2O6AA

Crystal structure of the haemophilus influenzae e57a mutant fbpa
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
307
structure length
307
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTAQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-affinity binding by the periplasmic iron-binding protein from Haemophilus influenzae is required for acquiring iron from transferrin
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal binding protein
source organism Haemophilus influenzae
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
total genus 113
structure length 307
sequence length 307
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o6aA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o6aA02
3PU5A 4OEVA 4OESA 1N7WA 1MQGA 1T0KA 1P1OA 4M4GA 2QS4A 1B3GA 1R1NA 1FW0A 5L8DA 1UQWA 4ZECA 4NF6B 5HBCA 4XKQA 1MXYA 2LAOA 1QUIA 1LB8A 1OVTA 1H43A 1MY2A 3IK6B 3FIRA 2CMOA 2Q88A 4FATA 3MUQA 2ALUA 3LC8A 5H8QA 4KYEA 3MAMA 2E1SA 3RPWA 2O1MA 4TOZA 1ZKBA 1LLSA 5J1DA 4C1TA 5L9OA 2HEUA 4LATA 5CI5A 1MH4A 2G93A 4GQOA 3QK6A 3TCHA 5CMBA 1OQGA 2Q2AA 3MPLA 2AL5A 4KD5A 2RF1A 1RKMA 4JBZA 3H6UA 2BJJX 2F97A 5CBRA 2AYSA 3QSLA 2VGQA 4H6DA 4RNSA 3OMBA 1B0LA 4G68C 1GTKA 2F78A 2XXPA 4QSCA 3FGSA 4G2ZA 3JYRA 2HFBA 3PD9A 3MWBA 2QL3A 4OERA 4XTCQ 5KDTA 5TP9A 1SI0A 1BIYA 2UVIA 4OXVA 2QPQA 5I56A 1D3KA 3SEVA 4ZE9A 1GV8A 3B7DA 1R9QA 3E9XA 3G3GA 4R6HA 2I6EA 4ELRA 1B58A 3I6VA 2YPNA 1S50A 2Y7RA 1B5HA 2G29A 1ZIUA 1PB8A 2XXUA 3MBPA 5H8QB 4RA1A 3OO6A 2F7AA 2YLNA 2O68A 4IO7A 1Z7NE 1P1QA 4DCXA 2CZLA 2H25A 3E3KA 5DYHA 5IKBA 1FQDA 4F2QA 4LQ5A 3G3KA 4MBPA 3M3LA 2PYYA 1YCJA 1FTMA 3RT6B 3PUWE 1QVSA 1ZBMA 4EXKA 1FQCA 4H67A 3TPAA 3R26A 4Z0IA 1MY0A 2XXVA 1R9LA 3RQTA 4YU0A 2DOJA 3FJ7A 4QFKA 3G7WA 1JEVA 1OLAA 1MDQA 1NH8A 1B7ZA 4GWOA 2R6GE 4THIA 3K1NA 3RTWB 3H3GA 3PPQA 5FTIA 3C33A 4IY5A 3OO9A 4GOTA 3KN8A 4QFNA 1DTGA 5KDTB 3PPOA 3LSXA 2XXYA 3H7MA 3T22A 3UK4A 2XD3A 3TFLA 4TQUQ 3U1OA 2XXXA 5DT6A 1IQ7A 3C34A 4KYDA 3H4ZA 