3RUMA 1JVYA 3FVGA 4F3PA 3SEWA 1J1NA 3H7MA 4G68C 3TAJA 4PE5B 3KZGA 4QFPA 5AE4A 2OK2A 4DZ1A 3KOSA 3U72A 4R2FA 3IO4A 3SEUA 4F2OA 4KYEA 4OXVA 4Z0IA 5ISUA 3TTKA 1IXGA 2FA7A 3B6TA 3PMWA 2IEEA 4XIGQ 1OQGA 2RC9A 4Q30B 2PMSA 4EF1A 3H06B 1M5BA 2RC7A 5H8QB 2VD2A 2H98A 3M3KA 3H6WA 3SEXA 5I58B 2PVUA 2ONKE 4R6YA 2REGA 3RTFB 4QF9A 4ZEFA 5I56A 1MQHA 3MZ1A 5EHMA 2RCBA 3K00A 2E1SA 3CG3A 4F3BA 3RT6B 5I2NA 3HPIA 3K02A 1CE2A 3C34A 4P0GA 4C0RA 4F1YA 2NOOA 1AIVA 2GHAA 2O51A 2DP8A 3O6GA 1HSEA 1IQ7A 4FATA 1JVXA 3LSFB 2XXHA 4OMBA 1Q1KA 3FJGA 4WEDA 4U4XA 1B3GA 2ALUA 2Q89A 1UTBB 5EYFA 5BUUA 2DSFA 3W9WA 2OLBA 3MVXA 3O9PA 2O7UA 5KCJB 3BFTA 4F3GA 4GQOA 4H1XA 4ELRA 3VLWA 5ELVA 2HCAA 1MDP1 5CMMA 1SD3A 4GWOA 4XTCQ 3D4GA 4UACA 1EZOA 4U4SA 1DTGA 3I3VA 4HCYA 1S50A 1TT1A 2W7YA 3A3UA 1BLFA 1WODA 2V3QA 3MW0A 1MH3A 4XKQA 1BIYA 1P1NA 2I0CA 2I4CA 3CFLA 4NF6A 4R6KA 2FNCA 3IOVA 3TTMA 3RQTA 5TPAB 5TP9A 4C1UA 4RPNA 1FTLA 1MRPA 4OHNA 2O7IA 3V83A 2D3IA 2ESNA 4FE8A 3B7DA 3KEIA 4OFLA 3TEPA 3FGSA 3TCGA 3WAFA 3GZGA 3CFZA 4FIMA 5AA1A 4JDFA 3IOTA 5DTBA 5L9OA 3G3IA 1URSA 3U1OA 2PYYA 1Y4CA 3U94A 5EHSA 3QIMA 3LSWA 3V5AA 5I57B 4F2QA 1H44A 2RF1A 4F29A 4NF5B 4RXLA 2F34A 5CC2A 3IK6B 4XKPA 2Q8JA 4GL0A 1QUJA 2UVGA 3G3KA 4TLMB 3ODBA 2G29A 1NNFA 1UTHA 2F35A 1JEUA 2V93A 3N5LA 4MLQA 1LSTA 2F8DA 4G8NA 3MP1A 3FXUA 4IO4A 2UVHA 1R9LA 3Q29A 2ZNTA 3IB1A 4KQPA 4RK2A 1RYOA 3IJXB 5DVFA 5FTIA 1OLCA 2I58A 3AXFA 4YKPA 3CR9A 2DQVA 2ZNSA 4ISUA 5JK4A 4IY6A 5JTYA 1F9BA 3LC8A 3PPNA 1ZMGA 2B3BA 3PUVE 4NEDA 1MY0A 3T66A 3IAZA 4Q5TA 4F39A 4PETA 2YPNA 4BDNA 3K1NA 1B05A 4OWDA 1B0HA 5DVJA 3MBPA 5AA2D 4R9GA 1ZBMA 2XXWA 3DP6A 2I3VA 2Z23A 2OWTA 3S4UA 4POWA 4HW8A 3S9MC 4NF8A 3OD7A 4OFOA 3P7IA 1GV8A 3FD3A 1B9JA 1GTKA 5K2XA 3I6VA 1MDQA 1DPPA 3VFJA 3QK6A 3MAMA 4X9TA 2ZYNA 1I6AA 1DOTA 1JW4A 1MH4A 1MPDA 2HEUA 3RNNA 3SERA 5ICQA 2A5TA 4ECFA 4YKKA 4R74A 4Z7EA 2D21A 1VSOA 2P1SA 4XKNA 2XXPA 4OFJA 4YICA 1OLAA 3BFUA 3PMXA 1P1UA 1PB8A 3FUZA 