4IO5A 1Y1ZA 4E0XA 1FTKA 1B52A 3IOUA 3TTRA 3V89B 4F3SA 2FA7A 3K6XA 3Q26A 3UIFA 2QRYA 3MJNA 1ATGA 1MH3A 1MY1A 3CI8A 4WKMA 4QFPA 3T9HB 2VP1A 5HM4B 2HXWA 1LBCA 1WVJA 3VV5A 4F31B 5TPAA 3TQWA 1B2HA 2VD2A 1QW0A 1ZTYA 2HCAA 1PC3A 3LSLA 1TT1A 1EZPA 3CSBA 3TMGA 3O6HA 2P2AA 2QS2A 4EQ7A 5CM6A 3IORA 4KQPA 2RCAA 2V25A 3DP8A 4JSDA 3IB1A 4YB7A 4Q0CA 5FHOA 3IJOB 2F7BA 4ZE8A 3P7IA 4QHQA 4FAJA 4R73A 4OFLA 3ILTB 4X9TA 2ANJA 1BKAA 4G4PA 3DM0A 1OQHA 1JEUA 1XT8A 3S9NC 1US5A 4IO3A 1N84A 2PT1A 3TTLA 4MLQA 3FJGA 5FHMA 5KCJB 1MPBA 3F11A 3VLWA 4DZ1A 1GVCA 1Y3QA 1B7UA 4NF8A 3KEIA 3T9XB 4FEBA 2F8DA 1ZMGA 1LAGE 1P1UA 3RGYA 4GRKA 4BDNA 1MPCA 3THIA 2A5TA 1BLFA 5L9SA 3PMWA 1LCFA 3Q28A 2DWIA 3OENA 4PP0A 5CRYA 5AA3A 3UA8A 1B4ZA 2V93A 3G3FA 5DEXA 3LSFB 1NH7A 4R2FA 1I6BA 2F35A 4ISUA 2HZLA 4OENA 2Y7WA 3G3HA 4QSEA 3MPKA 1M5BA 4U22A 5F1QA 1NNFA 1FTOA 3K0VA 5ELVA 2XX9A 3SEUA 1IUDA 5I2NA 2Y84A 1LBBA 1MY4A 2I49A 1B4HA 3CRBA 3VLVA 1EZOA 4L17A 1QUKA 3PPNA 3HSTA 2REJA 1MXVA 4KI0E 3T93B 4KR5A 1SBPA 3K2DA 4F39A 2HAVA 1XVXA 1QULA 1AMFA 4BDMA 2E0SA 4P11A 1H3DA 5H8HA 3GXAA 3FXUA 3S9MC 4H8JA 1B05A 2WKYA 4UACA 3CFLA 3PPPA 5I57A 1LAHE 2XXRA 1TFDA 4O3BA 1B46A 1Y4TA 2QJEA 5EYFA 2PX1A 2PBWA 3K00A 4OWDA 1LAFE 2A5TB 2IEEA 4KFQA 4R6KA 1XS5A 2HZKA 4FIMA 2P1SA 2KLFA 4OVJA 2OBGA 3LUYA 5DEXB 2I0CA 3DLNA 3BFUA 3MP8A 4LQ2A 2GHBA 2H98A 1HSLA 3G3JA 3V83A 3Q25A 5I2NB 1SW4A 3RLFE 3ODBA 1LGBC 4MLVA 1N3WA 3IB0A 3U72A 4BLAA 4WXJA 4BDOA 4N07A 4H65A 5DVIA 4ZEBA 3FZVA 4RK2A 1OMPA 3M3KA 1Y1MA 1B5IA 3E13X 4QFLA 1A8EA 1B51A 4PFUA 3MVXA 3H03A 3EPEA 5HPQA 3C32A 4H0WA 4HCWA 5A5XA 5AE4A 5H8HB 2VHAA 2F36A 4ELOA 1D9VA 2ZYNA 3PUYE 5BWJA 3VDFA 3FV2A 5CMKA 4P0IA 5AA1A 5I57B 3ZKLA 1MY3A 1UTBA 5ICTA 1DPPA 1RYXA 1A99A 3LBSA 1SDXA 4X1DA 4U1OA 4LONB 3TQLA 3VE1B 3U93A 4ELQA 1IITA 5DVJA 3PUXE 2W7YA 3EN3A 4NE4A 2DXYA 3WAEA 1VE4A 4KCCA 5M2VA 4ZEDA 2ZNTA 5AA4A 4EQBA 3MP1A 2B3BA 5FTHA 4RPOA 3T9UA 2RCBA 3GLBA 4NWCA 5DTBA 3N94A 1IXHA 1A8FA 4NTLA 2V3TA 4U4XA 4IO2A 3H6VA 2UXAA 1YAEA 5I58A 2DQVA 2OK2A 1TWYA 2DVZA 1OVBA 2R9JA 4JB7A 4F3GA 1USYH 2V84A 1MQHA 1B3FA 3KGCA 2O69A 3PD8A 1MG1A 4YB5A 4GL0A 3FATA 1Z7ME 2XXIA 4H5FA 3TTMA 3ZS6A 2OZZA 1SW2A 2O7UA 2Q89A 2REGA 4WEPA 3ONMA 2A5SA 2I4CA 4ESWA 1PDAA 4LZ7A 3O6IA 1UTBB 4HCYA 2QMWA 5H8SA 1MS7A 4ECFA 3KOTA 3CFZA 2F34A 2R71A 4JWXA 4WEDA 3SEWA 4RYAA 2D5WA 4F3BA 4ND9A 4IGTA 3PGFA 4UA8A 1LB9A 4KHZE 4YMBA 1A55A 1LSTA 4Z7EA 4R9GA 1P1WA 3O97A 4RXLA 2DWJA 3TAJA 2HAUA 1M5FA 3O29A 3KFMA 4FE8A 2V3QA 3FASA 1NMUA 1MQJA 3OD7A 3R6UA 3C4MA 1B5JA 3RNNA 1QKBA 4XXUA 5I58B 5TP9B 1GGGA 5I56B 3VXBA 4ZEFA 2PMSA 3VXCA 3GZGA 3TTKA 4YKIA 3HHFA 4X48A 1B3LA 4PFTA 1XOCA 2OWSA 4XKRA 4PFYA 2RC8A 1DTZA 1PB9A 3PPRA 5FHNA 5F7VA 3TDJA 4JXIA 1SVXB 3GBBA 4QRZA 1EU8A 3B6TA 3D4GA 2Q2CA 3IAZA 3OEKA 3SKPA 1JNFA 1PB7A 4U21A 1DMBA 3S4UA 4EQ9A 4DE8A 1JVYA 3V5AA 4YMAA 3DP4A 3IO4A 3FVKA 4K3FA 5ITOA 1AOVA 4TLMB 1IZ1A 3SDFA 1AH5A 3JV9A 2UVGA 3DP6A 2F5XA 3VFJA 4HS7A 5H8NA 3SESA 1MXXA 2I3VA 5EHMA 4JSOA 1KWHA 4GVOA 2O7IA 2I48A 1SW1A 2OCUA 3RTFB 4H5GA 4FECA 1FQAA 3RY3A 1PEBA 3IJXB 4LZ5A 4ZZEA 5I84A 1S9TA 1FQEA 2DS9A 1QUJA 3PUZE 2I4BA 2B3FA 1MPDA 4NF4A 1IEJA 3QYTA 2DYXA 4IY6A 4NF5A 4F2OA 2B65A 4M1VA 5EHSA 4DDDA 3O6GA 3MZBA 2PT2A 1RYOA 4ZDMA 1IXCA 2ONRA 3N6UA 4KCDA 2RC7A 3TKDA 1MM7A 3C9HA 2AIXA 2XXWA 3TYHA 3A3UA 3CSGA 2Q8JA 3HV1A 1ZU0A 4DXUA 3MVYA 4ZEKA 1PBQA 2Z8FA 4GL8A 1MQIA 2O51A 3C36A 4R72A 5B7DA 3M8UA 1MXWA 5DVFA 3L6GA 1TXFA 4PE5B 2P0SA 4H1XA 1URSA 2ZYKA 4NEDA 5TPAB 3FVOA 2FNCA 3O2AA 2NXOA 4JWOA 3S2VA 5H8NB 3R7XA 1SYIA 2NVUB 4H8IA 4Q30B 4OFJA 1ELJA 1MRPA 1ZJLA 1DPEA 2DVCA 4C0RA 4F18A 1AL3A 1DOTA 1UTHA 4G68A 3OOAA 5I59A 2OLBA 2ZNSA 2FYIA 4QF9A 1B3HA 2XX8A 2ZMBA 3JZJA 4NF4B 3S9EA 4PFWA 3I5OA 4NF5B 1N76A 1I69A 2GH9A 3KZGA 3SEYA 1CE2A 4XKNA 4PETA 1WODA 3QUJA 4HW8A 2O6AA 1ANFA 4JWYA 1O63A 4LUBA 1Y4CA 4AB6A 2OJTA 2GRVA 5B70A 1QJMA 3SETA 3UORA 1B6HA 1MXUA 1MDP1 1B1XA 3K02A 4NF8B 2DSFA 2I0BA 4I8CA 4I62A 3IR1A 2XXTA 3CR9A 4BDLA 3PMVA 3N5LA 3H6TA 4LA9A 2IA4A 2O1LA 1VSOA 4OYVA 