3K2DA 4KD5A 3O66A 5H8SA 1IITA 1FQAA 1Q35A 3FV2A 5L9MA 2DOJA 3MZBA 5L8DA 1H76A 2AYSA 1ATGA 1GVCA 3EHTA 1N04A 5CMBA 1SQYA 1VE4A 2ABHA 1FTMA 2HZLA 3T22A 2XD3A 4N13A 5AA2B 1JEVA 2DWJA 4GOTA 5B70A 3C36A 3MC2A 3K6UA 4L17A 4U21A 3M3LA 3TCHA 1NL5A 3VLUA 2D5WA 2B65A 1B5JA 2QJEA 1NH8A 3TTLA 2RINA 4I62A 1LBBA 3IO6A 3SDFA 5A5XB 1Y4TA 1QW0A 4ND9A 3VLVA 3DLNA 2O68A 1XVXA 3IJOB 4KI0E 5I57A 4BDLA 2XX9A 3LSXA 4DCXA 4NF5A 3MP8A 2X26A 1SI0A 3PUXE 4YB7A 1JNFA 2KLFA 3VV5A 2NUVA 3TPAA 3H4ZA 1MQDA 5HM4B 2IA4A 3OO6A 1B0LA 1A8FA 3VDFA 2V25A 3OXNA 4R6HA 2RC8A 4FJPA 3RY3A 1PEBA 1LCFA 1B3FA 3FZVA 5J1DA 3TTNA 2ANJA 2E0SA 4MH5A 1B7ZA 5I59B 1EZ9A 1VFDA 2Q88A 2H9BA 5KDTA 3OOAA 3V8XB 1B52A 3N94A 3TDJA 3IL1B 4H67A 3E4RA 3K6VA 4OEVA 3UK4A 2A5SA 3RT8A 3EQ1A 3FIRA 3O6HA 5FHMA 1NFTA 4O3BA 3VE1B 1IXHA 3R26A 3KOTA 3CSBA 5H8NA 2X7QA 1TWYA 3JZJA 3MZ9A 5DEXA 1POTA 3HHGA 3HHFA 1SW2A 1MM6A 1FQFA 3QAXA 3GBBA 1B3EA 4EF2A 4G68A 2F6GA 1LLSA 2Z8FA 2UYFA 3PUWE 3PU5A 1ANFA 3MPKA 1GGGA 4H5FA 1B1HA 1AMFA 1OVBA 1EU8A 4KCDA 5AA4B 1TFDA 3IX1A 1B7UA 5DYHA 2NWJA 1US4A 4ZZEA 1R9QA 4H65A 5I2KB 4LQ2A 2THIA 1JQFA 3CG1A 3LSLA 3K0VA 4JSDA 4ONYA 3K6WA 4AB6A 1N3WA 1BTJA 4QSEA 1XC1A 2VOZA 4GF8A 4ZEBA 2VD3A 1H3DA 1SBPA 1LAHE 1N3XA 1A55A 3VVEA 3UIFA 4PP0A 1NKXA 4RK9A 1LB9A 3O97A 1XHYA 3OEKA 3O28A 3JV9A 3ZKKA 2ONSA 1FTKA 4ESWA 3V89B 1DSNA 4I9DA 1MG1A 2Q2CA 2Y7IA 4U1OA 4KCCA 2DXYA 4O3AA 3U93A 4JBZA 3O29A 4Q8RA 2QS3A 4WKMA 3TODA 3UGWA 1DTZA 3KN8A 2M8CA 1L5TA 4KFQA 2QPQA 3PPOA 1DMBA 3SEYA 4MF3A 2QS2A 4DXBA 4FORA 3FVNA 5L9SA 1N7XA 2HZKA 1MS7A 2F6PA 5CRYA 4FEBA 4R73A 2ZYMA 2VHAA 1P1QA 4GXSB 1IZ1A 2DVZA 4QFKA 3DM0A 1TXFA 4NWCA 3KBRA 3GLBA 1QJMA 3IB2A 2Y7WA 3PUZE 4GFRA 5FHOA 5LOMA 3K6XA 5AA2A 1QVSA 3K1MA 3EHUA 1B2HA 1M5FA 3W15C 3MUQA 4ELQA 2DWHA 1P1WA 2HAVA 3TZAA 3TYHA 2Y84A 4PFWA 4PFUA 5H8FB 2AL5A 4ZE9A 4PFYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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