2UYFA 3UP9A 4R9FA 4DIGA 5CMMA 3UGWA 4F1YA 3VLUA 3M3FA 3H06B 3W15C 1IIWA 5LOMA 4I1DA 4GXSB 3HPIA 3PUVE 3OO7A 5AA2A 3KN7A 4XKPA 4F3PA 4G68B 5ITPA 3AXFA 3MQ9A 5I59B 2DWHA 3B6WA 4HTGA 1LCTA 4GD5A 4YKJA 3OXNA 2X26A 4F1UA 1MXZA 2DXRA 2ONKE 2H99A 3W9VA 1JW1A 2OWTA 1VR5A 3ZSFA 3HCQA 2QMXA 2Y7PA 4E0WA 2DE4A 4GF8A 3ILUB 2ABHA 1B9JA 3Q29A 5H8FA 4G8NA 3CFXA 4QFOA 3OELA 4RY1A 4EDPA 1IXIA 2ZYOA 3U94A 1FQBA 3LSWA 3BBRA 4U1ZA 3K6VA 1YTVA 3ZKKA 3HHGA 1R6ZA 2XD2A 3HO7A 2ZYMA 3I3VA 1URDA 2F6PA 3SEXA 3TCGA 3TZAA 1FTJA 2RC9A 4I9DA 1AIVA 4OTEA 4QSDA 3K6UA 3QAXA 2YJPA 1B3EA 4DLDA 1LFHA 3KOSA 1B40A 4KPTA 3KSXA 5ICQA 2D21A 3L6HA 1N3XA 3OO8A 1Y3PA 3U8QA 2Q9TA 4IO6A 3TTNA 3MC2A 2ZNUA 1O7TA 3VVEA 3IOWA 1XVYA 4ONYA 1XC1A 2XXQA 2QSXA 3LR1A 5AA2B 1B7HA 4BDRA 1FCKA 2Z8DA 1J1NA 4MF3A 4MFIA 4X1BA 1N04A 3A09A 1MM6A 4DXBA 3C35A 4KYSA 1N7XA 4ZEIA 3MZ9A 1BTJA 1SI1A 4C1UA 2NWJA 1LFIA 4NMYA 5A5XB 1LAXA 5H8FB 4GLIA 3H6WA 3EF7A 4G8MA 3A3CA 5CBSA 2UYEA 3DELB 3TODA 3VVFA 4AB5A 4FORA 1SW5A 1TFAA 3TUSA 3IB2A 2X7QA 5K2XA 3QIMA 4YICA 3W9WA 4AQ4A 1XHYA 2THIA 4POXA 1Q35A 2M8CA 1UIUA 4IO4A 3S9LC 4FJPA 1PBPA 1IXGA 3PV0E 4JDFA 1JETA 5AA4B 5ISUA 4OZ9A 1B32A 3FXQA 4F22A 1D4NA 1A40A 2VOZA 3N6TA 3ECRA 2V3UA 4TLLB 1YPNA 1NFTA 3UN6A 2DP8A 2DE3A 3TELA 2VD3A 3IX1A 4POWA 4ESXA 2PVUA 3Q27A 2Z23A 3FVNA 2ONSA 1P1NA 4G8HA 3FV1A 3U92A 2NOOA 1POTA 4F29A 3FVGA 1JQFA 4EF2A 4F1VA 1Y3NA 1Y20A 3K4UA 4ZZAA 1I6QA 3QXMA 3KSJA 4YKKA 5CMCA 5JTYA 2D3IA 2QS3A 4EF1A 5KCJA 3VVDA 4GFRA 3RT8A 4YZZA 1F9BA 4OHNA 3MW0A 3T9VA 3N26A 1CB6A 4O3AA 1NNKA 3CG3A 4YKPA 3FUZA 4Q5TA 1JVXA 2Y7KA 2HQ0A 1M5CA 4OFOA 4G77A 1M5DA 1WDNA 3GBAA 4LP2B 1S7YA 3MP6A 3BFTA 3K1MA 1USYE 1US4A 2ZXTA 4RPNA 3FD3A 1Y9UA 3KBRA 3B6QA 4N6PA 4OETA 1MQDA 4OMBA 1LFGA 4R2BA 3IL1B 3KJ7A 3KG2A 3IO6A 1NL5A 4DXCA 2DWAA 1B0HA 1A54A 3T66A 1EZ9A 4EUOA 4GXAA 2H9BA 1SYHA 3TCFA 2XX7A 5JTYB 3K1PA 2ESNA 5L9MA 4U23A 5K2YA 5JEIA 1OLCA 1BP5A 1UIVA 2H4IA 1NKXA 1VFDA 2O84X 2RKMA 3O9PA 5BUUA 3G3IA 4O3CA 2GFEA 2UVHA 1A7LA 4ELPA 4OQOA 4RJZA 1QKAA 1B1HA 5I2KA 4F19A 3SERA 1URGA 1FQFA 4RK9A 1JW5A 5KZTA 1POY1 3RN8A 2RINA 3FJMA 2I58A 1I6AA 1II5A 1H44A 3RUMA 2QS1A 1HSJA 1SD3A 1FTLA 1OIBA 4N13A 4ZS9A 1ZLQA 2GHAA 3KJTA 4GIZA 3D4CA 3O66A 1GR2A 4PQJA 2F7CA 1P99A 4XIGQ 4YAHX 2XXHA 1M5EA 1N0TA 3FXRA 1NNTA 4BDQA 4R74A 4MH5A 2DE2A 3PMXA 4YB6A 5CC2A 3IOVA 3K01A 3OSRA 3HN0A 3E4RA 2NUVA 1VFEA 4U2RA 3CIJA 4NF6A 5AA2D 1HSEA 1H45A 4U4SA 2UVJA 2Y7IA 1NNPA 3IOTA 3KN3A 3O28A 4DCYA 4IGRA 1Q1KA 3OEMA 4EXLA 4Q8RA 1D9YA 4P0GA 3T96B 4R6YA 3K6WA 3MZ1A 2AL4A 2I3WA 3EHSA 4OEUA 1H76A 5TU0A 2H5YA 4R75A 2Z22A 1JW4A 5IAIA 3CVGA 5JK4A 3BKIB 1DSNA 5I2KB 3USDA 1EH3A 3MVZA 2Z8EA 3V8XB 3TEPA 3OSQA 3MVWA 3QUFA 3WAFA 4LVQA 2F6GA 1UTHB 4NWDA 3EHUA 4FEDA 1L5TA 2XHDA 3C31A 4LZ8A 3EHTA 3EQ1A 2X7PA 4IB2A 1O64A 3CG1A 1SQYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F3DA 3PU5A 4OEVA 4OESA 1N7WA 1MQGA 1T0KA 1P1OA 4M4GA 2PFZA 2QS4A 1B3GA 1R1NA 4XFEA 1FW0A 5L8DA 2QVVA 1UQWA 4ZECA 4NF6B 5HBCA 4XKQA 1MXYA 4N8GA 2LAOA 1QUIA 1LB8A 1OVTA 1H43A 1MY2A 3IK6B 4X04A 3FIRA 2CMOA 2Q88A 4FATA 2B4MA 3MUQA 2ALUA 3LC8A 5H8QA 4KYEA 3MAMA 2XWVA 5ET6A 2E1SA 3RPWA 2O1MA 4P3LA 4TOZA 1ZKBA 1LLSA 5J1DA 4C1TA 5L9OA 2HEUA 4LATA 1LBWA 5CI5A 1MH4A 2G93A 4GQOA 3QK6A 3TCHA 5CMBA 1OQGA 2Q2AA 3MPLA 2AL5A 4KD5A 1FPLA 3RYDA 2RF1A 1RKMA 4JBZA 3H6UA 2BJJX 2F97A 5CBRA 2AYSA 2XXKA 3QSLA 2VGQA 4H6DA 4RNSA 3OMBA 1B0LA 4G68C 1GTKA 2F78A 2XXPA 4QSCA 2PCRA 3FGSA 4G2ZA 3JYRA 2HFBA 3PD9A 3MWBA 4G61A 2QL3A 4OERA 1K9YA 4XTCQ 4NX1A 5KDTA 2FVZA 5I5PA 5TP9A 1SI0A 1BIYA 2UVIA 4OXVA 2QPQA 5I56A 1D3KA 3SEVA 4ZE9A 1GV8A 3B7DA 1R9QA 3E9XA 3G3GA 4R6HA 2I6EA 1FPFA 4ELRA 1B58A 3I6VA 2YPNA 1S50A 2Y7RA 2HPGA 4MNCA 1B5HA 2G29A 1ZIUA 1PB8A 2XXUA 3MBPA 5H8QB 4RA1A 3OO6A 2F7AA 2YLNA 2O68A 4IO7A 1Z7NE 1P1QA 1JP4A 4DCXA 2CZLA 1IMDA 2H25A 1RDXA 3E3KA 5DYHA 5IKBA 4GWXA 1FQDA 4F2QA 3EKIA 2HHMA 4LQ5A 4MX6A 3G3KA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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